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Influência da estrutura do habitat e da matriz sobre a assembleia de anfíbios em uma paisagem naturalmente fragmentada

Barreto, Débora Soares 27 March 2014 (has links)
Submitted by Valquíria Barbieri (kikibarbi@hotmail.com) on 2018-04-09T21:31:21Z No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Débora Soares Barreto Grangeiro.pdf: 876950 bytes, checksum: a4bd9bba4c5b3f826bdb3d020031f2b7 (MD5) / Approved for entry into archive by Jordan (jordanbiblio@gmail.com) on 2018-04-26T17:16:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Débora Soares Barreto Grangeiro.pdf: 876950 bytes, checksum: a4bd9bba4c5b3f826bdb3d020031f2b7 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-26T17:16:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Débora Soares Barreto Grangeiro.pdf: 876950 bytes, checksum: a4bd9bba4c5b3f826bdb3d020031f2b7 (MD5) Previous issue date: 2014-03-27 / CAPES / Características do habitat são preditoras da diversidade e distribuição de espécies de anfíbios. Em paisagens fragmentadas, tanto características da mancha de habitat como da matriz circundante podem influenciar na composição das espécies nas manchas. No centro-oeste brasileiro, uma das paisagens que podem ser considerada naturalmente fragmentada para os anfíbios são os campos de murundus. Murundus – montículos de terra que não inundam em meio a campo inundável – podem ser vistos como verdadeiras ilhas ecológicas. O objetivo do presente estudo foi avaliar como a assembleia de anfíbios em campos de murundus é influenciada pela estrutura física do murundu, conectividade e pela matriz circundante. O estudo foi realizado em uma região no norte do Pantanal brasileiro, denominada Pirizal, no município de Nossa Senhora do Livramento, Mato Grosso. Para amostragem de anfíbios foram realizadas três campanhas com a duração de oito dias cada uma. Durante as campanhas, 15 murundus foram amostrados por meio de três pares de armadilhas de interceptação e queda. Para caracterizar a estrutura física do murundu, conectividade e a matriz circundante foram mensurados: perímetro da mancha de gravatá, área de troncos caídos, perímetro da base do termiteiro, altura do murundu, textura do solo, além do número de murundus vizinhos ao amostrado, distância média para os murundus vizinhos e soma dos perímetros dos murundus vizinhos. A influência das variáveis ambientais sobre a riqueza e abundância das espécies de anfíbios foi analisada por meio de regressões lineares múltiplas e a composição, através da Análise de Redundância (RDA). Ao longo do estudo foram registrados 1252 anfíbios, sendo as espécies mais abundantes Leptodactylus fuscus (Leptodactylidae), Pseudopaludicola sp. (Leiuperidae) e Rhinella bergi (Bufonidae). A riqueza e a abundância de anfíbios não foram influenciadas pelas variáveis ambientais. Desse modo, variações na riqueza e na abundância de espécies de anfíbios não podem ser atribuídas nem à estrutura física do murundu, nem à conectividade e matriz circundante. Porém, cerca de 47% da variação da composição de espécies foi explicada por variáveis ambientais, principalmente, relacionada à matriz: soma dos perímetros dos murundus vizinhos. Este descritor refere-se ao padrão geral de cobertura da matriz e seus efeitos refletem o fato de que algumas espécies de anuros estiveram mais associadas a ambientes mais fechados, enquanto outras, a ambientes mais abertos. Leptodactylus elenae e Pseudopaludicola mystacalis, por exemplo, foram mais abundantes em murundus inseridos em matriz com maiores valores de soma dos perímetros dos murundus vizinhos, enquanto Leptodactylus labyrinthicus e Rhinella bergi foram mais abundantes em murundus inseridos em matriz com os menores valores. Os resultados indicam que os anuros são sensíveis a mudanças em ambientes fragmentados, nos quais cada espécie responde às variações de acordo com as suas necessidades e com a disponibilidade de recursos necessários à sua sobrevivência. Além disso, em campos de murundus, as características e integridade da matriz onde os murundus estão inseridos pode ter maior importância sobre a composição de espécies nos murundus do que características estruturais dos próprios murundus. / Habitat characteristics are predictors of the diversity and distribution of amphibian species. In fragmented landscapes, both characteristics of the patchy habitats and of the surrounding matrix might influence the composition of species. In central-western Brazil, earthmound fields can be considered a naturally fragmented landscape for amphibians. Earthmounds – small terrain elevations not subject to floods, although situated in seasonally flooded areas – can be treated as ecological islands. The aim of the present study was to evaluate how the anuran assemblage in earthmound fields is influenced by earthmound physical structure, connectivity and by the surrounding matrix. The study was conducted in the northern portion of the Brazilian Pantanal, in a region called Pirizal, municipality of Nossa Senhora do Livramento, Mato Grosso. Anurans were sampled during three expeditions of eight days each, in a total of 15 earthmounds, by using pitfall traps with drift fences. To characterize the physical structure of the earthmounds was measured: perimeter of patches of terrestrial bromeliads, total area of fallen logs, perimeter of the base of termite mounds, height of the earthmound, and soil texture. To characterize the connectivity and physical structure of the surrounding matrix, for each earthmound was counted the number of neighboring earthmounds, and estimated its mean distance for neighboring earthmounds and the sum of the perimeters of these neighboring mounds. The influence of environmental variables on the richness and abundance of amphibians was analyzed using multiple linear regressions. The influence on species composition was analyzed using the Redundancy Analysis (RDA). A total of 1252 anurans were recorded. Leptodactylus fuscus (Leptodactylidae), Pseudopaludicola sp. (Leiuperidae) and Rhinella bergi (Bufonidae) were the most abundant species. The richness and abundance of amphibians were not influenced by environmental variables. Therefore, local variations in the richness and abundance of amphibian species cannot be attributed neither to the physical structure of the earthmounds, nor to the connectivity and surrounding matrix. However, nearly 47% of the variation in species composition was explained by environmental variables related to the matrix: sum of the perimeters of neighboring mounds. The latter descriptor refers to the vegetation cover pattern of the matrix, and recorded effects reflect the fact that some species of frogs were more associated with forested habitats, while others, to more open habitats. Leptodactylus elenae and Pseudopaludicola mystacalis, for example, were more abundant in earthmounds amidst a matrix presenting a higher sum of perimeters of neighboring mounds, while Leptodactylus labyrinthicus and Rhinella bergi were more abundant in earthmounds amidst a matrix with the lowest values. The results indicate that anurans are sensitive to changes in fragmented environments, in which each species responds to variations according to their needs and also according to the availability of resources necessary for their survival. Moreover, characteristics and integrity of the matrix where earthmounds are inserted may have greater importance to maintain species composition than structural characteristics of the earthmounds themselves.
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Taxonomia e filogenia molecular de Myxozoa parasitas de peixes de água doce oriundos de ambiente natural e de sistema de criação / Taxonomy and molecular phylogeny of Myxozoa parasites of freshwater fish from natural environment and fish farm

Carriero, Mateus Maldonado 12 May 2011 (has links)
O filo Myxozoa possui uma grande diversidade, sendo conhecidas cerca de 2300 espécies, as quais infectam principalmente peixes, mas também anfíbios répteis e aves. Para este estudo, coletas dos peixes de água doce foram realizadas no Pantanal Mato-grossense (estados de Mato Grosso e do Matogrosso do sul) e no Rio Mogi Guaçu e piscicultura do CEPTA/ICMBio (estado de São Paulo), visando estudos moleculares e morfológicos de mixosporídeos parasitas de 6 espécies de peixes. Os resultados das análises moleculares (amplificação e sequenciamento do gene 18S rDNA) e morfológicas revelaram a ocorrência de 11 espécies de mixosporídeos, sendo cinco parasitas comuns a Pseudoplatystoma corruscans e Pseudplatystoma fasciatum, três parasitas de Salminus brasiliensis, uma espécie parasita de Brycon hilarii, uma de Zungaru jahu e outra de Piaractus mesopotamicus. Das onze espécies, cinco ainda não são descritas pela literatura. A análise filogenética, utilizando o método de Neighbor-Joining, mostrou que o agrupamento das espécies ocorre principalmente de acordo com a proximidade filogenética de seus hospedeiros e que todas as espécies da América do Sul agruparam em um clado monofilético. Foi observado, em alguns pontos da árvore filogenética, que o tropismo de tecido e/ou órgão de infecção caracteriza um importante fator de seleção evolutiva. Com menor frequência também foi observado alguns agrupamentos resultantes de parasitas cuja maior relação aparente era a sua localização geográfica, porém, novos estudos ainda são necessários para determinar o verdadeiro papel deste fator na evolução dos mixosporídeos. / The phylum Myxozoa has a great diversity, with about 2300 known species, which infect mainly fishes, but also amphibians, reptiles and birds. In this study, freshwater fishes were caught in the Brazilian Pantanal wetland (Mato Grosso and Mato Grosso do Sul states) and in the Mogi Guaçu River and CEPTA/ICMBio\'s fishfarm (São Paulo state) aiming the molecular and morphological studies of myxosporeans parasites of 6 fish species. The results of molecular (amplification and sequencing of the 18S rDNA gene) and morphological analysis revealed the occurrence of 11 species of myxosporeans, five of them infecting both Pseudoplatystoma corruscans and Pseudoplatystoma fasciatum, three parasites of Salminus brasiliensis, one specie infecting Brycon hilarii, one infecting Zungaro jahu and another infecting Piaractus mesopotamicus. Of these eleven species, five are not yet described by literature. The phylogenetic analysis, using the Neighbor-joining method, showed that the species clustered mainly according to the phylogenetic distance of their hosts and that all species of South America were grouped in a monophyletic clade. In some positions of the phylogenetic tree was observed that tissue tropism and/or organ of infection characterized an important factor in evolutionary selection. Less frequently was also observed some groups containing species which the major apparent relation is its geographical position, however, new studies are still needed to determine the true role of this factor in the evolution of myxosporeans.
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Reprodução experimental de doença ósseo metabólica em jacaré do Pantanal (Caiman yacare) : aspectos clínicos e patológicos

Moraes, Luiz Gustavo de 30 April 2015 (has links)
Submitted by Simone Souza (simonecgsouza@hotmail.com) on 2018-05-02T14:42:48Z No. of bitstreams: 1 DISS_2015_Luiz Gustavo de Moraes.pdf: 5147440 bytes, checksum: 41e93fd987b9ead512830231f79a4931 (MD5) / Approved for entry into archive by Jordan (jordanbiblio@gmail.com) on 2018-05-16T15:08:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISS_2015_Luiz Gustavo de Moraes.pdf: 5147440 bytes, checksum: 41e93fd987b9ead512830231f79a4931 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-16T15:08:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISS_2015_Luiz Gustavo de Moraes.pdf: 5147440 bytes, checksum: 41e93fd987b9ead512830231f79a4931 (MD5) Previous issue date: 2015-04-30 / CNPq / A criação comercial de jacaré-do-pantanal (Caiman yacare) é uma atividade alternativa e legal dentro da Bacia do Rio Paraguai (pantanal matogrossense), que coíbe a caça predatória, preserva a espécie, tem reconhecido potencial econômico para o agronegócio e traz impacto social positivo para agricultura familiar. Em cativeiro, um dos principais problemas para a manutenção desta espécie, são as doenças nutricionais, associadas com dietas mal formuladas. As doenças ósseo-metabólicas (DOM) são frequentes em répteis cativos e comumente definidas como uma série de patologias que afetam a integridade e função óssea. Neste grupo é comum a osteodistrofia fibrosa (osteíte fibrosa cística), doença metabólica relativamente comum, caracterizada por extensa reabsorção óssea, acompanhada pela proliferação do tecido conjuntivo fibroso, e formação de cistos, com frequência, o osteoide aceleradamente formado não se torna mineralizado, formando osso imaturo. A partir da investigação epidemiológica que incluíram ocorrência de doenças, as dietas fornecidas e o manejo comumente adotado, uma DOM frequentemente relatada em criatórios de jacarés-do-pantanal foi reproduzida com o objetivo de caracterizar o quadro clínico e patológico. O estudo foi realizado no Laboratório de Patologia Veterinária, LPV-UFMT, filhotes de jacarés-do-pantanal, com idade aproximada de três meses, os quais foram pesados, medidos e divididos ao acaso em quatro grupos. Foram utilizadas duas dietas, uma balanceada e outra hiperfosfatêmica, cada uma associada à privação e exposição solar, ambas fornecidas cinco vezes por semana, durante seis meses. A evolução da doença foi acompanhada por avaliação clínica, radiográfica e biometria mensal para os parâmetros massa corpórea e comprimento rostro-cloacal, durante todo o período experimental. Ao término desse período, os jacarés foram eutanasiados e tiveram amostras coletadas, para estudos histológicos, através de colorações de eosina e hematoxilina e tricrômico de Masson. Os resultados obtidos, através da biometria mensal, mostraram que a dieta hiperfosfatêmica foi significativa para influenciar 8 negativamente o comprimento rostro-cloacal, ganho de peso e causou manifestação clínica da doença. Não ocorreu alterações significativas em relação a exposição ou privação a radiação solar. A DOM desenvolveu-se insidiosamente, tornando-se mais evidente entre o 3º e o 6º mês após o início do experimento. Os animais afetados mostraram dor quando manuseados, acentuada fraqueza muscular, perda de apetite, em alguns casos caquexia, dificuldade de locomoção e marcado amolecimento ósseo (consistência de borracha), especialmente da mandíbula e maxila e cifose principalmente torácica e lombar. Havia também aumento moderado de volume das paratireoides. O estudo radiográfico mostrou diminuição difusa na densidade do esqueleto, adelgaçamento cortical de ossos longos e deformidades angulares, particularmente da coluna vertebral. Microscopicamente notou-se hipertrofia de células da paratireoide caracterizada por aumento moderado do citoplasma, diminuição da eosinofilia e ocasionalmente vacuolização. Os ossos longos (fêmur e tíbia), chatos (do crânio e mandíbula) e vértebras, apresentavam marcada reabsorção óssea osteoclástica, com variável deposição de tecido conjuntivo fibroso e irregular aumento da atividade osteoblástica com formação de tecido ósseo imaturo. As alterações clínicas, que levaram a doença propriamente dita e a baixa taxa de crescimento atribuída à doença óssea metabólica, foram classificadas morfologicamente como osteodistrofia fibrosa, relacionada ao hiperparatireoidismo nutricional secundário. / The commercial breeding of the swamp alligator (Caiman yacare) is an legal and alternative activity in the region of the River Paraguai (Mato Grosso, Pantanal) that prohibits the illegal hunting, preserves the species and has recognized the economic potential for agribusiness and brings positive social impact to family farming. In captivity, a major problem for the maintenance of the species are the nutritional diseases associated with badly formulated diets. The bone-metabolic diseases (DOM) are common in captive reptiles and commonly defined as a range of disorders affecting bone integrity and function. This group is common to fibrous osteoarthritis (osteitis fibrosa cystica), a relatively common metabolic disorder characterized by extensive bone resorption, accompanied by proliferation of fibrous tissue and the formation of cysts, often the rapidly formed mineralized osteoid not become forming immature bone. From the epidemiological investigation that included the occurrence of diseases, provided diets and management commonly adopted, the DOM often reported in farms alligator-swampland was reproduced in order to characterize the clinical and pathological picture. The study was conducted at the Veterinary Pathology Laboratory, LPV-UFMT, young alligators from the marsh, aged approximately three months, which were weighed, measured and randomly divided into four groups. Two diets were used, and a balanced high phosphatemic another, each associated with withdrawal and exposure, both supplied five times a week for six months. The disease was accompanied by clinical, radiographic and biometrics monthly assessment for body mass parameters and snout-vent length, throughout the experimental period. At the end of that period, the alligators were euthanized and samples were collected for histological studies, through eosin staining and hematoxylin and Masson's trichrome. The results obtained from the monthly biometrics, showed that high phophatemic diet was significant for negative effect on the snout-vent length, weight gain and caused clinical manifestation of the disease. There was no significant changes in relation to exposure to solar radiation or deprivation. The DOM has developed insidiously, becoming more evident between the 3rd and the 6th month after the start of the experiment. Affected animals showed pain when handled, severe muscle weakness, loss of appetite, cachexia in some cases, difficulty of movement and marked bone softening (rubbery consistency), 10 particularly of mandible and maxilla and particularly the thoracic and lumbar kyphosis. There was also moderate enlargement of the parathyroid glands. Radiography showed diffuse decrease in skeletal density, cortical thinning and angular deformations of long bones, particularly the spine. Microscopically was noted parathyroid cells hypertrophy characterized by moderate increase in the cytoplasm, decreased eosinophilia and occasionally vacuolization. The long bones (femur and tibia), flat (skull and jaw) and vertebrae, had marked osteoclastic bone resorption, with variable deposition of fibrous connective tissue and irregular increase in osteoblastic activity with immature bone formation. The clinical, leading to disease itself and the low growth rate attributed to metabolic bone disease, were morphologically classified as fibrous osteodystrophy, related to secondary hyperparathyroidism nutrition.
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Taxonomia e filogenia molecular de Myxozoa parasitas de peixes de água doce oriundos de ambiente natural e de sistema de criação / Taxonomy and molecular phylogeny of Myxozoa parasites of freshwater fish from natural environment and fish farm

Mateus Maldonado Carriero 12 May 2011 (has links)
O filo Myxozoa possui uma grande diversidade, sendo conhecidas cerca de 2300 espécies, as quais infectam principalmente peixes, mas também anfíbios répteis e aves. Para este estudo, coletas dos peixes de água doce foram realizadas no Pantanal Mato-grossense (estados de Mato Grosso e do Matogrosso do sul) e no Rio Mogi Guaçu e piscicultura do CEPTA/ICMBio (estado de São Paulo), visando estudos moleculares e morfológicos de mixosporídeos parasitas de 6 espécies de peixes. Os resultados das análises moleculares (amplificação e sequenciamento do gene 18S rDNA) e morfológicas revelaram a ocorrência de 11 espécies de mixosporídeos, sendo cinco parasitas comuns a Pseudoplatystoma corruscans e Pseudplatystoma fasciatum, três parasitas de Salminus brasiliensis, uma espécie parasita de Brycon hilarii, uma de Zungaru jahu e outra de Piaractus mesopotamicus. Das onze espécies, cinco ainda não são descritas pela literatura. A análise filogenética, utilizando o método de Neighbor-Joining, mostrou que o agrupamento das espécies ocorre principalmente de acordo com a proximidade filogenética de seus hospedeiros e que todas as espécies da América do Sul agruparam em um clado monofilético. Foi observado, em alguns pontos da árvore filogenética, que o tropismo de tecido e/ou órgão de infecção caracteriza um importante fator de seleção evolutiva. Com menor frequência também foi observado alguns agrupamentos resultantes de parasitas cuja maior relação aparente era a sua localização geográfica, porém, novos estudos ainda são necessários para determinar o verdadeiro papel deste fator na evolução dos mixosporídeos. / The phylum Myxozoa has a great diversity, with about 2300 known species, which infect mainly fishes, but also amphibians, reptiles and birds. In this study, freshwater fishes were caught in the Brazilian Pantanal wetland (Mato Grosso and Mato Grosso do Sul states) and in the Mogi Guaçu River and CEPTA/ICMBio\'s fishfarm (São Paulo state) aiming the molecular and morphological studies of myxosporeans parasites of 6 fish species. The results of molecular (amplification and sequencing of the 18S rDNA gene) and morphological analysis revealed the occurrence of 11 species of myxosporeans, five of them infecting both Pseudoplatystoma corruscans and Pseudoplatystoma fasciatum, three parasites of Salminus brasiliensis, one specie infecting Brycon hilarii, one infecting Zungaro jahu and another infecting Piaractus mesopotamicus. Of these eleven species, five are not yet described by literature. The phylogenetic analysis, using the Neighbor-joining method, showed that the species clustered mainly according to the phylogenetic distance of their hosts and that all species of South America were grouped in a monophyletic clade. In some positions of the phylogenetic tree was observed that tissue tropism and/or organ of infection characterized an important factor in evolutionary selection. Less frequently was also observed some groups containing species which the major apparent relation is its geographical position, however, new studies are still needed to determine the true role of this factor in the evolution of myxosporeans.

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