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Ganho com seleção e diversidade genetica : medidas para monitorar o melhoramento populacional de arroz

Badan, Ana Claudia de Carvalho 03 August 2018 (has links)
Orientadores: Elcio Perpetuo Guimarães, Catalina Ramis-S / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-03T18:31:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Badan_AnaClaudiadeCarvalho_D.pdf: 597144 bytes, checksum: 1b60f4d96ffe6707c8d0080b51c847fd (MD5) Previous issue date: 2003 / Doutorado
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Variação genética para os caracteres fisiológicos, bioquímicos e nutricionais em sementes de uma população base de Myracrodruon urundeuva procedente de Aquidauana-MS

Berti, Christian Luis Ferreira [UNESP] 02 August 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-08-02Bitstream added on 2014-06-13T21:07:43Z : No. of bitstreams: 1 berti_clf_dr_ilha.pdf: 1092178 bytes, checksum: 68a8efc7ddc8d81323b76604a8b8df95 (MD5) / Dentre as espécies que vêm sofrendo interferência antrópica encontra-se a aroeira (Myracrodruon urundeuva Fr. All.). Como estratégias de conservação propostas, destacam-se a ex situ e entre as estratégias para avaliar a variabilidade genética destaca-se a genética quantitativa, onde são estimados parâmetros genéticos para alguns caracteres. As árvores estudadas pertencem a uma população de polinização aberta de Myracroduon urundeuva (F.F. & M.F. Allemão) localizada na rodovia de acesso à cidade de Aquidauana, MS. Este trabalho tem como objetivo quantificar a variação genética para os caracteres bioquímicos, físicos, fisiológicos e nutricionais em sementes de Myracrodruon urundeuva, identificar qual(is) teste(s) mais promissores para a determinação da viabilidade em campo de acordo com os teores dos mesmos e fornecer subsídios para conservação in situ e ex situ de Myracrodruon urundeuva. Foram realizadas análises físicas e fisiológicas (germinação, condutividade elétrica e massa de 100 sementes) e análises dos teores de: carboidratos, lipídios, amido, proteínas (albumina, globulina, prolamina e glutelina) e macronutrientes (N, P, K, Ca, Mg e S) em sementes e obtidas as estimativas de parâmetros genéticos. O conjunto de análises físicas e fisiológicas apresenta-se como o mais apropriado a obter a chance de maior ganho genético por apresentarem os maiores valores de coeficiente de variação relativa, seguidos, respectivamente, de nutricionais e bioquímicos. As médias obtidas para os caracteres bioquímicos foram: albumina (61,34 mg g-1), globulina (10,87 mg g-1), prolamina (58,19 mg g-1), glutelina (289,54 mg g-1), lipídios (21,70 mg g-1), amido (2,61 mg g-1) e carboidratos totais (24,00 mg g-1). Para os caracteres físicos e fisiológicos as médias obtidas foram: condutividade elétrica... / Among the species that have suffered human interference is mastic (Myracrodruon urundeuva Fr. All.). How conservation strategies proposals stand out ex situ and between strategies to assess the genetic variability highlights the quantitative genetics, which are estimated genetic parameters for some characters. The trees studied belong to a population of open-pollinated Myracroduon urundeuva (F.F. & M.F. Allemão) located on the access road to the town of Aquidauna, MS. This study aims to quantify the genetic variation for characters biochemical, physical, physiological and nutritional seeds M. urundeuva identify which one (s) test (s) more promising for the determination of viability in the field according to the levels of the same and provide grants for conservation in situ and ex situ M. urundeuva. Analyses physical and physiological (germination, electric conductivity and weight of 100 seeds) and analysis of the levels of: carbohydrates, lipids, starch, proteins (albumin, globulin, prolamin and glutelin) and macronutrients (N, P, K, Ca, Mg and S) in seeds and obtained estimates of genetic parameters. The set of physical and physiological analysis presents itself as the most appropriate to get the chance of greater genetic gain by presenting the highest values of coefficient of relative variation, followed, respectively, nutritional and biochemical. The mean values of biochemical characters were: albumin (61.34 mg g-1), globulin (10.87 mg g-1), prolamin (58.19 mg g-1), glutelin (289.54 mg g- 1), lipids (21.70 mg g-1), starch (2.61 mg g-1) and total carbohydrates (24.00 mg g-1). For the physical and physiological characters the averages were: electrical conductivity (61.34 mg g-1), weight of 100 seeds (10.87 mg g-1) and germination (58.19 mg g-1). The characters had the following nutrient medium: nitrogen (61.34 mg g-1), phosphorus... (Complete abstract click electronic access below)
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Variação genética para os caracteres fisiológicos, bioquímicos e nutricionais em sementes de uma população base de Myracrodruon urundeuva procedente de Aquidauana-MS /

Berti, Christian Luis Ferreira. January 2013 (has links)
Orientador: Mário Luiz Teixeira de Moraes / Coorientador: Miguel Luiz Menezes Freitas / Banca: Marco Eustaquio de Sá / Banca: Bruno Ettore Pavan / Banca: Marco Antonio Camillo de Carvalho / Banca: Camila Regina Baleroni Recco / Resumo: Dentre as espécies que vêm sofrendo interferência antrópica encontra-se a aroeira (Myracrodruon urundeuva Fr. All.). Como estratégias de conservação propostas, destacam-se a ex situ e entre as estratégias para avaliar a variabilidade genética destaca-se a genética quantitativa, onde são estimados parâmetros genéticos para alguns caracteres. As árvores estudadas pertencem a uma população de polinização aberta de Myracroduon urundeuva (F.F. & M.F. Allemão) localizada na rodovia de acesso à cidade de Aquidauana, MS. Este trabalho tem como objetivo quantificar a variação genética para os caracteres bioquímicos, físicos, fisiológicos e nutricionais em sementes de Myracrodruon urundeuva, identificar qual(is) teste(s) mais promissores para a determinação da viabilidade em campo de acordo com os teores dos mesmos e fornecer subsídios para conservação in situ e ex situ de Myracrodruon urundeuva. Foram realizadas análises físicas e fisiológicas (germinação, condutividade elétrica e massa de 100 sementes) e análises dos teores de: carboidratos, lipídios, amido, proteínas (albumina, globulina, prolamina e glutelina) e macronutrientes (N, P, K, Ca, Mg e S) em sementes e obtidas as estimativas de parâmetros genéticos. O conjunto de análises físicas e fisiológicas apresenta-se como o mais apropriado a obter a chance de maior ganho genético por apresentarem os maiores valores de coeficiente de variação relativa, seguidos, respectivamente, de nutricionais e bioquímicos. As médias obtidas para os caracteres bioquímicos foram: albumina (61,34 mg g-1), globulina (10,87 mg g-1), prolamina (58,19 mg g-1), glutelina (289,54 mg g-1), lipídios (21,70 mg g-1), amido (2,61 mg g-1) e carboidratos totais (24,00 mg g-1). Para os caracteres físicos e fisiológicos as médias obtidas foram: condutividade elétrica... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Among the species that have suffered human interference is mastic (Myracrodruon urundeuva Fr. All.). How conservation strategies proposals stand out ex situ and between strategies to assess the genetic variability highlights the quantitative genetics, which are estimated genetic parameters for some characters. The trees studied belong to a population of open-pollinated Myracroduon urundeuva (F.F. & M.F. Allemão) located on the access road to the town of Aquidauna, MS. This study aims to quantify the genetic variation for characters biochemical, physical, physiological and nutritional seeds M. urundeuva identify which one (s) test (s) more promising for the determination of viability in the field according to the levels of the same and provide grants for conservation in situ and ex situ M. urundeuva. Analyses physical and physiological (germination, electric conductivity and weight of 100 seeds) and analysis of the levels of: carbohydrates, lipids, starch, proteins (albumin, globulin, prolamin and glutelin) and macronutrients (N, P, K, Ca, Mg and S) in seeds and obtained estimates of genetic parameters. The set of physical and physiological analysis presents itself as the most appropriate to get the chance of greater genetic gain by presenting the highest values of coefficient of relative variation, followed, respectively, nutritional and biochemical. The mean values of biochemical characters were: albumin (61.34 mg g-1), globulin (10.87 mg g-1), prolamin (58.19 mg g-1), glutelin (289.54 mg g- 1), lipids (21.70 mg g-1), starch (2.61 mg g-1) and total carbohydrates (24.00 mg g-1). For the physical and physiological characters the averages were: electrical conductivity (61.34 mg g-1), weight of 100 seeds (10.87 mg g-1) and germination (58.19 mg g-1). The characters had the following nutrient medium: nitrogen (61.34 mg g-1), phosphorus... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Modelos de fragilidade com aplicações em analise de ligação

Carvalho, Benilton de Sá, 1979- 03 August 2018 (has links)
Orientador : Hildete Prisco Pinheiro / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-08-03T04:59:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carvalho_BeniltondeSa_M.pdf: 474587 bytes, checksum: a36675e0b9caba0eb2ecc12ecde9c758 (MD5) Previous issue date: 2003 / Mestrado / Mestre em Estatística
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Diversidade entre e dentro de populações simuladas sob deriva genética / Diversity among and within populations under simulated genetic drift

Sánchez, Carlos Felipe Barrera 15 December 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 570177 bytes, checksum: d71e9d24e3e0eda58b4a211dd8553b04 (MD5) Previous issue date: 2008-12-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The effect of genetic drift on populations has been the subject of many studies due to a reduction in the effective population size. It may seem that the case has only effect on the genetic composition of populations. Meanwhile, a random sampling of gametes in small populations has significant consequences for the conservation of genetic diversity, as the loss of genetic diversity and fixation of alleles within the population. Genetic diversity is fundamental to the evolution. The natural selection operates between the variations within populations to adjust to the environment, providing variation among populations and, finally, variation among species. Thus, the higher the genetic variability exists in the population, the greater the chances of exploitation by breeders in their work. The maintenance of genetic variability in populations is the basis for the conservation of species and hence the description and study of the effect of genetic drift which appears on it, is reason for the search. Thus, the research aimed to analyze the effect of genetic drift on the genetic diversity of different populations. For that were generated and analyzed data from the simulation of populations. One of the key factors to evaluate the effect of genetic drift is the size of populations to be worked. To study and acquisition of genetic differentiation within and between populations under the effect of genetic drift, 4000 were simulated populations originated from molecular markers co- dominant. The samples were generated, 20, 50, 100 and 200 individuals with 100 sub-populations subjected to 10 generations of random mating with emphasis on 10 loci. The populations were evaluated with different indices of genetic diversity between and within: heterozygosity and inbreeding, Distance Shannon - Wiener (1978), Index of diversity of Nei (1973), Index of Fixing Wright (1951, 1978), heterozygosity for Weir (1996), Analysis of molecular variance (AMOVA) of Excoffier, et al., (1992). We conclude that the effect of genetic drift by changing the gene frequency depends on the size of the population. The lower the population, most obvious are the effects of random sampling, the statistics GST, FST and oST increase their value to the advancement of generations, a result of loss of genetic variation within and genetic divergence among populations. / O efeito da deriva genética sobre as populações de pequenos tamanhos tem sido objeto de diversos estudos, apresentando efeito sobre a composição genética das populações. A amostragem dos gametas ao acaso dentro de pequenas populações com perda de diversidade genética e fixação de alelos, tem conseqüências de grande significado para a conservação da diversidade genética e das espécies. A diversidade genética é fundamental para que ocorra a evolução. A seleção natural atua entre as variantes dentro das populações em relação à adaptação ao ambiente, proporcionando variação entre populações e, por fim, variação entre espécies. A manutenção da variabilidade genética em populações é a base da conservação de espécies e, portanto, a descrição e o estudo do efeito da deriva genética sobre as populações se tornam de grande importância. Deste modo, o objetivo deste trabalho foi analisar o efeito da deriva genética sobre a diversidade genética de diferentes populações simuladas de diferentes tamanhos. Para o estudo da diferenciação genética dentro e entre populações sujeitas ao efeito da deriva genética, foram simuladas 4000 populações originadas de marcas moleculares co-dominantes. As amostras geradas foram de 20, 50, 100 e 200 indivíduos com 100 subpopulações submetidas a 10 gerações de acasalamento ao acaso com base em 10 locos. As populações foram avaliadas por meio dos seguintes índices de diversidade genética entre e dentro: Endogamia e Heterozigosidade, Distância Shannon Wiener (1978), Índice de diversidade de Nei (1973), Índice de Fixação de Wright (1951, 1978), Heterozigosidade de Weir (1996), Análise de variância molecular (AMOVA) de Excoffier, et al., (1992). Conclui-se que o efeito da deriva genética alterando a freqüência gênica depende do tamanho da população. Quanto menor a população, maiores são os efeitos da amostragem, evidenciados pelas estatísticas GST, FST e oST, que aumentam seu valor com o avanço das gerações, indicando perda de variação genética dentro e aumento da divergência genética entre as populações.
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Golias: software para análises estatística e biométrica de grande conjunto de dados utilizando as linguagens Júlia e R / Golias: software for statistical and biometric analysis of a large dataset using the languages Julia and R

Oliveira, Cristiano Ferreira de 21 February 2018 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2018-07-10T20:14:54Z No. of bitstreams: 1 textocompleto.pdf: 660296 bytes, checksum: 3ddfa0bd00c9a41014d5aa9058baa8be (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-10T20:14:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 textocompleto.pdf: 660296 bytes, checksum: 3ddfa0bd00c9a41014d5aa9058baa8be (MD5) Previous issue date: 2018-02-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A utilização de informações de marcadores moleculares para identificação de indivíduos geneticamente superiores para características de interesse é uma as principais contribuições da genética molecular no melhoramento genético. Assim, em programas de melhoramento genético, é crescente o uso de marcadores moleculares dispostos em matrizes de alta densidade, que necessitam de controle de qualidade e uso de metodologias adequadas para realizar a predição dos valores genéticos. Diante do exposto este trabalho tem como objetivo apresentar o software Golias, que é um software livre destinado ao processamento de dados de marcadores SNPs de alta dimensão. O Golias é integrado com os ambientes de programação R e Julia, utilizando o poder de processamento da linguagem Júlia e de pacotes do R otimizados em código C. Todas as análises são realizadas sem fazer necessário que o usuário tenha qualquer conhecimento em programação. O software proposto dispõe de procedimentos para o controle de qualidade de SNPs como call rate, MAF, teste de equilíbrio de Hardy-Weinberg, descarte de variáveis via componentes principais, um procedimento para imputação de informações genotípicas perdidas e algumas técnicas de predição utilizando métodos bayesianos. O Golias está disponível em português; pode ser baixado da Internet (https://www.dropbox.com/sh/ql92mzjed8735wq/AADfVadXY3oYM_3qe84Vb N-Ea?dl=0) e é compatível com sistema operacional Windows. / The use of molecular marker information to identify genetically superior individuals for traits of interest is one of the main contributions of genomic selection in breeding. Thus, in genetic breeding programs is increasing the use of molecular markers arranged in high density matrices which require quality control and the use of appropriate methodologies to predict genetic values. The work aims to present the Golias software that is a free software for processing data from high- size SNPs. Golias is integrated with the R and Julia programming environments, using the processing power of the Júlia language and R-optimized C-packets. All analyzes are performed without making it necessary for the user to have any programming knowledge. The proposed software has procedures for quality control of SNPs such as call rate, MAF, Hardy-Weinberg equilibrium test, variables discarding via principal components, a procedure for imputation of lost genotype information and some prediction techniques using Bayesian methods. Golias is available in Portuguese; can be downloaded from the Internet (https://www.dropbox.com/sh/ql92mzjed8735wq/AADfVadXY3oYM_3qe84Vb N-Ea?dl=0) and is compatible with Windows operating system.
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Interação genótipo x ambiente em progênies de Cordia trichotoma (Vell.) Arráb. ex Steud. e Dalbergia nigra (Vell.) Allemão ex Benth em sistema de plantio misto /

Santos, Wanderley dos. January 2018 (has links)
Orientador: Ananda Virginia de Aguiar / Resumo: As espécies nativas podem ser utilizadas para diversos usos em sistemas de produção, bem como para recuperação ambiental. Porém, poucas dessas espécies são exploradas economicamente devida à falta de oferta de sementes com qualidade genética no mercado. De maneira geral, a caracterização genética de populações e a seleção de indivíduos mais produtivos a partir de testes de progênies é a primeira etapa do processo para obtenção de indivíduos mais produtivos para sistemas de produção. Assim, os objetivos desse trabalho foram estimar a variação e a divergência genética, as relações genéticas e fenotípicas entre os caracteres quantitativos, bem como a interação genótipo x ambiente de testes de progênies de polinização aberta de Cordia trichotoma e Dalbergia nigra. As avaliações foram realizadas durante os quatro primeiros anos após o plantio. Os caracteres avaliados foram: diâmetro do coleto a 30 cm do solo, diâmetro a altura do peito 1,30 m do solo, altura total das plantas, altura do primeiro verticilo e sobrevivência. Para a estimativa dos componentes de variância e das análises multivariadas utilizou-se o método REML/BLUP (Melhor predição linear não viciada/máxima verossimilhança restrita). As análises foram realizadas entre as progênies da mesma espécie. Dois testes de progênies de C. trichotoma e D. nigra, em sistema de consórcio, foram instalados em 2012 na empresa Vale Rio Doce, em Linhares-ESpirito Santo, em duas áreas, em duas textura de solos. O delineamento experiment... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Native species can be used for various purposes in production systems, as well as for environmental recovery. However, few of these species are economically exploited due to the lack of genetic quality of seeds in the marketplace. In general, the genetic characterization of populations and the selection of more productive individuals from progeny tests are the first stage of the process to obtain more productive individuals for production systems. The objectives of this work were to estimate the variation and genetic divergence, identify the genetic and phenotypic relationships among the quantitative traits, as well as analyze the genotype x environment interaction of open pollinated progenies of Cordia trichotoma and Dalbergia nigra. The assessments were conducted during the first four years after planting. The evaluation traits were: collection diameter at 30 cm from the soil, diameter at 1.30 m from the soil, total height of the plants, height of first whorl and survival. To estimate the components of variance and multivariate analyzes, the REML/BLUP method (Restricted Maximum Likelihood/Best Linear Unbiased Prediction) was used. The analyses were carried out among the progenies of the same species. The two progenies of Cordia trichotoma and Dalbergia nigra, in a consortium system, were installed in 2012 at Vale Rio Doce, in the municipality of Linhares, Espirito Santo, in two areas, using two distinct soils. The experimental Randomized Complete Block design (RCB) were div... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Diversidade genética em populações de Myracrodruon urundeuva (F.F. & M.F. Allemão) utilizando caracteres quantitativos

Canuto, Daniela Sílvia de Oliveira [UNESP] 29 January 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-01-29Bitstream added on 2014-06-13T21:07:44Z : No. of bitstreams: 1 canuto_dso_dr_ilha.pdf: 546568 bytes, checksum: 277ddfa04a5cb5726a68fcc227b176bd (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A aroeira Myracrodruon urundeuva (F.F. & M.F. Allemão) é conhecida pela extraordinária durabilidade e resistência de sua madeira, possui reconhecido valor econômico e apresenta diversas aplicações, entre elas, a confecção de esteios, postes moirões e dormentes, extração de tanino e bálsamo. Seis populações da espécie estão sendo conservadas ex situ em delineamentos experimentais na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da FEIS/UNESP, em Selvíria-MS, onde se pretende ampliar a base genética, recombinar a variabilidade genética e produzir sementes para reflorestamentos. Das seis populações duas são procedentes de área com pouca perturbação antrópica: Estação Ecológica do Instituto Florestal em Paulo de Faria-SP e Estação Ecológica do Seridó em Serra Negra do Norte-RN. As outras quatro são de área com forte perturbação antrópica: Bauru-SP, Itarumã-GO, Petrolina-PE e Selvíria-MS. Dessa forma, foram avaliados nove testes de progênies de M. urundeuva para caracteres quantitativos empregando-se a metodologia REML/BLUP (máxima verossimilhança restrita / melhor predição linear não viciada), assumindo que as progênies são parentes no grau de meios-irmãos e a metodologia MHPRVG para a análise de adaptabilidade e estabilidade nos testes de progênies provenientes da Estação Ecológica de Paulo de Faria em quatro sistemas de plantio (ambientes) diferentes. Este trabalho permitiu estudar os caracteres de desenvolvimento silvicultura nos testes de progênies, a variabilidade genética, o ganho de seleção a partir do Índice Multiefeito, a propagação sexuada e assexuada, a sobreposição de geração e a estabilidade e adaptabilidade das progênies de M. urundeuva. Verificou-se que as progênies de M. urundeuva em relação aos caracteres silviculturais analisados: altura total, diâmetro médio da copa (DMC), diâmetro à altura do peito (DAP)... / The aroeira Myracrodruon urundeuva (F.F. & M.F. Allemão) has been known for the extraordinary durability and resistance of its wood, it has recognized economic value and presents several uses, as for, posts, and sleepers, tannin extraction, and balm. Six populations of the species has been conserved by ex situ design in Experimental Station of Education, Research, and Extension of FEIS/UNESP, in Selvíria-MS Brazil, where to intend to enlarge the genetic base, mix up the genetic variability and to produce seeds for reforestations. Two out of six populations are coming from sites with little anthopic disturbance: Ecological Station of the Instituto Forestal in Paulo de Faria-SP, Brazil and Ecological Station of Seridó in Serra Negra- RN, Brazil. The others four are from sites with large anthopic disturbance: Bauru-SP, Itarumã-GO, Petrolina-PE and Selvíria-bad. In that way, were evaluated nine progeny trial of M. urundeuva to study the traits using the methodology of REML/BLUP (máxima verossimilhança restrita/melhor predição linear não viciada), stating that the are half site and the MHPRVG methodology for the adaptability and stability analyses by trials from Ecological Station of Instituto Florestal of Paulo de Faria by four different plantation systems (atmospheres). This research to study the traits of development forestation in the progeny trials, the genetic variability, the selection gain starting by Index Multi-effects´, the propagation sexual and assexual, Superiority of elite trees in relationship of the progenies and the stability and adaptability of the progenies of M. urundeuva. Verified that the progenies of M. urundeuva in relation to the traits analyzed silviculturais: total height, medium diameter of the cup (DMC), diameter to the height of the chest (DAP) they had a satisfactory development, and the progenies originating from of the Ecological Station... (Complete abstract click electronic access below)
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Emprego do BLUP/REML na avaliação genética de linhagens elites de milho-pipoca / The use of BLUP/REML for genetic evaluation of popcorn elite lines

Valente, Mágno Sávio Ferreira 24 February 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 836731 bytes, checksum: 1e5b214c3c6014a5c95797b0c455ae73 (MD5) Previous issue date: 2010-02-24 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / In breeding programs, it is important to use viable alternatives to reduce cost and time spent on population evaluations, combined with adequate statistical methodologies applying the maximum information available. Within this context, this work aimed to: i) study the genetic control of popping capacity and grain yield in popcorn; ii) predict the effects of general combining ability (GCA) and specific combining ability (SCA), applying mixed model analysis; iii) evaluate the performance per se of the lines used in hybrid crosses; and iv) evaluate the efficiency of Best Linear Unbiased-Prediction (BLUP) in predicting the performance of non crossed hybrids in diallelic analysis. Data from experiment evaluations of intra-population diallels of the Beija-Flor and Viçosa popcorn populations were used in the analyses. Eighteen S6 Beija-Flor elite lines were analyzed in ten environments and 29 S6 Viçosa elite lines in eight environments. Combined analyses were carried out, considering all the environments, with the additive model being adopted. The software ASREML was used in all analyses. GCA variability was verified both for grain yield and popping capacity. A significant SCA variability was verified in Beija-Flor for the two variables. In Viçosa, SCA was significant at 8% for grain yield while for popping capacity, the presence of additive effects was practically verified in its expression. Through the incorporation of sibling relationships in diallelic analysis, SCA values of combination of a line with itself (sjj) were predicted, without such cross being carried out. The use of BLUP/REML allowed the prediction of over 43 to 210% hybrid combinations, if compared only to the hybrid observed. Based on hybrid predictions, promising crosses were identified both for grain yield and popping capacity, being observed that the inclusion of a pedigree seems to make the analyses more accurate, as compared to the model not using this information. The performance per se and under S6 family crosses showed moderate correlations (r = 0.53) for popping capacity, showing that families with high popping capacity GCA can be selected, based on their performance per se. Aiming to obtain information on the efficiency in predicting S6 families based on performance per se and on S3 family crosses, a positive correlation (r = 0.76) was found for production between the GCA of top cross hybrids of the S3 families and the S6.family hybrids. When verifying BLUP efficiency in the prediction of non crossed hybrids, moderate to high Pearson and Spearman correlations were found among the predicted and observed values. Prediction of hybrids in the absence of dominance (popping capacity, r = 0.88) was more efficient than in the presence of dominance (grain yield, r = 0.53). The overall results showed that the use of mixed models is an efficient alternative in diallelic analysis, providing good precision in estimating genetic parameters, besides allowing the prediction of non crossed hybrids. / Em programas de melhoramento é importante o uso de alternativas viáveis para redução de custos e tempo nas avaliações de populações, aliadas ao uso de metodologias estatísticas adequadas, que aproveitem ao máximo as informações disponíveis. Neste contexto, o presente trabalho teve como objetivos: i) estudar o controle genético da capacidade de expansão e produção de grãos em milho-pipoca; ii) predizer os efeitos da capacidade geral de combinação (CGC) e da capacidade específica de combinação (CEC) por meio da análise de modelos mistos; iii) avaliar o desempenho per se das linhagens utilizadas nos cruzamentos híbridos; iv) avaliar a eficiência do BLUP na predição do desempenho de híbridos não realizados na análise dialélica. Nas análises, foram utilizados dados de experimentos de avaliação de dialelos intrapopulacionais das populações de milho-pipoca Beija-Flor e Viçosa. Foram analisadas 18 linhagens elites S6 de Beija-Flor, em 10 ambientes, e 29 linhagens elites S6 de Viçosa, em 8 ambientes. Foram realizadas análises conjuntas, considerando todos os ambientes, sendo adotado o modelo aditivo-dominante. Em todas as análises foi utilizado o software ASREML. Foi verificada variabilidade para CGC tanto para produção como para capacidade de expansão. Para CEC houve variabilidade significativa em Beija-Flor para as duas variáveis. Em Viçosa, a CEC foi significativa a 8% para produção de grãos, enquanto para capacidade de expansão foi verificada praticamente a presença de efeitos aditivos na sua expressão. Por meio da incorporação de informações de parentesco na análise dialélica, valores de capacidade específica de combinação de uma linhagem com ela mesma (sjj) foram preditos, sem que este cruzamento tenha sido realizado. Com o uso do BLUP/REML foi possível predizer de 43% a 210% a mais de combinações híbridas, se comparada somente aos híbridos observados. A partir das predições dos híbridos, cruzamentos promissores foram identificados tanto para produção de grãos como para capacidade de expansão, sendo que a inclusão do pedigree parece deixar as análises mais acuradas, em comparação ao modelo sem uso destas informações. O desempenho per se e em cruzamento de famílias S6 evidenciaram correlações moderadas (r=0,53) para capacidade de expansão, mostrando ser possível selecionar famílias com alta CGC em capacidade de expansão a partir do desempenho per se de suas famílias. Visando obter informações sobre a eficiência da predição de famílias S6 a partir do desempenho per se e em cruzamento de famílias S3, foi encontrada correlação positiva (r=0,76) para produção, entre a CGC dos híbridos topcross de famílias S3 e híbridos de famílias S6. Ao verificar a eficiência do BLUP na predição de híbridos não realizados, foram encontradas correlações de Pearson e Spearman de moderada a elevadas, entre os valores preditos e observados. A predição de híbridos não realizados na ausência de dominância (capacidade de expansão, r=0,88) foi mais eficiente, em comparação à presença de dominância (produção de grãos, r=0,53). Os resultados gerais demonstraram que o uso de modelos mistos é uma alternativa eficiente na análise dialélica, proporcionando boa precisão nas estimações dos parâmetros genéticos, além de permitir a previsão de cruzamentos não realizados.
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Potencial de caracteres para avaliação da arquitetura de plantas de feijão / Potential characters for evaluating the architecture of bean plants

Moura, Monique Maculan 18 February 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 670022 bytes, checksum: 545da53bb28a3a29eb0f499873a94613 (MD5) Previous issue date: 2011-02-18 / The bean breeding aiming to produce more upright architecture plants comes growing in importance based on four main objectives: to attend the demand of the producer of irrigated areas in relation to the possibility of mechanical harvesting; to attenuate the problems of diseases caused by soil fungi, especially the white mold; to facilitate the cultural practices and reduce the risks of cultivation in the rainy season. Currently, a grading scale is being used to evaluate the architecture of plant bean, however, this scale is subjective, demands hard work and relies an extensive experience of the evaluator. Therefore, it is important for bean breeding programs to identify characters with the potential to support or even replace, the assessment of plant architecture by notes, seeking greater efficiency in the selection of upright plants. Aiming to identify effective indicators of plant architecture, thirty-six bean lines were evaluated for key traits related to plant architecture and agronomic traits in two seasons, winter of 2007 and winter of 2009. The experiments were conducted in a randomized block design with three repetition at Coimbra’s Experimental Station, belonging to the Department of Plant Science, Universidade Federal de Viçosa. It was observed that more erect plants had a higher cycle, higher at harvest time, smaller insertion angle of branches, epicotyl and hypocotyls with larger diameter, higher height of first pod, pods concentrated on the main stem and a greater number of internodes on the main stem. By path analysis, it was observed that the insertion angle of branches, plant height at harvest and the diameter of the hypocotyl were the main determinants of character architecture of bean plants. Hypocotyl diameter showed a strong association of cause and effect with note plant architecture, high accuracy and precision in its evaluation and ease of evaluation. Moreover, its evaluation is not subjective, can be taken for individual plants within plots, the evaluation can be done after harvest and requires only six measures to access the genotypic value of lineages. Thus, the diameter of the hypocotyl stood out as an effective indicator of the bean plant architecture. / O melhoramento do feijoeiro visando à obtenção de plantas de arquitetura mais ereta vem crescendo em importância com base em quatro objetivos principais: atender à demanda do produtor de áreas irrigadas com relação à possibilidade de colheita mecânica; atenuar os problemas de doenças causadas por fungos de solo, especialmente o mofo-branco; facilitar os tratos culturais e reduzir os riscos do cultivo na safra das águas. Atualmente vem-se utilizando o emprego de uma escala de notas para avaliar a arquitetura de plantas de feijão, porém, essa escala é subjetiva, trabalhosa e depende de grande experiência do avaliador. Assim, é de importância para os programas de melhoramento do feijoeiro a identificação de caracteres com potencial para subsidiar, ou até mesmo substituir, a avaliação da arquitetura de plantas por notas, visando maior eficiência na seleção de plantas de porte ereto. Com o objetivo de identificar indicadores efetivos da arquitetura de plantas, trinta e seis linhagens de feijoeiro foram avaliadas quanto aos principais caracteres relacionados à arquitetura de plantas e caracteres agronômicos em duas safras, inverno de 2007 e inverno de 2009. Os experimentos foram conduzidos em blocos casualizados, com três repetições, na Estação Experimental de Coimbra, pertencente ao departamento de Fitotecnia da Universidade Federal de Viçosa. Observou-se que plantas mais eretas apresentaram maior ciclo, maior altura na colheita, menor ângulo de inserção dos ramos, epicótilo e hipocótilo com maior diâmetro, maior altura de inserção da primeira vagem, vagens concentradas na haste principal e maior número de entrenós na haste principal. Pela análise de trilha, observou-se que o ângulo de inserção dos ramos, a altura das plantas na colheita e o diâmetro do hipocótilo foram os principais caracteres determinantes da arquitetura de plantas do feijoeiro. O diâmetro do hipocótilo apresentou elevada associação de causa e efeito com nota de arquitetura de planta, elevada acurácia e precisão em sua avaliação e maior facilidade de avaliação. Ademais, sua avaliação não é subjetiva e podem ser tomadas medidas de plantas individuais dentro da parcela, bem como a avaliação pode ser realizada após a colheita e são necessárias apenas seis medidas para acessar o valor genotípico de linhagens. Assim, o diâmetro do hipocótilo se destacou como indicador efetivo da arquitetura de plantas do feijoeiro.

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