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Identificação de marcadores moleculares relacionados à severidade de sintomas da ferrugem marrom em painel associativo de cana-de-açúcar (Saccharum spp.)

Gonçalves, Bruna Sousa [UNESP] 03 July 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:08Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-07-03Bitstream added on 2014-06-13T19:54:03Z : No. of bitstreams: 1 goncalves_bs_me_jabo.pdf: 365802 bytes, checksum: 971fbfa106cd14733f5d01a18df13850 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Associações entre marcadores moleculares e caracteres agronômicos importantes constituem uma ferramenta valiosa em programas de melhoramento, uma vez que podem identificar indivíduos superiores, ainda em fases juvenis, e, consequentemente, acelerar o processo de desenvolvimento de cultivares. Neste contexto, este trabalho teve por finalidade estabelecer associações entre marcadores moleculares (AFLP e SSR) e resistência e/ou suscetibilidade à ferrugem marrom (Puccinia melanocephala) da cana-de-açúcar, por meio da abordagem de mapeamento associativo. Os dados fenotípicos foram obtidos de experimentos conduzidos em Ribeirão Preto, durante março de 2010 e janeiro de 2012, em delineamento de blocos casualizados completos, DBC, com três repetições. Oitenta e três genótipos de cana-de-açúcar, incluindo cultivares comerciais e clones IAC, foram avaliados quanto a resistência à ferrugem marrom, sob condições de infecção natural. As plantas foram fenotipadas aos 10 meses após o plantio e 7 meses após o primeiro corte. A maioria dos genótipos avaliados (>71%) apresentou reação de resistência à ferrugem marrom; sendo o ciclo de cana-planta mais suscetível ao ataque do fungo do que a soqueira. A resistência à ferrugem marrom apresentou elevada herdabilidade, superior a 0,7. O painel associativo foi caracterizado com 79 pares de primer SSR e 20 combinações de AFLP, os quais detectaram 1015 marcas polimórficas. Os marcadores SCC60.8, SCA31.3, M56/E35 e M56/E37 foram correlacionados à suscetibilidade, enquanto SCB14.9 e M56/E33, ligados à resistência à ferrugem marrom. O efeito individual das marcas oscilou entre -0.37 (R2 = 0.05) e 0.24 (R2 = 0.08). Os marcadores moleculares associados à severidade à ferrugem marrom serão validados, visando explorá-los dentro do programa de melhoramento genético para identificar materiais resistentes ou mesmo eliminar alelos desfavoráveis, e, assim, acelerar os ganhos genéticos / Associations between markers and agriculturally important traits are a valuable tool for breeding programs, since they can identify superior individuals still in the initial developmental stages, and thus accelerate the cultivars development. In this context, the work aimed to establish associations between molecular markers (AFLP and SSR) and resistance and/or susceptibility to brown rust (Puccinia melanocephala) in sugarcane, using association mapping approach. The phenotypic data were obtained from field trials in Ribeirão Preto, during March 2010 and January 2012 in a randomized complete block design, DBC, with three replications. Eighty-three sugarcane genotypes, including commercial cultivars and IAC clones, were evaluated for resistance to brown rust under natural infection. The plants were phenotyped at 10 months after planting and 7 months after the first cut. Most of the evaluated genotypes (>71%) presented rust resistance reaction, with the plant cane crop cycle more susceptible to the fungus attack than the rattoon cane. Brown rust resistance showed high heritability, greater than 0,7. The whole panel was genotyped with 79 SSR primer pairs and 20 AFLP primer combinations, resulting in 1015 polymorphic markers. Markers SCC60.8, SCA31.3, M56/E35 and M56/E37 were correlated with susceptibility, while SCB14.9 and M56/E33 were associated to brown rust resistance. The individual marker effect ranged from -0.37 (R2 = 0.05) to 0.24 (R2 = 0.08). The molecular markers associated with the severity of brown rust should be validated, to be exploited in the breeding program to identify resistant materials or even eliminate unfavorable alleles, and thus accelerate the genetic gain
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Qualidade de sistemas de plantio em cultivares de cana-de-açúcar

Zoia, Remo Marini [UNESP] 19 July 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:10Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-07-19Bitstream added on 2014-06-13T18:09:27Z : No. of bitstreams: 1 000725740.pdf: 839102 bytes, checksum: 89a52350e646c2782d5c96ba07b99d72 (MD5) / A cana-de-açúcar tem expressiva importância no Brasil. Desde o descobrimento e colonização, seu cultivo colabora com o desenvolvimento do país, pois é uma cultura de forte presença no campo econômico, com as produções de açúcar e etanol, e no social, com a geração de empregos. Diante da grande escassez de área em alguns estados, a necessidade de análises de projetos já existentes e novos projetos de aumento de produtividade e redução de custos se fazem necessários. A combinação de cultivares com diversas características é um dos trunfos para que o setor de bioenergia brasileiro tenha base para conseguir se manter no topo, visto que temos um grande leque de opções para os mais diferentes ambientes e situações. Para dois tipos de cultivares com dois sistemas de plantio houve diferenças qualitativas no que se diz respeito ao número de gemas, danos às gemas, paralelismo e falhas na deposição de mudas. Diante disso, o presente trabalho propôs-se avaliar a qualidade de operação de duas cultivares de cana-de-açúcar em dois diferentes sistemas de plantio. As cultivares usadas foram: RB835054 e SP813250 nos seguintes sistemas de plantio: semimecanizado e mecanizado. Os sistemas de plantio semimecanizado apresentaram valores melhores para as variáveis gemas totais, gemas viáveis e falhas. Para profundidade de sulcos os valores se assemelharam entre os dois sistemas. Já para o sistema de plantio mecanizado houve melhores valores para a variável espaçamento entre sulcos. Entre as cultivares houve valor semelhante para quase todas as variáveis estudadas, mas para falhas na deposição de mudas a cultivar SP813250 obteve resultados insatisfatórios quando comparada à RB835054 no sistema de plantio mecanizado / The sugarcane has a significant importance in Brazil. Since the discovery and colonization, its cultivation contributes to the development of the country. It is a culture of strong presence in the economic field, with production of sugar and ethanol, and social, with the creation of jobs. Given the dearth of area in some states, the need for analysis of actual projects and new projects to increase productivity and reduce costs are needed. The combination of varieties with different characteristics is one of the assets that the Brazilian bioenergy sector has base to get to stay on top, since we have an extensive menu for the most different environments and situations. For two kinds of cultivars with two planting systems will supposedly qualitative differences as regards the number of buds, damage yolks, parallelism and seedling failure deposition. Therefore, the present study aimed to evaluating the operation quality of two cultivars of sugarcane at two different tillage systems. The cultivars used were: RB835054 and SP813250 in the following cropping systems: semi-mechanized and mechanized. The semi-mechanized planting systems showed better valuesfor the variables total buds, viable buds and failures. For furrows depth there had very similar values. As for the mechanized planting was best values for the variables spacing between furrows.Among the cultivars there were similar values for almost all variables but for seedling failures deposition the cultivar SP813250 obtained unsatisfactory results when compared to RB835054 in the mechanized planting system
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Qualidade de sistemas de plantio em cultivares de cana-de-açúcar /

Zoia, Remo Marini. January 2013 (has links)
Orientador: Carlos Eduardo Angeli Furlani / Banca: Rouverson Pereira da Silva / Banca: Danilo Cesar Checchio Grotta / Resumo: A cana-de-açúcar tem expressiva importância no Brasil. Desde o descobrimento e colonização, seu cultivo colabora com o desenvolvimento do país, pois é uma cultura de forte presença no campo econômico, com as produções de açúcar e etanol, e no social, com a geração de empregos. Diante da grande escassez de área em alguns estados, a necessidade de análises de projetos já existentes e novos projetos de aumento de produtividade e redução de custos se fazem necessários. A combinação de cultivares com diversas características é um dos trunfos para que o setor de bioenergia brasileiro tenha base para conseguir se manter no topo, visto que temos um grande leque de opções para os mais diferentes ambientes e situações. Para dois tipos de cultivares com dois sistemas de plantio houve diferenças qualitativas no que se diz respeito ao número de gemas, danos às gemas, paralelismo e falhas na deposição de mudas. Diante disso, o presente trabalho propôs-se avaliar a qualidade de operação de duas cultivares de cana-de-açúcar em dois diferentes sistemas de plantio. As cultivares usadas foram: RB835054 e SP813250 nos seguintes sistemas de plantio: semimecanizado e mecanizado. Os sistemas de plantio semimecanizado apresentaram valores melhores para as variáveis gemas totais, gemas viáveis e falhas. Para profundidade de sulcos os valores se assemelharam entre os dois sistemas. Já para o sistema de plantio mecanizado houve melhores valores para a variável espaçamento entre sulcos. Entre as cultivares houve valor semelhante para quase todas as variáveis estudadas, mas para falhas na deposição de mudas a cultivar SP813250 obteve resultados insatisfatórios quando comparada à RB835054 no sistema de plantio mecanizado / Abstract: The sugarcane has a significant importance in Brazil. Since the discovery and colonization, its cultivation contributes to the development of the country. It is a culture of strong presence in the economic field, with production of sugar and ethanol, and social, with the creation of jobs. Given the dearth of area in some states, the need for analysis of actual projects and new projects to increase productivity and reduce costs are needed. The combination of varieties with different characteristics is one of the assets that the Brazilian bioenergy sector has base to get to stay on top, since we have an extensive menu for the most different environments and situations. For two kinds of cultivars with two planting systems will supposedly qualitative differences as regards the number of buds, damage yolks, parallelism and seedling failure deposition. Therefore, the present study aimed to evaluating the operation quality of two cultivars of sugarcane at two different tillage systems. The cultivars used were: RB835054 and SP813250 in the following cropping systems: semi-mechanized and mechanized. The semi-mechanized planting systems showed better valuesfor the variables total buds, viable buds and failures. For furrows depth there had very similar values. As for the mechanized planting was best values for the variables spacing between furrows.Among the cultivars there were similar values for almost all variables but for seedling failures deposition the cultivar SP813250 obtained unsatisfactory results when compared to RB835054 in the mechanized planting system / Mestre
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Identificação de marcadores moleculares relacionados à severidade de sintomas da ferrugem marrom em painel associativo de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) /

Gonçalves, Bruna Sousa. January 2012 (has links)
Orientador: Luciana Rossini Pinto / Coorientador: Dilermando Perecin / Banca: Antonio Augusto Franco Garcia / Banca: Antônio de Goes / Resumo: Associações entre marcadores moleculares e caracteres agronômicos importantes constituem uma ferramenta valiosa em programas de melhoramento, uma vez que podem identificar indivíduos superiores, ainda em fases juvenis, e, consequentemente, acelerar o processo de desenvolvimento de cultivares. Neste contexto, este trabalho teve por finalidade estabelecer associações entre marcadores moleculares (AFLP e SSR) e resistência e/ou suscetibilidade à ferrugem marrom (Puccinia melanocephala) da cana-de-açúcar, por meio da abordagem de mapeamento associativo. Os dados fenotípicos foram obtidos de experimentos conduzidos em Ribeirão Preto, durante março de 2010 e janeiro de 2012, em delineamento de blocos casualizados completos, DBC, com três repetições. Oitenta e três genótipos de cana-de-açúcar, incluindo cultivares comerciais e clones IAC, foram avaliados quanto a resistência à ferrugem marrom, sob condições de infecção natural. As plantas foram fenotipadas aos 10 meses após o plantio e 7 meses após o primeiro corte. A maioria dos genótipos avaliados (>71%) apresentou reação de resistência à ferrugem marrom; sendo o ciclo de cana-planta mais suscetível ao ataque do fungo do que a soqueira. A resistência à ferrugem marrom apresentou elevada herdabilidade, superior a 0,7. O painel associativo foi caracterizado com 79 pares de primer SSR e 20 combinações de AFLP, os quais detectaram 1015 marcas polimórficas. Os marcadores SCC60.8, SCA31.3, M56/E35 e M56/E37 foram correlacionados à suscetibilidade, enquanto SCB14.9 e M56/E33, ligados à resistência à ferrugem marrom. O efeito individual das marcas oscilou entre -0.37 (R2 = 0.05) e 0.24 (R2 = 0.08). Os marcadores moleculares associados à severidade à ferrugem marrom serão validados, visando explorá-los dentro do programa de melhoramento genético para identificar materiais resistentes ou mesmo eliminar alelos desfavoráveis, e, assim, acelerar os ganhos genéticos / Abstract: Associations between markers and agriculturally important traits are a valuable tool for breeding programs, since they can identify superior individuals still in the initial developmental stages, and thus accelerate the cultivars development. In this context, the work aimed to establish associations between molecular markers (AFLP and SSR) and resistance and/or susceptibility to brown rust (Puccinia melanocephala) in sugarcane, using association mapping approach. The phenotypic data were obtained from field trials in Ribeirão Preto, during March 2010 and January 2012 in a randomized complete block design, DBC, with three replications. Eighty-three sugarcane genotypes, including commercial cultivars and IAC clones, were evaluated for resistance to brown rust under natural infection. The plants were phenotyped at 10 months after planting and 7 months after the first cut. Most of the evaluated genotypes (>71%) presented rust resistance reaction, with the plant cane crop cycle more susceptible to the fungus attack than the rattoon cane. Brown rust resistance showed high heritability, greater than 0,7. The whole panel was genotyped with 79 SSR primer pairs and 20 AFLP primer combinations, resulting in 1015 polymorphic markers. Markers SCC60.8, SCA31.3, M56/E35 and M56/E37 were correlated with susceptibility, while SCB14.9 and M56/E33 were associated to brown rust resistance. The individual marker effect ranged from -0.37 (R2 = 0.05) to 0.24 (R2 = 0.08). The molecular markers associated with the severity of brown rust should be validated, to be exploited in the breeding program to identify resistant materials or even eliminate unfavorable alleles, and thus accelerate the genetic gain / Mestre
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O setor sucroenergético e o regime de apropriabilidade de cultivares de cana-de-açúcar: caso RIDESA / The sugar ethanol sector and the apropriabilidade regime of cultivars of sugarcane: case RIDESA

Silva, Patrícia Brandão Barbosa da 22 February 2013 (has links)
The innovation terminology has been intensively used nowadays to evidence scenery of entrepreneurial competitiveness in the entire world. Many actors, researchers and collaborators are using elements related to tacit and codified knowledge, proceedings, directives, researches and development that are resulting in useful things absorbed by the market. One efficient regime of appropriability may protect the creations of human intellect and give competitive advantages to his owner. The Brazilian system of intellectual and industrial property is based in specific laws: Innovation Act, Cultivar protection Act and Patent Protection Act, and also with participation in international treats. The scientific and technological advances are very linked to socioeconomic development. Due the economic importance of sucroenergetic sector, the present work will discuss about the RIDESA Program, whose has the Federal University of Alagoas as one player. This work pretends to bring elements over constitution, structure, legal regulation and other parameters related to development of new cultivars of sugarcane. Although RIDESA is responsible to furnish cultivars for 59% of total area used in sugarcane plantation, and positioned 7 of the 10 more used cultivars in Brazil, this sector was evaluated as been very weak in its appropriability regime. The sugarcane´s chain aspects of knowledge generation, protection and technological transfer were analyzed, giving promises for the fast growing of this sector based in new economic paradigms coming from entrance technologies. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / No presente cenário da competitividade mundial, o termo inovação tem sido muito usado e disseminado em diversos ambientes e por agentes, colaboradores, pesquisadores do mundo. Temos presenciado um conjunto de elementos relacionados ao conhecimento tacito e codificado, procedimentos, diretrizes, pesquisas, desenvolvimentos que geram resultados e que deverão ser absorvidos pelo mercado. Um regime de apropriabilidade eficiente pode garantir a exclusividade sobre as criações do intelecto humano e definir vantagens competitivas aos setores que a detém. O Brasil conta com o Sistema de Propriedade Intelectual amparado principalmente na legislação específica: Lei de Propriedade Industrial, Lei de Proteção de Cultivares e a Lei de Inovação, além da participação em acordos e tratados internacionais. Os avanços científicos e tecnológicos são de extrema importância para o desenvolvimento socioeconômico. Dada a importância nacional e local do setor econômico sucroenergético, o presente trabalho se propõe a estudar a Rede Interuniversitária para o Desenvolvimento do Setor Sucroenergético – RIDESA. A Universidade Federal de Alagoas é partícipe, do ponto de vista de sua constituição, estruturação e os meios legais que garantem a apropriabilidade das tecnologias obtidas através dos esforços destinados a pesquisa e desenvolvimento de novas cultivares de cana-de-açúcar. Mesmo sendo responsável pela criação das cultivares de cana utilizadas em mais de 59% da área cultivada no país, além de posicionar 7 das 10 cultivares mais utilizadas, o setor foi analisado e caracterizado como de fraca apropriabilidade. Os aspectos de geração do conhecimento, proteção e transferência da tecnologia do setor são abordados, com levantamento de expectativas de crescimento do setor, a partir de novos paradigmas de produção com tecnologias entrantes.

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