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Caracterização citogenética do gênero Eigenmannia (Teleostei:Gymnotiformes) das bacias Amazônicas, do Prata e do rio São Francisco: inferências sobre a diversificação cariotípica e origem e evolução dos cromossomos sexuaisJaime, Cristian Andrés Araya [UNESP] 29 July 2015 (has links) (PDF)
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000866048.pdf: 1772468 bytes, checksum: a3e7a4ffd79b2967e014506e0bde4ccb (MD5) / Comisión Nacional de Investigación Ciencia y Técnologia (CONICYT) / No presente trabalho, foram analisadas seis espécies/citótipos de peixes do gênero Eigenmannia, sendo E. microstoma, E. limbata, E. virescens, E. aff trilineata, Eigenmannia sp1 e Eigenmannia sp2, de diferentes bacias hidrográficas brasileiras, com o uso de técnicas citogenéticas básicas envolvendo a coloração com Giemsa e bandamento C e também técnicas de citogenética molecular, com a aplicação de hibridação in situ fluorescente (FISH) envolvendo o uso de sondas de DNAr 18S e 5S, DNA histônico H3/H4 e de RNAsn U2. Também foi estudado o comportamento meiótico e o nível de diferenciação do sistema múltiplo de cromossomos sexuais de Eigenmannia sp2 por imunodetecção de proteínas do complexo sinaptonêmico (SYCP3), proteínas relacionadas com a atividade da cromatina (H3K9me) e marcadores do tipo proteína γH2AX envolvida no reparo das quebras do DNA e associadas ao nível de pareamento dos bivalentes nos cromossomos meióticos. Finalmente, os dados da caracterização citogenética foram comparados com análises de DNA barcode para permitir uma melhor delimitação das espécies/citótipos analisados neste estudo. Os representantes analisados deste grupo confirmara a apresentação de expressiva variação no número diplóide, tendo sido observados deste cariótipos compostos por 28 cromossomos em Eigenmannia sp1 até o número diplóide de 38 cromossomos em E. microstoma, E. limbata e E. virescens. Em E. aff trilineata foi descrita pela primeira vez a ocorrência de um polimorfismo cromossômico do tipo ZZ/Z0 associado ao sexo, em que os machos apresentam cariótipos compostos por 32 cromossomos enquanto as fêmeas possuem cariótipos constituídos por 31 cromossomos. Sequências de DNAr 5S e RNAsn U2 foram localizadas em diferentes cromossomos, com variação na quantidade de sítios entre as espécies, enquanto o DNAr 18S apresentou-se conservado em relação ao número de cromossomos portadores, porém variando na... / In the present study, six species/cytotypes from de genus Eigenmannia collected at different Brazilian hydrographic basins were analyzed, including E. microstoma, E. limbata and E. virescens, E. aff trilineata, Eigenmannia sp1, and Eigenmannia sp2 using classical (Giemsa conventional staining and C-banding) and molecular cytogenetic techniques (fluorescence in situ hybridization with 5S and 18S rDNA, H3/H4 histone genes and U2 snDNA probes). Besides that, it was studied the meiotic behavior and the differentiation level of multiple sex chromosome system in Eigenmannia sp2 by immunodetection for synaptonemal complex proteins (SYCP3), proteins related to chromatin activity (H3K9me) and associated markers with the bivalent level pairing of the meiotic chromosomes (γH2AX). Finally, the cytogenetics results were analyzed in conjunction with the barcode DNA analysis for a better delineation of species/cytotypes studied. The analyzed species/cytotypes showed diploid number variation, with diploid numbers ranging from 28 chromosomes in Eigenmannia sp1 to 38 chromosomes in E. microstoma, E. limbata and E. virescens. In E. aff trilineata, for the first time, showed a ZZ/Z0 sex chromosome system, where males have karyotypes with 32 chromosomes to 31 chromosomes to females. 5S rDNA and U2 snDNA were located on different chromosomes, with variations on the number of clusters in the different species, while the 18S rDNA was conserved in number of sites per genome and variable in location. The meiotic analysis in the sex chromosomes of Eigenmannia sp2 showed a completely synaptic sexual trivalent X1X2Y formation without unsynaptics presence and inactive chromatin regions throughout its structure. These results suggest that this sex chromosomes system would be a recent rearrangement or simply it is a sex-linked character in this population. All the six species/cytotypes of Eigenmannia analyzed were easily ...
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Ninho ou esconderijo? Função da escavação do substrato em ciclídeosSilva, Fernanda Pereira Corbeira da [UNESP] 29 June 2015 (has links) (PDF)
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000869177.pdf: 1065595 bytes, checksum: 37bc4618eb2db5eb22e11d17faf92e0d (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Atualmente, a função das depressões que machos de muitas espécies de ciclídeos escavam no substrato é para atração de fêmeas para a reprodução. Assim, tais depressões têm sido consideradas um fenótipo estendido dos machos, ou seja, representam um caracter a mais, pelo qual a fêmea pode escolher o melhor macho. Assim, é esperado que somente os machos escavem e, sobretudo, em contextos reprodutivos. No entanto, em nosso estudo 1 vimos que tanto machos quanto fêmeas sexualmente imaturos já escavam essas depressões e que esse comportamento surge também na ausência da interação com coespecíficos e num período restrito da ontogenia. Isso ocorreu tanto para a domesticada tilápia-do-Nilo (Oreochromis niloticus) quanto para o selvagem cará (Geophagus brasiliensis). Isso sugere que o comportamento de escavar tenha uma forte determinação genética e outra função biológica relevante além da reprodução. No estudo 2, investigamos na tilápía-do-Nilo se essa outra função poderia ser a busca por alimento, uma vez que os padrões motores na escavação e no forrageamento do substrato são semelhantes. Contudo, vimos que a resposta de peixes com fome não satisfez as predições dessa hipótese. A fome do peixe não influenciou a frequência com que machos e fêmeas escavaram e nem o tamanho de suas escavações. Finalmente, no estudo 3 mostramos que as escavações de machos e fêmeas servem como refúgio, pois suas características permitem que os peixes se escondam dentro delas, a presença de uma toca no aquário reduz drasticamente a frequência de escavação, as escavações são posicionadas mais distantes de áreas abertas (perigo) e os peixes ficam dentro das escavações durante período de inatividade noturna. Isso indica que as escavações podem ter função de abrigo para evitar perigos potenciais
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Identificação e estimativa pesqueira de tubarões na costa de São Paulo (Província Argentina) utilizando marcadores genéticosUssami, Luis Henrique Fregadolli [UNESP] 21 September 2015 (has links) (PDF)
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000869206.pdf: 1021410 bytes, checksum: f183acbdffb2ad0ddb24e51f8eabd122 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Tubarões e raias estão atualmente entre os vertebrados mais ameaçados de extinção. Tal fato se deve principalmente à exploração pesqueira que permanece sem medidas eficientes de controle em quase todo o planeta, inclusive no Brasil. Considerando-se que cada espécie responde de forma independente às pressões ambientais e principalmente às ações humanas, é de fundamental importância para o desenvolvimento de planos de manejo adequado das suas populações e o ordenamento da exploração sustentável destes recursos que se proceda à caracterização da biodiversidade local, a avaliação das espécies mais capturadas e identificação dos táxons e populações mais suscetíveis à pesca. Contudo, especialmente para os elasmobrânquios, tais parâmetros são de difícil acesso, sobretudo devido às similaridades morfológicas entre as espécies e ainda, devido à prática pesqueira de remoção de partes dos animais como a cabeça e nadadeiras antes dos desembarques, inviabilizando a identificação da maioria das espécies. Segundo os registros de captura de elasmobrânquios elaborados pelo IBAMA nos últimos anos, apenas cerca de 20% dos indivíduos recebem alguma menção quanto à espécie, muitas vezes um nome popular que pode estar relacionado a mais de uma espécie biológica em diversos casos, sendo o restante do produto classificado apenas como cações. A utilização de ferramentas moleculares nos estudos da composição da biodiversidade tem proporcionado sua aplicação em diversas áreas, incluindo na identificação das espécies, no estudo de suas relações evolutivas e no auxílio de programas para a sua conservação. A identificação molecular com a utilização de técnicas do tipo PCR-multiplex e sequências barcode, que identificam características genéticas particulares de cada táxon estão atualmente sendo desenvolvidos e utilizados no reconhecimento das espécies, possibilitando a identificação... / Sharks and rays are currently among the most threatened vertebrate to extinction. This is due mainly to the fact that overfishing remains without effective control measures in almost the entire planet, including Brazil. Considering that each species responds independently to environmental pressures, and mainly to human actions, it is of fundamental importance for the development of appropriate management plans and programming the sustainable exploitation of these resources, to proceed to the characterization of local biodiversity, in the assessment of the species caught, in the correct identification of taxa and the most susceptible populations to fishing activities. However, especially for elasmobranches, such parameters are difficult to access, especially due to morphological similarities between species and also because of the fishing practice of removing parts such as the head and fins before landings, making it impossible to identify the most species. According elasmobranches capture records prepared by IBAMA in recent years, only about 20% of individuals receiving some identification indication, often only a popular name that can be related to more than one biological species, with the remainder fishing product classified just as sharks. The use of molecular tools in studies of the composition of biodiversity has provided its application in various areas, including in the identification of the species, in the study of their evolutionary relationships, and in assisting programs for their conservation. The use of molecular identification techniques as the PCR-multiplex type, and barcode sequences using part of the mitochondrial gene sequence Cytochrome Oxidase subunit I that permit to identify particular genetic characteristics of each taxon, are currently being used in the species recognition allowing simultaneous identification of different samples. In the present work, the objective of the study was to identify the species occurring...
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Identificação de estoques de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) através do uso de marcadores molecularesWalmsley, Sandra Menezes [UNESP] January 2004 (has links) (PDF)
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000224730.pdf: 549508 bytes, checksum: 7a91f508f5a084483c62c5a08f3ec1bd (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Este trabalho apresenta os problemas relacionados à implantação de um programa de melhoramento genético das tilápias-do-Nilo (Oreochromis niloticus) a partir de linhagens importadas para o Brasil, e uma contribuição no sentido de superá-los. Uma revisão de literatura é apresentada, onde são discutidos aspectos genéticos da formação dos estoques nacionais e as dificuldades que este processos geram para o melhoramento genético, as possibilidades oferecidas pela genética molecular para superá-las, os princípios de funcionamento da seleção assistida por marcadores moleculares (MAS) de DNA e do uso dos marcadores RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), para subsidiar uma recomendação de procedimentos gerais para a formação de banco genético da espécie e condução de programas de MAS com a espécie . Os dois capítulos seguintes apresentam contribuições para este objetivo, na forma de artigo científico. A primeira delas tem objetivo de investigar o potencial genético de quatro linhagens comerciais provenientes de diferentes estoques cultivados no país, para fins de formação de plantel híbrido intraespecífico a ser utilizado em programa de melhoramento genético. O objetivo da segunda é investigar a viabilidade técnica da utilização de dois índices de forma do corpo, como fenótipos correlacionados ao rendimento de filé para programa de melhoramento genético / This work presents the main problems related to the implantation of a genetic improvement program of Nile tilapia (Oreochromis niloticus) based on imported strains to Brazil and a contribution in order to overcome them. An overview is provided on the formation of national lineages, the difficulties brought by this process to genetic improvement, the possibilities offered by molecular genetic to overcome them, the DNA markers assisted selection (MAS), and the use of RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) markers in this process. A series of recommendation of general procedures for the formation of genetic bank and conduction of the MAS program for such species. The two following chapters present contributions of these objectives in a scientific paper form. The first one intends to investigate the genetic potential of four commercial strains proceeding from different stocks in Brazil in order to form an intra-specific hybrid plantel used in a genetic improvement program. The second one investigates the technical viability in the application of two body form indexes as correlated phenotypes to the fillet and carcass yield in a genetic improvement program
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Identificação de estoques de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) através do uso de marcadores moleculares /Walmsley, Sandra Menezes. January 2004 (has links)
Orientador: Fausto Foresti / Resumo: Este trabalho apresenta os problemas relacionados à implantação de um programa de melhoramento genético das tilápias-do-Nilo (Oreochromis niloticus) a partir de linhagens importadas para o Brasil, e uma contribuição no sentido de superá-los. Uma revisão de literatura é apresentada, onde são discutidos aspectos genéticos da formação dos estoques nacionais e as dificuldades que este processos geram para o melhoramento genético, as possibilidades oferecidas pela genética molecular para superá-las, os princípios de funcionamento da seleção assistida por marcadores moleculares (MAS) de DNA e do uso dos marcadores RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), para subsidiar uma recomendação de procedimentos gerais para a formação de banco genético da espécie e condução de programas de MAS com a espécie . Os dois capítulos seguintes apresentam contribuições para este objetivo, na forma de artigo científico. A primeira delas tem objetivo de investigar o potencial genético de quatro linhagens comerciais provenientes de diferentes estoques cultivados no país, para fins de formação de plantel híbrido intraespecífico a ser utilizado em programa de melhoramento genético. O objetivo da segunda é investigar a viabilidade técnica da utilização de dois índices de forma do corpo, como fenótipos correlacionados ao rendimento de filé para programa de melhoramento genético / Abstract: This work presents the main problems related to the implantation of a genetic improvement program of Nile tilapia (Oreochromis niloticus) based on imported strains to Brazil and a contribution in order to overcome them. An overview is provided on the formation of national lineages, the difficulties brought by this process to genetic improvement, the possibilities offered by molecular genetic to overcome them, the DNA markers assisted selection (MAS), and the use of RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) markers in this process. A series of recommendation of general procedures for the formation of genetic bank and conduction of the MAS program for such species. The two following chapters present contributions of these objectives in a scientific paper form. The first one intends to investigate the genetic potential of four commercial strains proceeding from different stocks in Brazil in order to form an intra-specific hybrid plantel used in a genetic improvement program. The second one investigates the technical viability in the application of two body form indexes as correlated phenotypes to the fillet and carcass yield in a genetic improvement program / Doutor
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Perfil de expressão e organização genômica de micrornas músculo-específicos na tilápia-do-nilo (Oreochromis nicoticus) /Nachtigall, Pedro Gabriel. January 2012 (has links)
Orientador: Danillo Pinhal / Banca: Alexandre Rossi Paschoal / Banca: Patrícia Pintor dos Reis / Resumo: MicroRNAs são pequenas moléculas de RNA que regulam pós-transcricionalmente a expressão gênica em diversas vias celulares específicas. Recentemente, alguns miRNAs de ação músculo-específica, especialmente aqueles expressos no músculo estriado esquelético, têm sido associados à regulação da biologia muscular, com papel fundamental no controle de eventos como miogênese e crescimento muscular hipertrófico e hiperplásico, além de constituírem vias metabólicas extremamente conservadas entre os vertebrados. A tilápia do Nilo é considerada um excelente modelo biológico para o estudo de miRNAs em vertebrados devido à sua importância econômica e por apresentar o genoma completo sequenciado. Contudo, pouco é conhecido a respeito da dinâmica evolutiva de miRNAs e sua potencial atuação na regulação dos mecanismos moleculares promotores do desenvolvimento do tecido muscular na espécie. Assim, foram realizados dois estudos direcionados para a (i) avaliação do perfil de expressão de miRNAs músculo-específicos e seus alvos no tecido muscular de adultos da tilápia do Nilo, e para (ii) analisar o padrão de organização genômica desses miRNAs em diferentes espécies de peixes e estabelecer comparações com outros grupos de vertebrados. Os principais resultados obtidos na análise do perfil de expressão no tecido muscular esquelético de cinco miRNAs músculo-específicos (miR-1, -133a, -133b, -206 e -499) evidenciaram um alto nível de expressão do miR-499 no músculo vermelho em comparação aos níveis observados no músculo branco. Esses dados, corroborados pela hibridação in situ e análise da expressão de genes alvo do miR-499, sugerem sua participação como elemento central na regulação de vias metabólicas particularmente ativas no músculo de contração lenta (vermelho) na tilápia do Nilo. De modo geral, as análises genômicas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: MicroRNAs are small RNA molecules that post-transcriptionally regulate gene expression in various specific cell pathways. Recently, some miRNAs have been described to have a muscle-specific action and has been associated with regulation of muscle biology with fundamental roles in myogenesis. The Nile tilapia is considered an excellent biological model for the study of miRNAs in vertebrates due to their economic importance and to present the complete genome sequenced. However, little is known about the evolutionary dynamics of miRNAs and their potential role in regulating the molecular mechanisms that promote the muscle development on Nile tilapia. Thus, two studies were conducted: (i) a study to evaluate the expression pattern of muscle-specific miRNAs and their targets in different skeletal muscle types in adults of Nile tilapia, and (ii) a study to analyze the comparative evolutionary dynamics and genomic organization of these miRNAs in fish genomes. Our expression analysis by qPCR and in situ hybridization, carried out on five muscle-specific miRNAs (miR-1, -133a, -133b, -206 and -499), revealed a highly differential expression of miR-499 in red skeletal muscle (slow-twitch). These data evidenced the key role played by the miR-499 in the maintenance of the slow-twitch muscle type in Nile tilapia. The comparative genomic analysis performed on six species of fish showed a conserved dynamism for the muscle-specific miRNAs analyzed (miR-1-1/-133a-2, miR-1-2/133a-1, miR-206/133b, miR-214 e miR-499). However, a copy of miR-214 was detected in the genome of five species belonging to the superorder Acanthopterygii. Interestingly, this copy also has a high level of synteny over the species when it was detected. Thus, the obtained data may assist in the understanding of the role of muscle-specific miRNAs in muscle biological pathways... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Desenvolvimento e identificação de mirossatélites para pirarara - Phractocephalus hemioliopterus (Siluriformes, Pimelodidae) : para análise de variabilidade genética /Souza, Caroline Araújo de. January 2012 (has links)
Orientador: Fábio Porto-Foresti / Banca: Diogo Teruo Hashimoto / Banca: Fernanda Simões de Almeida / Resumo: A pirarara (Phractocephalus hemioliopterus) é um bagre nativo das bacias do rio Amazonas e Tocantins-Araguaia que pode atingir na sua fase adulta cerca de 60 kg. A pirarara é comercializada como peixe ornamental e é um peixe atrativo para a pesca esportiva. A espécie pertence à família Pimelodidae e tem sido ameaçada em seu habitat devido à crescente interferência antrópica nas últimas décadas. O acesso aos dados sobre a situação destas populações constitui um importante meio para o delineamento de projetos de manejo, a fim de conservar a espécie e manter os estoques de reprodutores para piscicultura. Para este fim, os marcadores microssatélites são interessantes para estudos genéticos devido a sua natureza codominante e multialélica, características ideais para serem utilizados em estudos de mapeamento genético, identificação e elucidação de questões sobre a genética de populações de diferentes organismos. Neste contexto, o presente projeto teve por objetivo a identificação e seleção de marcadores moleculares tipo microssatélites para indivíduos da espécie Phractocephalus hemioliopterus, coletados nos Rios Araguaia e Rio das Mortes,e avaliar a estrutura e os níveis de diversidade genética nessas duas localidades. Inicialmente, foram seqüenciadas 67 colônias recombinantes, dos quais apenas 32 continham sequências repetitivas do tipo microssatélite. Destas, 62,5% eram repetições dinucleotídicas e o restante composto por trinucleotídeos e tetranucelotídeos repetidos de forma imperfeita. Deste total, foi possível desenhar primers para 26 loci. Após a amplificação por PCR, 9 loci se mostraram polimórficos e informativos, e foram testados em seis espécies próximas, para a investigação de regiões no DNA altamente conservadas, com sucesso de amplificação de 81,4%. A heterozigosidade observada... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The catfish pirarara (Phractocephalus hemioliopterus) is a native Amazonas and Tocantins-Araguaia basin fish, which can weigh up to about 60 kg in its adult form. The pirarara is marketed as an ornamental fish and it is an attraction for sport fishing. The species belongs to the family Pimelodidae and it has been threatened in its habitat due to increasing human interference in recent decades. Access to data on the situation of these populations is an important means for the design of management projects in order to conserve the species and maintaining the stocks of fish breeding. The microsatellite markers for genetic studies are interesting because of their codominant and multiallelic nature, ideal characteristics for use in studies of gene mapping, identification and elucidation of questions about population's genetics of different organisms. In this context, this project aimed to identify and select microsatellite markers on Phractocephalus hemioliopterus individuals, collected in the Araguaia and das Mortes Rivers, and to evaluate the structure and levels of genetic diversity. Initially, 67 recombinat colonies were sequenced, of which only 32 contained repetitive sequences of the microsatellite type. Of these, 62.5% were dinucleotide repeats, and the remainder consisted of trinucelotide and tetranucleotide imperfect repeats. Of this total, it was possible to design primers for 26 loci. After PCR amplification, nine loci showed to be polymorphic and informative, and were tested on six related species for the investigation of highly conserved DNA regions, with a successful amplification of 81.4%. The observed heterozygosity ranged from 0.421 to 0.947. The two sites showed significant deviations from Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) (p<0.01) for some loci, which may be due to the presence of null alleles or even problems... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Caracterização citogenética do gênero Eigenmannia (Teleostei:Gymnotiformes) das bacias Amazônicas, do Prata e do rio São Francisco : inferências sobre a diversificação cariotípica e origem e evolução dos cromossomos sexuais /Jaime, Cristian Andrés Araya. January 2015 (has links)
Orientador: Fausto Foresti / Coorientador: José Carlos Pansonato Alves / Banca: Orlando Moreira-Filho / Banca: Roberto Ferreira Artoni / Banca: Diogo Teruo Hashimoto / Banca: Patrícia Elda Sobrinho Scudeler / Resumo: No presente trabalho, foram analisadas seis espécies/citótipos de peixes do gênero Eigenmannia, sendo E. microstoma, E. limbata, E. virescens, E. aff trilineata, Eigenmannia sp1 e Eigenmannia sp2, de diferentes bacias hidrográficas brasileiras, com o uso de técnicas citogenéticas básicas envolvendo a coloração com Giemsa e bandamento C e também técnicas de citogenética molecular, com a aplicação de hibridação in situ fluorescente (FISH) envolvendo o uso de sondas de DNAr 18S e 5S, DNA histônico H3/H4 e de RNAsn U2. Também foi estudado o comportamento meiótico e o nível de diferenciação do sistema múltiplo de cromossomos sexuais de Eigenmannia sp2 por imunodetecção de proteínas do complexo sinaptonêmico (SYCP3), proteínas relacionadas com a atividade da cromatina (H3K9me) e marcadores do tipo proteína γH2AX envolvida no reparo das quebras do DNA e associadas ao nível de pareamento dos bivalentes nos cromossomos meióticos. Finalmente, os dados da caracterização citogenética foram comparados com análises de DNA barcode para permitir uma melhor delimitação das espécies/citótipos analisados neste estudo. Os representantes analisados deste grupo confirmara a apresentação de expressiva variação no número diplóide, tendo sido observados deste cariótipos compostos por 28 cromossomos em Eigenmannia sp1 até o número diplóide de 38 cromossomos em E. microstoma, E. limbata e E. virescens. Em E. aff trilineata foi descrita pela primeira vez a ocorrência de um polimorfismo cromossômico do tipo ZZ/Z0 associado ao sexo, em que os machos apresentam cariótipos compostos por 32 cromossomos enquanto as fêmeas possuem cariótipos constituídos por 31 cromossomos. Sequências de DNAr 5S e RNAsn U2 foram localizadas em diferentes cromossomos, com variação na quantidade de sítios entre as espécies, enquanto o DNAr 18S apresentou-se conservado em relação ao número de cromossomos portadores, porém variando na... / Abstract: In the present study, six species/cytotypes from de genus Eigenmannia collected at different Brazilian hydrographic basins were analyzed, including E. microstoma, E. limbata and E. virescens, E. aff trilineata, Eigenmannia sp1, and Eigenmannia sp2 using classical (Giemsa conventional staining and C-banding) and molecular cytogenetic techniques (fluorescence in situ hybridization with 5S and 18S rDNA, H3/H4 histone genes and U2 snDNA probes). Besides that, it was studied the meiotic behavior and the differentiation level of multiple sex chromosome system in Eigenmannia sp2 by immunodetection for synaptonemal complex proteins (SYCP3), proteins related to chromatin activity (H3K9me) and associated markers with the bivalent level pairing of the meiotic chromosomes (γH2AX). Finally, the cytogenetics results were analyzed in conjunction with the barcode DNA analysis for a better delineation of species/cytotypes studied. The analyzed species/cytotypes showed diploid number variation, with diploid numbers ranging from 28 chromosomes in Eigenmannia sp1 to 38 chromosomes in E. microstoma, E. limbata and E. virescens. In E. aff trilineata, for the first time, showed a ZZ/Z0 sex chromosome system, where males have karyotypes with 32 chromosomes to 31 chromosomes to females. 5S rDNA and U2 snDNA were located on different chromosomes, with variations on the number of clusters in the different species, while the 18S rDNA was conserved in number of sites per genome and variable in location. The meiotic analysis in the sex chromosomes of Eigenmannia sp2 showed a completely synaptic sexual trivalent X1X2Y formation without unsynaptics presence and inactive chromatin regions throughout its structure. These results suggest that this sex chromosomes system would be a recent rearrangement or simply it is a sex-linked character in this population. All the six species/cytotypes of Eigenmannia analyzed were easily ... / Doutor
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Genética de populações de Prochilodus argenteus e P. costatus do médio São Francisco /Melo, Bruno Francelino de. January 2011 (has links)
Orientador: Claudio de Oliveira / Banca: Alexandre Wagner da Silva Hilsdorf / Banca: Fernanda Simões de Almeida / Resumo: O Rio São Francisco forma uma das maiores bacias hidrográficas sulamericanas e vem sofrendo grandes impactos causados por ações antrópicas. A bacia conta com uma rica fauna de peixes, muitos de elevada importância para a pesca comercial e de subsistência. O estado de Minas Gerais apresenta uma importante indústria pesqueira e a região de Três Marias representa a zona mais produtiva na bacia do São Francisco. Nesta região, duas espécies de peixes são encontradas abundantemente: Prochilodus argenteus (curimatã-pacu), responsável por até 50% do pescado, sendo a espécie de maior porte da família Prochilodontidae com alguns indivíduos alcançando 15 kg, e Prochilodus costatus (curimatã-pioa) que possui um importante papel ecológico e para a pesca de subsistência. Estudos prévios sugerem a existência de diferentes populações de P. argenteus na região de Três Marias e de apenas uma população de P. costatus na mesma área. No entanto, os níveis de estruturação e os padrões de migração das espécies não foram testados utilizando indivíduos pertencentes aos tributários de todo o médio São Francisco. No presente estudo, duas hipóteses foram testadas: (i) os peixes que nascem nas lagoas marginais dos tributários vivem, preferencialmente nesses próprios tributários, não migrando para o leito do São Francisco; (ii) os peixes que nascem nas lagoas dos tributários migram preferencialmente para o leito do São Francisco no período de alimentação, retornando aleatoriamente ou não para os tributários durante o período de reprodução. Nove amostragens de P. argenteus com um total de 273 espécimes e cinco de P. costatus com 156 espécimes foram coletadas em todo o médio São Francisco em dois períodos, chuvoso e seco. Utilizamos seis loci microssatélites altamente polimórficos e os resultados indicaram... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The São Francisco is one of the largest South America river basin and has suffered large impacts caused by human actions. The basin has a rich fish fauna, many of great importance for commercial fishing and for subsistence. The Minas Gerais State has a strong fishery activity and the Três Marias region is the most productive fishing region in the São Francisco basin. In this region, two fish species are abundantly found: Prochilodus argenteus (curimatã-pacu), representing almost 50% of the total catch, being the largest member of the Prochilodontidae family sometimes reaching a body weight of 15 kg and P. costatus (curimatã-pioa) that has an important ecological role and for subsistence fishing. Previous studies suggest the existence of distinct populations of P. argenteus and only one population of P. costatus in the Três Marias region. However, the structuring levels and migration patterns were not tested using individuals from tributaries of the middle São Francisco. Here we tested two hypotheses: (i) fishes recruited on marginal lagoons from tributaries live preferably in these tributaries; (ii) fishes recruited on marginal lagoons from tributaries preferentially migrate downstream to the main stream of the São Francisco River in the feeding season, returning upstream randomly or not to the tributaries for reproduction. Nine populations of P. argenteus with 273 specimens and five populations of P. costatus with 156 specimens were collected throughout middle São Francisco in the rainy and dry seasons. We used six highly polymorphic microsatellite loci and the results indicated high levels of variability within populations for both species. Additionally, low values of population differentiation were detected in P. argenteus (FST = 0,008, P < 0,008) and P. costatus (FST = 0,031, P < 0,008) with high values... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Genetic and Morphological Variation in Natural Populations of the Red Shiner, Notropis lutrensis, and their Relationship to Adaptation in a Generalist SpeciesWooten, Michael Conrad 05 1900 (has links)
Twenty-two natural populations of the red shiner minnow, Notropis lutrensis were examined for morphological and genetic variation. This research was aimed at testing the hypothesis that morphological and genetic variation was primarily influenced by the degree of gene flow between populations. Ten linear measurements were taken from each of 1320 specimens. Morphological characters were adjusted for differential growth by least squares linear regression techniques. Genetic variability was estimated for each individual red shiner through the methods of starch gel electrophoresis. Twenty presumtive gene loci were resolved.
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