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Calibração em um modelo de crescimento tumoral / Calibration in a tumoral growth model

Leonardo Fabián, Juan Humberto 07 December 2016 (has links)
Submitted by Maria Cristina (library@lncc.br) on 2017-04-25T18:45:24Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Juan_Fabián.pdf: 15964818 bytes, checksum: 6132da2dc6151e30f3b191ee9a3f3ff5 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Cristina (library@lncc.br) on 2017-04-25T18:45:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação_Juan_Fabián.pdf: 15964818 bytes, checksum: 6132da2dc6151e30f3b191ee9a3f3ff5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-25T18:45:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação_Juan_Fabián.pdf: 15964818 bytes, checksum: 6132da2dc6151e30f3b191ee9a3f3ff5 (MD5) Previous issue date: 2016-12-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes) / Cancer is a group of diseases that is causing an incresingly number of deaths worldwide. A crucial step towards battling cancer is to comprehend the biological mechanism behind malignancy. Computational modeling might help to understand tumor evolution, the interplay among the variety of phenomena that take place at di erent time and space scales, as well as the development of new therapies. In this work we apply the phase eld modeling approach to build the mathematical model that depicts the evolution of a vascular tumors. This modeling approach allows to de ne the di erent cell constituents of the tumor microenvironment in a natural and simple way. The developed model, based on the mixture theory, considers healthy and cancer cells and is coupled to a dispersion model for the oxygen, which is the only source of nutrients needed to mantain cell viability. The whole model is solved by using the nite elment method for the space approximation and a semi-implicit Euler method for time approximation, since the expansive part of the energy functional is treated explicitly, yielding an unconditionally gradient stable method. As a rst step towards a reliable model prediction, parameter calibration is performed by using a Bayesian approach. Model calibration aims at estimating every parameter of the model through observational data from tumor evolution. In this study, we only consider the estimation of the proliferative rate, which is one of the most in influential parameter on the evolution of the tumor volume. As a result of the calibration step, we obtain the most probable value parameter as well as its a posteriori probability distribution. / O câncer é um conjunto de doenças que a cada dia vem incrementando o número de mortes a nível mundial. Devido a isso, compreender a biologia da doença tem se tornado crucial para combate-la. A modelagem computacional pode contribuir para o entendimento da evolução tumoral, das inter-relações entre os diversos fenômenos que ocorrem em diversas escalas de tempo e espaço e para o desenvolvimento de novas terapias. Neste trabalho usamos a modelagem de campo de fase como ferramenta para a formulação do modelo matemático que representa a evolução de tumores avasculares. Com este tipo de modelagem é possível definir de forma natural e mais simples a presença de vários tipos de células no microambiente. O modelo desenvolvido, baseado na teoria de misturas, considera apenas células cancerosas e saudáveis, e está acoplado à um modelo de dispersão de oxigênio, considerado a única fonte de nutrientes necessária para a viabilidade celular. Este modelo foi resolvido utilizando o método dos elementos finitos para aproximação espacial e o método de Euler semi-implícito para a aproximação temporal, visto que o termo expansivo do funcional de energia é modelado explicitamente. Esta aproximação confere ao esquema numérico propriedades vantajosas de estabilidade. Como primeiro passo para a obtenção de predições confiáveis, a calibração de parâmetros do modelo resultante é realizada, utilizando a abordagem Bayesiana. A calibração do modelo permite estimar os parâmetros que definem o modelo a partir de dados observados, característicos dos tumores. Neste estudo, focamos na calibração da taxa de proliferação tumoral, considerado um dos parâmetros mais importantes na evolução do volume tumoral. Como resultado, obtemos tanto o valor do parâmetro mais provável quanto a distribuição de probabilidade a posteriori.
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Avaliação da associação dos polimorfismos da enzima conversora da angiotensina (ACE) e ACTN3 na relação potência versus resistência / Evaluation of the polymorphism association of the angiothensine conversion enzyme (ACE) and ACTN3 in the relationship of power to versus resistence

Woellner, Glaucio Neves 22 February 2017 (has links)
O Atletismo é uma modalidade esportiva que possui provas com demandas energéticas diferentes: potência (P) para saltadores, velocistas e lançadores e resistência (R) para corredores de longas distâncias e marcha atlética. É possível observar diferenças destas características com as possíveis variações da frequência do genótipo DD (deleção), II (inserção) e heterozigoto ID na ACE, bem como da frequência genotípica RR, RX e XX na ACTN3. O presente artigo tem por objetivo correlacionar à recorrência do polimorfismo ACE (Enzima Conversora da Angiotensina) da ACTN3 nos atletas de Atletismo. Estudos anteriores relacionaram estes polimorfismos à capacidade física demandada em outras modalidades. A amostra foi composta por 50 atletas (39 homens e 11 mulheres), com idade de 13 a 38 anos, participantes de equipes de atletismo, que foram então agrupados em função da característica de suas provas (Potência ou Resistência). O estudo apresentou diferenças significativas entre as amostras e o esperado para esta frequência pelo equilíbrio de HardyWeinberg (p=0,0067, para o Polimorfismo da ACE e p=0,0143, para o polimorfismo da ACTN3), no que tange a capacidade dominante da prova e também relacionada ao perfil da população brasileira, grupo controle comparado da literatura (p=0,0223, para o Polimorfismo da ACE e p=0,024, para o polimorfismo da ACTN3). O estudo apresentou uma recorrência de 71,7% somados os genótipos DD e ID, corroborando assim com estudos prévios e 33,3% do genótipo II, conflitando assim com pesquisas anteriores. / The Track and Field’s is a sport that has tests with different energy demands: power (P) for jumpers, sprinters and throwers and resistance (R) for runners and race walking long distances. It is possible to observe differences in these characteristics with possible variations of the D allele (deletion) and I (insert). This article recurrence of ACE (Angiotensin Converting Enzyme) in Track and Field’s athletes.Previous studies have linked this polymorphism to the defendant physical capacity in other modes. The sample was composed of 25 athletes (16 men and 10 women) from 13 to 38 years old with participants in a track team, which were then grouped according to the characteristic of this evidence (power or strength). The study showed significant differences between the samples and the expected for this frequency by the Hardy-Weinberg equilibrium (p = 0.0067, for the ACE polymorphism and p = 0.0143 for the ACTN3 polymorphism), regarding the capacity (P = 0.0223, for the ACE Polymorphism and p = 0.024 for the ACTN3 polymorphism). The study presented a recurrence of 71.7% in addition to the DD and ID genotypes, thus corroborating previous studies and 33.3% of genotype II, thus conflicting with previous research.
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Avaliação da associação dos polimorfismos da enzima conversora da angiotensina (ACE) e ACTN3 na relação potência versus resistência / Evaluation of the polymorphism association of the angiothensine conversion enzyme (ACE) and ACTN3 in the relationship of power to versus resistence

Woellner, Glaucio Neves 22 February 2017 (has links)
O Atletismo é uma modalidade esportiva que possui provas com demandas energéticas diferentes: potência (P) para saltadores, velocistas e lançadores e resistência (R) para corredores de longas distâncias e marcha atlética. É possível observar diferenças destas características com as possíveis variações da frequência do genótipo DD (deleção), II (inserção) e heterozigoto ID na ACE, bem como da frequência genotípica RR, RX e XX na ACTN3. O presente artigo tem por objetivo correlacionar à recorrência do polimorfismo ACE (Enzima Conversora da Angiotensina) da ACTN3 nos atletas de Atletismo. Estudos anteriores relacionaram estes polimorfismos à capacidade física demandada em outras modalidades. A amostra foi composta por 50 atletas (39 homens e 11 mulheres), com idade de 13 a 38 anos, participantes de equipes de atletismo, que foram então agrupados em função da característica de suas provas (Potência ou Resistência). O estudo apresentou diferenças significativas entre as amostras e o esperado para esta frequência pelo equilíbrio de HardyWeinberg (p=0,0067, para o Polimorfismo da ACE e p=0,0143, para o polimorfismo da ACTN3), no que tange a capacidade dominante da prova e também relacionada ao perfil da população brasileira, grupo controle comparado da literatura (p=0,0223, para o Polimorfismo da ACE e p=0,024, para o polimorfismo da ACTN3). O estudo apresentou uma recorrência de 71,7% somados os genótipos DD e ID, corroborando assim com estudos prévios e 33,3% do genótipo II, conflitando assim com pesquisas anteriores. / The Track and Field’s is a sport that has tests with different energy demands: power (P) for jumpers, sprinters and throwers and resistance (R) for runners and race walking long distances. It is possible to observe differences in these characteristics with possible variations of the D allele (deletion) and I (insert). This article recurrence of ACE (Angiotensin Converting Enzyme) in Track and Field’s athletes.Previous studies have linked this polymorphism to the defendant physical capacity in other modes. The sample was composed of 25 athletes (16 men and 10 women) from 13 to 38 years old with participants in a track team, which were then grouped according to the characteristic of this evidence (power or strength). The study showed significant differences between the samples and the expected for this frequency by the Hardy-Weinberg equilibrium (p = 0.0067, for the ACE polymorphism and p = 0.0143 for the ACTN3 polymorphism), regarding the capacity (P = 0.0223, for the ACE Polymorphism and p = 0.024 for the ACTN3 polymorphism). The study presented a recurrence of 71.7% in addition to the DD and ID genotypes, thus corroborating previous studies and 33.3% of genotype II, thus conflicting with previous research.

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