Titre de l'écran-titre (visionné le 15 mai 2023) / Le point de départ de ce mémoire-création est Desvelo, un court-métrage que j'ai réalisé, pour en éclater la construction vers une proposition scénique interartistique et fragmentée qui explore d'autres modalités narratives et spatiales que celles du cinéma. En admettant la simultanéité et l'enchevêtrement, cette expérimentation explore la possibilité d'une nouvelle perception du genre filmique et par là même, d'une nouvelle action spectatorielle. La démarche s'inscrit dans les champs du cinéma élargi ainsi que du théâtre postdramatique. S'appuyant sur une réflexion théorique à partir des concepts d'entre-deux et d'écriture quantique, cette création élargit les possibilités d'interprétation et de sens, procurant une expérience unique à chaque spectateur et spectatrice. Cette recherche-création vise à apporter une attention particulière sur ce type de fabrication filmique éclatée, en proposant un éclairage sur les principes et les stratégies qui apparaissent opératoires et qui ont des incidences sur la réception.

En raison de la fonte pluriannuelle des glaces dans l'Océan Arctique et de la fonte de la calotte glaciaire du Groenland, les communautés microbiennes sont exposées à de plus grandes fluctuations de salinité au cours de la saison de croissance et dans de vastes zones géographiques. Les Eaux du Nord très productives ont subi des changements marqués dans les tendances saisonnières de la chlorophylle de surface observées grâce à la télédétection et les données in situ, mais l'interprétation de ces données en termes d'espèces reste difficile puisque la phénologie de la communauté et la variabilité spatio-temporelle sont encore inconnues. Il est essentiel de bien comprendre la dynamique des assemblages de phytoplancton et d'autres espèces microbiennes pour comprendre les réponses des écosystèmes face au changement global. De plus, les grandes fluctuations de salinité ou stress salin et le choc osmotique sont parmi les principaux facteurs environnementaux limitant la croissance et la productivité des plantes et des microorganismes. Pour combler ce manque de connaissance, nous avons premièrement appliqué le séquençage d'amplicon à haut débit pour étudier les communautés microbiennes d'eucaryotes arctiques d'été et d'automne des deux côtés du nord de la baie de Baffin sur plus de 12 ans (2005 à 2018). Ces communautés sont soumises à des régimes de stratification et de courants opposés. Deuxièmement, nous avons étudié la réponse transcriptionnelle d'une microalgue associée à la glace exposée à des salinités progressivement décroissantes afin de mieux comprendre la capacité génétique de cette algue à tolérer les fluctuations de salinité, ainsi que d'identifier les gènes de stress clés. Enfin, nous avons combiné une approche métagénomique comparative avec le séquençage des amplicons d'ARNr 18S pour étudier les capacités fonctionnelles, la diversité et la dynamique des microorganismes dans la colonne d'eau supérieure du nord de la baie de Baffin pendant deux étés consécutifs (2017-2018). Nous avons constaté que la saisonnalité était un facteur majeur déterminant les assemblages de communauté des eaux de surface estivales avec le complexe d'espèces Chaetoceros socialis-gelidus et Micromonas polaris dominant le phytoplancton, et les Alpha et Gammaproteobactéries dominant la communauté bactérienne. En automne, les dinoflagellés d'eau libre non-cultivés et non-décrits étaient favorisés. Nos résultats suggèrent que la production automnale de l'Arctique, due à des conditions d'eau libre plus longue, pourrait ne pas refléter une floraison printanière dominée par les diatomées, comme le prévoient certains scénarios des saisons sans glace plus longues. Par ailleurs, une réponse progressive et une adaptation spécifique aux conditions arctiques froides et salines ont été observées avec l'expression différentielle de plusieurs protéines antigel, comme la protéine de liaison à la glace et une acyl-estérase toutes deux impliquées dans l'adaptation au froid. Nos résultats suggèrent que la protéine de liaison à la glace peut également jouer un rôle crucial dans l'adaptation à un changement rapide de salinité et à la survie cellulaire. Par ailleurs, grâce à l'annotation fonctionnelle, nous avons examiné les gènes impliqués dans la protection des photosystèmes, la régulation osmotique et les protéines antigel, cruciales pour l'acclimatation à un environnement froid. L'utilisation de la génomique comparative permettrait de révéler les évolutions des familles de gènes conférant l'adaptation des microorganismes aux transitions entre eau salée et eau douce. Ce travail de thèse aura des implications non seulement pour l'Arctique où les communautés de surface sont soumises à de grandes fluctuations de salinité, de température et de lumière, mais il contribuera également aux connaissances fondamentales dans les domaines de la production de biocarburants et de la prévision des efflorescences algales potentiellement nuisibles. / As the Arctic Ocean freshens due to multiyear ice and Greenland Ice Sheet melt, the microbial communities are being exposed to greater salinity fluctuations over the growth season and across wide geographic areas. Although remote sensing and limited in situ data have shown that the highly productive North Water has undergone marked changes in the seasonal patterns of surface chlorophyll. Interpreting this data in terms assemblages of species is difficult since the community phenology and spatiotemporal variability is unknown. Understanding the dynamics of phytoplankton and other microbial species assemblages is critical to understand ecosystem responses to global change. Moreover, greater salinity fluctuations or salt stress and osmotic shock are among the main environmental factors limiting the growth and productivity of plants and microorganisms. To address this knowledge gap, firstly, high throughput amplicon sequencing was applied to investigate summer-fall Arctic microbial communities from two sides of Northern Baffin Bay over 12 years (2005 to 2018), that are subjected to very different stratification and major current regimes. Secondly, we investigated the transcriptional response of an ice-associated microalga exposed to progressively decreasing salinities to gain a deeper understanding of the genetic capacity of this alga to tolerate salinity fluctuations, as well as to identify key stress genes. And lastly, we combined comparative metagenomic approach with 18S rRNA amplicon sequencing to investigate the functional capacities, diversity and dynamics of the microorganisms in upper water column of the Northern Baffin Bay during two consecutive summers (2017-2018). We found that seasonality was a major factor determining communities with summer species complex Chaetoceros socialis-gelidus and Micromonaspolaris dominating phytoplankton and Alpha and Gammaproteobacteria dominating bacterial community. In autumn uncultured undescribed open water dinoflagellates were favored. Our results suggest that Arctic autumn production due to longer open water conditions may not mirror a diatom dominated spring bloom as projected in some scenarios of longer ice-free seasons. Furthermore, a gradual response and specific adaptation to cold saline Arctic conditions were seen with differential expression of several antifreeze proteins, an ice-binding protein and acyl-esterase involved in cold adaptation. Our results suggest that ice-binding protein may also have a crucial role for the adaptation of a rapid change of salinity, by providing survival advantage to the cells. Moreover, through functional annotation, we examined potential genes involved in photosystem protection, osmotic regulation and antifreeze proteins, to be crucial for acclimatization to cold environment. The use of comparative genomics would reveal evolutions of gene families conferring adaptation of microorganisms to transitions between salt and fresh water. The combination of these several methodologies provides invaluable insights into the composition, the metabolic repertoire and putative functional profile of a microbial assemblage. This thesis work will have implications not only for the Arctic where surface communities are subject to large fluctuations in salinity and light but will also contribute to fundamental knowledge in the fields of biofuel production and harmful algal bloom prediction.

Le large éventail d'applications du système CRISPR-Cas a conduit à des innovations biotechnologiques qui sont sur le point de transformer l'industrie pharmaceutique actuelle. Néanmoins, l'atteinte d'un haut niveau d'efficacité à un gène cible reste encore aujourd'hui un défi pour l'édition du génome. Ceci est dû principalement à la capacité encore limitée de modifier tous les sites du génome humain, tout comme le faible taux de recombinaison homologue obtenu chez les cellules de mammifères. Ainsi, l'optimisation des processus de modification génique s'avère indispensable pour favoriser les diverses utilisations de l'édition du génome. Dans cette thèse, il a été question de (i) développer une méthode d'enrichissement de cellules génétiquement modifiées et (ii) augmenter la polyvalence de l'édition du génome en augmentant la plage de ciblage du système CRISPR-Cas9 dans le génome humain. L'objectif de la première partie de cette thèse visait à étudier la fonctionnalité du gène ATP1A1, codant pour la pompe sodium/potassium (Na⁺/K⁺ ATPase), comme marqueur endogène de l'édition du génome. Dans ce sens, nous avons modifié la sensibilité de cette pompe pour l'ouabaïne en insérant des mutations dominantes dans le locus ATP1A1, ce qui a permis de générer des cellules résistantes à l'ouabaïne. La capacité de multiplexage du système CRISPR-Cas permet de co-cibler simultanément ATP1A1 et le locus d'intérêt, où il est possible d'enrichir des évènements de réparation par NHEJ ou par RH dans les deux locus à la suite de l'ajout d'ouabaïne. Ainsi, nous avons démontré que cette approche peut être appliquée non seulement aux lignées cellulaires, mais aussi aux cellules primaires ce qui permet d'envisager une possible utilisation pour le développement thérapeutique ex vivo. Dans le deuxième objectif de cette thèse, il était question d'optimiser le système CRISPR1-Cas9 de Streptococcus thermophilus dans le but d'élargir le répertoire de nucléases pour l'édition du génome. Dans ce sens, nous avons optimisé l'expression de l'ARN guide et nous avons caractérisé diverses variantes de St1Cas9 permettant de cibler des régions riches en A/T. Autant sous forme de nucléase que d'éditeur de base, l'application de nos variantes de St1Cas9 in vitro a permis d'obtenir des hauts taux d'édition du génome humain. Ainsi, la taille de St1Cas9 est idéale pour sa vectorisation avec son ARN guide dans un seul vecteur adéno-associés (AAV). Dans ce sens, nous avons démontré que l'administration du vecteur AAV-St1Cas9 permet de sauver la létalité et les anomalies métaboliques dans un modèle murin de tyrosinémie héréditaire de type I. En tout, ces travaux illustrent des outils permettant d'augmenter le rendement d'édition et l'ouverture de nouvelles régions géniques pouvant être ciblées à l'intérieur du génome humain à l'aide du système CRISPR-Cas9. Ainsi, nous avons démontré la fonctionnalité des outils développés au cours de ce projet de thèse pour diverses applications ex vivo et in vivo, permettant ainsi d'élargir le potentiel thérapeutique de l'édition du génome.

Le complexe de Bay of Islands (BOI), situé sur la côte ouest de Terre-Neuve au Canada, est l'un des systèmes de subduction fossiles les mieux préservés de la planète. Le complexe de BOI est constitué de matériel allochtone mis en place sur le continent Laurentia lors de la phase Taconienne de l'orogénèse Appalachienne. Il se compose d'une ophiolite reposant sur une semelle métamorphique. La semelle métamorphique de BOI comprend, du sommet vers la base, des granulites à grenat et clinopyroxène, des amphibolites à grenat et clinopyroxène, des amphibolites communes et des roches métasédimentaires. Deux types de protolithes peuvent être distingués parmi la portion mafique de la semelle : des protolithes cumulatifs gabbroïques avec des Mg# élevés et des compositions appauvris en éléments traces ainsi que des protolithes basaltiques avec des contenus en éléments traces similaires à des N-MORB. La datation de titanite provenant de deux amphibolites communes permet de fixer un âge minimum pour le métamorphisme à 485 ± 4 Ma. Les données détritiques U-Pb sur zircon de la partie métasédimentaire de la semelle de BOI forment un spectre d'âges allant de l'Archéen à l'Ordovicien dominé par la population la plus jeune dont le pic se situe à c. 490 Ma. Ce pic est interprété comme l'âge maximal de déposition des sédiments. L'origine de ces jeunes détritus peut être attribuée au magmatisme associé à l'orogénie Taconienne. Les données obtenues indiquent que 1) l'initiation de la subduction responsable de la formation du complexe de BOI s'est produite dans le domaine océanique possiblement à une faille de détachement avant c. 485 Ma et 2) les sédiments constituant la partie métasédimentaire de la semelle proviennent de la plaque supérieure et se sont déposés sur la plaque inférieure lorsque la subduction était déjà en cours.

Cette recherche vise à étudier la relation entre la morphologie urbaine, les microclimats et le confort thermique dans les espaces publics extérieurs par des relevés dynamiques in situ. En milieu urbain, les paramètres microclimatiques tels que la chaleur et la lumière peuvent varier en fonction de l'espace et du temps. Ces variations souvent générées par la morphologie urbaine peuvent être plus au moins appropriées aux conditions du confort thermique et visuel, dépendamment des facteurs tels que les conditions climatiques, la forme des constructions, la nature de l'espace et son mode d'occupation. C'est dans une optique plutôt physiologique que nous avons exploré la diversité de l'environnement thermique et visuel en milieu urbain. Le but est de démontrer l'effet de cette dynamique environnementale sur la perception des ambiances thermiques et visuelles d'un piéton. Les données sur l'environnement thermique et visuel de trois tissus urbains situés au centre-ville de Québec ont été mesurées en mouvement à l'aide d'un appareil portatif de mesure des ambiances physiques (APMAP-4). Les calculs des indicateurs de la morphologie urbaine sont basés sur plusieurs techniques (mesure sur carte, traitement d'images satellites et relevés photographiques). Le croisement des données a permis de (1) démontrer la dynamique de l'environnement thermique et visuel d'un parcours urbain, (2) d'analyser les conditions du confort thermique de trois tissus urbains et (3) d'identifier les différents niveaux d'adaptation caractérisant un parcours urbain pendant une journée typique d'été et l'automne.

Thèse en cotutelle. Doctorat en didactique: Université Laval, Québec et Université de Toulouse Le Mirail, Toulouse, France. / Tableau d’honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2012-2013. / Nous soutenons que l’enseignement de la lecture littéraire, au lycée et au cégep, peut contribuer à former des sujets lecteurs divers, c’est-à-dire des sujets pluriels, changeants et contradictoires, situés dans une historicité, mais capables de s’en distancier de manière réflexive, et ce, grâce à la médiation du texte lu et à celle des autres lecteurs du texte. Premièrement, nous avons élaboré un modèle de compréhension de la diversité des sujets lecteurs, basé sur la critique d’une conception unitaire, homogène et essentialiste du sujet que l’école devrait former et de la culture qu’elle souhaite transmettre. Deuxièmement, nous avons étudié dans quelle mesure la diversité des interprétations effectivement produites par les élèves peut constituer une médiation efficace de la compréhension de soi-même et d’autrui comme sujet lecteur divers. Cette compréhension reposant sur la confrontation entre les interprétations produites successivement par un même lecteur et simultanément par plusieurs lecteurs, elle est nécessairement transitoire, fragmentaire, intersubjective et réflexive. Troisièmement, nous avons décrit et expliqué comment des élèves élaborent plusieurs interprétations d’un texte littéraire, à la fois en mobilisant les diverses ressources de leur subjectivité et en s’appropriant des éléments interprétatifs coconstruits avec leurs pairs et leur enseignant. En cohérence avec ces visées herméneutiques et praxéologiques, nous avons conçu une séquence d’enseignement, axée sur La plage des songes de S. Péan (1998), intégrant des activités individuelles et collaboratives de lecture, d’écriture et d’oral. Ce dispositif a été expérimenté par deux enseignants, dans une classe de seconde en France et dans une classe de cégep au Québec. Notre méthodologie qualitative vise la compréhension approfondie de sept parcours de lecteurs, grâce au croisement de données recueillies par le biais d’observations de cours, de textes d’élèves et d’entretiens. L’étude multicas confirme que les élèves sont capables de mettre en relation diverses ressources subjectives (cognitives, épistémiques, psychoaffectives, socioculturelles, axiologiques), de mettre à distance leurs interprétations et celles de leurs pairs et de réfléchir sur leur expérience lectorale. Les échanges intersubjectifs (en particulier les comités de lecteurs) jouent un rôle significatif dans la compréhension réflexive par les élèves de la singularité et de la diversité de leur parcours interprétatif. / We argue that literary reading education, at secondary school and CEGEP levels, can contribute to the development of diverse subject readers—i.e., plural, changing and contradictory subjects—within a historical perspective but able to distance themselves reflexively, aided by their own interpretation of the text and the interpretations of other readers. Firstly, we developed a model for understanding subject reader diversity, based on the critical analysis of a uniform, homogeneous and essentialist concept of the subject that the school should teach and the culture that it wishes to pass on. Secondly, we examined to what extent the diversity of interpretations actually produced by students can effectively establish the mediation of the understanding of self and others as a diverse subject reader. This understanding is inevitably transitory, fragmented, intersubjective and reflexive, given that it is based on the confrontation between different interpretations produced successively by the same reader and simultaneously by several readers. Thirdly, we described and explained how students develop several interpretations of a literary text by using their various subjectivity resources while at the same time appropriating interpretive elements developed jointly with their peers and teacher. In keeping with these hermeneutic and praxeological objectives, we have designed a teaching sequence, based on La plage des songes by S. Péan (1998). This sequence incorporates individual and collaborative reading, writing and speaking activities. It was tested by two teachers, during the first year of lycée studies in France and as part of a CEGEP-level course in Quebec. Our qualitative methodology is intended to promote thorough understanding of seven reader paths, using data gathered through classroom observation, student texts and interviews. This multi-case study confirms that students are capable of linking different subjective resources (cognitive, epistemic, psycho-emotional, sociocultural, axiological), taking a step back from their interpretations and those of their peers, and reflecting on their reading experience. Intersubjective exchanges (particularly between the reading committees) play a significant role in students’ reflexive understanding of the singularity and diversity of their interpretative paths.

La présente recherche s'inscrit dans une démarche de diffusion du savoir sur les ambiances architecturales et urbaines. Elle propose d'aider à la lecture des ambiances physiques, à travers une technique de représentation compilant dans une interface numérique deux types de données, sensorielles et filmiques. Ces données sont relevées grâce à un casque muni de senseurs (APMAP, Potvin 1997, 1999, 2004) ainsi que la prise d'information vidéo de l'environnement en mouvement. La méthode est baptisée APMAP/Vidéo. Le mémoire en présente les différentes phases de développement ainsi que son utilisation dans une étude de cas. Le chapitre 1 traite des ambiances physiques dans leur fonctionnement et leurs composantes, puis dresse un bilan sur les modes de représentation adaptés à celles-ci. Le chapitre 2 introduit la technique APMAP/VIDÉO, ses critères de développement et le choix des outils. Le chapitre 3 présente les étapes de réalisation. Le chapitre 4 porte sur l'application de la technique dans le cadre d'un relevé. Le chapitre 5 dresse finalement le bilan de la technique, les avantages et les limites de son utilisation. Étant donné que la technique élaborée exploite la dimension spatiale et temporelle des ambiances, son mode de représentation est dynamique. Un CD ROM accompagne le texte, permettant de visualiser les séquences des différentes versions, du prototype à la version finale, ainsi que les fichiers informatiques nécessaires à une utilisation éventuelle.

Ce mémoire s'intéresse à la construction identitaire des étudiants originaires de milieux francophones minoritaires au Canada. Dans une perspective sociologique, cette recherche est basée sur une étude de cas auprès de 21 étudiants francophones originaires de la Saskatchewan, de l'Ontario et du Nouveau-Brunswick. La cueillette des données a été réalisée à partir d'entretiens individuels semi-dirigés de type récits de vie. Les données ont été analysées à partir d'un cadre théorique qui s'inscrit dans la perspective de l'interactionnisme symbolique. Selon cette approche, l'identité est le produit des diverses interactions que vit un individu au cours de sa vie. Les résultats de l'analyse des épisodes d'interaction montrent que le contact avec l'autre conduit à une négociation qui permet aux étudiants de se (re)définir et de se (ré)affirmer au plan identitaire. Ce mémoire contribue au développement de connaissances utiles dans le champ de l'orientation en ce qui concerne les transitions étudiantes et la construction identitaire.

The purpose of this study was to evaluate the role of client-directed choice in treatment for a child with childhood apraxia of speech (CAS), as compared to a lack of client-directed choice. One way to exercise control over practice conditions is through incidental choices. In studies of non-speech motor learning, offering opportunities for incidental choice to the learner, thus increasing their autonomy, has been shown to enhance learning (Wulf & Lewthwaite, 2016). Increasing client engagement and buy-in could maximize their level of motivation in treatment, and lead to better learning outcomes. This study used a single-case, alternating treatments design consisting of two conditions (Child-choice and Clinician-choice). The treatment employed prosodic variation during speech practice; the speech practice involved the ASSIST protocol (Maas et al., 2022). Options for prosodic variation were presented using the name and vocal characteristics of three different emotional tones (happy, sad, and angry). Each treatment session alternated between two conditions. In the first condition, the participant chose the tone in which to practice each target. In the second condition, the clinician chose the tone. The primary outcome measure was accuracy, as judged by blinded listeners from recordings. Effect sizes were computed and compared between conditions to address the primary research question (Does client-directed choice enhance learning compared to clinician-directed choice?). Comparison between treated item sets and untreated item sets provided a replication of the overall ASSIST protocol. Preliminary results to date showed no clear effects for either autonomy or treated vs. untreated sets. / Communication Sciences

Ce mémoire examine le rôle de l'action communautaire au Québec dans la réalisation de la justice alimentaire. Au moyen des outils ethnographiques propres à l'anthropologie, un cas y est examiné en détails : le projet MAÏS réalisé dans la MRC de Portneuf, qui cherche à favoriser la sécurité alimentaire des habitantes et habitants de la région. L'action de cette initiative y est analysée à travers trois des principales dimensions du concept de justice alimentaire, soit la portée de l'action (de palliative à transformatrice), la reconnaissance des inégalités structurelles et les processus démocratiques. Y sont mises en évidence les forces et les limites de l'action communautaire pour favoriser la justice sociale dans le système alimentaire. L'utilisation du concept de justice alimentaire ayant peu pénétré les milieux de la recherche francophone, en particulier ceux du Québec, ce mémoire cherche à ouvrir ce champ en proposant une adaptation de ses outils au contexte québécois. / This master's thesis examines the role of community action in Quebec in achieving food justice. Using ethnographic tools, a case is examined in detail: the MAÏS project carried out in the MRC of Portneuf, which seeks to promote food security for the inhabitants of the region. This initiative is analyzed through three of the main dimensions of the food justice concept, namely the scope of the action (from palliative to transformative), the recognition of structural inequalities and democratic processes. It highlights the strengths and limitations of community action to promote social justice in the food system. The use of the concept of food justice having little penetrated the French-speaking research circles, in particular those of Québec; this thesis seeks to open this field by proposing an adaptation of its tools to the context of the province of Québec.