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Ocorrência de anticorpos e caracterização genotípica de isolados de Toxoplasma gondii em pombos (Zenaida auriculata) de vida livre capturados em Londrina, Paraná

Barros, Luiz Daniel de [UNESP] 01 March 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-03-01Bitstream added on 2014-06-13T19:55:39Z : No. of bitstreams: 1 barros_ld_me_jabo.pdf: 316486 bytes, checksum: 47f0ed48430e97c60257700b27571deb (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O presente trabalho teve como objetivos determinar a soro-ocorrência de anticorpos, isolar e caracterizar geneticamente T. gondii de pombos Zenaida auriculata de vida livre do município de Londrina, Paraná. Foram capturados 206 pombos da espécie Z. auriculata utilizando armadilhas tipo arapuca, em três regiões do município de Londrina, dentre elas o campus universitário, zona urbana e rural. Após a eutanásia em câmara de CO2, realizou-se a punção cardíaca de cada animal para a colheita de sangue e obtenção de soro para a pesquisa de IgG anti-T. gondii pelo Teste de Aglutinação Modificado (MAT). Em seguida foi realizada a necropsia para a colheita de tecidos (pulmão, coração, fígado, cérebro e músculo peitoral) para o isolamento do agente por meio do bioensaio em camundongos. Os isolados obtidos foram caracterizados por meio da PCR-RFLP utilizando 12 marcadores genéticos. Os resultados foram comparados e classificados de acordo com os genótipos presentes no ToxoDB (http://toxodb.org/toxo/). No MAT, 22,3% (46/206) das amostras foram consideradas soropositivas, com títulos variando de 16 até 4096. A soro-ocorrência de acordo com a região de captura foi de 56%, 12,1% e 6,2% para campus universitário, zona urbana e zona rural respectivamente (p<0,05). Doze (5,8%) animais foram positivos no bioensaio, obtendo-se os isolados Pb01, Pb06, Pb12, Pb13, Pb14, Pb36, Pb150, Pb153, Pb155, Pb164, Pb185 e Pb200. A análise genotípica revelou a presença de sete genótipos, quatro dos quais se classificam como genótipos #1, #6, #17 e #65 do ToxoDB e três não descritos anteriormente. O trabalho é o primeiro relato na literatura de isolamento do parasita em pombos Z. auriculata, além disso, foi observado o tipo clonal II, genótipo raro no Brasil, confirmando a diversidade genética dos isolados de T. gondii no Brasil / This study aimed to evaluate the serum occurrence of anti-Toxoplasma gondii antibodies, isolate and genetically characterize this parasite from 206 wildlife pigeons (Zenaida auriculata) trap captured in Londrina city, Paraná. The birds were captured in three regions of Londrina, among them college campus, the urban and rural area. After euthanasia by CO2 chamber, the animals were bleeding by cardiac puncture, after what the serum was obtained. Lung, heart, liver, brain and pectoral muscle were collected from pigeons to performer mouse bioassay. Detection of IgG anti-T. gondii was performed by modified agglutination test (MAT). The isolates were molecularly characterized by PCR-RFLP using 12 genetic markers and the results were compared and ranked according the genotypes present in ToxoDB (http://toxodb.org/toxo/). Through MAT, 22,3% (26/206) of samples were considered positive, with titers ranging from 16 to 4096. The infection rate according to the capture region was 56%, 12,1% and 6,2% for university campus, urban and rural areas respectively. Twelve (5,8%) animals were positive in the bioassay, obtaining the isolates Pb01, Pb06, Pb12, Pb13, Pb14, Pb36, Pb150, Pb153, Pb155, Pb164, Pb185 and Pb200. Genotypic analysis revealed the presence of seven different ones, genotypes #1, #6, #17 and #65, and three not previously described. This study is the first report of isolation of the parasite in pigeons Z. auriculata. Furthermore, was observed the clonal type II, genotype rare in Brazil, confirming the genetic diversity of isolates of T. gondii in Brazil
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Ocorrência de anticorpos e caracterização genotípica de isolados de Toxoplasma gondii em pombos (Zenaida auriculata) de vida livre capturados em Londrina, Paraná /

Barros, Luiz Daniel de. January 2012 (has links)
Orientador: Rosangela Zacarias Machado / Coorientador: João Luis Garcia / Banca: Aramis Augusto Pinto / Banca: Odilon Vidotto / Resumo: O presente trabalho teve como objetivos determinar a soro-ocorrência de anticorpos, isolar e caracterizar geneticamente T. gondii de pombos Zenaida auriculata de vida livre do município de Londrina, Paraná. Foram capturados 206 pombos da espécie Z. auriculata utilizando armadilhas tipo arapuca, em três regiões do município de Londrina, dentre elas o campus universitário, zona urbana e rural. Após a eutanásia em câmara de CO2, realizou-se a punção cardíaca de cada animal para a colheita de sangue e obtenção de soro para a pesquisa de IgG anti-T. gondii pelo Teste de Aglutinação Modificado (MAT). Em seguida foi realizada a necropsia para a colheita de tecidos (pulmão, coração, fígado, cérebro e músculo peitoral) para o isolamento do agente por meio do bioensaio em camundongos. Os isolados obtidos foram caracterizados por meio da PCR-RFLP utilizando 12 marcadores genéticos. Os resultados foram comparados e classificados de acordo com os genótipos presentes no ToxoDB (http://toxodb.org/toxo/). No MAT, 22,3% (46/206) das amostras foram consideradas soropositivas, com títulos variando de 16 até 4096. A soro-ocorrência de acordo com a região de captura foi de 56%, 12,1% e 6,2% para campus universitário, zona urbana e zona rural respectivamente (p<0,05). Doze (5,8%) animais foram positivos no bioensaio, obtendo-se os isolados Pb01, Pb06, Pb12, Pb13, Pb14, Pb36, Pb150, Pb153, Pb155, Pb164, Pb185 e Pb200. A análise genotípica revelou a presença de sete genótipos, quatro dos quais se classificam como genótipos #1, #6, #17 e #65 do ToxoDB e três não descritos anteriormente. O trabalho é o primeiro relato na literatura de isolamento do parasita em pombos Z. auriculata, além disso, foi observado o tipo clonal II, genótipo raro no Brasil, confirmando a diversidade genética dos isolados de T. gondii no Brasil / Abstract: This study aimed to evaluate the serum occurrence of anti-Toxoplasma gondii antibodies, isolate and genetically characterize this parasite from 206 wildlife pigeons (Zenaida auriculata) trap captured in Londrina city, Paraná. The birds were captured in three regions of Londrina, among them college campus, the urban and rural area. After euthanasia by CO2 chamber, the animals were bleeding by cardiac puncture, after what the serum was obtained. Lung, heart, liver, brain and pectoral muscle were collected from pigeons to performer mouse bioassay. Detection of IgG anti-T. gondii was performed by modified agglutination test (MAT). The isolates were molecularly characterized by PCR-RFLP using 12 genetic markers and the results were compared and ranked according the genotypes present in ToxoDB (http://toxodb.org/toxo/). Through MAT, 22,3% (26/206) of samples were considered positive, with titers ranging from 16 to 4096. The infection rate according to the capture region was 56%, 12,1% and 6,2% for university campus, urban and rural areas respectively. Twelve (5,8%) animals were positive in the bioassay, obtaining the isolates Pb01, Pb06, Pb12, Pb13, Pb14, Pb36, Pb150, Pb153, Pb155, Pb164, Pb185 and Pb200. Genotypic analysis revealed the presence of seven different ones, genotypes #1, #6, #17 and #65, and three not previously described. This study is the first report of isolation of the parasite in pigeons Z. auriculata. Furthermore, was observed the clonal type II, genotype rare in Brazil, confirming the genetic diversity of isolates of T. gondii in Brazil / Mestre
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Estudo de associação genômica e análise de enriquecimento genético da criotolerância espermática em bovinos da raça Nelore

Carmo, Adriana Santana do [UNESP] 23 February 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:10Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-23Bitstream added on 2014-06-13T19:45:06Z : No. of bitstreams: 1 carmo_as_dr_jabo.pdf: 750695 bytes, checksum: badd16ed8cd1277688580dd61ee13af8 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Estudo de Associação Genômica (GWAS - Genome Wide Association Study) foi conduzido para identificar regiões cromossômicas relacionadas à capacidade de criotolerância espermática em bovinos da raça Nelore, empregando os fenótipos: diferença entre a motilidade do sêmen fresco e descongelado (DMD) e diferença entre a motilidade do sêmen fresco e pós-teste de termo-resistência (DMT), com o intuito de compreender melhor os fenômenos que regem tal característica. O perfil de SNP (SNP - Single Nucleotide Polymorphism) de cento e vinte e cinco touros foi determinado com o auxílio de micro-arranjo de alta densidade de SNP (BovineHD Illumina®). As estimativas dos valores genéticos dos touros (EBV - Estimated Breeding Value) (Experimento 1) e as médias das medidas fenotípicas (Experimento 2) foram calculadas para as características em questão. As metodologias estatísticas GRAMMAR e EIGENSTRAT foram utilizadas para a realização do teste de associação fenótipo / genótipo após procedimento de controle de qualidade dos dados. A análise de enriquecimento funcional foi realizada com auxílio do software DAVID. Essa análise apontou a família de genes Serpina (inibidores de proteases), reguladores de cAMP e componentes do citoesqueleto celular como o grupo de genes que apresentam maior importância funcional para as características avaliadas. Todas as metodologias testadas demonstraram-se capazes de identificar regiões genômicas associadas aos fenótipos DMD e DMT, destacando-se os cromossomos 1, 16 e 19 / Genome Wide Association Study (GWAS) was performed in order to identify chromosomal regions related to sperm cryotolerance capacity in Nellore cattle for the phenotypes: difference between fresh and post-thaw semen motility (DMD) and difference between fresh and post thermal resistance test semen motility (DMT), aiming to better understand the phenomena governing this characteristic. SNP (Single Nucleotide Polymorphism) profile of one hundred and twenty five Nellore bulls were determined using high density SNP chip (BovineHD Illumina®). Estimated Breeding Values - EBV (Experiment 1) and phenotypic measures means (Experiment 2) were calculated for the evaluated traits. The statistical methodologies GRAMMAR and EIGENSTRAT were used to test the phenotype / genotype association after data quality control. Functional enrichment analysis was performed using DAVID software. These analyses pointed out to Serpine (protease inhibitor), cAMP metabolism control and cytoeskeletal components gene families as the most important functional gene groups for the evaluated traits. All the methods tested shown to be able to identify genomic regions associated with phenotypes DMD and DMT, especially chromosomes 1, 16 and 19
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Parâmetros genéticos para produção de leite e características lineares de tipo em vacas leiteiras de alta produção e da população de vacas do estado do Paraná

Buzzo, Álida Mariana dos Reis January 2016 (has links)
Orientador : Prof. Dr. Rodrigo de Almeida Teixeira / Co-orientadora : Profª. Drª. Laila Talarico Dias / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Zootecnia. Defesa: Curitiba, 28/03/2016 / Inclui referências : f. 51-57 / Área de concentração : Meio ambiente, melhoramento e modelagem animal / Resumo: As características lineares de tipo (CLT) têm potencial para serem utilizadas para identificar vacas com potencial para altas produções ao longo da vida produtivada vaca. O objetivo deste trabalho foi estimar os parâmetros genéticos e analisar as relações entre as CLT e os dados de produção ajustados aos 305 dias durante a primeira lactação e com os dados de lactações acumuladas durante toda a vida produtiva da vaca. Foram comparadas duas populações de vacas: um banco de dados da população geral de animais do Estado do Paraná e, um segundo conjunto de dados, correspondente ao grupo de vacas que produziram acima de 35.000 kg de leite na vida produtiva (vacas vitalícias). As informações analisadas são pertencentes ao banco de dados da Associação Paranaense dos Criadores da Raça Holandesa do Paraná, de lactações completas encerradas entre 2000 e 2014. As análises de variância foram realizadas usando-se o programa SAS/STAT versão 9.4e, para estimar valores de herdabilidade e correlações entre os dados de produção etipo utilizou-se o programa MTDFREML. Os valores estimados de herdabilidade para leite, gordura e proteína na primeira lactação foram, respectivamente, 0,34 ± 0,011,0,39 ± 0,011 e 0,24 ± 0,010 para a população geral e, de 0,54 ± 0,027, 0,43 ± 0,028e 0,39 ± 0,025, respectivamente, para as vacas vitalícias. Para a produção acumulada, a herdabilidade para leite, gordura e proteína foram, respectivamente, 0,04 ± 0,005, 0,05 ± 0,005 e 0,05 ± 0,005 para a população geral e 0,10 ± 0,017,0,06 ± 0,015 e 0,11 ± 0,018, respectivamente, para as vacas vitalícias. Para as CLT, a herdabilidade para a população geral variou de 0,06 a 0,39. Para as vacas vitalícias, a herdabilidade variou entre 0,08 a 0,36. O sistema mamário e a garupa são os compostos que vão responder melhor à seleção direta na população de vacas vitalícias. As correlações genéticas entre as 23 CLT e a produção na primeira lactação variaram entre -0,13 a 0,10 na população geral e -0,27 a 0,42 na populaçãode vacas vitalícias, indicando que a população de vacas vitalícias apresentou maior correlação entre produção de leite na primeira lactação e CLT. As correlações genéticas entre as CLT e a produção acumulada variaram entre -0,30 a 0,22 na população geral e -1,00 a 0,30 na população de vacas vitalícias. Fêmeas com melhor escore de angulosidade apresentaram produções mais altas. Palavras-chave: Correlação. Herdabilidade. Longevidade. Produção acumulada.Vaca vitalícia. / Abstract: With the aim of search for linear type traits (LTT) that allow identify cows with potential for high production over the productive life, during the first lactation, production data adjusted to 305 days in first lactation and accumulated lactations inproductive life were used, and also linear type classification data, belonging to the Breeders Association of Holstein Cattle of Paraná, for the period 2000-2014 to estimate heritability and correlations between data production and type. Analyses were performed using SAS / STAT version 9.4 and MTDFREML programs. Analyzes were performed using single-trait and two-trait for LTT and milk production by comparing two populations of cows: cows that produced over 35.000 kg milk in their productive life (lifetime cows) and the general population. The heritability for milk, fatand protein in first lactation were, respectively, 0.34 ± 0.011, 0.39 ± 0.011 and 0.24 ±0.010 for the general population and 0.54 ± 0.027, 0.43 ± 0.028 and 0 , 39 ± 0.025, respectively, for the population of lifetime cows. For the accumulated production, the heritabilities for milk, fat and protein were respectively 0.04 ± 0.005, 0.05 ± 0.005 and 0.05 ± 0.005 for the general population and 0.10 ± 0.017, 0.06 ± 0.015 and 0.11 ±0.018, respectively, for the population of lifetime cows. For LTT, the heritability for the general population ranged from 0.06 to 0.39 and for lifetime cows, heritability ranged from 0.08 to 0.36. The genetic correlations among the 23 LTT and production in the first lactation ranged from -0.13 to 0.10 in the general population and -0.27 to 0.42 in the population of lifetime cows, indicating that the population of lifetime cows presented an increased correlation among milk production in first lactation and LTT.The genetic correlations among LTT and cumulative production traits ranged from -0.30 to 0.22 in the general population and -1.00 to 0.30 in the population of lifetime cows. The mammary system and rump are the compounds that will respond better to direct selection in the population of lifetime cows. For the general population, the mammary system and dairy strength could get a genetic gain by selection. Femaleswith greater angularity, presented higher production. Keywords: Correlation. Heritability. Lifetime production. Longevity.
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Estudo de associação genômica e análise de enriquecimento genético da criotolerância espermática em bovinos da raça Nelore /

Carmo, Adriana Santana do. January 2012 (has links)
Orientador: José Fernando Garcia / Coorientador: Marc Roger Jean Marie Henry / Coorientador: Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da Silva / Coorientador: Vera Fernanda Martins Hossepian de Lima / Banca: Jose Bento Sterman Ferraz / Banca: Heidge Fukumasu / Banca: Roberto Carvalheiro / Banca: Joaquim Mansano Garcia / Resumo: Estudo de Associação Genômica (GWAS - Genome Wide Association Study) foi conduzido para identificar regiões cromossômicas relacionadas à capacidade de criotolerância espermática em bovinos da raça Nelore, empregando os fenótipos: diferença entre a motilidade do sêmen fresco e descongelado (DMD) e diferença entre a motilidade do sêmen fresco e pós-teste de termo-resistência (DMT), com o intuito de compreender melhor os fenômenos que regem tal característica. O perfil de SNP (SNP - Single Nucleotide Polymorphism) de cento e vinte e cinco touros foi determinado com o auxílio de micro-arranjo de alta densidade de SNP (BovineHD Illumina®). As estimativas dos valores genéticos dos touros (EBV - Estimated Breeding Value) (Experimento 1) e as médias das medidas fenotípicas (Experimento 2) foram calculadas para as características em questão. As metodologias estatísticas GRAMMAR e EIGENSTRAT foram utilizadas para a realização do teste de associação fenótipo / genótipo após procedimento de controle de qualidade dos dados. A análise de enriquecimento funcional foi realizada com auxílio do software DAVID. Essa análise apontou a família de genes Serpina (inibidores de proteases), reguladores de cAMP e componentes do citoesqueleto celular como o grupo de genes que apresentam maior importância funcional para as características avaliadas. Todas as metodologias testadas demonstraram-se capazes de identificar regiões genômicas associadas aos fenótipos DMD e DMT, destacando-se os cromossomos 1, 16 e 19 / Abstract: Genome Wide Association Study (GWAS) was performed in order to identify chromosomal regions related to sperm cryotolerance capacity in Nellore cattle for the phenotypes: difference between fresh and post-thaw semen motility (DMD) and difference between fresh and post thermal resistance test semen motility (DMT), aiming to better understand the phenomena governing this characteristic. SNP (Single Nucleotide Polymorphism) profile of one hundred and twenty five Nellore bulls were determined using high density SNP chip (BovineHD Illumina®). Estimated Breeding Values - EBV (Experiment 1) and phenotypic measures means (Experiment 2) were calculated for the evaluated traits. The statistical methodologies GRAMMAR and EIGENSTRAT were used to test the phenotype / genotype association after data quality control. Functional enrichment analysis was performed using DAVID software. These analyses pointed out to Serpine (protease inhibitor), cAMP metabolism control and cytoeskeletal components gene families as the most important functional gene groups for the evaluated traits. All the methods tested shown to be able to identify genomic regions associated with phenotypes DMD and DMT, especially chromosomes 1, 16 and 19 / Doutor
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Modelos genéticos para a produção no dia do controle em bovinos Gir Leiteiro (Bos indicus)

Pereira, Rodrigo Junqueira [UNESP] 27 April 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-04-27Bitstream added on 2014-06-13T20:43:05Z : No. of bitstreams: 1 pereira_rj_dr_jabo.pdf: 607358 bytes, checksum: 1336bea4603875e3ea34e119f6764b26 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Com o objetivo de desenvolver um modelo adequado para a avaliação genética da raça Gir Leiteiro (GL) utilizando-se as produções no dia do controle (PDC), foram analisados registros de controle leiteiro de primeiras lactações de vacas da raça GL e cruzadas com Holandês. Primeiramente, as PDC foram analisadas por modelos multicaracterísticas, onde a produção em cada um dos 10 meses da lactação foi considerada como uma característica diferente. Compararam-se sete modelos: multicaracterísticas padrão, três modelos de posto reduzido ajustando os primeiros 2, 3 ou 4 componentes principais genéticos e três modelos considerando-se uma estrutura de análise fatorial para a matriz de covariâncias genéticas, com 2, 3 ou 4 fatores. Entre os modelos comparados, aquele ajustando os dois primeiros componentes principais foi o melhor de acordo com os critérios de comparação, e diminuiu consideravelmente o número de parâmetros estimados e o tempo gasto para a convergência. Entretanto, ainda assim o número de parâmetros a ser estimado permaneceu grande. Em um segundo estudo, foram comparados modelos de regressão aleatória cujos efeitos genético aditivo e de ambiente permanente foram modelados por polinômios ortogonais de Legendre ou funções Splines lineares. A variância residual foi modelada por 1, 5 ou 10 classes. Cinco classes modelaram as mudanças nas variâncias residuais adequadamente e foram utilizadas na comparação dos modelos. O modelo que utilizou polinômios de Legendre de grau 3 para o efeito genético aditivo e 4 para o de ambiente permanente foi o melhor modelo de acordo com os critérios DIC e BIC. Entretanto, a alta correlação de rank (0,998) entre este modelo e aquele aplicando polinômios de Legendre de grau 3 para os efeitos genético aditivo e de ambiente... / In order to develop a suitable model for genetic evaluation of Dairy Gyr breed (DG) using test-day yields (TD), first lactation TD records from purebred DG and crossbred (DG x Holstein) cows were analyzed. First, the TD were analyzed by multivariate models, where the production in each of the 10 months was considered to be a different trait. The following seven models were compared: standard multivariate model, three reduced rank models fitting the first 2, 3 or 4 genetic principal components, and three models considering a 2-, 3- or 4-factor structure for the genetic covariance matrix. Among the models compared, that one fitting the first two principal components was the best according to the model selection criteria, and markedly reduced the number of parameters estimated and the time spent to reach convergence. However, the number of parameters to be estimated remained high. In a second study, random regression models (RRM) in which additive genetic and permanent environmental effects were modeled using orthogonal Legendre polynomials or linear Spline functions, were compared. Residual variances were modeled considering 1, 5, or 10 classes. Five classes fitted the changes in residual variances adequately and were used for model comparison. According to the DIC and BIC criteria, a model using third-degree and fourth-degree Legendre polynomials for additive genetic and permanent environmental effects, respectively, provided the best fit. However, the high rank correlation (0.998) between this model and that applying third-degree Legendre polynomials for additive genetic and permanent environmental effects, indicates that practically the same bulls would be selected by both models. Therefore, the latter model, which is less parameterized, was used in the other studies components of the thesis. In the following... (Complete abstract click electronic access below)
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Modelos genéticos para a produção no dia do controle em bovinos Gir Leiteiro (Bos indicus) /

Pereira, Rodrigo Junqueira. January 2012 (has links)
Orientador: Lúcia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Rui da Silva Verneque / Coorientador: Lenira El Faro Zadra / Banca: Henrique Nunes Oliveira / Banca: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Banca: Annaiza Braga Bignardi / Banca: Anibal Eugênio Vercesi Filho / Resumo: Com o objetivo de desenvolver um modelo adequado para a avaliação genética da raça Gir Leiteiro (GL) utilizando-se as produções no dia do controle (PDC), foram analisados registros de controle leiteiro de primeiras lactações de vacas da raça GL e cruzadas com Holandês. Primeiramente, as PDC foram analisadas por modelos multicaracterísticas, onde a produção em cada um dos 10 meses da lactação foi considerada como uma característica diferente. Compararam-se sete modelos: multicaracterísticas padrão, três modelos de posto reduzido ajustando os primeiros 2, 3 ou 4 componentes principais genéticos e três modelos considerando-se uma estrutura de análise fatorial para a matriz de covariâncias genéticas, com 2, 3 ou 4 fatores. Entre os modelos comparados, aquele ajustando os dois primeiros componentes principais foi o melhor de acordo com os critérios de comparação, e diminuiu consideravelmente o número de parâmetros estimados e o tempo gasto para a convergência. Entretanto, ainda assim o número de parâmetros a ser estimado permaneceu grande. Em um segundo estudo, foram comparados modelos de regressão aleatória cujos efeitos genético aditivo e de ambiente permanente foram modelados por polinômios ortogonais de Legendre ou funções Splines lineares. A variância residual foi modelada por 1, 5 ou 10 classes. Cinco classes modelaram as mudanças nas variâncias residuais adequadamente e foram utilizadas na comparação dos modelos. O modelo que utilizou polinômios de Legendre de grau 3 para o efeito genético aditivo e 4 para o de ambiente permanente foi o melhor modelo de acordo com os critérios DIC e BIC. Entretanto, a alta correlação de rank (0,998) entre este modelo e aquele aplicando polinômios de Legendre de grau 3 para os efeitos genético aditivo e de ambiente... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In order to develop a suitable model for genetic evaluation of Dairy Gyr breed (DG) using test-day yields (TD), first lactation TD records from purebred DG and crossbred (DG x Holstein) cows were analyzed. First, the TD were analyzed by multivariate models, where the production in each of the 10 months was considered to be a different trait. The following seven models were compared: standard multivariate model, three reduced rank models fitting the first 2, 3 or 4 genetic principal components, and three models considering a 2-, 3- or 4-factor structure for the genetic covariance matrix. Among the models compared, that one fitting the first two principal components was the best according to the model selection criteria, and markedly reduced the number of parameters estimated and the time spent to reach convergence. However, the number of parameters to be estimated remained high. In a second study, random regression models (RRM) in which additive genetic and permanent environmental effects were modeled using orthogonal Legendre polynomials or linear Spline functions, were compared. Residual variances were modeled considering 1, 5, or 10 classes. Five classes fitted the changes in residual variances adequately and were used for model comparison. According to the DIC and BIC criteria, a model using third-degree and fourth-degree Legendre polynomials for additive genetic and permanent environmental effects, respectively, provided the best fit. However, the high rank correlation (0.998) between this model and that applying third-degree Legendre polynomials for additive genetic and permanent environmental effects, indicates that practically the same bulls would be selected by both models. Therefore, the latter model, which is less parameterized, was used in the other studies components of the thesis. In the following... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Estudo de tipos sanguineos em bovinos selecionados para leite e para corte da raça Gir (Bos indiais) criada no Brasil

Mortari, Norma 13 July 2018 (has links)
Orientador : Bernardo Beiguelman / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-13T22:33:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mortari_Norma_D.pdf: 18915971 bytes, checksum: 311204e8857d049f1002f71ce6f734c5 (MD5) Previous issue date: 1990 / Resumo: o objetivo do presente trabalho foi caracterizar, por meio de marcadores geneticos do sangue, a raça zebuina Gir criada no Brasil, avaliando as dlferenças entre as variedades leiteira e de corte. Foram feitos testes serológicoa para trinta e tres especificidades antigenicas, referentes a nove s1stemas de grupos sangdlneos (A, B, C, F, J, L, M, S e Z) e testes eletroforeticos em gel de amido, para quatro sistemas de polimorfismos bioquimicos (albumlna, anldrase carbonica, hemogloblna e transferrlna). A amostra consistiu de 922 animais, sendo 476 do grupo de lelte e 446 do grupo de corte, além de 358 descendentes lncluídos na anàlise de determlnaçao dos fenogrupos do sistema B. ... Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The purpose of this study was to characterize by means of blood genetec markers, the Gyr breed raised in Brazil, ai well as to evaluate the differences between dairy and beef herds within this breed. Serological tests for 33 specificities of 9 blood group aystems (A, B, C, F, J, L, S, K and Z) and starch gel electrophoresis for albumin, carbonic anhydraae, hemoglobin and transferrin systems were done. A total of 922 animals were analysed, and of those 476 were classified as dairy cattle and 446 as beef cattle. In addition to that, 358 offsprings were typed for the purpose of phenogroup determination in the B system. ... Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Doutorado / Genetica / Doutor em Ciências Biológicas

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