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MELQART : un système d'exécution de mashups avec disponibilité de données / MELQART : a mashup execution system with data availability

Othman Abdallah, Mohamad 26 February 2014 (has links)
Cette thèse présente MELQART, un système d'exécution de mashups avec disponibilité de données. Un mashup est une application web qui combine des données provenant de fournisseurs hétérogènes (web services). Ces données sont agrégées pour former un résultat homogène affiché dans des composants appelés mashlets. Les travaux dans le domaine des mashups, se sont principalement intéressés au fonctionnement des mashups, aux différents outils de construction et à leur utilisation et interaction avec les utilisateurs. Dans cette thèse, nous nous intéressons à la gestion de données dans les mashups et plus particulièrement à la disponibilité et la fraîcheur de ces données. L'amélioration de la disponibilité tient compte du caractère dynamique des données des mashups. Elle garantit (1) l'accès aux données même si le fournisseur est indisponible, (2) la fraicheur de ces données et (3) un partage de données entre les mashups afin d'augmenter la disponibilité de données. Pour cela nous avons défini un modèle de description de mashups permettant de spécifier les caractéristiques de disponibilité des données. Le principe d'exécution de mashups est défini selon ce modèle en proposant d'améliorer la disponibilité et la fraicheur des données du mashup par des fonctionnalités orthogonales à son processus d'exécution. Le système MELQART implante ce principe et permet de valider notre approche à travers l'exécution de plusieurs instances de mashups dans des conditions aléatoires de rupture de communication avec les fournisseurs de données. / This thesis presents MELQART: a mashup execution system that ensures data availability. A mashup is a Web application that application that combines data from heterogeneous provides (Web services). Data are aggregated for building a homogenous result visualized by components named mashlets. Previous works have mainly focused, on the definition of mashups and associated tools and on their use and interaction with users. In this thesis, we focus on mashups data management, and more specifically on fresh mashups data availability. Improving the data availability take into account the dynamic aspect of mashups data. It ensures (1) the access to the required data even if the provider is unavailable, (2) the freshness of these data and (3) the data sharing between mashups in order to avoid the multiple retrieval of the same data. For this purpose, we have defined a mashup description formal model, which allows the specification of data availability features. The mashups execution schema is defined according to this model with functionalities that improve availability and freshness of mashed-up data. These functionalities are orthogonal to the mashup execution process. The MELQART system implements our contribution and validates it by executing mashups instances with unpredictable situations of broken communications with data providers.
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Recherche et études de marqueurs précoces permettant de déterminer l'état de fraicheur de filets de poissons / Research and early marker studies to determine the state of fish fillet freshness

Cléach, Jérôme 17 December 2018 (has links)
La fraîcheur est un paramètre clé de la qualité du poisson. Les méthodes actuelles appliquées en routine pour déterminer la fraîcheur du poisson ne sont pas applicables à toutes les espèces et reflètent davantage un début d'altération du produit. Ainsi, la recherche d'indicateurs précoces de fraîcheur du poisson représente encore un défi majeur et d'actualité dans l'industrie de la pêche. Le but de ces travaux de thèse était de démontrer que les fonctions et l'intégrité mitochondriales étaient susceptibles de constituer des indicateurs précoces de la fraîcheur de filets de poisson. En effet, la mitochondrie est la "centrale" énergétique de la cellule eucaryote et joue un rôle clef dans les mécanismes de mort cellulaire tels que l'apoptose et la nécrose. Les fonctions et l'intégrité mitochondriales de cellules musculaires de filets de poisson ont été étudiées à différents temps de conservation post mortem à 4°C. Le modèle d'étude était la daurade royale (Sparus aurata) (lignée cellulaire de fibroblastes (SAF-1) et muscles de poisson). Dans un premier temps, la structure des mitochondries de poisson a été étudiée par microscopie électronique à transmission. De nombreuses dégradations de la structure des mitochondries ont été observées dans les filets à partir de 72 heures (J3) de conservation à 4°C. Ces altérations se sont accentuées à J4 et J6. La fonctionnalité des mitochondries a ensuite été évaluée selon deux approches : la respiration mitochondriale (oxygraphie) et le potentiel membranaire mitochondrial (ΔΨₘ) estimé avec la sonde fluorescente Rhodamine 123. A partir de 96 heures de conservation à 4°C (J4), ces deux paramètres ont été significativement impactés témoignant d'une altération des fonctions et de l'intégrité mitochondriales.Ces résultats sont ainsi en corrélation avec l'altération structurale observée par microscopie. En parallèle, une méthode d'évaluation du potentiel membranaire a été développée avec un fluorimètre à microvolume à partir d'un modèle bactérien puis de mitochondries isolées. Ces travaux de thèse ont démontré que l'étude des fonctionnalités mitochondriales constitue un marqueur fiable et précoce de la fraîcheur des filets de poisson. Des connaissances supplémentaires sur les mécanismes cellulaires post mortem ont également été apportées. Ces résultats constituent ainsi le point de départ pour le développement d'un kit d'évaluation de la fraîcheur et ouvrent la voie pour la recherche de marqueurs de fraîcheur et de congélation/décongélation basés sur les fonctionnalités et intégrité mitochondriales. / Freshness is a key parameter of fish quality. Current routine techniques to determine fish freshness are not applicable to all species and reflect a late stage of alteration. Thus, research on early indicators of fish freshness still represents a major and topical challenge in fishing industry. This PhD research project aimed to demonstrate that mitochondrial functions and integrity constitute early indicators of fish fillet freshness. Mitochondria are the powerhouse of the cell and play a central role in cell death mecanisms such as apoptosis and necrosis. Mitochondrial function and integrity in fish filet muscle cells were studied at different times of storage post mortem at 4°C. The species studied as a model was the gilthead seabream (Sparus aurata) (gilthead seabream fibroblast cell line (SAF-1) and fish fillets). Firstly, the structure of fish mitochondria was studied by transmission electron microscopy. Numerous mitochondrial structural alterations have been observed in fish fillet from 72 hours (D3) of storage at 4°C. These alterations were more pronounced at D4 and D6. Then, mitochondrial functionality was assessed with two approaches: mitochondrial respiration (oxygraphy) and mitochondrial membrane potential (ΔΨₘ) estimated with the fluorescent probe Rh123. From 96 hours of storage at 4°C (D4), these two parameters were significantly disrupted demonstrating the alteration of mitochondrial function and integrity. The results are in correlation with the mitochondrial structural alterations described by microscopy. In parallel, a method of mitochondrial membrane potential evaluation has been developed with a micro-volume fluorimeter, first using bacteria and then isolated mitochondria. This work demonstrated that the mitochondrial functionality study constitutes a reliable and early fish filet freshness indicator. Additional knowledge on cell mechanisms in post mortem condition has been brought. These results constitute the starting point for the development of a fish freshness assay kit and pave the way to research on others freshness and freeze-thawing indicators based on mitochondrial integrity and functionality.

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