Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:59Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2004-11Bitstream added on 2014-06-13T21:05:30Z : No. of bitstreams: 1 taveira_rz_dr_botfmvz.pdf: 263449 bytes, checksum: 25a9e90e6bbf0574c26236eb35b75feb (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Poucas informações encontram-se disponíveis acerca dos parâmetros genéticos de características reprodutivas em eqüinos. Sendo assim, conduziu-se um estudo utilizando informações provenientes de 7.278 éguas da raça Puro-Sangue Inglês, sendo 6.327 informações sobre a idade à primeira cobertura (IPC), 5.400 relativas a idade à primeira parição (IPP), 5.473 referentes ao primeiro período de gestação (PPG) e 4.404 relativas ao primeiro intervalo de partos (PIEP). Os dados foram analisados pelo método da máxima verossimilhança restrita, com a utilização do aplicativo MTDFREML para estimação dos componentes de variância e covariância. A idade média à primeira cobertura foi de 4,93 anos, com desvio padrão de 1,45 anos, mínimo de 2,07,anos máximo de 11,94 anos e estimativa de herdabilidade (h2) de 0,19. A idade média à primeira parição foi de 6,01 anos, com desvio padrão de 1,53 anos, mínimo de 3,01anos, máximo de 12,9 anos e estimativa de herdabilidade de 0,38. O primeiro período de gestação médio foi de 337,83 dias, com desvio padrão de 9,47 dias, mínimo de 302 dias, máximo de 396 dias e estimativa de herdabilidade de 0,16. O primeiro intervalo de partos médio foi de 490,18 dias, com desvio padrão de 192,02 dias, mínimo de 303 dias, máximo de 1.095 dias e estimativa de herdabilidade de 0,01. As correlações genéticas encontradas entre a IPC e o IPP, PIEP e PPG foram 1, 0,55 e - 0,13, respectivamente. As correlações genéticas da IPP com PIEP e PPG foram 0,52 e 0,35, respectivamente, enquanto que a correlação genética entre o PIEP e PPG foi de - 0,54. Das características avaliadas a IPP mostrou-se mais interessante para incorporação em programas de seleção que visem melhorar aspectos reprodutivos de eqüinos da raça Puro-Sangue Inglês no Brasil. / There is very little information on the genetic parameters of reproductive traits in equine. With that in mind, a study was conducted using information from 7,278 Thoroughbred mares, of which 6,327 entries were about age at first covering (AFC), 5,400 relating to age at first foaling (AFF), 5,473 relating to first gestation period (FGP) and 4,404 relating to first foaling interval (FFI). The data were analyzed by Maximum Restricted Likelihood, with the application of MTDFREML, to estimate variance and covariance components. Average age at first covering was 4.93 years, with a standard deviation of 1.45 years, minimum of 2.07 years, maximum of 11.94 years and heritability estimate (h2) of 0.19. Average age at first foaling was 6.01 years, with a standard deviation of 1.53 years, minimum of 3.01 years, maximum of 12.9 years and estimative of heritability of 0.38. The first average gestation period was 337.83 days, with a standard deviation of 9.47 days, minimum of 302 days, maximum of 396 days and estimative of heritability of 0.16. First foaling interval was 490.18 days, with a standard deviation of 192.02 days and minimum of 303 days, maximum of 1,095 days and estimative of hereditability of 0.01. Genetic correlations found between AFC and AFF, FFI and FGP were 1, 0.55 and - 0.13, respectively. Genetic correlations of AFF with FFI and FGP were 0.52 and 0.35, respectively, whereas the genetic correlation between FFI and FGP was - 0. 54. Among the evaluated traits, AFF was shown to be the most interesting to incorporate in selection programs whose aim is to improve reproductive traits in Thoroughbred horses in Brazil.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-17Bitstream added on 2014-06-13T20:06:57Z : No. of bitstreams: 1 garcia_fq_dr_ilha.pdf: 352246 bytes, checksum: 097f8549b6195af1104ffbbd10cb0141 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O milho é uma planta cultivada no mundo todo e de importância econômica mundial. Em função de sua importância, amplos programas de melhoramento são realizados nesta cultura. Das várias técnicas utilizadas, a seleção recorrente recíproca tem sido importante na melhoria do cruzamento entre duas populações e, consequentemente, na obtenção de melhores híbridos entre linhagens extraídas das mesmas. No entanto o sucesso da seleção recorrente recíproca depende da existência de variabilidade genética interpopulacional e heteroze. O objetivo deste trabalho foi verificar a existência de variabilidade genética nas populações de milho de porte baixo Isanão-VF1 e Isanão-VD1, em condições de espaçamento reduzido e alta densidade de plantas, visando o início de um programa de seleção recorrente recíproca. Foram estimados parâmetros genéticos para oito caracteres, avaliando-se 80 progênies de meios irmãos interpopulacionais Isanão-VF1 e 72 Isanão-VD1, semeadas na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da Faculdade de Engenharia, Campus de Ilha Solteira (UNESP), em Selvíria/MS. Foi encontrada variabilidade genética interpopulacional, expressa através dos caracteres florescimento feminino (FF), altura de plantas (AP), altura de espigas (AE) e rendimento de grãos (RG), com herdabilidades (em nível de médias de progênies) de 68,8%, 76,9%, 75,0% e 54,78%, respectivamente. Os índices de variação (coeficiente de variação genético/coeficiente de variação experimental) foram de 0,9; 1,1; 1,0 e 0,6, respectivamente para FF, AP, AE e RG. Espera-se um ganho de 10,76%/ciclo de seleção no RG do híbrido interpopulacional, 19 qualificando as populações Isanão-VF1 e Isanão-VD1 para serem submetidas a um programa de seleção recorrente recíproca. Com uma heterose de 38,2% do híbrido interpopulacional sobre as populações... / Maize is a cultivated crop around the globe, and of worldwide economic importance. Due to its importance, wide genetic breeding programs are constantly applied upon it. Among the techniques employed, reciprocal recurrent selection has been important in improving the cross between two populations and in obtaining superior hybrids of inbred lines originated from them. However, the success of reciprocal recurrent selection is dependent of interpopulation genetic variability. The objective of this research was to verify the presence of genetic variability in brachytic populations Isanão-VF1 and Isanão-VD1 maize, cultivated in reduced row spacing and high plant density, aiming at beginning a reciprocal recurrent selection breeding program. Were Genetic parameters estimated for eight traits, evaluated in 80 interpopulation half-sib progenies of Isanão-VF1 and 72 of Isanão-VD1, at the UNESP Research Farm, located in Selvíria, state of Mato Grosso do Sul, Brazil. Interpopulational genetic variability was expressed in the traits silk emergence (FF), plant height (AP), ear height (AE) and grain yield (RG). The coefficients of heritability progeny mean basic were 68.8%, 76.9%, 75.0% and 54.8%, respectively. Estimates of the index of variation (genetic variation coefficient/experimental variation coefficient) were 0.9, 1.1, 1.0 and 0.6, for SE, PH, EH and GY, respectively. A gain of 10.76%/cycle on GY is expected on the interpopulation hybrid, indicating Isanão-VF1 and Isanão-VD1 populations as base for a reciprocal recurrent selection progr am. The heterosis of 38.2% of the interpopulation hybrid over the parental populations qualify the latter as a sources of inbred lines, to be used us hybrid crosses more adapted the condition of high plant density and reduced row spacing.

Resumo: A identificação de interação genótipo-ambiente em bovinos de corte pode auxiliar o processo de seleção, aumentando a eficiência da avaliação genética de reprodutores submetidos à ambientes distintos. Características medidas pós-desmame estão mais sujeitas aos efeitos da interação genótipoambiente do que na fase pré-desmame. Assim, o objetivo deste trabalho foi verificar a existência do efeito da interação genótipo-ambiente sobre os pesos corporais aos 365 (P365), 450 (P450) e aos 550 (P550) dias de idade de bovinos Nelore criados nos estados de Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Minas Gerais, Pará e São Paulo. Os componentes de (co)variância, parâmetros genéticos e os valores genéticos preditos foram estimados para cada característica, por estado e para o conjunto total de dados, pelo método da máxima verossimilhança restrita. Correlações de Spearman entre as classificações dos touros por estado quanto ao valor genético para cada característica ou considerando cada estado individualmente e em conjunto (todos os estados), assim como a correlação genética entre observações da mesma característica, medida em dois estados distintos foram utilizadas para avaliar o efeito da interação genótipo-ambiente sobre as características estudadas. Correlações de Spearman não significativas indicaram mudança de posição na classificação de touros e conseqüente existência de interação genótipo-ambiente. A ocorrência desta interação também foi constatada em algumas ocasiões por estimativas de correlação genética entre observações da mesma característica em estados diferentes, para P365 foi observada indícios de interação entre SP e GO (0,71), SP e MT (0,68) e também entre SP e PA (-0,11), para P450, MT e MG (-0,28), GO e PA (0,62) e SP e PA (0,66), para a característica P550, MT e MG (-0,38), MG e PA (0,73), MG e SP (-0,34) e para... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The properly identification of genotype-environment interaction in beef cattle herds can help the selection process and improve genetic evaluation of sires submitted in different environments. Post weaning traits may be more influenced by the genotype-environment interactions than others. So, this paper objective was verify genotype-environment interaction in, beef cattle, body weight at 365 (P365), 450 (P450) and 550 (P550) days of age in herds distributed in six Brazilian states, Goiás (GO), Mato Grosso (MT), Mato Grosso do Sul (MS), Minas Gerais (MG), Pará (PA) and São Paulo (SP). Genetic parameters, (co)variance components and genetic values were estimated for each trait, each state and for all states together, using maximum restricted likelihood method. Spearman correlations among sire's classifications due to its genetic value, for each trait, by state individually or in group (using data from all states), genetic correlation between the same trait measured in two different states were used to evaluate genetic-environment interaction over the traits studied. Non significant Spearman's correlation indicated position changes at sires classification and consequently genotype-environment interaction. This interaction occurrence was also observed between genetic correlations of the same trait measured in two different states. Genetic correlation for P365, between SP and GO states were (0, 71), SP and MT (0, 68) and also between SP and PA (-0, 11). For P450, MT and MG (-0, 28), GO and PA (0, 62) and SP and PA (0, 66). P550, MT and MG (-0, 38), MG and PA (0, 73), MG and SP (-0, 34) and SP and PA (-0, 86). There so, selection conduced considering data obtained in one state could be different than one based in others. Beef cattle summary organized by state would be indicated if this one would be economically viable. / Orientador: João Ademir de Oliveira / Coorientador: Danísio Prado Munari / Coorientadora: Cládudia Cristina Paro de Paz / Banca: Sandra Aidar de Queiroz / Banca: Ruy Alberto Caetano Correa Filho / Mestre

Submitted by DANIELA BARRETO AMARAL TEIXEIRA null (danielabateixeira@hotmail.com) on 2016-07-09T12:26:08Z No. of bitstreams: 1 DissertaçãoDaniela.pdf: 1505420 bytes, checksum: b57087f798762d84c029781714eac7b5 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-07-12T16:54:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 teixeira_dba_me_jabo.pdf: 1505420 bytes, checksum: b57087f798762d84c029781714eac7b5 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-12T16:54:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 teixeira_dba_me_jabo.pdf: 1505420 bytes, checksum: b57087f798762d84c029781714eac7b5 (MD5) Previous issue date: 2016-06-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A habilidade de permanência (HP), que pode ser definida como a probabilidade de uma vaca parir numa determinada idade, dado que ela teve esta oportunidade, é uma característica reprodutiva de grande importância em bovinos de corte, estando diretamente relacionada à produtividade do rebanho. O objetivo deste trabalho foi estimar parâmetros genéticos e identificar possíveis regiões do genoma que estejam associadas com a expressão fenotípica da HP de vacas da raça Nelore. Os componentes de variância foram estimados por inferência bayesiana utilizando um modelo de limiar no qual foram considerados os efeitos sistemáticos de grupos de contemporâneos e precocidade sexual, e os efeitos aleatórios de animal e resíduo.Os efeitos dos SNPs foram estimados por meio da metodologia ssGBLUP, sendo utilizados na análise 2838 animais genotipados com o painel de alta densidade da Illumina (Bovine HD Assay Illumina, San Diego, CA, USA). A variância explicada por janelas formadas por 200 SNPs consecutivos foi utilizada na identificação das regiões de maior efeito sobre a expressão da característica HP. A herdabilidade encontrada utilizando a matriz A (pedigree) foi de 0,11±0,01 e utilizando a matriz H( matriz de parentesco que combina a informação de pedigree e dos SNPs) de 0,14±0,01. Foram encontrados 147 genes candidatos para a característica habilidade de permanência em regiões dos cromossomos 1, 2, 5, 6, 9, 20 e no cromossomo sexual X. Novas regiões candidatas para a característica habilidade de permanência foram detectadas e a maioria está relacionada a funções reprodutivas, imunológicas e ligadas ao sistema nervoso. / Stayability, which can be defined as the probability of a cow calving to a certain age since it has this opportunity, is a reproduction trait of great importance in beef cattle and is directly related to the productivity of the herd. The objective of this study was to estimate variance components through single-step G-BLUP methodology, and use the solutions of the SNPs effects to identify possible regions of the genome that are associated with the phenotypic expression of stayability in Nellore cows. The variance components were estimated by Bayesian inference using a threshold model in which were considered the fixed effects of precocity and contemporary groups, and the random effects of residue and animal. The effects of SNP were estimated by ssGBLUP methodology being used for the analysis 2838 animals genotyped with the Illumina panel of high density ( HD Assay Bovine Illumina, San Diego, CA , USA ). A Manhattan plot containing the variance explained by the windows formed by 200 SNPs consecutive was used to identify regions of greatest effect on the expression of stayability trait. The heritability found using the A matrix was 0.11 ± 0.01 and using the H matrix was 0.14 ± 0.01. 147 potential genes for stayability were found in regions of chromosomes 1,2,5,6,9,20 and sexual chromosome X. New candidate regions for stayability were detected and most of them are related to reproductive, immune and nervous system. / FAPESP: 2009/16118-5

Submitted by LUCAS HENRIQUE BRITO SALES null (lucash.b.s@hotmail.com) on 2017-07-31T16:19:43Z No. of bitstreams: 1 Dissertação FINAL_Lucas Brito.pdf: 2624281 bytes, checksum: 4b18f17d4f492f2f78b7d31bebab7f64 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-08-03T15:04:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 sales_lhb_me_jabo.pdf: 2624281 bytes, checksum: 4b18f17d4f492f2f78b7d31bebab7f64 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-03T15:04:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 sales_lhb_me_jabo.pdf: 2624281 bytes, checksum: 4b18f17d4f492f2f78b7d31bebab7f64 (MD5) Previous issue date: 2017-06-14 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / A análise de componentes principais (PCA) e análise de fatores (FA) são amplamen-te utilizadas no processamento de dados visando a redução da dimensionalidade. No entanto, poucos são os estudos que empregou estes métodos em um conjunto de características importantes em bovinos da raça nelore com a finalidade de mode-lar a estrutura de (co)variância dos dados. O objetivo deste estudo foi estimar pa-râmetros genéticos para as características de crescimento, carcaça e qualidade da carne em machos Nelore, utilizando diferentes modelos multi-características visando a redução da dimensionalidade dos dados. Um total de 3.865; 4.121; 4.109; 4.188; 4.213; 3.320 e 16.575 registros de peso da carcaça quente (PCQ), área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), escore de marmorização (MARM), maciez, mensurada pela força de cisalhamento (SF), lipídios (LP) e peso ao sobreano (PS), respectivamente, foram usados. As análises foram realizadas por meio de cinco modelos: multi-característica padrão, três modelos de posto reduzido ajustando os primeiros três (PC3), quatro (PC4) e cinco (PC5) componentes princi-pais genéticos e um modelo utilizando análise de fatores com três (FA3) fatores. Os modelos foram comparados pelo Critério de Informação de Akaike (AIC) e Critério Bayesiano de Schwarz (BIC), levando em consideração o número de parâmetros. Foram considerados para todos os modelos os efeitos aleatórios genético aditivo direto e residual, e os efeitos fixos do grupo de contemporâneos e o efeito linear da idade do animal ao abate como covariável, exceto para peso ao sobreano. Os mo-delos de análise de fatores e componentes principais genéticos selecionados por ambos os critérios de seleção foram o PC3 (BIC), PC4 (AIC) e o FA3 (AIC e BIC), com 46, 50 e 53 parâmetros, respectivamente. No entanto, o modelo que mais se aproximou do modelo multi-característica padrão foi o PC4, sendo então, o mais indicado devido a semelhança das estimativas de (co)variância. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,06 (LP) a 0,31 (AOL) com MV e 0,04 (LP) a 0,30 (AOL) com o PC4. As maiores estimativas de correlações genéticas foram entre as carac-terísticas PCQ x SF, PCQ x PS e MARM x LP, sendo similar nos modelos MV e PC4. As maiores estimativas de correlações fenotípicas foram entre as característi-cas de peso e AOL (PS x SF), (PS x AOL) e (SF x AOL). Em geral, foram necessá-rios quatro componentes principais para modelar a estrutura das (co)variâncias ge-néticas para as características de crescimento, carcaça e qualidade da carne. O modelo de posto reduzido indicado pelo o AIC (PC4) reduziu o número de parâme-tros a serem estimados em 21,4%, sem diminuir a qualidade do ajuste. / Principal component (PCA) and factor analysis (FA) are widely used in data processing to reduce dimensionality. However, few studies have used these methods in a set of important traits in Nelore cattle for the purpose of modeling the covariance structure data. The aim of this study was to estimate genetic parameters for growth, carcass and meat quality traits in Nellore males, using different multivariate models to reduce the dimensionality data. A total of 3.865; 4.121; 4.109; 4.188; 4.123 3.320 and 16.575 records, hot carcass weight (HCW), 12-13th rib eye area (REA), backfat thickness (BF), marbling score (MS), warner-wraztler wear force (WBSF), lipid content (LC), and weight at 550 days (W550), respectively, were used. The analyzes were performed using five models: standard multi-characteristic, three reduced-rank models, and adjusted the first three (PC3), four (PC4) and five (PC5) genetic main components, and a model using factor analysis with three (FA3) factors. The models were compared by the Akaike Information Criterion (AIC) and Schwarz Bayesian Criterion (BIC), taking into account the parameters number. The random effects of the direct and residual additive genetic and the fixed effects of the contemporaneous group and the linear effect of animal age on slaughter were considered as covariate, except for yearling weight. The analysis models of genetic factors and main components selected by both selection criteria were PC3 (BIC), PC4 (AIC) and FA3 (AIC and BIC), with 46, 50 and 53 parameters, respectively. However, the model that most approached the standard multi-characteristic model was PC4, and is therefore most appropriate due to the similarity of covariance estimates. Estimates of heritability ranged from 0.06 (LP) to 0.31 (AOL) with MV and 0.04 (LP) to 0.30 (AOL) with PC4. The highest estimates of genetic correlations were among the characteristics PCQ x SF, PCQ x PS and MARM x LP, being similar in the MV and PC4 models. The highest estimates of phenotypic correlations were among the weight and AOL (PS x SF), (PS x AOL) and (SF x AOL) traits. In general, four main components were required to model the structure of the genetic covariances for growth, carcass and meat quality traits. The reduced rank model indicated by the AIC (PC4) reduced the parameters number to be estimated by 21.4%, without decreasing the quality of the adjustment. / CNPq: 184428-1

Submitted by Alejandro Barrera Carvajal null (alejandrobarreracarvajal@gmail.com) on 2017-10-05T04:26:06Z No. of bitstreams: 1 Dissertaçao_Alejandro_Barrera_Carvajal.pdf: 1237994 bytes, checksum: b3cc225c970d5d4a261bca85aee4a212 (MD5) / Approved for entry into archive by Monique Sasaki (sayumi_sasaki@hotmail.com) on 2017-10-09T16:57:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 barreracarvajal_a_me_jabo.pdf: 1237994 bytes, checksum: b3cc225c970d5d4a261bca85aee4a212 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-09T16:57:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 barreracarvajal_a_me_jabo.pdf: 1237994 bytes, checksum: b3cc225c970d5d4a261bca85aee4a212 (MD5) Previous issue date: 2017-07-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O conhecimento da estrutura de uma população é importante quando se deseja manter a variabilidade genética em programas de melhoramento genético. As estimativas dos parâmetros genéticos permitem identificar as características de interesse econômico que podem responder a seleção direta ou indireta. Neste trabalho, objetivou-se avaliar a estrutura genética populacional e estimar os parâmetros genéticos para as características peso corporal da fêmea na entrada (PEP) e na saída (PSP) da primeira estação de monta, idade ao primeiro parto (IPP), peso corporal da vaca ao primeiro parto (PPP), peso corporal da vaca ao primeiro desmame (PPD) e perímetro escrotal aos 378 dias (PE378) em bovinos da raça Caracu, para avaliar critérios de seleção e os procedimentos de acasalamento para manter a variabilidade genética da população. A estrutura genética da população foi avaliada pelo tamanho efetivo (Ne), número efetivo de fundadores (fe), número efetivo de ancestrais (fa), intervalos de geração, coeficiente de endogamia (F), coeficiente de parentesco médio (AR) e integridade do pedigree. Os parâmetros genéticos foram estimados pelo método de máxima verossimilhança restrita (REML) por meio de modelo animal multi-característica. Os resultados obtidos para Ne na geração máxima, completa e equivalente, foram 180,90; 57,39; e 92,38, respectivamente. O valor para fe foi de 199 e para fa de 27. O coeficiente de endogamia médio e o parentesco médio foram 2,14% e 5,72%, respectivamente. Na avaliação da integridade do pedigree foram identificados 94,83% das mães e 93,82% dos pais com registros de origem. As estimativas de herdabilidade para as características de peso corporal variaram de 0,37 ± 0,09 (PPP) a 0,46 ± 0,08 (PPD). Para as características reprodutivas, as estimativas de herdabilidade foram 0,31 ± 0,10 para PE378 e 0,10 ± 0,06 para IPP. As correlações genéticas variaram de -0,37 ± 0,30 (PE378 e IPP) a 0,94 ± 0,06 (PSP e PPP). As correlações genéticas entre os pesos corporais medidos durante o primeiro ciclo reprodutivo e IPP indicaram que a seleção visando controlar o peso corporal nesse período não irá afetar a idade ao primeiro parto. A correlação genética favorável obtida entre PE378 e IPP (-0,37±0,30) indicou que a seleção para PE378 nos machos poderá favorecer a redução de idade ao primeiro parto das fêmeas. A partir dos parâmetros populacionais, concluiu-se que a variabilidade genética da população tem sido mantida, assim como os níveis de endogâmia, em decorrência do controle dos acasalamentos no decorrer das gerações. / The knowledge of the structure of the population is important to desired to maintain genetic variability in breeding programs. The genetic parameters estimates allow identifying economic interest traits that can respond to direct or indirect selection. The goal of this study was to evaluate the population genetic structure and to estimate the genetic parameters for the body weight of the cow at the beginning (WBF) and at the end (WEF) of the first breeding season, age at first calving (AFC), body weight of cow at first calving (WFC), body weight of cow at first weaning (WFW) and scrotal circumference measured at 378 days (SC378) in Caracu beef cattle, to assess the selection criteria and to indicate mating procedures to maintain the genetic diversity of the population. The genetic structure of the population was verified of the effective population size (Ne), the effective number of the founders (fe), the effective number of the ancestors (fa), the generational intervals, the inbreeding coefficient (F), the average relatedness (AR) and of the pedigree integrity. The restricted maximum likelihood method (REML) was used to estimate the genetic parameters under multitrait animal model. The maximum, complete and equivalent generation for Ne was 180.90; 57.39 and 92.38, respectively. For the fe were 199 and for fa 27. The average of the inbreeding coefficient and the AR were 2.14% and 5.72%, respectively. The integrity of the pedigree identified was 94.83% of the dam and 93.82% of the sire with known initial records Estimates of heritability for body weight traits ranged from 0.37 ± 0.09 (WFC) to 0.46 ± 0.08 (WFW). For the reproductive traits, the heritability estimates were 0.31 ± 0.10 for SC378 and 0.10 ± 0.06 for AFC. Genetic correlations ranged from -0.37 ± 0.30 (SC378 and AFC) to 0.94 ± 0.06 (WEF and WFC). Genetic correlations between body weights measured during the first reproductive cycle and the AFC indicated that selection to control body weight in this period will not affect age at first calving. The favorable genetic correlation obtained between SC378 and AFC (-0.37 ± 0.30) indicated that selection for SC378 of males may reduce the age at first calving of females. The population parameters showed that the genetic variability of the population has been maintained, as well as the levels of the inbreeding due to the control of mating during the generations.

Orientador: Edson Seizo Mori / Banca: Edson Seizo Mori / Banca: Mauricio Dutra Zanotto / Banca: Léo Zimback / Resumo: O pinhão manso (Jatropha curcas L.) é uma espécie perene com grande potencial para produção de biodiesel, pois apresenta rápido crescimento é de fácil cultivo e com capacidade de adaptação às diversas condições edafoclimáticas. O presente trabalho tem como objetivo avaliar, por meio de teste de progênies, a variabilidade genética de progênies de pinhão manso para as características de crescimento: altura, diâmetro do colo e número de ramos. Foi implantado um teste de progênies na Fazenda São Manuel, localizada no município de São Manuel - SP, pertencente à Faculdade de Ciências Agronômicas, UNESP, Campus de Botucatu. O espaçamento utilizado foi de 4,0 x 2,5 m, em blocos casualizados. Foram analisadas altura, diâmetro da base e número de ramos das plantas de 28 progênies, procedentes principalmente da EPAMIG, e obtidas às estimativas de parâmetros genéticos. As médias de altura e diâmetro foram aos seis meses de 52,38 e 2,91, aos 12 meses 68,87 e 3,98, aos 18 meses 82,31 e 4,23 e aos 24 meses 108,78 e 5,04, respectivamente. Detectou-se diferença estatística pelo Teste F, em nível de 5% de probabilidade, indicando haver variabilidade entre as progênies. As estimativas dos coeficientes de variação genética individual (CVgi) e coeficiente de variação genética de progênies (CVgp) aos 24 meses foram de 26,7 e 13,4% para altura; 15,1 e 7,5% para diâmetro e 21,2 e 10,6% para número de ramos, respectivamente. As estimativas de herdabilidade média de progênies () aos 24 meses foi de 0,36 para altura; 0,35 e para diâmetro e 0,42 para número de ramos, respectivamente. Os resultados obtidos indicam que as progênies de pinhão manso apresentam variabilidade genética para os caracteres avaliados, mostrando potencial para serem utilizadas em programas de melhoramento genético / Abstract: The jatropha (Jatropha curcas L.) is a perennial species with a great potential for biodiesel production, as it offers rapid growth, moreover it is easy to be cultivated and it has a high capacity of adaptability to various soil and climatic conditions. The objective of this research is to evaluate, by progeny test, the genetic variability for the following characteristics of jatropha's progenies; growth, height diameter and number of branches. It has been implanted a progeny test, at São Manoel's farm, located in São Manoel - São Paulo, belonging to the Faculdade de Ciencias Agronomicas, UNESP, Botucatu. The experimental design was random blocs 4,0 x 2,5 m. The project analyzed height, diameter, number of branches of 28 progenies of plants, coming mainly from EPAMIG, and as a result the project obtained estimates of genetic parameters. The average height and diameter in the first six months were 52.38 and 2.91, at twelfth month were 68,87 and 3,98, at eighteenth month were 82,21 and 4,23 and at twenty-fourth month were 108,78 and 5,04. Statistical difference was detected by a F test at 5% level of probability, it indicates variability among the progenies. The coefficient estimates of individual genetic variation and genetic variation of progenies at twenty-fourth months were 26.7 and 13.4% for height, 15,1 and 7,5% for diameter 21.2 and 10.6% for number of branches, respectively. Estimates of heritability at twenty-fourth months were 0.36 for height, 0.35 for diameter and 0.42 for number of branches, respectively. The results obtained indicate that the progenies of jatropha present genetic variability for traits showing potential to be used in breedind programs / Mestre

Resumo: As características reprodutivas das fêmeas são de grande importância na exploração de bovinos de corte no Brasil, pois estas influenciam diretamente no número de bezerros produzidos. A habilidade de permanência de fêmeas no rebanho apresenta grande impacto nos custos das propriedades rurais, pois está diretamente ligada à capacidade das vacas em produzir determinado número de bezerros em um espaço de tempo. O objetivo deste trabalho foi estudar a habilidade de permanência de fêmeas no rebanho aos 76 meses de idade (HP) e suas associações genéticas com a idade ao primeiro parto (IPP), peso corporal de machos e de fêmeas aos 420 dias de idade (P420) e perímetro escrotal aos 420 dias de idade (PE420), para fornecer subsídios ao programa de avaliação genética da raça Canchim. Por se tratar de uma característica binária, definiu-se HP como sucesso (2) quando as fêmeas obtiveram no mínimo três bezerros até os 76 meses de idade e fracasso (1) para as demais. No modelo animal, foi incluído o efeito fixo de grupo de contemporâneos (GC) e os efeitos aleatórios aditivos direto e residual. Os dados foram analisados por meio de inferência Bayesiana, em análise bi-característica de HP com as demais características. Aos 76 meses de idade 40,77% das vacas obtiveram sucesso. As médias de IPP, P420 e PE420 foram iguais a 40,28 ± 7,85 meses, 254,92 ± 45,05 kg e 24,63 ± 3,84 cm, respectivamente. As estimativas de herdabilidade obtidas para HP, IPP, P420 e PE420 foram iguais a 0,03 ± 0,01; 0,04 ± 0,01; 0,24 ± 0,04 e 0,24 ± 0,06, respectivamente. As associações genéticas da característica HP com IPP, P420 e PE420 foram iguais a -0,63 ± 0,20; -0,09 ± 0,11 e 0,45 ± 0,21, respectivamente. As correlações ambientais, de HP com IPP e P420 foram iguais... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Improvement of female fertility has become of fundamental importance for profit maximization in the beef cattle herds in Brazil. The stayability trait was defined as whether or not a cow calved in a herd at a specific age. Therefore, the objectives of the present study are to analyze stayability (Stay) and its genetic association with age at first calving (AFC), body weight in males and females at 420 days of age (BW420) and scrotal circumference at 420 days of age (SC420), in Canchim cattle. In this research, Stay was defined as success (2) for females that had a minimum of three calves at 76 months of age and failure (1) for the others. Genetic parameters were estimated for all traits. The animal model included the fixed effect of contemporary group (CG) and the additive direct and residual random effects. The data was studied using Bayesian inference in two-trait analyses. At 76 months of age the percent of success was equal to 40.77%. The means for AFC, BW420 and SC420 were equal to 40.28 ± 7.85 months, 254.92 ± 45.05 kg e 24.63 ± 3.84 cm, respectively. The analyses provided heritability estimates of 0.03 ± 0.01, 0.04 ± 0.01, 0.24 ± 0.04 and 0.24 ± 0.06 for Stay, AFC, BW420 and SC420, respectively. The estimates of posterior genetic association were equal to -0.63 ± 0.20, -0.09 ± 0.11 and 0.45 ± 0.21 between Stay with AFC, BW420 and SC420, respectively. The environmental association between Stay with AFC and BW420 were 0.02 ± 0.01 and -0.06 ± 0.04, respectively, and for SC420 the environmental correlation was computed as zero. Selection for higher BW420 should not improve the Stayability trait. However, selection for SC420 should improve this trait and also contribute positively in Stayability. The improvement of age at first calving and Stayability should not be obtained by selection for these traits, but mainly, by changes in management and environmental conditions. / Orientador: Maurício Mello de Alencar / Coorientador: Danísio Prado Munari / Banca: Cláudia Cristina Paro de Paz / Banca: João Ademir de Oliveira / Mestre

Orientador: Ricardo da Fonseca / Banca: Cláudia Cristina Paro de Paz / Banca: Aníbal Eugênio Vercesi Filho / Resumo: Os objetivos desse estudo foram planejar e implementar um programa de melhoramento genético de ovinos no oeste paulista e estimar parâmetros genéticos de características de crescimento e de carcaça em ovinos Suffolk, afim de traçar estratégias de seleção para programas de melhoramento genético. Os dados analisados para a realização do primeiro objetivo, foram coletados da prova de ganho de peso realizada em 2009, sendo os animais oriundos de 11 propriedades próximas a região de Dracena. As características avaliadas foram peso ajustado aos 150 dias de idade (P150) e ganho de peso médio diário (GPD). Para o auxílio da classificação dos cordeiros um índice da prova de ganho de peso (Ipgp) foi elaborado e 5 reprodutores foram indicados para a seleção. Entretanto, por falta de interesse dos produtores, nenhum dos animais indicados para a reprodução foram utilizados, sendo estes, vendidos para o abate. Desta forma, para o início de um programa de melhoramento genético de ovinos na região, será necessário a formação de um rebanho com mérito genético superior, adequado ao sistema de manejo adotado na região e ao mercado consumidor, através de produtores interessados em selecionar seus animais ou então pela faculdade, se responsabilizando pelo fornecimento de material genético para a região. Para a realização do segundo objetivo, os dados avaliados foram coletados entre os anos de 2007 e 2009, oriundos de uma propriedade localizada no Estado de São Paulo, participante do programa de melhoramento Ovigol, desenvolvido pela empresa Aries Reprodução e Melhoramento Genético Ovino - Ltda em parceria com a empresa AbacusBio Limited da Nova Zelândia. As estimativas dos componentes de (co)variâncias e dos parâmetros genéticos foram obtidos pelo software REMLF90, que usou... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objectives of this study were to design and implement a program of genetic improvement of sheep in western São Paulo state and estimate genetic parameters for growth traits and carcass in Suffolk sheep in order to trace selection strategies for genetic improvement programs. The data analyzed to achieve the first objective, we collected evidence of weight gain took place in 2009, and the animals from 11 properties near the Dracena.These characteristics were adjusted weight at 150 days of age (P150) and average daily weight gain (ADG). To aid the classification of lambs an index of evidence of weight gain (IPGP) was developed and five players were nominated for selection. However, due to lack of interest of producers, none of the animals listed were used for reproduction, the latter being sold for slaughter.Thus, for the beginning of a breeding program for sheep in the region will require the formation of a herd with superior genetic merit, appropriate to the management system adopted in the region and to the consumer market by producers interested in selecting their animals or for college, taking responsibility for providing genetic material for the region. To achieve the second objective, the data evaluated were collected between 2007 and 2009, coming from a property located in the State of São Paulo, participant Ovigol improvement program, developed by Aries Reproduction and Breeding Sheep - Limited in AbacusBio partnership with New Zealand Limited. Estimates of (co) variances and genetic parameters were obtained by REMLF90 software, which used the restricted maximum likelihood method under multi-trait animal model. The predicted heritability for BW, GPPré, PD, GPPós, AOL and EGS were 0.06, 0.48, 0.45, 0.16, 0.10 and 0.07, respectively. Genetic correlations between weight traits ranged from -0.67 to 0.98... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:20Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-08-29Bitstream added on 2014-06-13T21:00:53Z : No. of bitstreams: 1 pinto_cs_me_botfca.pdf: 1125735 bytes, checksum: 911ee854430bff9965e0ec58e6a7b681 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A ferrugem causada pelo fungo Puccinia psidii Winter é uma das doenças mais limitantes no estabelecimento de novos plantios e na condução de brotações de algumas espécies e procedências de Eucalyptus. O método de controle mais eficiente é o plantio de populações de Eucalyptus resistentes à doença. O presente trabalho tem como objetivo estudar a variabilidade genética em progênies de Eucalyptus dunnii Maiden para resistência à ferrugem causada pelo fungo Puccinia psidii Winter. Foram instalados dois testes de progênies de Eucalyptus dunnii no campo, em áreas com histórico de observação de ocorrência da ferrugem pertencentes à empresa Suzano Papel e Celulose, plantados em espaçamento 3x2m, e um teste de progênies em ambiente controlado (câmara de inoculação), conduzido no Departamento de Produção Vegetal. Os experimentos foram instalados em blocos casualizados, o primeiro com 60 progênies, na região de Itapetininga/SP, o outro com 48 progênies de Eucalyptus dunnii, ambos com oito plantas por parcela e repetidos em seis blocos. Foram feitas medições de altura de planta, avaliação da severidade de ataque do fungo. A estimativa da variabilidade genética foi determinada utilizando o programa computacional SELEGEN. As progênies de Eucalyptus dunnii apresentaram uma boa variabilidade genética para resistência a ferrugem e altura das plantas; não houve correlação entre progênies atacada e redução no crescimento em altura / Rust caused by Puccnia psidii Winter fungus is a limiting factor to establish new plantings and to conduct sprouting of some Eucalyptus species and its origin. The more efficient control method is Eucalytpus population planting resistant to the disease. This work has as an objective to study the genetic viability in Eucalyptus dunnii Maiden progenies resistant to Rust caused by Puccinia psidii Winter. It was installed two Eucalyptus dunnii progenies tests in the field, at Suzano Paper and Cellulose Company areas where rust was observed in the past, spacing 3x2m, and one progeny test in controlled environment (inoculation chamber), conducted at Plant Production Department. Both were installed in randomized blocks, the first with 60 progenies, in Itapetininga/SP Region, and the other with 48 progenies of Eucalytpus dunnii. Both with eight plants per plot and repeated in six blocks. The high of the plants were measured and evaluated the fungus attack. Genetic variability estimates was determinate thought SELEGEN (a computer program). The Eucalyptus dunnii progenies presented a good genetic variability for rust resistance and plants high; there was no correlation between infected progenies and decrease in high development