Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2015-05-19T16:49:25Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO Rafaela Carvalho Tigre.pdf: 8383179 bytes, checksum: 4faaf34d6442f38ca981fd651b1fa042 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-19T16:49:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO Rafaela Carvalho Tigre.pdf: 8383179 bytes, checksum: 4faaf34d6442f38ca981fd651b1fa042 (MD5) Previous issue date: 2009-02-16 / CAPES / Os aleloquímicos liquênicos, têm um importante papel na ecologia dos liquens, podendo afetar o desenvolvimento de outros organismos ao seu redor. O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial alelopático do talo de Cladonia verticillaris, seus extratos e suas substâncias principais, os ácidos fumarprotocetrárico (FUM) protocetrárico (PRO) sobre a germinação e o desenvolvimento inicial de Lactuca sativa. Os extratos foram obtidos com éter dietílico, clorofórmio e acetona. O FUM foi extraído a partir do extrato acetônico. Ensaios cromatográficos foram realizados para detecção dos fenóis. O experimento foi conduzido em placas de Petri contendo extratos, ou FUM ou PRO (0,01; 0,1; 1,0; 2,5mg/mL). Nos bioensaios in vivo foram borrifadas soluções de uréia (0,1; 1,0 e 10mg/mL) sobre o líquen. Observou-se que o talo e todas as soluções testadas não afetaram a germinabilidade, mas os extratos causaram alterações no tempo de germinação. Os parâmetros biométricos foram mais sensíveis aos aleloquímicos obtendo-se diferentes respostas dependendo da concentração. As alterações morfológicas das plântulas indicaram modificações no balanço hormonal das plântulas, com indução da formação de pêlos, raízes laterais, aumento do diâmetro radicular e inibições do sistema radicular. Notou-se que a adição de uréia (0,1mg/mL) e água deionizada ativa a urease causando diferentes efeitos alelopáticos. As análises cromatográficas revelaram a presença de FUM e PRO nos extratos indicando serem estas as substâncias responsáveis pelas alterações observadas.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:04:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4344_1.pdf: 1015492 bytes, checksum: d096bbe2d62601d478111a837c689e7b (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A doença de Chagas continua a ser um problema de Saúde Pública relevante e, o único tratamento, o Benznidazol, acarreta severos efeitos colaterais e possui limitações terapêuticas. Diante disso, objetivou-se analisar o efeito do extrato acetônico (ACE) e dos ácidos fumarprotocetrárico (FUM) e protocetrárico (PRO) do líquen Cladonia verticillaris (Raddi) Fr.. contra Trypanosoma cruzi, in vitro. O extrato acetônico foi obtido mediante a uma seqüência eluotrópica de solventes orgânicos. Posteriormente foram obtidos os compostos isolados (FUM) e (PRO). Foram realizados leituras cromatográficas para confirmação e determinação do grau de pureza das substâncias. Os bioensaios foram conduzidos com formas epimastigotas e tripomastigotas sangüínea incubadas durante 72 e 24 horas respectivamente, na ausência ou presença de 75 a 300ig.mL-1das substâncias testes. Foram determinadas nesse período a IC50 e IL50. As análises foram realizadas em triplicatas em três experimentos independentes. As formas tripomastigotas revelaram maior susceptibilidade aos metabólitos secundários, com 100% de lise dos parasitas tratados com 300 ig·mL-1 de PRO, após 24 horas de incubação. A análise ultraestrutural de tripomastigotas tratadas revelaram desorganização de organelas, retração nuclear e danos ao cinetoplasto e a mitocôndria. Estas alterações foram mais evidentes nos tratamento com PRO. Concluindo, os resultados obtidos estimulam estudos futuros para elucidar os mecanismos de ação destes compostos bem como avaliar seus efeitos sobre formas amastigotas intracelulares. Estes resultados também apontam para o uso do PRO como agente potencial contra Trypanosoma cruzi

Lichens are known producers of a variety of secondary metabolites. Fungal polyketides constitute a large family of these secondary metabolites that have a high degree of struc-tural diversity. Usnic acid is a lichen metabolite that has a broad range of biological ac-tivities. However the use of usnic acid in medical applications is limited due to the slow growth of the lichen in nature. In order to conduct in depth studies on compounds such as usnic acid it will be necessary to express their gene clusters in fast growing organisms. To achieve this goal, polyketide biosynthesis in the lichen fungi Cladonia uncialis has been investigated to identify the gene clusters that are responsible for secondary metabo-lites production. This thesis reports the de novo whole-genome sequencing of the lichen Cladonia un-cialis, in silico analysis of polyketide biosynthetic gene clusters, and putative identifica-tion and annotation of 56 different secondary metabolite gene clusters. The identified gene clusters include thirty two different type I polyketide synthase genes (non-reducing, partly reducing and highly reducing PKS genes) gene clusters besides two gene clusters of type III PKS gene, three independent, novel non-ribosomal peptide synthetases (NRPS) biosynthetic gene clusters, as well as seven noncanonical NRPS genes that did not contain condensation (C) domains, three polyketide non-ribosomal (PKS-NRP) hy-brid gene clusters, one lanthipeptide synthase gene and six different terpene synthase gene clusters. Out of 32 candidate genes a single PKS has been identified as being re-sponsible for usnic acid biosynthesis. The structure of one of the lichen non-reducing PKS genes that is responsible for produc-tion of a halogenated lichen metabolite was also studied. Based on the biosynthetic opera-tions of the gene cluster as well as catalogued examples of halogenated polyketides iso-lated from lichen fungi to date, this study suggests that the gene cluster is a biosynthetic gene for an unidentified anthraquinone. The ketosynthase and the acyltransferase do-mains among two different non reducing PKS genes from Cladonia uncialis genome se-quence are also studied. The amino acid sequences of the domains are confirmed by us-ing mass spectrometry. Protein homology modeling was performed using the Swiss-Model server. The generated protein models were visualized using LASERGENE Pro-tean 3D molecular visualization system. / May 2015

Cladonia perforata is an endangered lichen endemic to the Atlantic Coastal Ridge, Lake Wales Ridge, Southwest Florida, and the North Gulf Coast of Florida. In all but a single locality, C. perforata relies entirely on asexual reproduction through fragmentation for reproduction, dispersal, and recruitment. This study suggests a positive correlation between fragment size and survivability of fragments after one year. The average thallus grew at a rate of 10.42% per year and younger branches of a thallus grew at a quicker rate than older branches. Additionally, a review of thalli morphology suggests C. perforata has a diverse form, and becomes more bifurcated as it increases in size. / Includes bibliography. / Thesis (M.S.)--Florida Atlantic University, 2014. / FAU Electronic Theses and Dissertations Collection

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:06:23Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4805_1.pdf: 2322336 bytes, checksum: 477fa2d5091ee20b59a03f762f50c856 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2006 / Liquens da região nordeste, especialmente Cladonia verticillaris (Raddi) Fr., são reconhecidos como eficientes biomonitores da qualidade do ar. O Complexo Industrial Portuário de Suape, por não possuir forma alguma de aferição de poluição atmosférica, foi avaliado em 7 pontos, usando C. verticillaris como biomonitor por 12 meses. A cada coleta bimestral, as amostras foram avaliadas no ponto de vista fisiológico (avaliação de pigmentos e fenóis) e, danos à estrutura externa (lupa estereoscópica e microscopia eletrônica de varredura). Foi possível estabelecer os pontos com melhor qualidade do ar, ou áreas críticas, observando a direção predominante dos ventos e pluviosidade. Nas áreas mais poluídas, próximas a indústria Pamesa os teores do principal composto de C. verticillaris, o ácido fumarprotocetrárico, foram bastante reduzidos, com acúmulo de produtos intermediários de sua biossíntese, o que ratifica a ação dos poluentes na célula. Isto pode ser também verificado na quantificação dos pigmentos e danos à estrutura externa. Foram consideradas como áreas críticas os pontos denominados de Viveiro, Bonesa e PC1, todos localizados próximos à indústria Pamesa (fabricante de cerâmicas). Os outros pontos, variaram de má, medianos e bons em termos de qualidade do ar, merecendo também atenção para que exista em Suape a implantação de políticas que garantam bons índices de pureza atmosférica, onde os dados poderão ser utilizados para futuros planejamentos de gestão ambiental na área

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:52:23Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4540_1.pdf: 1554570 bytes, checksum: a102b3e2f43f0c3029d85deb1901a318 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2007 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os líquens tem sido utilizados na medicina popular desde a antiguidade para tratar vários tipos de doenças do trato respiratório como irritação da garganta, tosse, tuberculose, e asma. Este estudo tem como objetivo avaliar a atividade expectorante do extrato acetônico e do ácido fumarprotocetrárico (FUM) de Cladonia verticillaris em camundongos. Para este propósito, foram usados 60 camundongos albinos suíços, fêmeas, separados em cinco grupos, aos quais foi administrado vermelho de fenol, diluído em salina 0,9%, intraperitonealmente (200 mg/kg em 10 mL/kg) e após isto, foi administrada a droga oralmente. Os animais foram sacrificados 30 minutos e 1 hora após a administração das drogas e tiveram a traquéia dissecada e canulada com uma agulha, através da qual foram realizadas lavagens pulmonares com solução salina. Os fluidos coletados foram centrifugados e ao sobrenadante adicionado NaOH (0,01 N). Em seguida, a leitura do material foi feita em espectrofotômetro a 546 nm. Os resultados foram analisados através do teste não paramétrico de Mann-Whitney (p ≤ 0,05). Os grupos tratados com ambroxol (75 mg/kg) e com o extrato acetônico (80 mg/kg) apresentaram aumento estatisticamente significante da excreção do vermelho de fenol na secreção traqueobrônquica dos animais. Estes resultados sugerem que, na forma oral, o extrato acetônico, na dose de 80 mg/kg, mostrou-se tão eficaz quanto o ambroxol como expectorante

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:54:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4879_1.pdf: 418798 bytes, checksum: e66fde5c4b3fce381304c6361e623bcf (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004 / Lectinas são proteínas ou glicoproteínas de origem não imunológica que possuem sítios de ligação para carboidratos e/ou glicoconjugados. Uma lectina do líquen Cladonia verticillaris foi purificada através de cromatografia de exclusão molecular. O líquen triturado foi submetido à extração e uma purificação parcial por fracionamentos utilizando sulfato de amônio. As amostras foram submetidas a ensaios de atividade hemaglutinante (AH) e suas concentrações protéicas foram estimadas. A fração mais ativa, F1 (0-30 %), foi submetida a ensaios de inibição, a ensaios de estabilidade térmica e de dependência de íons divalentes, assim como a ensaios cromatográficos para a purificação e caracterização lectínica. ClaveLL foi isolada através de cromatografia de exclusão molecular de F1, e submetida aos mesmos ensaios; foi também avaliada quanto à estabilidade da AH em valores de pH compreendidos de 2 a 12. F1 e ClaveLL foram analisadas em eletroforeses em gel de poliacrilamida (PAGE) para proteínas nativas ácidas e básicas, assim como para proteínas desnaturadas. F1 foi inibida parcialmente por carboidratos (N-acetil-D-glicosamina, xilose, arabinose, ramnose e manose) e glicoproteínas (fetuína, caseína, ovalbumina e peroxidase) ou totalmente (glicoproteínas presentes em soro fetal bovino e em soro de coelho). ClaveLL foi inibida parcialmente por carboidratos (N-acetil-D-glicosamina, galactose, ramnose, manose, glicose e trealose) e ovalbumina, e inibida totalmente por fetuína, asialo-fetuína, caseína, asocaseína e glicoproteínas presentes em colostro, soro de coelho e soro fetal bovino. F1 foi termoestável, mantendo sua AH a 80°C, enquanto ClaveLL foi sensível ao aumento de temperatura. F1 e ClaveLL não foram dependentes de íons, mas MnCl2, BaCl2, CaCl2 e MgCl2 estimularam sua AH. ClaveLL foi mais ativa nos valores de pH ácido (5,5) ou básico (11,0). PAGE contendo SDS resolveu F1 e ClaveLL como única banda polipeptídica (glicosilada) com peso molecular menor que 14 kDa. F1 glicosilada pode ter resíduos glicose/manose uma vez que se ligou à Cramoll 1,4-Sepharose, uma matriz de afinidade com a lectina de semente de Cratylia mollis, isoformas 1 e 4 glicose/manose específica, imobilizada à Sepharose CL-4B. PAGE para proteínas nativas ácidas detectou em ClaveLL uma única banda que migrou junto com a frente de corrida; o mesmo foi observado em PAGE para proteínas nativas básicas. Cromatografia de ClaveLL através de filtração em gel em sistema ÄKTA-FPLC, resolveu três picos distintos com AH, que sugeriram formas de agregados moleculares para a lectina nativa, com pesos moleculares estimados em 170, 110 (pico principal) e 82 kDa. Concluindo, ClaveLL glicosilada altamente purificada é estável a pH e principalmente inibida por glicoproteínas

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:55:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6721_1.pdf: 750036 bytes, checksum: 5d5b91cdde91a476a51047522e2fc412 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Faculdade de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / Proteínas antimicrobianas, entre elas as lectinas, despertam o interesse de muitos pesquisadores, uma vez que podem ser usadas como agentes biológicos contra infecções microbianas. Esse trabalho descreve atividades antibacteriana e antifúngica de uma lectina e de outras preparações obtidas do líquen Cladonia verticillaris, contra microorganismos de importância médica. A lectina ClaveLL foi purificada através de um protocolo previamente definido. O líquen foi submetido à extração com tampão fosfato de sódio pH 7,0 (PBS), seguida de filtração e centrifugação para obtenção do extrato bruto (E). Foi realizado um fracionamento com sulfato de amônio a 30 %. A fração protéica obtida por centrifugação (F1) foi submetida à cromatografia de exclusão molecular utilizando a matriz Sephadex G-100 para a obtenção da lectina pura e ativa. A atividade antibacteriana foi testada contra Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis, Enterococcus faecalis, Klebsiella pneumoniae e Escherichia coli. ClaveLL apresentou atividade antimicrobiana contra todas as espécies testadas, com maior ação inibitória sobre o crescimento de E. coli, contra a qual revelou menor Concentração Mínima Inibitória (7,18 mg/mL), embora a menor Concentração Mínima Bactericida (57,4 mg/mL) tenha sido detectada contra E. faecalis. Nos ensaios antifúngicos, foram avaliadas preparações de E, F1 e ClaveLL contra os dermatófitos Trichophyton mentagrophytes, Microsporum gypseum, Trichophyton rubrum, Trichosporon cutaneum e Trichosporon asahi. A atividade antifúngica também foi avaliada contra os fitopatogênicos Fusarium solani, Fusarium oxysporum e Fusarium lateritium, os quais são patógenos oportunistas que podem causar infecções graves em humanos. ClaveLL foi mais ativa contra T. rubrum com um percentual de inibição de 35 % em relação ao controle negativo (PBS). E e F1 apresentaram maior atividade de inibição de crescimento contra T. mentagrophytes (35 %) e F. solani (42,9 %), respectivamente. Os resultados indicam ClaveLL e outras preparações obtidas de C. verticillaris como potenciais agentes antimicrobianos úteis para aplicações biotecnológicas com enfoque na saúde humana

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:06:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo673_1.pdf: 1420053 bytes, checksum: ef8ced7819f9a2265ea08ee64724b6ee (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / Estudos realizados com liquens da região Nordeste destacam Cladonia verticillaris como biomonitor da qualidade do ar em áreas urbanas e industriais. Objetivando-se avaliar o risco de contaminação ocupacional numa indústria petroquímica no Estado de Pernambuco, utilizou-se C. vetrticillaris em ensaios de biomonitoramento. Após oito meses de exposição ao ambiente industrial em 12 pontos monitorados, C. verticillaris apresentou comportamento diferenciado em 6, portanto, esse material foi selecionado para realização de testes complementares de cromatografia liquida de alta eficiência (CLAE) e cromatografia em camada delgada (CCD) após 1 e 8 meses de experimento. Nas CLAEs realizadas no material após um mês de experimento foram constatados teores do principal composto produzido pela espécie (ácido fumarprotocetrárico - FUM) próximos ao do material tempo zero (0,8 mg/mg). Após 8 meses de experimento o FUM foi detectado nos ensaios de CCD e CLAE nos pontos 07, 08 e 10. O ponto 09 e o 11 apresentaram apenas bandas referentes ao PRO na CCD, na CLAE foram obtidos picos com tempo de retenção semelhantes ao do PRO. O FUM não foi detectado em nenhum dos ensaios referente ao ponto 12. Foram realizados também ensaios em laboratório onde o material foi submetido a estireno ou pirrolidina (produtos processados na indústria) com objetivo de verificar a ação isolada desses produtos. O material foi coletado periodicamente para realização de ensaios de CCD, visualização em lupa e quantificação de pigmentos (clorofilas e feofitinas). A partir da análise das CCDs constatou-se a presença de bandas referentes ao FUM e ao PRO no material submetido ao estireno. No experimento com pirrolidina houve a ausência de bandas referentes aos compostos produzidos pela espécie, demonstrando que o material foi mais sensível á pirrolidina do que ao estireno. A partir da quantificação de pigmentos observou-se diminuição da produção de clorofilas e feofitinas no material submetido ao estireno, além do nível de feofitina ultrapassar o de clorofila. No material submetido á pirrolidina ocorreu uma produção exacerbada de feofitina (15,6 mg/mL). Tais resultados foram ratificados através da visualização do material em lupa onde constatou-se maiores alterações quanto a coloração no material submetido à pirrolidina que passou para a cor marrom, refletindo alta concentração de feofitina. Os resultados das análises do material submetido ao ambiente industrial a aos contaminantes em laboratório se ratificam e indicam o ponto 12 como de maior risco de contaminação ocupacional devido à pirrolidina

Made available in DSpace on 2014-06-12T23:15:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3318_1.pdf: 1751915 bytes, checksum: b1f2b13e084eb72dbb204cbfab9df2f3 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os liquens são organismos que degradam rochas pela ação química de suas substâncias e mecânica por incrustação no substrato, favorecendo o processo de formação do solo. Os liquens quando submetidos a diferentes doses de radiação, são estimulados a produzirem suas substâncias em quantidades diferenciadas daquelas que produziriam sem a intervenção das mesmas. Nesta pesquisa, objetivou-se determinar possíveis mudanças na produção do ácido barbático (BAR) pelo líquen Cladonia salzmannii, submetido a diferentes doses de radiação gama, e determinar se seus compostos lixiviados para o solo alterariam sua composição química. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado constituindo cinco tratamentos com cinco repetições. Amostras com 8g de C. salzmannii foram submetidas a doses de radiação gama de 5; 10; 60 e 100Gy, acondicionadas em bandejas plásticas contendo 1kg de solo. Durante todo o experimento, as amostras foram borrifadas com 20mL de água destilada em dias alternados. Amostras de liquens e de solo foram coletadas aos 7, 28, 71, 100 e 136 dias e, analisadas por espectrofotometria, Cromatografia em Camada Delgada (CCD) e Líquida de Alta Eficiência (CLAE). Os resultados evidenciaram um aumento na produção do BAR na dose de 5Gy. Houve uma tendência de redução na produção, havendo uma biossíntese bastante reduzida aos 100Gy. Foram determinados os valores de pH, teores de carbono total e nitrogênio total de cada unidade experimental, sendo observados aumentos destes atributos químicos, principalmente nos tratamentos irradiados