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CARACTERIZAÇÃO PARASITOLÓGICA DE CRIANÇAS E DA QUALIDADE DA ÁGUA CONSUMIDA NO BAIRRO CALADÃO EM CORONEL FABRICIANO-MGVirgínia Maria da Silva Gonçalves 27 July 2008 (has links)
Tendo em vista que a água é um recurso natural essencial à vida e ao desenvolvimento das comunidades humanas, a preocupação com a sua qualidade assume importância na medida em que a mesma é destinada como dessedentação podendo tornar-se um meio importante de transmissão de doenças. A presente pesquisa analisou a qualidade da água utilizada no bairro Caladão em Coronel Fabriciano-MG. Trata-se de um estudo descritivo com abordagem quali-quantitativa. A amostra constituiu-se de 140 crianças, moradoras do bairro em estudo, cujos domicílios são abastecidos por água de nascente sem tratamento prévio. A coleta de dados foi realizada através da aplicação de entrevista semi-estruturada aos pais ou responsáveis pelas crianças buscando informações sobre as fontes de abastecimento de água, armazenamento e usos, caracterização dos locais de deposição de resíduos, busca de indicadores de saúde de doenças relacionadas à água, bem como a percepção higiênico-sanitária dos entrevistados sobre a relação água e saúde. As falas dos entrevistados foram ordenadas utilizando-se o Discurso do Sujeito Coletivo. Foram realizadas entrevistas semi-estruturadas com 58 responsáveis pelas crianças, representando 41,42% do total das crianças entre 6 meses e 5 anos de idade cadastradas no Programa Saúde da Família (PSF) Caladão. Simultaneamente foi realizada análise microbiológica de amostras de água utilizadas nos domicílios e água das duas nascentes onde é efetuada a captação pela Prefeitura de Coronel Fabriciano para abastecimento da população como também levantamento parasitológico de fezes destas crianças. Os resultados revelaram que a água utilizada pelos moradores encontra-se fora do padrão de potabilidade determinado pela Portaria do Ministério da Saúde (MS) n. 518/2004, uma vez que apresentou coliformes totais e Escherichia coli em 100% das amostras. O levantamento parasitológico das 140 crianças que fizeram parte da amostra apresentou índice de infecção em 62,85% das crianças parasitadas, destacando-se entre os parasitas mais encontrados o Ascaris lumbricoides, a Giardia lamblia e a Entamoeba histolytica. As entrevistas mostraram que todos os entrevistados utilizam água de nascente, não realizam nenhum tratamento prévio desta água e em alguns casos nem mesmo a filtragem é realizada. O destino do esgoto e lixo é de responsabilidade dos órgãos públicos, mas existe drenagem a céu aberto de dejetos líquidos e descarte inadequado do resíduo sólido. Os discursos montados a partir das falas dos entrevistados revelaram que, apesar dos moradores terem consciência sobre a importância da qualidade da água para a saúde, ainda utilizam a água da nascente sem nenhum tipo de tratamento. Percebe-se a importância do planejamento de ações, em conjunto com os profissionais de saúde, os órgãos públicos e a população, que favoreçam a melhoria das condições de saúde, visando abastecimento de água adequado não só para prevenção de doenças infecto-parasitárias, mas também melhores condições de higiene e bem estar.
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SUSTENTABILIDADE ECONÔMICA DOS SISTEMAS AGROFLORESTAIS NA AGRICULTURA FAMILIAR NO CÓRREGO DOS ELIOTAS, SIMONÉSIA-MG. / Sustentability of the Agroflorestal Systems in Familiar AgricultureMaria Aparecida Salles Franco 31 May 2007 (has links)
lt;p align="justify"gt; Esta pesquisa analisou a sustentabilidade econômica de um grupo de agricultores familiares produzindo em sistemas agroflorestais, no Córrego do Eliotas, localizado no município de Simonésia-MG. O grupo pesquisado é formado por cinco famílias que desenvolvem há cinco anos, uma experiência de introdução de espécies da flora nativa, cana e frutas nas entrelinhas de cafezais já estabelecidos, convertendo-o em um sistema agroflorestal, incentivados pela igreja católica e pela Fundação Biodiversitas. O trabalho investigou as características socioeconômicas e culturais dos agricultores, as características das propriedades, a renda bruta da produção, os custos de produção e a renda líquida de cada agrofloresta, analisando o grau de sustentabilidade do núcleo familiar neste espaço de produção. Estes dados foram comparados com quatro outras famílias de agricultores familiares de mesmo porte de área de produção que, porém, trabalham com agricultura convencional. Os resultados mostram que os sistemas agroflorestais estudados, apresentam renda bruta e renda líquida inferior ao do sistema convencional, porém, possuem mais sustentabilidade no que diz respeito às suas necessidades básicas. São auto-sustentáveis em boa parte dos ítens da alimentação, produzem parte de suas necessidades energéticas. Conclui-se que o Sistema Agroflorestal contribui com a conservação ambiental e os agrofloresteiros possuem grande sustentabilidade no que diz respeito ao atendimento de sua necessidade básica.lt;/pgt; / lt;p align="justify"gt; The present research analyzed the sustentability of the agroflorestal systems in the familiar agriculture of the Córrego dos Eliotas, located in the city of Simonésia-MG. The group of five analyzed families of familiar agriculturists develops since five years ago an experience of introduction of species of the native flora, sugar cane and fruits in the space between lineses of already established coffee plantations, converting it into a agroflorestal system, after incentive of the Biodiversitas Foundation. The work investigated the social econonomic and cultural characteristics of the agriculturists, the caracteristics of the properties, the gross income of the production, the costs of production and the net income of each agroflorestal system, analyzing the degree of sustentability of the familiar nucleus in its space of production. These data had been compared with four families of familiar agriculturists of same size of production area who, however, work with conventional agriculture. The results show that the studied agroflorestal systems, present gross income and net income inferior to the one of the conventional system
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ANÁLISE ERGONÔMICA DA ATIVIDADE DO PROFISSIONAL DE ENFERMAGEM NO MUNICÍPIO DE CARATINGA-MGSylvio da Silva Araújo Júnior 17 July 2008 (has links)
O presente estudo foi realizado em unidades de saúde, localizadas no município de Caratinga, estado de Minas Gerais. Os objetivos específicos foram caracterizar o perfil dos trabalhadores, mensurar a carga de trabalho físico em toda jornada de trabalho e avaliar a biomecânica das atividades de remoção e transporte de pacientes. Os dados foram coletados por meio de entrevistas individuais e de medições e avaliação das atividades desenvolvidas. Os resultados indicaram que os trabalhadores de enfermagem possuíam idade média de 35 anos e 80,5% são do gênero feminino. O sistema de trabalho adotado é de 12h de trabalho por 36h de descanso em 90% dos casos, 84% dos trabalhadores consideraram realizar esforço excessivo para realização de suas tarefas. Apesar de 62% dos trabalhadores terem afirmado se sentirem cansados para o trabalho, 64% se dizem satisfeitos com o mesmo. A carga cardiovascular nas atividades gerais como aferição de sinais vitais, preparação de medicamentos, requisição de medicamentos e higiene dos pacientes foi igual a 17,2%. A freqüência cardíaca média era de 94 bpm e estava abaixo da freqüência limite do trabalhador de 118 bpm. Estas atividades foram classificadas como leves. A atividade de remoção e transporte de pacientes apresentou carga cardiovascular acima do valor recomendado e os trabalhadores exerceram esta atividade acima do valor da freqüência cardíaca limite de uma jornada de trabalho, visto que a carga foi de 53%. A freqüência cardíaca média foi de 133 bpm e estava acima da freqüência limite do trabalhador de 118. Esta atividade foi classificada como pesada. Através da análise estatística conclui-se que não há dependência entre as variáveis estudadas. Na avaliação biomecânica verificou-se que todas as articulações dos profissionais de enfermagem de Caratinga que participaram do grupo de estudo, apresentaram a carga limite ultrapassada, para suportar peso. A atividade empurrar a maca oferece risco de compressão do disco L5 S1 da coluna vertebral, com força de compressão igual a 5861,0N.
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PERCEPÇÕES SOBRE TRANSTORNOS MENTAIS EM USUÁRIOS EM REGIME INTENSIVO NO CAPS II DE MURIAÉ/MGAna Maria Luciano Ligeiro da Mata 22 August 2008 (has links)
Objetivou-se nesse estudo, compreender a percepção atribuída ao modelo de assistência a portadores de transtorno mental do Centro de Atenção Psicossocial (CAPS) Adélia Bizzo Xaia em Muriaé-MG, pelos profissionais dessa instituição e pelos usuários, buscando-se a inclusão e aceitação desses no convívio familiar e comunidade local e identificar como o meio ambiente influencia na saúde mental, além de caracterizar o perfil e patologias mais incidentes. A problematização refere-se à necessidade de compreender o modelo de atendimento e manutenção dos indivíduos com transtornos mentais atendidos e assistidos, uma vez que estes, não conseguem se (re)inserir no convívio com a família e a sociedade como um todo, considerando-se suas limitações na convivência. Este estudo tem caráter descritivo, qualitativo e busca-se um entendimento sobre os procedimentos de atendimento aos usuários. Utilizou-se como instrumento de coleta de dados questionário e entrevista semi-estruturada, além da observação participante com alguns usuários no período de janeiro de 2007 a junho de 2008. Dos 45 usuários em regime intensivo, foram inquiridos 20 (44%) por meio de sorteio e 6 profissionais que trabalham nessa unidade, sendo um médico-psiquiatra, uma psicóloga, uma enfermeira, um técnico em enfermagem, um monitor de oficina e um auxiliar de serviços gerais. Concluiu-se que a percepção dos usuários foi positiva em relação ao trabalho desenvolvido no CAPS; chegando a referirem-se como sua segunda casa e às vezes como sua primeira; a loucura continua ainda hoje como um enigma que desperta uma variedade de sentimentos, concepções e buscas, onde o homem se limita apenas a buscar uma compreensão ainda difícil de alcançar; existe um distanciamento entre o discurso e a prática, indicando diferentes modos de lidar com a loucura por parte dos profissionais, gestores, instituições (CAPS) e famílias; os usuários não estão inseridos na dinâmica da comunidade, família, associações de qualquer classe e até do próprio CAPS.
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Análise empírica da utilização de técnicas de aprendizagem de máquina para classificação de sequências de proteínas de Metarhizium anisopliae / Empirical analysis of machine learning techniques for classification of protein sequences of Metarhizium AnisopliaeDias, Maria Fernanda Ribeiro 23 February 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-02-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes) / Metarhizium anisopliae} is an entomopathogenic fungus used as biological insecticide possessing proteins linked to infection processes and unknown control mechanisms, many of which may be controlled by the ubiquitination system. In this work we used machine-learning techniques to predict {\it M. anisopliae~ isolate E6} ubiquitination-prone proteins.
One hundred fifty-one ubiquitinable peptides and one hundred fifty-one non-ubiquitinable peptides from {\it S. cereviseae} and {\it H. sapiens} were used as the training set.\!\footnote{(http://iclab.life.nctu.edu.tw/ubipred/)} These peptides were composed by 21 amino acids flanking a central lysine residue. Each of these peptides was represented as a numerical vector corresponding to the average value for their constituent amino-acids of each of the 31 physicochemical properties previously used in Ubipred. Hierarchical clustering of ubiquitinable proteins from this dataset showed evidence of correlation between several physicochemical properties, indicating redundancy in these features. Redundant features may cause model overfitting and increase computational cost. We used the classification algorithm Weighted-Voting (W-V), with cross validation, to disclose the minimal set of features best correlated with the probability of a given peptide being ubiquitinable.
WeightedVotingXvalidation performed similarly for vectors of 10 and 31 dimensions. Indeed, each of the 10 features in the minimal set correlates with most of the remaining 21 features, as confirmed by pairwise Pearson correlation test (coefficients ranging from -0.95 to -0.40 and 0.40 to 0.98). We then compared the performance of the algorithms W-V and Support Vector Machine (SVM) with radial kernel for vectors with 10 or 31 dimensions. In both cases, SVM outperformed W-V. The resulting of recall, precision and accuracy with 10 features were respectively, 67\%, 65\% and 66\% for SVM against 65\%, 55\% and 47\% for W-V and with 31 features were 71\%, 71\% and 71\% for SVM against 60\%, 55\% and 52\% for W-V.
Processing time in ASUS K43U, Process with AMD Dual Core C60 1.0 GHz, 2 x 512 KB of cache memory, 4 GB of RAM. Processing time was 8h and 22h, for SVM with 10 or 31 physicochemical features, respectively.
Considering the risk of overfitting the model due to features redundancy, we applied the SVM trained with 10 features to search for ubiquitination-prone proteins in the predicted proteome of {\it M. anisopliae~ isolate E6} (10,775 proteins). The 160,694, 21-amino acids long peptides flanking a central lysine residue extracted from these proteins were represented as a 10 dimensional vector for the training dataset. Forty-four of these proteins with no lysine were automatically excluded from this analysis. The classifier predicted 9,314 proteins as being ubiquitination-prone.
The small loss of performance of the SVM after dimensionality reduction is compensated by the significant reduction in processing time. The feature correlations suggest a lower risk of overfitting for the 10-dimensions model. / Metarhizium anisopliae é um fungo entomopatogênico utilizado como inseticida biológico. Este organismo possui proteínas ligadas ao processo de infecção cujos mecanismos de controle ainda são desconhecidos. Muitos destes mecanismos podem ser controlados pelo sistema de ubiquitinação. Neste trabalho, foram utilizados métodos de aprendizado de máquina para classificar sítios de ubiquitinação em proteínas preditas, a partir do genoma do fungo {\it \Manisopliae~} isolado E6.
Cento e cinquenta e um (151) peptídeos ubiquitinados e cento e cinquenta e um (151) peptídeos não-ubiquitinados de {\it S.cereviseae} e {\it H.sapiens} foram utilizados como conjunto de treinamento.\!\footnote{(http://iclab.life.nctu.edu.tw/ubipred/)} Cada um destes peptídeos foi composto por 21 aminoácidos com um resíduo de lisina central. Os peptídeos foram representados como vetores numéricos que correspondem ao valor médio das propriedades físico-químicas dos aminoácidos. O agrupamento hierárquico feito com os peptídeos (dados de treinamento), mostrou evidências de correlação entre várias propriedades físico-químicas, indicando alguma redundância nos atributos. Atributos redundantes podem causar {\it overfitting} do modelo e aumentar o custo computacional. Nós utilizamos o algoritmo {\it WeightedVotingXValidation} para descobrir o conjunto mínimo de atributos que me\-lhor re\-pre\-sen\-tam os peptídeos a serem classificados como ubiquitináveis ou
não.
O algoritmo {\it WeightedVotingXValidation} apresentou um comportamento semelhante para vetores de 10 e 31 dimensões. A correlação entre os atributos foi confirmada pelo teste de correlação de Pearson (coeficientes que variam de -0,95 a -0,40 e 0,40 a 0,98). Em seguida, comparamos o desempenho dos classificadores W-V e {\it Support Vector Machine} (SVM) com a função {\it kernel} radial para vetores com 10 ou 31 dimensões. Em ambos os casos, os resultados do SVM superou W-V. O resultado de {\it recall}, precisão e acurácia quando utilizamos 10 atributos foram, respectivamente, 67 \%, 65\% e 66\% para SVM, contra 65\%, 55\% e 47\% para W-V. Com o uso de 31 atributos, o resultado para os indicadores de desempenho foi de 71\%, 71\% e 71\% para SVM contra 60\%, 55\%, 52\% para W-V.
Os dados foram processados em um {\it notebook} ASUS K43U com AMD Dual Core C60 1.0GHz , 2 x 512 KB de memória cache, 4 GB de RAM. O tempo de processamento foi de 8h e 22h, para SVM com 10 e 31 atributos físico-químicos, respectivamente.
Considerando-se o risco de {\it overfitting} do modelo e a redundância dos atributos, nós aplicamos o algoritmo SVM treinado com 10 atributos físico-químicos para classificar possíveis proteínas propensas a ubiquitinação no proteoma de {\it \Manisopliae~} isolado E6 (10.775 proteínas). Os 160.694 peptídeos particionados em 21 aminoácidos contendo um resíduo de lisina na posição central, extraídos a partir de proteínas, foram representados por vetores de 10 dimensões e utilizados como conjunto independente. Das \seqliprot, 9.314 foram classificadas como sendo propensas a ubiquitinação e 1.417 como não-ubiquitináveis. Quarenta e quatro destas proteínas não foram analisadas por não possuírem o aminoácido lisina.
A pequena perda de desempenho com a redução de dimensão do espaço de dados é compensada pela redução significativa no tempo de processamento e pelo menor risco de {\it overfitting} utilizando vetores de 10 dimensões.
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Inventário, biodiversidade e conservação de áreas úmidas do município de São LeopoldoBertoluci, Vilma Daniela Mânica 27 April 2003 (has links)
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Previous issue date: 27 / Universidade do Vale do Rio dos Sinos / As áreas úmidas estão entre os ecossistemas mais produtivos de nosso planeta com enorme importância ecológica, econômica e cultural para a humanidade. As áreas úmidas
variam em tamanho, desde muito pequenas, a vastas áreas, entretanto todas são importantes para o estabelecimento de plantas raras ou endêmicas. A relação entre área e
diversidade de espécies tem sido investigada por vários pesquisadores e numerosos estudos e experimentos têm desenvolvido teorias relacionando estes atributos. Entretanto a informação sobre a relação entre área e diversidade de espécies em áreas úmidas ainda é escassa. Os inventários de áreas úmidas são usados como primeiro estágio para programas de conservação, determinando os valores econômicos das áreas úmidas e originando critérios para o uso desses recursos. O objetivo deste trabalho foi inventariar as áreas úmidas do município de São Leopoldo, analisar a diversidade de macrófitas e macroinvertebrados e elaborar critérios para a conservação desses sistemas. O inventário de á / Wetlands are the most productive ecosystems around the world, with enormous ecological, economic and cultural importance for humanity. The wetlands vary in size, from
small to vast areas, however, they are all important to the establishment of rare or endemic plants. The relationship between area and diversity of species has been investigated by biologists, and numerous studies and experiments have developed general theories about this relationship. However, the information about the relationship between species diversity and area in wetlands is still scarce. The inventories of wetland are used in the first stage of the conservation programs, determining the economic value of the wetlands and creating criteria for the use of these resources. The main goals of this study were to inventory the wetlands of the São Leopoldo region, to analyze the diversity of macrophytes and
macroinvertebrates in wetland of the São Leopoldo and to establish criteria for the conservation programs in wetlands. The inventory of we
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Pesquisas acadêmicas no Ensino Básico: contribuições para as práticas dos professores de Ciências e BiologiaLUCAS, L. F. 21 February 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-02-21 / A primeira etapa deste estudo teve como objetivo verificar o que vem sendo produzido sobre o ensino de Ciências e Biologia no ensino básico no município de São Mateus, Norte do Espírito Santo. Um levantamento das pesquisas acadêmicas no período de janeiro/2010 a julho/2016 indicou que o curso de Licenciatura em Ciências Biológicas e o Programa de Pós-graduação em Ensino na Educação Básica da Universidade Federal do Espírito Santo (UFES), Campus São Mateus, realizou um total de 102 pesquisas acadêmicas, com significativa contribuição de atividades realizadas pela equipe de bolsistas do Programa Institucional de Bolsas de Iniciação à Docência (PIBID) do Curso de Ciências Biológicas. Na análise do descritor Áreas previlegiadas foi possível verificar que a maior parte das pesquisas abordou Temas transversais e Ciência/Tecnologia/Sociedade/Ambiente. Considerando os trabalhos em áreas específicas, Botânica foram os mais desenvolvidos. Na análise dos focos temáticos, os dois focos com maior destaque foram Conteúdo-Método e Recursos Didáticos. A segunda etapa do estudo teve como objetivo analisar as contribuições das pesquisas acadêmicas realizadas no ensino básico para as práticas dos professores de Ciências e Biologia. Foram feitas entrevistas não estruturadas com dez professores das redes pública e particular de ensino do município. De modo geral, os professores buscam e aproveitam os conhecimentos adquiridos através das pesquisas acadêmicas, seja para aquisição de conhecimento, como suporte em sala de aula ou pela necessidade constante de atualização, ficando evidente sua contribuição para a sua formação continuada, além de auxiliar no enriquecimento de suas aulas. A maioria dos entrevistados declarou fazer pesquisa, e alguns professores possuem resultados apresentados em encontros científicos e publicados em revistas científicas. Porém, o trabalho revelou que existe uma necessidade de maior preparação do futuro professor para a prática de pesquisa nos cursos de graduação. Foi possível verificar uma crescente cooperação entre as escolas do município e a UFES, principalmente através do PIBID. Entretanto, apesar de ainda existir um distanciamento entre essas duas instituições de ensino, tem-se notado uma maior aproximação nos últimos anos, no qual os programas de pós-graduação foram citados como fator importante para essa aproximação. Em relação à importância da pesquisa acadêmica, os docentes enfatizam que ela deve acontecer na perspectiva de parceria com o ensino básico e destacam a necessidade de maior preparação para o compromisso social nas universidades.
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Desenvolvimento de imunossensor para detecção de fator de necrose tumoral (TNF-ALFA)Lima, Michella Bezerra 21 August 2008 (has links)
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Previous issue date: 2008-08-21 / The development of analytical and low cost methods for fast safe diagnosis and control of illnesses in humans has been one of researchers great interests in the last two decades. This attention is also due to simplicity of use and the great sensitivity in the results. Biosensors based on the surface plasmon resonance (SPR) technique combines the inherent specificity of the recognition elements with high sensitivity of physical transducers, enabling selective and sensitive detection of the analytes of interest without labeling and preliminary purification steps. We proposed the development of a biosensor with immobilized monoclonal antibodies on gold surface, for specific recognition of TNF-α using SPR technique. Design. Anti-TNF-α antibody was covalently immobilized on a gold substrate by silane coupling chemistry. After this, TNF-α antigens aliquots were added on the biosensor surface and the signal was measured during three minutes for TNF-α mass quantification recognized by immobilized antibodies. Results.This biosensor presented 24.0 pg.mm-2 (198,3 28,4) of antibodies immobilized on gold surface. TNF-α human was determined from successive injections, with a linear range from 4.3 up to 34.7 pg/mm-2 (R=0.98, SD=2.18, p<0.0001). Conclusion. We performed a preliminary biosensor to quantify TNF-α for planning of diseases treatment, such as auto immune and periodontal diseases, in which TNF-α inhibitor therapy is usually applied. In this cases, it would be necessary the quantification of this cytokine for therapeutic dose adjustment, improving treatment effectiveness and costs reduction. In the next step we intend to optimize the biosensors conditions preparation as well as to test it in human body fluids samples / Os imunossensores, ou biossensores de imunoafinidade são sistemas que exploram a seletividade e especificidade das interações antígeno-anticorpo, para detecção do analito alvo. O objetivo deste trabalho foi o desenvolvimento de um imunossensor, em que anticorpos monoclonais (anti-TNF-α humano) foram imobilizados em superfícies modificadas de ouro, para reconhecimento específico do Fator de Necrose Tumoral Alfa humano (TNF-α). Para a imobilização dessas imunoglobulinas foi necessária a formação de uma monocamada auto-organizada (SAM) sobre a superfície do sensor, composta por 3-aminopropiltrietóxisilano (APTS), sendo testadas quatro concentrações diferentes (1%, 2,5%, 5% e 10%), em dois tipos de solventes, água deionizada e tolueno, para comparação de metodologias para obtenção de melhores respostas. Os métodos de caracterização adotados foram a espectroscopia de Ressonância de Plásmon de Superfície (SPR), para análise da imobilização de anticorpos, na superfície modificada do sensor e a resposta dos sistemas desenvolvidos para detecção do TNF-α; e, Microscopia de Força Atômica (AFM), para verificação topográfica da SAM da superfície sensora. Os resultados mostraram que as melhores condições de desenvolvimento do biossensor desenvolvido neste trabalho ocorreram com a utilização de APTS 2,5% em tolueno, bloqueado com BSA 1%. O biossensor apresentou 24 pg.mm-2 (198,3 28,4 mgrau) de TNF-α humano imobilizados na superfície de ouro, e após injeções sucessivas de 25 pg.mL-1 de antígeno (n=8), em triplicata experimental, obtivemos uma região linear de resposta de 4,3 a 34.7 pg.mm-2 (R=0.98, SD=2.18, p<0.0001). Em análise topográfica das superfícies sensoras, realizada por AFM, foi observado que as amostras preparadas em tolueno, com melhores respostas de reconhecimento do antígeno, apresentaram menor uniformidade na sua estrutura, em razão da maior rugosidade detectada. Foi desenvolvido um imunossensor experimental, que servirá como modelo para o desenvolvimento de biossensor para aplicação clínica futura para quantificação de TNF- humano em fluidos corporais de pacientes portadores de doenças inflamatórias
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Allobates tinae: uma espécie, ou um complexo de espécies semelhantesSilva, Douglas Lacerda da, (92) 992339706 26 September 2018 (has links)
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Previous issue date: 2018-09-26 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Allobates tinae is not a widely distributed species as previously suggested but a complex of cryptic species. In this study, we describe a new species of the Allobates tinae complex that inhabits the lowland dense rainforest of the northern Purus-Madeira Interfluve. We suggest that the distribution of A. tinae is restricted to the southern Purus-Madeira Interfluve and the species inhabits lowland open rainforest. The new species described herein can be easily distinguished by the following combination of morphological characters: small body size; absence of dark blotches or hourglass pattern on dorsum; throat, chest and belly yellow in males and females; when present, melanophores are scarce and founf only on the mandible; Finger III (Finger IV following Grant et al. 2017) uniform in width along phalanges; distal phalange of Finger III larger in males adult than in females; proximal phalange of Finger III larger than medial and distal phalanges in females; forearm shorter than arm. Tadpoles with emarginated buccal apparatus; three or four triangular papillae on corner of the anterior labium; one row of 12 or 14 short, triangular papillae on posterior labium; similar-sized papillae on posteromedial and posterolateral region of posterior labium. Advertisement call characterized by short trills composed by 5 ± 1 (3–7) notes that last 0.041 s ± 0.004 (0.029–0.054 s). Average silent interval between notes was 0.15 s ± 0.03 (0.10–0.23 s), being shorter between the first pair of notes [0.12 s ± 0.01 (0.10–0.15 s)] than between the last pair [0.19 s ± 0.02 (016–0.23 s)]. Peak frequency was 5635 Hz ± 209 (5168–6008 Hz); lower frequency was 5387 Hz ± 204 (4849–5817 Hz); upper frequency was 5829 Hz ± 191 (5374–6206 Hz). The new species described in this study is the 20th species of Allobates from the Brazilian Amazonia. Phylogenetic results indicate that there are two candidate species awaiting formal description in the Allobates tinae species complex. / Allobates tinae não é uma espécie de ampla distribuição como sugerido previamente, mas sim um complexo de espécies semelhantes. Aqui descrevemos uma das quatro espécies do complexo Allobates tinae que ocorre na porção norte do interflúvio Purus-Madeira na floresta ombrófila densa. Sugerimos que Allobate tinae é uma espécie restrita a porção sul do interflúvio e que habita floresta ombrófila aberta. A nova espécie de Alloabtes descrita nesse estudo pode ser diferenciada facilmente pela combinação dos seguintes caracteres morfológicos: tamanho pequeno, dorso sem manchas ou desenhos de ampulheta; ventre, saco vocal e tórax amarelo em machos e fêmeas com escassos melanóforos, quando presentes concentrados na região da mandíbula; dedo III (IV segundo Grant et al. 2017) dos machos de largura uniforme ao longo de todas as falanges; falange distal dos machos mais larga que das fêmeas; dedo III das fêmeas de largura irregular; falange basal mais larga que as falanges medial e distal; antebraço mais curto que o braço. Girinos possuem disco oral emarginado; lábio anterior com 3 ou 4 papilas triangulares e curtas, presente nas margens laterais do lábio; lábio posterior inteiramente cercado por uma fileira de 12 ou 14 papilas triangulares, com tamanho semelhante na margem póstero-lateral e póstero-medial. Cantos de anúncio são compostos por 5 ± 1 (3–7) notas com duração média de 0.041 s ± 0.004 (0.029–0.054 s), intervalo silencioso entre notas é de 0.15 s ± 0.03 (0.10–0.23 s), sendo mais curto entre as duas primeiras notas [ 0.12 s ± 0.01 (0.10–0.15 s)] do que entre as duas últimas notas [0.19 s ± 0.02 (016–0.23 s)], com frequência de pico 5635 Hz ± 209 (5168–6008 Hz), a frequência baixa 5387 Hz ± 204 (4849–5817 Hz) e a frequência alta é de 5829 Hz ± 191 (5374–6206 Hz). A espécie descrita nesse estudo é a 20ª espécie do gênero descrita para a Amazônia brasileira. Resultados filogenéticos sugerem a existência de outras duas espécies candidatas no complexo A. tinae aguardando descrição formal. / O sistema está prático e fácil, sendo pertinente da forma com a qual está disponível. / O presente trabalho, evidência a grande importância de estudos envolvendo complexos crípticos de espécies e a grande substimativa da fauna de anuros nas terras baixas da Amazônia.
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Variabilidade espacial em caracteres morfológicos e diversidade genética de Dendropsophus walfordi (Anura: Hylidae) em bancos de macrófitas na AmazôniaMelo, Lizane da Silva, 92 981094450 17 July 2018 (has links)
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Previous issue date: 2018-07-17 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The Amazon is home to a high biological diversity, which has attracted researchers since the
19th century. Although, the actual number of species occurring in the Amazon, and the
processes responsible for the origin and maintenance of this great diversity, are still widely
debated. Much of what is known of the Amazon herpetofauna is related to non-floodable forest
areas; little is known about diversity in seasonally flooded environments. For amphibians a
mode of dispersion in flooded forests can occur through macrophyte banks. These aquatic plant
communities are considered to be the most densely populated habitats in the várzea water
bodies. Generally, in amphibians, the dispersion movements are of short distances. Longdistance
dispersions are not common, but important for population expansion, colonization of
new habitats, and gene flow. Dendropsophus walfordi occurs in the central region and further
north of the Amazon Basin in Brazil, in flooded environments associated with macrophytes. In
this work we used morphometric data to evaluate if there are significant morphological
differences between the sampled populations, as well as gene mtDNA 16S sequence data, to
evaluate the distribution pattern of the genetic variability of the species. Considering that
Dendropsophus walfordi occurs in macrophytic banks our null hypothesis is that populations
are panmíticas throughout their distribution, since the dislocations of the macrophyte banks
would facilitate the gene flow. To verify patterns of morphological divergence a PCA was
performed. The mtDNA 16S gene was sequenced from 64 individuals distributed in 10
locations. Bayesian inferences were used to investigate the number of real populations.
Population structure was obtained through the AMOVA and demographic events were
investigated via Tajima D and Fu Fs. The index of genetic diversity was also calculated. In
addition, considering the lack of phylogenetic relationships for the species of the group
Dendropsophus microcephalus of which D. walfordi is a part, we incorporated this approach in
the present work using as strategy the obtaining of all mtDNA 16S sequences deposited in
GenBank for the species of the group, taking species of the group Dendropsophus
leucophyllatus as an external group. The analysis of the main components showed that there are
no apparent phenotypic differences among the populations of D. walfordi. Neutrality tests
showed population expansion, and AMOVA revealed high levels of population structure.
Although there is no relationship between genetic distance and geographic distance, some other
factor such as river barriers may be contributing to these levels of structuring. Considering the
database obtained, we also explore the phylogenetic relationships of D. walfordi with the other
species of the group D. microcephalus. The results of the maximum likelihood analysis
indicated little resolution (low support) for the confirmation of the monophyletic group D.
microcephalus and, interestingly, the species D. walfordi and D. nanus showed to be
paraphyletic and the brother group of D. coffea, the which suggests that D. walfordi is
synonymous with D. nanus. / A Amazônia abriga uma alta diversidade biológica, que atrai pesquisadores desde o
século XIX. Porém, o número real de espécies que ocorrem na Amazônia, e os
processos responsáveis pela origem e manutenção dessa grande diversidade, ainda são
amplamente debatidos. Muito do que se conhece da herpetofauna amazônica está
relacionado às áreas de floresta não inundáveis; pouco se sabe sobre a diversidade nos
ambientes sazonalmente alagados. Para os anfíbios um modo de dispersão nas florestas
alagadas pode se dar através dos bancos de macrófitas. Essas comunidades de plantas
aquáticas são consideradas os habitats mais densamente populosos nos corpos de água
da várzea. Geralmente, em anfíbios, os movimentos de dispersão são de curtas
distâncias. Dispersões em longa distância não são comuns, porém importantes para a
expansão populacional, colonização de novos habitats e fluxo gênico. Dendropsophus
walfordi ocorre na região central e mais ao norte da Bacia Amazônica no Brasil, em
ambientes alagados associados às macrófitas. Nesse trabalho utilizamos dados
morfométricos para avaliar se existem diferenças morfológicas significantes entre as
populações amostradas, e também dados de sequência do gene mtDNA 16S, para
avaliar o padrão de distribuição da variabilidade genética da espécie. Considerando que
Dendropsophus walfordi ocorre nos bancos de macrófitas nossa hipótese nula é de que
as populações são panmíticas ao longo de sua distribuição, uma vez que os
deslocamentos dos bancos de macrófitas facilitariam o fluxo gênico. Para verificar
padrões de divergência morfológica foi realizada uma PCA. Foi sequenciado o gene
mtDNA 16S de 64 indivíduos distribuídos em 10 localidades. Foram utilizadas
inferências Bayesianas para investigar o número de populações reais. A estrutura de
populações foi obtida por meio da AMOVA e eventos demográficos foram investigados
via testes D de Tajima e Fs de Fu. Também foi calculado o índice de diversidade
genética. Adicionalmente, considerando a inexistência das relações filogenéticas para as
espécies do grupo Dendropsophus microcephalus do qual faz parte D. walfordi,
incorporamos essa abordagem no presente trabalho usando como estratégia a obtenção
de todas as sequências de gene mtDNA 16S depositadas no GenBank para as espécies
do grupo, tendo espécies do grupo Dendropsophus leucophyllatus como grupo externo.
A análise dos componentes principais mostrou que não há diferenças fenotípicas
aparentes entre as populações de D. walfordi. Os testes de neutralidade mostraram
expansão populacional, e a AMOVA revelou níveis altos de estruturação populacional.
Apesar de não haver relação entre a distância genética e distancia geográfica, algum
outro fator como barreiras fluviais podem estar contribuindo para esses níveis de
estruturação. Considerando o banco de dados obtidos, também exploramos as relações
filogenéticas de D. walfordi com as outras espécies do grupo D. microcephalus. Os
resultados da análise de Máxima Verossimilhança indicaram pouca resolução (baixo
suporte) para a confirmação do monofiletismo do grupo D. microcephalus e,
interessantemente, as espécies D. walfordi e D. nanus mostraram-se parafiléticas e
grupo irmão de D. coffea, o que sugere que D. walfordi seja sinônimo de D. nanus. / Em anexar um novo arquivo e ter que refazer todas as etapas novamente para isso.
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