Orientador: Sandro Roberto Valentini / Coorientador: Cleslei Fernando Zanelli / Banca: Paulo Sérgio Rodrigues Coelho / Banca: Flávio Henrique da Silva / Banca: Iran Malavazi / Banca: Carla Columbano de Oliveira / Resumo: O provável fator de início de tradução 5A (eIF5A) é altamente conservado de arqueas a mamíferos e sofre uma modificação pós-traducional única e essencial, em que uma lisina específica é convertida em um resíduo de hipusina. Este fator já foi relacionado ao transporte nucleocitoplasmático, à degradação de mRNA e à proliferação celular. Dados recentes restabelecem uma função para eIF5A na tradução e sugerem a sua atuação na etapa de elongação ao invés de início, como originalmente proposto. Uma vez que o envolvimento de eIF5A com o degradação de mRNA ainda não foi elucidado, tornou-se interessante estudar qual a natureza desta relação. O metabolismo de mRNA é um processo complexo que envolve as etapas da tradução (mRNAs nos polissomos), repressão da tradução (mRNAs acumulados em grânulos de estresse) e degradação de mRNA (mRNAs nos P bodies). Os componentes da maquinaria de degradação de mRNA acumulam-se nos P bodies e, neste trabalho, foi verificado que eIF5A não se localiza nestes corpúsculos. Ainda, foi avaliada a formação de P bodies no mutante tif51A-3, na temperatura não permissiva (38ºC), e foi verificada uma inibição na formação de P bodies. Outros mutantes com defeitos na elongação da tradução, como cca1-1 e eft2H699K, também apresentaram defeito na agregação dos P bodies. Foi avaliada a existência de interação genética sintética entre os mutantes tif51A-1 e tif51A-3 e mutantes de fatores envolvidos com a repressão da tradução e/ou degradação de mRNA. Foi revelada uma supressão parcial do fenótipo de termossensibilidade com nocautes dos genes SBP1, DHH1 e PAT1, que codificam fatores ativadores da remoção do capacete e repressores da tradução. Por outro lado, uma interação sintético doente entre os mutantes tif51A-1 e xrn1Δ foi... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The putative translation initiation factor 5A (eIF5A) is highly conserved from archaea to mammals and undergoes an unique and essential post-translational modification, in which a specific lysine residue is converted into a hypusine residue. This factor has been involved in several cellular processes such as nucleocytoplasmic transport, mRNA decay and cell proliferation. Recent data have re-established a function for eIF5A in translation and suggests a role in elongation rather than initiation as originally proposed. Since the involvement of eIF5A with mRNA decay has not been elucidated it has become interesting to study the aspects of this relationship. mRNA metabolism is a complex process that involves the steps of translation (mRNAs on the polysomes), translation repression (mRNAs accumulated in granules) and mRNA degradation (mRNAs in P bodies). The mRNA degradation machinery accumulates in P bodies and in this study we have verified that eIF5A is not localized inside them. P bodies assembly was evaluated in the tif51A-3 mutant at non-permissive temperature and this aggregation was inhibited. Other mutant strains with defects in translation elongation, such as cca1-1 e eft2H699K, also presented defective P body assembly. The existence of synthetic genetic interactions between the eIF5A mutants, tif51A-1 and tif51A-3, and translation repression and/or mRNA decay mutants was evaluated. A partial suppression of the temperature sensitive phenotype of the eIF5A mutants was revealed when SBP1, DHH1 and PAT1 genes were deleted. Since those proteins are decapping activators and translational repressors these interactions reveal a putative function for eIF5A as an inhibitor of translation repression. However, a synthetic sick phenotype between tif51A-1 and xrn1Δ mutants was observed. Finally, stress granules... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Resumo: Os ácaros Cunaxidae são predadores de ácaros fitófagos, outros pequenos artrópodes e nematóides. O objetivo foi conhecer as espécies de Cunaxidae de ocorrência no solo e em plantas de dois ecossistemas naturais do Estado de São Paulo, Cerrado e Mata Atlântica e os aspectos biológicos de uma das espécies coletadas. Estudos sobre a diversidade desse grupo em ecossistemas naturais são importantes como uma informação a mais para justificar a conservação desses ecossistemas e também para uma possível utilização prática desses predadores como agentes de controle biológico de pragas em ecossistemas agrícolas. De um total de 561 espécimes de cunaxídeos, 42 espécies foram estudadas. Dentre essas espécies, 12 eram conhecidas e 30 eram espécies novas para a ciência. Portanto, cerca de 70% da diversidade consistia em espécies novas. Dentre as espécies conhecidas, apenas uma já havia sido constatada no Brasil. Por meio desse estudo, foi possível verificar uma grande diversidade de cunaxídeos em ecossistemas naturais do Estado de São Paulo. Dentre os táxons novos, 3 gêneros novos e 10 espécies novas foram descritos neste estudo. Uma das espécies novas, Cunaxatricha tarsospinosa, encontrada em plantas da vegetação natural (Mata Atlântica) e na cultura da seringueira do Estado do Mato Grosso do Sul e de São Paulo, teve seus aspectos biológicos avaliados quando alimentada com Tenuipalpus heveae. / Abstract: The Cunaxidae mites are predators of phytophagous mites, other small arthropods and nematodes. The objective was to know the species of Cunaxidae occurring in the soil and on the plants of two natural ecosystems of the State of São Paulo, "Cerrado" and "Atlantic Forest" and the biological aspects of one of the species collected. Studies about the diversity of this group in natural ecosystems are important as additional inforrnation to justify the conservation of those ecosystems and for the possible practical use af these predatory mites as biological control agent of pests in agroecosystems. Df a total of 561 specimens of cunaxids, 42 species were studied. Among these species, 12 were known and 30 were new species to science. Therefore, about 70% of the diversity consisted in new species. Among the known species, just one was already known fram Brazil. Trough this study was possible to verify a high diversity of the cunaxid in the natural ecosystems of the State of São Paulo. Among the new taxa found, 3 new genera and 10 new species were described in this study. One of the new species, Cunaxatricha tarsospinosa, found on plants of the natural vegetation ("Atlantic Forest") and on the rubber tree plantation of the State of Mato Grosso do Sul and São Paulo, has their biological aspects evaluated when fed with Tenuipalpus heveae. / Orientador: Gilberto José de Moraes / Coorientador: Jacob Den Heyer / Banca: Reinaldo José Fazzio Feres / Banca: Carlos Holger Wenzel Flechtmann / Banca: Carlos Amadeu Leite de Oliveira / Banca: Sergio Antonio de Bortoli / Doutor

Orientador: Fernando Bastos / Banca: Silvia Luzia Frateschi Trivelato / Banca: Claudio Bertolli Filho / Banca: Ana Maria de Andrade Caldeira / Banca: Roberto Nardi / Resumo: O trabalho corresponde um estudo de caso (Bogdan & Biklen,1994)em que aulas de biologia de uma turma de alunos do 2 º ano do ensino médio foram sistematicamente observadas com o intuito de verificar de que forma surgem e são trabalhadas questões relativas aos avanços recentes em biologia celular e molecular (organismos transgênicos,clonagem,experiências com células tronco,projeto genoma etc.). Atenção especial foi dada às demandas formativas que esse aspecto do ensino de biologia suscita junto aos professores,tanto em nível de aprofundamento de conhecimentos em biologia celular e molecular,quanto em nível de decisões sobre como organizar abordagem e discussão de temas polêmicos e implicações éticas subjacentes.O referencial teórico para o desenvolvimento da pesquisa e análise de dados foi estruturado com base em literatura especializada sobre formação de professores (Schön &Costa,2000; Perrenoud,2000;Zaballa,A.,1998; Carvalho e Gil-Pérez,1995; entre outros). / Abstract: The work corresponds to study of case (Bogdan &Biklen,1994)in which biology classes in group o students from second year in high school were systematically observed on propose to verify how the questions relating to the recent advances in molecular and cellular biology (transgenic organisms,clonating,experiments with stem- cells,genome project,etc.)appear and worked.A special attention was given formative demands that this spect of the teaching in biology rouse among the teachers,both making deeper in the knowledge in molecular and cellular biology and the decisions about how organize the approach and discussion relating to the polemic subjects and ethic implications underlying.The theoretic reference to the development of the research and data analysis was based on specialized literature about teachers graduation (Schön &Costa,2000;Perrenoud,2000;Zaballa,A.,1998;Carvalho e Gil-Pérez,1995; et al.). / Mestre

Orientador: Alberto Gaspar / Banca: Graça Aparecida Cicillini / Banca: Ana Maria de Andrade Caldeira / Resumo: A teoria da evolução biológica tornou-se o eixo organizador do pensamento biológico, e desde a publicação de A Origem das Espécies o tema tem sido amplamente discutido tanto dentro como fora dos ambientes acadêmicos. A partir do século XX, o ensino da teoria da Evolução Biológica de Charles Darwin passou a integrar os currículos da educação básica no Brasil e no mundo, e desde então muitas divergências acerca do ensino deste tema têm surgido. O uso de recursos didáticos alternativos e a educação informal em ciências podem ser uma importante ferramenta de auxílio ao professor, se bem utilizado em sala de aula, minimizando os problemas decorrentes do ensino tradicional. Os objetivos do trabalho foram os seguintes: (1) Identificar por quais meios os alunos do ensino médio de escolas públicas e particulares de São José do Rio Preto-SP aprendem ou se informam a respeito da teoria da Evolução Biológica; (2) avaliar a importância atribuída por professores à educação informal na aprendizagem da Evolução Biológica; (3) identificar se os professores de Biologia utilizam recursos e estratégias alternativas de ensino como recurso didático para ensinar a Evolução Biológica e qual a importância por eles atribuída a esses recursos; (4) verificar como os professores de Biologia se posicionam como parceiros mais capazes no ensino de Evolução Biológica. A pesquisa foi desenvolvida em duas fases: (1) Levantamento de dados sobre fontes de informação a respeito de Evolução Biológica entre alunos do ensino médio; (2) Entrevistas com professores de Biologia do ensino médio de modo a identificar como lidam com o uso de recursos alternativos e a educação informal, ambos no ensino de Evolução Biológica. As respostas dos professores foram analisadas de maneira qualitativa sob o enfoque da teoria sócio-histórica de Lev Semenovitch Vigostki. Os resultados... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The evolutionary biology theory has become the organizing axis of the biological thought, and since the publication of The Origin of the Species the theme has been highly discussed on academic and non-academic environments. On twentieth century the evolutionary biology theory has integrated the basics education curriculum in Brazil and other parts of the world, and since then many divergent opinions has appeared about the teaching of this theme. So, the use of alternative teaching resources and strategies and informal science teaching can be an important helping tool to the teacher, if well used at classroom, helping on decreasing the problems coming from the traditional teaching. The objectives of this job were: (1) Identify by what channels the high school students of public and private schools get informed about evolutionary biology; (2) evaluate how important is the informal science teaching on the Evolutionary Biology learning, on teachers' view; (3) identify if Biology teachers use alternative didactic resources and strategies as didactic resource on the Evolutionary Biology teaching and how important are they for him; (4) verify how Biology teachers get positioned as most capable partner on the Evolutionary Biology teaching. The research was developed on two phases: (1) Data acquiring about information resources about Evolutionary Biology by high school students; (2) Biology teacher interviews, attempting to identify how they work with strategies and alternative didactic resources, and the informal education on the Evolutionary Biology teaching. The teacher's answers were analyzed on the qualitative way under the light of the social-historic Vygotsky's theory. The quantitative results showed us that the high school students get information about evolutionary biology through informal resources when in comparison to formal education resources. The teacher's answers... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Resumo: Na descrição hierárquica do conhecimento biológico, o ser vivo é considerado como ponto central nas relações engendradas pelos seguintes níveis: ambiente externo (ecológico/evolutivo), organismo e ambiente interno (genético/ molecular). O organismo compreendido como nível focal da discussão biológica pode ressaltar a autonomia da Biologia em relação às outras áreas do conhecimento científico. No contexto do ensino, assume-se que as discussões epistemológicas do conhecimento biológico podem promover uma compreensão mais integrada dos fenômenos biológicos. Assim, organizou-se um grupo de pesquisa com graduandos de um curso de Ciências Biológicas para discutir conceitos centrais do conhecimento biológico, entre eles, o conceito de organismo. Esta pesquisa teve como objetivos: 1) Elaborar uma caracterização do conceito de organismo, partindo de uma abordagem hierárquica, integrando as discussões advindas da Filosofia da Biologia contemporânea referentes aos conceitos de auto-organização, autonomia agencial, propriedades emergentes e níveis hierárquicos; 2) Analisar como o conceito de organismo se impõe frente às explicações de vida presentes na literatura contemporânea da Filosofia da Biologia; 3) Utilizar a discussão teórica relativa ao conceito de organismo como fundamentação de um grupo de "Pesquisas em Epistemologia da Biologia", verificando as contribuições desse aporte teórico para a formação de alunos de Licenciatura em Ciências Biológicas na área de Epistemologia da Biologia e Ensino de Ciências; 4) Analisar as discussões e produções escritas ocorridas no desenvolvimento do grupo de "Pesquisas em Epistemologia da Biologia" que abordaram o conceito de organismo, com a finalidade de verificar se uma abordagem hierárquica tendo o organismo como nível focal contribui para uma visão integrada do conhecimento biológico pelos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In the hierarchical of biological knowledge, the living being could be considered as central point in the relations produced by three levels: external environment (ecological/evolution), organism and environment intern (genetic/molecular). The comprehension of the organism as a focal level in the biological debate can underline the autonomy of Biology among the other areas of the scientific knowledge. In the education context it is assumed that the epistemological discussions of the biological knowledge can promote an integrated understanding of the biological phenomena. Thus, a research group consisting of Biological Sciences undergraduates was organized to debate central concepts of the biological knowledge in which the discussions of the organism concept are included. This research aimed to: 1) develop a characterization of the concept of organism from a hierarchical approach by integrating the resulting discussions from contemporary philosophy of biology that are related to the concepts of self-organization, autonomy agents, emergent properties and hierarchical levels; 2) to analyze how the concept of organism is placed in front of the explications of life in the contemporary literature of philosophy of biology; 3) to use the theoretical discussion on the concept of organism as fundamentation for a group of "Studies in Epistemology of Biology," noting the help of this theoretical contribution to the Biological Sciences students training in the Biology and Epistemology in Science Teaching; 4) to analyze discussions and written productions that occurred in the development of the 'Research in Epistemology of Biology's group which addressed the concept the organism in order to verify if a hierarchical approach in which the organism is the focal level contributes to an integrated view of biological knowledge for biology students. On the basis of the theoretical referential... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Ana Maria de Andrade Caldeira / Coorientador: Charbel Niño El-Hani / Banca: Fernando Bastos / Banca: Maurício de Carvalho Ramos / Banca: Luzia Marta Bellini / Banca: Marcelo Carbone Carneiro / Doutor

Orientador: Jair Lopes Junior / Banca: Elio Carlos Ricardo / Banca: Renato Eugenio da Silva Diniz / Resumo: A teoria evolutiva desempenha papel fundamental dentro das ciências biológicas, dado que possibilita a organização e a unificação do corpo de conhecimentos desta área. Em concordância com esta perspectiva, o ensino-aprendizagem de Biologia deve salientar a centralidade e a importância da evolução para este componente curricular. Entretanto, as pesquisas brasileiras sobre ensino de evolução biológica evidenciam uma série de obstáculos para a construção de conteúdos referentes à teoria evolutiva, bem como para a adoção da evolução como eixo central da disciplina de Biologia. A constatação e o reconhecimento de tais dificuldades impõem questões sobre os subsídios oferecidos pelos documentos oficiais da educação básico do Estado de São Paulo e pelas pesquisas acadêmicas sobre o ensino de evolução para enfrentamento das mesmas. Nesta perspectiva, poder-se-ia demarcar correspondências entre, de um lado, os indicadores de aprendizagem derivados das pesquisas acadêmicas sobre o ensino de conteúdos relacionados ao tema origem e evolução da vida e, de outro lado, o contexto escolar no qual ocorrem os processos de ensino-aprendizagem desta temática. Considerando as diferentes dimensões em relação às quais tais correspondências poderiam ser analisadas, o presente trabalho concentrou ênfase em investigar se os indicadores de aprendizagem referentes ao tema evolução derivados das pesquisas acadêmicas equivalentes ou consistentes com os descritores preconizados pelas matrizes de referência do Sistema de Avaliação de Rendimento Escolar do Estado de São Paulo (SARESP). Nestes termos, objetivamos com este estudo investigar e caracterizar as possíveis correspondências entre os descritores e as habilidades preconizadas em documentos oficiais da educação básica do Estado de São Paulo e os indicadores de aprendizagem expostos pelas pesquisas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The evolutionary theory plays a fundamental role in the biological sciences, data that makes possible the organization and unification of the corpus of knowledge in this area. In agreement with this perspective, the Biology teaching and learning must highlight the centrality and the importance of the evolution for this curriculum component. However, the Brazilian researches on the teaching of biological evolution show a series of obstacles to building contents concerning to the evolutionary theory, as well as the adoption of the evolution as the central axis of the biology discipline. The fact and the recognition of these difficulties impose questions about the subsidies offered by official documents of the basic education in the State of São Paulo and by the academic researches on the teaching of evolution in order to face them. In this perspective, it could be able to demarcate correspondences between, on one hand, the learning, indicators derived from academic research on teaching content related to the subject origin and evolution of the life and on the other hand, the school context in which occur the teaching and learning processes of this subject. Considering the different dimensions on which such matches could be analyzed, this study focused emphasis on investigating whether the indicators of learning on the subject of evolution derived from academic researches would be equivalent to or consistent with the descriptors recommended by the matrices of reference of the Evaluation System of the School Performance of the State of São Paulo (SARESP). In these terms, this study aimed to investigate and characterize the possible matches between descriptors and the skills recommended in official documents of the basic education in the State of Sao Paulo and the indicators of learning exhibited by academic... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Resumo: Esta tese trata da caracterização espectroscópica por dicroísmo circular e fluorescência, caracterização estrutural utilizando as técnicas de cristalografia de raios X e espalhamento de raios X a baixos ângulos (SAXS) de duas (chiquimato quinase e corismato sintase) das sete enzimas da via metabólica do ácido chiquímico na forma apo e em complexo com seus respectivos ligantes naturais e o desenvolvimento de abordagens computacionais para implementação e integração de ferramentas de modelagem molecular comparativa e análise das estruturas tridimensionais geradas em larga escala das enzimas da via do ácido chiquímico de microorganismos e de plantas. A motivação deste trabalho é o fato de que a tuberculose e outras doenças também negligenciadas causadas por microorganismos são a causa de morte de milhões de pessoas no mundo, assim a caracterização estrutural de proteínas alvo para propor novas drogas tornou-se essencial. O principal interesse no estudo da via do ácido chiquímico é o fato que a via não esta presente em humanos, o que a torna alvo seletivo para desenho de drogas, diminuindo o impacto das drogas em humanos. Os resultados obtidos a partir das técnicas experimentais utilizadas neste trabalho possibilitaram um melhor entendimento do mecanismo catalítico das enzimas chiquimato quinase e corismato sintase. A partir dos dados de modelagem molecular em larga escala, foi possível montar um banco de dados relacional e curado, o SKPDB, que contém anotações detalhadas sobre a função e estrutura das enzimas, podendo ser acessado emhttp://lsbzix.rc.unesp.br/skpdb/index.html. Este trabalho aumenta a certeza de que a modelagem molecular comparativa em conjunto com técnicas experimentais é uma ferramenta útil e valiosa na anotação de seqüências e no estudo estrutural e funcional de proteínas. / Abstract: This thesis deals with the spectroscopic characterization by fluorescence and circular dicroismo, structural characterization using the techniques of X-ray crystallography and X-ray scattering at low angles (SAXS) of two (corismato synthase and shikimate kinase) of the seven enzymes of the metabolic pathway of chiquimic acid in apo form and in complex with their natural ligands and the development of computational approaches to implementation and integration of tools for molecular modeling and comparative analysis of three-dimensional structures generated in a large scale means of the enzyme chiquimic acid of microorganisms and plants. The motivation of this work is the fact that tuberculosis and other neglected diseases also caused by microorganisms are the cause of death of millions of people around the world, so the structural characterization of proteins offer new targets for drugs has become essential. The main interest in studying the path of chiquimic acid is the fact that the route is not present in humans, which makes selective target for design of drugs, reducing the impact of drugs in humans. The results obtained from the experimental techniques used in this study allowed a better understanding of the catalytic mechanism of shikimate kinase enzymes and corismato synthase. From the data of molecular modeling in large scale, it can build a relational database and cured, the SKPDB which contains detailed notes on the structure and function of enzymes, which can be accessed in http://lsbzix.rc.unesp.br/skpdb/index.html. This work increases the certainty that the comparative molecular modeling together with experimental techniques is a useful and valuable tool in the annotation of sequences and the study of structural and functional proteins. / Orientador: Mário Sérgio Palma / Coorientador: Walter Filgueira de Azevedo Júnior / Banca: Júlio César Borges / Banca: Marcos Roberto de Mattos Fontes / Banca: Fátima Pereira de Souza / Banca: José Márcio Machado / Doutor

Orientador: Marinônio Lopes Cornélio / Banca: José Roberto Ruggiero / Banca: Luis Paulo Barbour Scott / Resumo: O α-tocoferol é a principal dentre as moléculas que desempenham o papel biológico de vitamina E, sendo a que apresenta maior biodisponibilidade e atividade. Além dos papéis como vitamina, o α-tocoferol tem diversas funções no organismo incluindo a inibição de proteínas da família PLA2. Esse trabalho apresenta a análise vibracional do α-tocoferol inteiro no vácuo seguido pela otimização geométrica da molécula em ambiente protéico. O estudo do tocoferol no vácuo foi realizado dentro do formalismo do DFT usando o funcional de correlação-troca B3LYP e a base de funções 6-311G**. A análise vibracional foi realizada em um programa desenvolvido pelo autor. Em ambiente protéico, o processo foi dividido em duas etapas: a otimização geométrica do sistema inteiro no formalismo da dinâmica molecular e a otimização somente do ligante e de um envelope protéico em DFT. Por dificuldades computacionais não foi possível a análise vibracional do sistema. / Abstract: The α-tocopherol is the most important molecule which has the biological role of vitamin E, having the greatest biodisponibility and activity. Besides its vitamin roles, the α- tocopherol has many functions in organisms including the inhibition of proteins of the PLA2 family. This work presents the vibrational analysis of the whole α-tocoferol in vacuum followed by the geometric optimization of the molecule in protein environment. The study of tocopherol in vacuum was done in the DFT framework using the B3LYP exchangecorrelation functional with the 6-311G** function basis and the vibrational analysis was done by a program developed by the author. The process was divided in two steps for the study in protein environment: the geometrical optimization of the whole system in the molecular dynamics framework and the optimization of the ligand and a protein envelope in DFT. Due to computational troubles it was not possible to perform the vibrational analysis of this system. / Mestre

Resumo: Amostras de plantas sintomáticas provenientes de produções comerciais de pimentão e pimenta das regiões de Lins, Salto, Sorocaba, Itapetininga, Joanópolis no Estado de São Paulo foram obtidos durante os anos de 2000 a 2005 e analisadas quanto à espécie de tobamovírus presente. Visando ampliar o conhecimento da variabilidade biológica, bem como genética destes isolados, após a purificação por monolesões, estes isolados foram inoculados na série diferenciadora de Capsicum spp. contendo os genes L1, L2, L3 e L4 que permitiram a separação dos mesmos em patótipos. Foram observadas as espécies Tobacco mosaic virus (TMV), Tomato mosaic virus (ToMV) pertencentes ao patótipo P0 e Pepper mild mottle virus (PMMoV) pertencente ao patótipo P1-2, respectivamente. A maioria dos isolados de tobamovírus foram encontrados sob cultivo de estufa e com predominância do ToMV, porém com baixa incidência. A identidade das espécies de tobamovírus nas amostras de pimentão e pimenta foi confirmada por RT-PCR, utilizando-se oligonucleotídeos universais para o gênero Tobamovirus seguido de sequenciamento e específicos para cada uma das espécies. O sequenciamento do fragmento amplificado correspondente à parte da porção codificadora para a capa protéica dos isolados identificados como ToMV revelou identidade de aminoácidos entre 90% a 100% quando comparados com outras seqüências de To MV. Três isolados de ToMV não detectados pelos oligonucleotídeos específicos tiveram sua identidade confirmada após sequenciamento como pertencentes a esta espécie. Os isolados caracterizados como patótipo P1-2 de PMMoV apresentaram identidade de aminoácidos entre 96% a 100% quando comparados com outras seqüências de PMMoV. Nas principais regiões produtoras do Estado de São Paulo ainda não ocorre o patótipo P1-2-3 de PMMoV, bem como a incidência de tobamovírus em pimentão e pimenta é baixa. / Abstract: Isolates from commercial hot and sweet peppers fields surrounding the cities of Lins, Salto, Sorocaba, Itapetininga, Bragança Paulista in São Paulo State were collected during the years 2000 to 2005 and analyzed for the presence of tobamovirus species. The biological and genetic variability of these isolates, purification by local lesions , was analysed using the differencial genotypes of Capsicum spp. with the L1, L2, L3 e L4 genes that permit the classification of the isolates in pathotypes. The occurrence of Tobacco mosaic virus (TMV) and Tomato mosaic virus (ToMV) belonging to the P0 pathotype and Pepper mild mottle virus (PMMoV) belonging to the P1-2, respectively, was observed. The most part of tobamovirus isolates were found in indoor conditions and with predominance of the ToMV specie, however with low incidence. The identification of the tobamovirus species was confirmed by RTPCR using degenerated primers for the Tobamovirus genus and specific primers for TMV, ToMV and PMMoV. The analysis of part of the coat protein sequence gene of the isolates of ToMV characterizated as P0 showed amino acids identity ranging between 90 to 100% when compared with others ToMV sequences. The identity of three ToMV isolates that could not be detected by the ToMV specific primers was confirmed only after the sequence analysis. The isolates characterized as P1-2 PMMoV showed amino acids identity ranging between 96 to 100% when compared with others PMMoV sequences. The pathotype P1-2-3 PMMoV still does not occurs in the main producing areas of São Paulo State, as well as the tobamovirus incidence in sweet and hot pepper is low. There is no possible geographic correlation origin for the ToMV Brazilian isolates, whereas the PMMoV isolates could be separated in two phylogenetics branches, one including isolates from Japan, Germany and Taiwan and the second including isolates from Italy, China and Korea. / Orientador: Renate Krause Sakate / Coorientador: Marcelo Agenor Pavan / Banca: Antonio Carlos Maringoni / Banca: Cyro Paulino da Costa / Banca: Rômulo Fujito Kobori / Banca: Valdir Atsushi Yuki / Doutor

Orientador: Maria Izabel Souza Camargo / Coorientador: Adriane C. Araújo Braga / Banca: Daniela Carvalho dos Santos / Banca: Aparecida do Carmo Zerbo Tremacoldi / Banca: Karina Ribeiro / Banca: Tatiana da Silva Souza / Resumo: O hepatopâncreas dos crustáceos, também conhecido como glândula digestiva, passa por modificações morfo-funcionais em resposta a fatores como dieta, variações de temperatura, ciclo de muda, estágio reprodutivo e contaminação. Este trabalho objetivou analisar, morfologicamente, através de técnicas de microscopia eletrônica e de luz, o hepatopâncreas de fêmeas adultas do camarão-rosa Farfantepenaeus brasiliensis, em dois diferentes estágios de desenvolvimento gonadal, coletadas em Guarapari, Espírito Santo, Brasil, bem como relacionar esta espécie às condições ambientais, comparativamente ao camarão Xiphopenaeus kroyeri. A microscopia eletrônica de varredura evidenciou hepatopâncreas de tamanhos semelhantes nas fêmeas com gônadas desenvolvidas (DE) e naquelas esgotadas (ES), apresentando-se como um órgão não-lobado e recoberto por tecido conjuntivo com poros. Histologicamente, foram identificados cinco tipos celulares nos túbulos: células E (embrionárias), R (reabsortivas), F (fibrilares), B (vesiculares) e M (basais). Comparado às DE, o epitélio hepatopancreático das fêmeas ES mostrou-se mais escamoso, acidófilo, delimitando um amplo lúmen que contem partes das células B e R; nestas, ainda, as células M estiveram mais evidentes. As células R mostraram escassez em organelas, mitocôndrias apicais, vacúolos marcados para polissacarídeos ácidos, além de gotas lipídicas vistas principalmente nas fêmeas ES. As células F, fortemente marcadas pelo azul de bromofenol, apresentaram vesículas de secreção próximas às microvilosidades, retículo endoplasmático rugoso bem desenvolvido, em arranjo circular ou com cisternas dilatadas. As células B foram marcadas pela presença de grandes corpos digestivos com conteúdo polissacarídico neutro, sendo eliminado, posteriormente... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The hepatopancreas of crustaceans, also known as the digestive gland, undergoes morphological and functional changes in response to factors such as diet, temperature variations, moult cycle, reproductive stage and contamination. This study aimed to analyze, morphologically, by means of electron and light microscopies, the hepatopancreas of adult females of the pink shrimp Farfantepenaeus brasiliensis at two different stages of gonadal development, collected in the southern coast of Espirito Santo, Brazil, as well as to relate this species to the environmental conditions, compared to Xiphopenaeus kroyeri shrimp. The scanning electron microscopy revealed similar size in the hepatopancreas of females with developed gonads (DE) and those with exhausted gonads (ES). It presents as a non-lobed organ covered by connective tissue with pores. Histologically, five cell types were identified in tubules: E (embryonic), R (reabsorptive), F (fibrillar), B (vesicular) and M (basal). Compared to those DE females, the hepatopancreas from ES females showed a more flattened epithelium, acidophilus and delimiting a large lumen which contains parts of R and B cells; in these, also, the M cells were more evident. R cells showed shortage in organelles, apical mitochondria, vacuoles marked for acid polysaccharides, and lipid droplets seen mainly in female ES. F cells were strongly marked by bromophenol blue and presented secretory vesicles near the microvilli, well-developed rough endoplasmic reticulum in circular arrangement, or even with dilated cistern. B cells were marked by the presence of large digestive bodies with neutral polysaccharide content, being later eliminated inside the tubular lumen. The observed features also allowed us to infer the possible stages of moult in which the shrimps were. Although some... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor