CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / O cajueiro (Anacardium occidentale L.) à uma planta nativa do Brasil com grande valor comercial. Isso contribui com a geraÃÃo de milhares de empregos diretos e indiretos, especialmente na RegiÃo Nordeste, em Ãpoca de estiagem. Programas de melhoramento genÃtico vem selecionando cultivares de cajueiro melhores adaptados ao ambiente semiÃrido a fim de colocÃ-lo em um mercado cada vez mais competitivo. A busca por marcadores microssatÃlites pode auxiliar os programas de melhoramento no que diz respeito ao acesso à diversidade genÃtica da espÃcie. O presente trabalho tem como objetivo a identificaÃÃo de marcadores SSR em cajueiro com base no transcriptoma de sementes e folhas, bem como sua validaÃÃo por PCR em diferentes genÃtipos comerciais. Utilizando ferramentas de bioinformÃtica foram encontrados motivos SSRs do tipo di- tri- tetra- penta- e hexanucleotÃdeos, onde o motivo do tipo trinucleotÃdeo foi o mais representativo nos transcritos do cajueiro anÃo CCP 76 e comum variando de 60 a 65%, respectivamente. Os transcritos de cajueiro comum e anÃo CCP 76 compartilham um total de 298 marcadores SSR, destes, 29 foram escolhidos para amplificaÃÃo por PCR, os quais 9 mostraram polimorfismo nos genÃtipos testados. As sequÃncias situadas prÃximas aos marcadores SSR codificam proteÃnas, que em sua maioria pertencem a famÃlias gÃnicas. Pode-se concluir que foram encontrados regiÃes contendo marcadores SSRs na regiÃo transcrita de nove genÃtipos de cajueiro, podendo ser uma ferramenta Ãtil nas anÃlises genÃticas e abrindo perspectivas para o papel endÃgeno dos SSRs na funÃÃo proteica. / The cashew tree is a native plant from Brazil with high market value. This contributes to the generation of thousands direct and indirect jobs, especially in the Northeast region, during dry season. Breeding programs have been selecting cashew cultivars that best adapt to semi-arid environment in order to fit it in the increasingly competitive market. The search for microsatellite markers can assist breeding programs regarding to access to genetic diversity of the species. This study aims to identify SSR markers in the cashew tree based on seeds and leaves transcriptome, as well as assess its validation by PCR technique in different commercial genotypes. Using bioinformatics tools, SSRs motifs from types di- tri- tetra- penta- and hexanucleotides were found. Trinucleotide-type motif was the most representative in transcripts both from dwarf cashew CCP 76 and common cashew, ranging from 60 to 65%, respectively. Transcripts from common cashew and dwarf cashew CCP 76 share a total of 298 SSR markers. 29 of these were selected for amplification by PCR, in which 9 showed polymorphism in genotypes tested. The sequences located near to the SSR markers encode proteins, which mostly belong to gene families. It can be concluded that regions containing SSRs markers were found in the transcribed region of nine cashew genotypes, and can be a useful tool in genetic analysis and open up prospects for endogenous role of SSRs in protein function.

CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / O cÃncer gÃstrico à a quarta neoplasia maligna mais freqÃente e a segunda causa de morte por cÃncer no mundo, registrando-se aproximadamente 934 mil novos casos e 700 mil mortes por ano. No Brasil, o cÃncer gÃstrico à o sexto tumor maligno mais freqÃente. Na regiÃo Nordeste à a segunda neoplasia mais freqÃente entre os homens e a quarta entre as mulheres, sendo que no estado do Cearà à a terceira neoplasia mais freqÃente. Dentre os agentes infecciosos, a bactÃria Helicobacter pylori (H. pylori), considerada pela OMS agente carcinogÃnico do grupo I, tem sido destacada, nas Ãltimas dÃcadas, visto sua relaÃÃo com a gastrite crÃnica ativa, com o desenvolvimento de Ãlceras gÃstricas e duodenais e aumento do risco de cÃncer gÃstrico. AlÃm da presenÃa, a variaÃÃo genÃtica das cepas de H. pylori parece influenciar na gravidade das doenÃas causadas pela infecÃÃo. O carÃter patogÃnico à dado pela presenÃa, em algumas cepas, da denominada ilha de patogenicidade, cag-PAI; um fragmento de DNA de 35-40 Kb cepa especÃfico, a qual possui uma sÃrie de genes associados a um virulento aparato secretÃrio. AlÃm disso, outro gene, denominado vacA, tambÃm apresenta-se como um importante fator de virulÃncia. Apesar dessas associaÃÃes nÃo hà ainda uma relaÃÃo direta entre a presenÃa desses genes com o processo tumorigÃnico. Uma das possÃveis explicaÃÃes à a presenÃa de outros genes que contribuam para o fenÃtipo mais grave ou maligno, principalmente associada a cag-PAI. Nesse contexto, o presente estudo objetivou investigar a freqÃÃncia de H. pylori genotipando quanto as variantes alÃlicas de vacA, a presenÃa dos genes cagA, cagE e virB11 e sua associaÃÃo com os dados clinico- patolÃgicos de adenocarcinoma gÃstricos de uma populaÃÃo do Estado do CearÃ. Para tanto, 101 casos de adenocarcinoma gÃstricos (68 homens e 33 mulheres), obtidos de dois hospitais de Fortaleza, foram analisados por PCR quanto à presenÃa de H. pylori e os genes estudados. A distribuiÃÃo do cÃncer gÃstrico por sexo, sÃtio anatÃmico do tumor e anÃlise histopatolÃgicas, de modo geral, reproduziram as tendÃncias da literatura mundial. A bactÃria esteve presente em 93% dos casos analisados. Os genes de H. pylori apresentaram as seguintes freqÃÃncias: vacAs1m1 (75,5%), vacAs1m2 (13,8%), vacAs2m1 (4,6%), vacA s2m2 (6,5%), cagA (64,9%), cagE (53,2%) e virB11 (60,6%). Esse dados sÃo os primeiros na literatura mundial citando a freqÃÃncia virB11 e o segundo para o gene cagE em cÃncer gÃstrico e indicam uma variaÃÃo de cepas circulantes quanto a presenÃa desses genes quando comparado esses dados com os de outras doenÃas gÃstricas. A combinaÃÃo mais freqÃente foi vacAs1m1cagA(+)cagE(+)virB11(+), encontrada em 36,2% dos casos analisados, sendo considerada a cepa mais patogÃnica. A integridade de cag-PAI foi verificada em 38,3% dos casos, quando considerados os trÃs marcadores estudados, entretanto, considerando-se pelo menos um marcador de lado direito (cagA e/ou cagE) e o marcador do lado esquerdo (virB11), a freqÃÃncia foi de 56,4%. A distribuiÃÃo dos genÃtipos de H. pylori em grupos demonstrou que a maior freqÃÃncia das cepas consideradas mais patogÃnicas foi em tumores do antro gÃstrico, nÃo houve predileÃÃo das variaÃÃes genotÃpicas por nenhum dos tipos histolÃgicos, alÃm de verificar-se a alta freqÃÃncia das cepas mais patogÃnicas nos estadiamentos II e IV, demonstrando a participaÃÃo de H. pylori na carcinogÃnese gÃstrica. / The gastric cancer is the fourth more frequent cancer, and the second cause of death for cancer in the world, recording approximately 934 thousand of new cases and 700 thousand of deaths a year. In Brazil, the gastric cancer is the sixth more frequent malignant tumor. In the Northeast area, it is the second more frequent cancer among the men and fourth among the women. In the state of Ceara, it is the third more frequent neoplasia. Among the infectious agents, the bacterium Helicobacter pylori (H. pylori), which is considered carcinogenic agent of the group I, has been pointed in the last decades because of the connection with activated chronic gastritis, with the development of peptic ulcers and duodenais, and the increase of the risk of gastric cancer. Besides the presence, genetic variation of the strains of H. pylori seems to influence in the seriousness of the disease caused by infection. The pathogenic character is given by the presence, in some cepas, of the called cag pathogenicity island, cag-PAI; one gene fragment of 35-40 Kb strain specific, which possess a series of genes associates to a virulent type IV secretion apparatus. Moreover, another gene, called vacA, it is presented as an important virulence factor. Despite these associations does not have still a direct relation enters the presence of these genes with the tumorigenic process. One of the possible explanations is the presence of other genes that contribute for fenotype more serious or malignant, mainly associates cag-PAI. In this context, the present study objectified to investigate the frequency of H. pylori genotyped how much the alelics variants of vacA the presence of the genes cagA, cagE and virB11 and its association with the clinic- pathological dates of gastric adenocarcinoma of one population of the Ceara State. For in such a way, 101 cases of gastric adenocarcinoma (68 men and 33 women), gotten of two hospitals of Fortaleza, had been analyzed by PCR how much to the presence of H. pylori and the studied genes. The distribution of the gastric cancer by sex, anatomical sites and the histopatologic analysis, in general way, had reproduced the trends of world-wide literature. The bacterium was present in 93% of the analyzed cases. The genes of H. pylori had presented the following frequencies: vacAs1m1 (75,5%), vacAs1m2 (13,8%), vacAs2m1 (4,6%), vacA s2m2 (6,5%), cagA (64,9%), cagE (53,2%) and virB11 (60,6%). These data are the first ones in world-wide literature citing the frequency of virB11 and as for the gene cagE in gastric cancer and indicate a circulating variation of strains how much the presence of these genes when compared these data with the ones of other gastric diseases. The most frequent combination was vacAs1m1cagA(+)cagE(+)virB11(+), found in 36,2% of the analyzed cases, being considered strain more pathogenic. The integrity of cag-PAI was verified in 38,3% of the cases, when considered the three studied markers, however, considering at least one marker of right side (cagA and/or cagE) and the marker of the left side (virB11), the frequency was of 56,4%. The distribution of the genotypes of H. pylori in groups demonstrated that the biggest frequency of strains considered more pathogenic was in tumors of the gastric antrum, did not have predilection of the genotypic variations for none of the histologic types, besides verifying it high frequency of more pathogenic strains in tumor stage II and IV, demonstrating to the participation of H. pylori in gastric carcinogenesis.

O feijÃo-de-corda (Vigna unguiculata (L.) Walp.), à uma espÃcie cultivada de grande importÃncia para a alimentaÃÃo das populaÃÃes rurais e urbanas das regiÃes tropicais e subtropicais do mundo. A produtividade dessa espÃcie varia muito, em virtude, principalmente, das variaÃÃes climÃticas e da utilizaÃÃo de materiais genÃticos pouco produtivos ou com caracterÃsticas indesejÃveis. A produtividade de grÃos à influenciada por efeitos genotÃpicos (G), efeitos ambientais (E) e das interaÃÃes genÃtipo x ambiente (G x E), que levam ao comportamento diferencial dos genÃtipos nos diversos ambientes. A interaÃÃo G x E pode ser caracterizada por estudos sobre adaptabilidade e estabilidade fenotÃpica por meio de diversas tÃcnicas. Com base nisso, esta pesquisa objetivou verificar a magnitude da interaÃÃo G x E, e a sua conseqÃÃncia na adaptabilidade e a estabilidade fenotÃpica da produtividade de grÃos de quinze cultivares de feijÃo-de-corda, por meio de quatro metodologias (Eberhart e Russell, Cruz, Torres e Vencovsky, Lin e Binns e AMMI ou âAdditive Main effects and Multiplicative Interactionâ). Os experimentos foram conduzidos em cinco municÃpios (Alto Santo, Barreira, CrateÃs, Itapipoca e Limoeiro do Norte) do estado do CearÃ, em cultivo de sequeiro nos anos 2006 e 2007. O delineamento utilizado foi o de blocos casualizados com 15 tratamentos e quatro repetiÃÃes. A parcela experimental teve dimensÃes de 3,0 m x 5,0 m, com quatro fileiras, espaÃadas de 0,75 m entre, e 0,25 m dentro das fileiras. As duas fileiras centrais corresponderam à Ãrea Ãtil. O desbaste foi feito aos 15 dias apÃs plantio deixando-se em mÃdia duas plantas por cova. Os ambientes corresponderam à combinaÃÃo de ano e local totalizando dez ambientes, dos quais foram utilizados oito para as anÃlises estatÃsticas. O efeito de ambientes foi mais importante do que o efeito da interaÃÃo genÃtipos x ambientes (G x E), e este mais importante do que o efeito de genÃtipos. A magnitude da interaÃÃo G x E para a produtividade de grÃos foi alta, indicando que este à um caractere instÃvel. A regressÃo linear de Eberhart e Russell nÃo classificou nenhum dos genÃtipos testados como de adaptaÃÃo geral, nem estÃvel nos ambientes avaliados. A regressÃo bissegmentada de Cruz, Torres e Vencovsky caracterizou os genÃtipos quanto à adaptabilidade em condiÃÃes especÃficas de ambientes favorÃveis, desfavorÃveis ou de adaptaÃÃo geral, mas todos instÃveis. O mÃtodo de Lin e Binns classificou simultaneamente os genÃtipos quanto à adaptabilidade e estabilidade com apenas um parÃmetro, ordenando os genÃtipos em sequÃncia decrescente. O mÃtodo AMMI possibilitou a explicaÃÃo da maior parte interaÃÃo G x E nos dois primeiros CPIs. Esse mÃtodo classificou os genÃtipos e ambientes quanto a estabilidade de forma precisa em dois biplots. A correlaÃÃo de Spearman indicou que alguns parÃmetros das diferentes metodologias utilizadas estÃo diretamente associados nÃo devendo ser utilizados simultaneamente, enquanto outros nÃo associados podem ser usados em complementaridade. Os genÃtipos que reuniram mais adaptabilidade com estabilidade para produtividade de grÃos foram: Inhuma, BR 17 â GurguÃia, BRS-MarataoÃ, Sempre Verde-CE, BRS-ParaguaÃu e BRS-Rouxinol, pela combinaÃÃo de vÃrios parÃmetros. / Cowpea (Vigna unguiculata (L.) Walp.), is very important crop for feeding the rural and urban populations of the tropical and subtropical areas of the world. The yield of that crop varies, mainly, because climate variations and of the use of low yield genetic materials with undesirable characteristics. Grains yield is influenced by the effects of environments (E), genotypes (G) and G à E interaction that into account the variabily of the genotypes in the several environments. The interaction G x E can be characterized by studying the adaptability and stability phenotipic using several techniques. This research aimed to verify the magnitude of the interaction G x E, their effects or the adaptability and the phenotipic stability of the productivity of grains of fifteen cultivate of cowpea. Four methodologies were used for this study (Eberhart and Russel, Cruz, Torres and Vencovsky, Lin and Binns and AMMI or âAdditive Main effect and Multiplicative Interaction "). The experiments were carried out in five countries (âAlto Santo, Barreira, CrateÃs, Itapipoca and Limoeiro do Norteâ) of the state of âCearÃâ, Brasil, under rainfall conditions during the years of 2006 and 2007. A complete randomized design with 15 treatments and four replication were used. Each experimental unit were 3,0 m x 5,0 m, with four rows spaced by 0,75 m containing 20 plants 0,25 m apart. The two central rows were harvested for futher analysis. The extra plants in each experimental unit were thinning 15 days after sowing, leaving two plants per rows. The Eberhart and Russell linear regression did not classified the cultivars tested for general adaptation and stability; it means that all cultivars were considered unstable by this methodology. The bissegmented regression methodology proposed by Cruz, Torres and Vencovsky allowed to classify the cultivars as adaptable for favorable, unfavorable environment and for general adaptation, but all of than were considered unstable. The method of Lin and Binns classified the cultivars simultaneously for adaptability and stability with just a parameter in decreased order of sequence. The AMMI method made possible the explain most of the G x E interaction in the first two IPCA. This method classified the cultivars and environment in relation to the stability in two biplots in a pricise way. The f Spearmanâs correlation indicated that some parameters used by the methodologies mentioned were associated and so they can not be used simultaneously. On the other hand, the one that were not associated be used as a complementarity. The list genotypes that showed highest adaptability and stability for grain yield were âInhuma, BR 17 â GurguÃia, BRS-MarataoÃ, Sempre Verde-CE, BRS-ParaguaÃu e BRS-Rouxinolâ because they combined both parameters.