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Caracterização dos sistemas de criacão de bovinos com atividade reprodutiva e estimativa de prevalência da brucelose bovina na Região Centro-Sul do Brasil / Characterization of cattle herds with reproductive activity and estimation of the prevalence of bovine brucellosis in Central-Southern region of Brazil

Braga, Guilherme Basseto 05 July 2010 (has links)
A pecuária é um setor do agronegócio que vêm se destacando na economia nacional. Com a intenção de amparar esta importante cadeia produtiva, a atuação dos serviços de fomento e defesa sanitária animal tornam-se cada vez mais necessárias. A compreensão integral do espaço sobre o qual estes serviços exercem sua influência, tornaria mais efetiva as estratégias de atuação frente aos problemas enfrentados. Em 2001, o Ministério da Agricultura Pecuária e Abastecimento realizou um estudo soroepidemiológico visando conhecer a situação epidemiológica da brucelose bovina em 14 Unidades Federativas. O trabalho incluiu um questionário epidemiológico aplicado na intenção de avaliar os possíveis fatores de risco para a doença nos rebanhos. O mesmo possibilitou a realização de uma análise descritiva da pecuária em diversas regiões. Os resultados demonstraram que a cadeia produtiva no país é altamente heterogênea, revelando diferenças significativas mesmo dentro dos Estados. De maneira geral, as frequências encontradas a respeito de investimento em tecnologia, intensificação dos manejos, utilização da inseminação artificial, utilização de raças especializadas, e participação de assistência veterinária, demonstrou-se crescente à medida que se avança em direção às Unidades Federativas da região Sul. A comercialização de reprodutores demonstrou-se intensa e realizada diretamente entre as propriedades. O comércio informal do leite e da carne bovina ainda corresponde por uma parcela significativa do mercado. Tendo em vista a escassez de projetos com este foco, reflete-se a respeito da necessidade de outros projetos deste tipo, considerando que os cenários em que as criações estão inseridas, deveriam ser tomados como ponto de partida na elaboração de estratégias de atuação frente aos problemas encontrados no setor. / Livestock is an agribusiness sector highlighted in the current national economy. With the intention of supporting this important activity, the performance of animal health promotion and defense services become increasingly necessary. With a full understanding of the environment on which these services exert its influence, strategies actions to minimize the problems faced become more effective. In 2001, the Ministry of Livestock Agriculture conducted a seroepidemiological study aiming to explore the epidemiological situation of bovine brucellosis in 14 Federal Units. The study included an epidemiological questionnaire which objective was to assess the possible risk factors for disease in livestock. It also allowed the development of a descriptive analysis of livestock breeding and raising in various regions. The results showed that the productive chain in Brazil is highly heterogeneous, revealing significant differences even within the same state. In general, frequencies of investment in technology, management practices, use of artificial insemination, use of specialized breeds, and veterinary care, increases as one moves toward the Federal Units located in the South of Brazil. The sale of breeding proved to be intense and conducted directly between the properties. The informal trade of milk and beef still accounts for a significant portion of the market. Given the lack of projects with this focus, the need for other projects of this type appears to be relevant when one considers that the scenarios in which the creations are found should be the starting point to develop strategies to act face the problems found in the industry.
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Molecular genetic and genomic characterization of an emerging mycotoxigenic pathogen Fusarium proliferatum

Almiman, Bandar F. January 2018 (has links)
This aim of this research was to elucidate the genotypic diversity of the mycotoxigenic species Fusarium proliferatum associated with diverse hosts and distributed in wide geographic locations to gain new insights into the biology of this emerging pathogen. This study developed a novel molecular genetic marker FG1056. Multilocus typing of F. proliferatum isolates (52) using F. verticillioides (2) and F. oxysporum (3) as references was carried out with FG1056 and a set of known genetic markers (ITS, TEF1, CAL and FUM1). This distinguished up to 10 genetic groups, 2 clusters and 23 haplotypes among the F. proliferatum isolates. FG1056 marker showed the highest number of SNPs (169), informative sites (89) and haplotypes (23) relative to other markers used and was comparable to the multi locus typing. Varying patterns of relationships were observed between isolates represented in the genetic groups and their host and geographic origin. Considerable biological variability was recorded among the F. proliferatum isolates in morphology, growth, sporulation and most notably fumonisin production (up to 140-fold differences) with reference to variable temperature, water activity and duration. De novo genome assemblies with the size ranging from 43.96 - 50 Mb have been developed for four diverse F. proliferatum isolates. In silico analysis led to the identification of 12,980 genes common to all isolates and up to 134 genes potentially unique to an isolate. Using these resources, FUM gene cluster (~45.3 Kb) was identified for the first time in F. proliferatum. Order and orientation of the 16 FUM genes and the complete flanking genes (MSF1 and ZCB1 at 5’; ANK1 and GAT1 at 3’) have been determined. This study has provided new insights into the genetic and biological diversity of F. proliferatum and also developed new genetic and genomic resources, which will serve as a solid platform for further research particularly to understand the regulation of fumonisins production in the laboratory and in the field.
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Aspectos agronômicos e qualidade de frutos de tangerineiras e pomeleiros no agreste meridional de Pernambuco

NASCIMENTO JÚNIOR, Ivanildo Ramalho do 17 February 2012 (has links)
Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-17T12:08:29Z No. of bitstreams: 1 Ivanildo Ramalho do Nascimento Junior.pdf: 550438 bytes, checksum: 6a9cb7e8f4ae831e30a138ad05f4a0d1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-17T12:08:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ivanildo Ramalho do Nascimento Junior.pdf: 550438 bytes, checksum: 6a9cb7e8f4ae831e30a138ad05f4a0d1 (MD5) Previous issue date: 2012-02-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The study of promising genotypes of crown and rootstock in potential regions for the production of fresh citrus fruits is fundamental to the continued development of national citrus sector. The microregion of Garanhuns in Southern Agreste of Pernambuco and other potential areas of northeast of Brazil, due to favorable edafoclimatic conditions for growing citrus, can generate production that could serve both regional and international markets. Thus, the objective was to evaluate genotypes of tangerines and grapefruits at Southern Agreste of Pernambuco conditions, through evaluation of agronomic parameters and physical, chemical and physical-chemical characteristics of fruits, aiming at the diversification of fruticulture. The experiment was conducted at Experimental Station of Brejão (IPA), evaluating thirteen varieties of tangerines and hybrids and three grapefruits. The evaluation of the maturation period was identified with the accompanying from development floral branch to maturation of fruits. For the analysis of plant development, was used the randomized block design with five replications and one plant per plot, being evaluated the diameter of stem above and below of grafting point, the crown diameter, plant height and volume crown. For the analysis of the fruits was used the randomized block design with four replications and four fruits per plot, being used twelve descriptors. In relation to maturation period, the Murcott, Kinnow and Fortune Iniasel tangerines were classified as mid-season, even as the Flame, Star Ruby and Henderson grapefruits. The Nova tangerine and the Flame grapefruit presented the smallest crown volume with 9.71 and 8.70 cubic meters respectively in the last measurement, positive feature in citrus breeding programs to obtain new crown varieties. Regarding fruit, the Robinson tangerine and the Henderson grapefruit presented the highest ratio mean with 20.83 and 5.93 respectively. All tangerines showed diameter within the established by standard classification of fresh citrus fruits, however, the Mexerica, Dancy and Swatow varieties had average fruit weight less than the main commercialized tangerines, even as the three grapefruits varieties studied. / O estudo de genótipos promissores de copa e porta-enxerto em regiões potenciais para a produção de citros de mesa é fundamental para a continuidade do desenvolvimento do setor citrícola nacional. A microrregião de Garanhuns no Agreste Meridional Pernambucano e outras áreas potenciais do Nordeste brasileiro, devido às condições edafoclimáticas favoráveis ao cultivo de citros, podem gerar produção que poderá atender tanto o mercado regional quanto internacional. Assim, objetivou-se avaliar genótipos de tangerineiras e pomeleiros nas condições edafoclimáticas da região do Agreste Meridional de Pernambuco, mediante avaliação dos parâmetros agronômicos e características físicas, físico-químicas e químicas dos frutos, visando à diversificação da fruticultura. O experimento foi realizado na Estação Experimental de Brejão (IPA), onde foram avaliadas treze variedades de tangerineiras e híbridos e três pomeleiros. A avaliação do período de maturação foi identificada com acompanhamento do desenvolvimento do ramo floral até a maturação dos frutos. Para a análise do desenvolvimento das plantas utilizou-se o delineamento em blocos casualisados, com cinco repetições e uma planta por parcela, sendo avaliado o diâmetro do caule acima e abaixo do ponto de enxertia, o diâmetro de copa, altura da planta e volume de copa. Para a análise dos frutos utilizou-se o delineamento em blocos casualisados, com quatro repetições e quatro frutos por parcela, sendo utilizados doze descritores. Quanto ao período de maturação, as tangerineiras Murcott, Kinnow e Fortune Iniasel se enquadraram como de meia-estação, assim como, os pomeleiros Flame, Star Ruby e Henderson. A tangerineira Nova e o pomeleiro Flame apresentaram o menor volume de copa com 9,71 e 8,70 m³ respectivamente na última medição, característica positiva em programas de melhoramento genético de citros para obtenção de novas variedades de copa. Em relação aos frutos, a tangerina Robinson e o pomelo Henderson apresentaram as maiores médias de ratio com 20,83 e 5,93 respectivamente. Todas as tangerinas apresentaram calibre dentro do estabelecido pela Norma de Classificação dos Citros de Mesa, porém, as variedades Mexerica, Dancy e Swatow apresentaram média da massa dos frutos inferior as principais variedades de tangerinas comercializadas, assim como, as três variedades de pomeleiros estudadas.
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Comparative study of technological parameters of characterization in stones and coatings and non resined resined. / Estudo comparativo dos parÃmetros de caracterizaÃÃo tecnolÃgica em rochas ornamentais e de revestimentos resinadas e nÃo resinadas.

Fernando Antonio Castelo Branco Sales 19 December 2012 (has links)
For intermediate analysis and technological characterization tests conducted on samples of resinated and non-resinated rocks with distinct structural and geological characteristics, we sought to verify the effectiveness of the resin with respect to physical and mechanical resistance of these rocks, as well as evaluating the reduction of agents that produce the same changes and pathology. The investigation of this research has focused on three types of rocks: the first refers to a commercially called White granite Blizzard, which is an isotropic rock with some degree of fracture, equigranular texture and average grain size of the fine and the second was represented petrographically for a garnet-biotite-musvovita roughly gnaissificado, commercially known as Casa Blanca, having a coarse-grained, with lineations and foliations with a high presence of micaceous minerals, and the third is a volcanic rock, trade name Wood Stone, material considered exotic because of their textural heterogeneity, with a high degree of fissuring, having very fine grain. After the results of tests and analysis, they were correlated and evaluated the effectiveness of the resin, being featured in that it produces significant improvements in physical and mechanical resistance of these rocks, especially regarding the levels of porosity and water absorption, which are the gateway of the causative agents of change and generations of pathologies in ornamental and coating. Research has shown that materials with restricted use, or even inappropriate to certain environments, due to its physical and mechanical resistance, using the resin, the same could be used without restrictions. The importance of testing materials whose marketing is made using resin was evident due to changes often significant parameters of the results of characterization of technology, which serve as reference in the specification suitable for use as coating materials or ornamental, the construction works.The apparent porosity and water absorption were reduced by 9, 7% and 91.46% respectively after the material is resin. / Por intermÃdio de anÃlises e ensaios de caracterizaÃÃo tecnolÃgica realizados em amostras resinadas e nÃo resinadas de rochas ornamentais, com caracterÃsticas geolÃgicas e estruturais distintas, buscou-se verificar a eficÃcia da resina no tocante a resistÃncia fÃsica e mecÃnica dessas rochas, bem como avaliar a reduÃÃo dos efeitos dos agentes que produzem alteraÃÃes e patologias nas mesmas, e na exalaÃÃo do gÃs radÃnio. A investigaÃÃo desta pesquisa foi focada em trÃs tipos de rochas: a primeira representada por um granito comercialmente denominado Branco Nevasca, que constitui uma rocha isotrÃpica com pouco grau de fraturamento, textura equigranular e granulaÃÃo de mÃdia a fina; a segunda um granada-biotita-musvovita grosseiramente gnaissificado, granulaÃÃo grosseira,apresentando lineaÃÃes e foliaÃÃes com elevada presenÃa de minerais micÃceos, denominado Casa Blanca; e, a terceira uma rocha vulcÃnica, com nome comercial Wood Stone, material considerado exÃtico em funÃÃo de sua heterogeneidade textural, com alto grau de fissuramento, possuindo granulaÃÃo muito fina. ApÃs os resultados dos ensaios e anÃlise, os mesmos foram correlacionados e avaliada a eficÃcia da resina, sendo constatado que a mesma produz melhoras significativas na resistÃncia fÃsica e mecÃnica dessas rochas, especialmente no tocante aos Ãndices de porosidade e de absorÃÃo dâÃgua, que sÃo a porta de entrada dos agentes causadores de alteraÃÃes e geraÃÃes de patologias, nas rochas ornamentais e de revestimento. TambÃm demonstrou eficiÃncia na reduÃÃo da exalaÃÃo do gÃs radÃnio A pesquisa mostrou que materiais com uso restrito, ou mesmo inadequado a certos ambientes, em funÃÃo de sua resistÃncia fÃsica e mecÃnica, com o uso da resina os mesmos poderiam ser utilizados sem restriÃÃes. A importÃncia de se realizar ensaios nos materiais cuja comercializaÃÃo à feita com uso de resina, ficou evidenciada devido Ãs alteraÃÃes, muitas vezes significativas, nos parÃmetros dos resultados de caracterizaÃÃo tecnolÃgica, os quais servem de referÃncia na especificaÃÃo adequada de uso dos materiais utilizados como revestimento ou ornamental nas obras de construÃÃo civil. A porosidade aparente e a absorÃÃo dâÃgua foram reduzidas em 90,7% e 91,46%, respectivamente, apÃs os materiais serem resinados.
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Caracterização e análise de desempenho de uma rede de sensores sem fio. / Characterization and performance analisys of a wireless sensor network.

Fábio Henrique Cabrini 27 October 2006 (has links)
As redes de sensores sem fio (RSSF) ganham maior visibilidade a cada ano, e a sua utilização é cada vez mais imprescindível no sensoriamento dos mais diversos ambientes. Estas redes podem ser instaladas em praticamente todos os tipos de ambientes, graças ao seu tamanho reduzido, sua facilidade de comunicação e seu baixo custo. Esta tecnologia permite transportar os dados através de nós que utilizam algoritmos de roteamento oferecendo resistência a falhas. O conhecimento das principais arquiteturas e dos protocolos envolvidos na comunicação, bem como do comportamento destas redes em ambientes reais, é de extrema importância para a compreensão do funcionamento da rede e dos fenômenos que afetam o seu desempenho. Este trabalho apresenta a utilização de uma RSSF baseada no dispositivo Mica2dot, desenvolvido pela Universidade de Berkeley, no monitoramento de parâmetros ambientais de uma sala limpa utilizada na construção de dispositivos semicondutores. Apresentamos a caracterização dos dispositivos e do ambiente em questão; também avaliamos dois protocolos de roteamento neste ambiente e fatores que afetam o funcionamento do sistema de rádio, como a variação do RSSI (Receive Signal Strength Indicator). Os protocolos de roteamento escolhidos para esta avaliação foram o TOSB (TinyOs Beaconing), que é o protocolo padrão do sistema operacional TinyOS, e o PROC (Proactive ROuting with Coordination), que apresenta características de pró-atividade. Os protocolos foram avaliados segundo as métricas de consumo de energia e taxa média de entrega de pacotes. / Wireless sensor networks (WSNs) are growing year after year, and its use is being more and more indispensable in sensing the most varied environments. These networks can be installed in almost all kinds of environments, thanks to its reduced size, its easiness of communication and its low cost. One of the main characteristics of this technology is the capacity of transporting data through the nodes that use router algorithms, offering a good resistance to failures. The knowledge of the main architectures and of the protocols involved in communication, as well the behavior of these networks in real environments, is of extreme importance to the understanding of the working conditions of the network and of the phenomena that affect its performance. This piece of work aims to present a study related to the use of a WSN based on the Mica2dot device developed by the University of Berkeley, in the monitoring of the environmental parameters of a clean room used to the construction of semiconductor devices. This work presents the characterization of the devices and of the environment in question, as well evaluates some factors that affect the working of the radio system and evaluates two router protocols in this environment. The chosen router protocols for this evaluation were TOSB (TinyOs Beaconing) that is the standard protocol of the operational system TinyOS, and PROC (Proactive Routing with Coordination), that presents some pro-active characteristics. The protocols were evaluated according to the measurement of the energy consumption and average rate of deliver of packages.
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Purificação e caracterização de proteases do veneno da Pseudechis australis e de seus inibidores endógenos / Purification and characterization of Pseudechis australis venom proteases and endogenous inhibitors

Bruno Baessa Chagas 22 July 2015 (has links)
A Austrália é um país cuja fauna é um repositório de potenciais novos biofármacos, pois se encontram no continente os animais mais mortais do planeta, dentre eles, as serpentes. A serpente Pseudechis australis (Mulga snake) é a maior serpente venenosa da Austrália e tem ampla distribuição geográfica. Os venenos de serpentes são complexas misturas com proteínas e peptídeos que apresentam uma variedade de atividades biológicas. Devido à riqueza de seus componentes, várias moléculas encontradas no veneno vêm sendo utilizadas com fins terapêuticos, como agentes anticoagulantes ou analgésicos. Apesar dessas informações, existem poucos dados disponíveis sobre os componentes específicos deste veneno. O presente trabalho tem como objetivo isolar e caracterizar as proteases desse veneno, ainda não descritas, um primeiro passo para compreender o papel destas enzimas no processo de envenenamento, assim como seus inibidores endógenos. Estes desempenham uma função protetora da glândula de veneno, inibindo a ação das enzimas in loco, prevenindo assim a degradação do tecido glandular por estas toxinas. O interesse nestes inibidores está relacionado ao seu potencial uso na terapia de diversas doenças como distúrbios da coagulação, hipertensão e câncer. / Australia is a natural repository of some of the deadliest venomous animals on the planet and, as such, a potential source for new toxin-derived drugs. Venomous snakes are among the many potential sources of new promising compounds. Snake venoms are complex mixtures of proteins and peptides that exhibit a variety of biological activities which all are directed towards subduing the prey and/or aggressor. These toxins act disturbing homeostasis, affecting neural transmission, hemostasis, tissue integrity as well as other body functions. Such a a wide array of specific activities has turned snake toxins into successful drugs used for therapeutic purposes, as anticoagulants or analgesic agents. Unlike snake venoms from other parts of the world, there are few records on the venom composition of Australian snakes, turning these into potential sources of new bioactive molecules for drug design. This study aims to isolate and characterize the yet undescribed proteases of the venom of P. australis as well as their endogenous inhibitors, as a first step in understanding the role of these enzymes in the envenoming process.
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Caracterização da bainha fibrosa da palmeira Livistona chinensis para aplicação no design de produto

Jobim, Silvie Janis Mossate January 2018 (has links)
A palmeira Livistona chinensis, nativa do sul do Japão, é muito utilizada como planta ornamental em paisagismos em todo o território brasileiro, e além de adaptar-se bem a vários tipos de solos é de fácil reprodução. Essa palmeira produz uma bainha fibrosa na base de seu pecíolo, que é de fácil extração, plana, flexível e porosa, com características ainda pouco conhecidas e exploradas, é um material de fonte renovável que instiga a criatividade para seu uso tanto de forma artesanal quanto industrial. Neste contexto a caracterização da bainha fibrosa da palmeira Livistona chinensis se torna relevante, pois pode representar um leque de oportunidades para o desenvolvimento de novos produtos para o mercado. A caracterização da bainha fibrosa foi realizada com auxílio de microscópio eletrônico de varredura, espectrometria de energia dispersiva de raios-X, microtomografia, análise termogravimétrica, difração de raios-X, composição química e umidade, espectroscopia no infravermelho por transformada de Fourier Também foram obtidos valores para densidade, gramatura e resistência à tração, incluindo índice de absorção acústica, condutividade térmica e Termografia infravermelha. Os ensaios e análises realizados indicaram que a fibra possui propriedades e características que são comparáveis a outras fibras lignocelulósicas e os resultados estão bem próximas aos encontrados para as fibras de coco, como a composição química, densidade e índice de cristalinidade. Um dos fatores relevantes é o índice de condutividade térmica da bainha fibrosa que se manteve próximo aos valores de materiais isolantes utilizados industrialmente como a lã de rocha e lã de vidro. Quanto aos ensaios de termografia de infravermelho, que apontam seu potencial para ser usado como isolante térmico. / The Livistona chinensis palm, native to southern Japan, is widely used as an ornamental plant in landscaping throughout the Brazilian territory, and besides adapting well to various types of soils, it is easy to reproduce. It produces a fibrous sheath at the base of its petiole, which is easy to extract, flat, flexible and porous, with characteristics still little known and exploited, is a renewable source material, and which instigates creativity for its use both artisanly and industrial. In this context the characterization of the fibrous sheath of palmeira Livistona chinensis becomes relevant, since it can represent a range of opportunities for the development of new products for the market. The characterization of the fibrous sheath was performed with scanning electron microscope, X-ray dispersive energy spectrometry, microtomography, thermogravimetric analysis, X-ray diffraction, chemical composition and humidity, Fourier transform infrared spectroscopy We also obtained values for density, weight and tensile strength, including acoustic absorption index, thermal conductivity and infrared thermography. The tests and analyzes indicated that the fiber has properties and characteristics that are comparable to other lignocellulosic fibers and the results are very close to those found for coconut fibers, such as chemical composition, density and crystallinity index. One of the relevant factors is the thermal conductivity index of the fibrous sheath that remained close to the values of insulating materials used industrially as rock wool and glass wool. Regarding the infrared thermography tests, which point out its potential to be used as thermal insulation.
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Characterization of Electrically Active Defects at Nb/Si Interface Using Current Transport and Transient Capacitance Measurements

January 2018 (has links)
abstract: In this project, current-voltage (I-V) and Deep Level Transient Spectroscopy (DLTS) measurements are used to (a) characterize the electrical properties of Nb/p-type Si Schottky barriers, (b) identify the concentration and physical character of the electrically active defects present in the depletion region, and (c) use thermal processing to reduce the concentration or eliminate the defects. Barrier height determinations using temperature-dependent I-V measurements indicate that the barrier height decreases from 0.50 eV to 0.48 eV for anneals above 200 C. The electrically-active defect concentration measured using DLTS (deep level transient spectroscopy) drops markedly after anneals at 250 C. A significant increase in leakage currents is almost always observed in near-ideal devices upon annealing. In contrast, non-ideal devices dominated by leakage currents annealed at 150 C to 250 C exhibit a significant decrease in such currents. / Dissertation/Thesis / Masters Thesis Materials Science and Engineering 2018
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Representação e quantificação de redes vasculares a partir de imagens de angiografia tridimensional / Representation and quantification of blood vessels from three-dimensional angiographic images

Valverde, Miguel Angel Galarreta 12 December 2017 (has links)
As imagens de Angiografia por Ressonância Magnética (angio-RM) e Tomografia Computadorizada (angio-TC) são ferramentas amplamente usadas em processos de quantificação vascular e no diagnóstico de doenças cardiovasculares, as quais são consideradas entre as principais causas de morte. Contudo, a análise dos vasos em larga escala a partir das imagens é dificultada, tanto pela variabilidade natural dos vasos no corpo humano, quanto pela grande quantidade de dados disponíveis. Além disso, os métodos de quantificação existentes, usualmente extraem as características a partir dos esqueletos, ou até mesmo das próprias imagens de angiografia, razão pela qual tais métodos podem fazer necessária a reanálise das imagens repetidas vezes. Com o intuito de facilitar a análise e de fornecer uma ferramenta de apoio ao diagnóstico, neste trabalho são apresentados um modelo de representação textual de redes vasculares e uma metodologia de quantificação vascular automática, que é feita a partir dessa representação. A representação é obtida a partir da segmentação de imagens volumétricas de angio-RM e angio-TC, seguida da extração de trajetórias e diâmetros de redes vasculares. Tal representação é híbrida, combinando grafos e uma sequência textual de instruções, e permite não apenas a extração de caraterísticas morfológicas da rede vascular, como também a compressão das imagens e, ainda, a reconstrução de imagens similares às imagens originais. A partir das características extraídas, foram realizados estudos comparativos entre arquiteturas vasculares, o que é feito tanto por meio do uso de imagens sintéticas, como por meio de imagens reais, imagens nas quais foi possível encontrar diferenças entre arquiteturas, além de viabilizar a caracterização de aneurismas em um indivíduo. Paralelamente, desenvolvemos um método que permite identificar similaridade entre segmentos vasculares, o que por sua vez possibilita o reconhecimento e rotulação de segmentos em um conjunto de redes vasculares. A metodologia por nós desenvolvida deve também auxiliar no desenvolvimento de processos de classificação de vasos sanguíneos, de ferramentas para o diagnóstico automático de doenças vasculares, e para a melhora de técnicas utilizadas na prática clínica. / Magnetic Resonance Angiography (angio-MR) and Computed Tomography Angiography (angio-TC) are widely used imaging techniques used for vascular quantification and the diagnosis of cardiovascular diseases, considered one of the main causes of death. Blood vessel analysis using angiographic images is intrisically difficult because of the natural human vessel variability and the large amount of information. Additionally, most quantification methods perform the analysis of entire datasets, which can be very time consuming when they need to be reanalyzed. With the aim of reducing these problems and to provide a tool to aid diagnosis, we propose a textual representation model for vascular networks and an automatic vascular quantification methodology. The representation is obtained from volumetric image segmentation of angio-MR and angio-TC, followed by the extraction of the trajectory and the blood vessel diameters. This representation is hybrid in nature, combining graphs and a sequence of textual instructions, allowing for the extraction of morphological features, image compression, and the synthesis of angiographic images. Using extracted features derived from the model, comparative studies of vascular architecture can be performed. Experiments were made using synthetic and real images, in which was possible to find structural differences that make feasible to characterize abnormalities such as aneurysms. Also, a vessel similarity identification method was developed, which makes it possible to recognize vessel segments and label them in a set of vessel networks. The proposed methodology should aid in blood vessel classification processes, automatic diagnosis of cardiovascular diseases, and allow development of methods and applications that could be used in the clinical practice.
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Caracterização de estado sólido e análise computacional de uma nova forma cristalina do fármaco antifilariose dietilcarbamazina: um sal de ácido maleico / Characterization of solid state and computational analysis of a new crystalline form of the antifilarial drug diethylcarbamazine: a maleic acid salt

Ribeiro, Leandro 12 August 2011 (has links)
A caracterização no estado sólido de insumos farmacêuticos constitui uma parte muito importante no entendimento de suas propriedades físicas, químicas e farmacológicas. A partir da análise estrutural por difração de raios X em monocristal, pode-se identificar a conformação no estado sólido do fármaco, assim como sua densidade eletrônica. Estes estudos podem ser complementados com dados provenientes da Modelagem Molecular, que compreende um número de ferramentas e métodos computacionais e teóricos que têm como objetivos compreender e prever o comportamento de sistemas reais. Nesse contexto, visando compreender melhor as propriedades de estado sólido apresentadas pelo fármaco anti-filariose dietilcarbamazina (DEC), foi obtido um novo sal, o maleato de dietilcarbamazina (DEC maleato), cujas propriedades foram comparadas com as das estruturas já reportadas, DEC citrato e DEC pura. A DEC maleato foi caracterizada por difração de raios X em monocristal, espectroscopias Raman e Infravermelho e análise térmica. A DEC maleato cristaliza no grupo espacial triclínico PI com dois confôrmeros da molécula de DEC na unidade assimétrica, ambos exibindo caudas etílicas na conformação syn em relação ao anel piperazina, diferentemente do que ocorre na DEC citrato e na DEC pura, nas quais esses fragmentos moleculares apresentam uma conformação anti. A principal interação intermolecular entre o fármaco e o ácido maleico é do tipo N-H•••O, que caracteriza a formação do sal e, consequentemente, do par iônico (DEC)+(maleato)-. Além disso, uma rede complexa de interações intermoleculares não-clássicas do tipo C-H•••O estão presentes entre as moléculas de DEC, DEC-maleato e maleato-maleato, levando a um empacotamento cristalino na forma de um sanduíche, onde os confôrmeros da DEC acomodam-se em colunas intercaladas por bicamadas de íons maleato. Não foram observadas transições de fase estruturais em função da temperatura entre 100 K e temperatura ambiente. No entanto, devido à variação conformacional observada entre as moléculas de DEC, cálculos quânticos foram realizados na fase gasosa, otimizando as conformações moleculares tanto da molécula de DEC neutra quanto da carregada a fim de determinar as características de sua estrutura eletrônica utilizando o método da Teoria do Funcional de Densidade, com o funcional híbrido B3LYP e o conjunto de função de base 6-31++G. Através dos cálculos teóricos foram obtidas quatro novas conformações, uma para DEC neutra e três da carregada, para as quais analisou-se as energias de conformação, os espectros vibracionais simulados e por fim os mapas de potencial eletrostático e os orbitais de fronteira. / The solid state characterization of active pharmaceutical ingredients (API) constitutes an important part in understanding their physical, chemical and pharmacological properties. From the structural analysis by single crystal X-ray diffraction, the API conformation in the solid form, as well as its electronic density, can be identified. These studies can be supplemented with data from the Molecular Modeling, which includes a number of theoretical and computational tools used to understand and to predict the behavior in real systems. In this context, aiming to better comprehend the solid state properties exhibited by the anti-filarial drug diethylcarbamazine (DEC), a new salt was obtained, the diethylcarbamazine maleate (DEC maleate), and its properties were compared with the ones of the reported structures, DEC citrate and pure DEC. The DEC maleate was characterized by single crystal X-ray diffraction, infrared and Raman spectroscopy and thermal analysis. DEC maleate was found to crystallize in the triclinic space group PI with two very similar conformers of the DEC molecule in the asymmetric unit, both exhibiting the ethylic chains in conformation syn in relation to the piperazine ring, unlike what happens to DEC citrate and pure DEC, where these chains are anti related. The main intermolecular interaction between the API and the maleic acid is of the type NH•••O, characterizing the salt formation, and thus, the ionic pair (DEC)+(maleate)-. Moreover, a complex network of no-classical intermolecular interactions of the type CH•••O occur between DEC-DEC, DEC-maleate, and maleate-maleate molecules, leading to a sandwich like crystal packing, where DEC conformers are accommodated in columns intercalated by maleates bilayers. No phase transitions were observed for the molecule structure in function of temperature between 100 K and room temperature. However, due conformational variations observed among DEC molecules of the three structures, quantum calculations were performed in the gas phase, optimizing the molecular conformations of both, the neutral and the charged DEC molecules to determine the characteristics of the electronic structure using the method of Density Functional Theory with the B3LYP hybrid functional and basis set 6-31++G. new conformations it were found, for which geometrical characteristics, conformation energies, vibrational spectra simulation and finally the electrostatic potential maps and the frontier orbitals, were analyzed.

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