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Estudos genético moleculares em forrageiras tropicais / Molecular genetic studies in tropical foragesSousa, Adna Cristina Barbosa de 16 August 2018 (has links)
Orientadores: Anete Pereira de Souza, Liana Jank / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-16T21:01:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2010 / Resumo: As pastagens cultivadas, utilizadas em pastejo, constituem a forma mais econômica de fornecer alimentação abundante e de qualidade aos animais. Entre as principais forrageiras cultivadas, está a gramínea Panicum maximum Jacq. que ocupa uma posição de destaque na pecuária brasileira por apresentar elevada produção e qualidade, ser facilmente propagada por sementes e altamente palatável ao gado. As leguminosas forrageiras também são importantes não só pela qualidade e quantidade de forragem produzida, mas também pela fixação de nitrogênio atmosférico e transferência às gramíneas associadas, reduzindo os custos de produção. Entre elas citamos, Cajanus cajan (L.) Millsp., Centrosema pubescens Benth. e Calopogonium mucunoides Desv. Apesar de estas forrageiras terem sido estudadas dos pontos de vista morfológico e agronômico, conhecimentos genéticos ainda são limitados. A caracterização do sistema reprodutivo e o conhecimento da extensão da variabilidade genética contida dentro dos bancos de germoplasma podem auxiliar no planejamento de estratégias para maximizar os ganhos genéticos em programas de melhoramento. Nesse contexto, foram utilizados marcadores microssatélites para estimar a diversidade genética de acessos do banco de germoplasma de P. maximum, C. cajan, C. pubescens e C. mucunoides. Foram desenvolvidos 75 marcadores microssatélites polimórficos para P. maximum, 26 para C. pubescens, 23 para C. mucunoides e para C. cajan foram selecionados 43 microssatélites da literatura. Os resultados mostraram a eficiência desses marcadores para estimar a diversidade genética intra e interespecífica, obtida através de similaridades genéticas. Foi possível observar a formação de grupos bem definidos entre os acessos dessas espécies e adicionalmente, a transferibilidade desses marcadores específicos para outras espécies de forrageiras tropicais. Considerando o potencial de C. pubescens e C. mucunoides para as pastagens cultivadas brasileiras, o sistema reprodutivo dessas espécies foi caracterizado com os microssatélites
desenvolvidos. A taxa de cruzamento encontrada para C. pubescens foi de 26% e para C. mucunoides foi de 16%, mostrando que ambas as espécies apresentam um sistema misto de reprodução com predominância de autogamia. Esses dados devem ser considerados durante a multiplicação de sementes para manutenção do banco de germoplasma, a fim de manter a integridade individual de cada acesso. O conhecimento da estrutura genética da população de uma espécie, aliado ao conhecimento de outras características biológicas de interesse, pode fornecer subsídios para programas de conservação do germoplasma, manejo sustentável, domesticação e melhoramento genético da espécie. Os marcadores microssatélites desenvolvidos nesse trabalho, a caracterização da diversidade genética e a taxa de cruzamento são resultados fundamentais, promissores e consistentes para uso no melhoramento, podendo contribuir de forma eficiente na seleção e uso dos recursos genéticos disponíveis. / Abstract: Cultivated pastures used for grazing, are the most economical way to provide abundant high quality feed to animals. Among the main fodder crops, the grass Panicum maximum Jacq. occupies a prominent position in the Brazilian livestock industry by presenting high yield and quality, being easily propagated by seeds and highly palatable to livestock. The legumes also are important not only due to the quality and quantity of fodder produced, but also due to fixation of atmospheric nitrogen and transfer to the associated grasses, reducing production costs. Among them, Cajanus cajan (L.) Millsp., Centrosema pubescens Benth. and Calopogonium mucunoides Desv. Although these forages have been studied from the morphological and agronomic standpoint, genetic information is still limited. The characterization of the reproductive system and the knowledge of the extent of genetic variability contained within the germplasm banks can assist in planning strategies to maximize genetic gains. In this context, microsatellite markers were used to estimate the genetic diversity of germplasm banks of selected accessions of P. maximum, C. cajan, C. pubescens and C. mucunoides. Seventy-five polymorphic microsatellite markers were developed for P. maximum, 26 for C. pubescens, 23 for C. mucunoides and for C. cajan 43 microsatellites were selected from the literature. The results showed the efficiency of these markers to estimate the intra and interspecific genetic diversity obtained through genetic similarities. It was possible to observe the formation of welldefined clusters among the accessions within these species and in addition, the transferability of these specific markers to other species of tropical forages. Considering the potential of C. pubescens and C. mucunoides for the Brazilian cultivated pastures the reproductive system of these species were characterized with the microsatellites developed. The outcrossing rate was 26% for C. pubescens and 16% for C. mucunoides, showing that both species have a mixed mating system with predominance of autogamy. This information should be considered during
the multiplication of seeds for maintenance of the germplasm bank, in order to conserve the integrity of each individual genotype. Knowledge of the genetic structure, together with other biological characteristics of interest can provide support to germplasm conservation programs, sustainable management, domestication and breeding of the species. The microsatellite markers developed in this research, the characterization of the genetic diversity and crossing rates are fundamental results, both promising and consistent to be used in breeding and may contribute to the efficiency of selection and use of the available genetic resources. / Doutorado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Doutor em Genetica e Biologia Molecular
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Avaliação de caracteres morfologicos, de qualidade de sementes e suas correlações em hibridos ineditos de Panicum maximum jacq.Paterniani, Ricardo Stip 26 March 1996 (has links)
0Orientador: Roberto Usberti / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agricola / Made available in DSpace on 2018-07-21T17:37:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1996 / Resumo: Quinze híbridos inéditos de capim-colonião (Panicum maximum Jacq.) foram avaliados, em experimentos em blocos ao acaso com três repetições, quanto aos seguintes caracteres agronômicos e mortológicos: altura de planta, relação número de pertilhos reprodutivos/ número total de pertilhos, relação nQde panículas/pertilho reprodutivo, ciclo de florescimento, porcentagem de matéria seca; comprimento da lâmina foliar, largura da lâmina foliar e comprimento de panícula. Posteriormente, as sementes colhidas foram analisadas quanto aos seguintes parâmetros de qualidade: pureza física, nQ de sementes/grama, viabilidade inicial (teste de tetrazólio), germinação normal e após envelhecimento acelerado e velocidade de germinação de sementes não tratadas e tratadas com H2S04 em cada caso. Adicionalmente, foram determinadas, pelo teste de ,tetrazólio, as porcentagens de sementes remanescentes viáveis, ao final dos testes de germinação. Ocorreu notável variabilidade, entre os híbridos estudados,
quanto ao ciclo de florescimento, possibilitando a distinção de quatro grupos: ciclo tardio, médio, precoce e muito precoce. Observou-se, para os híbridos de ciclo precoce e muito precoce, alocação preferencial de energia para as funções reprodutivas (maiores valores para número de pertilhos reprodutivos/número total de pertilhos e número de panículas/pertilho reprodutivo). Por outro lado, os híbridos de ciclo médio e tardio tiveram grande parte da energia direcionada para as funções vegetativas (maiores comprimento e largura da lâmina foliar; maior comprimento de panícula e maior porcentagem de matéria seca). O número de sementes/grama e a pureza física apresentaram correlações lineares negativas de elevada magnitude com o ciclo de florescimento (r = -0,89 e r = -0,90, respectivamente). Em sementes não tratadas, os híbridos de ciclo tardio e médiorevelaram maiores porcentagens de germinação e índices de velocidade de germinação, quando comparados com os demais (coeficientes de correlação com
o ciclo de florescimento: r = 0,86 e r = 0,82, respectivamente). Por outro lado, as porcentagens de germinação após o teste de envelhecimento acelerado, também em sementes não tratadas, apresentaram correlação zero com o ciclo de florescimento (os híbridos de ciclo tardio sofreram sensível redução; os de ciclo precoce e muito precoce, elevação acentuada enquanto os de ciclo médio mantiveram-se constantes). A escarificação química das sementes com H2S04 revelou dados diferentes para os híbridos em estudo: geralmente, os de ciclo precoce e muito precoce, com alta dormência nas sementes, mostraram elevação significativa na porcentagem de germinação enquanto os de ciclo médio e tardio, com reduzida dormência, não tiveram esses valores alterados pelo tratamento. Os resultados de dormência, calculados com base na diferença entre a viabilidade
inicial e a porcentagem de germinação, foram confirmados pela porcentagem de sementes remanescentes viáveis após o teste padrão de germinação
comprovando, assim, a eficácia e precisão do teste de tetrazólio. Finalmente, foi possível a identificação de dois híbridos, H-22 e H-13, com excelentes caracteres forrageiros e de qualidade de sementes, sendo provável a sua futura liberação como novos cultivares / Abstract: Fifteen new guineagrass hybrids have been studied as to the following agronomic and morphological characters: plant height, reproductive tillers number/overall tillers number, panicles number/reproductive tiller, flowering cycle, dry matter porcentage, blade length, blade width and panicle length. Additionally, harvested seeds of each hybrid have been analyzed for physical purity, number of seeds/gram; viability (tetrazolium test), normal germination and vigor (accelerated aging test), untreated and H2S04-scarified seeds as well as germination rates and remaining seed viability detection. The hybrids have been successfully classified in four groups: late, medium, early and very early types regarding to flowering cycles. Early- and very-early-cycle hybrids have shown high energy allocation to reproductive functions (the highest values for reproductive tiller - number/overall tiller number, panicle number/reproductive tiller). On the other hand, late- and medium-cycle hybrids have had the most of energy allocated to 61
vegetative functions (the highest values for leaf length and width; panicle length; fresh and dry weight and dry weighUfresh weight relation). Number of seeds/gram and physical purity have been highly and negatively correlated with flowering cycle (r = -0,89; r = -0,90, respectively). In untreated seeds, late- and mediumcycle hybrids have revealed the highest values for percentage and rate of germination, highly and positively correlated with flowering cycles (r = 0,86; r = 0,82, respectively). In addiction, the percentages of germination afie r the accelerated aging test have presented no correlation with the flowering cycle, due to different hybrid performance (the late ones have suffered significant reduction; the early and very early ones, remarkable increase and the medium ones have had small changes). H2S04 seed scarification have shown no effect in late- and medium-cycle hybrid percentage of germination (reduced seed dormancy) while the early- and very-early-cycle ones have increased significantly their percentageof germination (high seed dormancy). The precision and efficiency of the tetrazolium test have been clearly demonstrated in this research by the comparison between the results of seed dormancy calculated from the normal germination results and the percentage of remained viable seeds afier it. Finally, it has been possible to identify two hybrids (H-22 and H-13) with high forage potential and good seed quality, to be released as cultivar in the near future / Mestrado / Pre-Processamentos de Produtos Agropecuarios / Mestre em Engenharia Agrícola
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Utilização de Fontes de Nitrogênio em Tanzânia (Panicum maximum Jack.) no final da estação das águas / Use of sources of Nitrogen in Tanzania (Panicum maximum JacK.) in the end of the station of the rainsVuolo, Marcelo Gilberti 08 August 2006 (has links)
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Previous issue date: 2006-08-08 / The present work was accomplished with the intention of describing the behavior of sources nitrogens and his action in Tanzania in the corresponding final period the station of the waters (April-May). They were used seven different treatment under four repetitions, being each one of these equivalent sources to 100kg.N.ha-1, except for the treatment corresponding to the witness which came exempts of any manuring. The used sources were: uréia, sulfate of ammonium and nitrate of ammonium; and their respective combinations: uréia (50kg.N.ha-1) and sulfate of ammonium (50kg.N.ha-1), uréia (50kg.N.ha-1) and nitrate of ammonium (50kg.N.ha-1) and, sulfate of ammonium (50kg.N.ha-1) and nitrate of ammonium (50kg.N.ha-1). The samples were picked with use of wood picture representing area of a square meter, being analyzed the matter-drought tenors and of present nutritious in the aerial part of the plants. The studied sources are formulations of easy financial and physical access on the part of producers and rural entrepreneurs and they participate actively of the daily of the same ones when in the accomplishment of covering manurings in forages for won of vegetative growth. It is observed in the results that when inserted in a proportion of available Nitrogen of equal tenor, the sources behave in a similar way not presenting significant differences in the matter-drought tenors, nitrogen, match, potassium and calcium. As for the other nutritious: sulfur and magnesium are observed elevations of the tenors mainly in the treatments that possess sources that it contains sulfur in his/her composition (sulfate of ammonium; sulfate of ammonium and nitrate of ammonium; sulfate of ammonium and uréia). / O presente trabalho foi realizado com o intuito de descrever o comportamento de fontes nitrogenadas e sua ação em Tanzânia no período final correspondente a estação das águas (abril-maio). Foram utilizados sete tratamentos distintos sob quatro repetições, sendo cada uma destas fontes equivalentes a 100kg N ha-1, com exceção do tratamento correspondente à testemunha a qual apresentava-se isenta de qualquer adubação. As fontes utilizadas foram: uréia, sulfato de amônio e nitrato de amônio; e suas respectivas combinações: uréia (50kg.N.ha-1) e sulfato de amônio (50kg.N.ha-1), uréia (50kg.N.ha-1) e nitrato de amônio (50kg.N.ha-1) e, sulfato de amônio (50kg.N.ha-1) e nitrato de amônio (50kg.N.ha-1). As amostras foram colhidas com utilização de quadro de madeira representando área de um metro quadrado, sendo analisadas os teores de matéria-seca e de macronutrientes presentes na parte aérea das plantas. As fontes estudadas são formulações de fácil acesso financeiro e físico por parte de produtores e empresários rurais e participam ativamente do cotidiano dos mesmos quando na realização de adubações de cobertura em forragens para ganhos de crescimento vegetativo. Observou-se nos resultados que quando inseridas em uma proporção de Nitrogênio disponível de igual teor, as fontes se comportaram de forma similar não apresentando diferenças significativas nos teores de matéria-seca, nitrogênio, fósforo, potássio e cálcio. Quanto aos demais macronutrientes: enxofre e magnésio observaram-se elevações dos teores principalmente nos tratamentos que possuem fontes que contém enxofre em sua composição (sulfato de amônio; sulfato de amônio e nitrato de amônio; sulfato de amônio e uréia).
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Utilização de Fontes de Nitrogênio em Tanzânia (Panicum maximum Jack.) no final da estação das águas / Use of sources of Nitrogen in Tanzania (Panicum maximum JacK.) in the end of the station of the rainsVuolo, Marcelo Gilberti 08 August 2006 (has links)
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Previous issue date: 2006-08-08 / The present work was accomplished with the intention of describing the behavior of sources nitrogens and his action in Tanzania in the corresponding final period the station of the waters (April-May). They were used seven different treatment under four repetitions, being each one of these equivalent sources to 100kg.N.ha-1, except for the treatment corresponding to the witness which came exempts of any manuring. The used sources were: uréia, sulfate of ammonium and nitrate of ammonium; and their respective combinations: uréia (50kg.N.ha-1) and sulfate of ammonium (50kg.N.ha-1), uréia (50kg.N.ha-1) and nitrate of ammonium (50kg.N.ha-1) and, sulfate of ammonium (50kg.N.ha-1) and nitrate of ammonium (50kg.N.ha-1). The samples were picked with use of wood picture representing area of a square meter, being analyzed the matter-drought tenors and of present nutritious in the aerial part of the plants. The studied sources are formulations of easy financial and physical access on the part of producers and rural entrepreneurs and they participate actively of the daily of the same ones when in the accomplishment of covering manurings in forages for won of vegetative growth. It is observed in the results that when inserted in a proportion of available Nitrogen of equal tenor, the sources behave in a similar way not presenting significant differences in the matter-drought tenors, nitrogen, match, potassium and calcium. As for the other nutritious: sulfur and magnesium are observed elevations of the tenors mainly in the treatments that possess sources that it contains sulfur in his/her composition (sulfate of ammonium; sulfate of ammonium and nitrate of ammonium; sulfate of ammonium and uréia). / O presente trabalho foi realizado com o intuito de descrever o comportamento de fontes nitrogenadas e sua ação em Tanzânia no período final correspondente a estação das águas (abril-maio). Foram utilizados sete tratamentos distintos sob quatro repetições, sendo cada uma destas fontes equivalentes a 100kg N ha-1, com exceção do tratamento correspondente à testemunha a qual apresentava-se isenta de qualquer adubação. As fontes utilizadas foram: uréia, sulfato de amônio e nitrato de amônio; e suas respectivas combinações: uréia (50kg.N.ha-1) e sulfato de amônio (50kg.N.ha-1), uréia (50kg.N.ha-1) e nitrato de amônio (50kg.N.ha-1) e, sulfato de amônio (50kg.N.ha-1) e nitrato de amônio (50kg.N.ha-1). As amostras foram colhidas com utilização de quadro de madeira representando área de um metro quadrado, sendo analisadas os teores de matéria-seca e de macronutrientes presentes na parte aérea das plantas. As fontes estudadas são formulações de fácil acesso financeiro e físico por parte de produtores e empresários rurais e participam ativamente do cotidiano dos mesmos quando na realização de adubações de cobertura em forragens para ganhos de crescimento vegetativo. Observou-se nos resultados que quando inseridas em uma proporção de Nitrogênio disponível de igual teor, as fontes se comportaram de forma similar não apresentando diferenças significativas nos teores de matéria-seca, nitrogênio, fósforo, potássio e cálcio. Quanto aos demais macronutrientes: enxofre e magnésio observaram-se elevações dos teores principalmente nos tratamentos que possuem fontes que contém enxofre em sua composição (sulfato de amônio; sulfato de amônio e nitrato de amônio; sulfato de amônio e uréia).
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Produtividade do arroz de terras altas em razão da época de dessecação das plantas de cobertura /Nascente, Adriano Stephan, 1970- January 2012 (has links)
Orientador: Carlos Alexandre Costa Crusciol / Banca: Luis Fernando Stone / Banca: Orivaldo Arf / Banca: Juliano Carlos Calonego / Banca: José Laércio Favarin / Resumo: Plantas de cobertura podem romper camadas compactadas e sua palha pode equilibrar os teores de NO3- e NH4+ no solo e proporcionar melhor desenvolvimento do arroz no sistema semeadura direta (SSD). Entretanto, deve-se observar o momento adequado para se realizar a dessecação com glifosato das plantas de cobertura e evitar fitotoxicidade na cultura do arroz. Desta forma, objetivou-se nesse trabalho avaliar o efeito de espécies de cobertura sobre os atributos do solo e da época de dessecação no acúmulo de ácido chiquímico nas plantas de arroz, nos componentes da produção e na produtividade de grãos da cultura no SSD. O experimento foi conduzido na Fazenda Capivara da Embrapa Arroz e Feijão, Santo Antônio de Goiás, GO. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso com três repetições em esquema de parcelas subdivididas por dois anos agrícolas (2008/09 e 2009/10). As plantas de cobertura (Urochloa ruziziensis, Urochloa brizantha, Panicum maximum, Pennisetum glaucum) e o pousio estavam nas parcelas e a época de dessecação (-30, -20, -10 e 0 dias em relação à semeadura do arroz) nas subparcelas. O uso de plantas de cobertura proporciona maior estabilidade dos agregados e a redução da densidade do solo. A palha de milheto proporciona a menor densidade e relação NO3-/NH4+ no solo e a maior produtividade do arroz de terras altas. A aplicação de glifosato nas plantas de cobertura provoca translocação do herbicida para as plântulas de arroz e acúmulo de ácido chiquímico. A dessecação do milheto e pousio deve ser realizada entre 20 e 30 dias antes da semeadura do arroz. A dessecação de U. ruziziensis, U. brizantha e P. maximum deve ser realizada com mais de 30 dias em relação à semeadura do arroz / Abstract: Cover crops can break up compacted layers and their straw could balance the levels of NO3- e NH4+ in the soil and provide better rice development at no-tillage system (NTS). However, it must be observe the proper time to desiccate with glyphosate the cover crops and avoid phytotoxicity in rice crop. Therefore, this study aimed to evaluate the effect of cover crops in the soil attributes and the desiccated times in the amount of shikimic acid in rice plants, in the yield components and grain yield of upland rice sowed in the NTS. The trial was performed on Capivara farm from Embrapa Rice and Bean, Santo Antônio de Goiás, GO. The experimental design was a randomized blocks with three replications in a split-plot scheme for two growing seasons (2008/09 and 2009/10). The cover crop (Urochloa ruziziensis, Urochloa brizantha, Panicum maximum, Pennisetum glaucum) and fallow were in the main plots and desiccation times (-30, -20, -10 and 0 days in relation to rice sowing) were in the subplots. The use of cover crops in NTS provides greater aggregate stability and reducing soil compaction. The millet straw provides the lowest soil bulk density and relation NO3-/NH4+ and the highest upland rice yield. The application of glyphosate in cover crops causes herbicide translocation to the rice seedlings and accumulation of shikimic acid. Millet and fallow must be desiccated between 20 and 30 days before rice sowing. The cover crops U. ruziziensis, U. brizantha and P. maximum must be desiccated over 30 days prior to the rice sowing / Doutor
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Produtividade do arroz de terras altas em razão da época de dessecação das plantas de coberturaNascente, Adriano Stephan [UNESP] 17 December 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0
Previous issue date: 2012-12-17Bitstream added on 2014-06-13T20:00:35Z : No. of bitstreams: 1
nascente_as_dr_botfca.pdf: 704081 bytes, checksum: 6d1288bc73790e1f7aa9e9f5501d2cc8 (MD5) / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) / Plantas de cobertura podem romper camadas compactadas e sua palha pode equilibrar os teores de NO3- e NH4+ no solo e proporcionar melhor desenvolvimento do arroz no sistema semeadura direta (SSD). Entretanto, deve-se observar o momento adequado para se realizar a dessecação com glifosato das plantas de cobertura e evitar fitotoxicidade na cultura do arroz. Desta forma, objetivou-se nesse trabalho avaliar o efeito de espécies de cobertura sobre os atributos do solo e da época de dessecação no acúmulo de ácido chiquímico nas plantas de arroz, nos componentes da produção e na produtividade de grãos da cultura no SSD. O experimento foi conduzido na Fazenda Capivara da Embrapa Arroz e Feijão, Santo Antônio de Goiás, GO. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso com três repetições em esquema de parcelas subdivididas por dois anos agrícolas (2008/09 e 2009/10). As plantas de cobertura (Urochloa ruziziensis, Urochloa brizantha, Panicum maximum, Pennisetum glaucum) e o pousio estavam nas parcelas e a época de dessecação (-30, -20, -10 e 0 dias em relação à semeadura do arroz) nas subparcelas. O uso de plantas de cobertura proporciona maior estabilidade dos agregados e a redução da densidade do solo. A palha de milheto proporciona a menor densidade e relação NO3-/NH4+ no solo e a maior produtividade do arroz de terras altas. A aplicação de glifosato nas plantas de cobertura provoca translocação do herbicida para as plântulas de arroz e acúmulo de ácido chiquímico. A dessecação do milheto e pousio deve ser realizada entre 20 e 30 dias antes da semeadura do arroz. A dessecação de U. ruziziensis, U. brizantha e P. maximum deve ser realizada com mais de 30 dias em relação à semeadura do arroz / Cover crops can break up compacted layers and their straw could balance the levels of NO3- e NH4+ in the soil and provide better rice development at no-tillage system (NTS). However, it must be observe the proper time to desiccate with glyphosate the cover crops and avoid phytotoxicity in rice crop. Therefore, this study aimed to evaluate the effect of cover crops in the soil attributes and the desiccated times in the amount of shikimic acid in rice plants, in the yield components and grain yield of upland rice sowed in the NTS. The trial was performed on Capivara farm from Embrapa Rice and Bean, Santo Antônio de Goiás, GO. The experimental design was a randomized blocks with three replications in a split-plot scheme for two growing seasons (2008/09 and 2009/10). The cover crop (Urochloa ruziziensis, Urochloa brizantha, Panicum maximum, Pennisetum glaucum) and fallow were in the main plots and desiccation times (-30, -20, -10 and 0 days in relation to rice sowing) were in the subplots. The use of cover crops in NTS provides greater aggregate stability and reducing soil compaction. The millet straw provides the lowest soil bulk density and relation NO3-/NH4+ and the highest upland rice yield. The application of glyphosate in cover crops causes herbicide translocation to the rice seedlings and accumulation of shikimic acid. Millet and fallow must be desiccated between 20 and 30 days before rice sowing. The cover crops U. ruziziensis, U. brizantha and P. maximum must be desiccated over 30 days prior to the rice sowing
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Estudos genético-moleculares em Panicum maximum = mapeamento genético-molecular e análise de transcriptoma via RNA-seq = Genetic and molecular studies in Panicum maximum: genetic and molecular mapping and transcriptome analysis via RNA-seq / Genetic and molecular studies in Panicum maximum : genetic and molecular mapping and transcriptome analysis via RNA-seqToledo-Silva, Guilherme, 1983- 25 August 2018 (has links)
Orientadores: Anete Pereira de Souza, Liana Jank / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-25T03:40:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Toledo-Silva_Guilherme_D.pdf: 25638879 bytes, checksum: 40fca686426836cea01016a242b64c84 (MD5)
Previous issue date: 2013 / Resumo: No Brasil, a pecuária bovina é baseada principalmente na utilização de pastagens cultivadas para alimentação animal. A espécie Panicum maximum Jacq., popularmente conhecida no Brasil como capim colonião, encontra-se entre as espécies mais utilizadas na alimentação do gado de corte. Grande parte das áreas destinadas a pastagens encontra-se estabelecida com cultivares exóticas e de reprodução clonal. O monocultivo representa sério risco para todos os sistemas de produção baseados no uso de pastagens. Nesse sentido, o melhoramento genético de forrageiras e o lançamento de novas cultivares de P. maximum surgem como alternativa para a diversificação das pastagens. O presente trabalho teve como objetivo principal contribuir para o conhecimento básico sobre a genética e a biologia molecular de P. maximum. Primeiramente, foi realizada a montagem de novo e análise do transcriptoma da espécie utilizando a metodologia de sequenciamento massivo paralelo de cDNA (RNA-seq), resultando em 38.192 unigenes, os quais foram anotados em diferentes bancos de dados. A maioria dos genes relacionados as vias de fixação de carbono C4 e de síntese de lignocelulose foram identificados. Ainda, foram identificados 5.035 marcadores microssatélites (SSR) e 346.456 marcadores do tipo single nucleotide polymorphism (SNP) em todo o transcriptoma. Na segunda parte deste trabalho, foram desenvolvidos 131 novos marcadores moleculares do tipo microssatélite para P. maximum. Estes marcadores foram utilizados juntamente a 43 marcadores SSR obtidos da literatura, para construção de mapas genético-moleculares, através da genotipagem dos híbridos F1 resultantes de cruzamento intraespecífico. Os mapas de ligação cobriram 672,2 cM e 802,2 cM dos genomas dos genitores S10 e Mombaça. Estes resultados contribuem para a pesquisa associada a P. maximum e forrageiras tropicais, assim como para os programas de melhoramento genético / Abstract: In Brazil, livestock feeding is mainly based on cultivated pastures. Panicum maximum Jacq., also known as capim-colonião, figures among the most cultivated tropical forage plants in brazilian pastures, which are established with exotic cultivars of clonal reproduction, leading to monoculture, and consequently offering serious risks to associated production systems. One possible solution to monoculture falls on new cultivars releases, throught breeding programs, diversificating livestock pastures in Brazil. The work presented here had an objective of elucidate some basic aspects regarding the genetics and molecular biology of P. maximum. First, we conducted a de novo assembly and analysis of leaf transcriptome, throught massive parallel cDNA sequencing (RNA-seq), resulting in 38.192 unigenes, which were annotated in different databases. Genes related to C4 metabolism and lignocellulose synthesis are valuable resource to breeding programs and were identified among assembled transcripts. Thus, several putative molecular markers were located in unigenes: 5.035 microsatellites (SSR) motifs and 346.456 single nucleotide polymorphism (SNP) positions. Also, we developed 131 new genomic and expressed SSR markers for P. maximum. These markers were used with 43 published SSR markers to develop a genetic map. A segregating F1 population were used for such, hybrids of S10 (sexual genotype) and Mombaça (apomictic genotype) crossing. Linkage maps covered 672,2 cM and 802,2 cM of parentals genomes respectively, using 88 and 96 markers each. Results presented in this work contributes to P. maximum and tropical grasses related research and breeding programs / Doutorado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Doutor em Genetica e Biologia Molecular
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