In eukaryotic translation initiation, eIF2B, a 295 kDa multisubunit (from α to ε) complex,is the guanine nucleotide exchange factor (GEF) of eIF2, a GTP binding protein, and hasmultiple roles in regulating the level of active eIF2-GTP-Met-tRNAi ternary complexes inthe cytoplasm. Mutations in eIF2B subunits affect global protein synthesis and, in human,are responsible to cause a genetically inherited lethal childhood brain disease calledLeukoencephalopathy with Vanishing White Matter (VWM). Although the genetic aspectseIF2B have been widely studied over decades, detailed structural knowledge only becameavailable in recent years but is still limited. This study aims to gain structural insights intoyeast eIF2B by a range of electron microscopy techniques to improve our understandingtowards its GEF activity with eIF2 and regulatory response. By performing size-exclusion chromatography and multi-angle static light scattering (SECMALS), it was found that eIF2B is a stable dimer of pentamers (~600 kDa). Negativestaining (25.8 Å) and cryo-EM (12.1 Å) eIF2B decamer models that showed 2-foldrotational symmetry were generated by single particle reconstruction. Homology modelingof yeast eIF2B subunits revealed an eIF2B(αβδ)2 hexameric core and two separate arm-likeeIF2Bγε catalytic domains with potential flexibility. To constrain subunit position in thearm structure, Ni-NTA-Nanogold labeling against the multihistidine tag of eIF2Bγ wasperformed. In addition, genetic approaches were applied to eliminate synthesis of eIF2Bα(34 kDa) and eIF2B(βγδε)2 octamer complexes (532 kDa) were purified by SEC-MALSand analysed by negative staining single particle reconstruction. It was speculated thatdeletion of eIF2Bα might have triggered significant conformational rearrangement that ledto high uniformity in the 2D class averages. A hypothetical model was thus proposed forthe octamer where the two arm-like domains clamp together to form a compact structure.

Orientador : Chin Shu Chen / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-15T09:32:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kanzig_RodolfoGuilhermo_M.pdf: 2666010 bytes, checksum: d39b29ad0e08d758369e55e8224ea989 (MD5) Previous issue date: 1976 / Resumo: Neste estudo o método de analiso de sistemas foi aplicado na analise dos efeitos térmicos durante a secagem em spray. O modelo matemático foi programado em Fortran IV e executado no sistema de computação PDP 10. Assumindo cinética de reação de primeira ordem e diversas energias de ativação estudaram-se o efeito da distribuição de tamanhos das partículas do tamanho das partículas, do teor de sólidos da alimentação do secador e a influência das tempera furas. Os resultados indicam a importância do tamanho das partículas e da energia de ativação da reação no tratamento térmico. A presença de partículas pequenas, ao aumentar a velocidade de secagem, diminui tratamento térmico. Simulando condições de secagem cos dados publicados na literatura, obtiveram-se valores de D212 entre 0,009 e 0,018 minutos a Z = 200 para Salmonella Typhimurium, Thompson e Ketucky. Conclui-se que o tratamento térmico durante a secagen em spray pode ser dividido em duas partes: durarte a secagem e durante o transporte até a saída do secador, sendo em cada uma, indicada a influência qualitativa das variáveis / Abstract: In this study the method of system analysis was applied to analyze the thermal effects during the process of spray drying. The model was programmed in Fortran IV end was executed on system PDP 10 Computer. By assuming the first order reaction and different activation energies, the effects of particle size distribution, particle size, solid content, of feed and influence of temperatures were studied. The results indicated the important effects of particle size and the activation energy of re-action on thermal treatments. The presence of small particles by increasing drying velocity was found to decrease thermal effects. Simulation of drying conditions similar to that of reported in the literature, values of D212 between 0,009 and 0,018 minutes at Z = 200 ºF, were obtained for Salmonella Typhimurium, Thompson e Ketucky. It concluded that thermal effects during spray drying nay be divided in two parts; one during drying: itself and the other during transport to the outlet of the drier. The application of the model was able to evaluate the qualitative effects of various variables on the thermal processes / Mestrado / Mestre em Tecnologia de Alimentos

Orientador: Felix Guillermo Reyes Reyes / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-15T09:04:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Valim_MariaFilomenaClaretFernandesdeAguiar_M.pdf: 3211749 bytes, checksum: e5d04d853abf2ab93d1198eddc9cd677 (MD5) Previous issue date: 1989 / Resumo: Neste estudo foi realizada a avaliação do efeito, na respiração mitocondrial, dos seguintes corantes orgânicos sintéticos artificiais, de uso permitido em alimentos no Brasil: Eritrosina, Ponceau 4R, Vermelho 40, Amarelo Crepúsculo, Amarelo de Tartrazina, Azul de Indigotina, Azul Brilhante e Amaranto, assim como dos corantes: Laranja GGN, Escarlate GN e Vermelho Sólido E. Utilizando-se mitocôndrias isoladas de fígado e de rim de ratos Wistar, verificou-se que estes corantes inibiam a respiração mitocondrial comprovada pelo decréscimo da velocidade de consumo de oxigênio no estado III, desacoplado. Após a verificação deste efeito "in vitro", foi selecionado o corante Eritrosina, para a avaliação "in vivo" de seu efeito na função respiratória mitocondrial. Para tanto, foram utilizados ratos Wistar, machos e fêmeas, submeti dos durante noventa dias, a diferentes ingestões hídricas contendo Eritrosina nas concentrações de, aproximadamente, 0, 100, 500 e 1000 mg de corante par kg de peso corpóreo medi o das ratos de cada grupo. Não foram verificadas diferenças significativas, a nível de 5%, no ganho de peso dos animais, nem efeitos na sua função respiratória mitocondrial hepática. Ao termino do estudo de 90 dias, foi procedida uma avaliação anatomo-histológica dos sistemas digestivo, respiratório, urinário e linfóide, sendo os tecidos fixados e preparados histologicamente segundo técnicas de rotina. O exame anatômico dos órgãos não demonstrou alteração significativa, com exceção da dilatação do ceco dos animais que ingeriram Eritrosina, independente da dose. A observação dos órgãos ao Microscópio Óptico não revelou ocorrência de anomalias. Com exceção do baço, não foi verificada diferença estatisticamente significativa, à nivel de 5%., no peso relativo dos órgãos estudados: fígado, rins e bexiga / Abstract: Eleven organic synthetic dyes currently or formerly permitted as food colors in Brasil were tested to determine their effect on mitochondrial respiratory function using mitochondria isolated from rat liver and kidney. It was verified that these dyes inhibit the mitochondrial respiration by afecting the oxygen uptake rate on state III, in the presence of both a-ketoglutarate and succinate. Erythrosine was selected to investigate this effect, "in vivo". For this purpose, the compound was administrated, on the water, to Wistar rats, male and female, during ninety days at dose levels of , approximately, 0, 100, 500 and 1000 mg/ kg b. w. No significative difference was observed on body weight gain and no effect was found on the hepatic mitochondrial respiratory function of the animals. At the end of the sub-chronic study macroscopic examination of the following animals systems was performed; digestive, respiratory, urinary and 1infoid. The only abnormality observed was enlargement of the caecum of those animals submitted to ingestion of Erythrosine, The organs were also submitted to histological examination according to routine procedures, and their observation at the Optic Microscope revealled no tissular abnormalities. With exception of the spleen of the male rats , no significative difference, at 5% level , was found on the relative organs weight studied (liver, kidneys and bladder) / Mestrado / Mestre em Ciência de Alimentos

Orientador: Mary Anne Heidi Dolder / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-15T14:55:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Quagio-Grassiotto_Irani_M.pdf: 16334575 bytes, checksum: e4058da8ed47ebc42a124980f5affe08 (MD5) Previous issue date: 1983 / Resumo: Espermátides em diferentes fases de maturação e espermatozóide de Ceratitis capitata, provenientes dos testículos dos machos ou das espermatecas das fêmeas deste inseto, foram preparados segundo as técnicas usuais em microscopia eletrônica, contrastada positiva e negativamente e observados em microscópio eletrônico de transmissão. Algumas variações técnicas como a estocagem do mateiral sem prévia fixação, por 7 a 15 dias, a ¿10 GRAUS¿, em glutaraldeido a 0,25%; fixação em glutaraldeido a 3% adicionado de 2% de ácido tânico; pós-fixação em mistura de tetróxido de ósmio adicionado de 0,05M de ferricianeto de potássio ou de 0,5% de ácido- tânico; desidratação em etanol 95% contendo 2% de ácido fosfotúngstico (EPTA) sem e com contrastação por uranila e chumbo, também foram empregadas no preparo dos espécimes em estudo. As observações da espermiogênese em C. capitata mostraram que esta, como nos insetos em geral, caracteriza- se pela formação do "Nebenkern" ou complexo mitocondrial, formação do flagelo, alongamento celular, condensação do material nuclear e eliminação do citoplasma. As espermátides em fase inicial de diferenciação apresentam núcleo e cromatina com aspecto similar ao das células soma ticas e grande quantidade de mitocôndrias no citoplasma. ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: Spermatids in various stages of maturation and spermatozoa of Ceratitis capitata) were obtained from the testis of males and the spermathecae of females. Routinely prepared for transmission electron microscopy) they were positively and negatively stained. A few variations of the basic techniques were also employed, namely: Maintaining spermatozoa w ithout previous fixation in a solution of 0,25% glutaraldehyde for 7 to 14 days, at ¿10 DEGREES¿; fixation in 3% glutaraldehyde to which 2% tannic acid was added; post-fixation in a mixture of 1% osmium tetroxide to which either 0,05M potassium ferricianide or 0,5% tannic acid was added; dehydration in 95%.ethanol) containing 2% phosphotungstic acid (EPTA), with or without staining of the sections. The observations on the spermatogenesis of C. capitata are quite similar to the description of this process for insects in general. It may be defined .by the following steps: .Formation of the "Nebenkern", development of the flagellum, celular elongation, nuclear condensation) and elimination of the excess cytoplasm. Spermatids iniciating their differention have a nucleus and chromatin very similar to somatic cells) as well as a large number of mitochondria dispersed in'the cytoplasm. In the next step) these mitochondria fuse to form the "Nebenkern". ...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Mestrado / Biologia Celular / Mestre em Ciências Biológicas

Acompanha memorial / Tese (livre docencia) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-16T08:27:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lin_C-T(Chhiu-Tsu)_LD.pdf: 6868812 bytes, checksum: c30630d368b20512423fc8c36fe5cc38 (MD5) Previous issue date: 1983 / Tese (livre docencia) - Univer

Orientador: Antonio Sergio Ramalho / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-16T08:55:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maciel-Guerra_AndreaTrevas_D.pdf: 1928831 bytes, checksum: 39b3aa894e12fad7d65e57f4397dbca7 (MD5) Previous issue date: 1989 / Resumo: O Glaucoma Congênito Primário (GCP) é uma entidade genética heterogênea, geralmente considerada distinta da Megalocórnea e do glaucoma congênito de manifestação tardia ou juvenil. A fim de detectar indicações da heterogeneidade genética do GCP a nível clínico, foram examinados 67 portadores dessa anomalia, dos quais se obtiveram dados anamnésticos e de exame oftalmológico. Os resultados da análise se segregação, bem como a alta freqüência de consangüinidade observada nessa amostra indicam que o padrão de herança autossômico recessivo predomina entre nossos pacientes. A associação significativa encontrada entre a recorrência familial do GCP e a existência de consangüinidade entre os genitores, o início das manifestações ao nascimento e a bilateralidade e simetria da doença indica que os casos que manifestem essas três características sejam considerados de alto risco de recorrência na irmandade, enquanto que aqueles em que nenhuma dessas características é observada devam ser considerados os de mais baixo risco. A existência de megalocórnea ou de glaucoma congênito de manifestação tardia ou juvenil em um dos olhos do portador de GCP ou em outros membros da família sugere fortemente que essas entidades nosológicas correspondam a diferentes formas de expressão de uma mesma anomalia básica do ângulo iridocorneal, indicando que devam ser analisadas em conjunto. Estudos aprofundados do glaucoma congênito se fazem necessários, portanto, para elucidação de seus diversos aspectos genéticos e clínicos / Abstract: Primary Congenital Glaucoma (PCG) is a heterogeneous genetic entity which is usuall_ considered distinct from Megalocornea and congenital glaucoma of late or juvenil onset. History and ophthalmological data were obtained from 67 PCG cases in order to find out indications of the genetic heterogeneity_ of this disease at the clinical level. The results obtained from a complex segregation analysis, as well as the high frequency of parental consanguinity in this sample, indicate that the autosomal recessive pattern of inheritance predominate among our patients. A high recurrence risk is expected to the sibs of PCG cases with parental consanguinity, onset of the disease at birth and bilateral and symmetrical involviment, while those which exhibit none of these features seem to be at the lowest risk of having affected sibs. Since megalocornea and congenital glaucoma of late or juvenile onset can be found in the other eye of a PCG patient or in other individuals in the same family, these diseases appear to be manifestations of the same basic abnormality of the iridocornea1 angle. Hence, the_ should be analyzed together with PCG. Comprehensive studies of congenital glaucoma are thus necessary to elucidate its clinical and genetical peculiarities / Doutorado / Doutor em Ciências

Orientador: Philippe Brosson / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Fisica Gleb Wataghin / Made available in DSpace on 2018-07-17T06:27:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pinheiro_ErnestoSa_M.pdf: 1198885 bytes, checksum: a60bee1babac7b401394436953bfb84a (MD5) Previous issue date: 1974 / Resumo: Neste trabalho estudamos em detalhe o comportamento da emissão espontânea em lasers de Arseneto de Gálio ( CaAs ). Este estudo compreendeu duas partes. Na primeira, parte explicamos a não saturação da emissão espontânea no lado de energia baixa da linha do laser, através de urn modelo que se baseava na hipótese de não equilíbrio térmico entre os e elétrons dentro da cauda ( tail ). Na segunda parte, estudamos a emissão espontânea durante e depois da excitação do laser por pulsos de corrente muito rápidos. Nossas medidas de decaimento da emissão espontânea para a corrente acima do limiar e para os estados de energia mais baixa ( na cauda ) mostraram duas constantes de tempo. P. Brosson, J. E. Ripper e N. B. Patel antes observaram Uma redução na intensidade da emissão espontânea em corrente um pouco acima do limiar, para os estados de energia alta da linha do laser e bem próximos desta linha. Este comportamento e as duas constantes de tempo observadas no decaimento da emissão espontânea, interpretamos a partir de um modelo baseado na suposição de não equilibrio térmico ( contrariamente ao que vinha sendo admitido até o presente ) entre os elétrons injetados na região p de um laser de semicondutor. Observamos tempos longos de termalização e de recombinação que aumentavam quando iamos em direção aos estados mais fundos na cauda. Esses tempos mostraram, portanto, uma dependência na energia: quanto mais baixa era a energia na cauda ( tail ) , mais longos eram os tempos de termalização e de recombinação. Observamos tempo longos de termalização mesmo para estados bem próximos e acima da linha do laser. Cálculos computacionais preliminares baseados no nosso modelo concordaram qualitativarnente com os resultados experimentais de medidas de decaimento. Entretanto, estes cálculos ainda estão sendo testados, e por essa razão apresentados aqui / Abstract: Not informed. / Mestrado / Física / Mestre em Física

Orientador: Philippe Brosson / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Fisica Gleb Wataghin / Made available in DSpace on 2018-07-17T06:34:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sartorio_MariaSalete_M.pdf: 4100141 bytes, checksum: 9d71e9b457b0f204c08c1f8626b10fcd (MD5) Previous issue date: 1975 / Resumo: Não informado / Abstract: Not informed. / Mestrado / Física / Mestre em Física

Orientador: Frederico Dias Nunes / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Fisica Gleb Wataghin / Made available in DSpace on 2018-07-17T13:15:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MendozaAlvarez_JulioGregorio_D.pdf: 10704251 bytes, checksum: d194908629d52b9404cb7b8cb63d9158 (MD5) Previous issue date: 1979 / Resumo: Neste trabalho calculamos a variação das partes real e imaginária do índice de refração complexo, devida à injeção de portadores. Nossos cálculos foram feitos para GaAs tipo p, com uma densidade de , impurezas de: NA = l,5.l018 e ND = 3,1017cm-3. A parte real do índice de refração foi calculada através da absorção e das relações de dispersão de Kramers-Kronig modificadas. No cálculo da absorção foram levados em conta: i ) redução na energia da banda proibida produzida pelos portadores nas bandas; ii ) presença de caudas nas bandas de condução e valência como consequência da elevada concentração de impurezas; iii ) influência dos portadores injetados, nas caudas das bandas e no elemento de matriz das transições. Para injeção acima de n0=1.1018cm-3, nós obtivemos que a variação do índice de refração com a injeção n tinha a forma: DN ~ -An+B(hn), sendo que a constante B depende da energia do fóton e é da mesma ordem do que o termo -An para as injeções normalmente usadas nos lasers. Para injeções menores do que n0, DN se aparta da relação de linearidade com n; e ainda para injeções menores do que n' ~ 7.1017cm-3, a variação se torna positiva. A partir dum perfil na densidade de portadores injetados, aplicando nossos resultados acima citados, obtivemos um perfil do índice de refração complexo ao longo da junção. Se discute a influência deste perfil no guiamento na direção paralela à junção dum laser. Um perfil do índice de refração real na direção paralela à junção do tipo sech2( y/y') foi usado para se resolver a equação de onda e obter os modos permitidos pela cavidade; com este perfil conseguimos explicar os dados experimentais da variação na separação em comprimento de onda entre os modos adjacentes transversais paralelos a junção. São discutidos os campos próximo e distante resultantes deste perfil. O caso de lasers de heteroestrutura dupla é discutido, e se obtém uma variação efetiva no índice de refração a qual depende da injeção, da variação de temperatura e do fator de confinamento. Finalmente, algumas aplicações dos nossos cálculos foram feitas, obtendo-se expressões, para a variação com a temperatura dos parâmetros hc e hv que medem a profundidade das caudas, e para o ganho em função da injeção e da energia (válida para energias em torno daquela correspondente a gmax) / Abstract: In this work, we calculated the variation of the real and imaginary parts of the complex refractive index, due to carrier injection. Our calculations were made for p-type GaAs with density of impurities: NA = 1.5×10l8 , ND = 3×10l7cm-3. The real part of the refractive index was calculated through the absorption coefficient and modified Kramers-Kronig dispersion relations. In calculating the absorption we taken into account: i ) bandgap shrinkage due to carrier exchange interaction; ii ) tails in the conduction and valence bands arising fran the high impurity density; iii ) injected carrier influence on the bandtails and on the transition matrix elerrent. We obtained that for injection greater than n0 = 1×l018cm-3, the refractive index variation with injection is: DN ~ -An+B (hn), where B is a constant depending on the photon energy and of the same order that the term -An for the normal injection used in lasers. For carrier injection less than n0, DN apparts from the linearity with n; and if n is less than n' ~ 7×10l7cm-3, DN will be positive. By using an injected carrier density profile, we applied our results cited above, and obtained a complex refractive index profile along the junction. The influence of this profile on guiding along the junction was discussed. We used a real refractive index profile along the junction plane of the form sech2( y /y') into the wave equation to obtain the permitted cavity modes; using this profile, we explained experimental data on the wavelenght separation variation between adjacent modes transverse parallel to the junction plane. We discussed the near - and far-field radiation patterns resulting from this profile. The double-heterostrocture laser case is discussed, obtaining an effective refractive index variation depending on carrier injection, temperature variation and confinement factor. Finally, sare applications of our calculations were made, resulting in expressions: for the temperature variation of the bandtail parameters hc and hv, and for the gain as a function of carrier injection and photo energy (valid for energies around of that corresponding to gmax) / Doutorado / Física / Doutor em Ciências

Orientador: Attilio Jose Giarola / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Eletrica / Made available in DSpace on 2018-07-20T03:01:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Barbosa_WagnerGomes_M.pdf: 3650825 bytes, checksum: f822510b69368dda782a0560b0800a37 (MD5) Previous issue date: 1995 / Resumo: Um desenvolvimento teórico é aqui apresentado para a análise de antenas de microfita sobre superfície cônica e operando no modo T MlO. Três antenas de microfita são propostas e analisadas, duas delas com um único patch e urna com dois patches, simetricamente localizados, ao redor da superfície cônica. Nessa análise, o modelo de cavidade com paredes laterais magnéticas é utilizado para o cálculo da freqüência de ressonância e da impedância de entrada. A formulação através das funções diádicas de Green é utilizada pa.ra a obtenção dos campos radiados pelas antenas, na região dos campos distantes. Resultados numéricos para essas antenas são apresentados para: 1) freqüência de ressonância, 2) impedância de entrada em função do ponto de alimentação e da freqüência e 3) diagrama de radiação. O conhecimento destes resultados é importante para o projeto das antenas consideradas / Abstract: A theoretical development is presented here for the analysis of microstrip antennas on a conical surface and operating in the T MIO mode. Three microstrip antennas are proposed and analyzed, two of them with a single patch and one with two patches, symmetrically located around the conical surface. In this analysis the cavity model with magnetic side walls is used for the calculation of the resonant frequency and input impedance. The dyadic Green's functions formulation is used for obtaining the fields radiated by the antennas, in the far field region. Numerical results for these antennas are shown for: 1) resonant frequency, 2) input impedance as function of feed position and of frequency, and 3) radiation pattern. The knowledge of these results is important for the design of this considered antennas / Mestrado / Mestre em Engenharia Elétrica