Li, Chi Pang. / Thesis (M.Phil.)--Chinese University of Hong Kong, 2010. / Includes bibliographical references (leaves 127-141). / Abstracts in English and Chinese. / Abstract --- p.i / Abstract (Chinese) --- p.iii / Acknowledgements --- p.v / Contents --- p.vi / List of Tables --- p.ix / List of Figures --- p.x / Chapter Chapter 1 --- General Introduction --- p.1 / Chapter Chapter 2 --- Literature Review --- p.3 / Chapter 2.1 --- Caridean phylogeny --- p.3 / Chapter 2.1.1 --- Informative morphological characters in Caridean shrimps --- p.3 / Chapter 2.1.2 --- Brief history of Caridean classifications --- p.4 / Chapter 2.1.3 --- Natantia/Reptantia scheme vs. Dendrobranchiata/Pleocyemata scheme --- p.8 / Chapter 2.2 --- Phylogney of the family Hippolytidae --- p.10 / Chapter 2.3 --- Molecular approach to phylogeny --- p.11 / Chapter 2.3.1 --- Use of molecular data --- p.11 / Chapter 2.3.2 --- Use of mitochondrial gene markers in crustaceans --- p.12 / Chapter 2.3.3 --- Use of nuclear gene markers in crustaceans --- p.14 / Chapter Chapter 3 --- Phylogeny of the Infraorder Caridea Based on five Nuclear Genes --- p.27 / Chapter 3.1 --- Introduction --- p.27 / Chapter 3.2 --- Materials and Methods --- p.28 / Chapter 3.2.1 --- Sample Collection --- p.28 / Chapter 3.2.2 --- DNA extraction and PCR amplification --- p.28 / Chapter 3.2.3 --- DNA sequencing --- p.29 / Chapter 3.2.4 --- Phylogenetic analysis --- p.30 / Chapter 3.3 --- Results --- p.34 / Chapter 3.3.1 --- Enolase --- p.34 / Chapter 3.3.2 --- NaK --- p.35 / Chapter 3.3.3 --- PEPCK --- p.37 / Chapter 3.3.4 --- Histone --- p.38 / Chapter 3.3.5 --- 18S rRNA --- p.39 / Chapter 3.3.6 --- Combined dataset --- p.41 / Chapter 3.3.7 --- Substitution saturation analysis --- p.43 / Chapter 3.4 --- Discussion --- p.44 / Chapter 3.4.1 --- Evaluation of the five nuclear gene markers --- p.44 / Chapter 3.4.1.1 --- Nuclear protein coding genes --- p.44 / Chapter 3.4.1.2 --- 18S rRNA --- p.81 / Chapter 3.4.2 --- Superfamilies and families --- p.82 / Chapter 3.4.2.1 --- Superfamilies --- p.82 / Chapter 3.4.2.2 --- Families --- p.86 / Chapter 3.4.3 --- Basal groups --- p.86 / Chapter 3.4.4 --- Procarididae --- p.88 / Chapter Chapter 4 --- Phylogeny of the family Hippolytidae --- p.90 / Chapter 4.1 --- Introduction --- p.90 / Chapter 4.2 --- Materials and Methods --- p.91 / Chapter 4.2.1 --- Sample Collection --- p.91 / Chapter 4.2.2 --- DNA extraction and PCR amplification --- p.91 / Chapter 4.2.3 --- DNA sequencing --- p.95 / Chapter 4.2.4 --- Phylogenetic analysis --- p.95 / Chapter 4.3 --- Results --- p.95 / Chapter 4.3.1 --- Enolase --- p.95 / Chapter 4.3.2 --- NaK --- p.98 / Chapter 4.3.3 --- 16S rRNA --- p.99 / Chapter 4.3.4 --- Combined dataset --- p.100 / Chapter 4.4 --- Discussion --- p.118 / Chapter 4.4.1 --- "Resurrection of family Lysmatidae Dana,1852" --- p.118 / Chapter 4.4.2 --- Other hippolytid clades --- p.120 / Chapter 4.4.2.1 --- """Hippolytidae""" --- p.120 / Chapter 4.4.2.2 --- Bythocarididae --- p.121 / Chapter 4.4.3 --- Superfamily Alpheoidea --- p.122 / Chapter Chapter 5 --- General Conclusion --- p.125 / References --- p.127

Orientador: Adilson Fransozo / Resumo: O camarão barba ruça Artemesia longinaris é um importante integrante da cadeia trófica marinha, porém o aumento da frota pesqueira e a consequente diminuição dos estoques de camarões considerados mais rentáveis comercialmente ocasionaram uma expansão na exploração de A. longinaris. Este camarão possui distribuição restrita ao Atlântico Ocidental, do Rio de Janeiro (Brasil) até a Argentina, podendo ser capturado a partir de águas rasas até 30 metros. O presente estudo tem como objetivo identificar a influência dos fatores ambientais na distribuição e os aspectos da biologia do camarão barba-ruça Artemesia longinaris , comparando com os resultados obtidos em um intervalo de 20 anos na enseada de Ubatuba. As coletas estão sendo realizadas mensalmente em 5 transectos, com o auxílio de um barco de pesca comercial, equipado com duas redes de arrasto do tipo "double-rig" (mexicana), cujas distancias entre-nós na panagem e no saco da rede são de, respectivamente, 12 e 10mm. Após cada arrasto os animais são acondicionados em caixas térmicas para posteriormente serem identificados, contados, medidos e classificados quanto ao estágio de desenvolvimento das gônadas, em laboratório. Em cada transecto, amostras de água estão sendo coletadas para mensurar a temperatura de fundo, temperatura de superfície, salinidade de fundo e de sedimento para verificar teor de matéria orgânica e phi. Os dados serão analisados para definir padrões de distribuição espaço-temporais, influências de fatores am... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre

No description available.

Thesis (M.S.)--Kent State University, 2006. / Title from PDF t.p. (viewed June 21, 2007). Advisor: Rodney M. Feldmann. Keywords: decapoda, crustacea, Jurassic, Romania. Includes bibliographical references (p. 161-181).

Made available in DSpace on 2014-06-12T23:02:12Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo8227_1.pdf: 6409405 bytes, checksum: b3ffda191367af60a6dae2967ed4e238 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005 / Estudos sobre o fluxo de zooplâncton entre o Canal de Santa Cruz (CSC) a partir da Barra de Catuama e a plataforma costeira adjacente (PCA) foram feitos com o objetivo de quantificar essa troca e definir os mecanismos de transporte e migração dos Decapoda planctônicos. As coletas foram realizadas durante as marés de sizígia (05 e 06/08/2001) e de quadratura (11 e 12/08/2001), em intervalos de 3 horas, num período de 15 horas para a maré de sizígia (n = 32 amostras) e de 24 horas para a maré de quadratura (n = 56 amostras). As amostras foram coletadas em três estações fixas (Estações Meio ou Convergência, Continente e Ilha) e em três níveis de profundidades (superfície, meio e fundo). Com o auxílio de uma bomba de sucção, a água foi filtrada com rede de plâncton (300 μm), durante 3 a 5 minutos. Logo após a filtragem, o material foi fixado com formol a 4%, neutralizado com bórax. Simultaneamente às coletas biológicas, foram feitas medições de velocidade e direção de corrente, através de um perfilador acústico de corrente (ADCP), além de temperatura, salinidade e oxigênio dissolvido. Em laboratório, as amostras foram pesadas, em balança de precisão, para determinação da biomassa sestônica através do peso úmido. Para a análise dos organismos, cada amostra foi totalmente analisada em estereomicroscópio. A Barra de Catuama apresentou uma grande variabilidade nos dados de biomassa sestônica e zooplâncton, com valores relativamente elevados, sobretudo durante a sizígia. O transporte instantâneo médio da biomassa foi de 98.10±75.92 mg*m -2 *s -1 , durante a sizígia, e de 31.46±26.52 mg*m -2 *s -1 , durante a quadratura. Os maiores picos de transporte de biomassa estiveram associados a grandes densidades de Brachyura, Calanoida e Sergestoida. Quanto ao transporte médio de organismos, os valores foram de 831.47±1192.53 org*m-2*s-1, durante a sizígia, e de 342.33±445.80 org*m-2*s-1, durante a quadratura. Os maiores valores de transporte de biomassa e organismos foram observados durante o período noturno (enchente e vazante). Os fluxos de importação e exportação não apresentaram diferenças significativas, sugerindo que em determinados períodos os valores possuir uma mesma ordem de magnitude. Provavelmente, estes dados podem ser em decorrência da forte influência marinha existente na área estudada, ocorrência de frentes estuarinas dentro do CSC, época de baixa liberação de larvas e forte impacto de peixes planctívoros sobre o meroplâncton. A análise estatística mostrou acúmulos significativos de zooplâncton nas zonas de convergência apenas durante o período diurno, considerando as três estações, refletindo que durante a noite, além das zonas de convergência, alguns taxa utilizam outros mecanismos de transporte. Foram identificados 29 taxa de Decapoda planctônicos, destacando-se os estágios iniciais de Lucifer faxoni, Acetes americanus, Pinnixa spp., Ocypodidae Morfotipo A, Uca spp., Petrolisthes armatus, Upogebia spp. e Alpheidae. A maior parte dos taxa registrados possui migração vertical em sincronia com as fases de maré e o fotoperíodo. O CSC atua, provavelmente, como área de reprodução para os Sergestoida, já que foi detectado um importante fluxo (tanto de importação quanto de exportação), de todos os estágios de desenvolvimento desta espécie. A função dos estuários tropicais como fonte de larvas de Decapoda do CSC para áreas costeiras foi confirmada no presente estudo. Os dados apresentados mostraram que larvas de Decapoda são exportadas do CSC para a PCA, mas o elevado número de estágios larvais em grande parte dos taxa identificados sugere que o desenvolvimento destas espécies ocorre na região próxima à Barra de Catuama

Thesis (Ph. D.)--Brigham Young University. Dept. of Microbiology and Molecular Biology, 2005. / Includes bibliographical references (p. 163-189).

Thesis (M.S.)--Kent State University, 2007. / Title from PDF t.p. (viewed Mar. 19, 2009). Advisor: Rodney Feldmann. Keywords: Monte León Formation, Argentina, mass mortality, Chaceon Peruvianus, Miocene, marine ashfall. Includes bibliographical references (p. 94-110).

Thesis (M.Sc) -- Memorial University of Newfoundland. / Typescript. Bibliography : leaves 122-128. Also available online.

Orientador: Rogério Caetano da Costa / Resumo: O objetivo do presente estudo foi investigar a biodiversidade e descrever o primeiro estágio larval (zoea I) dos camarões Caridea de substrato não consolidado que são capturados pela pesca de arrasto na região de Cananeia, São Paulo, Brasil. Foram realizadas coletas mensais durante um período de 2 anos (julho de 2012 a junho de 2014) em duas áreas (uma marinha costeira e outra que recebe influência estuarina) com um barco camaroeiro equipado com rede de arrasto de portas (4 metros de abertura), totalizando três horas de esforço amostral mensalmente. Para as espécies as quais não foram amostradas fêmeas com embriões, utilizou-se larvas de matrizes provenientes de amostragens simultâneas, realizadas em outras localidades. O total de 3066 camarões capturados incluiu oito espécies, sete gêneros, e quatro famílias: Hippolytidae (Exhippolysmata oplophoroides), Ogyrididae (Ogyrides alphaerostris), Alpheidae (Alpheus intrinsecus e A. carlae) e Palaemonidae (Leander paulensis, Periclimenes paivai, Nematopalaemon schmitti e Neopontonides brucei). Neopontonides brucei foi coletado pela primeira vez no litoral sul do estado, o que ampliou sua distribuição geográfica conhecida. Foi possível descrever de forma inédita a morfologia da zoea I de 4 espécies (Periclimenes paivai, Leander paulensis, Nematopalaemon schmitti e Alpheus intrinsecus) e redescrever a de Ogyrides alphaerostris. Os resultados provenientes das descrições permitiram diferenciar as espécies capturadas uti... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aim of the present study was to investigate the biodiversity and to describe the first larval stage (zoea I) of caridean shrimps from soft bottom that are captured by trawling in the Cananeia region, São Paulo, Brazil. Collections were made monthly in a period of 2 years (July 2012 to June 2014), in two areas (one marine and one with estuarine influence) with a shrimp fishing boat equipped with an otter trawl net (4 meters opening). The monthly sampling effort was three hours. For species which females with embryos were not sampled, it were used larvae of matrices from simultaneous samplings at other locations. The total of 3,066 captured shrimps included eight species, seven genera, and four families: Hippolytidae (Exhippolysmata oplophoroides), Ogyrididae (Ogyrides alphaerostris), Alpheidae (Alpheus intrinsecus and A. carlae) and Palaemonidae (Leander paulensis, Periclimenes paivai, Nematopalaemon schmitti and Neopontonides brucei). Neopontonides brucei was collected for the first time on the southern coast of São Paulo state, what expanded its known geographical distribution. It was possible to describe the morphology of the zoea I of 4 species for the first time (Periclimenes paivai, Leander paulensis, Nematopalaemon schmitti and Alpheus intrinsecus) and to redescribe Ogyrides alphaerostris. The results from the descriptions allowed differentiating the captured species using the external morphology of the first larval stage. The generated information... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Antonio Leão Castilho / Abstract: The present study was divided into two chapters that aimed to verify the spatiotemporal abundance of juveniles and adults, analyzing how the variation of the environmental factors (salinity, water temperature, rainfall, phi, organic matter) affect the distribution patterns and describe the population dynamics of Litopenaeus schmitti in Cananéia, south coast of the São Paulo state, Brazil. With a shrimp boat the shrimp and environmental factors were sampled monthly from July 2012 to May 2014, covering both the marine and estuarine environment. In the laboratory, shrimps were separated according to sex, measured on carapace length (CC) and classified for gonadal development stage. Growth and longevity were estimated from the von Bertalanffy equation and the sex ratio was tested by applying the Binomial test. A total of 1102 individuals were collected, 273 juveniles and 829 adults, with CC ranging from 16.7 to 39.6 mm in males and 16.7 to 44.9 mm in females. Adults were captured predominantly in sampling stations with marine influence, while juveniles were found in all sampling stations, especially those with estuarine influence. The presence of the majority of juvenile individuals in the estuarine environment evidences the importance of the estuary in the ontogeny and protection of the species, since this environment presents physical barriers (wide variation of salinity) for its predators. The environmental factor that most influenced the juveniles was the temperature and the... (Complete abstract click electronic access below) / Resumo: O presente estudo foi dividido em dois capítulos que tiveram como objetivos verificar a abundância espaço-temporal de juvenis e adultos, analisando como a variação dos fatores ambientais (salinidade, temperatura da água, pluviosidade, phi, matéria orgânica) afetam os padrões de distribuição da espécie, e descrever a dinâmica populacional de Litopenaeus schmitti em Cananéia, litoral sul do estado de São Paulo, Brasil. Com um barco camaroeiro os camarões e os fatores ambientais foram amostrados mensalmente de julho de 2012 a maio de 2014, abrangendo tanto o ambiente marinho quanto o estuarino. Em laboratório, os camarões foram separados quanto ao sexo, mensurados quanto ao comprimento da carapaça (CC) e classificados quanto ao estágio de desenvolvimento gonadal. O crescimento e a longevidade foram estimados a partir da equação de Von Bertalanffy e a razão sexual foi testada aplicando-se o teste Binomial. Um total de 1102 indivíduos foi coletado, sendo 273 juvenis e 829 adultos, com o CC variando de 16,7 a 39,6 mm nos machos e 16,7 a 44,9 mm nas fêmeas. Os adultos foram capturados predominantemente nas estações amostrais com influência marinha, enquanto que os juvenis foram encontrados em todas as estações amostrais, com destaque as que possuíam influência estuarina. A presença da maioria dos indivíduos juvenis no ambiente estuarino evidencia a importância do estuário na ontogenia e proteção da espécie, uma vez que este ambiente apresenta barreiras físicas (ampl... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre