Made available in DSpace on 2016-01-26T18:56:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Leila.pdf: 151367 bytes, checksum: 8d608bf8fde1f905b52307aca18e1344 (MD5) Previous issue date: 2007-05-07 / An experiment with soybean (cv. Conquista) was conduced in greenhouse, using samples of soil in areas under culture of pastures and annual cultures, obtained from seven cities of the region west of São Paulo. It was evaluated component of the nitrogen fixation and competitiveness of the strains of Bradyrhizobium recommended in reply the inoculation in soybean. The inoculation in the majority of the treatments had effect which is reflected in the increment of nodulation and accumulation of total N yield. The parameter numbers and dry mass of nodules in the soybean root showed significant interaction with local variables and evaluated inoculation. The increase of the nodulation in soybean inoculated in acid soil shows good adaptation of the recommended strains. The strain SEMIA 5080 was found in the majority of the nodules evaluated in the sorological typification. / Foi realizado um experimento com soja (cv. conquista), em casa de vegetação, utilizando-se amostras de solo de áreas sob cultivo de pastagens e culturas anuais, oriundas de sete municípios da região oeste paulista. Foram avaliados componentes da fixação biológica de nitrogênio e competitividade das estirpes de Bradyrhizobium em resposta à inoculação comercial em soja. Houve resposta à inoculação na maioria dos locais avaliados, o que refletiu na maior nodulação e acúmulo de N total na parte aérea. Os parâmetros número e massa seca de nódulos na raiz de soja apresentaram interação significativa com as variáveis, local e inoculação avaliadas. O aumento da nodulação da soja inoculada em solos ácidos mostra boa adaptação das estirpes recomendadas para o uso em inoculantes comerciais para os locais avaliados. A estirpe SEMIA 5080 foi encontrada na maioria dos nódulos avaliados na tipificação sorológica.

Made available in DSpace on 2016-07-18T17:51:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Leila.pdf: 151367 bytes, checksum: 8d608bf8fde1f905b52307aca18e1344 (MD5) Previous issue date: 2007-05-07 / An experiment with soybean (cv. Conquista) was conduced in greenhouse, using samples of soil in areas under culture of pastures and annual cultures, obtained from seven cities of the region west of São Paulo. It was evaluated component of the nitrogen fixation and competitiveness of the strains of Bradyrhizobium recommended in reply the inoculation in soybean. The inoculation in the majority of the treatments had effect which is reflected in the increment of nodulation and accumulation of total N yield. The parameter numbers and dry mass of nodules in the soybean root showed significant interaction with local variables and evaluated inoculation. The increase of the nodulation in soybean inoculated in acid soil shows good adaptation of the recommended strains. The strain SEMIA 5080 was found in the majority of the nodules evaluated in the sorological typification. / Foi realizado um experimento com soja (cv. conquista), em casa de vegetação, utilizando-se amostras de solo de áreas sob cultivo de pastagens e culturas anuais, oriundas de sete municípios da região oeste paulista. Foram avaliados componentes da fixação biológica de nitrogênio e competitividade das estirpes de Bradyrhizobium em resposta à inoculação comercial em soja. Houve resposta à inoculação na maioria dos locais avaliados, o que refletiu na maior nodulação e acúmulo de N total na parte aérea. Os parâmetros número e massa seca de nódulos na raiz de soja apresentaram interação significativa com as variáveis, local e inoculação avaliadas. O aumento da nodulação da soja inoculada em solos ácidos mostra boa adaptação das estirpes recomendadas para o uso em inoculantes comerciais para os locais avaliados. A estirpe SEMIA 5080 foi encontrada na maioria dos nódulos avaliados na tipificação sorológica.

京都大学 / 0048 / 新制・課程博士 / 博士(農学) / 甲第21152号 / 農博第2278号 / 新制||農||1059(附属図書館) / 学位論文||H30||N5126(農学部図書室) / 京都大学大学院農学研究科農学専攻 / (主査)教授 奥本 裕, 教授 白岩 立彦, 教授 冨永 達 / 学位規則第4条第1項該当 / Doctor of Agricultural Science / Kyoto University / DFAM

Com objetivo de avaliar a eficiência do uso de fertilizante (contendo macronutrientes - nitrogênio, fósforo e potássio - e micronutrientes - cobalto e molibdênio), associado a fungicida e a inoculante, no tratamento de sementes de soja (variedade cultivada FT-Abyara), foram realizados dois experimentos, em laboratório (2007) e em campo (safra agrícola de 2007/2008), no Departamento de Biologia da Universidade Federal de Santa Maria, em Santa Maria-RS. O experimento I constou de tratamentos de doses de macronutrientes e micronutrientes em mistura com os fungicidas Thiram e Carbendazim aplicados em Bradyrhizobium spp. em meio de cultura YMA. O experimento II foi realizado para avaliar o efeito do tratamento de sementes de soja com micronutrientes e fungicidas na sobrevivência de Bradyrhizobium spp. e sua influência no crescimento da planta. Com relação aos diferentes fertilizantes avaliados, verifica-se que o maior número de nódulos por planta e maior massa de matéria seca de nódulos foi obtido com os compostos que continham cobalto e molibdênio, resultado também observado em relação aos tratamentos com fungicidas. Os resultados experimentais permitem inferir que todos os tratamentos com fertilizantes aplicados via sementes aumentaram significativamente a altura de planta, o comprimento de raiz, e a massa de matéria seca da parte aérea e de raiz quando comparados à testemunha sem tratamento com fertilizante, fungicida e inoculante. Em função dos resultados obtidos neste trabalho com a cultura de soja, pode-se concluir que: (i) o tratamento de sementes com fungicidas diminui o número de células viáveis de Bradyrhizobium spp.; (ii) a utilização de cobalto e molibdênio no tratamento de sementes proporciona aumento na quantidade de células de Bradyrhizobium spp.; e (iii) o melhor parâmetro para avaliar a eficiência da inoculação no tratamento de sementes é o número de células viáveis de Bradyrhizobium spp. / With the purpose of evaluating the efficiency of fertilizers (with macronutrients - nitrogen, phosphorus and potassium - and micronutrients - cobalt e molybdenum), fungicides and inoculant utilization in the soybean (cultivar \'FT-Abyara\') seed treatment, two experiments were carried out, in laboratory (2007) and in field (season 2007/2008), at Biology Department of Federal University of Santa Maria, in Santa Maria, \'Rio Grande do Sul\' State, Brazil. The experiment I consisted of evaluating the macronutrients and micronutrients doses treatments mixed with fungicides (Thiram and Carbendazim) applied in the YMA culture medium of Bradyrhizobium spp. The experiment II consisted of evaluating the soybean seed treatment (with micronutrients and fungicides) effect on Bradyrhizobium spp. survival and its influence on the plant growth. In relation to different evaluated fertilizers, the higher number of nodules per plant and higher nodules dry mass were obtained with cobalt and molybdenum seed treatments. Similar results also were obtained with fungicides treatments. According to the results, all treatments with fertilizers increased the soybean plant height, root length, dry matter of canopy and roots when compared to the control (without fertilizers, fungicides and inoculant). According to the results, there are the following conclusions: (i) the seed treatment with fungicides decreases the viable cells number of Bradyrhizobium spp.; (ii) the utilization of cobalt and molybdenum in the seed treatment increases the Bradyrhizobium spp. cells number; and (iii) the best parameter to evaluate the seed treatment inoculation efficiency is the viable cells number of Bradyrhizobium spp.

Com objetivo de avaliar a eficiência do uso de fertilizante (contendo macronutrientes - nitrogênio, fósforo e potássio - e micronutrientes - cobalto e molibdênio), associado a fungicida e a inoculante, no tratamento de sementes de soja (variedade cultivada FT-Abyara), foram realizados dois experimentos, em laboratório (2007) e em campo (safra agrícola de 2007/2008), no Departamento de Biologia da Universidade Federal de Santa Maria, em Santa Maria-RS. O experimento I constou de tratamentos de doses de macronutrientes e micronutrientes em mistura com os fungicidas Thiram e Carbendazim aplicados em Bradyrhizobium spp. em meio de cultura YMA. O experimento II foi realizado para avaliar o efeito do tratamento de sementes de soja com micronutrientes e fungicidas na sobrevivência de Bradyrhizobium spp. e sua influência no crescimento da planta. Com relação aos diferentes fertilizantes avaliados, verifica-se que o maior número de nódulos por planta e maior massa de matéria seca de nódulos foi obtido com os compostos que continham cobalto e molibdênio, resultado também observado em relação aos tratamentos com fungicidas. Os resultados experimentais permitem inferir que todos os tratamentos com fertilizantes aplicados via sementes aumentaram significativamente a altura de planta, o comprimento de raiz, e a massa de matéria seca da parte aérea e de raiz quando comparados à testemunha sem tratamento com fertilizante, fungicida e inoculante. Em função dos resultados obtidos neste trabalho com a cultura de soja, pode-se concluir que: (i) o tratamento de sementes com fungicidas diminui o número de células viáveis de Bradyrhizobium spp.; (ii) a utilização de cobalto e molibdênio no tratamento de sementes proporciona aumento na quantidade de células de Bradyrhizobium spp.; e (iii) o melhor parâmetro para avaliar a eficiência da inoculação no tratamento de sementes é o número de células viáveis de Bradyrhizobium spp. / With the purpose of evaluating the efficiency of fertilizers (with macronutrients - nitrogen, phosphorus and potassium - and micronutrients - cobalt e molybdenum), fungicides and inoculant utilization in the soybean (cultivar \'FT-Abyara\') seed treatment, two experiments were carried out, in laboratory (2007) and in field (season 2007/2008), at Biology Department of Federal University of Santa Maria, in Santa Maria, \'Rio Grande do Sul\' State, Brazil. The experiment I consisted of evaluating the macronutrients and micronutrients doses treatments mixed with fungicides (Thiram and Carbendazim) applied in the YMA culture medium of Bradyrhizobium spp. The experiment II consisted of evaluating the soybean seed treatment (with micronutrients and fungicides) effect on Bradyrhizobium spp. survival and its influence on the plant growth. In relation to different evaluated fertilizers, the higher number of nodules per plant and higher nodules dry mass were obtained with cobalt and molybdenum seed treatments. Similar results also were obtained with fungicides treatments. According to the results, all treatments with fertilizers increased the soybean plant height, root length, dry matter of canopy and roots when compared to the control (without fertilizers, fungicides and inoculant). According to the results, there are the following conclusions: (i) the seed treatment with fungicides decreases the viable cells number of Bradyrhizobium spp.; (ii) the utilization of cobalt and molybdenum in the seed treatment increases the Bradyrhizobium spp. cells number; and (iii) the best parameter to evaluate the seed treatment inoculation efficiency is the viable cells number of Bradyrhizobium spp.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:53Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-12-14Bitstream added on 2014-06-13T18:44:27Z : No. of bitstreams: 1 pereira_rm_dr_jabo.pdf: 415712 bytes, checksum: 3a2847df5213880b53630ad700a376be (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Diversos estudos com bactérias fixadoras de nitrogênio buscam identificar genes responsáveis pela fixação de nitrogênio, nodulação e simbiose, assim como conhecer seu genoma e compreender melhor o metabolismo delas. No entanto ainda há poucos trabalhos sobre o genoma de Bradyrhizobium elkanii, bactéria importante no contexto da produção de alimentos e de utilização comercial. Esse é o primeiro estudo a comparar 2654 genes de Bradyrhizobium elkanii SEMIA 587, com as bactérias Bradyrhizobium japonicum LGM 6138, Azorhizobium caulinodans LGM 6465, Mesorhizobium huakuii LGM 14107, Rhizobium leguminosarum bv. Trifolii LGM 8820 e Sinorhizobium meliloti LGM 6133 através da comparação de genomas por hibridização (CGH) usando Microarray. Portanto o objetivo deste trabalho foi realizar uma taxonomia molecular através da comparação de genomas por hibridização DNA-DNA, utilizando a tecnologia de microarranjos de DNA (CGH Microarray), para buscar novos genes que possam ser úteis na classificação filogenética de rizóbios. A técnica de CGH Microarray permitiu encontrar sessenta e cinco genes comuns entre todas as bactérias analisadas, após realizar comparação e classificação de todos genes encontrados em comum entre elas. Os resultados obtidos ao se comparar três árvores filogenéticas baseadas em diferentes genes, confirmaram que alterar a quantidade e as sequências nas análises, causa variação nas árvores filogenéticas como já observado em outros microrganismos... / Diverse studies with fixing nitrogen bacteria search to identify responsible genes for the nitrogen fix, nodulation and symbiosis, as well as knowing its genome and understanding the metabolism of them better. However still has few works about genome of Bradyrhizobium elkanii, important bacterium in the context of the production of foods and commercial use. This is the first study to compare 2654 genes of Bradyrhizobium elkanii SEMIA 587, with the bacteria Bradyrhizobium japonicum LGM 6138, Azorhizobium caulinodans LGM 6465, Mesorhizobium huakuii LGM 14107, Rhizobium leguminosarum bv. Trifolii LGM 8820 and Sinorhizobium meliloti LGM 6133 through the CGH Microarray. Therefore aim of this work was to carry a molecular taxonomy through the comparison of genomes for hybridization DNA-DNA, being used the technology of microarrangements of DNA (CGH Microarray), to search new genes that can be useful in the phylogenetic classification of rhizobia. The technique of CGH Microarray allowed to find sixty and five orthologs genes between all the analyzed bacteria, after to carry through comparison and classification of all genes in common between them. The results gotten to if comparing three established phylogenetic trees in different genes, had confirmed that to modify the amount and the sequences in the analyses, cause variation in the phylogenetic trees as already observed in other microorganisms. The results suggest that how much bigger will be the number of used ortholog genes in the phylogeny, more trustworthy will be the gotten phylogenetic trees ...(Complete abstract, click electronic access below)

Verificou-se a influência da temperatura e da agitação ótima para o desenvolvimento da estirpe SEMIA 587 de Bradyrhizobium japonicum em fermentador de bancada. A variação da temperatura, nos estudos cinéticos, influenciou de forma mais marcante o desenvolvimento microbiano do que a variação da agitação. Os melhores resultados a nível de rendimento foram obtidos utilizando-se uma temperatura de 28ºC e uma agitação de 230 rpm. Fez-se também um estudo da competição entre as estirpes SEMIA 587 e SEMIA 5019 em fermentador, inoculante turfoso e por sítio de nodulação. A estirpe SEMIA 587, quando desenvolvida conjuntamente com a SEMIA 5019, atingiu aproximadamente 70% da população total após 120 horas de processo. Esta mistura mais as elaboradas com 30, 50 e 70% da estirpe SEMIA 587, foram utilizadas como tratamentos para a inoculação em soja e também para a impregnação em turfa esterilizada. Nestes experimentos observou-se uma predominância da estirpe SEMIA 587, em relação à SEMIA 5019, em fixar nitrogênio e competir por sítios de nodulação e também no inoculante. Os resultados confirmam a possibilidade de utilização dos cultivos mistos, desde que sejam encontradas condições operacionais para o desenvolvimento ótimo das duas estirpes.

Orientadora: Eliana Gertrudes Macedo Lemos / Banca: Maria José Valarini / Banca: Haroldo Alves Pereira Junior / Banca: Lúcia Maria Carareto Alves / Banca: João Martins Pizauro Junior / Resumo: Diversos estudos com bactérias fixadoras de nitrogênio buscam identificar genes responsáveis pela fixação de nitrogênio, nodulação e simbiose, assim como conhecer seu genoma e compreender melhor o metabolismo delas. No entanto ainda há poucos trabalhos sobre o genoma de Bradyrhizobium elkanii, bactéria importante no contexto da produção de alimentos e de utilização comercial. Esse é o primeiro estudo a comparar 2654 genes de Bradyrhizobium elkanii SEMIA 587, com as bactérias Bradyrhizobium japonicum LGM 6138, Azorhizobium caulinodans LGM 6465, Mesorhizobium huakuii LGM 14107, Rhizobium leguminosarum bv. Trifolii LGM 8820 e Sinorhizobium meliloti LGM 6133 através da comparação de genomas por hibridização (CGH) usando Microarray. Portanto o objetivo deste trabalho foi realizar uma taxonomia molecular através da comparação de genomas por hibridização DNA-DNA, utilizando a tecnologia de microarranjos de DNA (CGH Microarray), para buscar novos genes que possam ser úteis na classificação filogenética de rizóbios. A técnica de CGH Microarray permitiu encontrar sessenta e cinco genes comuns entre todas as bactérias analisadas, após realizar comparação e classificação de todos genes encontrados em comum entre elas. Os resultados obtidos ao se comparar três árvores filogenéticas baseadas em diferentes genes, confirmaram que alterar a quantidade e as sequências nas análises, causa variação nas árvores filogenéticas como já observado em outros microrganismos ...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Diverse studies with fixing nitrogen bacteria search to identify responsible genes for the nitrogen fix, nodulation and symbiosis, as well as knowing its genome and understanding the metabolism of them better. However still has few works about genome of Bradyrhizobium elkanii, important bacterium in the context of the production of foods and commercial use. This is the first study to compare 2654 genes of Bradyrhizobium elkanii SEMIA 587, with the bacteria Bradyrhizobium japonicum LGM 6138, Azorhizobium caulinodans LGM 6465, Mesorhizobium huakuii LGM 14107, Rhizobium leguminosarum bv. Trifolii LGM 8820 and Sinorhizobium meliloti LGM 6133 through the CGH Microarray. Therefore aim of this work was to carry a molecular taxonomy through the comparison of genomes for hybridization DNA-DNA, being used the technology of microarrangements of DNA (CGH Microarray), to search new genes that can be useful in the phylogenetic classification of rhizobia. The technique of CGH Microarray allowed to find sixty and five orthologs genes between all the analyzed bacteria, after to carry through comparison and classification of all genes in common between them. The results gotten to if comparing three established phylogenetic trees in different genes, had confirmed that to modify the amount and the sequences in the analyses, cause variation in the phylogenetic trees as already observed in other microorganisms. The results suggest that how much bigger will be the number of used ortholog genes in the phylogeny, more trustworthy will be the gotten phylogenetic trees ...(Complete abstract, click electronic access below) / Doutor

Verificou-se a influência da temperatura e da agitação ótima para o desenvolvimento da estirpe SEMIA 587 de Bradyrhizobium japonicum em fermentador de bancada. A variação da temperatura, nos estudos cinéticos, influenciou de forma mais marcante o desenvolvimento microbiano do que a variação da agitação. Os melhores resultados a nível de rendimento foram obtidos utilizando-se uma temperatura de 28ºC e uma agitação de 230 rpm. Fez-se também um estudo da competição entre as estirpes SEMIA 587 e SEMIA 5019 em fermentador, inoculante turfoso e por sítio de nodulação. A estirpe SEMIA 587, quando desenvolvida conjuntamente com a SEMIA 5019, atingiu aproximadamente 70% da população total após 120 horas de processo. Esta mistura mais as elaboradas com 30, 50 e 70% da estirpe SEMIA 587, foram utilizadas como tratamentos para a inoculação em soja e também para a impregnação em turfa esterilizada. Nestes experimentos observou-se uma predominância da estirpe SEMIA 587, em relação à SEMIA 5019, em fixar nitrogênio e competir por sítios de nodulação e também no inoculante. Os resultados confirmam a possibilidade de utilização dos cultivos mistos, desde que sejam encontradas condições operacionais para o desenvolvimento ótimo das duas estirpes.

Verificou-se a influência da temperatura e da agitação ótima para o desenvolvimento da estirpe SEMIA 587 de Bradyrhizobium japonicum em fermentador de bancada. A variação da temperatura, nos estudos cinéticos, influenciou de forma mais marcante o desenvolvimento microbiano do que a variação da agitação. Os melhores resultados a nível de rendimento foram obtidos utilizando-se uma temperatura de 28ºC e uma agitação de 230 rpm. Fez-se também um estudo da competição entre as estirpes SEMIA 587 e SEMIA 5019 em fermentador, inoculante turfoso e por sítio de nodulação. A estirpe SEMIA 587, quando desenvolvida conjuntamente com a SEMIA 5019, atingiu aproximadamente 70% da população total após 120 horas de processo. Esta mistura mais as elaboradas com 30, 50 e 70% da estirpe SEMIA 587, foram utilizadas como tratamentos para a inoculação em soja e também para a impregnação em turfa esterilizada. Nestes experimentos observou-se uma predominância da estirpe SEMIA 587, em relação à SEMIA 5019, em fixar nitrogênio e competir por sítios de nodulação e também no inoculante. Os resultados confirmam a possibilidade de utilização dos cultivos mistos, desde que sejam encontradas condições operacionais para o desenvolvimento ótimo das duas estirpes.