L'émergence et la propagation des technologies de communication à travers le monde ont facilité l'accélération du rythme de l'innovation dans une multitude de domaines. Avec un accès quasi-continu aux flux de l'information, la façon dont les humains vivent a changé, et avec elle ont évolué la structure et la fonction des entreprises, des marchés et de leurs composants. Dans cette thèse, nous explorons la co-évolution des entreprises et des marchés et analysons la création d'une nouvelle architecture organisationnelle qui résulte de cette co-évolution.Dans le chapitre 1, nous explorions les nombreuses branches de la littérature sur la théorie de la firme et la confrontons au phénomène de platformization des marchés au travers de l'étude d'eBay. Suite à l'analyse détaillée de cette étude de cas, le chapitre 1 conclut que le concept de l'entreprise a subi une métamorphose et que ses contours se redéfinissent aujourd'hui au-delà des définitions traditionnelles et contemporaines de l'entreprise. Pour résoudre ce problème, nus proposons la notion d'équivalence firme / marché. Ce concept sera ensuite utilisé dans les trois autres chapitres de la thèse.Quand les économistes voient une défaillance de marché, les entrepreneurs voient une opportunité d'affaire. Les entreprises d'aujourd'hui sont un entrelacement complexe d'interactions qui répondent aux défaillances du marché. Dans ce chapitre 2, nous expliquons comment les entreprises adressent ces opportunités de marchés grâce à des stratégies d'intermédiation passant par la création de plates-formes. Non seulement les entreprises facilitent l'activité du marché en fournissant aux autres participants des ressources de base, mais elles prennent également un rôle de premier plan dans la régulation de l'ensemble des activités économiques ainsi générées. L'objectif du chapitre 2 est d'explorer le phénomène de la double fonction de l'entreprise (création de marchés et soutien du marché) grâce à la notion d'équivalence firme / marché. Nous expliquons le rôle des entreprises qui choisissent de se positionner comme intermédiaire et qui prennent à leur charge la construction, le fonctionnement et le support de la plate-forme. Dans la littérature, ces entreprises sont appelées entreprises centrales, keystones, catalyseurs, ou tout simplement plates-formes. Ces entreprises sont capables d'attirer à elles une multitude de partenaires qui forment ce qu'une partie de la littérature appelle des écosystèmes d'affaires.Le chapitre 3 propose un regard différent sur la stratégie de création d'une plate-forme. Alors que dans le chapitre 2 nous nous sommes concentrés sur les entreprises qui créent et soutiennent les plates-formes, dans ce troisième chapitre, nous examinons de plus près les autres participants. Nous abordons ces participants comme des entreprises-satellites en raison de leur tendance à graviter vers les créateurs et les opérateurs de plate-forme. Nous étudions le rôle de ces entreprises-satellites dans les écosystèmes à base de plate-forme et observons que certaines entreprises-satellites peuvent potentiellement faire peser des menaces sur les détenteurs de plate-forme. Nous discutons ensuite les questions des clusters et du multi-homing, ainsi que la façon dont ces phénomènes affectent les entreprises centrales et leurs écosystèmes d'affaires. Nous concluons que ces comportements sont une source de pression concurrentielle entre les détenteurs de plateforme. Le chapitre 4 traite de la dynamique de l'équivalence entreprise / marché. Idéalement, l'équivalence entreprise / marché présente deux dimensions : l'innovation et le développement commercial. Dans ce modèle, la plate-forme est un artefact socio-technique central qui soutient les stratégies d'ouverture par rapport à ces deux dimensions. Elle facilite le partage et les échanges entre les participants. Ces systèmes ne sont pas statiques. / Emergence and spread of telecommunication technologies throughout the world facilitated acceleration in the pace of innovationin multitude of domains. Having access to the ongoing stream of information, the way human live has changed, and with it evolved the appearance and function of firms, markets, and their constituents. In this thesis we explore the co-evolution of firms and markets and observe the creation of new organizational architecture that resultas from this co-evolution. In chapter 1 we explore the numerous branches of the theory of the firm lterature and confront it to the phenomenon of platformization of markets through the study of the eBay case. Following the detailed annalysis of this case study, chapter 1 concludes that the concept of firm has undergone metamorphosis and has been redefined beyond the traditional and contemporary definitions of the firm. To adress this, we hence propose the concept of film / market equivalency. This concept is thoroughly explained ans discussed in the three chapters that follow. What the economists call a market failure, the entrepreneurs call a market opportunity. Firms today are the intricate interlacing of interactons, which arise in response to market failures. In chapter 2 we describe how the market opportunities that emerge as a result are adressed by the firms through market support strategy, i.e through creation of platforms. Not only do the firms facilitate marketa ctivity by providing participants with basic ressources, firm also take up a leading role in the regulation of all of their creation's activities. The purpose of chapter 2 is to explore the phenomenon of concurrent double function of firm, market creation and market support, through the concept of film / market equivalency. We explain the role of firms that that choose to position themselves as intermediaries and take charge over platform construction, operation and support. In the literature, ssuch firms are referred to as central partners who form what the management calls business ecosystems. Chapter 3 discusses a different take on the platform creation strategy. Whereas in chapter 2 we focused on the types of firms that create and support the platforms,in the third chapter we take a closer look at the constituents of platforms : the small players. In text we adress these players as "firms-satellites" due to their tendency to gravitate toward creators and operators of platforms. We study the role of these firms-staellites in the platform-based ecosystems and identify that some of firms-satellites may potentially bear threats to the platform owners. We then discuss the issues of clustering and multi-homing as welle as how these issues affect central firms, their business ecosystems and whether or not these behaviors are a source of competitive pressure. Chapter 4 discusses the dynamics of firm / market equivalency. Ideally, firm / market equivalency has two dimensions : innovation and business development. In this model, the platfform is a central sociotechnical artefact that supports openness strategies in both dimensions. It facilitates sharing and exchanges among participants. Such systems are not static. They co-evolve with their constituents : the participants and the platform owner. This chapter explores the dynamics involved in firm / market equivalency models. For each stage of development (birth, expansion, leadership, renewal), we study the architecture of the platform, the behaviour of participants and the strategic responseof the platform owner. We conclude the thesis with discussion ofa ntitrust issues that do or may arise as the result of employment of amrket creation and support strategies.

Les biotechnologies mobilisées aujourd'hui dans les bioindustries requièrent des compétences qu'une entreprise ne peut plus maîtriser seule. L'aboutissement d'innovations disruptives implique une approche pluridisciplinaire nécessitant l'intervention de plusieurs secteurs industriels ce qui s'oppose à une logique d'innovation propriétaire. La transversalité nécessaire à ces rapprochements entre entreprises privées et secteurs public et ou entre industries issues de secteurs d'activités différents modifie profondément la nature des modèles d'organisation. Parmi l'ensemble des modèles adoptés, celui des écosystèmes d'affaires (EA) occupe une place de plus en plus centrale dans les bioindustries. L'optimisation des logiques d'innovation associées est devenue un enjeu auquel même les institutions tentent de répondre en soutenant l'adoption de logiques d'innovation ouverte (IO) et le développement d'EA. Pourtant la nature de ces deux notions restent discutées et leur combinaison théorique mal comprise. Bien que les études de cas montrent que les EA appuient leur développement sur l'IO dans les domaines dont le développement repose sur la connaissance, la nature et la séquence de mise en œuvre des concepts mobilisés restent à déterminer. De plus, le débat demeure concernant la nature ontologique et les limites épistémologiques des notions d'IO et d'EA. Cette thèse s'efforce de préciser ces éléments puis elle détermine quel rôle est joué par l'IO dans l'émergence des EA dans les bioindustries françaises.L'analyse ontologique de la notion d'EA révèle la valeur purement métaphorique des transpositions effectuées par Moore depuis l'écologie pour en établir la définition. Par conséquent, l'approche analogique adoptée par une partie des scientifiques ne peut être retenue pour établir les limites épistémologiques de la notion d'EA. La nature ontologique de la notion d'IO reste incertaine. Nature des flux d'informations inter-organisationnels et capacités dynamiques des firmes sont conjointement mobilisés. Cette incertitude n'étant pas permissive à la réalisation d'une analyse épistémologique, les capacités dynamiques sont ici choisies comme fondement théorique de l'IO. L'analyse épistémologique de la notion d'EA démontre l'application d'une boucle récursive dans sa construction. De plus, elle révèle l'existence d'une théorie substantive derrière la notion d'EA, théorie mobilisant une séquence de concepts mise en œuvre successivement dans l'émergence des EA. L'IO étant l'une des notions mobilisées.La posture épistémologique adoptée dans cette thèse est celle du réalisme critique. Elle permet la prise en compte de la boucle récursive, est adaptée à l'approche par les théories ancrées, et intègre les circonstances intrinsèques et extrinsèques justifiant la manière dont les mécanismes générateurs sont activés. Elle autorise la formulation d'hypothèses fondatrices d'ordre ontologique. Ce choix permet de conserver la posture épistémologique séminale implicite de Moore, de légitimer la valeur de sa démarche ancrée, d'assumer l'hypothèse ontologique formulée à propos des fondements de l'IO, et de tenir compte des facteurs tant environnementaux qu'organisationnels justifiant de l'émergence des EA. La méthodologie d'analyse qui en découle est qualitative. Elle passe par une comparaison de deux études de cas réalisées sur la base d'analyses de données secondaires. Les facteurs contextuels de chaque cas sont corrélés afin de dévoiler les mécanismes générateurs justifiant du rôle de l'IO dans l'émergence des EA.Les résultats confirment la séquence de mise en œuvre des concepts proposés par Moore dans l'émergence des EA pour les bioindustries françaises. Ils précisent la place de l'IO dans cette séquence en spécifiant son rôle dans le passage de la collaboration à la coévolution des firmes au sein de l'EA. Ils confirment que l'EA ne constitue pas un modèle d'organisation en soi mais une posture inter-firmes favorisant l'adoption de modèles adaptés. / Biotechnologies mobilized today in bio-industries require skills that companies can no longer control alone. The development of disruptive innovations involves a multidisciplinary approach requiring the intervention of several industrial sectors that is opposed to proprietary innovation logic. Transversality necessary for these collaborations between private companies and public sectors and or between industries from different business sectors profoundly changes the nature of organizational models chosen by firms. Among all the models adopted, the business ecosystem (BE) occupies a more and more central place in bio-industries. The optimization of the associated logical innovation has become a challenge that even the institutions are trying to respond by supporting the adoption of open innovation logics (OI) and the development of BE. Yet, the nature of these two notions is still discussed and there theoretical combination remains poorly understood. Although case studies show that BE support their development on OI in knowledge based industries, nature and implementation sequence of underlying concepts remain to be determined. Moreover, the debate remains regarding the ontological and epistemological limits of OI and BE notions. This thesis seeks to clarify these elements and determines what role is played by the OI in the emergence of BE in the French bio-industries.The ontological analysis of BE notion reveals the purely metaphorical transpositions made by Moore from ecology to establish its definition. Therefore, the analogical approach supported by a part of the scientific community can't be applied to establish the epistemological limits of BE notion. The ontological nature of OI notion remains uncertain. Nature of inter-organizational information flows and dynamic capabilities of firms are jointly mobilized. This uncertainty is not permissive to the achievement of an epistemological analysis, therefore dynamic capacities here were chosen as theoretical foundations of the OI notion. The epistemological analysis of the development of BE notion demonstrates the application of a recursive loop in its construction. Moreover, it reveals the existence of a substantive theory behind the BE notion, theory which mobilizes a sequence of concepts implemented successively in the emergence of BE. The OI is one of mobilized notions.The epistemological posture adopted in this thesis is that of critical realism. It allows the inclusion of the recursive loop. It is suitable for the approach by grounded theories. It integrates intrinsic and extrinsic circumstances justifying how generating mechanisms are activated. It allows the formulation of founding ontological assumptions. This choice preserves Moore's implicit epistemological posture, legitimizes the value of its grounded approach, assumes the ontological assumption made about the foundations of OI notion, and takes into account both environmental and organizational factors justifying the emergence of BE. The resulting methodology is qualitative. It goes through a comparison of two case studies based on secondary data analysis. Contextual factors of each case are correlated to reveal the generative mechanisms justifying the role of OI in the emergence of BE.The results confirm the implementation sequence of concepts proposed by Moore in the emergence of BE in the French bio-industries. They precise the place of OI in this sequence by specifying its role in the transition from collaboration to co-evolution of firms within BE. They confirm that BE is not an organizational model in itself, but an inter-organizational stance promoting the adoption of appropriate models.