Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-01-26T09:40:18Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tâmera Nunes Vieira Almeida - 2011.pdf: 3539556 bytes, checksum: 0d3229ddfa2244e57c236faf04b328e8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-01-26T09:41:12Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tâmera Nunes Vieira Almeida - 2011.pdf: 3539556 bytes, checksum: 0d3229ddfa2244e57c236faf04b328e8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-26T09:41:12Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tâmera Nunes Vieira Almeida - 2011.pdf: 3539556 bytes, checksum: 0d3229ddfa2244e57c236faf04b328e8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2011-04-16 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The group A rotaviruses (RVA) are recognized as the main viral agents of acute childhood gastroenteritis, and due to the high morbidity-mortality rates vaccination has being considered the best alternative for prevention and control of RVA. In Brazil, in March, 2006 the Ministry of Health included the human rotavirus oral vaccine – VORH, which was developed from a monovalent attenuated strain G1P[8], in the National Immunization Program. In this context, the present study aimed at the investigation of the occurrence of RVA infections in the city of Goiânia after the implementation of the VORH, as well as the comparative analysis of the RVA circulating strains during the pre- and post-vaccination periods. For the RVA identification, 65 fecal samples obtained from children with acute gastroenteritis, in the period from 2008 to 2009, were tested by an immunoenzymatic assay and by polyacrilamide gel electrophoresis, with a total detection rate of 16.9% (11/65). After molecular characterization, the G2 genotype was identified in 10 samples, and four of those were considered as G2P[4] genotype. For the comparative analysis, the G2P[4] samples, as well as other 15 samples, obtained in the pre- and post-vaccination periods, were submitted to genomic sequencing of the coding regions for the proteins VP6, VP7 and NSP4. The molecular characterization of the VP7 gene showed that the G1 samples belonged to lineages I and II, sublineages d and b, respectively, and that all the G2 samples belonged to lineage II, with the differentiation of three sublineages, a, c and d, which were correlated with the collection periods. Regarding the VP6 genogroups and the NSP4 genotypes, a predominance of genogroup I and genotype A in postvaccination period was observed, whereas a predominance of genogroup II and genotype B was identified in the period before de vaccine implementation. The association between the G and P genotypes with VP6 genogroups and NSP4 genotypes revealed the predominance of the G1-P[8]-II-B combination in the pre-vaccination period, and the association G2-P[4]-I-A in the post-vaccination period, which suggests the substitution of these combinations after the implementation of the VORH. / Rotavírus do grupo A (RVA) são reconhecidos como os principais agentes virais da gastroenterite aguda infantil e, devido aos relevantes índices de morbi-mortalidade, a vacinação tem sido considerada a melhor alternativa para a prevenção e o controle de RVA. No Brasil, em março de 2006 o Ministério da Saúde adicionou ao Programa Nacional de Imunização a Vacina Oral de Rotavírus Humano (VORH), a qual foi desenvolvida a partir de uma amostra monovalente atenuada G1P[8]. Neste contexto, o presente estudo objetivou a investigação da ocorrência das infecções por RVA na cidade de Goiânia após a implantação da VORH, bem como proceder a uma análise comparativa das amostras de RVA circulantes nos períodos pré e pós-vacinal. Para identificação de RVA, 65 espécimes fecais coletados no período de 2008 a 2009 de crianças com gastroenterite aguda, foram submetidos ao Ensaio Imunoenzimático e Eletroforese em Gel de Poliacrilamida, sendo observado um índice total de detecção de 16,9% (11/65). Após caracterização molecular, o genótipo G2 foi identificado em 10 amostras, sendo que quatro destas foram definidas como G2P[4]. Para análise comparativa, as amostras G2P[4], bem como outras 15 amostras coletadas nos períodos pré e pós-vacinal, foram submetidas ao sequenciamento genômico para as regiões codificantes das proteínas VP6, VP7 e NSP4. A caracterização molecular do gene de VP7 mostrou que as amostras G1 pertenciam às linhagens I e II, sublinhagens d e b, respectivamente, e que todas as amostras G2 pertencem à linhagem II, com a diferenciação de três sublinhagens, a, c e d, as quais foram correlacionadas com os períodos de coleta. Considerando os genogrupos de VP6 e genótipos de NSP4 identificados, observou-se predominância para genogrupo I e genótipo A no período pós-vacinal, enquanto, genogrupo II e genótipo B foram identificados com maior frequência antes da implantação da vacina. A associação entre os genótipos G e P com genogrupos de VP6 e genótipos de NSP4 revelou predominância da combinação G1-P[8]II-B no período pré-vacinal e da associação G2-P[4]-I-A no período pós-vacinal o que sugere uma substituição destas combinações após a implantação da VORH.

Made available in DSpace on 2016-12-23T13:50:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESEfinal20nov.pdf: 1675526 bytes, checksum: d87e98395556fe1f79698375acf1eb1b (MD5) Previous issue date: 2005-10-14 / Acute diarrhea is one of the main causes of infantile mortality worldwide (WHO), mainly in developing countries. In the present work, the prevalence of Rotavirus (RV), adenovirus (Ad), diarrheogenic E. coli (EPEC, ETEC, EIEC, EHEC, EAEC, DAEC), Salmonella, Shigella, Cryptosporidium spp., Entamoeba histolytica and Giardia lamblia was studied among children up to 3 years old with acute diarrhea. From February 2003 to June 2004, stools samples were obtained prospectly from 253 children with acute diarrhea and 78 without diarrhea attending to the emergency room in a pediatric hospital - Hospital Infantil Nossa Senhora da Glória (HINSG), in Vitória Espírito Santo state, Brazil. Bacterial detection was done in 241 stools samples (12 were excluded because were in use of antimicrobian drugs) and E. coli were isolated in 219 and 68 cases with and without diarrhea, respectively. These cases were submited to serology with policlonal anti-seros (EPEC e EIEC) and hybridization tests (Hybr) to detect virulence genes of EPEC, ETEC, EIEC, EHEC, EAEC e DAEC. RV were studied in 147 cases for immune enzymatic assay (EIARA) and in 230 cases by poliacrylamide gel electrophoresis (PAGE) and Ad, only in 147 cases for immune enzymatic assay (EIARA). Protozoan infection was studied in 88 cases for immune enzymatic assay (EIA). Children with diarrhea were divided in Group I (88 cases = all enteropathogens studied), Group II (147 cases = bacterias, RV e Ad - EIARA) and Group III (230 cases = bacterias and RV - PAGE) and children without diarrhea were Group IV (78 cases = bactérias and RV - PAGE). Enteropathogens were detected in more than 60% in children with acute diarrhea and bacterial infection was the most prevalent: DEC were detected in 41,1%; EPEC in 3,6% (serology) e 9,1% (Hybr); Typical EPEC (0,9%); Atypical EPEC (8,2%); EAEC (9,1%); DAEC (20,6%); EIEC (0,9%); ETEC (4,2%). In stools samples from children without diarrhea, we found Atypical EPEC (10,3%); EAEC (20,6%); DAEC (16,2%); ETEC (1,5%). EHEC was not detected in the studied population. Shigella and Salmonella were detected in 4,6% e 2,9%, respectively, only in children with acute diarrhea. RV were detected in 35,2% (GEPA) and 50% (EIARA); Ad, in 8,2% and E. histolytica, Cryptosporidium spp. and G. lamblia in 8%, 11,4% and 14,8% of cases with diarrhea, respectively. In conclusion, Typical EPEC, EIEC and ETEC were detected only or predominantly in children with acute diarrhea. Atypical EPEC, EAEC and DAEC were not causes of acute diarrhea, except for EAEC in children more than two years old (p = 0,026). RV was the most prevalent agent when the classic enteropathogen DEC (Tipical EPEC, ETEC, EIEC and Shigella e Salmonella) was considered in this study. RV was more frequent in children below 18 months of life and in a period of March, 2003 up September, 2003. Associations among enteropathogens were frequent in the studied population and protozoa were the most of them. Comparing all of protozoa detected, only G. lamblia suggesting being a cause of acute diarrhea, isolately. / A diarréia aguda é uma causa importante de mortalidade infantil, nos países em desenvolvimento (OMS). A prevalência de rotavírus (RV), adenovírus (Ad), categorias diarreiogênicas de E. coli (DEC), Salmonella, Shigella, Cryptosporidium spp., Entamoeba histolytica e Giardia lamblia, foi pesquisada em crianças até 3 anos de idade. De fevereiro de 2003 a junho de 2004, foram obtidas 253 amostras fecais de crianças com diarréia aguda e 78 sem diarréia, atendidas no Hospital Infantil Nossa Senhora da Glória (HINSG), Vitória ES. O estudo das bactérias foi feito em 241 amostras fecais (12 excluídas por uso de antimicrobiano) com isolamento de colônias caracterizadas bioquimicamente como E.coli em 219 e 68 casos com diarréia e sem diarréia, respectivamente. Estes casos foram submetidos à sorologia com anti-soros polivalentes (EPEC e EIEC) e testes de hibridização (Hibr) para pesquisa de genes de virulência para detecção de EPEC, ETEC, EIEC, EHEC, EAEC e DAEC. RV foram pesquisados em 147 casos por ensaio imunoenzimático (EIERA) e em 230, através da eletroforese em gel de poliacrilamida (EGPA), e Ad em 147 casos, por ensaio imunoenzimático (EIERA). Os protozoários foram pesquisados 88 amostras por ensaio Imunoenzimático (EIE). As crianças com diarréia foram divididas em: Grupo I (88 casos = todos os agentes pesquisados), Grupo II (147 casos = bactérias, RV e Ad - EIERA) e Grupo III (230 casos = bactérias e RV - EGPA) e as crianças sem diarréia compuseram o Grupo IV (78 casos = bactérias e RV - EGPA). Mais de 60% das amostras colhidas de crianças com diarréia aguda foram positivas para enteropatógenos, sendo as bactérias, os mais prevalentes, seguidos pelos vírus. DEC foram detectadas em 41,1% dos casos de diarréia aguda: EPEC em 3,6% (sorologia) e 9,1% (Hibr); EPEC típica (0,9 %); EPEC atípica (8,2%); EAEC (9,1%); DAEC (20,6%); EIEC (0,9%); ETEC (4,2%). Nas crianças sem diarréia, detectou-se EPEC (10,3%); EAEC (20,6%); DAEC (16,2%); ETEC (1,5%). EHEC não foi detectada. Nas crianças com diarréia aguda foram detectados Shigella (4,6%), Salmonella (2,9%), RV em 35,2% (EGPA) e 50% (EIERA); Ad (8,2%) e E. histolytica (8%), Cryptosporidium spp. (11,4%) e G. lamblia (14,8%). Concluindo, EPEC típica, EIEC e ETEC foram detectadas apenas ou predominantemente nas crianças com diarréia. EPEC atípica, EAEC e DAEC não estiveram relacionadas com diarréia aguda, exceto EAEC nas crianças acima dos dois anos de idade (p = 0,026). RV foi agente infeccioso mais prevalente considerando somente DEC classicamente patógenas (EPEC típica, ETEC, EIEC, Shigella e Salmonella), nos menores de 18 meses de vida e nos meses de março a setembro de 2003. As associações entre enteropatógenos foram freqüentes, sendo os protozoários, o grupo de enterópatógenos com o maior número de associações. Dos protozoários avaliados, apenas G. lamblia parece ser agente etiológico isolado de diarréia aguda.