Submitted by Danielle Karla Martins Silva (danielle.martins@ufpe.br) on 2015-03-03T14:47:51Z No. of bitstreams: 2 David H. Oliveira, 2012 - Dissertação de mestrado - PPGBA.pdf: 7432913 bytes, checksum: 24d1200509356e7d7d0cf0bc1e5bdf5c (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-03T14:47:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 David H. Oliveira, 2012 - Dissertação de mestrado - PPGBA.pdf: 7432913 bytes, checksum: 24d1200509356e7d7d0cf0bc1e5bdf5c (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012 / CNPq ; PROTAX 2010 / Os octocorais do gênero Muriceopsis Aurivillius, 1931 estão entre os habitantes mais característicos dos recifes caribenhos, brasileiros e da costa da África Ocidental. O gênero conta com um total de seis espécies, sendo cinco destas registradas para o Atlântico Ocidental excluindo apenas M. tuberculata (África). Para o Brasil são registradas as espécies M. sulphurea, M. petila, M. metaclados, M. flavida e M. bayeriana. Existe uma confusão taxonômica envolvendo as espécies M. sulphurea e M. bayeriana, e alguns autores sugerem uma sinonímia entre ambas. O objetivo deste trabalho foi revisar as espécies do gênero Muriceopsis do Atlântico Ocidental utilizando a taxonomia integrativa (morfologia e molecular) para identificação das espécies. Foram analisados morfologicamente 95 exemplares de toda a costa brasileira (RS – AM) sendo 17 destes identificados como M. metaclados, 22 como complexo “Muriceopsis sulphurea/bayeriana”, 10 como M. flavida e sete como M. petila. A análise de similaridade de Jaccard entre os lotes do complexo “Muriceopsis sulphurea/bayeriana” corroboram a semelhança morfológica entre as espécies M. sulphurea e M. bayeriana. As analises moleculares foram realizadas através de sequencias da região ITS2 do DNA nuclear e dos modelos das estruturas secundárias do ITS2 do RNA de colônias brasileiras (PE, AL, BA) e caribenhas (Panamá e Colômbia), incluindo sequências do Genbank do holótipo da espécie M. bayeriana e de M. flavida. As análises filogenéticas foram realizadas utilizando os algoritmos de Máxima Parcimônia (MP), Máxima Verossimilhança (neighbour-jonning - NJ) e Inferência Bayesiana (IB) e demonstraram que os exemplares do Caribe (M. bayeriana) representam um clado diferente dos brasileiros (M. sulphurea), razão pela qual poderíamos considerar ambas como espécies crípticas, ou seja, apesar de estarem geneticamente isoladas, elas não apresentam diferenças morfológicas. Portanto se concluiu que o gênero Muriceopsis esta constituído por seis espécies: M. tuberculata, M. petila, M. flavida, M. metaclados, M. sulphurea e M. bayeriana, e possivelmente estas duas últimas seriam endêmicas do Brasil e do Caribe respectivamente.

Submitted by Douglas Silva (douglaslacerda1992@gmail.com) on 2018-11-06T15:44:11Z No. of bitstreams: 3 DISSERTAÇÃO_Versão_Final_2018_DOUGLAS _LACERDA.pdf: 3480099 bytes, checksum: 2a587c6aeaf35e91ebde7e80d5b0e623 (MD5) Carta_Encaminhamento_Autodepósito.pdf: 74603 bytes, checksum: c67bfaec3359c3a309ebef049fb39e80 (MD5) Ata de defesa de dissertação_Douglas Lacerda.pdf: 364655 bytes, checksum: 7685cef32081758b8806d59a5cc435d6 (MD5) / Approved for entry into archive by PPGZOOL Zoologia (ppgzoo.ufam@gmail.com) on 2018-11-06T16:10:20Z (GMT) No. of bitstreams: 3 DISSERTAÇÃO_Versão_Final_2018_DOUGLAS _LACERDA.pdf: 3480099 bytes, checksum: 2a587c6aeaf35e91ebde7e80d5b0e623 (MD5) Carta_Encaminhamento_Autodepósito.pdf: 74603 bytes, checksum: c67bfaec3359c3a309ebef049fb39e80 (MD5) Ata de defesa de dissertação_Douglas Lacerda.pdf: 364655 bytes, checksum: 7685cef32081758b8806d59a5cc435d6 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-11-06T17:53:56Z (GMT) No. of bitstreams: 3 DISSERTAÇÃO_Versão_Final_2018_DOUGLAS _LACERDA.pdf: 3480099 bytes, checksum: 2a587c6aeaf35e91ebde7e80d5b0e623 (MD5) Carta_Encaminhamento_Autodepósito.pdf: 74603 bytes, checksum: c67bfaec3359c3a309ebef049fb39e80 (MD5) Ata de defesa de dissertação_Douglas Lacerda.pdf: 364655 bytes, checksum: 7685cef32081758b8806d59a5cc435d6 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-06T17:53:56Z (GMT). No. of bitstreams: 3 DISSERTAÇÃO_Versão_Final_2018_DOUGLAS _LACERDA.pdf: 3480099 bytes, checksum: 2a587c6aeaf35e91ebde7e80d5b0e623 (MD5) Carta_Encaminhamento_Autodepósito.pdf: 74603 bytes, checksum: c67bfaec3359c3a309ebef049fb39e80 (MD5) Ata de defesa de dissertação_Douglas Lacerda.pdf: 364655 bytes, checksum: 7685cef32081758b8806d59a5cc435d6 (MD5) Previous issue date: 2018-09-26 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Allobates tinae is not a widely distributed species as previously suggested but a complex of cryptic species. In this study, we describe a new species of the Allobates tinae complex that inhabits the lowland dense rainforest of the northern Purus-Madeira Interfluve. We suggest that the distribution of A. tinae is restricted to the southern Purus-Madeira Interfluve and the species inhabits lowland open rainforest. The new species described herein can be easily distinguished by the following combination of morphological characters: small body size; absence of dark blotches or hourglass pattern on dorsum; throat, chest and belly yellow in males and females; when present, melanophores are scarce and founf only on the mandible; Finger III (Finger IV following Grant et al. 2017) uniform in width along phalanges; distal phalange of Finger III larger in males adult than in females; proximal phalange of Finger III larger than medial and distal phalanges in females; forearm shorter than arm. Tadpoles with emarginated buccal apparatus; three or four triangular papillae on corner of the anterior labium; one row of 12 or 14 short, triangular papillae on posterior labium; similar-sized papillae on posteromedial and posterolateral region of posterior labium. Advertisement call characterized by short trills composed by 5 ± 1 (3–7) notes that last 0.041 s ± 0.004 (0.029–0.054 s). Average silent interval between notes was 0.15 s ± 0.03 (0.10–0.23 s), being shorter between the first pair of notes [0.12 s ± 0.01 (0.10–0.15 s)] than between the last pair [0.19 s ± 0.02 (016–0.23 s)]. Peak frequency was 5635 Hz ± 209 (5168–6008 Hz); lower frequency was 5387 Hz ± 204 (4849–5817 Hz); upper frequency was 5829 Hz ± 191 (5374–6206 Hz). The new species described in this study is the 20th species of Allobates from the Brazilian Amazonia. Phylogenetic results indicate that there are two candidate species awaiting formal description in the Allobates tinae species complex. / Allobates tinae não é uma espécie de ampla distribuição como sugerido previamente, mas sim um complexo de espécies semelhantes. Aqui descrevemos uma das quatro espécies do complexo Allobates tinae que ocorre na porção norte do interflúvio Purus-Madeira na floresta ombrófila densa. Sugerimos que Allobate tinae é uma espécie restrita a porção sul do interflúvio e que habita floresta ombrófila aberta. A nova espécie de Alloabtes descrita nesse estudo pode ser diferenciada facilmente pela combinação dos seguintes caracteres morfológicos: tamanho pequeno, dorso sem manchas ou desenhos de ampulheta; ventre, saco vocal e tórax amarelo em machos e fêmeas com escassos melanóforos, quando presentes concentrados na região da mandíbula; dedo III (IV segundo Grant et al. 2017) dos machos de largura uniforme ao longo de todas as falanges; falange distal dos machos mais larga que das fêmeas; dedo III das fêmeas de largura irregular; falange basal mais larga que as falanges medial e distal; antebraço mais curto que o braço. Girinos possuem disco oral emarginado; lábio anterior com 3 ou 4 papilas triangulares e curtas, presente nas margens laterais do lábio; lábio posterior inteiramente cercado por uma fileira de 12 ou 14 papilas triangulares, com tamanho semelhante na margem póstero-lateral e póstero-medial. Cantos de anúncio são compostos por 5 ± 1 (3–7) notas com duração média de 0.041 s ± 0.004 (0.029–0.054 s), intervalo silencioso entre notas é de 0.15 s ± 0.03 (0.10–0.23 s), sendo mais curto entre as duas primeiras notas [ 0.12 s ± 0.01 (0.10–0.15 s)] do que entre as duas últimas notas [0.19 s ± 0.02 (016–0.23 s)], com frequência de pico 5635 Hz ± 209 (5168–6008 Hz), a frequência baixa 5387 Hz ± 204 (4849–5817 Hz) e a frequência alta é de 5829 Hz ± 191 (5374–6206 Hz). A espécie descrita nesse estudo é a 20ª espécie do gênero descrita para a Amazônia brasileira. Resultados filogenéticos sugerem a existência de outras duas espécies candidatas no complexo A. tinae aguardando descrição formal. / O sistema está prático e fácil, sendo pertinente da forma com a qual está disponível. / O presente trabalho, evidência a grande importância de estudos envolvendo complexos crípticos de espécies e a grande substimativa da fauna de anuros nas terras baixas da Amazônia.

Submitted by Johnsson Rodrigo (r.johnsson@gmail.com) on 2013-09-03T03:30:29Z No. of bitstreams: 1 EUVALDO_SILVA_DEFINITIVA.pdf: 1461931 bytes, checksum: b58e4aa27ee3926c3a858d5786798c63 (MD5) / Approved for entry into archive by Alda Lima da Silva(sivalda@ufba.br) on 2013-09-03T17:53:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 EUVALDO_SILVA_DEFINITIVA.pdf: 1461931 bytes, checksum: b58e4aa27ee3926c3a858d5786798c63 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-03T17:53:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 EUVALDO_SILVA_DEFINITIVA.pdf: 1461931 bytes, checksum: b58e4aa27ee3926c3a858d5786798c63 (MD5) / FAPESB, CNPq / Hypsiboas semilineatus é uma perereca de médio porte distribuída ao longo de quase toda extensão da Floresta Atlântica brasileira, desde o Estado de Pernambuco até o Estado de Santa Catarina. A espécie foi sucintamente descrita por Spix em 1824 como uma variedade de Hyla geographica (=Hypsiboas geographicus). Desde então vários autores subsequentes apresentaram descrições de novas espécies baseada em juvenis que posteriormente foram corretamente identificados como de H. semilineatus. Isso deveu-se ao fato de a morfologia dos juvenis de H. semilineatus ser muito diferente da dos adultos, o que resultou em um histórico taxonômico confuso envolvendo a identidade da espécie. Um século mais tarde, H. semilineatus foi sinonimizada com H. geographicus e, em seguida, separadas novamente. A revalidação de H. semilineatus como espécie plena foi baseada em cinco caracteres qualitativos e não houve apresentação de estatística associadas às diferenças em relação a H. geographicus. Desta maneira este trabalho visou (1) re-descrever a espécie de ocorrência atlântica, (2) caracterizar seus padrões de variação ao longo do gradiente latitudinal no qual se distribui e (3) testar a hipótese nula de que a espécie representa um complexo de espécies ao longo de sua distribuição. A abordagem utilizada para o tratamento dos dados foi a da taxonomia integrativa com a utilização de diferentes linhas de evidência (morfometria, bioacústica e padrão de desenho/colorido) para delimitar espécie. Em uma fase posterior, foram analisadas as demais espécies do grupo de H. semilineatus a fim de apresentar as relações morfométricas entre as mesmas e subsidiar suas diagnoses. / Salvador

Submitted by Lucas Henrique De Almeida null (lucasalmeida768@yahoo.com.br) on 2018-03-08T16:03:26Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Final FInal.pdf: 4152416 bytes, checksum: f411bb9ed807163a2ae24c13db2d4aee (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Luiza Carpi Semeghini (luiza@assis.unesp.br) on 2018-03-08T18:09:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 almeida_lh_me_assis.pdf: 4152416 bytes, checksum: f411bb9ed807163a2ae24c13db2d4aee (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-08T18:09:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 almeida_lh_me_assis.pdf: 4152416 bytes, checksum: f411bb9ed807163a2ae24c13db2d4aee (MD5) Previous issue date: 2018-02-28 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Plecoptera compreende uma ordem de insetos aquáticos com aproximadamente 3500 espécies conhecidas, sendo distribuídas em 16 famílias. No Brasil são registradas apenas duas famílias, sendo Gripopterygidae e Perlidae. Neste trabalho foram estudadas as espécies de Perlidae da Serra de Paranapiacaba, incluindo os Parques Estaduais Carlos Botelho (PECB), Intervales (PEI) e Turístico do Alto Ribeira (PETAR), Estado de São Paulo. Com o objetivo de integrar o conhecimento taxonômico ao molecular, obtendo identificações de adultos e a associação adulto-ninfa utilizando DNA Barcode. Foram registradas 14 espécies, sendo Anacroneuria representado por nove espécies: A. boraceiensis, A. debilis, A. fiorentini, A. flintorum, A. iporanga, A. itajaimirim, A. polita, A. subcostalis e A. tupi. Kempnyia por quatro espécies: K. auberti, K. colossica, K. flava e K. neotropica. Macrogynoplax por apenas uma espécie: M. veneranda. Foram realizados dois novos registros (Anacroneuria debilis e A. fiorentini), duas descrições de imaturos (A. flintorum e A. tupi) e uma sinonimização (Kempnyia petersorum). Adicionalmente, é fornecida uma chave de identificação de adultos da região. / Plecoptera comprises an order of aquatic insects with aproximately 3500 species, distributed in 16 families. In Brazil, only two families are recorded, being Gripopterygidae and Perlidae. In this work, were studied the species of Perlidae from Paranapiacaba mountains, including the Carlos Botelho State Park (PECB), Intervales State Park (PEI), and Alto Ribeira Tourist State Park (PETAR), São Paulo State. With the objective of integrating the taxonomic knowledge to the molecular, obtaining identifications of adults and the adult-nymph association using the DNA Barcode. Were recorded fourteen species, being Anacroneuria represented by nine species: A. boraceiensis, A. debilis, A. fiorentini, A. flintorum, A. iporanga, A. itajaimirim, A. polita, A. subcostalis and A. tupi. Kempnyia by four species: K. auberti, K. colossica, K. flava and K. neotropica. Macrogynoplax by only one species: M. veneranda. Were made two new records (Anacroneuria debilis and A. fiorentini), two descriptions of nymphs (A. flintorum and A. tupi), and one synonymization (Kempnyia petersorum). In addition, a key is provided for the identification of adults from the region / FAPESP: 2015/22008-9

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:49:10Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo126_1.pdf: 5361968 bytes, checksum: 5b5b15ceb3a451a8c287f6b4b77e6338 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Petróleo Brasileiro S/A / O filo Nematoda apresenta uma grande diversidade e elevada abundância em ambientes aquáticos (marinhos e água doce) e terrestres. A identificação do grupo usando caracteres morfológicos consome tempo, principalmente devido à alta plasticidade fenotípica entre as populações. Alguns métodos moleculares como DNA barcoding oferecem um alternativa eficiente no estudo da biodiversidade das comunidades dos Nematoda marinhos. Os objetivos desse estudo foram: (1) revisão molecular discutindo os conceitos de taxonomia de DNA, código de barras e taxonomia integrativa; (2) aplicação dos marcadores moleculares nucleares e mitocondriais; (3) fazer um inventário molecular através das sequências depositadas em bancos de dados públicos, estimando a porcentagem dos genes mais usados para DNA barcoding com os Nematoda marinhos, produzir novas sequências de DNA de Nematodade três regiões: Bacia de Campos (RJ), Baja Califórnia (Mex) e Bolsa Chica (CA/USA) e (4) elaborar uma visão conceitual do Cartão de Identificação dos Nematoda (NIC) integrado com bancos de dados apresentando-se como uma ferramenta útil para estudos ecológico-moleculares. Os resultados apontaram que mais de 600 espécies do filo Nematoda já foi sequenciado, a maioria parcialmente, depositadas em bancos genéticos públicos com respectivos números de acesso e genes. Observou-se que o gene 18S é o mais utilizado na produção de sequências barcode com aproximadamente 72%, enquanto que citocromo oxidase e região intergênica são frequentemente menos sequenciados. A partir das árvores filogenéticas construídas, o marcador Minibarcode não se mostrou útil para taxonomia molecular dos Nematoda marinhos. Nesse estudo produziu-se 20 sequências de 18S e 42 de 28S, pertencentes a 36 espécies, correspondendo a 27 gêneros e 15 famílias. Além disso, 14 espécies foram identificadas como novos registros de sequências para Genbank. Em adição, o conceito NIC tem o objetivo de promover ligação entre os diversos tipos de bancos de dados públicos a partir da criação de um site . A técnica de DNA barcoding nos Nematoda marinhos tem crescido rapidamente nos últimos anos, devido à necessidade de aprimoramento das ferramentas de biodiversidade e ecológicas em programas de monitoramento. Foi feita a descrição de Cornurella gen nv da Bacia de Campos (RJ) apresentando caracteres morfológicos da família Desmodoridae (Nematoda). Estudos futuros usando uma combinação de taxonomia integrativa e NIC são necessários para melhorar a informação disponível, com o intuito de caracterizar melhor a diversidade dos Nematoda marinhos

Primary taxonomic research in neotropical ichthyology still suffers from limited integration between morphological and molecular tools, despite major recent advancements in both fields. Such tools, if used in an integrative manner, could help in solving long-standing taxonomic problems. The genus Pimelodella Eigenmann & Eigenmann, 1888 is a perfect case for an integrative and multidisciplinary approach in taxonomy. Pimelodella is a genus of the Heptapteridae broadly distributed throughout trans- and cis-Andean South America, and one of the main components of Neotropical Ichthyofauna. Nowadays is the most species-rich genus of the family, with 79 valid species. However, the validity and delimitation of those species is extremely problematic, due their broad geographic distribution, conserved morphology, and ancient and imprecise descriptions. Pimelodella is undoubtedly one of the most severe taxonomic bottlenecks in neotropical ichthyology. This project presents a taxonomic revision of Pimelodella using an integrative morphological-molecular approach. The traditional taxonomic revision covers the genus in its entirety, with all the components of this kind of study. All types were examined, and the number of valid species herein recognized was reduced to 55 species, for which full descriptions are presented. The molecular taxonomy was done for a circumscribed subset of the genus, with representation enough to understand the molecular divergences and compare them with the traditional taxonomy results, allowing an evaluation of the results of the revision. / A pesquisa taxonômica primária ainda apresenta pouca integração entre as ferramentas morfológicas e moleculares para o estudo de peixes neotropicais, apesar de grandes avanços recentes em ambos os campos. Tais ferramentas, se usadas de maneira integrativa, poderiam solucionar grupos reconhecidos por representarem problemas taxonômicos renitentes. O gênero Pimelodella Eigenmann & Eigenmann, 1888 se enquadra como um ótimo caso para a aplicação de uma estratégia integrativa e multidisciplinar. Pimelodella é um gênero da família Heptapteridae, distribuído amplamente por drenagens sul-americanas trans- e cis-andinas e compreende um dos principais componentes da ictiofauna neotropical. Atualmente é reconhecido como o maior gênero da família, com 79 espécies válidas descritas. Entretanto, a validade e delimitação dessas espécies é problemática, devido à elevada diversidade do gênero, aliada à ampla distribuição, morfologia conservada e descrições antigas e imprecisas. Trata-se de um dos grandes gargalos taxonômicos na sistemática e taxonomia de peixes neotropicais. Este projeto apresenta uma revisão taxonômica de Pimelodella utilizando uma abordagem integrativa morfológica-molecular. A revisão taxonômica clássica cobre a integridade da diversidade do gênero, com todos os componentes deste tipo de estudo. Todos os tipos foram examinados, e o número de espécies validas é aqui reduzido para 55 espécies, para as quais descrições completas são apresentadas. A parte molecular foi realizada em um subgrupo delimitado, com diversidade suficiente para que as estimativas de divergência molecular pudessem ser comparadas aos resultados da revisão morfológica, fornecendo um modelo de avaliação para o restante da revisão.

Submitted by Johnsson Rodrigo (r.johnsson@gmail.com) on 2013-09-06T12:32:48Z No. of bitstreams: 1 deise_definitiva.pdf: 27097250 bytes, checksum: a4da0f3192bffc18ed992a253b117d5b (MD5) / Approved for entry into archive by Alda Lima da Silva(sivalda@ufba.br) on 2013-09-12T17:58:47Z (GMT) No. of bitstreams: 1 deise_definitiva.pdf: 27097250 bytes, checksum: a4da0f3192bffc18ed992a253b117d5b (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-12T17:58:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 deise_definitiva.pdf: 27097250 bytes, checksum: a4da0f3192bffc18ed992a253b117d5b (MD5) / FAPESB / Anfíbios de ampla distribuição geralmente possuem problemas taxonômicos que põem em dúvida os seus limites específicos. Desta maneira, abordagens como a morfologia, acústica, molecular e distribuição geográfica podem ser utilizadas de forma integrada para resolver o status taxonômico de espécies como Hypsiboas faber. Populações de H. faber apresentam muita variação genótipica e fenótipica que sugere a possibilidade da existência de espécies criptícas. Para testar H. faber como hipótese, buscou-se analisar e caracterizar padrões de variação morfológica, colorido e acústica; identificar congruências entre diferentes linhas de evidências quanto à existência de grupos populacionais; estabelecer o limite específico inerente a Hypsiboas faber, determinando se a mesma compreende uma única linhagem; além de fornecer nova caracterização do adulto desta espécie, considerando amostras topotípicas. Caracteres morfométricos, coloração e parâmetros acústicos foram analisados, ao longo do gradiente latitudinal de H. faber. Seis grupos populacionais foram estabelecidos a partir da análise destas linhas de evidência integradas a dados moleculares (mtDNA) e diferenças significativas foram apontadas entre eles. Os padrões encontrados podem ser relacionados à teoria dos Refúgios Florestais Pleistocênicos e, consequentemente, à diferenciação alo-parapátrica. O norte da Mata Atlântica demonstrou ser a região mais divergente entre todos os grupos populacionais de H. faber. Contudo, as abordagens analisadas não evidenciaram lacunas discretas que pudessem indicar delimitações de linhagens crípticas. / Salvador

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:03:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1210_1.pdf: 3294326 bytes, checksum: 9fc990b48e1446999fb6ce37e99cda14 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Nematoda é um dos táxons mais abundantes e diversos dentre os metazoários, contudo, grande parte desta diversidade permanece desconhecida. A taxonomia do grupo muitas vezes tem uma história controversa, não somente em conseqüência do desenvolvimento dos procedimentos em sistemática, mas também por que relativamente poucos nematologistas produzem classificações detalhadas. Além disso, Nematoda é considerado um grupo de difícil identificação, devido ao seu tamanho corporal, o que reforça a necessidade da utilização de outros subsídios para acelerar a descoberta e classificação de sua biodiversidade. A fim de pôr em prática a taxonomia integrativa , onde vários tipos de dados são utilizados no estudo das espécies, este trabalho destinase a descrever uma nova espécie de Daptonema, revelar as suas relações filogenéticas, além de descrever e correlacionar sua estratégia reprodutiva com os parâmetros ambientais. As coletas de material biológico e dados abiótico foram realizadas na Bacia do Pina, quinzenalmente, na estação seca (setembro, outubro e novembro/2006) e na estação chuvosa (maio, junho e julho/2007), sempre na baixa-mar. Em dezembro, coletou-se uma amostra para extração de DNA e sequenciamento do gene 18S (rDNA). As seqüências foram analisadas pelos métodos de máxima parcimônia, neighbor-joining e inferência bayesiana. As correlações com os fatores ambientais foram realizadas utilizando a Correlação de Spearman. A espécie de Daptonema é nova por apresentar uma acentuada redução das setas cefálicas e a espícula em linha reta, característica esta que requer uma emenda na descrição do gênero. Em algumas fêmeas também se pode observar a incubação intra-uterina da prole, sendo tal característica considerada uma das autapomorfias da espécie. As análises apoiaram Daptonema sp. nov. como uma linhagem genética e evolutivamente distinta. Os dados também indicaram uma sinonímia e uma parafilia envolvendo Daptonema. Em Daptonema sp. nov. foi observado a ovoviviparidade, entretanto, o que torna o fenômeno peculiar é a presença de ovos e juvenis em vários estágios de desenvolvimento. Os resultados ecológicos mostraram que nenhum fator ambiental apresentou uma correlação significativa com o fenômeno reprodutivo em Daptonema sp. nov

Free-living marine nematodes are the most ubiquitous, abundant and diverse meiofaunal component of benthic communities. These are excellent model organisms, due to its short life span, wide availability and feasibility to cultivate with minimum laboratory facilities. In this study, a population of Diplolaimella dievengatensis Jacobs 1991 (Nematoda, Monhysteridae) from the relatively Pristine estuary of the Guaratuba River in São Paulo, Brazil was isolated and cultivated. The goals were; i- to apply an integrative taxonomic approach in order to compare this population from Brazil with another from the species type-locality in the Belgian Coast, with regard to morphological, life-cycle and the 18S gene of the rDNA molecular data; and ii- to compare, at the light of life history theory, the responses of life history parameters such as; fecundity, growth and survivorship of D. dievengatensis (here as a slower species) and Litoditis marina (Bastian, 1865) (Nematoda, Rhabditidae) (as a faster species) under sublethal exposition to the sodium dodecyl sulfate (SDS) surfactant. The population from Brazil was similar to that from Belgium coast in all parameters. Although morphometric analyses considered the Brazilian D. dievengatensis isometrically larger than the Belgian population regarding some characters, the presence of all diagnostic characters confirmed the similarity of both species. The life-cycle, hatching time, final body length, and biomass parameters were similar in both populations, in which females were larger than males. The population growth, measured as intrinsic rate of natural increase was slightly higher for the D. dievengatensis from Brazil (rm=0.41), than the European population (rm =0.348). Molecular comparison on Genbank showed 99.4% of similarity between both populations, indicating therefore, that D. dievengatensis from Brazil is similar to those from Belgium. In the chapter ii, both species responded differently to SDS exposition. Growth and reproduction rate of D. dievengatensis surprisingly were enhanced at low and intermediate concentrations of SDS (0.001 and 0.003%), while for L. marina these parameters were reduced in all SDS concentrations tested (0.001, 0.003 and 0.006%). The SDS did not affect the survivorship of adults of the slower specie. On the other hand, survivorship of adults of the fast species was significantly affected by SDS and this effect was dependent on adult gender, with reduced rates of males exposed to 0.006% SDS. Although both species are located nearby along the fast-slow continuum, they responded distinctly to of the toxic SDS effect. Effects over L. marina met the trend of faster species in allocating fewer investments in defenses against physiological injuries and on their own somatic maintenance. We propose that the apparent lower resistance of this faster species under stress at the individual level is balanced by their higher reproductive rates, conferring higher resilience to this species at the population level. Finally, it was demonstrated that the marine nematode D. dievengatensis is an important native model organism which can be used in a wide range of studies and experimental tests. Identifying and understanding differential effects of stress in the context of life-history theory is an important aspect which enhanced our understanding about the threats posed by anthropogenic activities on natural communities / Nematodas marinhos de vida livre são o mais onipresentes, abundantes e diversos componentes da meiofauna em comunidades bênticas. São excelentes organismos modelo devido a seu curto ciclo de vida, ampla disponibilidade e viabilidade de cultivo com mínima estrutura laboratorial. Neste estudo, uma população de Diplolaimella dievengatensis Jacobs 1991 (Nematoda, Monhysteridae) do estuário relativamente prístino do rio Guaratuba, São Paulo, Brasil foi isolada e cultivada. Os objetivos foram: ii- aplicar uma abordagem taxonômica integrativa a fim de comparar esta população do Brasil com outra da localidade tipo dessa espécie, da costa da Bélgica, com relação à dados morfológicos, do ciclo de vida e molecular do gene 18S do rDNA; e ii-comparar, à luz da teoria da historia de vida, repostas de parâmetros do ciclo de vida tais como: fecundidade, crescimento e sobrevivência de D. dievengatensis (aqui como espécies mais lenta) e Litoditis marina (Bastian, 1865) (Nematoda, Rhabditidae) (como espécie rápida) sob exposição subletal ao surfactante dodecil sulfato de sódio (DSS) . A população do Brasil foi similar a da costa da Bélgica em todos os parâmetros. Embora analises morfométricas consideraram D. dievengatensis do Brasil isometricamente maior que a população belga em relação em algumas características, a presença de todos os caracteres diagnósticos confirmaram a similaridade de ambas as espécies. Os parâmetros de ciclo de vida, tempo de eclosão, comprimento corporal final e biomassa foram similares em ambas as populações, nas quais fêmeas foram maiores que machos. Crescimento populacional, mensurado como taxa intrínseca de crescimento natural foi ligeiramente mais alta para D. dievengatensisdo Brasil (rm=0.41), que para a população europeia (rm=0.348). Comparações moleculares no Genbank mostraram 99.4% de similaridade entre ambas populações, indicando portanto que a população do Brasil é similar a D. dievengatensis belga. No capítulo ii, ambas as espécies responderam distintamente a exposição ao SDS. Supreendentemente as taxas de crescimento e de reprodução de D. dievengatensis foram incrementadas sob concentrações mais baixas e intermediárias (0.001 e 0.003%), enquanto para L. marina esses parâmetros foram reduzidos em todas as concentrações de DSS testadas (0.001, 0.003 e 0.006%). O DSS não afetou a sobrevivência de adultos da espécie mais lenta. Por outro lado, a sobrevivência de adultos da espécie mais rápida foi significativamente afetada pelo SDS e esse efeito foi dependente do sexo, com taxas reduzidas em machos expostos a 0.006 % de DSS. Embora ambas as espécies estejam proximamente dispostas ao longo do gradiente \"rápido-lento\", elas responderam diferentemente ao efeito tóxico do DSS. Efeitos sobre L marina se enquadram no padrão de espécies mais rápidas ao alocar menores investimentos para as defesas contra danos fisiológicos e para sua própria manutenção somática. Nós propomos que a aparente menor resistência desta espécie rápida sob estresse ao nível individual é balanceada por suas altas taxas reprodutivas, conferindo mais alta resiliência a essa espécie ao nível populacional. Por fim, foi demonstrado que D. dievengatensis é um importante organismo modelo nativo que pode ser usado em uma ampla diversidade estudos e testes experimentais. Identificar e compreender diferentes efeitos do estresse dentro do contexto da teoria da história de vida é um aspecto importante, o qual tem aumentado nosso conhecimento sobre as ameaças de atividades antropogênicas sobre comunidades naturais

The diversity of the genus Trichomycterus Valenciennes 1832 in the Rio Doce basin is investigated using conventional and modern morphology and DNA analyses. The work is presented in two Chapters. Chapter One, entitled Diversity of the genus Trichomycterus Valenciennes, 1832 (Siluriforms, Trichomycteridae) in the Rio Doce basin: a systematic study integrating phenotypes, DNA and classical taxonomy integratively analyzes specimens of the genus from the entire Rio Doce drainage and adjacent basins, both from available world-wide collections and from active sampling efforts. A combination of phenotypic and DNA (COI barcoding analysis) provides evidence for the existence of 14 species in the basin, 10 of which are new: T. alternatus Eigenmann, 1917; T. argos Lezama et al., 2012; T. astromycterus sp. nov.; T. barrocus sp. nov.; T. brucutu sp. nov.; T. brunoi Barbosa & Costa, 2010; T. immaculatus (Eigenmann & Eigenmann, 1889)] T. illuvies sp. nov.; T. melanopygius sp. nov.; T. ipatinguensis sp. nov.; T. pussilipygius sp. nov.; T. sordislutum sp. nov.; T. vinnulus sp. nov; and T. tantalus sp. nov. . In addition, a lectotype is designated for T. immaculatus and the species is considered as a senior synonym of Trichomycterus pradensis Sarmento-Soares et al., 2005. Although remarkable, such increase in species number of Trichomycterus in a single drainage matches similar recent increments in some other Southeastern Brazilian basins, such as the Paraíba do Sul and Iguaçu. The kind of differentiation among species herein recognized varies, with some of them being well-differentiated in morphology but not in barcoding data, and others showing the opposite phenomenon. The geographical distribution of each of the 14 species is plotted in the Rio Doce basin. The wide geographical distribution of some species (T. alternatus and T. immaculatus) is explained against data from geomorphological processes and comparative information on their biology. Chapter two, The type specimens of Trichomycterus alternatus (Eigenmann, 1917) and T. zonatus (Eigenmann, 1918), with elements for future revisionary work (Teleostei, Siluriformes, Trichomycteridae) focuses on the complex taxonomy, nomenclature and type material status of T. alternatus and T. zonatus. The type series of the two species are analyzed in detail, both in morphology and locality data. Osteological information was obtained with conventional and a new technique of radiographic stereo-triplets. Our new data elucidates their species distinctiveness, diagnostic characteristics, type localities and show that T. zonatus does not occur in the Rio Doce basin. / A diversidade do gênero Trichomycterus Valenciennes 1832 na bacia do Rio Doce é investigada utilizando métodos convencionais e modernos em análises morfológicas e moleculares. Os resultados desta dissertação são apresentados em dois capítulos. Capítulo um, intitulado Diversity of the genus Trichomycterus Valenciennes, 1832 (Siluriforms, Trichomycteridae) in the Rio Doce basin: a systematic study integrating phenotypes, DNA and classical taxonomy examinou espécimes pertencentes a este gênero encontrados no Rio Doce e em bacias adjacentes disponíveis em coleções nacionais e internacionais e coletados durante esta dissertação. O conjunto de dados obtidos através de análises morfológicas e moleculares (COI, DNA barcoding) revelou a existência de 14 espécies na bacia do Rio Doce, das quais 10 novas: T. alternatus Eigenmann, 1917; T. argos Lezama et al., 2012; T. astromycterus sp. nov.; T. barrocus sp. nov.; T. brucutu sp. nov.; T. brunoi Barbosa & Costa, 2010; T. immaculatus (Eigenmann & Eigenmann, 1889)] T. illuvies sp. nov.; T. melanopygius sp. nov.; T. ipatinguensis sp. nov.; T. pussilipygius sp. nov.; T. sordislutum sp. nov.; T. vinnulus sp. nov; and T. tantalus sp. nov. Além disso, é designado um lectótipo para T. immaculatus, espécie aqui proposta como sinônimo sênior de Trichomycterus pradensis Sarmento-Soares et al., 2005. O acentuado incremento em número de espécies de Trichomycterus para uma única bacia segue um padrão de crescimento em biodiversidade conhecida do gênero para outras drenagens do sudeste brasileiro a exemplo do rio Paraíba do Sul e Iguaçu. Os tipos de diferenciação detectada entre as espécies aqui tratadas variam, com algumas bem corroboradas morfologicamente, porém muito similares ou indiferenciáveis em análise de DNA barcoding, e outras apresentando o fenômeno oposto. As distribuições geográficas de cada uma das 14 espécies são mapeadas com base em todo o material examinado. A ampla distribuição geográfica de algumas espécies (T. alternatus and T. immaculatus) é explicada através de processos geomorfológicos e informações comparativas sobre suas biologias. O capítulo dois, The type specimens of Trichomycterus alternatus (Eigenmann, 1917) and T. zonatus (Eigenmann, 1918), with elements for future revisionary work (Teleostei, Siluriformes, Trichomycteridae) se concentra em esclarecer a complexa taxonomia, nomenclatura e o status do material tipo de T. alternatus e T. zonatus. As séries tipos das duas espécies foram minuciosamente analisadas tanto para morfologia como para suas respectivas localidades de proveniência. Informações osteológicas foram obtidas através de técnicas de radiografia convencionais e uma nova metodologia chamada stereo triplets. Os dados obtidos corroboram as respectivas espécies como distintas, e permitem uma avaliação precisa de seus respectivos caracteres diagnósticos e localidades tipo. Também se chegou à conclusão que T. zonatus não ocorre na bacia do Rio Doce.