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Mise en évidence et caractérisation de nouveaux gènes impliqués dans les ciliopathies rénales / Characterization of new genes involved in renal ciliopathies

Failler, Marion 18 September 2015 (has links)
Résumé confidentiel / Confidential abstract
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Mise en évidence et caractérisation de nouveaux gènes impliqués dans les ciliopathies rénales / Characterization of new genes involved in renal ciliopathies

Failler, Marion 18 September 2015 (has links)
Résumé confidentiel / Confidential abstract
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Mise en évidence et caractérisation de nouveaux gènes impliqués dans les ciliopathies rénales / Characterization of new genes involved in renal ciliopathies

Failler, Marion 18 September 2015 (has links)
Le cil primaire est une antenne sensorielle présente à la surface de la plupart des cellules qui contrôle des voies de signalisation clés au cours du développement et de l’homéostasie tissulaire. Des défauts de formation ou de fonctionnement des cils sont responsables de maladies génétiques complexes appelées ciliopathies. La néphronophtise (NPH) est une ciliopathie caractérisée par une néphropathie tubulo-interstitielle chronique évoluant généralement vers l’insuffisance rénale terminale (IRT) avant l’âge adulte. La NPH peut être isolée ou associée à des signes extra-rénaux tels que la rétinite pigmentaire et des défauts du squelette permettant de définir des syndromes comme celui de Saldino-Mainzer (MZSDS). La NPH est une maladie à transmission autosomique récessive très hétérogène sur le plan génétique et les protéines codées par les gènes identifiés ont quasiment toutes été impliquées dans des fonctions ciliaires. Le séquençage d’exome de patients, ciblant plus de 1300 gènes ciliaires (ciliome), a permis de mettre en évidence des mutations dans deux nouveaux gènes candidats pour la NPH : CEP83 et TEKT1. Mon travail de thèse a consisté à caractériser l’effet des mutations et à valider leur implication dans les phénotypes des patients. CEP83 a été retrouvé muté chez plusieurs patients non-apparentés présentant une NPH avec IRT précoce (< 5 ans). CEP83 est un composant des appendices distaux du centriole père qui joue un rôle clé dans les étapes précoces de la formation du cil. J’ai montré que les mutations identifiées entraînaient une désorganisation des appendices distaux qui pourrait expliquer les défauts de ciliogénèse observés dans les fibroblastes et les biopsies rénales de patients. Ces résultats ont permis de démontrer l’implication d’une nouvelle protéine centriolaire dans la physiopathologie des formes sévères de NPH. TEKT1 présente des mutations hétérozygotes composites chez un patient ayant un tableau clinique complexe associant un MZSDS et une dyskinésie ciliaire primitive (PCD) due à des défauts de cils motiles. Une analyse génétique détaillée a mis en évidence des mutations sévères dans un second gène, WDR19, déjà caractérisé dans les formes de NPH associées à des défauts osseux. TEKT1 code la protéine Tektine-1, un membre encore non caractérisé de la famille des tektines impliquées dans les cils motiles. L’analyse de cellules nasales multiciliées a montré que Tektine-1 était localisée le long de l’axoneme des cils motiles contrôles et absent des cils des cellules du patient qui présentaient aussi des anomalies sévères de battement. En parallèle, des défauts de ciliogénèse, typiques de mutations de WDR19, ont été observés dans les fibroblastes du patient. Ces résultats suggèrent que ce phénotype complexe est dû aux effets complémentaires des mutations des deux gènes TEKT1 et WDR19, responsables des défauts dans les cils motiles et primaires, respectivement. / The primary cilium is a sensory antenna present on the surface of most of the cells. It controls key signaling pathways during development and tissue homeostasis. Defects in cilia growth or activity are responsible for complex genetic diseases called ciliopathies. Nephronophthisis (NPH) is a ciliopathy characterized by chronic tubulointerstitial nephritis which usually progresses to end-stage renal disease (ESRD) before adulthood. NPH may be isolated or associated with extra-renal defects such as retinitis pigmentosa and skeleton involvement. The combination of these symptoms defines syndromes such as Saldino-Mainzer (MZSDS). NPH is an autosomal recessive disorder highly genetically heterogeneous and almost all of proteins encoded by the identified genes have been involved in ciliary function. The exome sequencing in patients, targeting up to 1300 ciliary genes (ciliome), highlighted new mutations in 2 NPH candidate genes: CEP83 and TEKT1. My work was to characterize the effects of the mutations and validate their involvement in patient phenotypes. CEP83 was found mutated in several unrelated patients with early-onset of NPH (IRT<5 years). CEP83 is a component of distal appendages on the mother centriole which play a crucial role in the early steps of cilia formation. I have shown that the identified mutations perturbed the distal appendages formation which might explain the defects in ciliogenesis observed in fibroblasts and kidney biopsies from patients. These results have demonstrated the involvement of a new centriolar protein in the pathophysiology of NPH severe forms. TEKT1 presents compound heterozygous mutations in a patient with a complex phenotype combining a MZSDS and primary ciliary dyskinesia (PCD) due to defects in motile cilia. The genetic analysis showed mutations in a second gene, WDR19, already characterized in NPH associated with bone defects. TEKT1 encodes the Tektin-1 protein, an uncharacterized member of the tektin family involved in motile cilia. The nasal multiciliated cells analysis showed that Tektin-1 was localized along the axoneme of control motile cilia and absent from the cilia in patient cells, which also had severe beating impairment. In parallel, defects in ciliogenesis, typical of WDR19 mutations, were observed in the fibroblasts from the patient. These results suggest that this dual ciliary phenotype is rather due to the additional effect of mutations in both TEKT1 and WDR19, responsible for the defects in motile and primary cilia, respectively.
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Caractérisation et rôle des cils primaires de l'épididyme dans la voie de signalisation Hedgehog

Bernet, Agathe 27 September 2018 (has links)
Les cils primaires (CP) sont des antennes de signalisation présentes en un seul exemplaire à la surface de la plupart des cellules. Ils jouent un rôle de mécano/chimio-senseur pour le développement et le maintien de l’homéostasie des tissus, en réponse aux stimuli et à la voie de signalisation Hedgehog (Hh). En 2013, l’ultrastructure des CP a été mise en évidence au niveau de l’épithélium épididymaire d’équidés. L’épididyme, organe du système reproducteur masculin, est composé d’un épithélium pseudo-stratifié qui se différencie au cours du développement postnatal jusqu’à la maturité sexuelle. Les principaux types cellulaires qui composent cet organe au stade adulte, assurent des rôles distincts et bien orchestrés afin de contrôler la composition du micro environnement spermatique. Bien que la mutation de gènes codants pour les constituants majeurs des CP entraine une infertilité masculine, peu de choses sont connues concernant leur rôle au niveau du système reproducteur. Nous émettons donc l’hypothèse que les CP de l’épididyme joueraient un rôle dans le contrôle des fonctions épididymaires. Nos objectifs se définissent en deux points 1) la caractérisation spatiotemporelle de cette organelle le long de l’épididyme, 2) l’étude fonctionnelle des CP de l’épididyme dans la voie de signalisation Hh. Grâce à une souris double transgénique Ar13b/mCherry- EGFP/CETN2, nous avons révélé une évolution spatio-temporelle des CP au cours du développement postnatal. En effet, à la naissance, les CP sont localisés au pôle apical des cellules épithéliales alors que chez l’adulte, les CP sont exclusivement associés aux cellules basales cytokératine-V positives. De plus, par une approche pharmacologique nous avons évalué l’implication des CP de l’épididyme murin dans la voie de signalisation Hh. Bien que les fonctions des CP, au niveau de l’épididyme, restent à déterminer, notre étude préliminaire ouvre la porte à une meilleure compréhension du contrôle et maintien des fonctions épididymaires et de la fertilité masculine. / Primary cilia (PC) are signaling antennas present in a single copy on the surface of most cells. They play a mechano / chemo-sensory role for the development and maintenance of tissue homeostasis, in response to extracellular stimuli. In 2013, the ultrastructure of PC was demonstrated in equine epididymal epithelium. The epididymis, an organ of the male reproductive system, is composed of a pseudo-stratified epithelium that differentiates during postnatal development until puberty. The different cell types populating this epithelium control discrete and well-orchestrated role in order to monitor the composition of the spermatic microenvironment. Although the mutation of genes coding for the major constituents of PC leads to male infertility, little is known regarding their role in the male reproductive system. Our hypothesis is that PC play a role in the control of the functions important to epididymis development and homeostasis. Our objectives are defined in two points: 1) to define the spatio-temporal localization of this organelle along the epididymis, and 2) to determine the function of PC in the transduction of the Hh signaling pathway, which is known to be important for proper sperm maturation. Using an Arl13b / mCherry- Cetn2 / GFP transgenic mouse model, we revealed for the first time a spatio-temporal change of PC cell-specificity during epididymis postnatal development, from birth to adulthood. After birth, PC are localized at the apical pole of undifferentiated cells whereas in the adult, elongated PC are exclusively associated with cytokeratin-V positive basal cells. In addition, we evaluated the involvement of epididymal PC in the transduction of the Hh signaling pathway through a pharmacological approach. Although the functions of PC in the epididymis remains to be determined, our preliminary in vitro studies open the door to a better understanding of the control and maintenance of epididymal functions and male fertility.
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Fonctions biologiques et intégration des signaux BMP, FGF, Nodal et Notch au cours de la différenciation et la morphogenèse de l'embryon de xénope / Biological functions and intergration of BMP, FGF, Nodal and Notch signals durinf differentiation and morphogenesis of the xenopus embryo

Luxardi, Guillaume 03 December 2010 (has links)
Mon travail de thèse a été principalement de comprendre comment les voies de signalisations contrôlent la différenciation et la morphogenèse de l'embryon de vertébré. Les communications entre cellules sont à la base du développement des métazoaires et de leurs évolutions et sont souvent impliquées dans les pathologies humaines. J'ai profité de la puissance des approches fonctionnelles chez le xenope pour essayer de comprendre comment les signaux BMP, FGF, Nodal et Notch sont intégrés dans le temps et l'espace afin de coordonnées différentes décisions cellulaires. Premièrement, nous avons montré que la voie Nodal est active avant la transition mid-blastuléene et permet l'induction du mesedoderme à travers l'auto régulation de l'expression de ces ligands Xnr5 et Xnr6 (Skirkanish et al. soumis à Development). Deuxièmement, j'ai montré que différent ligand de la voie Nodal contrôlent séquentiellement l'induction du mesendoderm et les mouvements de gastrulation (Luxardi et al., Development, 2010). Troisièmement, j'ai montré qu'un cinquième ligand de la voie Nodal, Xnr4, contrôle la régionalisation médio latérale de la plaque neurale ouverte et la neurogenèse. Quatrièmement, nous avons montré qu'une famille de microARN, nir449, contrôle la différenciation des cellules multi-ciliées à travers son action sur un ligand de la voie Notch, Delta-1 (Marcet et al. Nature Cell Biology, en révision). Enfin, j'ai découvert une nouvelle fonction des signaux BMP dans le control de la spécification des épithéliums muco cilié. / My PhD work generally addressed how signaling pathways control differentiation and morphogenesis in the vertebrate embryo. intercellular communication is the basis of metazoan development and evolution and is often involved in human pathologies. I take advantage of the power of functional approaches in the Xenopus embryo, to try and understand how BMP, FGF, Nodal and Notch signals are intragrated in time ans space to coordinate vatious cellular decisions. First, we showed that Nodal signaling is activated before the mid blastula transition and allow mesendoderm induction through the auro regulation of the expression of its ligands Xnr5 and Xnr6 (Skirkanish et al., submitted to development). Second, I have demonstrated that in a gastrulation movements (Luxardi et al., Development, 2010). Third, I have demonstrated that a fifth Nodal ligand, Xnr4, control medio-lateral patterning of the open neural plate and neurogenesis. Froth, we showed that a microRNA family, mir449, controls differenciation of multiciliated cells through the regulation of the Notch ligand Delta-1 (Marcet et al. Nature Cell Biology, in revision). Last, I have discovered a novel function of the BMP pathway in the control of cell type specification within the epidermal mucocialiary epithelium
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Caractérisation fonctionnelle de deux nouveaux gènes ciliaires pendant le développement des vertébrés / Functional characterization of two new ciliary genes during the development of vertebrate

Jerber, Julie 19 March 2014 (has links)
Les cils et les flagelles sont des organites cellulaires très conservés qui assurent des fonctions essentielles. Chez l'Homme, les défauts d'assemblage des cils et des flagelles conduisent à de multiples pathologies, les ciliopathies. Afin de comprendre comment se forment et fonctionnent les cils, j'ai analysé la fonction de deux nouveaux gènes identifiés comme cible des facteurs de transcription de ciliogenèse RFX. Tout d'abord je me suis focalisée sur le gène CCDC151, évolutivement conservé dans les espèces possédant des cils motiles. J'ai pu montrer que CCDC151 est impliquée dans le transport dépendant de l'IFT des bras de dynéine chez les animaux et qu'elle est nécessaire à la perception sensorielle chez la drosophile. Par ailleurs, j'ai également montré que cette protéine possède des fonctions cellulaires additionnelles puisqu'elle est requise pour l'orientation correcte des plans de division cellulaire et qu'elle est impliquée dans la régulation de la taille du cil primaire chez les mammifères. Je me suis ensuite intéressée au gène LRRC48 également conservée dans les espèces possédant des cils motiles. Cette protéine est nécessaire à la motilité des flagelles de spermatozoïdes et des cils des neurones sensoriels en 9+0 et dans la réponse auditive chez la drosophile. De plus LRRC48 est indispensable au développement des vertébrés puisque son absence chez le poisson zèbre conduit à l'hydrocéphalie, des kystes rénaux et des défauts de motilité des cils. Elle est également essentielle à la biogenèse de l'oreille dans cet organisme.En conclusion, il s'agit de deux nouveaux acteurs de la ciliogenèse potentiellement impliqués dans les pathologies ciliaires chez l'Homme / Cilia are highly conserved structures found from protozoa to mammals where they play essential physiological and developmental functions and cilia dysfunction leads to various syndromes in humans known as ciliopathies. To understand cilia formation and function, I performed functional analysis of two new target genes of the RFX ciliogenic transcription factors. First, I focused on CCDC151 that is evolutionary conserved in motile ciliated species. I showed that CCDC151 is involved in the control of IFT-dependent dynein arm assembly in animals and required for geotaxis behavior of adult flies. In zebrafish, depletion of Ccdc151 leads to left-right asymmetry defects and kidney cysts, two phenotypes resulting from impaired ciliary beating. However, I also showed that CCDC151 is also implicated in other cellular functions in vertebrates as it is involved in proper orientation of cell divisions and implicated in the regulation of primary cilium length in mammalian cells. In a second part, I studied LRRC48 that is also conserved in species with motile cilia. I showed that this protein is essential for motility of flagellar spermatozoids and for motility of the 9+0 sensory cilia as well as in the auditory response in drosophila. In zebrafish, morpholinos induced depletion of this protein leads to hydrocephaly, kidney cysts, inner ear abnormalities and cilia motility defects. Moreover this protein is also required for inner ear biogenesis in the model. In conclusion, these two genes are essential for ciliogenesis and they are new candidate genes potentially implicated in human ciliary diseases
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Étude de la fonction de la protéine Bug22p dans différents organismes / Study of Bug22p protein in different organisms

Laligné, Chloé 29 September 2011 (has links)
Les cils sont des organites très conservés au cours de l’évolution des eucaryotes et présents à la surface de presque tous les types cellulaires. Ils sont constitués d’une structure microtubulaire, l’axonème, entourée d’une membrane en continuité avec la membrane plasmique. Ils sont nucléés par un corps basal, centriole ancré à la surface cellulaire. Grâce aux nombreux récepteurs qu’ils concentrent à leur membrane, tous les cils sont des senseurs de leur environnement. Ils peuvent aussi être motiles et assurer, par leur battement coordonné, le déplacement relatif de la cellule et du fluide environnant. Tandis que cil et structure centriolaire, hérités du premier eucaryote, ont été perdus par certains champignons et par les plantes supérieures, certains gènes codant des protéines ciliaires et centriolaires sont pourtant retrouvés dans le génome de ces espèces. Cette conservation de protéines sans l’organite suggère soit que ces protéines interviennent dans un même processus moléculaire utilisé dans plusieurs organites, soit qu’elles jouent des rôles dans des processus moléculaires distincts via leur interaction avec différents types de partenaires.J’ai choisi d’étudier l’une de ces protéines ciliaires et centriolaires, Bug22p, hautement conservée en séquence protéique entre l'homme et la paramécie, mais également présente chez les plantes supérieures. J’ai mené cette étude principalement sur la paramécie, système modèle pour la biogénèse des corps basaux et des cils, mais aussi sur des cellules de mammifère et de végétaux supérieurs. Si Bug22p est impliquée dans la détermination du battement ciliaire chez la paramécie, elle se localise également dans des cils immotiles de cellules de mammifère suggérant que son activité ciliaire n’est pas réduite à cette seule fonction. Des expériences d’inactivation génique suggèrent par ailleurs un lien entre l’activité de Bug22p et la polyglycylation. Sa surexpression dans les cellules de mammifère en culture entraîne l’apparition d’extensions cellulaires et une augmentation des réseaux de tubulines acétylées probablement associées à une stabilisation des microtubules. L'ensemble de mes résultats suggère donc un rôle de Bug22p dans la régulation de modifications post-traductionnelles. En plus d’être présente dans les structures ciliaires, Bug22p se localise aussi bien dans les noyaux de la paramécie que dans ceux des cellules humaines et des plantes supérieures Arabidopsis et Nicotiana. Ces observations ouvrent un nouveau champ d’études. En effet, si l’on sait que les tubulines ciliaires sont soumises à différentes modifications post-traductionnelles telles que polyglycylation ou acétylation, ce type de modifications touchent également des protéines nucléaires régulant ainsi le trafic de protéines nucléaires ou l’expression génique. Nous pouvons donc avancer l’hypothèse selon laquelle Bug22p agirait sur la régulation de ces modifications dans le cil et dans le noyau. Il serait donc intéressant de caractériser les modifications post-traductionnelles chez les plantes supérieures afin de vérifier une possible implication de Bug22p dans leur régulation et donc comprendre les raisons de sa conservation chez les végétaux. / Cilia, organelles that have been conserved throughout the evolution of eukaryotes, are found at the surface of most cell types. They are composed of a microtubular structure, the axoneme, surrounded by a membrane continuous to the plasma membrane. Cilia are nucleated by basal body, which is a centriole anchored to the cell surface. Cilia are environmental sensors concentrated in the ciliary membrane. Cilia can be motile and ensure the relative movement of the cell with respect to the surrounding fluid by their coordinated beating. While cilia and centriolar structures inherited from the first eukaryote have been lost by certain fungi and higher plants, certain genes encoding ciliary and centriolar proteins are found in the genomes of organisms lacking these structures. The conservation of these proteins without organelle suggests that these proteins are involved in the same molecular process into different organelles or proteins are involved into different processes through some interactions with different partners.I chose to study the ciliary and centriolar protein, Bug22p, highly conserved between human and Paramecium proteins sequences, and also present in higher plants. My work addressed this study primarily on Paramecium, a model system for biogenesis of basal bodies and cilia, and I also pursued investigation of mammalian cells and higher plants. I was able to show that Bug22p is necessary for efficient Paramecium ciliary beating, but I also localized in the immotile cilia of mammalian cells suggesting that Bug22p is not only restricted to the motile ciliary function. By knockdown experiments in Paramecium, I obtained evidence that Bug22p is involved in polyglycylation. Bug22p overexpression in mammalian cells led to the appearance of cell extensions and increased acetylated tubulin networks consistent with microtubule stabilization. My results suggest that Bug22p may regulate post-translational proteins modifications.Bug22p is also localized in the nuclei of Paramecium, human and higher plants such as Arabidopsis and Nicotiana. These observations open a new field of study. The axoneme microtubules are highly modified by post-translational modifications such as acetylation and polyglycylation; we know that in the nucleus, theses modifications are involved in the control of nuclear trafficking of some proteins and the regulation of gene expression. We can therefore speculate that Bug22p acts on the regulation of these changes in the cilium and in the nucleus. Finally, it would be interesting to characterize the post-translational modifications in higher plants to verify the possible involvement of Bug22p in their regulation and thus understand the meaning of its conservation in higher plants lacking cilia.
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Battement de flagelles artificiels : Dynamique individuelle et collective

Coq, Naïs 19 November 2010 (has links) (PDF)
Ce travail porte sur trois problèmes d'hydrodynamique à petite échelle, dans lesquels des structures déformables interagissent avec un fluide visqueux. Ces structures sont des filaments flexibles, inspirés des flagelles biologiques. Dans chaque cas, une étude expérimentale quantitative est associée à un modèle théorique minimal afin de saisir l'essentiel de la physique mise en jeu. Le premier système est un filament élastique macroscopique, entraîné en rotation. Lorsque la fréquence augmente, le filament subit une transition d'un état peu déformé à un profil hélicoïdal. Selon les conditions d'ancrage, cette transition de forme peut être associée à une branche instable dans la relation force/couple. Le second système est constitué de microcils artificiels, obtenus par auto-assemblage de colloïdes superparamagnétiques. Nous avons étudié la dynamique individuelle et collective de ces microcils actionnables. Nous présentons leur fabrication et leur organisation en réseaux de géométrie contrôlée, dans des canaux microfluidiques. Les filaments sont actionnés en précession autour de l'axe vertical. Il existe une inclinaison critique de champ magnétique par rapport à l'axe de précession, au-delà de laquelle la réponse d'un filament à haute fréquence n'est plus synchrone. Cette transition dynamique repose sur un critère géométrique, lié à la nature de l'interaction magnétique dipolaire. Enfin, sous l'effet des interactions hydrodynamiques à longue portée, les trajectoires des extrémités libres d'un réseau de filaments subissent une évolution morphologique inattendue. Un modèle minimal à deux corps apporte une compréhension semi-quantitative de nos résultats expérimentaux.
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Ciclos de transformação : formação continuada de professores de LE por meio de trabalho com projetos

Teixeira, Isabel Cristina de Araújo 03 March 2016 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Letras, Departamento de Línguas Estrangeiras e Tradução, Programa de Pós-Graduação em Linguística Aplicada. 2016. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-05-23T18:11:58Z No. of bitstreams: 1 2016_IsabelCristinadeAraújoTeixeira.pdf: 1939627 bytes, checksum: d01eeaf2813d0fddd7b31297dbd8d6b4 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-05-23T20:00:50Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_IsabelCristinadeAraújoTeixeira.pdf: 1939627 bytes, checksum: d01eeaf2813d0fddd7b31297dbd8d6b4 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-23T20:00:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_IsabelCristinadeAraújoTeixeira.pdf: 1939627 bytes, checksum: d01eeaf2813d0fddd7b31297dbd8d6b4 (MD5) / Este estudo se refere a uma pesquisa-ação sobre indícios de ressignificações na abordagem de ensinar de uma professora de língua estrangeira (LE) por meio de formação continuada baseada no trabalho com projetos e reflexão. A professora selecionada para o estudo leciona inglês como língua estrangeira em uma escola pública de referência no ensino de LE no Distrito Federal: o Centro Interescolar de Línguas de Taguatinga (CILT) desde 2013 e apresenta um perfil condizente com a pesquisa. O objetivo da pesquisa foi auxiliar a professora participante a implementar projetos pedagógicos no contexto de LE a fim de promover ressignificações na sua abordagem de ensino. Ademais, buscou-se que a reflexão empreendida ao longo da pesquisa pudesse contribuir para que a professora participante refletisse sobre sua prática docente. Por fim, objetivou-se, por meio deste estudo, reunir subsídios teóricos e práticos para a melhoria do ensino de LE nos Centros Interescolares de Língua (CILs) por meio da sugestão de um modelo de formação reflexivo de professores. Detectou-se que a presente investigação poderia auxiliar na formação continuada de professores dos Centros Interescolares de Línguas que estão passando por uma fase importante de reorganização curricular e metodológica. Assim, a análise de dados se alicerçou em vertentes teóricas sobre construtos basilares como formação continuada (ALMEIDA FILHO, 2013; BEHRENS, 2007; CONTRERAS, 2012; DINIZ-PEREIRA, 2009; FREIRE, 2000; GUANDALINI, 2013; INBERNÓN, 2010; MOREIRA, 2002; NÓVOA, 2009; OLIVEIRA, 2013; SMYTH, 1991; ZEICHNER; 1993). Ademais, esta pesquisa beneficiou-se de estudos tanto sobre abordagem de ensinar (ALMEIDFA FILHO, 1999; 2011; 2012; 2013; 2014; CAVALCANTI; MOITA LOPES, 1991; FONTÃO DO PATROCÍNIO, 1991; SATELLES; ALMEIDA FILHO, 2010) quanto sobre crenças e ressignificação (ALMEIDA FILHO, 1993; 2005; 2013; BARCELOS, 2001; 2003; BARCELOS; KAJALA, 2003; KUDIESS, 2005; LUZ, 2001; OLIVEIRA, 2010; MORAN, 2013; RICHARDS; LOCKHART, 1994, 1996). Também tratou-se do professor reflexivo (ALVAREZ, 2009; BENASSULY, 2002; CONTRERAS, 1997; DEWEY, 1938; DUTRA, 2014; FAGUNDES, 2014; LIBÂNEO, 2002; NÓVOA, 1992; SCHÖN, 2000; ZEICHNER, 1993) e do trabalho com projetos e o papel do professor na implementação dos mesmos (ALMEIDA, 2000; BEHRENS, 2013; BEHRENS; JOSÉ, 2010; FRIED-BOOTH, 2013; GADOTTI; 1993; HERNANDÉZ, 1998; 2000; HERNANDÉZ; VENTURA, 1994; 1996; NOGUEIRA, 2005; PRADO, 2005; STOLLER, 2002; 2005). A pesquisa se embasou em aporte teórico da pesquisa qualitativa (CHIZZOTTI, 2006; DENZIN; LINCOLN, 2006; EL ANDALOUSSI, 2004; LAVILLE; DIONE, 1999; LUDKE ; ANDRÉ, 1986) concretizada pela pesquisa-ação (BURNS, 1999; 2010; CHIZOTTI, 2006; EL ANDALOUSSI, 2004; ELLIOTT, 1991; SILVESTRE, 2008; TRIPP, 2005) empregando instrumentos de coleta de dados: a) observação com gravação de áudio de aula com notas de campo; b) entrevistas semiestruturadas; c) questionários escritos mistos; d) diário da professora participante; e) sessões de planejamento e reflexão colaborativas. Os resultados logrados foram ressignificações significativas na visão de língua/linguagem/LE da professora participante, do seu papel como professora e do ensino de LE. Similarmente, pôde-se observar a função primordial da reflexão para uma prática mais conscientemente planejada e que levou em consideração o outro. Em conclusão, a análise valida uma formação dialógica, feita em lócus e que promova a autonomia do professor. _______________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / This study refers to an action research that collected evidence of resignification of a foreign language teacher´s approach to teaching after going through a process of ongoing professional development based on Project work and reflection. The participant selected to take part in this research teaches English as a foreign language in a public school that is reference in the Federal District, the Centro Interescolar de Línguas de Taguatinga (CILT), since 2013. The participant presents a profile that fits the study. The objective of this research was to help the teacher to implement projects in the foreign language context aiming for a change in her teaching approach. Besides that, it was intended that the reflection practiced throughout the research could contribute to the teacher´s reflection of her own teaching. Finally, this study had the purpose to gather theoretical and practical support to improve the foreign language teaching in the Centro Interescolares de Línguas through the suggestion of a model of reflective ongoing professional development. It was detected that the present investigation could help with the ongoing professional development of teachers that work in the Centros Interescolares de Línguas, which are going through an important phase of methodological and curricular reform. Therefore, the data analysis was guided by theoretical trends about basic concepts such as ongoing professional development (ALMEIDA FILHO ,2013; BEHRENS, 2007; CONTRERAS, 2012; DINIZ-PEREIRA, 2009; FREIRE, 2000; GUANDALINI, 2013; INBERNÓN, 2010; MOREIRA, 2002; NÓVOA 2009; OLIVEIRA, 2013; SMYTH; 1991; ZEICHNER; 1993). Also, this research benefited from studies on teaching approach (ALMEIDFA FILHO, 1999; 2011; 2012; 2013; 2014; CAVALCANTI; MOITA LOPES, 1991; FONTÃO DO PATROCÍNIO,1991; SATELLES; ALMEIDA FILHO,2010) as well as on beliefs and resignification (ALMEIDA FILHO, 1993; 2005; 2013; BARCELOS, 2001; 2003; BARCELOS; KAJALA, 2003; KUDIESS, 2005; LUZ, 2001; OLIVEIRA, 2010; MORAN, 2013; RICHARDS; LOCKHART, 1994, 1996). It also employed the reflective teacher research (ALVAREZ, 2009; BENASSULY, 2002; CONTRERAS, 1997; DEWEY, 1938; DUTRA, 2014; FAGUNDES, 2014; LIBÂNEO, 2002; NÓVOA, 1992; SCHÖN, 2000; ZEICHNER, 1993) and studies on Project work and the teacher´s role when implementing it (ALMEIDA, 2000; BEHRENS, 2013; BEHRENS; JOSÉ, 2010; FRIED-BOOTH, 2013; GADOTTI; 1993; HERNANDÉZ, 1998; 2000; HERNANDÉZ; VENTURA, 1994; 1996; NOGUEIRA, 2005; PRADO, 2005; STOLLER; 2002; 2005). The research was based on the qualitative theoretical research frame (CHIZZOTTI, 2006; DENZIN; LINCOLN, 2006; EL ANDALOUSSI, 2004; LAVILLE; DIONE, 1999; LUDKE ; ANDRÉ, 1986) carried out through action research (BURNS, 1999; 2010; CHIZOTTI 2006; EL ANDALOUSSI, 2004; ELLIOTT, 1991; SILVESTRE, 2008 e TRIPP, 2005) using the following data instruments: a) observation with field notes; b) semi-structed interviews; c) mixed written questionnaires; d) teacher´s diary; e) colaborative planning and reflection sessions. The results indicated a relevant change in the teacher´s view of language/Foreign Language and the resignification of both her role as a teacher and her view of foreign language teaching. In the same way, it was observed the outstanding role of reflection to a more consciously planned teaching practice that takes into account the other people involved in the process. To sum up, the analysis validates an ongoing professional development based on dialogue, done at school, and that promotes the teacher´s autonomy.
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Primary cilia on colonic mesenchymal cells regulate DSS-induced colitis and inflammation associated colon carcinogenesis / Régulation de la colite induite par DSS et de la carcinogenèse du côlon associée à l'inflammation par les cils primaires des cellules mésenchymateuses du côlon

Tang, Ruizhi 04 July 2017 (has links)
La glycylation, une modification post-traductionnelle des microtubules, est cruciale dans le maintien des cils primaires. Notre groupe a précédemment identifié un rôle inattendu de la tubuline glycylase TTLL3 dans la régulation de l'homéostasie du colon et de la tumorigénèse. Plus précisément, une diminution du nombre de cils primaires a été observée chez les souris déficientes pour la glycylase TTLL3, qui est la seule glycylase exprimée dans le côlon. Les souris TTLL3 - / - ne présentent pas d'anomalie évidente à l'état stationnaire. Cependant, lorsqu'elles sont exposées à une carcinogenèse du côlon chimiquement induite, les souris TTLL3 - / - sont plus sensibles à la formation de tumeurs. Il est important de noter que les niveaux d'expression de TTLL3 sont significativement réduits dans les carcinomes primaires et métastases colorectales chez l'homme comparativement au tissu de côlon sain, ce qui suggère un lien entre la régulation des cils primaires par TTLL3 et le développement du cancer colorectal.L'objectif de mon projet de thèse était d'explorer l’effet de la modulation des cils primaires sur la carcinogenèse du côlon. J’ai ainsi démontré que le nombre de cils primaires diminue lors de la carcinogenèse du côlon chimiquement induite chez la souris. Notamment, j'ai découvert que les cils primaires du côlon sont principalement exprimés par les cellules mésenchymateuses. Pour mieux caractériser le rôle des cils primaires dans le côlon murin, j'ai étudié les conséquences de leur perte dans les cellules mésenchymateuses intestinaux. Pour cela, j'ai utilisé deux modèles de souris KO conditionnelles, pour la kinesin-3A (Kif3A) et le transport intra-flagellaire 88 (Ift88), deux molécules essentielles pour la formation des cils. Leur délétion spécifique dans les cellules mésenchymateuses intestinaux est obtenue par croisement des souches de souris Kif3Afl/fl et Ift88fl/fl des souris transgéniques collagène VI-cre. Bien que le promoteur colllagène VI ne soit actif que dans un sous-ensemble de cellules mésenchymateuses coliques, j'ai constaté que la diminution du nombre de cils primaires dans ces derniers favorise la colite chimiquement induite et la carcinogenèse. L'analyse par séquençage ARN des cellules mésenchymateuses coliques isolés de souris mutantes suggère un déclenchement de la signalisation Wnt et Notch chez les souris ColVIcre-Kif3Afl/fl. Nous confirmons actuellement ces résultats par qPCR et immunohistochimie. / Glycylation, a posttranslational modification of microtubules, is crucial in the maintenance of PC. Our group previously identified an unexpected role of the tubulin glycylase TTLL3 in the regulation of colon homeostasis and tumorigenesis. Specifically, a decreased number of primary cilia (PC) was observed in mice deficient for the glycylase TTLL3, which is the only glycyclase expressed in the colon. TTLL3-/- mice display no obvious abnormalities in the steady state. However, when exposed to chemically induced colon carcinogenesis, TTLL3-/- mice are more susceptible to tumor formation. Importantly, TTLL3 expression levels were significantly downregulated in human primary colorectal carcinomas and metastases as compared to healthy colon tissue, suggesting a link between TTLL3 regulation of PC and colorectal cancer development.The aim of my thesis project was to explore the relation of PC and colon carcinogenesis. In fact, I could demonstrate that the number of PC decreases during chemically induced colon carcinogenesis in mice. Notably, I discovered that PC in the colon are mostly expressed by fibroblasts. To better characterize the role of PC in murine colon, I studied the consequences of a loss of PC in intestinal fibroblasts. For this, I used two independent ciliary conditional knockout mice, kinesin-3A (Kif3A) and intraflagellar transport 88 (Ift88), both essential for cilia formation. Specific deletion in intestinal fibroblasts is obtained by crossing with colVI-cre transgenic mice. Though the colVI promoter is only active in a subset of colonic mesenchymal cells I found that the decreased number of PC in colonic mesenchymal cells promotes chemically induced colitis and carcinogenesis. RNAseq on isolated colonic mesenchymal cells of mutant mice suggests a triggering of Wnt and Notch signaling in ColVIcre-Kif3aflx/flx mice. We are presently validating these findings by qPCR and immunohistochemistryTaken together, I discovered that PC are expressed by at least a subset of colonic mesenchymal cells, which has not been described before. Decreased numbers of those PC renders mice more susceptible to colitis and colitis associated carcinogenesis.

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