Orientador: Paulo Mazzafera / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-17T19:01:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DominguesJunior_AdilsonPereira_M.pdf: 2226269 bytes, checksum: 6e8a3f3315cad57c394a7eecc3145113 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: O glyphosate é considerado o herbicida mais utilizado em todo mundo. Seu mecanismo de ação baseia-se no bloqueio da rota do chiquimato, interrompendo a síntese dos aminoácidos aromáticos. Observa-se que a sua aplicação de maneira incorreta permite que uma parcela do ingrediente ativo chegue à cultura não-alvo, caracterizando a deriva. O café aparece como a segunda mais importante commodity no mercado internacional, com o Brasil como principal produtor. Neste trabalho, avaliou-se o impacto que o herbicida glyphosate teria na cultura de café, em uma condição de deriva simulada via pulverização foliar e via contaminação de três diferentes tipos de solos: argiloso, arenoso e rico em matéria orgânica. Análises revelaram que, em baixas concentrações, o glyphosate pode reduzir a taxa fotossintética do cafeeiro, mas estimular a síntese de pigmentos foliares. Também foi observado um aumento do conteúdo de compostos fenólicos, configurando-se como um possível caso de hormese. Quando aplicado nas folhas, o herbicida foi transportado para frutos em desenvolvimento. Nos frutos, o herbicida alterou o metabolismo de diversos compostos importantes para a bebida do café, tais como a cafeína e açúcares. Assim, este trabalho apresenta-se como um dos primeiros a investigar as alterações induzidas pelo herbicida glyphosate em plantas de café e a relatar a hormese provocada pelo herbicida sobre seus metabólitos secundários / Abstract: Glyphosate is the most widely used herbicide worldwide. Its mechanism of action is based on the blockage of the shikimate pathway, hindering the biosynthesis of the aromatic amino acids. Its incorrect application allows a portion of the active ingredient to reach the non-target crop, characterizing the drift. Coffee is the second commodity in the international market, and Brazil is the main producer. Here, we studied the impact that the herbicide glyphosate would have on coffee plants, in a condition where drifting was simulated by foliar sprays and contamination of three different soils: clay, sandy and rich in organic matter. Our data revealed that, at low concentrations, glyphosate may reduce photosynthesis, but it can stimulate the biosynthesis of leaf pigments. An increase of phenolic compounds was also observed, suggesting a possible hormesis effect. When applied to the leaves, the herbicide was transported to developing fruits and in the fruits the metabolism of important compounds for the coffee beverage, such as caffeine and sugar, was altered. Thus, this work presents itself as one of the first to investigate the impact of glyphosate herbicide on the coffee tree and report the hormesis caused by the herbicide on secondary metabolites of coffee / Mestrado / Biologia Vegetal / Mestre em Biologia Vegetal

Orientador: Marcelo Menossi Teixeira / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-05T11:53:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mondego_JorgeMauricioCosta_D.pdf: 1365745 bytes, checksum: d2f496fe8deacf2a20e24327a8f483dc (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: O café é um dos principais produtos agrícolas mundiais. O Brasil é um dos maiores países produtores e consumidores de café. Assim sendo, a cafeicultura possui extrema importância econômica em nosso país. Um dos principais fatores que causam prejuízo à lavoura do café é o ataque do bicho mineiro (Leucoptera coffeella), pois Coffea arabica, principal espécie cultivada do café, é suscetível a essa praga. O Instituto Agronômico de Campinas (IAC) empreende um projeto de melhoramento de Coffea arabica, visando a resistência ao bicho mineiro, através de cruzamentos com C. racemosa, espécie naturalmente resistente a L. coffeella.Neste trabalho isolamos genes diferencialmente expressos durante o ataque do bicho mineiro a plantas de uma progênie híbrida derivada de cruzamentos entre Coffea arabica e C. racemosa. Foram construídos macroarranjos de DNA contendo 1536 ESTs de bibliotecas de subtração enriquecidas em genes preferencialmente expressos em plantas resistentes infestadas. Membranas foram hibridadas com sondas de cDNA obtidas a partir de RNA total de folhas suscetíveis e resistentes ao bicho mineiro, em diferentes momentos da infestação (controle não infestado, pósoviposição e pós-eclosão). Após análises estatísticas e clusterização hierárquica, 21 cDNAs induzidos em pelo menos um tratamento foram selecionados como diferencialmente expressos durante a infestação do bicho mineiro. A expressão diferencial de cinco genes (PR-8, CAX9, SPC25, psaH, BEL) foi confirmada através de RNA blot contendo RNA de um segundo experimento de infestação, demonstrando a eficiência dos macroarranjos de DNA na seleção de genes diferencialmente expressos. O padrão de expressão dos cinco genes citados foi verificado em diferentes órgãos do cafeeiro e durante o desenvolvimento do fruto do café. Nossos resultados sugerem que o mecanismo de resistência ao bicho mineiro é derivado de uma maior expressão basal de genes relacionados a defesa em plantas resistentes do que em plantas suscetíveis, e que plantas resistentes possuem um mecanismo de sinalização de defesa disparado pela oviposição de L. coffeella. Dentre os cDNAs selecionados, destacamos SSH101B04, cuja proteína deduzida é similar a inibidores de protease do tipo Kunitz STI (Soybean Trypsin Inhibitor). Devido a sua alta similaridade com proteínas do tipo miraculina, esse gene foi denominado CoMir (Coffea Miraculin). CoMir foi induzido após a oviposição em plantas resistentes, mas não foi induzido após a eclosão da lagarta do minador em plantas resistentes nem em plantas suscetíveis. Através de ensaios de RNA blot foi verificado que CoMir é expresso em folhas, botões florais verdes e brancos e em frutos verdes imaturos. Ensaios de hibridação in situ demonstraram que CoMir é expresso no metaxilema de folhas, de pétalas e do estigma, e no estômio, endotécio, tapete e feixe vascular da antera. Ensaios de localização subcelular demonstraram que a proteína CoMir localizou-se preferencialmente no apoplasma e no citoplasma de células de epiderme de cebola (Allium cepa). Nossos resultados sugerem que CoMir é uma proteína reguladora de proteólise durante o desenvolvimento do café, que é mobilizada para defesa após a oviposição de L. coffeella / Abstract: Coffee is one of the most important crops in the world. Brazil is one of the biggest coffee producer and consumer countries. Therefore, coffee plantations have great relevance in our country. One of the main factors that affect coffee plantations is the attack of the coffee leaf miner (Leucoptera coffeella). This is due to the susceptibility of Coffea arabica, the main cultivated species. The Agronomic Institute of Campinas (IAC) develops a Coffea arabica breeding program aiming the resistance to the infestation of coffee leaf miner, using crosses with C. racemosa, a resistant species. In this work, we have isolated differentially expressed genes during L. coffeella attack to plants of a hybrid progenie between C. arabica and C. racemosa. We have produced cDNA arrays containing ESTs from subtracted cDNA libraries enriched in genes preferentially expressed in infested resistant plants. Arrays were probed with samples from susceptible and resistant leaves, in different treatments (control noninfested, after oviposition and after caterpillar eclosion). After statistical analysis and hierarchical clustering, 21 cDNA clones induced in at least one treatment were selected as differentially expressed during coffee leaf miner infestation. The differential expression of five genes (PR-8, CAX9, SPC25, psaH, BEL) was confirmed by RNA blot containing samples from a second infestation experiment, demonstrating the efficiency of DNA arrays in the identification of differentially expressed genes. The expression profile of these five genes was verified in different organs of coffee plants and during coffee fruit development. Our results suggest that the resistance mechanism against coffee leaf miner is derived from a higher basal expression of defense/stress genes in resistant plants, and that resistant plants have a defense signaling mechanism triggered by L. coffeella oviposition. Among the selected cDNAs, we identified SSH101B04, which deduced protein is similar to Kunitz STI (Soybean Trypsin Inhibitor) protease inhibitors. The gene was named CoMir due to its high similarity to miraculin-like proteins. CoMir was induced after oviposition in resistant plants, but it was not induced after larval eclosion in susceptible and resistant plants. RNA-blot experiments showed that CoMir was expressed in leaves, green flower buds, white flower buds and early green fruits. In situ hybridization showed that CoMir is expressed in the metaxylem vessels of leaves, petals and stigma and in the stomium, endothecium and vascular bundles of anthers. Subcellular localization assays demonstrated that CoMir was localized in the apoplasm and citoplasm of onion (Allium cepa) epidermal cells. Our results suggest that CoMir is a protein that regulates proteolysis during coffee development that is mobilized to defense after L. coffeella oviposition / Doutorado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Doutor em Genetica e Biologia Molecular

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-06-14T17:15:28Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1088159 bytes, checksum: 3e4a1e4b87da8b32eca25f8a7f62ba92 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-14T17:15:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1088159 bytes, checksum: 3e4a1e4b87da8b32eca25f8a7f62ba92 (MD5) Previous issue date: 2017-07-07 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O Coffea arabica L. é a espécie de maior importância econômica e o desenvolvimento de cultivares resistentes às principais doenças do cafeeiro, como a ferrugem (Hemileia vastatrix) e a antracnose dos frutos (Colletotrichum kahawae), é importante para obter estabilidade produtiva e diminuição dos custos de produção. Para aumentar a eficiência de seleção de cafeeiros superiores no melhoramento genético deve-se realizar a caracterização morfoagronômica dos materiais genéticos a serem selecionados e a estimação dos valores genéticos dos indivíduos. Além disso, aliar essas metodologias à seleção assistida por marcadores moleculares (SAM) é uma forma de minimizar as limitações da seleção puramente fenotípica. Essa estratégia reduz o tempo e o custo para seleção e, para a resistência a doenças, permite a busca de resistência duradoura e de amplo espectro por meio da piramidação de genes. Portanto, objetivou-se identificar cafeeiros para avanço de geração no programa de melhoramento por meio de seleção baseada na metodologia de modelos mistos (REML/BLUP) aliada à seleção assistida por marcadores. Para isso, sete características morfoagronômicas foram utilizadas para avaliar a diversidade genética, estimar os parâmetros genéticos e quantificar os ganhos com a seleção de famílias em melhoramento. Cafeeiros resistentes a doenças em campo foram analisados com marcadores moleculares para identificar indivíduos portadores de genes que conferem resistência a diferentes raças de H. vastatrix e resistência a C. kahawae, visando a piramidação de genes e obtenção de resistência múltipla. As populações analisadas neste trabalho fazem parte do Programa de Melhoramento Genético do Cafeeiro desenvolvido pela Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais (EPAMIG), em parceria com a Universidade Federal de Viçosa (UFV), a Universidade Federal de Lavras (UFLA) e a Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa Café). As plantas que deram origem a essas populações, por serem potenciais fontes de resistência à H. vastatrix, foram introduzidas pela UFV, oriundas do Centro de Investigação das Ferrugens do Cafeeiro (CIFC), localizado em Oeiras/Portugal. Com base nas características morfoagronômicas e análise de agrupamento, observou-se alto grau de parentesco entre as famílias. O índice de seleção permitiu selecionar nove famílias, com ganhos de seleção superior a 26% em relação à população original. Com base em marcadores moleculares, das nove famílias selecionadas, oito apresentaram em suas progênies o gene S H 3 de resistência a H. vastatrix e a outra o gene Ck-1 de resistência a C. kahawae. A SAM permitiu, ainda, identificar uma família que embora não tenham sido selecionada nas análises morfoagronômicas, é portadora do gene para resistência às raças I, II e patótipo 001 de H. vastatrix. Os cafeeiros selecionados pelas características morfoagronômicas e SAM foram superiores às testemunhas e apresentaram genes em indivíduos diferentes, que conferem resistência às principais doenças do cafeeiro, ferrugem e C. kahawae. Esses cafeeiros podem ser utilizados como fonte de resistência para novos cruzamentos. Além disso, buscou-se avaliar novas fontes de resistência em outra população, no qual a SAM permitiu identificar 31 famílias portadoras do gene S H 3, duas com o gene Ck-1, seis para o QTL ligado ao grupo de ligação 2, e duas para o QTL ligado ao grupo de ligação 5. Esses diferentes genes foram encontrados isolados em alguns cafeeiros e também piramidados em outros, com diferentes combinações. Os cafeeiros selecionados poderão ser utilizados para avanço de geração no melhoramento e como fontes para piramidação de genes nos programas de melhoramento com vista a obter cultivar com resistência múltipla e durável. / Coffea arabica L. is the most economically important species and the development of resistant cultivars to the main coffee plants diseases, such as rust (Hemileia vastatrix) and fruit anthracnose (Colletotrichum kahawae), is important to obtain productive stability and production costs decrease. In order to increase the selection efficiency for superior coffee plants in genetic improvement, the morphological analysis of the genetic material to be selected and the estimation of the individuals’ genetic values should be carried out. In addition, combining these methodologies with molecular marker-assisted selection (MAS) is a way of minimizing the purely phenotypic selection limitations. This strategy reduces time and selection cost and, for disease resistance, allows the search for long- lasting and wide spectrum resistance through gene pyramidation. Therefore, this study’s objective was to identify coffee plants for the breeding program advance generation, based on mixed models selection (REML/BLUP), combined with markers assisted selection. For this, seven morphoagronomic characteristics were used to evaluate genetic diversity, to estimate the genetic parameters and to quantify the gains with families’ selection in breeding. Field-resistant coffee plants were analyzed with molecular markers to identify individuals carrying genes that confer resistance to different strains of H. vastatrix and resistance to C. kahawae, aiming at genes pyramiding of and obtaining multiple resistance. The populations analyzed in this work are part of the Coffee Breeding Program developed by the Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais (EPAMIG), in partnership with the Universidade Federal de Viçosa (UFV), the Universidade Federal de Lavras (UFLA) and the Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa Café). The plants that gave origin to these populations, being potential resistance sources to H. vastatrix, were introduced by the UFV, from the Centro de Investigação das Ferrugens do Cafeeiro (CIFC), located in Oeiras/Portugal. Based on the morphoagronomic characteristics and cluster analysis, a high kinship degree between families was observed. The selection index allowed nine families to be selected, with selection gains higher than 26% in relation to the original population. Based on molecular markers, eight out of the nine families selected had H. vastatrix resistance S H 3 gene and the Ck-1 gene resistance to C. kahawae in their progenies. The MAS also allowed to identify a family that although has not been selected by the morphoagronomic analyzes, it is a carrier of the resistance gene to the races I, II and to H. vastatrix 001 pathotype. The coffee plants selected by MAS and morphological characteristics were superior to the controls and presented genes in different individuals, which confer resistance to the main coffee plants diseases, rust and C. kahawae. These coffee plants can be used as a resistance source for new crossings. In addition, new resistance sources in another population were evaluated, in which MAS allowed to identify 31 families carrying S H 3 gene, two with Ck-1 gene, six for the QTL linked to the linkage group 2, and two for the QTL linked to the linking group 5. These different genes were found isolated in some coffee plants and also pyramidal in others, under different combinations. The selected coffee plants may be used for generation advance and as gene pyramiding sources in breeding programs aiming to obtain a durable and multiple resistant crop.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-11-11T13:05:18Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2270168 bytes, checksum: 4d5c7476f158ba98a5b02380751d66af (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-11T13:05:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2270168 bytes, checksum: 4d5c7476f158ba98a5b02380751d66af (MD5) Previous issue date: 2014-08-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Foi avaliado o efeito da presença de uma árvore que possui nectários extraflorais (Inga sp., Fabaceae) no controle do bicho-mineiro do cafeeiro (Leucoptera coffeella) e broca- do-café (Hypothenemus hampei) em cafeeiros sob sistemas agroflorestais. A disponibilidade de néctar em árvores de Ingá aumentou o parasitismo do bicho-mineiro e diminuiu os danos em plantas de café. Para elucidar os mecanismos envolvidos no controle das pragas do café em sistemas agroflorestais foi avaliado o efeito do néctar, como uma fonte de alimento, no fitness de inimigos naturais das pragas do café. Em laboratório, foi avaliado o efeito de um alimento rico em açúcar, semelhante ao néctar, na biologia de um tripes predador que foi encontrado dentro de frutos brocados de café e se alimentando nos nectários dos Ingás nos sistemas agroflorestais. Além disso, foi avaliado o efeito da predação do tripes na população de brocas no interior de frutos brocados. A sobrevivência do tripes aumentou com a fonte de alimento rica em açúcar. No entanto, o tempo de desenvolvimento das larvas aumentou e eles não atingiram a idade adulta, a não ser quando foram alimentados com a broca-do-café. A predação do tripes não foi suficiente para diminuir a população de brocas-do-café no interior dos frutos. O efeito do néctar extrafloral do Ingá na sobrevivência de inimigos naturais do bicho-mineiro também foi avaliado. A sobrevivência de quatro espécies de parasitoides e de uma espécie de crisopídio aumentou quando se alimentaram de néctar extrafloral. Por fim, foi realizado um experimento em campo para comparar a produção do café, os danos no cafeeiro e o parasitismo e a predação das pragas entre café em monocultivo e café consorciado com árvores de Ingá. Para avaliar o efeito da proximidade das árvores na proteção do café, a produção e o controle de pragas foram avaliados ao longo de transectos de 50 m se estendendo a partir das árvores Ingá. O peso dos frutos do café aumentou quando o café foi consorciado com árvores Ingá. Os danos causados pelo bicho-mineiro e pela broca-do-café também foram menores no café consorciado e aumentou com a distância das árvores. O parasitismo e predação das pragas do café não respondeu significativamente à presença das árvores, mas mostrou a tendência esperada. Portanto, árvores de Ingá com nectários extraflorais aumentam o controle natural de pragas e a produção em cultivos cafeeiros. / The effect of the presence of an extrafloral nectary-bearing tree (Inga sp., Fabaceae) on the control of coffee leaf miner (Leucoptera coffeella) and coffee berry borer (Hypothenemus hampei) in agroforestry coffee systems was assessed. The availability of nectar from Inga trees increased parasitism of coffee leaf miner and decreased damage on coffee plants. To uncover mechanisms behind enhanced pest control in agroforestry systems we assessed the effect of nectar feeding on fitness of natural enemies of coffee pests. Through a laboratory experiment, we assess the effect of a sugar-rich food source resembling nectar on life-history traits of a predatory thrips that was found inside bored coffee fruits and feeding on extrafloral nectar of Inga trees during surveys in coffee agroforestry systems. Also, we assessed the effect of the thrips predation on coffee berry borer population inside the berries. The predatory thrips benefited from feeding on sugar-rich food through increased survival. However, the developmental time of larvae was increased and they did not reach adulthood unless fed on coffee berry borers. Thrips did not decrease the abundance of coffee berry borer inside the berries. The effect of nectar from Inga trees on natural enemies of coffee leaf miners was also assessed. Four parasitoid species and one green lacewing species increased their survival when feeding on extrafloral nectar. Subsequently, we performed a field experiment comparing coffee yield, coffee damage and parasitism and predation of coffee pests between coffee plots with or without Inga trees. To evaluate the effect of nectar source proximity on coffee protection, we also assessed pest control and production along transects of 50 m extending from the Inga trees. Coffee fruit weight was increased when coffee was consorted with Inga trees. Damage caused by coffee leaf miners and coffee berry borers were also lower in consorted coffee plants and increased with distance from the trees. Parasitism and predation of coffee pests did not increase significantly when coffee was associated with Inga trees, but showed the proper trends. Therefore, Inga trees bearing extrafloral nectaries enhanced natural pest control of pests and production in coffee crops.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-11-25T07:11:38Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1723831 bytes, checksum: cf2815d4e6da475d371abe6dea9ab071 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-25T07:11:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1723831 bytes, checksum: cf2815d4e6da475d371abe6dea9ab071 (MD5) Previous issue date: 2015-02-19 / O café constitui um dos principais produtos agrícolas mundiais devido às grandes rendas econômicas que gera nos países onde é cultivado. Nesta cultura, comumente podemos observar pragas como Brevipalpus phoenicis e doenças como Hemileia vastatrix que podem ocasionar grandes perdas econômicas, caso medidas de controle não sejam tomadas. O controle destas pragas e doenças usualmente é feito com a aplicação de agrotóxicos, que podem ocasionar problemas tanto nas pragas que se deseja atingir (resistência) como nos inimigos naturais que podem ser afetados indiretamente. O controle biológico torna-se uma opção viável para a diminuição do uso de agrotóxicos e o ácaros predadores fitoseídeos são objeto de muitas pesquisas sobre sua capacidade de explorar diversos recursos na sua alimentação e sua aplicabilidade nesse tipo de controle. O predador Ricoseius loxocheles (Ácari: Phytoseiidae) tem a capacidade de se alimentar e carregar esporos de ferrugem do cafeeiro e por ser membro de uma família de ácaros predadores possui potencial para agente de controle biológico. No entanto, pouca informação existe sobre sua função ecológica no sistema cafeeiro. Nesse contexto, o objetivo do estudo foi determinar a capacidade predatória de R. loxocheles sobre B. phoenicis e o desempenho do fitoseídeo em diferentes fontes alternativas de alimento avaliando sua sobrevivência e reprodução. Os resultados mostraram que o ácaro B. phoenicis não representa uma presa potencial para o fitoseídeo R. loxocheles, já que o sucesso reprodutivo desse ácaro predador foi negativo quando unicamente tinha a presença da praga, ocasionando a morte do fitoseídeo. O crescimento populacional (ri) de R. loxocheles foi positivo em mudas de café infectadas por ferrugem. Adicionalmente, foi demonstrado que o ácaro aproveita diversos recursos alimentícios alternativos, como ferrugem de café, ferrugem de trevo e o pólen de taboa para seu sucesso reprodutivo. Das fontes testadas, apenas o pólen apícola foi o único recurso não viável que reduziu a oviposição e ocasionou a sua morte. / Coffee is one of the main crops in the world, due to the large economic importance that generates in the countries where it is cultivated. This culture is commonly attacked by some pests and diseases, such as Brevipalpus phoenicis and Hemileia vastatrix, respectively, that can produce great economic losses if a not appropriate control is used. The control of these pests and diseases is usually done applying chemicals products that can cause several problems: the target pests can become resistant and the natural enemies can be also indirectly affected. So, biological control becomes a viable option for the reduction of pesticide use, considering that the phytoseiids has been the subject of many studies due their ability to explore various food sources. The phytoseiid mite Ricoseius loxocheles (Acari: Phytoseiidae) has the ability to feed and carry coffee leaf rust spores. However, the little information about this behavior limits to understand their role in agricultural systems, especially in the coffee crops. Then, the objective of this study was to evaluate the predatory ability of R. loxocheles on B. phoenicis and the performance (survival and reproduction) of this phytoseiid on different food sources. The results showed that B. phoenicis does not represent a potential prey for R. loxocheles, considering that the reproductive success of this predatory mite was negative when this pest was the diet, resulting in the death of the phytoseiid. Population growth (ri) of R. loxocheles was positive on coffee plants infected by the rust, but the mite had also good population performance on several alternative food resources, such as coffee rust, rust clover and the cattail pollen for their reproductive success. However, from all alternative food sources tested bee pollen was the only non-viable resource that reduced oviposition of R. loxocheles and caused the death of the phytoseiid mite.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-01-04T15:13:56Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 966478 bytes, checksum: 3cfecd335fdf17c55fadb4e067f15dfd (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-04T15:13:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 966478 bytes, checksum: 3cfecd335fdf17c55fadb4e067f15dfd (MD5) Previous issue date: 2016-07-28 / As regiões tropicais concentram grande biodiversidade natural. No entanto, a agricultura convencional, não incorporou essa biodiversidade aos seus processos produtivos. Sistemas Agroflorestais (SAFs), são sistemas produtivos que buscam consorciar, pelo menos um componente arbóreo aos cultivos agrícolas. Esses sistemas contribuem para melhor produção de matéria orgânica e ciclagem de nutrientes, essenciais para garantir a sustentabilidade na agricultura tropical. Buscando contribuir para o conhecimento acerca da ciclagem de nutrientes em SAFs, este trabalho avaliou a decomposição e liberação de nutrientes por resíduos vegetais de cafeeiro (Coffea arábica), ingá (Inga sp). e bananeira (Musa sp.) em sistemas agroflorestais no Estado do Espírito Santo. O estudo foi desenvolvido em duas propriedades rurais de agricultores familiares em Alegre-ES. Foram utilizados litterbags preenchidos com diferentes misturas de material vegetativo das três espécies citadas. Os litterbags foram levados a campo para avaliar a liberação de nutrientes (N, P, K, Ca e Mg) e redução de massa seca a cada 60 dias durante um ano. Para a liberação de N, houve diferenças entre os tratamentos, sendo que, aqueles que continham ingá apresentaram os maiores teores. O nutriente que se disponibilizou mais rapidamente foi o K com liberação rápida até os 180 dias. Em relação ao Ca e Mg, ocorreu imobilização em todos os tratamentos. O P tem sua mineralização efetiva a partir dos 180 dias. Já o nitrogênio, apresenta tendência a mineralização a partir dos 300 dias. Pelos baixos níveis de P presentes no solo do SAF2, as podas se mostraram importantes para incrementar a ciclagem deste elemento evitando assim que grande parte dele fique imobilizada nos tecidos do ingá. A combinação de espécies de mais rápida decomposição e liberação de nutrientes, com aquelas de decomposição mais lenta é importante para um fluxo mais contínuo de nutrientes, podendo garantir maior aproveitamento da adubação mineral. / Tropical regions concentrate a large natural biodiversity. However, in conventional agriculture, it was not incorporated. Agroforestry systems are productive systems that seek consorting at least one tree component to the agricultural. These systems contribute to the production of organic matter and nutrient cycling, essential to ensure sustainability in tropical agriculture. Seeking to contribute to the knowledge of nutrient cycling in agroforestry systems, this study evaluated the decomposition and release of nutrients for plant residues of Coffea arabica, Inga sp. and Musa sp. in agroforestry systems in the State of Espírito Santo. The study was conducted in two farms of family farmers in Alegre- ES. Litterbags was used filled with different mixtures of plant material of the three species mentioned. The litterbags field were taken to evaluate the release of nutrients (N, P, K, Ca and Mg) and reduced dry weight every 60 days in a year. The quadratic regression model was the best fit for dry mass reduction and release of nutrients in the two agroforestry systems.. For N, there were differences between treatments, and the ones containing inga showed the highest levels. The nutrient that is released faster K, with quick release up to 180 days. Residues are shown a source of rapidly available K. As for Ca, Mg immobilization occurred in all treatments. The P has its effective mineralization from 180 days. Since nitrogen has a tendency to mineralization from 300 days. Low levels of P present in the soil SAF2, pruning are very important for increasing the cycling of the element thus preventing much of it becomes immobilized in inga tissues. The combination of species, those with rapid decomposition and release of nutrients from those with slow decomposition is important to ensure continuous flow of nutrients, and may provide greater utilization of mineral fertilization. / Não foi colocado a agência de fomento porque o autor cita a CAPES, CNPq e FAPEMIG como apoio à pesquisa.

Submitted by Samira Ramos (samira.ramos@unifenas.br) on 2018-06-26T17:43:54Z No. of bitstreams: 1 KLESO SILVA FRANCO JUNIOR.pdf: 842182 bytes, checksum: 7c01c7db790ee0db82fb97d7f77bb7b2 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-26T17:43:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 KLESO SILVA FRANCO JUNIOR.pdf: 842182 bytes, checksum: 7c01c7db790ee0db82fb97d7f77bb7b2 (MD5) Previous issue date: 2017-08-11 / Most Brazilian soils present low natural fertility and, often, with unbalanced nutrient contents. The use of cover crops as green manure improves soil fertility by increasing organic matter, increasing soil CEC, decreasing water erosion and reducing fertilization costs. In addition, such use stimulates the biological fraction of the soil composed of microorganisms, which perform essential functions and beneficial to the soil as decomposition of organic matter and release of nutrients unavailable to plants. Soil bioactivators are composed of organic and carboxylic acids that increase the release of macro and micronutrients from soils to plants, among which we can highlight the bioenergetic Penergetic associated to cover plants in the chemical, physical and biological characteristics and the influence of these parameters related to coffee development. The research was conducted at Fazenda Boa Esperança, in the municipality of Serrania - MG, using cover plants associated with the bioactivator in the field, using a randomized block design, in a 4x2 factorial scheme, analyzing the chemical, physical and biological characteristics of soil and coffee plant. After tabulation, the data were submitted to analysis of variance by grouping the means by means of the Scott Knott test, at 5% probability. The results indicated that the use of cover crops associated to the bioactivation technology contribute to the improvement of the chemical characteristics (CTC, base sum, base saturation, acidity, macro and micronutrients), physical (temperature and humidity) (Phosphorus and Potassium solubilizing diazotrophic bacterium) and the growth of coffee tree branches and productivity, as well as the reduction of the nematode population (Meloidogyne and Xiphinema). / A maioria dos solos brasileiros apresenta baixa fertilidade natural e, muitas vezes, com teores de nutrientes desbalanceados. O uso de plantas de cobertura como adubação verde melhora a fertilidade do solo pelo acréscimo de matéria orgânica, aumento da CTC efetiva do solo, diminuição da erosão hídrica e redução dos custos com adubação. Além disso, tal uso estimula a fração biológica do solo composta por microrganismos, os quais realizam funções essenciais e benéficas ao solo como decomposição da matéria orgânica e liberação de nutrientes indisponíveis às plantas. Os bioativadores de solo são compostos constituídos por ácidos orgânicos e carboxílicos que aumentam a liberação de macro e micronutrientes dos solos para as plantas, dentre os quais podemos destacar o bioativador Penergetic. Este trabalho de pesquisa, portanto, teve como objetivo avaliar a contribuição do bioativador Penergetic associado a plantas de cobertura nas características químicas, físicas e biológicas e a influência desses parâmetros relacionada ao desenvolvimento do cafeeiro. A pesquisa foi conduzida na Fazenda Boa Esperança, no Município de Serrania - MG, com a utilização das plantas de cobertura associadas ao bioativador em campo, utilizando delineamento de blocos ao acaso, em esquema fatorial 4x2, analisando as características químicas, físicas e biológicas do solo e da planta do cafeeiro. Após a tabulação, os dados foram submetidos à análise de variância agrupando as médias por meio do teste de Scott Knott, a 5% de probabilidade. Os resultados obtidos indicaram que a utilização de plantas de cobertura associadas à tecnologia de bioativação contribuem para melhoria das características químicas (CTC, soma de bases, saturação por bases, acidez, macro e micronutrientes), físicas (temperatura e umidade) e biológicas do solo (bactérias diazotróficas solubilizadoras de Fósforo e Potássio) e do crescimento de ramos e produtividade do cafeeiro, além da redução da população de nematoides (Meloidogyne e Xiphinema).

Acredita-se que o Brasil é o centro de diversidade de vírus transmitidos por ácaros do gênero Brevipalpus (VTB). Alguns desses VTB infectam culturas fundamentais para o agronegócio brasileiro como citros e café, além de maracujá e de várias plantas ornamentais. Na última década os genomas de dois deles, Citrus leprosis virus C (CiLV-C) e Coffee ringspot virus (CoRSV) foram sequenciados, mas ainda é escasso o conhecimento sobre a diversidade genética e processos evolutivos envolvidos na população dessas espécies. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi caracterizar molecularmente novas estirpes de CiLV-C e CoRSV que infectam citros e café, respectivamente. E revelar as relações filogenéticas com espécies de VTB conhecidas, assim como avaliar a variabilidade genética da população de CiLVC no Brasil. Para o estudo de CiLV-C, 47 amostras de Citrus sinensis apresentando sintomas típicos da leprose dos citros foram coletadas em diferentes regiões do Brasil no período de 2011-2015. A presença de CiLV-C foi detectada por RT-PCR em todas as amostras coletadas e, posteriormente, foi realizado o sequenciamento de quatro regiões do genoma viral (p29, p15, RI e MP) de cada isolado. As sequências obtidas foram utilizadas no estudo de filogenia e variabilidade da população de CiLV-C no Brasil. Foi demonstrado que a população de CiLV-C apresenta uma variabilidade relativamente baixa; entretanto, foi identificada a existência de duas linhagens dentro da espécie, nomeadas Cor e SJRP. Os genomas completos de CiLV-C SJRP e também do dicorhavirus tentativo CoRSV identificado em Limeira, SP, foram obtidos mediante o sequenciamento de RNA de pequeno tamanho (siRNA). Cada sequência foi validada mediante o sequenciamento de fragmentos gerados por RT-PCR ao longo do genoma. CiLV-C SJRP apresenta cerca de 85% de identidade de nucleotídeo com o membro-tipo do gênero Cilevirus e exibe evidências de recombinação com isolados da linhagem Cor, a prevalente no território brasileiro. Globalmente, o genoma de CoRSV Limeira apresenta mais de 90% de identidade de nucleotídeo com isolado CoRSV Lavras, o que indica que ambos os isolados são membros da mesma espécie tentativa de dichorhavirus. / South America is most likely the center of diversity of Brevipalpus transmitted viruses (BTV). Some of these BTV infect major crops of the Brazilian agribusiness such as citrus and coffee. Passion fruit and several other ornamental plants are affected as well. The genome of two of these viruses, Citrus leprosis virus C (CiLV-C) and Coffee ringspot virus (CoRSV) were sequenced, but the knowledge about several molecular characteristics and processes involved in the evolution of their populations are still scarce. Thus, the objective of this study was to molecularly characterize new isolates of BTV infecting citrus and coffee, reveal the phylogenetic relationships with known species of BTV, and assess the genetic variability of the population of CiLV-C in Brazil. For CiLV-C studies, 47 samples of Citrus sinensis showing typical symptoms of leprosis were collected in different Brazilian regions during 2011-2015. The presence of CiLV-C was detected by RT-PCR in all the collected samples and four regions of the viral genome (p29, p15, IR and MP) of each isample were sequenced. It has been shown that the CiLV-C population has relatively low variability; although the existence of two lineages named Cor and SJRP were identified in this work. The complete genomes of one isolate of the lineage SJRP (CiLV-C SJRP) and that of the tentative dicorhavirus CoRSV found in Limeira, SP, were obtained by small RNA (siRNA) Sequencing. Validation was performed by sequencing fragments generated by RT-PCR using specific primers throughout the genome. CiLV-C SJRP has about 85% nucleotide identity with the genome of the type-member of the Cilevirus genus and shows evidence of recombination with isolates of the lineage Cor, which are prevalent in Brazil. CoRSV isolate Limeira has more than 90% of nucleotide identity with CoRSV Lavras, indicating that both isolates are members of the same tentative species of dichorhavirus.

Acredita-se que o Brasil é o centro de diversidade de vírus transmitidos por ácaros do gênero Brevipalpus (VTB). Alguns desses VTB infectam culturas fundamentais para o agronegócio brasileiro como citros e café, além de maracujá e de várias plantas ornamentais. Na última década os genomas de dois deles, Citrus leprosis virus C (CiLV-C) e Coffee ringspot virus (CoRSV) foram sequenciados, mas ainda é escasso o conhecimento sobre a diversidade genética e processos evolutivos envolvidos na população dessas espécies. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi caracterizar molecularmente novas estirpes de CiLV-C e CoRSV que infectam citros e café, respectivamente. E revelar as relações filogenéticas com espécies de VTB conhecidas, assim como avaliar a variabilidade genética da população de CiLVC no Brasil. Para o estudo de CiLV-C, 47 amostras de Citrus sinensis apresentando sintomas típicos da leprose dos citros foram coletadas em diferentes regiões do Brasil no período de 2011-2015. A presença de CiLV-C foi detectada por RT-PCR em todas as amostras coletadas e, posteriormente, foi realizado o sequenciamento de quatro regiões do genoma viral (p29, p15, RI e MP) de cada isolado. As sequências obtidas foram utilizadas no estudo de filogenia e variabilidade da população de CiLV-C no Brasil. Foi demonstrado que a população de CiLV-C apresenta uma variabilidade relativamente baixa; entretanto, foi identificada a existência de duas linhagens dentro da espécie, nomeadas Cor e SJRP. Os genomas completos de CiLV-C SJRP e também do dicorhavirus tentativo CoRSV identificado em Limeira, SP, foram obtidos mediante o sequenciamento de RNA de pequeno tamanho (siRNA). Cada sequência foi validada mediante o sequenciamento de fragmentos gerados por RT-PCR ao longo do genoma. CiLV-C SJRP apresenta cerca de 85% de identidade de nucleotídeo com o membro-tipo do gênero Cilevirus e exibe evidências de recombinação com isolados da linhagem Cor, a prevalente no território brasileiro. Globalmente, o genoma de CoRSV Limeira apresenta mais de 90% de identidade de nucleotídeo com isolado CoRSV Lavras, o que indica que ambos os isolados são membros da mesma espécie tentativa de dichorhavirus. / South America is most likely the center of diversity of Brevipalpus transmitted viruses (BTV). Some of these BTV infect major crops of the Brazilian agribusiness such as citrus and coffee. Passion fruit and several other ornamental plants are affected as well. The genome of two of these viruses, Citrus leprosis virus C (CiLV-C) and Coffee ringspot virus (CoRSV) were sequenced, but the knowledge about several molecular characteristics and processes involved in the evolution of their populations are still scarce. Thus, the objective of this study was to molecularly characterize new isolates of BTV infecting citrus and coffee, reveal the phylogenetic relationships with known species of BTV, and assess the genetic variability of the population of CiLV-C in Brazil. For CiLV-C studies, 47 samples of Citrus sinensis showing typical symptoms of leprosis were collected in different Brazilian regions during 2011-2015. The presence of CiLV-C was detected by RT-PCR in all the collected samples and four regions of the viral genome (p29, p15, IR and MP) of each isample were sequenced. It has been shown that the CiLV-C population has relatively low variability; although the existence of two lineages named Cor and SJRP were identified in this work. The complete genomes of one isolate of the lineage SJRP (CiLV-C SJRP) and that of the tentative dicorhavirus CoRSV found in Limeira, SP, were obtained by small RNA (siRNA) Sequencing. Validation was performed by sequencing fragments generated by RT-PCR using specific primers throughout the genome. CiLV-C SJRP has about 85% nucleotide identity with the genome of the type-member of the Cilevirus genus and shows evidence of recombination with isolates of the lineage Cor, which are prevalent in Brazil. CoRSV isolate Limeira has more than 90% of nucleotide identity with CoRSV Lavras, indicating that both isolates are members of the same tentative species of dichorhavirus.

Durante o século XIX as chácaras tornaram-se uma opção de morar entre as classes dominantes. Resultante de um período próspero devido à riqueza ocasionada pela cultura do café, esse novo estilo de moradia passa a representar em determinados locais sinônimo de luxo e status. Em Jacareí, não foi diferente. É a partir dessa premissa que tomou-se objeto de estudo a Chácara Xavier, uma das poucas propriedades desse padrão que ainda conserva várias de suas características enquanto exemplar daquele período. Tendo testemunhado vários acontecimentos, esse local tinha ainda muito a mostrar. Dessa forma, a cultura material recuperada através dos métodos e técnicas utilizados pela arqueologia, aliada a uma série de opções oferecidas pela Arqueologia Histórica como estudos documentais, levantamentos arquitetônicos, história oral, entre outras, acabou revelando parte desta história, bem como algumas transformações ocorridas não só no espaço, mas principalmente no modo de vida de uma sociedade que começava a se esboçar / During XIX century, the rural residences became a living option among dominant classes. Result of a prosper age caused by the coffee culture\'s richness, this new life style was going to represent, in some places, splendour and status. In Jacareí, it was not different. Starting from this premise, Chácara Xavier was taken as object of study: being one of the few properties with such standart wich conserves several self-characteristics while a sample of that age. Confirming several events, this local still had a lot to show. In that way, the material culture that was recovered by methods and technics used by archaeology, plus series of options offered by Historical Archaeology, like documental studies, architetonical risings, oral history, among other things, was about to reveal part of this history, including some transformations that occours not only in this place, but mainly in the way of living of a society that begans to plot out