Os peixes teleósteos representam cerca de metade de todas as espécies de vertebrados já descritas. Esta rica diversidade reflete-se nas diferentes formas de determinação sexual, sendo as principais desencadeadas por influência ambiental e por fatores genéticos. Os genes envolvidos neste mecanismo têm sido caracterizados em diversas espécies de peixes teleósteos, como é o caso dos genes dmrt1 e amh que têm importante papel na diferenciação em machos de teleósteos e o gene cyp19a1a, que possui relação com a diferenciação sexual de fêmeas. Têm sido cada vez mais corrente na literatura, estudos envolvendo genes da via de diferenciação sexual em espécies de teleósteos, porém escassas são as informações em relação à ordem Characiformes. Além da genética, a biologia reprodutiva de peixes teleósteos engloba ainda estudos relativos ao papel dos hormônios e do ambiente na reprodução, inclusive na reprodução em cativeiro. A presente dissertação tem como principal objetivo a análise dos genes acima citados na espécie Characidium schubarti (Characiformes) - que possui pouca informação sobre sua biologia reprodutiva na literatura-; caracterizando fragmentos dos genes dmrt1 e cyp19a1a e a similaridade destes com os mesmos já descritos em outras ordens de peixes teleósteos. Além disso, foi possível no desenvolver do projeto, obter informações pertinentes em relação ao papel do ambiente e de hormônios exógenos na reprodução da espécie. Espera-se que com o aumento de pesquisas envolvendo genes relacionados ao sexo, o objetivo de controlar o gênero sexual em peixes economicamente importantes possa ser alcançado com sucesso a partir do controle da expressão de fatores da via de diferenciação / Teleost fishes represent about half of all vertebrate species already described. Such a rich diversity is reflected in different forms of sex determination, the main ones being triggered by environmental influences and genetic factors. Genes such as amh and dmrt1 are involved in this mechanism and have been characterized in several teleost fish species, they play an important role in the differentiation of teleost males whereas the cyp19a1a gene is related to the female sexual differentiation. Have been increasingly common in the literature, studies concerning the rule of genes in sex differentiation in teleosts, however pieces of information regarding the order Characiformes are scarce. Besides genetics, reproductive biology of teleost fishes also includes studies on the role of hormones and environment on reproduction, and also captive breeding. This thesis aims to analyze the aforementioned species in Characidium schubarti (Characiformes) genes for which little information exists on their reproductive biology literature featuring fragments of genes dmrt1 and cyp19a1a and the similarity of these with those already described in other orders of teleost fish . Moreover, it was possible to develop the project, obtaining relevant information regarding the role of the environment and exogenous hormones in reproduction of the species. It is expected that with the increase of research involving genes related to sex, in order to control the sexual gender for such an economically important fish can be successfully achieved from the control of the expression of factors of differentiation

Os peixes teleósteos representam cerca de metade de todas as espécies de vertebrados já descritas. Esta rica diversidade reflete-se nas diferentes formas de determinação sexual, sendo as principais desencadeadas por influência ambiental e por fatores genéticos. Os genes envolvidos neste mecanismo têm sido caracterizados em diversas espécies de peixes teleósteos, como é o caso dos genes dmrt1 e amh que têm importante papel na diferenciação em machos de teleósteos e o gene cyp19a1a, que possui relação com a diferenciação sexual de fêmeas. Têm sido cada vez mais corrente na literatura, estudos envolvendo genes da via de diferenciação sexual em espécies de teleósteos, porém escassas são as informações em relação à ordem Characiformes. Além da genética, a biologia reprodutiva de peixes teleósteos engloba ainda estudos relativos ao papel dos hormônios e do ambiente na reprodução, inclusive na reprodução em cativeiro. A presente dissertação tem como principal objetivo a análise dos genes acima citados na espécie Characidium schubarti (Characiformes) - que possui pouca informação sobre sua biologia reprodutiva na literatura-; caracterizando fragmentos dos genes dmrt1 e cyp19a1a e a similaridade destes com os mesmos já descritos em outras ordens de peixes teleósteos. Além disso, foi possível no desenvolver do projeto, obter informações pertinentes em relação ao papel do ambiente e de hormônios exógenos na reprodução da espécie. Espera-se que com o aumento de pesquisas envolvendo genes relacionados ao sexo, o objetivo de controlar o gênero sexual em peixes economicamente importantes possa ser alcançado com sucesso a partir do controle da expressão de fatores da via de diferenciação / Teleost fishes represent about half of all vertebrate species already described. Such a rich diversity is reflected in different forms of sex determination, the main ones being triggered by environmental influences and genetic factors. Genes such as amh and dmrt1 are involved in this mechanism and have been characterized in several teleost fish species, they play an important role in the differentiation of teleost males whereas the cyp19a1a gene is related to the female sexual differentiation. Have been increasingly common in the literature, studies concerning the rule of genes in sex differentiation in teleosts, however pieces of information regarding the order Characiformes are scarce. Besides genetics, reproductive biology of teleost fishes also includes studies on the role of hormones and environment on reproduction, and also captive breeding. This thesis aims to analyze the aforementioned species in Characidium schubarti (Characiformes) genes for which little information exists on their reproductive biology literature featuring fragments of genes dmrt1 and cyp19a1a and the similarity of these with those already described in other orders of teleost fish . Moreover, it was possible to develop the project, obtaining relevant information regarding the role of the environment and exogenous hormones in reproduction of the species. It is expected that with the increase of research involving genes related to sex, in order to control the sexual gender for such an economically important fish can be successfully achieved from the control of the expression of factors of differentiation

O grupo Characidium lauroi pertence ao gênero Characidium e é formado por seis espécies, C. lauroi, Characidium sp. piabanha, C. japuhybense, C. oiticicai, C. schubarti, e Characidium sp. iguaçu, que se distribuem nas bacias do Rio Paraíba do Sul, Drenagens Costeiras da Baía de Ilha Grande, Rio Tietê, Rio Paranapanema e Rio Iguaçu, respectivamente. Os estudos disponíveis sobre as relações evolutivas entre as espécies que compõem esse grupo baseiam-se em dados morfológicos que, entretanto, não foram suficientes para resolver as relações entre C. oiticicai, C. schubarti e Characidium sp. iguaçu. Estudos citogenéticos ou moleculares não foram aplicados até agora às espécies do gênero Characidium com o intuito de verificar a existência do grupo C. lauroi. Técnicas que envolvem o uso de DNAmt, como PCR-RFLP, DNA barcoding e sequenciamento podem auxiliar na resolução dessa questão, uma vez que as espécies do gênero Characidium formam um grupo interessante para a aplicação dessas técnicas, principalmente por apresentar algumas espécies com limites taxonômicos muito próximos, como as espécies que compõem o grupo C. lauroi. No presente estudo, técnicas de citogenética clássica e molecular, assim como a técnica de PCR-RFLP, o uso do DNA barcoding e sequenciamento foram utilizados na tentativa de analisar e elucidar as relações filogenéticas entre as espécies do gênero Characidium, principalmente com enfoque nas relações entre as espécies do grupo C. lauroi. Os resultados citogenéticos encontrados indicam que esse grupo de espécies pode ser definido pela presença de cromossomos sexuais diferenciados do tipo ZZ/ZW portadores de cístrons ribossomais e pela presença de um cariótipo relativamente estável. No entanto, essas características não estão restritas ao grupo C. lauroi. Os resultados de PCR-RFLP, assim como os resultados obtidos por meio do DNA barcoding e sequenciamento, indicam que as espécies C. lauroi e C. sp. piabanha podem formar uma única espécie, da mesma forma que as populações de C. schubarti. No entanto, as espécies do grupo C. lauroi não formam um grupo monofilético. A relação entre as espécies do grupo C. lauroi com C. pterostictum e C. lanei pode indicar que essas espécies tenham passado por uma separação recente e que, não necessariamente essas duas espécies façam parte do grupo C. lauroi, mas sim que fazem parte de um grupo maior de espécies do gênero Characidium, o que é corroborado até por dados citogenéticos. Comparações entre as topologias encontradas com base em dados morfológicos e moleculares e suas implicações na delimitação e nas relações encontradas entre as espécies do grupo C. lauroi são discutidas. / The group Characidium lauroi belongs to the genus Characidium and consists of six species, C. lauroi, Characidium sp. piabanha, C. japuhybense, C. oiticicai, C. schubarti and Characidium sp. iguaçu; which are distributed in the basins of the Paraiba do Sul River, Drainage Coastal Bay of Ilha Grande, Tietê River, Paranapanema River and Iguaçu River, respectively. Available studies on the evolutionary relationships between species that make up this group are based on morphological data, however, were not sufficient to address the relationship between C. oiticicai, C. schubarti and Characidium sp. iguaçu. Cytogenetic and molecular studies have not been applied so far to the species of the genus Characidium in order to verify the existence of group C. lauroi. Techniques that involve the use of mtDNA, such as PCRRFLP, DNA barcoding and sequencing may help in resolving this issue, since the genus Characidium form an interesting group for the application of these techniques, mainly for some species with taxonomic boundaries very close, as the species that make up group C. lauroi. In this study, techniques of classical and molecular cytogenetics, as well as PCR-RFLP, the use of DNA barcoding and sequencing were used in an attempt to analyze and elucidate the phylogenetic relationships among species of the genus Characidium, mainly focusing on relations between species of group C. lauroi. The cytogenetic results obtained indicate that this group of species can be defined by the presence of sex chromosomes differentiated ZZ / ZW carrying ribosomal cistrons and the presence of a relatively stable karyotype. However, these features are not restricted to the group C. lauroi. The results of PCR-RFLP and the results obtained by barcoding DNA and the sequencing, indicate that C. lauroi and Characidium sp. piabanha may form a single species, in the same way that populations of C. schubarti. However, the species of group C. lauroi not form a monophyletic group. The relationship between species of group C. lauroi with C. pterostictum and C. lanei may indicate that these species have experienced a recent separation and, not necessarily these two species are part of group C. lauroi, but they are part of a larger group of species of the genus Characidium, which is supported even by cytogenetic data. Comparisons between the topologies found based on morphological and molecular data and its implications for delimitation and relationships found between species of group C. lauroi are discussed.

O grupo Characidium lauroi pertence ao gênero Characidium e é formado por seis espécies, C. lauroi, Characidium sp. piabanha, C. japuhybense, C. oiticicai, C. schubarti, e Characidium sp. iguaçu, que se distribuem nas bacias do Rio Paraíba do Sul, Drenagens Costeiras da Baía de Ilha Grande, Rio Tietê, Rio Paranapanema e Rio Iguaçu, respectivamente. Os estudos disponíveis sobre as relações evolutivas entre as espécies que compõem esse grupo baseiam-se em dados morfológicos que, entretanto, não foram suficientes para resolver as relações entre C. oiticicai, C. schubarti e Characidium sp. iguaçu. Estudos citogenéticos ou moleculares não foram aplicados até agora às espécies do gênero Characidium com o intuito de verificar a existência do grupo C. lauroi. Técnicas que envolvem o uso de DNAmt, como PCR-RFLP, DNA barcoding e sequenciamento podem auxiliar na resolução dessa questão, uma vez que as espécies do gênero Characidium formam um grupo interessante para a aplicação dessas técnicas, principalmente por apresentar algumas espécies com limites taxonômicos muito próximos, como as espécies que compõem o grupo C. lauroi. No presente estudo, técnicas de citogenética clássica e molecular, assim como a técnica de PCR-RFLP, o uso do DNA barcoding e sequenciamento foram utilizados na tentativa de analisar e elucidar as relações filogenéticas entre as espécies do gênero Characidium, principalmente com enfoque nas relações entre as espécies do grupo C. lauroi. Os resultados citogenéticos encontrados indicam que esse grupo de espécies pode ser definido pela presença de cromossomos sexuais diferenciados do tipo ZZ/ZW portadores de cístrons ribossomais e pela presença de um cariótipo relativamente estável. No entanto, essas características não estão restritas ao grupo C. lauroi. Os resultados de PCR-RFLP, assim como os resultados obtidos por meio do DNA barcoding e sequenciamento, indicam que as espécies C. lauroi e C. sp. piabanha podem formar uma única espécie, da mesma forma que as populações de C. schubarti. No entanto, as espécies do grupo C. lauroi não formam um grupo monofilético. A relação entre as espécies do grupo C. lauroi com C. pterostictum e C. lanei pode indicar que essas espécies tenham passado por uma separação recente e que, não necessariamente essas duas espécies façam parte do grupo C. lauroi, mas sim que fazem parte de um grupo maior de espécies do gênero Characidium, o que é corroborado até por dados citogenéticos. Comparações entre as topologias encontradas com base em dados morfológicos e moleculares e suas implicações na delimitação e nas relações encontradas entre as espécies do grupo C. lauroi são discutidas. / The group Characidium lauroi belongs to the genus Characidium and consists of six species, C. lauroi, Characidium sp. piabanha, C. japuhybense, C. oiticicai, C. schubarti and Characidium sp. iguaçu; which are distributed in the basins of the Paraiba do Sul River, Drainage Coastal Bay of Ilha Grande, Tietê River, Paranapanema River and Iguaçu River, respectively. Available studies on the evolutionary relationships between species that make up this group are based on morphological data, however, were not sufficient to address the relationship between C. oiticicai, C. schubarti and Characidium sp. iguaçu. Cytogenetic and molecular studies have not been applied so far to the species of the genus Characidium in order to verify the existence of group C. lauroi. Techniques that involve the use of mtDNA, such as PCRRFLP, DNA barcoding and sequencing may help in resolving this issue, since the genus Characidium form an interesting group for the application of these techniques, mainly for some species with taxonomic boundaries very close, as the species that make up group C. lauroi. In this study, techniques of classical and molecular cytogenetics, as well as PCR-RFLP, the use of DNA barcoding and sequencing were used in an attempt to analyze and elucidate the phylogenetic relationships among species of the genus Characidium, mainly focusing on relations between species of group C. lauroi. The cytogenetic results obtained indicate that this group of species can be defined by the presence of sex chromosomes differentiated ZZ / ZW carrying ribosomal cistrons and the presence of a relatively stable karyotype. However, these features are not restricted to the group C. lauroi. The results of PCR-RFLP and the results obtained by barcoding DNA and the sequencing, indicate that C. lauroi and Characidium sp. piabanha may form a single species, in the same way that populations of C. schubarti. However, the species of group C. lauroi not form a monophyletic group. The relationship between species of group C. lauroi with C. pterostictum and C. lanei may indicate that these species have experienced a recent separation and, not necessarily these two species are part of group C. lauroi, but they are part of a larger group of species of the genus Characidium, which is supported even by cytogenetic data. Comparisons between the topologies found based on morphological and molecular data and its implications for delimitation and relationships found between species of group C. lauroi are discussed.

Made available in DSpace on 2016-05-02T13:55:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Alexandre Rodrigues da Silva.pdf: 537157 bytes, checksum: 26ef64737314d9afbcf947440006a927 (MD5) Previous issue date: 2005-02-28 / Coordenacao de Aperfeicoamento de Pessoal de Nïvel Superior / Cytogenetic studies were performed on four populations of the fishes belonging to the Characidium genus collected on small tributaries of the Grande River basin south of the State of Minas Gerais Brazil The studies brought forth two manuscripts whose abstracts are presented below Manuscript one Cytogenetic divergences between two sympatric species of Characidium (Teleostei Characiformes, Crenuchidae) from Machado River MG Brazil Cytogenetic studies were performed on two sympatric species of Characidium C gomesi and C cf zebra from the Grande river basin Minas Gerais State Brazil Although both species had a chromosome number equal to 50 chromosomes with a karyotype exclusively consisting of meta- and submetacentric chromosomes an interspecific diversity was detected concerning the size of the two first chromosome pairs of the karyotypes Active NORs were located at terminal position on the long arm of the 17th pair in C gomesi and at subterminal position on the long arm of the 23th pair in C cf zebra The fluorochrome CMA3 stained only the NOR-bearing pair of chromosomes of both species The pattern of heterochromatin also showed some differentiation among these species being restricted to centromeric or pericentromeric region in C cf zebra and practically absent in C gomesi These data are discussed concerning chromosome diversification in this fish group Manuscript two Karyotype characterization of two alopatric populations of Characidium cf zebra (Pisces Crenuchidae) from Grande River basin MG Brazil Two populations of Characidium cf zebra were collected in tributaries from Grande river basin and analyzed from the cytogenetic viewpoint Both C cf zebra populations studied had the same karyotypic structure with diploid number 2n igual 50 metacentric/submetacentric chromosomes and fundamental number 100 C-band patterns showed heterochromatin only in the centromeric region Results of analyses from the nucleolus organizer region obtained by silver nitrate staining was observed on one pair of small submetacentric chromosomes at the terminal position of the long arm Treatment with chromomycin A3 (CMA3) showed regions rich in GC base pairs in the NOR-bearing pair of chromosomes on both populations and in one metacentric chromosome with bright signal on the terminal position in the long arm in the Coqueiro stream population Some aspects related to C cf zebra chromosome composition are discussed / Foram realizados estudos citogenéticos em quatro populações de peixes pertencentes ao gênero Characidium coletados em pequenos tributários da bacia do Rio Grande sul do Estado de Minas Gerais Brasil Os estudos resultaram em dois artigos sendo apresentados seus resumos abaixo Primeiro artigo Divergências Citogenéticas entre duas espécies simpátricas de Characidium (Teleostei Characiformes Crenuchidae) do Rio Machado MG Brasil Foram realizados estudos citogenéticos em duas espécies simpátricas de Characidium C gomesi e C cf zebra da bacia do Rio Grande Estado de Minas Gerais Brasil Embora ambas as espécies tenham apresentado um número de cromossomos igual a 50 com um cariótipo que consiste exclusivamente de cromossomos meta e submetacêntricos uma diversidade interespecífica foi detectada envolvendo o tamanho dos dois primeiros pares de cromossomos do cariótipo RONs ativas foram localizadas em posição terminal no braço longo do décimo sete par em C gomesi e em posição subterminal no braço longo do vigésimo terceiro par de C cf zebra O fluorocromo CMA3 marcou somente o par cromossômico portador da RON em ambas as espécies O padrão de heterocromatina também mostrou alguma diferenciação entre estas espécies estando restrita a regiões centroméricas ou pericentroméricas em C cf zebra e praticamente ausente em C gomesi Estes dados são discutidos no que diz respeito à diversificação cromossômica neste grupo de peixes Segundo artigo Caracterização do Cariótipo de duas populações alopátricas de Characidium cf zebra (Pisces Crenuchidae) da bacia do Rio Grande MG Brasil Duas populações de Characidium cf zebra foram coletadas em tributários da bacia do rio Grande e analisadas sob o aspecto citogenético Ambas as populações de C cf zebra estudadas apresentaram a mesma estrutura cariotípica com número diplóide de 2n igual 50 cromossomos meta e submetacêntricos e número fundamental igual a 100 O bandeamento C evidenciou a heterocromatina somente na região centromérica Resultados das análises da região organizadora de nucléolos obtidas pela marcação com o nitrato de prata evidenciaram as mesmas na posição terminal do braço longo de um pequeno par de cromossomos submetacêntricos O tratamento dos cromossomos com o fluorocromo cromomicina A3 (CMA3) mostrou regiões ricas em pares de bases GC no par de cromossomos marcado pela RON em ambas as populações e em um cromossomo metacêntrico na posição terminal do braço longo na população do córrego do Coqueiro Alguns aspectos relacionados à composição cromossômica de C cf zebra são discutidos

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-01-18T20:28:29Z No. of bitstreams: 1 542771.pdf: 11497250 bytes, checksum: a473c9719ac5165bb0ee4a8bbf6129e2 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-18T20:28:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 542771.pdf: 11497250 bytes, checksum: a473c9719ac5165bb0ee4a8bbf6129e2 (MD5) Previous issue date: 2001-06-29 / CAPES / O "grupo Characidium lauroi" é formado por seis espécies que habitam pequenos riachos de montanha, tributários do rio Iguaçu, Paranapanema, Tietê, Paraíba do Sul, além dos rios costeiros entre a baía da Ilha Grande e a Ribeira de Iguape. Quatro dessas espécies foram descridas por Haroldo Travassos entre as décadas de 40 e 60, Characidium lauroi, C. japuhybense, C. schubarti e C. oiticicai, e duas são novas para a ciência, Characidium sp. "piabanha" e Characidium sp. "iguaçu". Três sinapomorfias corroboram a monofilia do grupo: a ausência do ramo parietal do canal látero-sensorial da cabeça; barras tranversais com poucos cromatóforos; e presença de pequenas máculas arredondadas ao longo do flanco. As relações filogenéticas entre essas espécies sugerem que os eventos de separação das cabeceiras dos rios do sudeste foram importantes nos processos de especiação e diversificação do grupo. Characidium japuhybense, que ocorre apenas nos riachos costeiros, é a espécie mais basal do grupo. Characidium lauroi e C. sp. "piabanha" estão mais relacionadas com as espécies da bacia do Paraná do que com a anterior; entretanto, formam um clado monofilético endêmico das tributários do alto e médio rio Paraíba do Sul. As relações entre C. schubarti, C. oiticicai e Characidium sp. "iguaçu", formam uma politomia, que demonstra uma suposta separação tardia entre e complexa as cabeceiras do Iguaçu, Tietê, Paranapanema e Ribeira de Iguape. / The "Characidium lauroi" group is composed by five species, that inhabit small mountains streams, such as the tributaries of the Iguaçu, Paranapanema, Tietê and Paraíba do Sul rivers, and coastal streams between Ilha Grande bay and Ribeira de Iguape. Four of these species were described by Haroldo Travassos between the 1940's and 1960's, Characidium lauroi, C. japuhybense, C. schubarti e C. oiticicai, and two of them are new to the science, Characidium sp. "piabanha" e Characidium sp. "iguaçu". Three sinapomorphies corroborate the monophily of the group: absence of parietal branch in the head laterossensorial system; small number of cromatophores in the transversal bars; and small rounded spots along the side of the body. The phylogenetic relationships among these species suggest that the history of isolating events among of the headwaters of southeastern Brazil was important for the species diversification process. Characidium japuhybense, which occurs only in coastal rivers, is the most basal species. Characidium lauroi and Characidium sp. "piabanha" form a monophyletic clade that is endemic to upper and middle Paraíba do Sul river drainages. The sister group of this clade is comprised of species that occur in the Parana drainage. The relationships among C. schubarti, C. oiticicai and Characidium. sp. "iguaçu" clade are poorly resolved, thus suggesting a putative recent and complex separation between the headwaters of the rivers Iguaçu, Tietê, Paranapanema and Ribeira de Iguape.

Submitted by ÉRICA ALVES SERRANO FREITAS null (ericaserrano@ibb.unesp.br) on 2017-01-09T12:02:55Z No. of bitstreams: 1 TESE Érica Alves Serrano.pdf: 10056165 bytes, checksum: a4b250d060ea74b9f61a8fe8636426d0 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-01-11T18:08:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 freitas_eas_dr_bot.pdf: 10056165 bytes, checksum: a4b250d060ea74b9f61a8fe8636426d0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-11T18:08:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 freitas_eas_dr_bot.pdf: 10056165 bytes, checksum: a4b250d060ea74b9f61a8fe8636426d0 (MD5) Previous issue date: 2016-12-07 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Cromossomos B são componentes aparentemente dispensáveis encontrados nos genomas de inúmeras espécies, compostos basicamente de sequências repetitivas de DNA. Dentre uma variedade de questões a respeito destes elementos, a busca pelo conhecimento de sua origem tem sido amplamente estudada. Em peixes, a ocorrência destes cromossomos foi relatada em cerca de 60 espécies, incluindo espécies do gênero Characidium, no qual estes elementos aparentam não ter uma origem única. Com o objetivo de investigar a origem e conteúdo molecular dos cromossomos B em Characidium, nós analisamos duas espécies, Characidium gomesi e Characidium alipioi, portadoras de cromossomos B, utilizando a combinação de técnicas citogenéticas moleculares, análises de sequências e sequenciamento massivo. Nossos resultados mostraram que i) em ambas as espécies os Bs tiveram origem intraespecífica, no entanto, em C. alipioi se originaram de forma independente em relação aos Bs de outras duas espécies do gênero, assim, não compartilham os mesmos cromossomos ancestrais; ii) em C. gomesi as duas variantes compartilham DNA repetitivos, sendo cinco distribuídos nos cromossomos A, B e ZW, e um restrito aos cromossomos B e ZW, confirmando a origem dos Bs a partir dos cromossomos sexuais; iii) os supranumerários em C. alipioi provavelmente surgiram a partir do par de cromossomos autossômicos submetacêntrico 19; iv) Bs em C. alipioi se tornaram um cenário propício para acumulação de DNAs repetitivos após seu surgimento; e v) a histona H3 isolada dos cromossomos B e A de C. gomesi apresentou idêntica sequência de aminoácidos, e as taxas de dN/dS foram menores para aquelas provenientes do genoma B, sugerindo a ação de uma seleção positiva e possível transcrição das cópias no supranumerário. Os resultados obtidos reforçam a importância da integralização de abordagens cromossômicas e moleculares para compreender questões relacionadas à biologia evolutiva de cromossomos supranumerários, uma vez que, permitiram ampliar o conhecimento sobre a estrutura, composição e origem dos cromossomos B entre os representantes do gênero Characidium. Tais observações reforçam a proposição deste grupo de peixes como um modelo interessante de estudos sobre a origem e estrutura destes elementos genômicos, bem como das estratégias evolutivas apresentadas pelos cromossomos supranumerários nos peixes. / B chromosomes are apparently dispensable components found in the genomes of many species, mainly composed of repetitive DNA sequences. These elements have been reported in approximately 60 fish species, including the genus Characidium, in which these elements do not appear to have a single origin. In order to investigate the origin and molecular content of B chromosomes in Characidium, we analyzed two species bearing B chromosomes, Characidium gomesi and Characidium alipioi, using a combination of molecular cytogenetic techniques, DNA sequence analysis and massive sequencing. Our results showed that i) the B chromosomes of both species had an intraspecific origin, but from different chromosomes; ii) the two B-variants of C. gomesi share the same repetitive DNA sequences, five distributed on the elements of the A set, and on B and ZW chromosomes, and one restricted to B and ZW chromosomes, reforcing its origin from the sex chromosomes; iii) the supernumerary in C. alipioi probably arose from the chromosomes of the submetacentric pair 19; iv) B chromosomes in C. alipioi became a conducive setting for repetitive DNAs accumulation after its emergence; v) the sequence of H3 histone gene isolated from the chromosomes of the A set and B chromosomes of C. gomesi presented identical aminoacid sequences and the rates of dN/dS were lower for those from the B genome, suggesting the action of a positive selection and possible transcription of the supernumerary copies. The results reveals the importance of multiple approaches of chromosomal and molecular methods to understand issues related to evolutionary biology of supernumerary chromosomes, once allowed to increase knowledge about the structure, composition and origin of B chromosomes in representatives of the genus Characidium. These observations reinforce the proposition of this fish group as an interesting model for studies on the origin and structure of these genomic elements and the evolutionary strategies presented by supernumerary chromosomes in fish. / FAPESP: 2013/02143-3

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-04-28Bitstream added on 2014-06-13T18:49:59Z : No. of bitstreams: 1 silveira_lgg_me_sjrp.pdf: 677330 bytes, checksum: 60c27e1985cb1219edc741012f5ab3db (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Characidium lagosantense Travassos, 1947 é redescrito e uma nova espécie do Alto rio Paraná é apresentada. Foram examinados 400 exemplares provenientes do centroeste (Goiás e Mato Grosso do Sul) e sudeste do Brasil (Minas Gerais e São Paulo). Através de análise morfométrica e merística, padrão de colorido e caracteres osteológicos foi possível redescrever C. lagosantense e reconhecer uma nova espécie para o sistema do Alto rio Paraná. Ambas as espécies diferenciam-se de todas as demais espécies do gênero por apresentarem corpo alto (em média maior que 25% do CP) e comprimento padrão máximo raramente ultrapassando 25 mm. Aproximam-se de C. bahiense Almeida, 1971, descrita de lagoas temporárias em Arembepe – Bahia, e C. laterale (Boulenger, 1895), descrita do Baixo rio Paraná no Paraguai. Characidium lagosantense difere de Characidium sp. por apresentar linha lateral completa, comprimento da nadadeira peitoral maior que o comprimento da nadadeira pélvica e ausência de uma mancha irregular na forma de um borrão no pedúnculo caudal. A distribuição de C. lagosantense é ampliada para a drenagem do rio Paranã (bacia do Alto rio Tocantins - GO) e para a drenagem do rio Mogi-Guaçu (bacia do Alto rio Paraná - SP). / Characidium lagosantense Travassos, 1947 is redescribed and a new species from the Alto rio Paraná is presentation. Four hundred specimens were examined from west central (Goiás and Mato Grosso do Sul) and southeast of Brazil (Minas Gerais and São Paulo). Through morfometric and meristic analysis, color pattern and osteological characters it was possible to redescribe C. lagosantense and propose a new species from the Alto rio Paraná system. Both species differ from all other species in the genus by presenting deep body (usually deeper than 25% of CP) and maximum standard length rarely surpassing 25 mm. Both approach C. bahiense Almeida, 1971, described from a small lake in Arembepe – Bahia, and C. laterale (Boulenger, 1895), described from lower rio Paraná – Paraguai. Characidium lagosantense differs from Characidium sp. for presenting complete lateral line, pectoral fin larger than pelvic fin, and irregular blotch in the form of a blot in the caudal peduncle absent. The distribution of C. lagosantense now includes also the drainages of rio Paranã (Alto rio Tocantins basin - GO) and rio Mogí- Guaçu (Alto rio Paraná basin - SP).

Submitted by Elizabete Silva (elizabete.silva@ufes.br) on 2015-08-19T19:32:29Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Redescrição, osteologia craniana e limites de distribuição geográfica de Characidium timbuiense Travassos, 1946 (Characiformes Crenuchidae), com descrição de três e.pdf: 9134164 bytes, checksum: 61bc79f622c154746242143ed779547a (MD5) / Approved for entry into archive by Morgana Andrade (morgana.andrade@ufes.br) on 2016-01-11T11:30:01Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Redescrição, osteologia craniana e limites de distribuição geográfica de Characidium timbuiense Travassos, 1946 (Characiformes Crenuchidae), com descrição de três e.pdf: 9134164 bytes, checksum: 61bc79f622c154746242143ed779547a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-11T11:30:01Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Redescrição, osteologia craniana e limites de distribuição geográfica de Characidium timbuiense Travassos, 1946 (Characiformes Crenuchidae), com descrição de três e.pdf: 9134164 bytes, checksum: 61bc79f622c154746242143ed779547a (MD5) Previous issue date: 2015 / CAPES / Apresenta-se a redescrição de Characidium timbuiense Travassos, 1946 incluindo a osteologia craniana. Characidium timbuiense difere das demais congêneres, exceto C. grajahuense, C. pterostictum e C. vidali, pela presença de manchas com formato de poliedros, que ocorrem na porção média e inferior das laterais do corpo. A espécie, que era conhecida apenas para as cabeceiras do rio Timbuí, teve sua distribuição ampliada. Seus limites geográficos foram conhecidos, sendo ao norte a bacia do rio Piraquê-Açu, ao leste o Oceano Atlântico, ao sul a bacia do rio Itapemirim e ao oeste o divisor de águas que separa o vale do rio Doce das drenagens litorâneas circunvizinhas. Characidium timbuiense é comparada com espécies nominais e formas potencialmente novas, geograficamente próximas. Três espécies vizinhas potencialmente novas são descritas. Sendo, Characidium sp. ―caparaó‖, ocorrente na região dos contrafortes da Serra do Caparaó; Characidium sp. ―cricaré‖, ocorrente da bacia do rio Jucuruçu até a bacia do rio Itapemirim e Characidium sp. ―doce‖, aparentemente endêmica da bacia do rio Doce. Finalmente, é disponibilizada uma chave de identificação taxonômica para as espécies de Characidium das drenagens da Mata Atlântica Nordeste, entre as bacias do rio Jucuruçu ao Itabapoana. / A redescription of Characidium timbuiense Travassos 1946 is provided, including the cranial osteology. Characidium timbuiense is distinctive from the species within the genus, with the exception of C. grajahuense, C. pterostictum and C. vidali, by the presence of polyedric shaped spots distributed over the middle and low portions of lateral sides of body. The species, known only for headwaters of rio Timbuí, has its distribution expanded. Its geographical limits were stablished, corresponding to rio Piraquê-Açu basin on North, Atlantic Ocean on east, rio Itapemirim basin on south and watershed divide between the rio Doce and neighbor drainages on west. Characidium timbuiense is compared with nominal species and potentially new forms, geographically close. Three potentially new species are described. Characidium sp. "caparaó", from montane region of Caparaó; Characidium sp. "cricaré", ranging from Rio Jucuruçu to the Rio Itapemirim and Characidium sp. ―doce‖, apparently endemic to the Rio Doce basin. Finally, an identification key is available for recognition of Characidium species on Northeastern Mata Atlântica between the rivers Jucuruçu to Itabapoana.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-19Bitstream added on 2014-06-13T20:07:16Z : No. of bitstreams: 1 alves_jcp_dr_botib.pdf: 3347522 bytes, checksum: 430f7c8a15cc08bc6af20d88aee1d9cc (MD5) / Foram analisadas onze espécies de peixes do gênero Characidium, Characidium cf. zebra, Characidium cf. gomesi, Characidium lauroi, Characidium oiticicai, Characidium lanei, Characidium pterostictum, Characidium schubarti, Characidium alipioi, Characidium sp1, Characidium sp2 e Characidium sp3 de diferentes bacias hidrográficas brasileiras, com o uso de técnicas citogenéticas básicas (coloração com Giemsa, localização das RONs pela marcação com nitrato de Prata e bandamento C) e moleculares (marcação por fluorocromos base-específicos, hibridação in situ fluorescente com sondas de DNAr 18S e 5S, com sondas teloméricas (TTAGGG)n e com sondas para histona H1 e também microdissecção, amplificação e hibridação in situ fluorescente com sondas produzidas a partir do cromossomo sexual W e dos cromossomos B). Todas as espécies apresentaram número diplóide de 2n=50 cromossomos, com predominância dos cromossomos dos tipos meta e submetacêntricos, além da ocorrência de cromossomos supranumerários em C. pterostictum, C. oiticicai, C. cf. gomesi e Characidium sp3. Foi observada também a ocorrência de um sistema ZZ-ZW de cromossomos sexuais representado pelo par heteromórfico número 2 em todas as espécies, com exceção apenas de Characidium cf. zebra, que não apresentou cromossomos sexuais diferenciados. O DNAr 5S foi localizado em diferentes cromossomos entre estas espécies, mas sempre em posição intersticial dos cromossomos, reforçando a idéia de que esta localização cromossômica poderia representar alguma vantagem relacionada à organização destes genes no genoma. As RONs, identificadas pela prata, pela CMA3 e pela sonda de DNAr 18S, foram sempre localizadas em compartimentos cromossômicos distintos do DNAr 5S e estão diretamente relacionadas ao processo de diferenciação dos cromossomos Z e W,... / Eleven species of fish of the genus Characidium comprised by Characidium cf. zebra, Characidium cf. gomesi, Characidium lauroi, Characidium oiticicai, Characidium lanei, Characidium pterostictum, Characidium schubarti, Characidium alipioi, Characidium sp1, Characidium sp2, and Characidium sp3 from different Brazilian hydrographic basins were analyzed using basic cytogenetic (coloration with Giemsa, localization of NORs for silver nitrate marking and C-banding) and molecular techniques (for base-specific fluorochrome markings, fluorescent in situ hybridization with 18S and 5S rDNA probes, telomere probes (TTAGGG)n, and H1 histone, as well as microdissection, amplification and in situ fluorescent hybridization using probes prepared from both sex W and B chromosome). All the species presented a diploid number of 2n=50 chromosomes, with a predominance of the meta- and submetacentric types, besides the occurrence of supranumerary chromosomes in C. pterostictum, C. oiticicai, C. cf. gomesi, and Characidium sp3. The occurrence of a ZZ-ZW sex chromosome system represented by the heteromorphic pair number 2 in all species was observed, with the exception of Characidium cf. zebra, which did not presented differentiated sex chromosomes. The 5S rDNA marks were observed in different chromosomes among these species, but always located in an interstitial position, strengthening the idea that this chromosome location might represent some advantage related to the organization of these genes in the genome. NORs identified using Silver and CMA3, staining and 18S rDNA probe have always been located in distinct chromosome compartments when compared to 5S rDNA, showed to be directly related to the Z and W chromosome differentiation process, and is considered to play an important role in their evolution, considering that they could... (Complete abstract click electronic access below)