Submitted by Johnsson Rodrigo (r.johnsson@gmail.com) on 2013-09-03T03:30:29Z No. of bitstreams: 1 EUVALDO_SILVA_DEFINITIVA.pdf: 1461931 bytes, checksum: b58e4aa27ee3926c3a858d5786798c63 (MD5) / Approved for entry into archive by Alda Lima da Silva(sivalda@ufba.br) on 2013-09-03T17:53:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 EUVALDO_SILVA_DEFINITIVA.pdf: 1461931 bytes, checksum: b58e4aa27ee3926c3a858d5786798c63 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-03T17:53:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 EUVALDO_SILVA_DEFINITIVA.pdf: 1461931 bytes, checksum: b58e4aa27ee3926c3a858d5786798c63 (MD5) / FAPESB, CNPq / Hypsiboas semilineatus é uma perereca de médio porte distribuída ao longo de quase toda extensão da Floresta Atlântica brasileira, desde o Estado de Pernambuco até o Estado de Santa Catarina. A espécie foi sucintamente descrita por Spix em 1824 como uma variedade de Hyla geographica (=Hypsiboas geographicus). Desde então vários autores subsequentes apresentaram descrições de novas espécies baseada em juvenis que posteriormente foram corretamente identificados como de H. semilineatus. Isso deveu-se ao fato de a morfologia dos juvenis de H. semilineatus ser muito diferente da dos adultos, o que resultou em um histórico taxonômico confuso envolvendo a identidade da espécie. Um século mais tarde, H. semilineatus foi sinonimizada com H. geographicus e, em seguida, separadas novamente. A revalidação de H. semilineatus como espécie plena foi baseada em cinco caracteres qualitativos e não houve apresentação de estatística associadas às diferenças em relação a H. geographicus. Desta maneira este trabalho visou (1) re-descrever a espécie de ocorrência atlântica, (2) caracterizar seus padrões de variação ao longo do gradiente latitudinal no qual se distribui e (3) testar a hipótese nula de que a espécie representa um complexo de espécies ao longo de sua distribuição. A abordagem utilizada para o tratamento dos dados foi a da taxonomia integrativa com a utilização de diferentes linhas de evidência (morfometria, bioacústica e padrão de desenho/colorido) para delimitar espécie. Em uma fase posterior, foram analisadas as demais espécies do grupo de H. semilineatus a fim de apresentar as relações morfométricas entre as mesmas e subsidiar suas diagnoses. / Salvador

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Biologia, Programa de Pós Graduação em Biologia Animal, 2014. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2014-06-11T14:58:05Z No. of bitstreams: 1 2014_LuisaMayumiArakeTacca.pdf: 3171230 bytes, checksum: f2a279d3f6739aba7da24618336db559 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-07-09T11:45:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_LuisaMayumiArakeTacca.pdf: 3171230 bytes, checksum: f2a279d3f6739aba7da24618336db559 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-07-09T11:45:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_LuisaMayumiArakeTacca.pdf: 3171230 bytes, checksum: f2a279d3f6739aba7da24618336db559 (MD5) / Os anfíbios anuros são animais que vêm sendo estudados e utilizados como modelos para descoberta de novas moléculas há algum tempo. Sua pele secreta uma mistura de substâncias ativas em grande parte já isoladas e estruturalmente caracterizadas. Dentre tais compostos, podemos citar peptídeos antimicrobianos, hipotensores e opióides, aminas biogênicas, alcaloides e esteróis. O trabalho em questão analisou um peptídeo oriundo da secreção cutânea do anfíbio Hypsiboas punctatus. Tal peptídeo apresenta uma sequência de 15 resíduos de aminoácidos e um motivo ativo composto pelo tripeptídeo KGD característico das proteínas da família das desintegrinas, até o momento inédito em anfíbios. O peptídeo em questão foi modificado em mais cinco análogos e sintetizado por meio de síntese química sólida. As moléculas foram purificadas, caracterizadas e testadas e, ao final do processo, tiveram os modelos das suas estruturas tridimensionais determinados por meio de Ressonância Magnética Nuclear. A sequência peptídica original foi modificada para gerar cinco análogos sintéticos obtidos por meio de síntese química em fase sólida. Todos os análogos foram submetidos à oxidação do par de resíduos de cisteína para formação das respectivas pontes dissulfeto, purificados, caracterizados e testados. Ao final deste processo, tiveram suas respectivas estruturas tridimensionais determinadas por meio de Ressonância Magnética Nuclear. O peptídeo natural não apresentou qualquer atividade anti- plaquetária in vitro quando testado por meio da metodologia de impedância elétrica, no entanto é possível atribuir-se a esta molécula discreta atividade relativa de inibição de agregação em ensaios de espalhamento plaquetário. Contudo, quando avaliados comparativamente sob mesma metodologia, os análogos sintéticos demonstram atividade anti-plaquetária significativamente superior ao peptídeo natural, utilizado neste trabalho como um arquétipo estrutural de desintegrina. Tais evidências, isto é, a comprovação experimental do surgimento de uma nova atividade biológica em análogos sintéticos, originalmente inexistente na molécula arquetípica, corrobora nossa hipótese sobre a importância da redistribuição das cargas (positiva e negativa) ao longo do eixo maior da estrutura 3D de cada análogo e da necessidade de um reposicionamento “Taylor-Made” dos motivos (Arg-Gly-Asp; Lys-Gly-Asp; His-Gly-Asp) para que as novas moléculas fossem ativas. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Anurans are animals that have been much explored as models. Their skin is part of their immune system and it has special glands which secrete a rich mixture of substances related to their innate defense against predators and microorganisms. Among this molecules are active peptides which have been isolated and tested for many pathogens and are a growing field within pharmacology. The present work analyzed a specific peptide from the skin secretion of the amphibian Hypsiboas punctatus. It is formed by a 15 amino acid sequence with a KGD disintegrin-like motif in the center of a loop constricted by a disulfide bridge. This motif has never been registered for amphibians before. The natural peptide was modified into five analogues which were synthesized through solid phase tButyl/FMOC strategy. They were purified (Reverse-Phase High Performance Liquid Chromatography), characterized (Mass Spectrometry), had their biological activity tested and their 3D structures calculated with the use of Nuclear Magnetic Resonance. The natural peptide did not show any anti-platelet inhibition activity when tested through electric impedance methodology; however it did show relative biological activity when tested through platelet spreading assay methodology. The modified analogues showed a higher activity rate. The results indicate the verification of the hypothesis of the importance of an improved positioning of the positive and negative charges along the molecule structure and also of the need for the ligand section of the peptide to be centered in the active loop.

Submitted by Alisson Mota (alisson.davidbeckam@gmail.com) on 2015-07-17T19:14:03Z No. of bitstreams: 1 Dissertação- Richardson Alves de Almeida.pdf: 16503565 bytes, checksum: ae56b25c886cb0202de3c9e6c34ca1bc (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-20T12:48:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação- Richardson Alves de Almeida.pdf: 16503565 bytes, checksum: ae56b25c886cb0202de3c9e6c34ca1bc (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-20T12:53:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação- Richardson Alves de Almeida.pdf: 16503565 bytes, checksum: ae56b25c886cb0202de3c9e6c34ca1bc (MD5) / Made available in DSpace on 2015-07-20T12:53:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação- Richardson Alves de Almeida.pdf: 16503565 bytes, checksum: ae56b25c886cb0202de3c9e6c34ca1bc (MD5) Previous issue date: 2011-03-30 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Amphibian skin secretions are rich sources of biologically active substances with various physiological functions and defense, most of low molecular weight, as biogenic amines, alkaloids, steroids, peptides and proteins of high molecular weight. The genus Hypsiboas, belonging to the family Hylidae from class of amphibians, presents as promissing supplier of peptides with biological potential. Peptides identified of species Hypsiboas are analogous to the known antimicrobial peptides. This work was realized a systematic study of the skin secretion of Hypsiboas cinerascens obtained by stimulation, where it was possible to identify a new peptide with wide antimicrobial activity, named cinerascetina. Its sequence was identified by techniques of high performance liquid chromatography (HPLC) and mass spectrometry (MALDI-TOFTOF) and confirmed by genetic sequencing, and was also possible identified six new peptides with possible antimicrobial activity. / Secreções de pele de anfíbios são fontes ricas de substâncias biologicamente ativas com diversas funções fisiológicas e de defesa, a maioria de baixa massa molecular como as aminas biogênicas, alcaloides, esteroides, peptídeos e proteínas de massa molecular elevada. O gênero Hypsiboas, pertencente à família Hylidae da classe dos anfíbios, apresenta-se como promissor fornecedor de peptídeos com potencial biológico. Peptídeos identificados de espécies de Hypsiboas apresentaram analógia a peptídeos antimicrobianos conhecidos. Neste trabalho foi realizado um estudo sistemático da secreção da cutânea de Hypsiboas cinerascens obtida por estimulação, onde foi possível identificar um novo peptídeo com ampla atividade antimicrobiana, o qual foi denominado de Cinerascetina. Sua sequência foi identificada por técnicas de cromatografia liquida de alta eficiência (CLAE) e espectrometria de massa (MALDITOF- TOF) e confirmada por técnica de sequenciamento genético, sendo que através desse estudo de sequenciamento genético, também foi possível identificar seis novos peptídeos com possível atividade antimicrobiana.

Orientador: Luciano Alves dos Anjos / Resumo: O presente estudo analisou a fauna parasitária de três espécies de anuros desde a fase larval até a adulta, Hypsiboas cinerascens, Hypsiboas geographicus e Rhinella marina da Reserva Florestal Ducke, Amazônia Central. A fauna de parasitas de anuros da região é pouco conhecida, sendo a fase larval a menos estudada. Os dados analisados durante os dois anos de coleta demonstraram que espécies parasitas diferem nas duas fases de vida dos anfíbios anuros. Foram analisados um total de 224 girinos, e 38 indivíduos adultos, em três áreas de amostragem diferentes: poças temporárias, poça permanente, e uma lagoa da reserva. Um total de 827 parasitas foi encontradonosgirinos, e 3.534 nos adultos. Nas fases larvais foram encontrados nematoidespertencentes à espécie Gyrinicola chabaudi, metacercárias de trematódeos de Diplostomídeos e protozoários do gênero Nyctotherus. Nos adultos, a riqueza parasitária foi maior: nestes foram encontrados nematoides, trematódeos, acantocéfalos, carrapatos e larvas de Diptera. As fases larvais das espécies de anuros aqui estudados, representam novos registros de hospedeiros para o nematoide Gyrinicola chabaudi, ampliando o conhecimento de sua distribuição geográfica. Com os dados obtidos, podemos compreender que a riqueza entre as duas fases de desenvolvimento dos anuros são bem distintas. Durante o processo de metamorfose até a fase adulta o animal transporta grupos de parasitas, conectando-os entre o ambiente aquático e o ambiente terrestre. Este traba... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre

Submitted by FRANCIELE CRISTINA DE SOUZA null (francielexingu@gmail.com) on 2017-04-24T18:57:03Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao_FRANCIELE_FINAL Unesp.pdf: 3022787 bytes, checksum: 6f9282ebb7236dffb5792ca794b069dd (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-04-26T13:57:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 souza_fc_me_bot.pdf: 3022787 bytes, checksum: 6f9282ebb7236dffb5792ca794b069dd (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-26T13:57:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 souza_fc_me_bot.pdf: 3022787 bytes, checksum: 6f9282ebb7236dffb5792ca794b069dd (MD5) Previous issue date: 2017-03-02 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas (FAPEAM) / O presente estudo analisou a fauna parasitária de três espécies de anuros desde a fase larval até a adulta, Hypsiboas cinerascens, Hypsiboas geographicus e Rhinella marina da Reserva Florestal Ducke, Amazônia Central. A fauna de parasitas de anuros da região é pouco conhecida, sendo a fase larval a menos estudada. Os dados analisados durante os dois anos de coleta demonstraram que espécies parasitas diferem nas duas fases de vida dos anfíbios anuros. Foram analisados um total de 224 girinos, e 38 indivíduos adultos, em três áreas de amostragem diferentes: poças temporárias, poça permanente, e uma lagoa da reserva. Um total de 827 parasitas foi encontradonosgirinos, e 3.534 nos adultos. Nas fases larvais foram encontrados nematoidespertencentes à espécie Gyrinicola chabaudi, metacercárias de trematódeos de Diplostomídeos e protozoários do gênero Nyctotherus. Nos adultos, a riqueza parasitária foi maior: nestes foram encontrados nematoides, trematódeos, acantocéfalos, carrapatos e larvas de Diptera. As fases larvais das espécies de anuros aqui estudados, representam novos registros de hospedeiros para o nematoide Gyrinicola chabaudi, ampliando o conhecimento de sua distribuição geográfica. Com os dados obtidos, podemos compreender que a riqueza entre as duas fases de desenvolvimento dos anuros são bem distintas. Durante o processo de metamorfose até a fase adulta o animal transporta grupos de parasitas, conectando-os entre o ambiente aquático e o ambiente terrestre. Este trabalho é o primeiro, até o momento, que descreve este tipo de interação na região, contribuindo assim com o aumento de registro de novas informações sobre estudos parasitológicos na Amazônia. / The present study analyzed the parasitic fauna of three species of anurans from the larval to adult phase, Hypsiboas cinerascens, Hypsiboas geographicus, and Rhinella marina of the Ducke Forest Reserve, Central Amazonia. The anurans parasitic’ fauna of the region is little known, being the larval stage less studied. The data analyzed during two years of collection showed that parasite species differ in two life stages of anuran amphibians.A total of 224 tadpoles, and 38 adult individuals, were analyzed in three different sampling areas, temporary pools, permanent pond, and one reserve pond. A total of 827 parasites were found in tadpoles, and 3,534 in adults. In the larval stages nematodes belonging to the species Gyrinicola chabaudi, metacercariae of trematodes of the family Diplostomidae, and protozoa of the genus Nyctotherus sp. In adults, parasite diversity was higher: in these were found nematodes, trematodes, acantocephalus, ticks, and larvae of Diptera. Larval phases of the anuran species studied here represent new host register for the Gyrinicola chabaudi nematode, increasing the knowledge of its geographical distribution.With obtained data we can understand that diversity and richness between the two stages of anuran development are very different. During the process of metamorphosis to adulthood the animal carries groups of parasites, connecting them between the aquatic environment and terrestrial environment. This work is the first, to date, which describes this type of interaction in the region, thus contributing to the increase in the registration of new information on parasitological studies in the Amazon.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-01-30T11:54:09Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação - Marcela Peixoto dos Santos - 2008.pdf: 1143917 bytes, checksum: 0046e36fdb0311b25939b8e28c2709e8 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-01-30T14:44:59Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação - Marcela Peixoto dos Santos - 2008.pdf: 1143917 bytes, checksum: 0046e36fdb0311b25939b8e28c2709e8 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-01-30T14:44:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação - Marcela Peixoto dos Santos - 2008.pdf: 1143917 bytes, checksum: 0046e36fdb0311b25939b8e28c2709e8 (MD5) Previous issue date: 2008-06-27 / (Sem resumo em outra língua) / O objetivo do presente trabalho foi responder questões relacionadas ao comportamento social e dinâmica populacional de Hypsiboas albopunctatus. O estudo foi realizado no Sítio Santa Terezinha, município de cocalzinho de Goiás, localizado no entorno do Distrito Federal leste do estado de Goiás, (15º47”40’ Sul; 48º46”33’ Leste; 1152m de altitude). As coletas foram realizadas de Outubro/2006 a março/2007. A atividade reprodutiva se estendeu de novembro a abril, estando restrita aos períodos de chuva, o que caracteriza a reprodução desta espécie como prolongada. Os sítios de vocalização incluíram galhos, folhas, solo, ramos de vegetação, troncos caídos. As fêmeas de H. albopunctatus foram maiores e mais pesadas que os machos. Não houve correlação significativa entre massa e CRC fé machos e fêmeas, a não ser os que foram encontrados em amplexo. Não houve diferença entre CRC e massa de machos solitários e em amplexo. O número de machos no agregado reprodutivo foi sempre maior do que o de fêmeas, o que resultou em valores baixos de RSO. Os machos defendem o território através de interações acústicas, e não foi observado comportamento agressivo nem combates físicos. A altura média ocupada nos sítios de vocalização foi de 34 cm em relação ao solo e de 42,7 cm em relação à água. Os indivíduos se distribuem de maneira uniforme no coro, sendo a distância média entre os indivíduos de 1,04 m. O comportamento satélite foi observado três vezes, e aparentemente não exerce influência no comportamento social da população em estudo. O amplexo é axilar e pode durar a noite toda, ocorrendo a oviposição no início da manhã.

Fundação de Amparo a Pesquisa no Estado do Rio Grande do Sul / On the last decades, amphibian populations have been suffering a global decline, and different factors can be related to this process. Parallel observations between the decrease of stratospheric ozone concentration in the late 1970s and amphibian decline in early 1980s aroused interest to study the possible association among increased incidence of ultraviolet radiation (UV) and amphibian decline. The UV radiation has important biological impact on living organisms due to their ability to induce lesions in the DNA molecule, which may result in the induction of mutations or cell death. Photoreactivation is an important DNA repair mechanism that promotes the reversal of UV-induced DNA damage by photolyase enzymes after the absorption of UVA and visible light photons. In this study, we evaluated the biolocial effects of UVB and UVA through morphological, histological, locomotor and survival of Hypsiboas pulchellus (Anura: Hylidae) tadpoles. Tadpoles kept in the laboratory were submitted to acute and chronic treatments, composed of different doses of UVB and UVA exposures. The results of survival curves indicate that the H. pulchellus is very sensitive to UVB radiation comparative to UVA. However, despite the high tadpole survival after UVA, they showed serious malformations after metamorphosis. Tadpoles body weight also suffered influence of different UV radiation doses, however the body length was bit affected. The locomotor capacity (horizontal and vertical speed) of UVB-exposed tadpoles has been significantly changed. In addition, UVB radiation had severe impact on the skin (stratum corneum) and mouth (rows of teeth and jaw sheaths) keratin structures of tadpoles, indicating that these should be important impacts of solar UV radiation in reducing the performance of these organisms. In parallel, it was also possible to observe the extreme importance of activation of photolyases for the repair of DNA damage after treatment with UVB but not UVA. Therefore, in this study, we present a wide characterization of the biological effects of solar UVB and UVA on the performance of H. pulchellus tadpoles. / Durante as últimas décadas, as populações de anfíbios vêm sofrendo um declínio generalizado e diferentes fatores são sugeridos como responsáveis por esse efeito. Observações paralelas entre o rápido decréscimo da concentração do ozônio estratosférico no final da década de 1970, com o declínio de anfíbios no início da década de 1980, despertaram grande interesse para se estudar as possíveis associações entre o aumento da incidência de radiação ultravioleta (UV) na superfície e a redução do número de espécies de anfíbios. Sabe-se que a radiação UV solar tem importante impacto biológico na vida dos organismos devido a sua grande capacidade de induzir lesões na molécula de DNA, que podem levar a indução de mutações ou morte celular. Um dos principais mecanismos de reparo de DNA é a fotorreativação que ocorre por meio das enzimas fotoliases, as quais promovem reversão dessas lesões ao absorver fótons de luz UVA e luz visível. Neste projeto, avaliou-se a ação biológica da radiação UVB e UVA a partir de dados morfológicos, histológicos, locomotores e de sobrevivência de girinos da espécie Hypsiboas pulchellus (Anura: Hylidae). Girinos coletados e mantidos no laboratório foram submetidos a tratamentos agudos e crônicos, compostos por exposições a diferentes doses de luz UVB e UVA. Os resultados de sobrevivência indicam que os girinos de H. pulchellus são muito sensíveis à radiação UVB em relação à UVA. Entretanto, apesar da alta sobrevivência dos indivíduos submetidos à radiação UVA, estes apresentaram sérias malformações em longo prazo. A massa corporal dos girinos também sofreu influência das diferentes doses de radiação UV aplicadas, entretanto o comprimento total foi pouco influenciado. A capacidade locomotora (vertical e horizontal) dos organismos expostos à luz UV foi bastante alterada, onde se destaca a grave redução da atividade locomotora dos indivíduos tratados com radiação UVB. Adicionalmente, a radiação UVB teve impacto severo nas estruturas de queratina da pele (estrato córneo) e da boca (queratodontes e mandíbula) dos girinos, indicando que esses devem ser impactos principais da radiação UV solar na redução da performance desses organismos. Em paralelo, também foi possível observar a extrema importância da ativação das enzimas fotoliases para a reparação dos danos de DNA, assim como os seus efeitos após os tratamentos com radiação UVB, mas não com UVA. Portanto, no presente trabalho, foi possível apresentar uma ampla caracterização dos efeitos biológicos da radiação UVB e UVA solar na performance de girinos de H. pulchellus.

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:12:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Quimica Eliane S F Alves.pdf: 4161656 bytes, checksum: 36361e76b0e7ad73aea61043645102f1 (MD5) Previous issue date: 2012-02-24 / Currently, the emergence of fungi, bacteria and viruses resistant to multiple drugs has stimulated interest in the development of antimicrobial peptides with increased therapeutic potential. They generally have properties of extreme importance as antimicrobial selective toxicity, rapid action, specific mechanisms of action and a broad spectrum of antimicrobial action. Many of these features can be found in peptides isolated from frog skin secretions. The main factor that differentiates antimicrobial peptides from other commonly antibiotics used in the conventional therapy is related to their mechanism of action. The driving force for much of the action of antimicrobial peptides is their ability to lysis cell membranes, rapidly killing a broad spectrum of microorganisms. Accordingly, the conformation of the peptide has a great importance in their interaction with the amphiphilic structure of biological membranes. The determination of the tridimensional structure by Nuclear Magnetic Resonance (NMR) technique allows the identification of the spatial position of each amino acid residue and highlighting those that are important for its action and, therefore, could be modified to increase the antimicrobial activity. The study of the three-dimensional structure of peptides in solution is an advantage of the NMR spectroscopy, since it can simulate the physiological environment, by means of surfactants. In this context, the tridimensional structures of two synthetic peptides: ocellatin-P1G16 (GLLDTLKGAAKNVVGGLASKVMEKL-NH2), isolated from the amphibians Leptodactylus labyrinthicus, and hylin a1 (IFGAILPLALGALKNLIK-NH2), isolated from Hypsiboas Albopunctatus, were proposed by NMR. The amphipathic caracter can be visualized by separation of the helix into two distinct sides, one hydrophobic (nonpolar) and the other hydrophilic (polar). The peptide hylin a1 in presence of SDS-d25 showed helical structure between residues Ile-5 to Ile-17 and the peptide ocellatin-P1G16 in SDS-d25 micelles showed a α-helical structure between residues Leu-3 to Lys-24, both are presented in amphipathic α-helix Finally, the molecular analyses of amphipathicity, electrostatic interaction, polarity and exchange hydrogen/deuterium, corroborate the proposed model, suggesting a model of parallel orientation to the peptide hylin a1 and the peptide ocellatin-P1G16 a parallel orientation, but with the cterminal portion immersed in the micelle SDS-d25 between residues Ser-19 to Leu-25, as observed by analyzing exchange hydrogen/deuterium. These structural characteristics make these peptides promising candidates for the development of a new antimicrobial drug. / Atualmente o surgimento de fungos, bactérias e vírus resistentes a múltiplos fármacos tem estimulado o interesse pelo desenvolvimento de peptídeos antimicrobianos com maior potencial terapêutico. Eles em geral possuem propriedades de extrema importância como um amplo espetro ação antimicrobiana, toxicidade seletiva, ação rápida e mecanismos de ação específicos. Muitas dessas características podem ser encontradas em peptídeos isolados da secreção cutânea de anuros. O principal fator que diferencia peptídeos antimicrobianos de antibióticos utilizados na terapia convencional está relacionado com o seu mecanismo de ação. A força motriz para a ação de grande parte de peptídeos antimicrobianos é sua habilidade em provocar lise em membranas celulares, matando rapidamente um amplo espectro de microorganismos. Nesse sentido, a conformação do peptídeo tem uma grande importância em sua interação com a estrutura anfifílica das membranas biológicas. Nesse contexto, a determinação da estrutura tridimensional por meio da espectroscopia de Ressonância Magnética Nuclear (RMN) possibilita a identificação da posição espacial de cada resíduo de aminoácido na estrutura terciaria, destacando aqueles que são importantes para a sua ação e que, portanto, poderiam ser modificados para aumentar a atividade antimicrobiana. O estudo da estrutura 3D dos peptídeos em soluçao é uma vantagem da espectroscopia de RMN, pois se consegue simular o ambiente fisiológico por meio de sulfactantes. Nesse contexto, determinou-se através da RMN a estrutura tridimensional de dois peptídeos sintéticos: ocellatina-P1G16 (GLLDTLKGAAKNVVGGLASKVMEKL-NH2) isolado dos anfíbios Leptodactylus labyrinthicus, e o peptídeo hilina a1 (IFGAILPLALGALKNLIKNH2), isolado do anfíbio Hypsiboas albopunctatus. A anfipaticidade da estrutura pode ser observada pela separação da estrutura em duas faces distintas, uma hidrofobica (apolar) e outra hidrofilica (polar). O peptídeo hilina a1, em presença de SDS-d25, apresentou estrutura helicoidal entre os resíduos Ile-5 a Ile-17 e o peptídeo ocellatina-P1G16, em presença de SDS-d25, apresentou estrutura em α-hélice entre os resíduos Leu-3 a Lys-24, ambos em α-hélice anfipática. Por fim, as análises moleculares de anfipaticidade, interação eletrostática, polaridade e troca H2O/D2O, apontaram a mesma face de interação dos peptídeos com a membrana, propondo um modelo de orientação paralela para o peptídeo hilina a1 e para o peptídeo ocellatina- P1G16 uma orientação paralela, porém com a porção c-terminal mergulhada na micela de SDS-d25 entre os resíduos Ser-19 e Leu-25. Tais características estruturais tornam esses peptídeos candidatos promissores para o desenvolvimento de um novo fármaco antimicrobiano.

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-10-17T20:27:19Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ivan Borel Amaral - 2009.pdf: 844143 bytes, checksum: 1036d666696f26300e191f6b1659eb02 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2014-10-17T20:43:51Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ivan Borel Amaral - 2009.pdf: 844143 bytes, checksum: 1036d666696f26300e191f6b1659eb02 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-17T20:43:51Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ivan Borel Amaral - 2009.pdf: 844143 bytes, checksum: 1036d666696f26300e191f6b1659eb02 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2009-09-28 / In recent years, population declines of amphibians have been observed in different parts of the world. The process of fragmentation and destruction of habitats is considered the most threat to this diversity. Urbanization reduces species richness at assemblage of amphibian reproduction. Due to amphibians require a modest area for survival, some species can thrive in urban fragments. But small population sizes and isolation can cause the loss of genetic diversity and the extinction local. The advertisement calls are the most common vocalizations in anurans that primarily have the function to attract females and secondarily, serve to mediate aggressive interactions between males. For many species, individual reproductive success is directly proportional to the effort put in the corner. The variation between populations may be related to local adaptation, resource availability and reduced gene flow. This study aimed to test the following hypotheses: ( 1 ) Due to the effects of fragmentation and habitat destruction and urbanization , population sizes of Hypsiboas albopunctatus urban parks are smaller than the population size of rural populations , (2 ) There are differences morphometric H. albopunctatus between rural and urban environments , and ( 3 ) Due to the change of social structure as a function of fragmentation and influence of urban noise , there are differences in vocalizations of H. albopunctatus between rural and urban environments . The H. albopunctatus populations of urban and rural environments differ in population size , the body size and characteristics of the advertisement call. Urban populations were smaller than those of the rural environment. The results showed that populations are lower in smaller and changed urban fragments . Urban populations had a lower repetition rate of notes compared to rural environment . This fact may be related mainly to reduced population sizes and consequent behavioral change and structure of choirs of urban environments. It is unreasonable to reject the hypothesis that the sounds of car engines may influence the acoustic parameters of the corners of H. albopunctatus in urban environment. The population of H. albopunctatus Zoo vocalised in higher frequency bands and acoustic variable that is inversely related to body size of individuals as in other anurans. The population of this fragment was the one that differed from all others in both acoustic as morphometric characteristics. These results support the hypothesis that there are differences in the characteristics of the advertisement calls of Hypsiboas albopunctatus between rural and urban environments. The population of P. M. Jardim Botânico was the most distanced itself from the other urban populations in both acoustic and morphometric characteristics as the population size. This population was the most resembled the population characteristics of the rural environment. A same species of amphibian populations may have considerably differences in population structure, morphological and behavioral characteristics due to the fact that some are under the influence of the urban environment and other rural environment. The planning for the conservation of such populations requires more refined analysis that takes into account the aspects of ecological, behavioral and adaptive responses of this species in their specific environment. / Nos últimos anos, declínios populacionais de anfíbios têm sido observados em diversas partes do mundo. O processo de fragmentação e destruição de habitats é considerado uma das maiores ameaça a essa diversidade. A urbanização reduz a riqueza de espécies em assembleias de áreas de reprodução de anfíbios. Contudo, porque os anfíbios requerem uma área modesta para sua sobrevivência, algumas espécies podem ter sucesso em fragmentos urbanos. Mas, devido aos pequenos tamanhos populacionais e ao isolamento, sofrem perda de diversidade genética, podendo extinguir-se localmente. Os cantos de anúncio são as vocalizações mais comuns em anuros que, primariamente, têm a função de atrair as fêmeas e secundariamente servem para mediar interações agressivas entre os machos. Para muitas espécies, o sucesso reprodutivo individual é diretamente proporcional ao esforço empregado no canto. A variação entre populações pode estar relacionada com a adaptação local, a disponibilidade de recursos e a redução do fluxo gênico. Este trabalho teve por objetivo testar as seguintes hipóteses: (1) Devido aos efeitos da fragmentação e destruição de habitat e da urbanização, os tamanhos populacionais de Hypsiboas albopunctatus dos parques urbanos são menores que os tamanhos populacionais das populações rurais; (2) Há diferenças morfométricas de H. albopunctatus entre os ambientes rurais e os ambientes urbanos; e (3) Devido à alteração da estrutura social em função da fragmentação e influência de ruídos urbanos, há diferenças nas vocalizações de anúncio de H. albopunctatus entre os ambientes rurais e os ambientes urbanos. As populações de H. albopunctatus de ambientes urbanos e rurais diferiram nos tamanhos populacionais, nos tamanhos corporais e nas características do canto de anúncio. As populações urbanas foram menores que as do ambiente rural. Os resultados demonstraram que as populações são menores nos fragmentos urbanos menores e mais alterados. As populações urbanas apresentaram uma menor taxa de repetição de notas comparado ao ambiente rural. Esse fato pode estar relacionado principalmente com os tamanhos populacionais reduzidos e a consequente alteração comportamental e de estrutura dos coros dos ambientes urbanos. Não é razoável descartar a hipótese de que os sons de motores de veículos possam influenciar nos parâmetros acústicos dos cantos de H. albopunctatus no ambiente urbano. A população de H. albopunctatus do Jardim Zoológico vocalizou em faixas de frequências mais altas e essa variável acústica está inversamente relacionada com o tamanho corporal dos indivíduos como em outros anuros. A população desse fragmento foi a que mais se diferenciou de todas as outras, tanto nas características acústicas quanto morfométricas. Esses resultados corroboram a hipótese de que há diferenças nas características de cantos de anúncio de Hypsiboas albopunctatus entre os ambientes rurais e urbanos. A população do P. M. Jardim Botânico foi a que mais se distanciou das outras populações urbanas tanto nas características acústicas e morfométricas quanto no tamanho populacional. Esta população foi a que mais se assemelhou às populações do ambiente rural. Uma mesma espécie de anfíbio pode possuir populações que diferem consideravelmente em estrutura populacional, características morfológicas e comportamentais devido ao fato de algumas estarem sob a influência de ambiente urbano e outras de ambiente rural. O planejamento para a conservação de tais populações requer análises mais refinadas que levem em conta os aspectos de respostas ecológicas, comportamentais e adaptativas dessa espécie a seu determinado meio.