El desarrollo de técnicas matemáticas para mejorar la visualización de imágenes médicas DICOM, mediante segmentación y procesamiento morfológico es el principal objetivo del presente proyecto de tesis. Para lograr este fin, se recopilaron imágenes médicas de un Tomógrafo Computarizado en diferentes estudios especializados de UROTEM, Tórax y de Cerebro, los cuales fueron procesados mediante algoritmos matemáticos desarrollados en el software Matlab. En el primer capítulo se plantea el problema; la necesidad de un post procesamiento de imágenes médicas, se fundamenta la importancia de esta investigación y se identifican los objetivos a lograr, así como también, se describen los antecedentes de esta investigación. Como marco teórico, en el segundo capítulo, se explica brevemente el funcionamiento de un Tomógrafo Computarizado, la adquisición de una imagen y el desarrollo del formato DICOM como un estándar internacional para imágenes médicas. Las técnicas matemáticas se describen en el capítulo tres; segmentación de imágenes, mediante el método de N. Otsu y procesamiento morfológico, detallándose su formulación y se definen las funciones empleadas en el software Matlab basadas en estas técnicas. El desarrollo de técnicas computacionales son descritas en el capítulo cuatro, donde se presenta por cada estudio; un diagrama de bloques y el desarrollo del procedimiento del algoritmo en Matlab, Finalmente, en el capítulo cinco, se muestran las pruebas y resultados de las imágenes DICOM de cinco pacientes por estudio, identificándose las patologías de forma automática. The mathematical technics to improve the visualization of medical images DICOM, through segmentation and morphological processing is the main goal of the following thesis project. In order to achieve this purpose, we collected medical images from a computed tomography scanner in three different exams, UROTEM, Thorax, and Brain. These images were processed through the mathematical algorithms developed in the software Matlab. The first chapter presents the problem; the necessity to post processing the medical images, the importance of the investigation as a tool to help in the medical diagnosis and the identification of a pathology automatically, the identification of the objectives to accomplish, and also it describes the antecedents of medical images processing developed from different authors. As a theory, in the second chapter, explain briefly the working basis of the Computed tomography scanner, the acquisition of an image and the developing of DICOM format as an international standard for medical images. The mathematical technics, are described in the chapter three; segmentation of the images, through the Otsu method and morphological processing, explaining its formula and function in Matlab Software. The developing of the computational technics are described in chapter four , UROTEM, Thorax and Brain; a flow chart of each exam and the step by step procedure of the Matlab algorithm, which applied the segmentation and morphological processing in the images.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:57:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3231_1.pdf: 6436783 bytes, checksum: c662f8d8349c26c2ade3725340833a24 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Universidade Federal de Pernambuco / A telemedicina é uma alternativa importante no cuidado do paciente e vem sendo utilizada na prestação de assistência e na educação na área médica. Uma análise comparativa entre os métodos mais utilizados na telemedicina e aqueles utilizados na tele-educação evidencia que potencialidades como a utilização de ambientes virtuais para realização de trabalhos colaborativos a distância ainda não são bem exploradas pela área da saúde. Dentre as técnicas de diagnóstico, o diagnóstico por imagem vem se destacando como uma excelente ferramenta para a descoberta de doenças. As imagens médicas possuem a capacidade de fornecer muitas informações relativas à saúde do paciente, documentando o que está acontecendo em seu corpo, reduzindo a subjetividade dos diagnósticos e oferecendo maior precisão aos tratamentos invasivos. Assim, é possível concluir que um ambiente virtual com finalidade de dar suporte ao diagnóstico médico, deve ter entre seus componentes básicos, recursos para armazenamento, manipulação e transferência de imagens. Com o objetivo de oferecer ao sistema de saúde recursos para realização de atividades multiprofissionais para o diagnóstico remoto, foi desenvolvido um ambiente virtual colaborativo integrado a ferramentas de manipulação de imagens. O sistema consiste em um ambiente virtual para interação entre pessoas para viabilizar meios eficientes para o estudo de casos clínicos e o diagnóstico médico. Assim, o sistema: i) permite que dados sobre o paciente e suas eventuais doenças sejam persistidos na base de dados para que profissionais possam acessá-los e usá-los para fundamentar os laudos, cujos resultados podem ser inseridos no próprio ambiente; ii) disponibiliza o atendimento virtual de pacientes através de recursos como chat e envio de mensagens; iii) viabiliza recursos para a definição de diagnósticos através da interação de multiprofissionais em uma rede de trabalho cooperativa; e iv) habilita o acesso de seus usuários ao banco de imagens de exames, para fundamentar o diagnóstico ou o treinamento de profissionais. Foram desenvolvidos e propostos métodos de implementação para persistência e manipulações de imagens no padrão DICOM 3.0, protocolo utilizado mundialmente para armazenamento e transmissão de imagens médicas. Também, foram integrados ao ambiente, recursos para o processamento de imagens para que essas pudessem ser trabalhadas para atenderem análises diagnósticas específicas. A disponibilização de recursos que permitem a definição de diagnósticos através da colaboração de multiprofissionais é uma importante contribuição deste trabalho, pois os sistemas de informação que trabalham com imagens médicas, em geral, não disponibilizam tais recursos. As ferramentas que permitem que discussões clínicas sejam realizadas estimulam o compartilhamento entre diferentes profissionais, localizados remotamente, expandindo os limites da colaboração. Os recursos para o trabalho colaborativo que compõem o sistema podem ser utilizados para que os profissionais possam solucionar problemas cognitivos de forma qualitativamente diferente do que teriam realizado individualmente. A ferramenta para processamento de imagens integrada ao AV permitiu a expansão de suas funcionalidades, permitindo que técnicas de realce de imagens pudessem ser utilizadas no processo de diagnóstico.

This dissertation thesis is focused on the optimization of bandwidth parameters for the transport of medical image data between medical devices and remote data storage. As real and fully functional structure, which will be analyzed in this work. It was selected system MeDiMed (Metropolitan Digital Imaging System in Medicine). The thesis examines the operation of the small health organizations and their modalities, which use this system for remote data archiving. Traffic analysis is then statistically processed. The thesis also deals with the analysis of increasing the security during accessing health system, and assesses its impact on transmitted data. The effect of setting the transmission parameters and the most widely used types of ciphers on the transfer speed is also compared.

Este trabalho apresenta o estudo e implementação de um sistema para vinculação e visualização de imagens de ressonância magnética nuclear e tomografia computadorizada a partir de um sistema de informação em radiologia (RIS), possibilitando a recuperação e disponibilização dos exames (laudos e imagens), através de rede \"ethernet\", para visualização a partir de uma interface desenvolvida para \"browser\". Os exames podem ser recuperados através do número de registro (RGHC) ou do nome do paciente. As imagens utilizadas no trabalho estão nos padrões DICOM 3.0 (Digital Imaging and Communications in Medicine) e JPEG (Joint Photographic Experts Group). Para a vinculação dos exames que possuem suas imagens em JPEG foi desenvolvida uma interface para inclusão das informações necessárias que garantem a consistência deste processo. Para os exames que possuem suas imagens em formato DICOM 3.0 as informações foram extraídas automaticamente dos cabeçalhos e armazenadas no banco de dados. O sistema possui uma interface amigável ao usuário, podendo ser rapidamente incorporada ao projeto de um PACS (Picture Archiving and Communication System). A implementação foi idealizada para servir ao Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (HCFMRP/USP), com base no seu sistema de informação em radiologia. Os resultados demonstram que o tempo de retorno das imagens é clinicamente satisfatório e considerado bom pela avaliação qualitativa dos médicos. / This work presents the study and implementation of a system aiming the indexing and visualization of the images of nuclear magnetic resonance and computerized tomography from a radiology information system (RIS), allowing the retrieval and availability of the exams (results and images), through an ethernet net for visualization beginning with an interface developed to a browser. The exams may be recovered either through their register number (RGHC) or the patient\'s name. The images employed in the work follow the DICOM 3.0 (Digital Imaging and Communications in Medicine) and JPEG (Joint Photographic Experts Group) patterns. For the indexing of the exams that present images in JPEG, an interface was developed to include the information required to guarantee the consistency of the process. For the exams presenting the DICOM 3.0 format, information was extracted automatically from the heading and filed in the database. The system has a friendly interface for the user, it may be rapidly incorporated to the project of an PACS (Picture Archiving and Communication System). The implementation was idealized to serve the Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, of the Universidade de São Paulo (HCFMRP/USP), based on its radiology information system (RIS). The results demonstrated that the time of retrieval of the images is satisfactory and considered good by evaluation qualified of the doctors.

Submitted by JOSIANE SANTOS DE OLIVEIRA (josianeso) on 2018-02-22T12:31:13Z No. of bitstreams: 1 Euclides Palma Paim_.pdf: 2529933 bytes, checksum: 9c867ad7f5950b65e99f49343f096e8e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-22T12:31:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Euclides Palma Paim_.pdf: 2529933 bytes, checksum: 9c867ad7f5950b65e99f49343f096e8e (MD5) Previous issue date: 2017-10-31 / Nenhuma / Imagens médicas são usadas diariamente para apoio ao diagnóstico em diferentes áreas da Radiologia no mundo todo. Essas imagens seguem uma padronização internacional definida pela ISO 12052, conhecida como padrão DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine). Cada instituição que reivindica conformidade com esta norma, possui seus próprios serviços de armazenamento, sistemas de visualização e processamento específicos para esses dados. No entanto, há uma grande necessidade de que essas imagens sejam analisadas por diferentes especialistas, a fim de que cada caso possa ser discutido de forma ampla, na busca do melhor tratamento para cada patologia. A indisponibilidade de dados em tempo real para a avaliação médica especializada impacta direta e profundamente no sucesso terapêutico. O modelo de computação em nuvem tem as características necessárias para garantir que estas imagens se encontrem ao alcance dos profissionais mais recomendados para cada caso, aptos a oferecer o melhor atendimento. A grande quantidade de recursos disponíveis em nuvem, para lidar com esses dados de forma escalável, facilita a criação de uma infraestrutura para apoio ao diagnóstico à distância através de recursos de Telemedicina. Tomando como base o paradigma computacional Publicar/Assinar, podemos estabelecer comunicação em tempo real para solucionar situações no campo da saúde, como comunicação entre hospitais ou clínicas e entre médicos, enfermeiros e especialistas envolvidos no diagnóstico. Em ambientes clínicos que lidam com transmissão massiva de imagens em alta resolução no padrão DICOM, bem como em ambientes com problemas de desempenho de rede, transmitir essas imagens em tempo hábil, armazenar e disponibilizar de forma segura é um problema sem solução espontânea. Dessa forma esse trabalho propõe uma arquitetura baseada em nuvem computacional, para coletar, comprimir, armazenar e recuperar dados utilizando o paradigma Publicar/Assinar e dois níveis de escalabilidade. O modelo PS2DICOM é estabelecido como um middleware que oferece recursos de infraestrutura na camada IaaS (Infrastructure as a Service), apoiando as tarefas de transmissão e armazenamento de arquivos dentro do padrão DICOM. O sistema oferece compactação dos dados com diferentes intensidades, conforme largura de banda disponível. O modelo PS2DICOM conta ainda com dois níveis de balanceamento de carga e com a elasticidade reativa oferecida pela infraestrutura. A pesquisa contribui ao apresentar uma arquitetura eficaz para otimizar tarefas de rede, capaz de ser adotada como solução ao desenvolver aplicações voltadas para nuvens computacionais aplicadas a saúde em futuras situações reais. A arquitetura foi testada utilizando um protótipo com módulos distintos, desenvolvidos para cada serviço específico oferecido e mostrou-se eficiente como solução para os problemas em questão. Seus detalhes são descritos nos capítulos seguintes, bem como sua implementação, que corrobora a viabilidade do modelo. / Medical images are used daily to support diagnosis in different areas of Radiology throughout the world. These images follow an international standardization defined by ISO 12052, known as DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine) standard. Each institution that claims compliance with this standard has its own storage services, visualization and processing systems specific to that data. However, there is a great need for these images to be analyzed by different specialists, so that each case can be discussed in a broad way, in the search for the best treatment for each pathology. The unavailability of real-time data for specialized medical evaluation has a direct and profound impact on therapeutic success. The cloud computing model has the necessary characteristics to ensure that these images are within the reach of the professionals most recommended for each case, able to offer the best service. The large amount of resources available in the cloud to handle this data in a scalable way facilitates the creation of an infrastructure to support remote diagnosis through Telemedicine resources. Based on the computational paradigm Publish/Subscribe, we can establish real-time communication to solve situations in the field of health, such as communication between hospitals or clinics and between doctors, nurses and experts involved in the diagnosis. In clinical environments that deal with massive transmission of high resolution images in the DICOM standard, as well as in environments with network performance problems, transmitting these images in a timely manner, storing and making them available securely is a problem without a spontaneous solution. In this way, this work proposes a computational cloud-based architecture to collect, compress, store and retrieve data using the Publish/Subscribe paradigm and two levels of scalability. The PS2DICOM model is established as a middleware that provides infrastructure resources in the IaaS (Infrastructure as a Service) layer, supporting the tasks of transmitting and storing files within the DICOM standard. The system offers data compression with different intensities, depending on available bandwidth. The PS2DICOM model also has two levels of load balancing and the reactive elasticity offered by the infrastructure. The research contributes to presenting an efficient architecture to optimize network tasks, capable of being adopted as a solution when developing applications focused on computational clouds applied to health in future real situations. The architecture was tested using a prototype with distinct modules, developed for each specific service offered and proved to be efficient as a solution to the problems in question. Its details are described in the following chapters, as well as its implementation, which corroborates the viability of the model.

Neste trabalho é apresentada a implantação de um servidor de imagens médicas com a implementação e integração de módulos para recuperação textual e baseada em conteúdo para o Serviço de Radiodiagnóstico do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (HCFMRP) da Universidade de São Paulo (USP). O sistema permite a aquisição, gerenciamento, armazenamento e disponibilização das informações dos pacientes, seus exames, laudos e imagens através da internet. Os exames radiológicos e suas respectivas imagens podem ser recuperados por informações textuais ou por similaridade do conteúdo pictório das imagens. As imagens utilizadas são de ressonância magnética nuclear e tomografia computadorizada e são geradas no padrão DICOM 3.0. O sistema foi desenvolvido contemplando tecnologias para Web com interfaces amigáveis para recuperação das informações. Ele é composto por três módulos integrados, sendo o servidor de imagens, o módulo de consulta textual e o módulo de consulta por similaridade. Os resultados apresentados indicam que as imagens são gerenciadas e armazenadas corretamente, bem como o tempo de retorno das imagens é clinicamente satisfatório, tanto para a consulta textual como para a consulta por similaridade. As avaliações da recuperação por similaridade apresentam que o extrator escolhido pode ser considerado relevante para separar as imagens por região anatômica. / This work introduces an the development of a server of medical images with the implementation and integration of modules to query/retrieve text information and content-based to Radiology Service of Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (HCFMRP) at Universidade de São Paulo (USP). The system allows the acquisition, management, archiving and availability of the patients information, theirs exams, results and images through of internet. The radiological exams and theirs respectives images can be retrieved by text information or similarity of pictorial content of images. Images are from magnetic resonance nuclear and computadorized tomography and are given using DICOM 3.0 protocol. The system has been developed considering web technologies with friendly interfaces to retrieval of information. It is composed by three integrated modules: the image server module, the query text module and query by similarity module. Results show that images are managed and archived exactly, retrieval time of images is clinically satisfactory, considering both the text query as well as the query by similarity. The evaluation of the retrieval by similarity shows the chosen extractor can be considerated relevant to separate the images by anatomic region.

Modern surgery of the 21st century relies in many aspects on computers or, in a wider sense, digital data processing. Department administration, OR scheduling, billing, and - with increasing pervasion - patient data management are performed with the aid of so called Surgical Information Systems (SIS) or, more general, Hospital Information Systems (HIS). Computer Assisted Surgery (CAS) summarizes techniques which assist a surgeon in the preparation and conduction of surgical interventions. Today still predominantly based on radiology images, these techniques include the preoperative determination of an optimal surgical strategy and intraoperative systems which aim at increasing the accuracy of surgical manipulations. CAS is a relatively young field of computer science. One of the unsolved "teething troubles" of CAS is the absence of technical standards for the interconnectivity of CAS system. Current CAS systems are usually "islands of information" with no connection to other devices within the operating room or hospital-wide information systems. Several workshop reports and individual publications point out that this situation leads to ergonomic, logistic, and economic limitations in hospital work. Perioperative processes are prolonged by the manual installation and configuration of an increasing amount of technical devices. Intraoperatively, a large amount of the surgeons' attention is absorbed by the requirement to monitor and operate systems. The need for open infrastructures which enable the integration of CAS devices from different vendors in order to exchange information as well as commands among these devices through a network has been identified by numerous experts with backgrounds in medicine as well as engineering. This thesis contains two approaches to the integration of CAS systems: - For perioperative data exchange, the specification of new data structures as an amendment to the existing DICOM standard for radiology image management is presented. The extension of DICOM towards surgical application allows for the seamless integration of surgical planning and reporting systems into DICOM-based Picture Archiving and Communication Systems (PACS) as they are installed in most hospitals for the exchange and long-term archival of patient images and image-related patient data. - For the integration of intraoperatively used CAS devices, such as, e.g., navigation systems, video image sources, or biosensors, the concept of a surgical middleware is presented. A c++ class library, the TiCoLi, is presented which facilitates the configuration of ad-hoc networks among the modules of a distributed CAS system as well as the exchange of data streams, singular data objects, and commands between these modules. The TiCoLi is the first software library for a surgical field of application to implement all of these services. To demonstrate the suitability of the presented specifications and their implementation, two modular CAS applications are presented which utilize the proposed DICOM extensions for perioperative exchange of surgical planning data as well as the TiCoLi for establishing an intraoperative network of autonomous, yet not independent, CAS modules. / Die moderne Hochleistungschirurgie des 21. Jahrhunderts ist auf vielerlei Weise abhängig von Computern oder, im weiteren Sinne, der digitalen Datenverarbeitung. Administrative Abläufe, wie die Erstellung von Nutzungsplänen für die verfügbaren technischen, räumlichen und personellen Ressourcen, die Rechnungsstellung und - in zunehmendem Maße - die Verwaltung und Archivierung von Patientendaten werden mit Hilfe von digitalen Informationssystemen rationell und effizient durchgeführt. Innerhalb der Krankenhausinformationssysteme (KIS, oder englisch HIS) stehen für die speziellen Bedürfnisse der einzelnen Fachabteilungen oft spezifische Informationssysteme zur Verfügung. Chirurgieinformationssysteme (CIS, oder englisch SIS) decken hierbei vor allen Dingen die Bereiche Operationsplanung sowie Materialwirtschaft für spezifisch chirurgische Verbrauchsmaterialien ab. Während die genannten HIS und SIS vornehmlich der Optimierung administrativer Aufgaben dienen, stehen die Systeme der Computerassistierten Chirugie (CAS) wesentlich direkter im Dienste der eigentlichen chirugischen Behandlungsplanung und Therapie. Die CAS verwendet Methoden der Robotik, digitalen Bild- und Signalverarbeitung, künstlichen Intelligenz, numerischen Simulation, um nur einige zu nennen, zur patientenspezifischen Behandlungsplanung und zur intraoperativen Unterstützung des OP-Teams, allen voran des Chirurgen. Vor allen Dingen Fortschritte in der räumlichen Verfolgung von Werkzeugen und Patienten ("Tracking"), die Verfügbarkeit dreidimensionaler radiologischer Aufnahmen (CT, MRT, ...) und der Einsatz verschiedener Robotersysteme haben in den vergangenen Jahrzehnten den Einzug des Computers in den Operationssaal - medienwirksam - ermöglicht. Weniger prominent, jedoch keinesfalls von untergeordnetem praktischen Nutzen, sind Beispiele zur automatisierten Überwachung klinischer Messwerte, wie etwa Blutdruck oder Sauerstoffsättigung. Im Gegensatz zu den meist hochgradig verteilten und gut miteinander verwobenen Informationssystemen für die Krankenhausadministration und Patientendatenverwaltung, sind die Systeme der CAS heutzutage meist wenig oder überhaupt nicht miteinander und mit Hintergrundsdatenspeichern vernetzt. Eine Reihe wissenschaftlicher Publikationen und interdisziplinärer Workshops hat sich in den vergangen ein bis zwei Jahrzehnten mit den Problemen des Alltagseinsatzes von CAS Systemen befasst. Mit steigender Intensität wurde hierbei auf den Mangel an infrastrukturiellen Grundlagen für die Vernetzung intraoperativ eingesetzter CAS Systeme miteinander und mit den perioperativ eingesetzten Planungs-, Dokumentations- und Archivierungssystemen hingewiesen. Die sich daraus ergebenden negativen Einflüsse auf die Effizienz perioperativer Abläufe - jedes Gerät muss manuell in Betrieb genommen und mit den spezifischen Daten des nächsten Patienten gefüttert werden - sowie die zunehmende Aufmerksamkeit, welche der Operateur und sein Team auf die Überwachung und dem Betrieb der einzelnen Geräte verwenden muss, werden als eine der "Kinderkrankheiten" dieser relativ jungen Technologie betrachtet und stehen einer Verbreitung über die Grenzen einer engagierten technophilen Nutzergruppe hinaus im Wege. Die vorliegende Arbeit zeigt zwei parallel von einander (jedoch, im Sinne der Schnittstellenkompatibilität, nicht gänzlich unabhängig voneinander) zu betreibende Ansätze zur Integration von CAS Systemen. - Für den perioperativen Datenaustausch wird die Spezifikation zusätzlicher Datenstrukturen zum Transfer chirurgischer Planungsdaten im Rahmen des in radiologischen Bildverarbeitungssystemen weit verbreiteten DICOM Standards vorgeschlagen und an zwei Beispielen vorgeführt. Die Erweiterung des DICOM Standards für den perioperativen Einsatz ermöglicht hierbei die nahtlose Integration chirurgischer Planungssysteme in existierende "Picture Archiving and Communication Systems" (PACS), welche in den meisten Fällen auf dem DICOM Standard basieren oder zumindest damit kompatibel sind. Dadurch ist einerseits der Tatsache Rechnung getragen, dass die patientenspezifische OP-Planung in hohem Masse auf radiologischen Bildern basiert und andererseits sicher gestellt, dass die Planungsergebnisse entsprechend der geltenden Bestimmungen langfristig archiviert und gegen unbefugten Zugriff geschützt sind - PACS Server liefern hier bereits wohlerprobte Lösungen. - Für die integration intraoperativer CAS Systeme, wie etwa Navigationssysteme, Videobildquellen oder Sensoren zur Überwachung der Vitalparameter, wird das Konzept einer "chirurgischen Middleware" vorgestellt. Unter dem Namen TiCoLi wurde eine c++ Klassenbibliothek entwickelt, auf deren Grundlage die Konfiguration von ad-hoc Netzwerken während der OP-Vorbereitung mittels plug-and-play Mechanismen erleichtert wird. Nach erfolgter Konfiguration ermöglicht die TiCoLi den Austausch kontinuierlicher Datenströme sowie einzelner Datenpakete und Kommandos zwischen den Modulen einer verteilten CAS Anwendung durch ein Ethernet-basiertes Netzwerk. Die TiCoLi ist die erste frei verfügbare Klassenbibliothek welche diese Funktionalitäten dediziert für einen Einsatz im chirurgischen Umfeld vereinigt. Zum Nachweis der Tauglichkeit der gezeigten Spezifikationen und deren Implementierungen, werden zwei modulare CAS Anwendungen präsentiert, welche die vorgeschlagenen DICOM Erweiterungen zum perioperativen Austausch von Planungsergebnissen sowie die TiCoLi zum intraoperativen Datenaustausch von Messdaten unter echzeitnahen Anforderungen verwenden.

Este trabalho apresenta o estudo e implementação de um sistema para vinculação e visualização de imagens de ressonância magnética nuclear e tomografia computadorizada a partir de um sistema de informação em radiologia (RIS), possibilitando a recuperação e disponibilização dos exames (laudos e imagens), através de rede \"ethernet\", para visualização a partir de uma interface desenvolvida para \"browser\". Os exames podem ser recuperados através do número de registro (RGHC) ou do nome do paciente. As imagens utilizadas no trabalho estão nos padrões DICOM 3.0 (Digital Imaging and Communications in Medicine) e JPEG (Joint Photographic Experts Group). Para a vinculação dos exames que possuem suas imagens em JPEG foi desenvolvida uma interface para inclusão das informações necessárias que garantem a consistência deste processo. Para os exames que possuem suas imagens em formato DICOM 3.0 as informações foram extraídas automaticamente dos cabeçalhos e armazenadas no banco de dados. O sistema possui uma interface amigável ao usuário, podendo ser rapidamente incorporada ao projeto de um PACS (Picture Archiving and Communication System). A implementação foi idealizada para servir ao Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (HCFMRP/USP), com base no seu sistema de informação em radiologia. Os resultados demonstram que o tempo de retorno das imagens é clinicamente satisfatório e considerado bom pela avaliação qualitativa dos médicos. / This work presents the study and implementation of a system aiming the indexing and visualization of the images of nuclear magnetic resonance and computerized tomography from a radiology information system (RIS), allowing the retrieval and availability of the exams (results and images), through an ethernet net for visualization beginning with an interface developed to a browser. The exams may be recovered either through their register number (RGHC) or the patient\'s name. The images employed in the work follow the DICOM 3.0 (Digital Imaging and Communications in Medicine) and JPEG (Joint Photographic Experts Group) patterns. For the indexing of the exams that present images in JPEG, an interface was developed to include the information required to guarantee the consistency of the process. For the exams presenting the DICOM 3.0 format, information was extracted automatically from the heading and filed in the database. The system has a friendly interface for the user, it may be rapidly incorporated to the project of an PACS (Picture Archiving and Communication System). The implementation was idealized to serve the Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, of the Universidade de São Paulo (HCFMRP/USP), based on its radiology information system (RIS). The results demonstrated that the time of retrieval of the images is satisfactory and considered good by evaluation qualified of the doctors.

Neste trabalho é apresentada a implantação de um servidor de imagens médicas com a implementação e integração de módulos para recuperação textual e baseada em conteúdo para o Serviço de Radiodiagnóstico do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (HCFMRP) da Universidade de São Paulo (USP). O sistema permite a aquisição, gerenciamento, armazenamento e disponibilização das informações dos pacientes, seus exames, laudos e imagens através da internet. Os exames radiológicos e suas respectivas imagens podem ser recuperados por informações textuais ou por similaridade do conteúdo pictório das imagens. As imagens utilizadas são de ressonância magnética nuclear e tomografia computadorizada e são geradas no padrão DICOM 3.0. O sistema foi desenvolvido contemplando tecnologias para Web com interfaces amigáveis para recuperação das informações. Ele é composto por três módulos integrados, sendo o servidor de imagens, o módulo de consulta textual e o módulo de consulta por similaridade. Os resultados apresentados indicam que as imagens são gerenciadas e armazenadas corretamente, bem como o tempo de retorno das imagens é clinicamente satisfatório, tanto para a consulta textual como para a consulta por similaridade. As avaliações da recuperação por similaridade apresentam que o extrator escolhido pode ser considerado relevante para separar as imagens por região anatômica. / This work introduces an the development of a server of medical images with the implementation and integration of modules to query/retrieve text information and content-based to Radiology Service of Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (HCFMRP) at Universidade de São Paulo (USP). The system allows the acquisition, management, archiving and availability of the patients information, theirs exams, results and images through of internet. The radiological exams and theirs respectives images can be retrieved by text information or similarity of pictorial content of images. Images are from magnetic resonance nuclear and computadorized tomography and are given using DICOM 3.0 protocol. The system has been developed considering web technologies with friendly interfaces to retrieval of information. It is composed by three integrated modules: the image server module, the query text module and query by similarity module. Results show that images are managed and archived exactly, retrieval time of images is clinically satisfactory, considering both the text query as well as the query by similarity. The evaluation of the retrieval by similarity shows the chosen extractor can be considerated relevant to separate the images by anatomic region.

This thesis deals with the segmentation of lung parenchyma and extraction of airways tree from three dimensional CT scans. The external mask of the lungs is created and subsequently used to ease the process of airway segmentation. In this work, some published methods for airways segmentation are described with focus on one, which is described more in detail and also implemented in MATLAB. The proposed approach is based on morphological grayscale reconstruction. Method is tested on the real patient CT scans and finally, the results are discussed.