ABSTRACT This dissertation examines the years 1980-2000 as a sociologically transformative period in Boston's history. The guiding research question is how organized politics and the policies that emerged responded to racial conflict, inequality and economic development, and wholesale change in the city's economic base during this period. The policies of the three governing regimes--the end of Kevin H. White's sixteen-year term, Raymond L. Flynn's nine years in office, and the beginning of Thomas M. Menino's twenty-year mayoralty--are analyzed in the content of these domains to identify the outcomes of several policy agendas that have helped shape life in Boston today. This analysis is in the context of urbanization and urbanism, viewed through the lenses of urban regime, growth machine coalition, progressive city, and government communalism theories. The study utilizes retrospective autoethnography linked with interviews and archival data research. The study found that during the end of the mayoral administration of Kevin White, Boston was in turmoil politically and racially. Political contests centered on growing poverty and inequality and racial unrest in the city. The election of 1983 was a "critical election" both because an African American was in the final runoff and because the two finalists repudiated the growth machine coalition and the racial politics of the past. Flynn's election began the populist transformation of economic policies in Boston to heal racial divisions. After he resigned to become Ambassador to the Vatican, the urban regime of Thomas Menino left intact many of the redistributive policies Flynn enacted; however, it also gradually returned to the growth machine coalition model of economic development, fueling the greatest class and income inequality in Boston's history. In the final analysis, both the policies of each urban regime and the activities of the religious, cultural, business, and neighborhood organizations that comprise city life changed the city in sociologically significant ways. This is the story of Boston 1980-2000, the role of its three mayors during that period, and how the city entered the twenty-first century with its physical decline in part reversed but with issues of race and class remaining significant touchstones.

Nous présentons un nouveau formalisme et des nouvelles méthodes pour modéliser le déséquilibre de liaison et tenir compte de la structure en haplotypes pour les données issues de la génomique des populations. La modélisation repose sur un problème d'optimisation avec contraintes qui est résolue avec un algorithme de programmation dynamique. Les méthodes établies ont toutes l'avantage d'avoir un coût algorithmique linéaire et donc de pouvoir traiter de grands jeux de données.Dans un premier temps, nous avons appliqué notre approche à l'étude des populations métisses et plus particulièrement au problème d'inférence des coefficients de métissage locaux.Notre méthode a été appliquée à des génotypes simulés de métissage humain ainsi qu'à des vrais génotypes obtenus dans des populations métisses de peupliers.Dans un second temps, nous avons développé notre formalisme d'optimisation pour traiter de l'inférence des haplotypes à partir des génotypes d'une population.L'ensemble de ces méthodes d'optimisation a été développé dans un module Python qui s'appelle Loter. / We present a new formalism and new methods to model linkage disequilibrium and to account for haplotype structure of population genomics data. Modeling relies on an optimization problem with constraints that is solved using dynamic programming. The algorithmic cost of proposed methods is linear, which is a desirable property to process large datasets.First, we applied our framework to study admixed populations and perform local ancestry inference. Our method is applied to simulated genotypes of admixed human populations and to real genotypes from admixed Populus species.Second, we developed our optimization framework to perform haploptype phasing and imputation based on a population of genotypes. All optimization methods have been developed in a Python package called Loter.

Made available in DSpace on 2015-12-10T14:22:29Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-12. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:28:35Z : No. of bitstreams: 1 000850034.pdf: 1958965 bytes, checksum: 19fdba345238432739b0e6a6d3b2303a (MD5) / O melasma é uma hipermelanose focal e adquirida de curso crônico que afeta áreas fotoexpostas, especialmente, de mulheres em idade fértil. Diversos fatores contribuem para seu desenvolvimento: exposição solar, esteroides sexuais, medicamentos e história familiar. Recentemente, ancestralidade referida foi apontada como outro fator de risco. E este fato incentivou a investigação da ancestralidade relacionada ao melasma. O principal objetivo desse projeto foi avaliar a associação entre a ancestralidade genética e o melasma facial. Foi realizado um estudo transversal envolvendo mulheres portadoras de melasma facial e seu grupo controle, pareado por idade, entre pacientes do Hospital das Clínicas, FMB-Unesp, Botucatu (Brasil). Foram excluídos descendentes de asiáticos, portadores de outras dermatoses faciais e fototipos extremos (I e VI). Após inquérito de dados clínicos e demográficos, foi coletado swab da mucosa oral para posterior extração de DNA, e a partir deste material, realizada avaliação da ancestralidade genética por estudo de marcadores informativos de ancestralidade do tipo INDEL. Foram avaliadas 119 mulheres com melasma facial e seus 119 controles. A idade média do início do melasma ocorreu aos 27±8 anos. Gestação (40%), exposição solar (37%) e contraceptivo oral hormonal (22%) foram os fatores mais frequentemente relatados como desencadeantes. Todos os sujeitos apresentaram algum grau de miscigenação quanto à ancestralidade genética. Os componentes Ancestralidade e melasma facial Maria Paula Barbieri D'Elia 14 genéticos africano e europeu diferiram significativamente entre casos e controles (10% vs 6%; 77% vs 82%; p<0,05). O percentual de ancestralidade africana (OR=1,04), história familiar de primeiro grau (OR=3,04), baixa escolaridade (OR=4,04) e uso de antidepressivos entre indivíduos com familiares acometidos pelo melasma (OR=6,15) associaram-se à doença, independentemente dos demais fatores...

Submitted by DONICER EDUARDO MONTES VERGARA null (donicer.montes@unisucre.edu.co) on 2016-04-11T17:24:33Z No. of bitstreams: 1 H.Tese-Donicer- Defensa Definitivo -08-04-2016.pdf: 1794206 bytes, checksum: a97a3f4dcd0f3e1489260272006d51af (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-04-12T14:43:11Z (GMT) No. of bitstreams: 1 montesvergara_de_dr_jabo.pdf: 1794206 bytes, checksum: a97a3f4dcd0f3e1489260272006d51af (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-12T14:43:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 montesvergara_de_dr_jabo.pdf: 1794206 bytes, checksum: a97a3f4dcd0f3e1489260272006d51af (MD5) Previous issue date: 2016-03-24 / Características reprodutivas, como a ocorrência de prenhez precoce, são mais importantes economicamente ao comparar-se com as características de crescimento. Desta forma, o aumento da taxa de fertilidade e emprego de animais geneticamente superiores é determinante no progresso da produtividade nas fazendas comerciais de produção de carne bovina. A seleção modifica as frequências alélicas de uma população ao transmitir as variantes gênicas mais interessantes. Considerando o desequilíbrio de ligação, alguns locos adjacentes às mutações favoráveis são transmitidos ao longo das gerações. Estes são conhecidos como assinaturas de seleção e podem ser identificados com o uso de “chips” de SNP e metodologias estatísticas adequadas. Com o objetivo de identificar assinaturas de seleção recentes em QTL previamente mapeados para características reprodutivas de fêmeas bovinas ligadas à precocidade sexual, foram genotipadas 2.035 fêmeas da raça Nelore (Bos taurus indicus) com o chip “Illumina BovineHD BeadChip”. Posteriormente foi inferida a fase de ligação dos SNPs e a reconstrução dos haplótipos. A detecção de assinaturas de seleção foi realizada por meio da aplicação da metodologia “Relative Extended Haplotype Homozygosity” (REHH). A identificação de genes que contribuem para a importância da característica nestas regiões foi feita com a ferramenta Map Viewer do “National Center for Biotechnology Information”- NCBI e GBrowse carregada com o genoma bovino versão UMD 3.1. Foram detectadas 2.756 regiões núcleo, com tamanho médio 27,6 ± 29,1 Kb, abrangendo 70,1 Mb dos 25 cromossomos estudados. Dos SNPs utilizados, 17.312 participaram da formação das regiões núcleo, com o mínimo de 10 no BTA27 e o máximo de 20 SNPs nos cromossomos 1, 3-7, 9-15,18-21, e 23-24. Foram identificadas 40 assinaturas de seleção recentes com diferentes níveis de significância e 56 genes A maioria dos genes localizados nas regiões de assinaturas de seleção tem relação com os processos biológicos de metabolismo mitocondrial, desenvolvimento pós-embrionário, regulação da taxa de ovulação e fertilidade, resposta imune, metabolismo de triglicerídeo, proliferação celular e neurônios receptores olfativos. A investigação de mecanismos regulatórios da expressão dos genes associados aos processos biológicos descritos pode oferecer conhecimentos sobre os mecanismos moleculares que afetam a característica ocorrências de prenhez precoce, na raça Nelore. / Some reproductive traits such as early pregnancy are more profitable than those related to growth. Increasing fertility rate and using genetically superior animals are crucial in productivity of meat commercial farms. Artificial selection modifies allele frequencies of a cattle population by transmitting the most significant gene variants. Considering linkage disequilibrium, some loci adjacent to favorable mutations are transmitted across generations. Known as signatures of selection, such locations can be identified by the SNP chips, and appropriate statistical methods. To determine recent selection signature in quantitative trait loci (QTL) previously mapped for reproductive cow features linked to sexual precocity, 2,035 Nelore (Bos taurus indicus) females were genotyped by Illumina Bovine chip. After, inferring the connection phase of SNPs allowed haplotype reconstruction. Selection signatures were detected by Relative Extended Haplotype Homozygosity (REHH) method. Genes supposedly important were recognized by Map Viewer from the National Center for Biotechnology Information (NCBI), and also through a loaded GBrowse with bovine genome UMD, version 3.1. A total of 2,756 core regions were detected, with an average size of 27.6 ± 29.1 Kb, covering 70.1 Mb of 25 chromosomes. 17,312 SNPs are involved in the formation of core regions with at least 10 on BTA27, and a maximum of 20 SNPs on 1, 3-7, 9-15, 18-21, and 23-24 chromosomes. We identify 40 possible recent selection signatures, with different levels of significance, and 56 positional candidate genes. Most of genes located in selection signature regions are related to biological processes of mitochondrial metabolism, post-embryonic development, ovulation rate regulation and fertility, immune response, triglyceride metabolism, cell proliferation, and olfactory receptor neurons. The investigation of regulatory mechanisms of gene expression associated with biological processes described can provide knowledge on the molecular mechanisms affecting characteristic of early pregnancy occurrences in Nellore.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-01-07Bitstream added on 2014-06-13T20:23:21Z : No. of bitstreams: 1 espindola_smcg_dr_jabo.pdf: 360908 bytes, checksum: 4d6651892be89ff6a6c3957a8387c0d9 (MD5) / Atualmente, a soja destaca-se como a mais importante oleaginosa cultivada no mundo. Os investimentos em pesquisa levaram à tropicalização da soja, permitindo, pela primeira vez na história, que o grão fosse plantado com sucesso, em regiões de baixas latitudes, entre o Trópico de Capricórnio e a linha do Equador. Em função disso tem-se buscado o desenvolvimento de genótipos com ampla adaptabilidade, o que implica em uma baixa interação genótipo x ambiente. O entendimento do tipo de interação permite um melhor posicionamento e indicação de regiões de plantio da cultivar em questão facilitando o trabalho do melhorista. A presença desse fenômeno pode acarretar uma redução da produtividade global de uma área para a qual se faça uma indicação geral de uma dada cultivar. Por outro lado, pode-se tirar proveito de sua existência usando-se procedimentos estatísticos que identifiquem o padrão dessa interação, e gerem informações que possibilitem o agrupamento de locais em zonas dentro das quais a magnitude da interação não seja significativa, permitindo indicações específicas de cultivares para tais zonas. O uso de ferramentas moleculares tem se apresentado como uma opção para seleção de características com base no genótipo e eliminando assim o efeito do ambiente na expressão da característica em questão. O melhoramento assistido por marcadores moleculares tem sido tema de inúmeros trabalhos de seleção assistida, cujos resultados variam de concretos e positivos a controversos e pouco significativos em termos de ganhos genéticos, econômicos e eficiência, quando comparados com a seleção fenotípica. Os capítulos seguintes permitem apresentar resultados de metodologias moleculares e convencionais aplicadas em um programa de melhoramento para seleção de genótipos superiores de soja. / Nowadays, soybean highlights as the most important oilseed cultivated in the world. The investments in research led to soybean “tropicalization”, allowing, for the first time in history, that the grain was seeded with success, in low latitudes, between the tropic of Capricorn and the Equator. Due to this, researchers have tried to develop wide adaptability genotypes, which implies in a low genotype x environment interaction. The comprehension of the type of interaction allows a better placement and indications of cultivar planting regions, facilitating the breeder’s work. The presence of this phenomenon may result in a global productivity decrease of an area that make up an overall indication of a given cultivar. On the other hand, it is possible to take advantage of their existence using statistical procedures to identify the pattern of this interaction, and generate information that allow the grouping of local areas within which the magnitude of the interaction is not significant. Specific cultivar indication for these zones. The use o molecular tools have shown as an option for characteristics selection base on genotype and then eliminating the environment effect in the expression of the characteristic in question. The molecular marker-assisted breeding has been the subject of numerous works assisted selection, whose results varies from concrete and positive to controversial and little significant in terms of genetic gains, and economic efficiency compared to phenotypic selection. The following chapters present results provide molecular and conventional methodologies applied in a breeding program for superior genotypes selection.

Orientador: Leila Trevisan Braz / Banca: José Carlos Barbosa / Banca: Renata Castoldi / Resumo: A alface (Lactuca sativa L.) vem sendo cultivada por longos períodos desde a antiguidade. É considerada a mais importante hortaliça folhosa. É consumida na dieta brasileira, principalmente na forma de saladas cruas, devido a suas boas propriedades organolépticas. O presente trabalho objetivou avaliar o desempenho agronômico de oito linhagens e duas cultivares comerciais do Programa de Melhoramento Genético de Alface da UNESP - FCAV. As linhagens Jab 1, Jab 2, Jab 3, Jab 4, Jab 5, Jab 6, Jab 7 e Jab 8, e as cultivares de alfacecrespa Vanda e Vera foram avaliadas no município de Igarapava-SP, no período outono-inverno, em três sistemas de cultivo: Campo aberto, casa de vegetação tipo guarda-chuva e sombreado. Foram instalados três experimentos (ambientes de cultivo), em delineamento de blocos casualizados, com dez tratamentos (linhagens e cultivares) e quatro repetições. Foram avaliadas as características: diâmetro do caule, comprimento do caule, massa fresca total, número de folhas comerciais, massa das folhas comerciais e volume. Os resultados foram submetidos à análise conjunta, e as médias, comparadas pelo teste de Scott e Knott, ao nível de 5% de probabilidade. Não foram detectadas interações significativas para todas as características avaliadas. Os genótipos Jab 5 e Jab 6 destacaram-se por apresentarem os maiores volumes de planta, sendo superiores às demais linhagens e às cultivares comerciais Vera e Vanda. Os ambientes campo aberto e casa de vegetação tipo guarda-chuva... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Lettuce (Lactuca sativa L.) has been cultivated for long a long time, since the antiquity. It's considered the most important leafy vegetable. It's consumed on Brazilian diet, mainly in fresh salads, due its good organoleptic properties. This work aimed to evaluate the agronomic behavior of eight lettuce strains and two commercial cultivars Breeding Program at UNESP - FCAV. The genotypes Jab 1, Jab 2, Jab 3, Jab 4, Jab 5, Jab 6, Jab 7, and Jab 8 and the crispy loose-leaf cultivars Vanda and Vera were assessed at Igarapava County, SP, during the fall-winter period in three cropping systems: Field, "Umbrella" greenhouse and shaded greenhouse. It was carried out three experiments (cropping systems) in randomized blocks design, with ten treatments (genotypes and cultivars) with four replications. The results were submitted to joint analysis and means compared by test of ScottKnott, at level of 5% of probability. It was assessed the following characteristics: stem diameter, stem length, total fresh mass, number of commercial leaves, commercial leaf mass, and volume. There were not significant interactions to all evaluated traits. The genotypes Jab 5 and Jab 6 highlighted from the others, even than the cultivars Vera and Vanda, due to the higher volume. The environments field and "umbrella" greenhouse were the most suitable for all characters, except to stem diameter, which did not present significant difference to all the evaluated environments. / Mestre

Orientador: Hélio Amante Miot / Banca: Marcelo Távora Mira / Banca: Edileia Bagatin / Resumo: O melasma é uma hipermelanose focal e adquirida de curso crônico que afeta áreas fotoexpostas, especialmente, de mulheres em idade fértil. Diversos fatores contribuem para seu desenvolvimento: exposição solar, esteroides sexuais, medicamentos e história familiar. Recentemente, ancestralidade referida foi apontada como outro fator de risco. E este fato incentivou a investigação da ancestralidade relacionada ao melasma. O principal objetivo desse projeto foi avaliar a associação entre a ancestralidade genética e o melasma facial. Foi realizado um estudo transversal envolvendo mulheres portadoras de melasma facial e seu grupo controle, pareado por idade, entre pacientes do Hospital das Clínicas, FMB-Unesp, Botucatu (Brasil). Foram excluídos descendentes de asiáticos, portadores de outras dermatoses faciais e fototipos extremos (I e VI). Após inquérito de dados clínicos e demográficos, foi coletado swab da mucosa oral para posterior extração de DNA, e a partir deste material, realizada avaliação da ancestralidade genética por estudo de marcadores informativos de ancestralidade do tipo INDEL. Foram avaliadas 119 mulheres com melasma facial e seus 119 controles. A idade média do início do melasma ocorreu aos 27±8 anos. Gestação (40%), exposição solar (37%) e contraceptivo oral hormonal (22%) foram os fatores mais frequentemente relatados como desencadeantes. Todos os sujeitos apresentaram algum grau de miscigenação quanto à ancestralidade genética. Os componentes Ancestralidade e melasma facial Maria Paula Barbieri D'Elia 14 genéticos africano e europeu diferiram significativamente entre casos e controles (10% vs 6%; 77% vs 82%; p<0,05). O percentual de ancestralidade africana (OR=1,04), história familiar de primeiro grau (OR=3,04), baixa escolaridade (OR=4,04) e uso de antidepressivos entre indivíduos com familiares acometidos pelo melasma (OR=6,15) associaram-se à doença, independentemente dos demais fatores... / Abstract: Not available / Mestre

A síndrome de Marfan (MFS) é uma doença autossômica dominante do tecido conjuntivo que afeta o coração, vasos sanguíneos, pulmões, olhos, ossos e os ligamentos. Mutações no gene codificante da fibrilina 1 (FBN1) causam a síndrome de Marfan e doenças relacionadas do tecido conjuntivo. Fibrilina 1 é o componente principal das microfibrilas de 10-12nm encontradas na matriz extracelular (ECM). A ECM tem um papel estrutural na organização específica do tecido e participa na regulação de várias citocinas e fatores de crescimento. Uma quantidade crescente de evidências demonstra um relacionamento entre fibrilina 1 e o receptor do fator de transformação do crescimento (TGF-). A Homologia entre fibrilina 1 e TGF- latente (LTGF) permite que os microfibrilas sirvam de reservatório para esta citocina. Recentemente foram descritos nos pacientes com MFS, mutações nos genes receptores I e II do TGF- (TGFBRI/II). O objetivo deste estudo foi analisar a heterogeneidade genética da síndrome de Marfan. Nós realizamos análises de ligação para 6 marcadores dos gene FBN1 e TGFBRII em 34 famílias e sequenciamos o TGFBRI e TGFBRII. A análise de ligação dos haplótipos em relação aos marcadores do gene FBN1 indicou co-segregação em 70,58%, exclusão em 17,64% e homozigozidade em 11,76%; em relação aos marcadores do gene TGFBRII indicou co-segregação em uma família. Conseguimos demonstrar a heterogeneidade de lócus e a utilidade do teste diagnóstico na assistência das famílias pré-sintomáticas com manifestações atípicas ou ambíguas da MFS. / Marfan syndrome is an autosomal dominant disorder of connective tissue that can affect the heart, blood vessels, lungs, eyes, bones, and ligaments. Mutations in the gene encoding fibrillin 1 (FBN1) cause Marfan syndrome (MFS), and related connective tissue disorders. Fibrillin-1 is the main component of the 10-12 nm microfibrils found in the extracellular matrix (ECM). ECM displays a structural role in the tissue-specific organization and takes part in the regulation of various cytokines and growth factors. A growing body of evidence supports a narrow relationship between fibrillin 1 and TGF-beta. Homology between fibrillin 1 and latent TGF-beta (LTGF) allows microfibrils to be a reservoir for this cytokine. Recently, mutations in the gene for transforming growth factor-beta (TGF-) receptor type I and II (TGFBRI/II) have been described in patients with MFS. The aim of this study was to analyze the genetic heterogeneity of Marfan syndrome. We have performed linkage analysis for 6 FBN1 and TGFBRII gene markers in 34 families and sequenced both TGFBRI and TGFBRII. The haplotype linkage analysis concerning the FBN1 gene markers indicated co-segregation at 70.58%, exclusion at 17.64% and homozygosity at 11.76%; in relation to the TGFBRII gene markers, it indicated co-segregation in one family. We were able to demonstrate the heterogeneity of locus and the utility of the diagnostic test in the assistance of the daily pre-symptomatic families with atypical or ambiguous manifestations of MFS.

A disponibilidade de grandes bases de dados informatizadas em saúde tornou a técnica de relacionamento de fontes de dados, também conhecida como linkage, uma alternativa para diferentes tipos de estudos. Esta técnica proporciona a geração de uma base de dados mais completa e de baixo custo operacional. Objetivo- Investigar a possibilidade de completar/aperfeiçoar as informações da base de dados do RCBP-SP, no período de 1997 a 2005, utilizando o processo de linkage com três outras bases, a saber: Programa de Aprimoramento de Mortalidade (PRO-AIM), Autorização e Procedimentos de Alta Complexidade (APAC-SIA/SUS) e Fundação Sistema Estadual de Análise de Dados (FSeade). Métodos- Neste estudo foi utilizada a base de dados do RCBP-SP, composta por 343.306 com casos incidentes de câncer do município de São Paulo, registrados no período de 1997 a 2005, com idades que variaram de menos de um a 106 anos, de ambos os sexos. Para a completitude das informações do RCBP-SP foram utilizadas as bases de dados, a saber: PRO-AIM, APAC-SIA/SUS e FSeade. Foram utilizadas as técnicas de linkage probabilística e determinística. O linkage probabilístico foi realizado pelo programa Reclink III versão 3.1.6. Quanto ao linkage determinístico as rotinas foram realizadas em Visual Basic, com as bases hospedadas em SQL Server. Foram calculados os coeficientes brutos de incidência (CBI) e mortalidade (CBM) antes e após o linkage. A análise de sobrevida global foi realizada pela técnica de Kaplan-Meier e para na comparação entre as curvas, utilizou-se o teste de log rank. Foram calculados os valores da área sob a curva, sensibilidade e especificidade para determinar o ponto de corte do escore de maior precisão na identificação dos pares verdadeiros. Resultados- Após o linkage, verificou-se um ganho de 101,5 por cento para a variável endereço e 31,5 por cento para a data do óbito e 80,0 por cento para a data da última informação. Quanto à variável nome da mãe, na base de dados do RCBP-SP antes do linkage esta informação representava somente 0,5 por cento , tendo sido complementada, no geral, em 76.332 registros. A análise de sobrevida global mostrou que antes do processo de linkage havia uma subestimação na probabilidade de estar vivo em todos os períodos analisados. No geral, para a análise de sobrevida truncada em sete anos, a probabilidade de estar vivo no primeiro ano de seguimento antes do linkage foi menor quando comparada a probabilidade de estar vivo ao primeiro ano de seguimento após o linkage (48,8 por cento x 61,1 por cento ; p< 0,001). Conclusão- A técnica de linkage tanto probabilística quanto determinística foi efetiva para completar/aperfeiçoar as informações da base de dados do RCBP-SP. Além do mais, o CBI apresentou um ganho de 3,4 por cento . Quanto ao CBM houve um ganho de 25,8 por cento . Após o uso da técnica de linkage, foi verificado que os valores para a sobrevida global estavam subestimados para ambos os sexos, faixas etárias e para as topografias de câncer / The availability of large computerized databases on health has enabled the record linkage technique, an alternative for different study designs. This technique provides the generation of a more complete database, at low operational cost. Objective to investigate the possibility of completing/improving information from the database of the RCBP-SP, in the period between 1997 and 2005, using the record linkage technique with other three databases, namely: Mortality Improvement Program (PRO-AIM), Authorization of Highly Complex Procedures (APAC-SIA/SUS) and State System of Data Analysis (FSeade), comparing different strategies. Methods In this study we used the database of the RCBP-SP composed of 343,306 incident cancer cases in the Municipality of São Paulo registered in the period between 1997 and 2005 with ages raging from under one to 106 years, from both sexes. To complete the database of the RCBP-SP three databases were used, namely: PRO-AIM, APAC-SIA/SUS and FSeade. Both probabilistic and deterministic record linkage were used. Probabilistic linkage was performed using the Reclink III software, version 3.1.6. As for the the deterministic record linkage, the routines were run in the Visual Basic and databases hosted on a SQL Server. Before and after record linkage, crude incidence (CIR) and mortality rates (CMR) were calculated. The overall survival analysis was performed using the Kaplan-Meier technique and for the comparison between curves, the log rank test was employed. In order to determine the most precise cut-off scores in identifying true matches, we calculated the area under the curve, as well as, sensitivity and specificity. Results After record linkage, it was verified a gain of 101.5 per cent for the variable address, 31.5 per cent for death date and 80,0 per cent for the date of latest information. As for the variable mother´s name, in the database of the RCBP-SP before record linkage, this information represented only 0.5 per cent , having been completed, in general, in 76,332 registries. The overall survival analysis showed that before the record linkage there was an underestimation of the probability of being alive for all periods assessed. In general, for the truncated survival at seven years, the probability of being alive at the first year of follow up before record linkage was lower when compared to the probability of being alive at the first year of follow up after record linkage (48.8 per cent x 61.1 per cent ; p< 0.001). Conclusion Both the probabilistic and deterministic record linkage were effective to complete/improve information from the database of the RCBP-SP. Moreover, the CIR had a gain of de 3.4 per cent . As for the CMR, there was a gain of 25.8 per cent . After using the record linkage technique, it was verified that values for overall survival were underestimated for both sexes, all age groups, and cancer sites

Real social graphs datasets are fundamental to understanding a variety of phenomena, such as epidemics, crowd management and political uprisings, yet releasing digital recordings of such datasets exposes the participants to privacy violations. A safer approach to making real social network topologies available is to anonymize them by modifying the graph structure enough as to decouple the node identity from its social ties, yet preserving the graph characteristics in aggregate. At scale, this approach comes with a significant challenge in computational complexity. This thesis questions the need to structurally anonymize very large graphs. Intuitively, the larger the graph, the easier for an individual to be “lost in the crowd”. On the other hand, at scale new topological structures may emerge, and those can expose individual nodes in ways that smaller structures do not. To answer this problem, this work introduces a set of metrics for measuring the indistinguishability of nodes in large-scale social networks independent of attack models and shows how different graphs have different levels of inherent indistinguishability of nodes. Moreover, we show that when varying the size of a graph, the inherent node indistinguishability decreases with the size of the graph. In other words, the larger a graph of a graph structure, the higher the indistinguishability of its nodes.