Com o objetivo de avaliar os efeitos diretos da seleção para as características número de ramificações do pendão (NRP) e altura de espigas (AE) e os efeitos indiretos sobre outras características de importância agronômica, foram realizados três ciclos de seleção divergente na população ESALQ-PB 1 de milho. O primeiro ciclo foi praticado entre famílias de meios irmãos e nos ciclos seguintes praticou-se seleção massal. A avaliação dos ciclos de seleção foi feita através de três experimentos em blocos ao acaso, com 20 repetições, conduzidos em locais diferentes, com 20 tratamentos (população original, os três ciclos de seleção divergente e os respectivos cruzamentos entre linhas divergentes em cada ciclo e uma testemunha). Além das características selecionadas, NRP e AE, foram também estudadas: altura da planta (AP), posição relativa da espiga (PRE = AE/AP), prolificidade (PRO), produção de espigas (PE) e produção de grãos (PG). Através de uma análise de regressão conjunta, foi possível observar, em média, grande eficiência na seleção para se aumentar e diminuir NRP e AR. Após 3 ciclos de seleção, a primeira característica foi aumentada em 10,18 unidades (43,79%) na seleção positiva e reduzida em 5,77 unidades (-24,80%) na seleção negativa. Do mesmo modo a AE foi aumentada em 11,09 em (8,73%) e diminuída em 10,81 em (-8,51%). As demais características também mostraram alterações ao longo dos 3 ciclos de seleção. Assim a seleção para maior NRP provocou aumentos significativos em AP, AE e PRE, além de diminuições em PRO, PE e PG. A seleção para menor NRP provocou efeitos contrários nessas características. Por seu lado a seleção positiva para AE aumentou significativamente AP, PRE e NRP, enquanto a seleção negativa reduziu essas características. A PE mostrou tendência em aumentar, de maneira não significativa, tanto na seleção positiva para AE como na seleção negativa, o mesmo ocorrendo com a PG. Os resultados observados e estimados através da análise de regressão permitem concluir que NRP, sendo uma característica de fácil avaliação, pode ser utilizada no processo seletivo de plantas mais produtivas. O ideal seria a eliminação das plantas fracas (normalmente com pendões menores) e dentre as mais vigorosas tomar aquelas de pendões menores. Os resultados também mostraram que, na população ESALQ-PB 1, é possível reduzir-se AE sem perdas na produção, permitindo-se assim uma arquitetura mais apropriada para as plantas. / With the objective of evaluating the direct effects of selection on tassel branch number (NRP) and ear height (AE), and indirect effects on other characteristics of agronomic importance, three cycles of divergent selection were completed in the maize population ESALQ-PB 1. The first selection cycle was based on half - sib family means and the in next cycles mass selection for both sexes was used. For the evaluation of selection cycles the experiments were in completely randomized block design, with 20 replications, in three different locations with 20 entries comprising the original population, the three cycles of divergent selection and respectives crosses within cycles for each selection line, and a commercial hybrid as check. Besides the selected traits, NRP and AE, the following traits also were studied: plant height (AP), ear placement (PRE = AE/AP), prolificacy (PRO) and yield measured by ear weight (PE) and grain weight (PG). Using a combined regression analysis, it was observed, on the average, the efficiency of selection to increase and decrease tassel branch number and ear height. After three cycles of selection, the first characteristic was increased by 10.18 unities (43.79%) in positive selection and decreased by 5.77 unities (-24.80 %) in negative selection. In the same manner the ear height was increased by 11.09 cm (8.73%) and decreased by 10.81 cm (-8.51%). The others traits also showed changes along the three cycles of selection. Thus selection to increase tassel branch number also increased significant1y plant height; ear height and ear placement and decreased prolificacy, ear yield and grain yield. On the other hand selection to decrease NRP decreased plant height, ear height, ear placement and increased prolificacy ear yield and grain yield. The positive selection for ear height also increased plant height, ear placement and tassel branch number while the negative selection decreased those characteristics. The ear yield increased (not significantly) in both positive and negative selection for ear height. The same tendency of increase (significant in positive line) was observed in grain yield. The observed results and those estimated through regression analysis permit to conclude that tassel branch number can be considered in the selection process because in it will contribute for the obtention of superior and more efficient genotypes. The results also showed that, in the population ESALQ-PB 1, i t's possible to decrease ear height without losses in yield, that may also contribute of a better architecture of the maize plant.

Na presente pesquisa foi feita uma avaliação da seleção recorrente intrapopulacional no milho Suwan DMR envolvendo oito ciclos de seleção, com o objetivo principal de estimar o progresso genético esperado e o observado e a disponibilidade de variabilidade genética para a seleção em ciclos posteriores. Além disso, foram desenvolvidas as expressões para o cálculo do tamanho efetivo populacional (Ne), adequadas ao método de seleção utilizado, sendo que o Ne foi estimado a partir do terceiro ciclo de seleção, considerando o segundo ciclo como referência. Para tanto, foram utilizados os dados obtidos do programa de melhoramento da população de milho Suwan DMR, conduzido pela Empresa Catarinense de Pesquisa Agropecuária (EMPASC) em Chapecó-SC, no período de 1979/80 e 1986/87. O programa foi conduzido utilizando-se o método de seleção entre e dentro de famílias de meios irmãos, sem sementes remanescentes (SEDFMISSR), com exceção do segundo ciclo que foi obtido por seleção massal estratificada. O método de SEDFMISSR foi conduzido com duas modificações em relação ao método original: a) realização simultânea, na mesma área experimental, das etapas de avaliação, seleção e recombinação; b) para a composição das fileiras masculinas, foi realizada uma seleção prévia de espigas no laboratório, de maneira que nem todas as famílias sob avaliação contribuíram como parentais masculinos. A utilização de delineamento experimental (blocos casualizados) incorporada nos ensaios de avaliação a partir do terceiro ciclo de seleção e as testemunhas (híbridos comerciais) a partir do segundo ciclo. As estimativas dos parâmetros genéticos e fenotípicos foram obtidas a partir das esperanças dos quadrados médios, considerando, quando necessária, a correção da produtividade de grãos por covariância em função do estande observado. O progresso esperado (Gse) foi estimado utilizando-se o diferencial de seleção, e o observado (Gso) foi obtido em função das testemunhas comuns presentes nos ensaios de avaliação dos diversos ciclos de seleção. Considerando os últimos cinco ciclos de seleção, obtiveram-se as estimativas médias (e amplitudes) para a produtividade de grãos: coeficiente de herdabilidade ao nível de médias de famílias: ĥ2m (%) = 39,08 (29,07 a 42,31); coeficiente de herdabilidade ao nível de plantas: ĥ2i (%) = 16,52 (12,52 a 22,05); (C.V.g/C.V.e) = 0,51 (0,46 a 0,61); variância genética aditiva: $#244; 2A (g/planta)2 = 316 (70 a 653); Gse (%/ciclo) = 5,52 (2,48 a 7,50); Gso (%/ciclo) = 5,95 (-7,07 a 19,09); progresso esperado acumulado: Gsea (%) = 27,6; progresso observado acumulado: Gsoa(%) = 29,8; porcentagem de seleção entre e dentro de famílias: 33,75 (15,29 a 68,63) e 4,99 (3,54 a 6,58), respectivamente; tamanho efetivo populacional: Ne = 193 (135 a 349); produtividade média de grãos:Ȳ (g/planta) = 117,8 (66,8 a 186). Apesar da população original Suwan DMR ser considerada de base genética bastante estreita, as estimativas da variância genética aditiva desta população foram comparáveis às estimativas médias obtidas para as populações brasileiras de ampla base genética. Particularmente importante, foi a verificação de que a variância genética aditiva não sofreu alterações que possam ser atribuídas à seleção, mantendo-se em magnitude bastante razoável para assegurar êxito na seleção em ciclos posteriores. O método de seleção utilizado proporcionou a manutenção de Ne relativamente alto, de um dado ciclo para outro, mesmo utilizando baixa porcentagem de seleção. / The effect of eight cycles of recurrent selection, applied to the Suwann DMR corn population, was investigated. The main interest was to verify the effect of selection concerning the expected and realized genetic progress on grain yield and the amount further progress. In addition, specific expressions of the effective population size (Ne) were developed, according to the selection procedure adopted. The second cycle population was taken as reference point to calculate N e. The Institution EMPASC (a research organization of the State of Santa Catarina for agriculture and livestock, Chapecó, SC, Brazil), through its corn population improvement program, provided the necessary data for this work. The period between 1979/80 and 1986/87 was covered. Selection among and within half sib families (SAWHSF) was the basic scheme applied, except for the obtention of the second cycle where a simple stratified mass selection was used. SAWHSF was conducted with two modifications, in relation to the original scheme, namely: a) evaluation of progenies, selection and intercrossing of superior plants, as basic steps of such a scheme, were carried out all in the same area; b) to compose the male rows, a previous selection of ears was made in the laboratory, such that not the whole set of progenies under evaluation contribute as male parents. Progenies were evaluated in randomized complete blocks with replications only after the second cycle and checks (commercial hybrids) incorporated in the progeny tests, only after the first cycle. Estimates of phenotypic and genotypic components of variation were obtained through the analyses of variance. In the case of higher stand variation, the covariance procedure was also applied. In all cases estimates were calculated considering expected values of mean squares. Selection differentials were taken to obtain expected progresses estimates (Gse). The inclusion of common checks in trials of subsequent years, permitted estimating realized gains (GSo.Considering the last five cycles of selection the folowing estimates (and reanges) could be obtained for grain yield: coefficient of heritability on a progeny mean basis: ĥ2m(%) =39.08 (29.07 to 42.31); coefficient of heritability on a plant basis: ĥ2i(%) = 16.52 (12.52 to 22.05); (C.V.g) / (C.V.e = 0.51 (0.46 to 0.61); additive genetic variance: ô2A (g/pl)2 = 316 (70 to 653); Gse (% / cycle) = 5.52 (2.48 to 7.50); Gso (% / cycle) = 5.95 (-7.07 to 19.09); accumulated expected progress: Gsea (%) = 27.6; accumulated observed progress: Gsoa (%) = 29.8; percentage of selection among and within progenies: 33.75 (15.29 to 68.63) and 4.99 (3.54 to 6.58), respectively; effective population size per cycle: Ne = 193 (135 to 349); average grain yield: Ȳ(g/planta) = 117.8 (66.8 to 186.0). Despite of the very narrow genetic base of original population suwan DMR, its additive genetic variance was comparable to additive genetic variances found for broader base populations of corn in Brazil. Particularly important was the finding that changes in the amount of additive genetic variance could not be attributed to selection. In fact, after the eight cycles, the genetic variance is still sufficiently large to guarantee additional gains, through selection. The selection scheme here adopted permitted the maintenance of relatively high N e values, from one cycle to the next, despite the relatively low selection percentages chosen throughout the program.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-06-21T18:45:41Z No. of bitstreams: 2 Dissertacao_Erik_Choueri_versFinal.pdf: 1694322 bytes, checksum: ac0f0c21f91cbd03c41643170d5ee15d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-21T18:45:41Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_Erik_Choueri_versFinal.pdf: 1694322 bytes, checksum: ac0f0c21f91cbd03c41643170d5ee15d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-08-28 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Amazon floodplains is a mosaic of environments who occupy more than 10% of basin and harbor countless species of animals and plants. In this context, the associeted avifauna exhibit different degrees of dependence related to use of microhabitats. Despite its ecological importance, the organisms’ population dynamics that use these environments are not well known, as well as the historical mechanisms that influenced the formation of these landscapes. Thus, this study evaluated the population dynamics of four forest birds species specialized in the Amazon floodplains use. Among these, were evaluated a generalist specie in the floodplain use (Hypocnemoides melanopogon) and three species that use preferably fluvial islands (Myrmotherula assimilis, Myrmoborus lugubris and Thamnophilus nigrocinereus), environments arranged discretely in landscape. When considering archipelagos situated in lower Negro River, despite evidences of gene flow between islands, subtle signals indicate that genetic diversity is heterogeneously distributed across the landscape. In a broader geographic scale, lineages of birds specialists of insular environments exhibited distinctions between Negro and other great rivers of Amazon. These results contrast with other studies that indicated no genetic structure in specialized birds in the amazon’s floodplains. It should be noted that such response was not observed in the generalist specie of flooded areas, suggesting that the organisms’ ecological characteristics can influence genetic diversity in these habitats. The temporal congruence of divergences between lineages of Negro and Solimões are evidences that paleoclimatic and geologic process related to the formation of landscape in recent past (Pleistocene) were possibly responsible by the current organization of these species. Finally, the species studied does not showed remarkable signals of population expansion, a similar result to that achieved for other floodplains’ birds, but are contrasting to those obtained in lowland (Terra Firme) organisms. This answer can be an idicative of constant avaliability of floodplains during the transition Pleistocene/Holocene. / As planícies alagáveis da Amazônia correspondem à um mosaico de ambientes que ocupam mais de 10% da bacia e abrigam inúmeras espécies de animais e plantas. Neste contexto, a avifauna associada apresenta graus distintos de dependência ao uso de determinados microhabitats. Apesar de sua relevância ecológica, pouco se conhece sobre a dinâmica populacional dos organismos que utilizam estes ambientes, assim como os mecanismos históricos que influenciaram a formação destas paisagens. Desta forma, o presente estudo avaliou a dinâmica populacional de quatro espécies de aves florestais de planícies alagáveis da Amazônia. Dentre estas, foi considerada uma espécie generalista no uso deste habitat (Hypocnemoides melanopogon) e outras três que utilizam preferencialmente ilhas fluviais (Myrmotherula assimilis, Myrmoborus lugubris e Thamnophilus nigrocinereus), ambientes dispostos de forma discreta na paisagem. Quando considerados os arquipélagos do baixo Rio Negro, apesar de evidências de fluxo gênico entre ilhas, foram encontrados sinais de distribuição heterogênea da diversidade genética na paisagem. Em escala geográfica mais ampla, linhagens das três espécies especializadas no uso de ambientes insulares apresentaram distinção entre o Negro outros grandes rios amazônicos. Estes resultados são contrastantes com outros estudos que indicaram ausência de estruturação genética em aves de planícies de fluviais amazônicas. Cabe salientar que tal reposta não foi observada para a espécie generalista de áreas alagadas, sugerindo que as características ecológicas dos organismos podem influenciar sua diversidade genética nestes habitats. A congruência temporal das divergências entre estas linhagens dos Negro e Solimões evidencia que processos paleoclimáticos e geológicos relacionados à formação da paisagem no passado recente (Pleistoceno) foram possivelmente responsáveis por reger a organização atual destes organismos. Por fim, as espécies estudadas não apresentaram sinais marcantes de expansão populacional recente, resultado concordante ao obtido para outras aves de planícies alagadas, mas que contrastam com aqueles obtidos para organismos de Terra Firme. Tal resposta pode ser um indicativo de disponibilidade constante dos habitats alagáveis amazônicos durante a transição entre Pleistoceno/Holoceno.

As freqüências de variantes alélicas de diferentes genes envolvidos no desenvolvimento da resposta imune foram analisadas em uma população de origem japonesa do sul do Brasil (n=119). Polimorfismos bialélicos dos genes CCR5, TNFR-II e IL-10, e dos segmentos gênicos TCRBV3S1, TCRBV13S5 e TCRBV18 foram analisados por PCR-RFLP. As freqüências alélicas foram determinadas e comparadas com as freqüências encontradas em outros grupos étnicos (caucasóides e afro-brasileiros). Nós observamos a ausência do alelo CCR5D32 na população testada. Os polimorfismos dos segmentos gênicos TCRBV3S1 e TCRBV13S5, e do gene IL-10 apresentaram freqüências alélicas significativamente diferentes das freqüências observadas em caucasóides e afro-brasileiros. O polimorfismo do segmento gênico TCRBV18 apresentou freqüências alélicas estatisticamente diferentes de caucasóides. Além disso, a comparação de duas sub-populações (definidas em nossa amostra de acordo com a origem geográfica no Japão) indicou diferenças entre as freqüências alélicas dos polimorfismos gênicos de TCRBV18 e IL-10 das mesmas. Esses dados indicam a existência de diferentes padrões imunogenéticos entre diferentes grupos étnicos. Outros polimorfismos SNPs de genes ligados ao sistema imune serão testados e comparados em nosso laboratório, utilizando as mesmas populações.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2008. / Submitted by wesley oliveira leite (leite.wesley@yahoo.com.br) on 2009-09-18T13:47:25Z No. of bitstreams: 1 2008_NeideMOGodinho.pdf: 1056735 bytes, checksum: 8eb44435455f25aa09a8943c3a2d8b8b (MD5) / Approved for entry into archive by Gomes Neide(nagomes2005@gmail.com) on 2010-09-30T14:34:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_NeideMOGodinho.pdf: 1056735 bytes, checksum: 8eb44435455f25aa09a8943c3a2d8b8b (MD5) / Made available in DSpace on 2010-09-30T14:34:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_NeideMOGodinho.pdf: 1056735 bytes, checksum: 8eb44435455f25aa09a8943c3a2d8b8b (MD5) Previous issue date: 2008 / A América Latina tem sido palco de grandes transformações populacionais, sendo hoje caracterizada por ter uma constituição multiétnica, porém com maior influência de três populações parentais - européia, africana e ameríndia. Apesar das similaridades, cada país latino-americano apresentou uma história de povoamento singular, já que ocorreram variações na distribuição das populações parentais e na quantidade de fluxo gênico entre elas. Esse trabalho teve por objetivo avaliar a constituição genética de populações miscigenadas da América Latina e Caribe e a estruturação genética entre elas. Para tanto, foram considerados quatro conjuntos populacionais e dois conjuntos de marcadores. Primeiro, foram analisados treze países da América Latina e Caribe (Argentina, Bahamas, Brasil, Chile, Colômbia, Costa Rica, El Salvador, Equador, Jamaica, México, Peru, Porto Rico e Venezuela), utilizando marcadores do tipo STRs (CSF1PO, D3S1358, D5S818, D7S820, D8S1179, D13S317, D16S539, D18S51, D21S11, FGA, TH01, TPOX e vWA). Em um segundo momento, foram avaliadas as diferenças entre as regiões geográficas de três países da América do Sul (Argentina, Brasil e Colômbia) utilizando os mesmos marcadores. Para uma análise mais regional, populações urbanas da região centro-oeste brasileira foram analisadas utilizando os mesmo marcadores anteriores adicionados do Penta E. O povoamento da região centrooeste foi também avaliado pela comparação de duas populações da região – Goiás e Distrito Federal – utilizando marcadores AIMs autossômicos - APO, AT3, D1, DRD2- A, ECA, FXIIIB, FyNull, GC, LPL, OCA2, PV92, Rb2300, Sb19.3 e TPA25. As análises de distância genética entre as populações latino-americanas e entre as regiões dos três países mostraram um quadro bastante heterogêneo quanto à distribuição das freqüências alélicas dos marcadores utilizados. A análise de mistura corroborou os dados de distância, sendo que a contribuição parental ameríndia variou de 5% a 73%, a africana de 4% a 90% e a européia de 4% a 66%. Com relação à análise das populações da região centro-oeste do Brasil, não foi observado diferenciação entre a distribuição gênica e genotípica, provavelmente devido ao intenso fluxo gênico entre elas. A mistura gênica estimada, considerando os marcadores microssatélites, foi de 11% para a parental ameríndia, 21% para a parental africana e de 68% para a parental européia. Os resultados obtidos com os marcadores AIMs foi de 15%, 21% e 63%, respectivamente. A maioria das populações analisadas apresentou modelo tri-híbrido de mistura. Esses resultados são concordantes com dados históricos e demográficos das populações latino-americanas. ____________________________________________________________________________ ABSTRACT / The Latin American population has been under great transformations and today it can be characterized as having a multiethnic constitution, however with three main parental populations influence - European, African and Amerindian. Despite their similarities, each country has a unique history of settlement, since there have been variations in the distribution of the parental populations and in the amount of gene flow between them. This study aimed to evaluate the genetic constitution in Latin American and Caribbean populations and the genetic structure between them. For that matter, four groups of populations and two sets of markers were employed. First, thirteen countries of Latin America and Caribbean (Argentina, Bahamas, Brazil, Chile, Colombia, Costa Rica, El Salvador, Ecuador, Jamaica, Mexico, Peru, Puerto Rico and Venezuela), were analyzed with STR markers (CSF1PO, D3S1358, D5S818, D7S820, D8S1179, D13S317, D16S539, D18S51, D21S11, FGA, TH01, TPOX and vWA). In a second moment, the differences between the geographic regions of three South-American countries were evaluated (Argentina, Brazil and Colombia) using the same markers. Next, for a more regional analysis, urban populations from Brazilian Middle-Western region were studied using the same markers listed above and Penta E. The settlement of the Brazilian Middle-Western region was also evaluated regarding the comparison of two populations of this region - Goiás and Federal District - using autosomic AIMs - APO, AT3, D1, DRD2-A, ECA, FXIIIB, FyNull, GC, LPL, OCA2, PV92, Rb2300, SB19.3 and TPA25. The analyses of the genetic distance between the Latin American populations and between the regions of the three countries had shown a heterogeneous picture of the distribution of the allelic frequencies. The admixture analysis corroborated the genetic distance data, with the Amerindian parental contribution presenting variations ranging from 5 to 73%, the African from 4 to 90% and the European from 4 to 66%. Regarding the analysis of the populations of the Brazilian Middle-Western region, differentiation between the genetic and genotypic distribution was not observed, probably due the intense gene flow between them. The genetic admixture estimate, considering the STRs markers, was 11% for the Amerindian parental, 21% for the African parental and 68% for the European parental. The results generated with the AIMs were 15%, 21% and 63%, respectively. The majority of the analyzed populations are tri-hybrid, having been formed by three parental groups. These results agree with historical and demographic data of the Latin American populations.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2008. / Submitted by Kathryn Cardim Araujo (kathryn.cardim@gmail.com) on 2009-09-22T11:44:22Z No. of bitstreams: 1 2008_CarolinaCarvalhoGontijo.pdf: 2185446 bytes, checksum: e129a07919bdf257cce4b57b4f01c19c (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2010-06-29T12:39:10Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_CarolinaCarvalhoGontijo.pdf: 2185446 bytes, checksum: e129a07919bdf257cce4b57b4f01c19c (MD5) / Made available in DSpace on 2010-06-29T12:39:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_CarolinaCarvalhoGontijo.pdf: 2185446 bytes, checksum: e129a07919bdf257cce4b57b4f01c19c (MD5) Previous issue date: 2008-05-29 / No Brasil, uma das principais formas de resistência à escravidão pelos escravos de ancestralidade africana foi a fuga e concentração em locais de difícil acesso, formando comunidades quilombolas. Hoje, remanescentes de quilombo, originados ou não dos antigos quilombos, se distribuem por todo o país. De forma geral, essas comunidades apresentam em sua composição genética grande contribuição africana, seguida, em graus variados, das contribuições ameríndia e européia. No presente trabalho, duas comunidades afro-derivadas, Santo Antônio do Guaporé (SAG) em Rondônia e Santiago do Iguape (STI) na Bahia, foram analisadas quanto a 13 marcadores informativos de ancestralidade – AIMs, i.e.: marcadores que apresentam diferenciais de freqüência maiores que 30% entre grupos definidos geográfica ou etnicamente. Os dados gerados foram utilizados para descrever SAG e STI quanto à adequação da distribuição genotípica ao Equilíbrio de Hardy-Weinberg, deficiência e excesso de heterozigotos, desequilíbrio de ligação e mistura; e para compará-las a outras populações urbanas e afro-derivadas. Os resultados indicaram que as duas populações, embora apresentem semelhanças, como a alta contribuição do grupo parental ameríndio em suas composições genéticas (37% em SAG e 56% em STI), apresentam diferenças significativas quando comparadas entre si pelo teste Exato de Fisher para diferenciação gênica e genotípica e pela estimativa de Fst. SAG e STI são também diferentes da população do Distrito Federal, com quem foram comparadas pelos mesmos testes. As análises de componente principal mostraram que as duas populações analisadas posicionam-se entre as parentais africana e ameríndia, o que vai ao encontro das estimativas de mistura. Em suma, as duas população aqui averiguadas apresentam alta contribuição africana e ameríndia, como outros remanescentes do país, mas se distinguem em decorrência dos inúmeros fatores associados a suas diferentes histórias. ___________________________________________________________________________________ ABSTRACT / In Brazil, many African descendant slaves avoided slavery by running away and hiding in communities called quilombos. Nowadays, quilombo remnants, either originated from old quilombos or defined by anthropological traces, are spread across the whole country. The present work analyzed 13 ancestry informative markers (AIMs) in order to detect the amount of contribution from the parental populations (Amerindians, Africans and Europeans) in the constitution of two afro-derived communities (Santo Antônio do Guaporé – SAG and Santiago do Iguape – STI). AIMs are markers whose frequencies differ by more than 30% between groups defined by ethnicity or geography. Statistical analysis such as genic and genotipic differentiation, F statistics and principal component analysis (PCA) were performed to compare SAG and STI to one another and to other Brazilian populations, manly to Distrito Federal (DF). Our results pointed out that SAG and STI, despite their high Amerindian contributions (37% and 56%, respectively), are significantly different from each other and from DF, according to the Fisher Exact Test for genic and genotipic differentiation and by Fst estimates. In PCA analysis, both populations were located between the African and Amerindian parental groups, matching the admixture estimates. In summary, SAG and STI showed high African and Amerindian contributions, like other Brazilian afro-derived populations, but are different from each other in their genetic constitutions as a consequence of their different histories.

As freqüências de variantes alélicas de diferentes genes envolvidos no desenvolvimento da resposta imune foram analisadas em uma população de origem japonesa do sul do Brasil (n=119). Polimorfismos bialélicos dos genes CCR5, TNFR-II e IL-10, e dos segmentos gênicos TCRBV3S1, TCRBV13S5 e TCRBV18 foram analisados por PCR-RFLP. As freqüências alélicas foram determinadas e comparadas com as freqüências encontradas em outros grupos étnicos (caucasóides e afro-brasileiros). Nós observamos a ausência do alelo CCR5D32 na população testada. Os polimorfismos dos segmentos gênicos TCRBV3S1 e TCRBV13S5, e do gene IL-10 apresentaram freqüências alélicas significativamente diferentes das freqüências observadas em caucasóides e afro-brasileiros. O polimorfismo do segmento gênico TCRBV18 apresentou freqüências alélicas estatisticamente diferentes de caucasóides. Além disso, a comparação de duas sub-populações (definidas em nossa amostra de acordo com a origem geográfica no Japão) indicou diferenças entre as freqüências alélicas dos polimorfismos gênicos de TCRBV18 e IL-10 das mesmas. Esses dados indicam a existência de diferentes padrões imunogenéticos entre diferentes grupos étnicos. Outros polimorfismos SNPs de genes ligados ao sistema imune serão testados e comparados em nosso laboratório, utilizando as mesmas populações.

Ctenomys lami é um roedor fossorial endêmico de uma região da Planície Costeira do Rio Grande do Sul, Brasil, conhecida como Coxilha das Lombas. Pouco se sabe, ainda, sobre a ecologia, comportamento e genética dessa espécie que foi descrita por Freitas (2001), considerando que esses conhecimentos são fundamentais no entendimento dos intrincados padrões evolutivos da mesma e principalmente do gênero do qual faz parte, tendo em vista que é um dos com maior diversidade de espécies entre os mamíferos. Além da importância na resolução de questões evolutivas, conhecimentos gerais sobre a espécie são necessários para o desevolvimento de planos de conservação e preservação. Este trabalho teve como objetivo identificar relações genéticas dentro e entre três possíveis subpopulações de C. lami através da análise do fluxo gênico (Fst, Fis, rst, Nm), de informações gerais como PIC (Conteúdo de Informação Polimórfica), média de alelos por locus, heterozigosidade, deficiência de heterozigotos e das relações de paternidade e parentesco. Para isso foram utilizados 89 indivíduos da população (subpopulação A: n=19; B: n=37; C: n=33) de uma área localizada na região de Itapuã, mais exatamente na borda leste da Lagoa Negra (S 30°21'35,6''/WO 51°00'32,9''), município de Viamão, RS. Para executar a análise genética foram utilizados marcadores de microssatélites descritos para espécies cogenéricas - Soc1, Soc2, Soc3, Soc4, Soc5, Soc6, Soc7 e Soc 8 desenvolvidas a partir de C. sociabilis e Hai2, Hai3, Hai4, Hai5 e Hai12 de C. haigi por Lacey (1999; 2001). Os resultados identificam que há um grande fluxo gênico, demonstrando assim, que não há uma subdivisão significativa entre as subpopulações sugeridas, mas também demonstram que parece haver uma estruturação incipiente, onde a distância e a baixa mobilidade dos indivíduos têm papel fundamental. A verificação da estrutura populacional através da análise de paternidade e parentesco indicou que a baixa variabilidade dos loci estudados impede uma definição real de paternidade e não oferecem dados suficientes para definir estruturação e comportamento dessa espécie. Sugere-se que essa baixa variabilidade seja resultado de um Efeito Fundador ocorrido recentemente na população. / Ctenomys lami was recently described by Freitas (2001) as a fossorial rodent, living only in Coxilha das Lombas, a region of the Coastal Plain of Rio Grande do Sul. The ecology, behavior and genetics of this species are not well known, although such knowledge is essential for understanding the intricate evolution patterns of this species as well as of the genus, which is one with the highest diversity among the mammals. Besides the importance of clarifying the evolution questions, general knowledge about this species is needed for developing conservation strategies. This work has the goal of identifying genetic relationships within and between three possible subpopulations of C. lami through the analysis of (i) genetic flow (Fst, Fis, rst, Nm), (ii) general information like PIC (Polymophic Information Content), allele mean per locus, heterozigosity, heterozygote deficiency and (iii) relatedness among individuals. Eighty-nine individuals from a population (subpopulation A: n=19; B: n=37; C: n=33) were analyzed in the area located in the region known as Itapuã, at the east banks of Lagoa Negra (S 30°21'35,6''/WO 51°00'32,9''), in Viamão, RS. To execute the genetic analysis, we used microsatellite markers described to cogeneric species (Hai2, Hai3, Hai4, Hai5 e Hai12, developed from C. haigi; and Soc1, Soc2, Soc3, Soc4, Soc5, Soc6, Soc7 e Soc 8, from C. sociabilis) by Lacey (1999; 2001). Results showed that there is high gene flow, and thus the three suggested sub-populations are not significantly divided. However, the population is not structured and the distance and low motility of individuals play an important role in this situation. When verifying the population structure through relatedness analysis, we found that the low variability of the studied loci does not allow a correct definition of paternity, and does not provide enough data to define structure and behavior of this species. We thus suggest that this low variability is an effect of a recent founder effect in this population.

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:38:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_5776_VOLPI 2012_Filogeografia Stenella longirostris_PPGBT_CEUNES_oficial_PROTEGIDO.pdf: 2949344 bytes, checksum: fa95887e37083748152e7197a8a96914 (MD5) Previous issue date: 2012-02-28 / Cetáceo. Marcadores genéticos. Genética de populações.

As freqüências de variantes alélicas de diferentes genes envolvidos no desenvolvimento da resposta imune foram analisadas em uma população de origem japonesa do sul do Brasil (n=119). Polimorfismos bialélicos dos genes CCR5, TNFR-II e IL-10, e dos segmentos gênicos TCRBV3S1, TCRBV13S5 e TCRBV18 foram analisados por PCR-RFLP. As freqüências alélicas foram determinadas e comparadas com as freqüências encontradas em outros grupos étnicos (caucasóides e afro-brasileiros). Nós observamos a ausência do alelo CCR5D32 na população testada. Os polimorfismos dos segmentos gênicos TCRBV3S1 e TCRBV13S5, e do gene IL-10 apresentaram freqüências alélicas significativamente diferentes das freqüências observadas em caucasóides e afro-brasileiros. O polimorfismo do segmento gênico TCRBV18 apresentou freqüências alélicas estatisticamente diferentes de caucasóides. Além disso, a comparação de duas sub-populações (definidas em nossa amostra de acordo com a origem geográfica no Japão) indicou diferenças entre as freqüências alélicas dos polimorfismos gênicos de TCRBV18 e IL-10 das mesmas. Esses dados indicam a existência de diferentes padrões imunogenéticos entre diferentes grupos étnicos. Outros polimorfismos SNPs de genes ligados ao sistema imune serão testados e comparados em nosso laboratório, utilizando as mesmas populações.