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Seleção de genes-referência para estudos de expressão gênica em macieiras

Perini, Pâmela January 2011 (has links)
A macieira (Malus x domestica) é uma das mais importantes frutíferas do mundo, e sua produção tem destaque na região sul do Brasil. Comparações entre padrões de expressão gênica de diferentes variedades constituem uma estratégia de alto valor científico para seu melhoramento genético. Contudo, a acurácia das análises é dependente de genes de referência estáveis para a normalização dos dados. A escolha de controles inapropriados pode resultar em determinações estatísticas e conclusões incorretas. Pelo presente trabalho, teve-se como objetivo selecionar os melhores genes-referência para estudos de expressão gênica em macieiras, via reação em cadeia da DNA polimerase quantitativa precedida de transcrição reversa (RT-qPCR). A expressão de 21 genes, incluindo tradicionais “housekeeping genes” ou genes sugeridos como constitutivos por dados de microarranjos disponíveis na literatura, foram avaliados em diferentes tecidos vegetativos e reprodutivos da cultivar ‘Gala’ de macieira. Para todos os genes, as combinações de primers testadas permitiram amplificações específicas e curvas de eficiência apropriadas. A estabilidade dos genes foi determinada por dois diferentes algoritmos estatísticos, geNorm e NormFinder. Os resultados permitiram concluir que, para os tecidos e condições avaliadas, EF1β, MDH, SAND, THFS e WD40 são os melhores genes normalizadores para quantificação relativa da abundância de transcritos de interesse em diferentes tecidos-alvos de macieira. A expressão de PAL foi utilizada para validação dos controles selecionados. Combinações específicas de dois ou três genes-referência demonstraram ser suficientes para a normalização dos dados em cada conjunto de amostras analisado. Finalmente, a expressão do gene MDP0000232313 ou MdDAM6, potencial gene MADS-box associado à dormência em macieira, foi avaliada em gemas da cultivar ‘Fuji Standard’, amostradas durante o ciclo vegetativo e de dormência das plantas ao longo do ano 2009. As análises foram conduzidas via RT-qPCR e de forma relativa aos genes EF1β e WD40. Observou-se um nível basal de expressão de MdDAM6 durante o verão e um aumento de cerca de 10 vezes no inverno, refletindo sua possível função no estabelecimento e/ou manutenção do estado endodormente das gemas de macieira, uma vez que este tenha sido estabelecido. / Apple (Malus x domestica) is one of the most important fruit tree crop in the world, and its production is prominent in southern Brazil. Comparisons among profiles of gene expression from different cultivars are valuable scientific tools for apple genetic breeding. However, the accuracy of the analyses is dependent on the evaluation of stable reference genes for data normalization. The inappropriate choice of controls may result in statistical significance undue or incorrect conclusions. In the present work, the objective was to select the best reference genes for gene expression studies by reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) in apple trees. The expression of 21 genes, including traditional housekeeping or genes suggested as constitutive by microarray data available in the literature, was evaluated in different vegetative and reproductive tissues of the apple ‘Gala’ cultivar. For all genes, tested combinations of primers allowed specific amplification and suitable efficiency curves. The stability of the genes was determined by two different statistical algorithms, geNorm and NormFinder. The results allowed us to conclude that, for tissues and conditions evaluated, EF1β, MDH, SAND, THFS and WD40 are the best normalizing genes for relative quantification of interest transcript abundance in different target tissues of apple. PAL expression was used to validate the selected normalizers. Specific combinations of two or three reference genes were shown to be sufficient to normalize each apple sample set analyzed. Finally, the MDP0000232313 or MdDAM6 gene expression, a potential MADS-box gene associated with dormancy in apple, was evaluated in buds of the apple 'Fuji' cultivar, sampled in the vegetative and dormant cycle of plants during the year of 2009. The analysis was performed by RT-qPCR and quantified in relation to the EF1β and WD40 normalizing genes. It a basal level of expression was observed during summer and a ten fold increase during winter, reflecting its possible function associated with the establishment and/or maintenance of the endodormant state of apple buds, once it has been established.
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Aplicações foliares de ácido giberélico e seus efeitos sobre a dormência de batata-semente (Solanum tuberosum L.) cv. Atlantic / not available

Coraspe-Leon, Hector Manuel 03 February 1995 (has links)
Foi estudado na região de Itapetininga-SP, Brasil, o efeito de pulverizações foliares de ácido giberélico (AG) sobre a dormência de tubérculos-sementes de batata da cv. Atlantic. Foram usadas as concentrações de 100, 300 e 700 ppm pulverizadas, 10 e 7 dias antes da dessecação da folhagem. As condições de armazenamento utilizadas foram as seguintes: temperatura ambiente e câmara frigorífica, nesta última e aplicou inicialmente uma faixa entre 7 e 9ºC, e posteriormente se elevou entre 15 e 20ºC até o fim do armazenamento. Observou-se que o AG proporcionou uma mudança no perfil de produção, obtendo-se uma maior quantidade de tubérculos-sementes. O conteúdo de matéria seca e a densidade específica dos tubérculos não foram afetados. A quebra de dormência foi mais intensa a medida que se aumentavam as doses de AG sob temperatura ambiente. A resposta do AG é fortemente condicionada pelo tipo de temperatura de armazenamento empregado. A pulverização foliar de AG na dose de 100 ppm 10 dias antes da dessecação da folhagem e posterior armazenamento a temperatura ambiente foi mais efetiva / not available
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Dormência natural e ação de giberelina e hidrazida maleica em genótipos de Ipomoea batatas (L.) Lam. / not available

Luengo, Rita de Fatima Alves 12 May 1994 (has links)
Os objetivos do presente estudo foram selecionar genótipos de Ipomoea batatas (L.) Lam. com brotamento tardio, que evitam perda pós-colheita devido ao brotamento quando se armazena batata-doce, e estudar o efeito de giberelina e hidrazida maleica sobre a dormência de genótipos de batata-doce com dormência curta e prolongada. Os experimentos foram conduzidos em Brasília (DF) no período de 1990 a 1993 com os cultivares Brazlândia Branca, Brazlândia Roxa, Brazlândia Rosada, Coquinho, Rio Doce e genótipos do banco de germoplasma de batata-doce da EMBRAPA-CNPH. As raízes foram armazenadas por três meses, à temperatura de 25+- 20° C e umidade relativa de 70 a 90%, pois temperaturas superiores a 15,5° C e umidade relativa elevada estimulam o brotamento da batata-doce. A aplicação de hidrazida maleica foi realizada no campo, sobre a parte aérea das plantas, 40 dias antes da colheita nas concentrações 2000mg.L-1, 3500mg.L-1 e 5000mg.L-1 e a aplicação de giberelina foi por imersão das raízes, após a colheit, nas concentrações 5mg.L-1, 10mg.L-1, 15mg.L-1. As características avaliadas foram número de brotações, altura da maior brotação, peso da matéria fresca e respiração. Os resultados obtidos permitiram concluir que existe variabilidade genética entre genótipos de batata- doce em relação à dormência; o cultivar comercial com menor dormência foi Brazlândia Roxa; o cultivar com maior dormência foi Rio Doce. Não foi observado efeito da aplicação de hidrazida maleica a 2000mg.L-1, 3500mg. L-1 e 5000mg.L-1 nem da aplicação de giberelina a 5mg.L-1, 10mg.L-1, 15mg.L-1 na dormência dos cultivares Brazlândia Roxa (dormência curta) e Rio Doce (dormência prolongada). O cultivar Rio Doce apresenta taxas respiratórias mais elevadas que os cultivares Brazlândia Roxa, Coquinho e Princesa. Quando tratado com giberelina, há diminuição nas taxas respiratórias. O cultivar Brazlândia Roxa apresenta médias de matéria fresca superiores em relação ao cultivar Rio Doce, que mostra-se mais sensível à deterioração. / not available
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Caracterização morfoanatômica e histoquímica de sementes de Butia odorata (Barb. Rodr.) Noblick durante a superação da dormência / Morphological and histochemical characteristics of the butia odorata (barb. Rodr.) Noblick seeds during warm stratification

Baratto, Bruna January 2016 (has links)
O gênero Butia compreende 20 espécies distribuídas, em sua maioria, no sul da América do Sul. Butia odorata (Barb. Rodr.) Noblick é uma palmeira endêmica do bioma Pampa, com alto potencial alimentício e ornamental. Seu diásporo é composto por um pirênio que abriga de uma a três sementes, as quais apresentam germinação irregular e lenta, resultado de dormência. Sabe-se que há relação dessa dormência com o opérculo da semente, e qual sua composição química também é citada como agravante. Através da remoção desta estrutura tem-se alta porcentagem germinativa, em curto período. A relação entre o opérculo e a influência da temperatura no período da germinação ainda é desconhecida para B. odorata, uma vez que a descrição morfoanatômica da espécie é incipiente e sua histoquímica é inexplorada. Este trabalho objetivou caracterizar a morfologia da estrutura de dispersão e descrever aspectos anatômicos e histoquímicos das sementes de B. odorata quando submetidas a tratamento para a superação da dormência. Diásporos de populações naturais foram semeados em caixas gerbox, sobre areia média lavada, esterilizada e umedecida. O material foi disposto em câmara de germinação sem iluminação interna por 20 dias sob temperatura de 40 ºC, seguido de 20 dias a 30 ºC. Após isoladas dos endocarpos, as sementes foram desbastadas e fixadas. Através de amostragens a cada cinco dias, foram caracterizados modificações anatômicas e a mobilização de reservas na semente. As sementes apresentam um envoltório (testa) com presença de estrias e no opérculo há presença de compostos fenólicos e ausência de lignina. O endosperma é homogêneo, branco e brilhante, com as células da região micropilar apresentando paredes espessas em relação ao restante do endosperma, sendo essas metabolizadas ao longo das amostragens. O embrião é pequeno, basal e apresenta a plúmula já diferenciada na primeira amostragem. Ao longo das amostragens e durante a manutenção dos pirênios sob temperatura de 40 ºC foi percebida a formação de uma zona de fragilidade no endosperma micropilar, o que, ao que tudo indica, está relacionado com a germinação. As reservas encontradas, as quais estavam presentes no endosperma e no embrião das sementes, foram: amido, polissacarídeos totais, lipídios totais, proteínas totais e compostos fenólicos na região opercular. A mobilização das reservas ocorreu antes mesmo do opérculo ser rompido. / The Butia genus comprises 20 species distributed mostly in southern South America. Butia odorata (Barb. Rodr.) Noblick is an endemic palm tree from the Pampa biome, with high food and ornamental potential. Its diaspore is composed of a pyrene which houses one to three seeds that have irregular and slow germination as a result of dormancy. It is known that there is a relationship between dormancy and seed operculum and its chemical composition can also be an aggravator. By removing this structure, seeds exhibit high germination percentage in a short period. The relationship between the operculum, as well as the influence of temperature on the germination period, is still unknown to B. odorata, since the morphoanatomical description of the species is incipient and its histochemical characteristics are unexplored. This study aimed to characterize the morphology of the dispersion structure and describe anatomical and histochemical features of B. odorata seeds when undergoing dormancy breaking treatment. Diaspores of natural populations were sown in gerbox on average washed, sterilized and moistened sand. The material was placed in a dark germination chamber for 20 days at 40 °C, followed by 20 days at 30 °C. Following this procedure, endocarps isolated from the seeds were chopped and fixed. By sampling every five days, anatomical changes and the mobilization of reserves in the seed were characterized. The seeds presented stretch marks in the involucre (seed coat or testa) and phenolic compounds with absence of lignin in the operculum. The endosperm is homogeneous, white and shiny, and the micropilar cells present thick walls, in relation to the rest of the endosperm, that were metabolized along the sampling. The embryo is small, basal and has differentiated plumule. While sampling at 40 °C the formation of a fragile zone in the micropilar endosperm was noted, which seems to be germination related. The reserves present in the endosperm and the embryo of seeds were: starch, total polysaccharides, total lipid, protein and phenolic compounds in the opercular region. The mobilization of reserves occurred even before the operculum was broken.
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Aplicações foliares de ácido giberélico e seus efeitos sobre a dormência de batata-semente (Solanum tuberosum L.) cv. Atlantic / not available

Hector Manuel Coraspe-Leon 03 February 1995 (has links)
Foi estudado na região de Itapetininga-SP, Brasil, o efeito de pulverizações foliares de ácido giberélico (AG) sobre a dormência de tubérculos-sementes de batata da cv. Atlantic. Foram usadas as concentrações de 100, 300 e 700 ppm pulverizadas, 10 e 7 dias antes da dessecação da folhagem. As condições de armazenamento utilizadas foram as seguintes: temperatura ambiente e câmara frigorífica, nesta última e aplicou inicialmente uma faixa entre 7 e 9ºC, e posteriormente se elevou entre 15 e 20ºC até o fim do armazenamento. Observou-se que o AG proporcionou uma mudança no perfil de produção, obtendo-se uma maior quantidade de tubérculos-sementes. O conteúdo de matéria seca e a densidade específica dos tubérculos não foram afetados. A quebra de dormência foi mais intensa a medida que se aumentavam as doses de AG sob temperatura ambiente. A resposta do AG é fortemente condicionada pelo tipo de temperatura de armazenamento empregado. A pulverização foliar de AG na dose de 100 ppm 10 dias antes da dessecação da folhagem e posterior armazenamento a temperatura ambiente foi mais efetiva / not available
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Perfil transcricional de genes relacionados à dormência em gemas de macieira

Falavigna, Vítor da Silveira January 2012 (has links)
A macieira (Malus x domestica Borkh.) é uma frutífera de clima temperado que possui grande importância econômica mundialmente, sendo sua produtividade intimamente relacionada à saída do processo de dormência hibernal. Este processo pode ser definido como a incapacidade da planta iniciar o crescimento meristemático mesmo sob condições favoráveis e os mecanismos de controle molecular da dormência em macieiras ainda são pouco compreendidos. O objetivo do presente trabalho foi investigar o perfil gênico diferencial entre cultivares de macieiras contrastantes para requerimento de frio. As cultivares selecionadas foram Gala e sua mutante espontânea Castel Gala, as quais apresentam alto e baixo requerimento de frio, respectivamente. A técnica de hibridização supressiva subtrativa (SSH) permitiu a identificação de 28 genes candidatos à regulação da dormência. Análises de RT-qPCR foram realizadas visando a validação da expressão diferencial dos genes selecionados, assim como caracterizá-los transcricionalmente em três cultivares distintas durante um ciclo de crescimento e de dormência. Dos 28 genes candidatos, 17 apresentaram o mesmo perfil diferencial identificado por SSH. Um acúmulo sazonal de transcritos durante o inverno foi identificado para alguns genes e as cultivares de maior requerimento de frio apresentaram acúmulo de transcritos por mais tempo. Este perfil permitiu-nos sugerir que estes genes podem estar atuando na regulação dos processos de dormência e de aclimatação ao frio. Dos 17 genes validados, aqueles codificadores de proteínas DAM, desidrinas, GAST1, LTI65, NAC, histonas variantes H2A.Z e RAP2.12 apresentaram os maiores contrastes transcricionais entre as cultivares analisadas durante o inverno e constituem-se como fortes candidatos a participantes do processo de progressão da dormência em macieiras. Finalmente, a família de genes codificadores de desidrinas de macieira teve seus membros identificados e caracterizados transcricionalmente. Análises in silico permitiram a identificação de oito modelos gênicos preditos de desidrinas no genoma de macieira. As cadeias peptídicas deduzidas foram classificadas conforme a presença dos segmentos conservados YnSKn. Um perfil sazonal de regulação da expressão foi identificado, com a presença de um pico de acúmulo de transcritos durante o inverno, o que sugere a presença de um mecanismo similar de regulação entre genes de desidrinas de macieira. / Apple tree (Malus x domestica Borkh.) is a temperate fruit crop of great economic importance worldwide and its productivity is related with the release from a bud dormancy process. This process is defined as the plant inability to initiate growth from meristems under favorable conditions and molecular information about dormancy control in apple trees is limited. The aim of the present work was to investigate the differential gene expression profiles between apple tree cultivars contrasting in chilling requirement for breaking dormancy. The selected apple cultivars were Gala and its derived bud sport Castel Gala, which displays high and low chilling requirement, respectively. A suppression subtractive hybridization (SSH) assay yielded 28 candidate genes putatively associated to dormancy cycling. RT-qPCR analyses were performed in order to validate the differential expression profiles and also to transcriptionally characterize the selected genes in three distinct apple tree cultivars during a growth to dormancy cycle. Among the 28 candidate genes, 17 confirmed the differential expression profile predicted by SSH. A seasonal transcript accumulation during the winter was identified to some genes, with high chilling requirement cultivars presenting higher levels of transcripts. This profile allowed us to suggest that these genes may be acting on dormancy regulation and cold acclimation. Out of the 17 candidate genes, those coding for DAM, dehydrins, GAST1, LTI65, NAC, histone variants H2A.Z and RAP2.12 displayed major differences in gene expression between cultivars through the winter and are strong candidates to play key roles on dormancy progression in apple trees. Finally, we identified and transcriptionally characterized the dehydrin gene family in apple trees. In silico analyses allowed us to identify eight predicted gene models for dehydrins in the apple genome. Deduced polypeptides were classified according to the presence of the conserved YnSKn segments. A seasonal regulation of gene expression was observed, with higher transcript accumulation during the winter. This data suggests that a similar mechanism of transcript regulation is acting through the apple dehydrin genes.
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Caracterização e padrão de expressão gênica relacionados ao degrane e dormência de sementes em arroz vermelho / Characterization and pattern of gene expression related to the shattering and seed dormancy in red rice

Markus, Catarine January 2013 (has links)
O arroz vermelho é considerado daninho principalmente devido às características de degrane e dormência das sementes, que contribuem para a perpetuação desta espécie na lavoura de arroz. A melhor compreensão destes mecanismos poderá ser utilizada para desenvolver tecnologias que proporcionam o controle desta planta daninha. O objetivo desta dissertação foi avaliar a expressão gênica e variação nucleotídica de genes relacionados ao degrane e dormência em sementes de arroz vermelho. O estudo foi realizado com a espécie silvestre O. glaberrima, cultivares de arroz e ecótipos de arroz vermelho provindos do sul do Brasil. A caracterização fenotípica mostrou que os ecótipos de arroz vermelho apresentam alto nível de degrane em comparação com cultivares de arroz, que possuem pouca variabilidade desta característica. Já a dormência das sementes apresentou grande variabilidade nos ecótipos de arroz vermelho e mostrou-se reduzida nas cultivares de arroz analisadas. A expressão do gene OsXTH8 teve relação direta com o caráter degrane. De forma contrária, a expressão do gene OsCel9D foi relacionada com a repressão deste caráter nos genótipos avaliados. O gene Sh4 não apresentou relação com o processo de degrane. Os genótipos Batatais, Nipponbare, AV 503 e O. glaberrima não apresentaram a mutação G237T no gene Sh4, indicando que este gene não possui envolvimento com o processo de domesticação dos genótipos avaliados. Com relação à dormência das sementes, a expressão do gene OsCYP707A5 não foi associada com essa característica em nenhum dos momentos avaliados. Aos 14 dias após a antese e em sementes maduras, os genes Sdr4 e OsMADS29 apresentam, respectivamente, relação positiva e negativa com a dormência das sementes de arroz vermelho. Durante o processo de germinação das sementes a expressão do gene OsMADS29 apresentou efeito negativo, enquanto que o gene Sdr4 mostrou relação positiva com o caráter dormência. Desta forma, os resultados encontrados sobre a dormência de sementes de arroz vermelho em comparação aos dados descritos na literatura para arroz cultivado são diferentes para o gene OsCYP707A5 e são similares para os genes Sdr4 e OsMADS29. O gene Sh4 não está associado ao degrane de sementes em arroz vermelho, contrariamente ao indicado em arroz cultivado. Os genes OsXTH8 e OsCel9D, até então pouco relacionados ao degrane de sementes, estão associados à ocorrência desta característica em arroz vermelho. / Red rice is the most important weed of the rice crop due to the occurrence of of seed shattering and seed dormancy. The better understanding of regulation of these process can be used to develop biotechnological and management technologies to mitigate the red rice infestation in rice fields. The aim of this study was to evaluate the variability of gene expression and nucleotide composition of genes related to seed shattering and seed dormancy in red rice. The study was based on red rice ecotypes, O. glaberrima and rice varieties from southern Brazil. The seed shattering of the red rice ecotypes was higher in comparison with the rice varieties, that have little variability of this trait. In contrast, seed dormancy had great variability in red rice ecotypes and this was reduced in the rice varieties. The expression of the gene OsXTH8 was directly associated with the seed shattering. Otherwise, the OsCel9D expression was related with the suppression of this characteristic. The gene Sh4 was not associated with the seed shattering. The genotypes Batatais, Nipponbare, AV 503 and O. Glaberrima didn’t show the G237T mutation in exon one of the gene Sh4, indicating that this gene has no involvement with the process of domestication of analyzed genotypes. In respect to seed dormancy, the gene expression of OsCYP707A5 was not related with this trait in any of the seed development and germination evaluated stages. At 14 days after anthesis and in mature seeds the genes OsMADS29 and Sdr4 were, respectively, positive and negative related with seed dormancy. During seeds germination, the gene Sdr4 had a positive effect on seed dormancy of red rice, and OsMADS29 gene had negative relationship with that character. During the seed germination the genes OsCYP707A5, OsMADS29 and Sdr4 were not associated, negative and positively related with seed dormancy of red rice. The seed dormancy in red rice in comparison to the described results for cultivated rice is differently related for the OsCYP707A5 gene, and is similarly associated for the genes Sdr4 and OsMADS29. In opposition with what was found in cultivated rice, the Sh4 gene is not associated with seed abscission process in red rice. The OsXTH8 and OsCel9D genes, not previously associated with seed shattering in rice cultivars, are associated with these trait in red rice.
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Caracterização morfoanatômica e histoquímica de sementes de Butia odorata (Barb. Rodr.) Noblick durante a superação da dormência / Morphological and histochemical characteristics of the butia odorata (barb. Rodr.) Noblick seeds during warm stratification

Baratto, Bruna January 2016 (has links)
O gênero Butia compreende 20 espécies distribuídas, em sua maioria, no sul da América do Sul. Butia odorata (Barb. Rodr.) Noblick é uma palmeira endêmica do bioma Pampa, com alto potencial alimentício e ornamental. Seu diásporo é composto por um pirênio que abriga de uma a três sementes, as quais apresentam germinação irregular e lenta, resultado de dormência. Sabe-se que há relação dessa dormência com o opérculo da semente, e qual sua composição química também é citada como agravante. Através da remoção desta estrutura tem-se alta porcentagem germinativa, em curto período. A relação entre o opérculo e a influência da temperatura no período da germinação ainda é desconhecida para B. odorata, uma vez que a descrição morfoanatômica da espécie é incipiente e sua histoquímica é inexplorada. Este trabalho objetivou caracterizar a morfologia da estrutura de dispersão e descrever aspectos anatômicos e histoquímicos das sementes de B. odorata quando submetidas a tratamento para a superação da dormência. Diásporos de populações naturais foram semeados em caixas gerbox, sobre areia média lavada, esterilizada e umedecida. O material foi disposto em câmara de germinação sem iluminação interna por 20 dias sob temperatura de 40 ºC, seguido de 20 dias a 30 ºC. Após isoladas dos endocarpos, as sementes foram desbastadas e fixadas. Através de amostragens a cada cinco dias, foram caracterizados modificações anatômicas e a mobilização de reservas na semente. As sementes apresentam um envoltório (testa) com presença de estrias e no opérculo há presença de compostos fenólicos e ausência de lignina. O endosperma é homogêneo, branco e brilhante, com as células da região micropilar apresentando paredes espessas em relação ao restante do endosperma, sendo essas metabolizadas ao longo das amostragens. O embrião é pequeno, basal e apresenta a plúmula já diferenciada na primeira amostragem. Ao longo das amostragens e durante a manutenção dos pirênios sob temperatura de 40 ºC foi percebida a formação de uma zona de fragilidade no endosperma micropilar, o que, ao que tudo indica, está relacionado com a germinação. As reservas encontradas, as quais estavam presentes no endosperma e no embrião das sementes, foram: amido, polissacarídeos totais, lipídios totais, proteínas totais e compostos fenólicos na região opercular. A mobilização das reservas ocorreu antes mesmo do opérculo ser rompido. / The Butia genus comprises 20 species distributed mostly in southern South America. Butia odorata (Barb. Rodr.) Noblick is an endemic palm tree from the Pampa biome, with high food and ornamental potential. Its diaspore is composed of a pyrene which houses one to three seeds that have irregular and slow germination as a result of dormancy. It is known that there is a relationship between dormancy and seed operculum and its chemical composition can also be an aggravator. By removing this structure, seeds exhibit high germination percentage in a short period. The relationship between the operculum, as well as the influence of temperature on the germination period, is still unknown to B. odorata, since the morphoanatomical description of the species is incipient and its histochemical characteristics are unexplored. This study aimed to characterize the morphology of the dispersion structure and describe anatomical and histochemical features of B. odorata seeds when undergoing dormancy breaking treatment. Diaspores of natural populations were sown in gerbox on average washed, sterilized and moistened sand. The material was placed in a dark germination chamber for 20 days at 40 °C, followed by 20 days at 30 °C. Following this procedure, endocarps isolated from the seeds were chopped and fixed. By sampling every five days, anatomical changes and the mobilization of reserves in the seed were characterized. The seeds presented stretch marks in the involucre (seed coat or testa) and phenolic compounds with absence of lignin in the operculum. The endosperm is homogeneous, white and shiny, and the micropilar cells present thick walls, in relation to the rest of the endosperm, that were metabolized along the sampling. The embryo is small, basal and has differentiated plumule. While sampling at 40 °C the formation of a fragile zone in the micropilar endosperm was noted, which seems to be germination related. The reserves present in the endosperm and the embryo of seeds were: starch, total polysaccharides, total lipid, protein and phenolic compounds in the opercular region. The mobilization of reserves occurred even before the operculum was broken.
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Dormência do câncer modelos matemáticos e simulações numéricas /

Ribeiro, Aiara Cristina de Oliveira January 2017 (has links)
Orientador: Paulo Fernando de Arruda Mancera / Resumo: O câncer é uma das principais causas de morbidade e mortalidade em todo o mundo. Um problema que atinge muitos pacientes diagnosticados com câncer é a recidiva, que pode ocorrer anos após uma aparente remissão completa da doença. Tal fenômeno pode ser explicado pela dormência do câncer. Neste trabalho, apresentamos alguns modelos matemáticos de ordem não inteira e inteira, de derivada temporal, que visam descrever o fenômeno da dormência do câncer. As simulações numéricas foram feitas utilizando o Método de Diferenças Finitas Não Local para Equações Diferenciais Fracionárias e o Método de Runge-Kutta de 4ª ordem. Para os modelos de ordem não inteira, as simulações exibiram que ordens menores da derivada fracionária resultam no maior amortecimento das soluções e alterações na estabilidade dos sistemas. Para o modelo de ordem inteira, as simulações exibiram que a angiogênese tumoral desempenha um papel importante na dormência tumoral. / Mestre
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Efeito do hipoclorito de sódio na qualidade fisiológica e integridade do tegumento de sementes de mamão / Effect of sodium hypochlorite in the physiological quality and integrity of papaya seed tegument

Gómez, Sindy Johanna 08 March 2016 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-06-22T14:28:45Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1569177 bytes, checksum: 2386d5aca0c7b533d9f67843b5a940a2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-22T14:28:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1569177 bytes, checksum: 2386d5aca0c7b533d9f67843b5a940a2 (MD5) Previous issue date: 2016-03-08 / A semente de mamão (Carica papaya L.) apresenta germinação lenta e irregular, devido a compostos fenólicos presentes no tegumento que limitam o intercâmbio de gases. O hipoclorito de sódio (NaClO), sendo um forte oxidante, pode agir na superação de dormência ao alterar as estruturas do tegumento. Entretanto, sua ação varia conforme a concentração, o tempo de exposição das sementes à solução e a relação entre a quantidade de produto e a massa de sementes (proporção). Assim, o objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito do hipoclorito de sódio, considerando novas combinações de concentração, tempo de exposição e proporção, na sarcotesta e/ou outras camadas do tegumento e seu efeito no potencial germinativo das sementes de mamão. As sementes foram avaliadas quanto à germinação e o vigor, pelos testes de germinação, primeira contagem de germinação, emergência de plântulas e índice de velocidade de emergência. A caracterização anatômica do tegumento externo foi realizada por meio da microscopia eletrônica de varredura. O experimento foi conduzido segundo o delineamento em blocos casualizados, com quatro repetições por tratamento, e cada repetição composta de duas réplicas de 50 sementes cada. Os tratamentos para os testes de germinação e primeira contagem foram dispostos em esquema fatorial 4x4x3 + 4, ou seja, quatro concentrações de solução de NaClO (0, 2, 4 e 6% de cloro ativo), quatro proporções (1:1; 2:1; 3:1 e 6:1; volume de solução: volume de sementes) e três tempos de exposição (8, 16 e 24 h), mais quatro tratamentos adicionais: a) sementes intactas (testemunha); b) método da peneira/empresa; c) tratamento 2%, 20:1, 24 h (concentração, mL de solução: número de sementes, e tempo de exposição de hipoclorito de sódio, respectivamente), e d) método da peneira+ 24 h em água parada, totalizando 52 tratamentos. Para a avalição da emergência de plântulas e índice de velocidade de emergência, os tratamentos constaram de: quatro concentrações (0, 2, 4 e 6% de cloro ativo) na proporção 3:1 durante 24 h de exposição, três tempos de exposição (8, 16 e 24 h) a 4% de concentração de cloro e na proporção 1:1, quatro proporções (1:1, 2:1, 3:1 e 6:1) a 6% de concentração de cloro, durante 16 h de exposição, mais três tratamentos adicionais: a) sementes intactas (testemunha); b tratamento 2%, 20:1, 24 h (concentração, mL de solução: número de sementes, e tempo de exposição de hipoclorito de sódio, respectivamente) e c) método da peneira+ 24 h em água parada; totalizando 14 tratamentos. Os tratamentos do teste de germinação e primeira contagem do teste de germinação foram comparados com os tratamentos adicionais pelo teste de Dunnett, a 5% de probabilidade, e os tratamentos adicionais entre si, pelo teste de Tukey, ao nível 5% de probabilidade. As médias obtidas da concentração foram submetidas a análise de regressão. Os dados obtidos no teste de emergência e índice de velocidade de emergência foram comparados com os tratamentos adicionais pelo teste de Dunnett, a 5% de probabilidade, e os tratamentos adicionais entre si, pelo teste de Tukey, ao nível de 5% de probabilidade. A exposição das sementes de mamão em soluções de hipoclorito de sódio não favoreceu a germinação, sendo prejudicial em concentrações mais elevadas. Os fatores concentração e proporção de hipoclorito de sódio foram prejudiciais à germinação das sementes, principalmente quando adotadas combinações com valores elevados de ambos. O tempo de exposição das sementes ao hipoclorito de sódio não afetou a germinação. O hipoclorito de sódio afetou a integridade do tegumento das sementes. O tratamento 0% de cloro ativo (imersão em água), proporção 2:1, 24 h de exposição, teve efeito semelhante aos tratamentos adicionais na germinação e foi superior aos demais na velocidade de germinação das sementes. Recomenda-se novos estudos, com concentração de hipoclorito de sódio próximo ou inferior a 4%, em lotes de sementes provenientes de frutos com diferentes históricos, ou seja, com qualidade fisiológica e dormência diferenciadas. / The papaya seed (Carica papaya L.) has slow and irregular germination since the phenolic compounds present in the seed coat limit the exchange of gases. Sodium hypochlorite (NaClO) is a strong oxidant, acts on dormancy breaking by changing the seed coat structures. However, their action can vary with concentration, the exposure time of the seeds in the solution and the relationship between the amount of product and seed mass (ratio). Thus, t he objective of this study was to evaluate the effect of sodium hypochlorite, considering new combinations of concentration, exposure time and ratio in the sarcotesta and/or other seed coat layers and their effect on germination potential of papaya seeds. The seeds were evaluated for germination and vigor, by the germination tests, first count of the germination, seedling emergence and the emergence velocity index (EVI). The anatomic characterization of the outer tegument was performed by scanning electron microscopy. The experiment was conducted according to a randomized complete blocks, with four repetitions per treatment and each replication consisted of two determinations of 50 seeds each. The treatments for the germination and first count were arranged in a factorial design 4x4x3 + 4, that is, four NaClO solution concentrations (0, 2, 4 and 6% of active chlorine), four ratios (1:1: 2:1, 3:1 and 6:1; volume of solution : seed volume, respectively), and three times of immersion (8, 16 and 24 hours), more four additional treatments: a) intact seeds (control); b) method of sieve/company; c) treating 20:1, 2% 24h (mL solution : number of seeds, concentration and exposure time of sodium hypochlorite, respectively), and d) method of sieve + 24 hours in stagnant water, totaling 52 treatments. For the evaluation of seedling emergence and emergence speed index, the treatments consisted of four concentrations (0, 2, 4 and 6% active chlorine) in the ratio 3:1 per 24 hours of exposure. Three exposure times (8, 16 and 24 hours) at 4% chlorine concentration, and the ratio 1:1, four ratios (1:1, 2:1, 3:1 and 6:1) at 6% chlorine concentration, during 16 hours of exposure, more three additional treatments: a) intact seeds (control); b) treating 20:1 2% 24 (mL solution : number of seeds, concentration and exposure time of sodium hypochlorite, respectively) and c) method of sieve + 24 hours in stagnant water, totaling 14 treatments. The germination test treatments and first count of the germination test were compared with the additional treatments by Dunnett test in 5% of probability, and additional treatments among themselves by Tukey test in 5% of probability. The concentration averages obtained were subjected to regression analysis. Data from the emergency test and emergency speed index were compared with the additional treatments by Dunnett test in 5% of probability, and additional treatments among themselves by Tukey test in 5% of probability. Sodium hypochlorite did not favor papaya seed germination, being harmful at higher concentrations. The factors chlorine concentration and ratio of sodium hypochlorite was detrimental to germination of the seeds, especially when taken combinations with high values of both. The exposure time of the seeds did not influence the effect of sodium hypochlorite on the germination. Sodium hypochlorite affects the integrity of the integument of the seed. The treatment 0% of active chlorine (water immersion), ratio 2:1, 24 h of exposition, had a similar effect to additional treatments and it was superior in the germination seed speed. It is recommended new studies with sodium hypochlorite concentration near or below 4%, in batches of seeds from fruits with different historical, that is with physiological quality and differentiated dormancy.

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