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Caractérisation des fonctions moléculaires des isoformes de NudCD1 dans le cancerAsselin-Mullen, Patrick January 2017 (has links)
Le cancer est la cause principale de décès chez les canadiens. Cette maladie est
souvent caractérisée par des surexpressions, des sous-expressions et des mutations chez
certaines protéines clés. NudCD1 est un gène ayant été identifié lors de la dernière
décennie comme possédant une forte expression chez des patients atteints de leucémie
myéloïde chronique. La protéine issue de ce gène n'est normalement exprimée qu'au niveau
des tissus sains testiculaires et cardiaques, elle est cependant surexprimée dans différents
cancers. La forte expression de NudCD1 est associée avec des phénotypes tumoraux,
possiblement agissant sur l'activation d'IGF1R qui permettrait les phosphorylations
subséquentes des voies de signalisation passant par AKT et ERK1/2. Le gène de NudCD1
est constitué de 12 exons pouvant être épissés alternativement de manière à produire 3
différentes isoformes. Ces isoformes possèdent une région C-terminale commune de 492
acides aminés et ont une région N-terminale spécifique. Les isoformes 2 et 3 ne sont
présentement que peu caractérisées et leur rôle potentiel ou présence dans le cancer est
inconnu. Cette étude nous suggère que les différentes isoformes de NudCD1 possèdent
des fonctions différentes dans le cancer. L'expression de ces différentes isoformes a été
mesurée au niveau des transcrits d'ARNm ainsi qu'au niveau des protéines dans différentes
lignées cellulaires cancéreuses et non-cancéreuses, principalement de types colorectales.
NudCD1-1 est exprimée fortement au niveau transcriptionnel et protéique, l'isoforme 2
n'est pas exprimée dans les lignées cellulaires étudiées alors que la troisième isoforme est
présente faiblement au niveau d'ARNm chez la majorité des lignées étudiées. La stabilité
protéique des isoformes a également été mesurée et démontre que NudCD1-2 et NudCD1-3
sont dégradées rapidement par le protéasome. L'observation microscopique des isoformes
par immunofluorescence a démontré que les isoformes n'ont pas la même localisation
cellulaire, la première étant principalement nucléaire, la deuxième majoritairement
cytoplasmique et la troisième est pancellulaire, Des expériences de spectrométrie de masse
en tandem couplées à la méthode de quantification SILAC ont démontré l'interaction entre
la protéine NudCD1-1 et DHX15. Ces mêmes expériences ont montré que NudCD1-2
pourrait interagir au niveau du cytosol avec HSP90 dans la réponse aux chocs thermiques
et le mouvement nucléaire alors que NudCD1-3 pourrait également agir avec ces protéines
en plus de jouer un rôle dans la transcription. L'interaction NudCD1-1 et DHX15 suggère
que la protéine pourrait agir au niveau du spliceosome ainsi que la transcription afin de
médier l'activation d'IGF1R pour mener au phénotype tumoral. Ces résultats suggèrent que
les différentes isoformes ont des fonctions différentes dans la cellule, mais ne sont pas
toutes impliquées dans le cancer, en plus d'approfondir les connaissances sur l'action de
NudCD1-1 dans le cancer.
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Characterization of the Protein Lysine Methyltransferase SMYD2Lanouette, Sylvain January 2015 (has links)
Our understanding of protein lysine methyltransferases and their substrates remains limited despite their importance as regulators of the proteome. The SMYD (SET and MYND domain) methyltransferase family plays pivotal roles in various cellular processes, including transcriptional regulation and embryonic development. Among them, SMYD2 is associated with oesophageal squamous cell carcinoma, bladder cancer and leukemia as well as with embryonic development. Initially identified as a histone methyltransferase, SMYD2 was later reported to methylate p53, the retinoblastoma protein pRb and the estrogen receptor ERalpha and to regulate their activity. Our proteomic and biochemical analyses demonstrated that SMYD2 also methylates the molecular chaperone HSP90 on K209 and K615. We also showed that HSP90 methylation is regulated by HSP90 co-chaperones, pH, and the demethylase LSD1. Further methyltransferase assays demonstrated that SMYD2 methylates lysine K* in proteins which include the sequence [LFM]-₁-K*-[AFYMSHRK]+₁-[LYK]+₂. This motif allowed us to show that SMYD2 methylates the transcriptional co-repressor SIN3B, the RNA helicase DHX15 and the myogenic transcription factors SIX1 and SIX2. Finally, muscle cell models suggest that SMYD2 methyltransferase activity plays a role in preventing premature myogenic differentiation of proliferating myoblasts by repressing muscle-specific genes. Our work thus shows that SMYD2 methyltransferase activity targets a broad array of substrates in vitro and in situ and is regulated by intricate mechanisms.
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