Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-12-19T15:21:25Z No. of bitstreams: 1 Nielson de Lima Barros.pdf: 595780 bytes, checksum: 41b3822c59bb8a9d0ff834daed31532b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-19T15:21:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nielson de Lima Barros.pdf: 595780 bytes, checksum: 41b3822c59bb8a9d0ff834daed31532b (MD5) Previous issue date: 2013-07-26 / Fusarium species cause important diseases on maize such as stalk-rot and ear-rot. Fungi in the Gibberella fujikuroi species complex (GFSC) are among the causal agents of these diseases, such as F. proliferatum, F. subglutinans, F. temperatum and F. verticillioides. The present study aimed to characterize the diversity of Fusarium isolates from different maize growing areas in Brazil. Morphological characters and sequences of fragments of the gene that encodes the translation elongation factor (tef1) were used to characterize the isolates. Fifty isolates obtained from maize kernels in different growing areas in Brazil were used. In the morphological characterization the isolates showed variation regarding the colony color and mycelial growth. The colony color varied from salmon to violet and the average diameter of the colonies at three days varied from 2.83 cm to 4.07 cm. The majority of isolates showed long chains of conidia and monophialides. A few isolates showed short chains, false heads and polyphialides. None of the isolates formed chlamydospore. Considering the morphological characterization the isolates were identified as F. proliferatum (4 isolates) and F. verticillioides (46 isolates). In the molecular characterization a neighbor-joining phylogenetic tree was generated from the sequenced fragments of the tef1 gene. From 50 isolates analyzed, 47 grouped together with reference isolates of F. verticillioides forming a sister group to F. musae. Two isolates grouped close to F. fujikuroi and one isolate grouped close to F. proliferatum. Ten haplotypes were identified within the F. verticillioides isolates from Brazil, with six haplotypes being new to the species. The cultural and morphological characters could not be grouped according with the phylogenetic sub-groups and haplotypes. The phylogenetic groups also did not reflect the geographical localization of isolates. The data collected in this study show that F. verticillioides is the dominant species and is widely distributed in the maize growing regions of Brazil, with high genetic diversity in the population. / Espécies de Fusarium causam doenças importantes no milho como a podridão do colmo e podridão de espigas. Fungos do complexo de espécies Gibberella fujikuroi (GFSC) estão entre os agentes causais dessas doenças, como F. proliferatum, F. subglutinans, F. temperatum e F. verticillioides. O presente estudo objetivou caracterizar a diversidade de isolados de Fusarium de diversas regiões produtoras de milho do Brasil. Para tal, foram utilizados marcadores morfológicos e sequências de fragmento do gene que codifica o fator de elongação 1-alfa (tef1). Foram utilizados 50 isolados obtidos de grãos de milho de diversas regiões produtoras do Brasil. Na caracterização morfológica os isolados apresentaram grande variação quanto à coloração das colônias e crescimento micelial. A cor das colônias variou do salmão ao violeta e o diâmetro médio das colônias aos três dias variou de 2,83 cm a 4,07 cm. A maioria dos isolados apresentou cadeias longas de conídios e monofiálides. Poucos isolados apresentaram cadeias curtas, falsas cabeças e polifiálides. Nenhum isolado formou clamidósporo. Pela caracterização morfológica os isolados foram identificados como F. proliferatum (4 isolados) e F. verticillioides (46 isolados). Na caracterização molecular foi gerada uma árvore filogenética de neighbor-joining a partir de fragmentos sequenciados do gene tef1. Dos 50 isolados analisados, 47 agruparam com isolados de referência de F. verticillioides, formando um grupo irmão à F. musae. Dois isolados agruparam próximo a F. fujikuroi e um isolado próximo a F. proliferatum. Foram identificados 10 haplótipos dentre os isolados de F. verticillioides do Brasil, com seis haplótipos sendo novos para a espécie. Não foi possível agrupar os caracteres culturais e morfológicos com os sub-grupos filogenéticos e haplótipos. Também não houve agrupamento filogenético refletindo localização geográfica dos isolados. Os dados apresentados neste estudo mostram que F. verticillioides é a espécie dominante e está amplamente distribuída nas regiões produtoras de milho do Brasil, com alta diversidade genética na população.

As espécies de mamíferos da Magnaordem Xenarthra podem apresentar infecção por diversas espécies de parasitas da Família Trypanosomatidae, incluindo representantes dos gêneros Trypanosoma, Endotrypanum e Leishmania. Além dos Xenarthra, representantes do gênero Coendou (Ordem Rondentia) também foram incluídos neste estudo. Assim, foi possível descrever a diversidade de tripanossomatídeos nos Xenarthra e no gênero Coendou, provenientes principalmente da região Amazônica. As amostras de sangue, tecido e hemoculturas foram coletadas em sua maioria nos estados Pará e Rondônia, seguido do Mato Grosso, Paraíba e Ceará. Análises filogenéticas com a região V7V8 do gene SSU rDNA e do gene gGAPDH, confirmaram a presença de T. rangeli (linhagens A, B e E) em preguiças e tamanduás, T. cruzi (TcIII) em preguiças e tatús, Endotrypanum ssp. em preguiças e Porcisia em ouriços. Além disso, encontramos em todos hospedeiros duas possíveis novas espécies de trypanossomas denominadas de T. sp1 e T. sp2. / Mammal species of Magnaordem Xenarthra may be infected by several parasitic species of Trypanosomatidae family, including representatives of the genera Trypanosoma, Endotrypanum and Leishmania. In addition to the Xenarthra, representatives of the genus Coendou (Rondentia Order) were also included in this study. Thus, it was possible to describe the diversity of trypanosomatids in the Xenarthra and in the genus Coendou, mainly from the Amazon region. Blood samples, tissue and blood cultures were collected mostly in the states of Pará and Rondônia, followed by Mato Grosso, Paraíba and Ceará. Phylogenetic analyzes based in the V7V8 region of the SSU rDNA and gGAPDH genes confirmed the presence of T. rangeli (lineages A, B and E) in sloths and anteaters, T. cruzi (TcIII) in sloths and armadillos, Endotrypanum ssp. in sloths and Porcisia in porcupine. In addition, we found in all hosts two candidates to a new species of Trypanosoma named herein T. sp1 and T. sp2.

Functional trait-based approaches are increasingly used in plant ecology to analyse the environmental filtration observed in environmental gradients. Such analyzes allow a quantification of the functional response of plant communities to changes occurring in a gradient, responding to abiotic and biotic drivers. Evidence suggests that intraspecific variation, due to phenotypic plasticity or genetic diversity and a difference in the composition of the species in question, should play a crucial role in driving the relationship of trait values in community vs. environment. Based on this, this dissertation presents an evaluation of the variation of functional traits of plant species in response to environmental filters in Restingas slopes of the South Coast of Alagoas as well as a contribution of the instraespecific variation and the turnover of the species in the gradient. For this, we measured 11 functional traits in Restinga species along a gradient by transects. We grouped plant species according to zones of gradient (zone a to zone c) and zone d (flood) and compared individual’s traits by ANOVA. Our second analysis partitioned the contributions of species turnover and intraspecific variation to among-site variation in functional traits. Significant differences were found between averages of traits in the zones. Evaluating the influence of species turnover and intraspecific variation on the average of each characteristic found in the zone, a decomposition of the total variation showed that the turnover of the species represents a greater proportion of the total variation of the characteristics in an intraspecific variation. Our results reveal that a community assembly is limited by environmental filters. / Recentes estudos em traços funcionais têm focado em análises para detecção da filtragem ambiental observada em gradientes ambientais. Tais análises permitem a quantificação da resposta funcional das comunidades de plantas às mudanças ambientais que ocorrem num gradiente, respondendo a “drivers” abióticos e bióticos. Evidências sugerem que a variação intraespecífica, decorrente da plasticidade fenotípica ou da diversidade genética e a diferença na composição das espécies em gradientes (isto é, o turnover da espécie), deve desempenhar um papel crucial na condução das relações valores de traços na comunidade vs ambiente. Baseado nisso, esta dissertação apresenta uma avaliação da variação de traços funcionais de espécies de plantas em resposta a filtros ambientais em gradientes de Restingas do Litoral Sul de Alagoas bem como a contribuição da variação instraespecífica e do turnover das espécies na comunidade. Para tanto, foram medidos 11 traços funcionais em espécies de Restinga ao longo de um gradiente edáfico por meio de transectos. As espécies foram agrupadas de acordo com as zonas do gradiente e os valores médios de traços funcionais por zona foram comparados por meio de ANOVA. Depois, foram calculadas as contribuições do turnover de espécies e da variação intraespecífica nas respectivas zonas. Foram encontradas diferenças nas características funcionais das espécies entre as zonas. Avaliando a influência do turnover de espécies e da variação intraespecífica sobre as médias de cada característica encontrada na zona, a decomposição da variação total mostrou que o turnover das espécies representou uma maior proporção da variação total da característica em comparação com a variação intraespecífica. Nossos resultados revelam, então, que a montagem da comunidade é limitada por filtros ambientais.