O condor-dos-andes (Vultur gryphus) é uma ave carniceira da família dos abutres do novo mundo (Cathartidae) que habita ao longo da cordilheira dos Andes, cuja população tem diminuído no último século até ser considerada como espécie ameaçada. No Equador tem sido registrado aproximadamente 100 indivíduos em liberdade. Para evitar a extinção da espécie no país tem sido iniciado um programa de conservação envolvendo várias áreas das Ciências Biológicas, entre essas a genética de populações. Para descrever a situação genética do condor no Equador, amostras de sangue e penas de condores em cativeiro e silvestres, mais várias amostras de penas de muda de distintos locais onde habitam, foram coletadas e analisadas através de sete microssatélites heteroespecíficos amplificados no genoma do condor por PCR. Os resultados indicam que o grupo de 72 amostras, apresenta uma diversidade genética moderada a baixa nos loci estudados, apesar das grandes áreas onde está distribuído, porém as análises de variância molecular AMOVA e Hardy-Weinberg considerando como hipótese alternativa a deficiência de heterozigotos, indicam que não constituem uma população endogâmica. Estudos de estruturação populacional sugerem a falta de subpopulações inclusive entre amostras de lugares distantes. Sugere-se que se existir estruturação populacional esta deve ser do tipo isolamento por distância, para poder comprovar esta hipótese se propõe estender a pesquisa no futuro incluindo amostragem de locais muito distantes através da América Andina e diferentes marcadores. O grupo de marcadores foi também altamente útil para identificação genética de indivíduos através das penas anônimas coletadas no habitat, porém não resulta muito forte como prova de paternidade, precisando de marcadores mais polimórficos e melhor distribuídos pelo genoma. / The Andean Condor (Vultur gryphus) is a scavenger bird of the New World vultures (Cathartidae) that lives along the Andes Mountains. Its population has declined in the last century until being considered an endangered species. In Ecuador, approximately 100 birds have been registered in freedom. To avoid extinction in this country has been initiated a conservation program involving several areas of biological sciences, one of these, population genetics. In order to describe the genetic situation of the condor in Ecuador, blood and feather samples from captive and wild condors, plus several samples of molted feathers from different locations were collected and analyzed through seven heteroespecific microsatellite amplified in the condor genome by PCR. The results show that the group of 72 samples had a moderate to low genetic diversity in the amplified loci, despite the large areas where it is distributed. The analysis of molecular variance (AMOVA) and Hardy-Weinberg with heterozygote deficiency as alternative hypothesis denotes that sampled condors do not constitute an inbred population. Structuring analyzes suggest there is not subpopulations even among samples from distant places. If exist some kind of pop0ulation structure in the species, it could be like isolation by distance structured, but in order to prove this hypothesis, it is recommended to extend the research including samples from distant locations through Andean America and more powerful genetic markers. Those markers was also highly useful for the genetic identification of not assigned feathers collected in the habitat, but as paternity test require more polymorphic markers and better distributed throughout the genome.

A andiroba (Carapa guianensis) é uma espécie arbórea de importância econômica na região Amazônica pelo grande interesse que vem despertando nas indústrias madeireira e cosmética. É uma planta monóica, com floração assincrônica e auto-incompatível. Ela é bastante plástica e se adapta para ocupar diferentes ambientes, sendo encontrada tanto no baixio como na terra firme. Os objetivos do presente estudo foram avaliar a estrutura genética de duas populações naturais de andiroba e quantificar a diversidade genética intrapopulacional, a autocorrelação espacial e o fluxo gênico analisando uma única população em dois ambientes distintos (terra firme e baixio) e em três classes de tamanho (plântulas, jovens e adultos). Para o estudo interpopulacional, foram avaliados 39 indivíduos adultos no município de Porto Acre e 38 em Rio Branco. Já para o intrapopulacional analisaram-se 957 indivíduos do município de Rio Branco. Foram utilizados sete locos polimórficos de microssatélites que permitiram observar 42 alelos em ambas as populações, sendo que as estimativas dos parâmetros genéticos foram muito próximas entre elas. Não foi observada endogamia e a taxa de cruzamento aparente foi alta indicando reprodução por alogamia. A maior parte da variabilidade genética (90,5%) foi encontrada dentro das populações. No entanto, a divergência genética entre as populações (9,5%) foi estatisticamente significativa e pode ser considerada intermediária. Com relação à variabilidade intrapopulacional, observou-se 85 alelos na população Rio Branco, com 67 alelos ocorrendo no ambiente de terra firme e 70 no baixio. A diversidade gênica foi semelhante nas três classes de tamanho na população total e nos dois ambientes, não tendo sido observada endogamia em nenhuma das classes de tamanho dos ambientes. Também não foi observada divergência genética entre as classes de tamanho. Já entre os indivíduos do ambiente de terra firme e os do baixio esta divergência foi baixa (1,63%), mas significativa. A taxa de cruzamento aparente foi alta tanto para os ambientes como para a população total. As analises de autocorrelação espacial dos genótipos revelaram que a população Rio Branco apresentou baixa estruturação espacial, sendo que as árvores localizadas a uma distância de até aproximadamente 370 metros tenderam a ser geneticamente similares. No ambiente de baixio encontrouse este mesmo padrão, com árvores localizadas a uma distância de até 160 metros mostrando-se mais aparentadas entre si. Quando se observou separadamente cada classe de tamanho neste ambiente, verificou-se baixa estruturação na classe dos jovens, e uma disposição quase que aleatória dos genótipos na classe dos adultos. Na terra firme não se observou estruturação espacial dos genótipos em nenhuma das classes. As analises de parentesco das plântulas indicaram que 7,3% dos parentais paternos foram encontrados no ambiente de terra firme e 9,4% no baixio. Este baixo índice encontrado mostra que é grande a quantidade de fluxo gênico vindo de fora da área amostrada. Verificou-se fluxo gênico de longo alcance dentro da população, observando-se uma distância média de até 888,8 metros entre os ambientes. Com base nos conhecimentos gerados sobre a estrutura genética, podem-se estabelecer estratégias de manejo e conservação dessas populações naturais de andiroba. / Crabwood (Carapa guianensis) is a tree of economic importance in the Amazon region, due to the great interest it has been attracting in the wood and cosmetics industries. It is a monoecious species, with asynchronic flowering and self-incompatible. This species is very plastic and adapts to occupy different habitats, and it is found in the lowland and upland habitats. The objectives of this study were to evaluate the genetic structure between two natural populations of crabwood, and to quantify the intrapopulational genetic diversity, the spatial autocorrelation and gene flow of one population, considering two habitats (upland and lowland) and three size classes (seedlings, young plants and adults). For the interpopulational study, 39 adult individuals were evaluated in the municipal district of Porto Acre and 38 in Rio Branco. For the intrapopulational studies, 957 individuals were analyzed in the municipal district of Rio Branco. Seven polymorphic microssatellite loci were used to detect 42 alleles in both populations, were the genetic parameter estimates were very similar to each other. Inbreeding was not observed and the apparent outcrossing rate was high, indicating an outcrossing breeding system for this species. Most of the genetic variability (90.5%) was found to be within populations. However, the genetic divergence between them (9.5%) was statistically significant and can be considered as intermediate. Regarding the intrapopulacional variability, 85 alleles were observed in the Rio Branco population, with 67 alleles occurring in the upland habitat and 70 in the lowland. The genetic diversity was similar in the three size classes in the total population, and in the two habitats. No inbreeding was observed in any of the size classes of either habitat. No genetic divergence was observed between size classes as well. Between individuals of the upland habitat and those of the lowland habitat, this divergence was low (1.63%), but significant. The autocorrelation spatial analysis of the genotypes showed that the Rio Branco population presented low spatial genetic structuring, with the trees located at a distance of approximately 370 meters tending to be genetically similar. In the lowland habitat the same pattern was found, with trees located at a distance of 160 meters tending to be more related between themselves. When each size class of this habitat was observed separately, a low spatial genetic structuring was found in the young classes and an almost random disposal of the genotypes was observed in the adult classes. In the upland habitat, a spatial genetic structure of the genotypes was not observed in any of the size classes. The paternity analysis of the seedlings indicated that 7.3% of the male parents were found in the upland habitat and 9.4% in the lowland. This low index shows that the amount of gene flow coming from outside the sampling area is high. Long-distance gene flow within the population studied was observed, with an average distance of 888.8 m found between habitats. Based in the acquired knowledge on the genetic structure, management and conservation strategies can be established for these natural crabwood populations.

Made available in DSpace on 2016-04-28T14:16:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jose Franco Monte Siao.pdf: 1556513 bytes, checksum: 635978cf87b4bf4ee8d7f5ca3319ec43 (MD5) Previous issue date: 2008-05-07 / Secretaria da Educação do Estado de São Paulo / The Ukrainian geneticist Theodosius Dobzhansky (1900-1975) made several visits to Brazil and for four times interacted with the group leaded by Prof. André Dreyfus (1897-1952), of the University of São Paulo. The partnership between Dobzhansky and Brazilian researchers was marked by the development of a project which lasted about twenty years and was supported by the Rockfeller Foundation. The first aim of this dissertation is to evaluate the impact made by Dobzhansky s four visits on the studies of genetics and evolution developed by the Brazilian group. The second aim is to analyse the scientific and extra-scientific factors which lead to the decrease of Brazilian and Dobzhansky s publications related to the subject of the project as well as the end of their partnership. The period considered is from 1943 to 1960. This dissertation contains an introduction and five chapters. The first chapter presents a general view of the scientific context of the period, an overview of Dobzhansky s career and of genetics in Brazil. The second chapter tries to analyse the impact made by Dobzhansky s visits on the studies developed by Dreyfus group using a bibliometric approach. The third chapter deals with the subjects discussed by Dreyfu s group during and after Dobzhansky s visits, studying a significant sample of their works. The fourth chapter tries to elucidate the scientific and extra-scientific factors which contributed to the decrease of Dobzhansky and Brazilians publications related to the subject of the project. The fifth chapter presents some final considerations. This study lead to the conclusion that Dobzhanky s influence on Dreyfus group was significant not only in quantitative terms (the amount of publications beginning with Dobzhansky s first visit), but also in qualitative terms. After Dobzhansky s arrival, Dreyfus group started a new line of investigation (the genetics of populations) adopting a new experimental material (Drosophila) and exploring a little studied region: the tropical one. The decrease of individual and joint publications dealing with the subject of the project during some periods can be explained by the adoption of new experimental materials by some members of the group; the involvement with some subjects which were not part of the initial project, such as Botany; Dobzhansky and his wife s health problems during the third visit; scientific disagreement between Dobzhansky and Brazilians; and Brazilian s desire of independence / O geneticista ucraniano Theodosius Dobzhansky (1900-1975) fez diversas visitas ao Brasil. Durante quatro delas interagiu com o grupo liderado pelo Prof. André Dreyfus (1897-1952) da Universidade de São Paulo. A parceria entre Dobzhansky e brasileiros foi marcada pelo desenvolvimento de um projeto que durou cerca de vinte anos e contou com o apoio da Fundação Rockfeller. O primeiro objetivo desta dissertação é avaliar o impacto que estas quatro visitas de Dobzhansky causaram sobre os estudos acerca de genética e evolução desenvolvidos pelo grupo brasileiro. O segundo objetivo é analisar os fatores científicos e extracientíficos que contribuíram para a redução das publicações de Dobzhansky e brasileiros sobre o assunto do projeto e para o final da parceria entre eles. O período considerado é de 1943 a 1960. Esta dissertação contém uma introdução e cinco capítulos. O primeiro capítulo oferece uma visão geral do contexto científico do período estudado, da trajetória de Dobzhansky e da genética no Brasil. O segundo capítulo procura analisar o impacto das visitas de Dobzhansky sobre os estudos desenvolvidos pelo grupo de Dreyfus através de um enfoque bibliométrico. O terceiro capítulo analisa os assuntos tratados em uma amostra significativa dos trabalhos desenvolvidos pelo grupo de Dreyfus durante e após as visitas de Dobzhansky. O quarto capítulo trata dos fatores de ordem conceitual e não conceitual que contribuíram para o decréscimo das publicações conjuntas de Dobzhansky e brasileiros. O quinto capítulo apresenta algumas considerações finais sobre o assunto. Este estudo levou à conclusão de que a influência de Dobzhanky foi significativa tanto em termos quantitativos (quantidade de publicações a partir de sua primeira visita) como em termos qualitativos. Sua vinda fez com que o grupo da USP passasse a se dedicar a uma nova linha de investigação (a genética de populações) adotando um novo material experimental (Drosophila) e explorando a região tropical que havia sido pouco estudada. A redução das publicações individuais e conjuntas sobre o assunto do projeto durante alguns períodos pode ser explicada pela adoção de novos materiais experimentais por parte de alguns membros do grupo; envolvimento com outros assuntos que não constavam no projeto como a botânica, por exemplo; problemas de saúde de Dobzhansky e sua esposa durante sua terceira visita; divergências científicas entre Dobzhansky e brasileiros e desejo de independência dos brasileiros

O condor-dos-andes (Vultur gryphus) é uma ave carniceira da família dos abutres do novo mundo (Cathartidae) que habita ao longo da cordilheira dos Andes, cuja população tem diminuído no último século até ser considerada como espécie ameaçada. No Equador tem sido registrado aproximadamente 100 indivíduos em liberdade. Para evitar a extinção da espécie no país tem sido iniciado um programa de conservação envolvendo várias áreas das Ciências Biológicas, entre essas a genética de populações. Para descrever a situação genética do condor no Equador, amostras de sangue e penas de condores em cativeiro e silvestres, mais várias amostras de penas de muda de distintos locais onde habitam, foram coletadas e analisadas através de sete microssatélites heteroespecíficos amplificados no genoma do condor por PCR. Os resultados indicam que o grupo de 72 amostras, apresenta uma diversidade genética moderada a baixa nos loci estudados, apesar das grandes áreas onde está distribuído, porém as análises de variância molecular AMOVA e Hardy-Weinberg considerando como hipótese alternativa a deficiência de heterozigotos, indicam que não constituem uma população endogâmica. Estudos de estruturação populacional sugerem a falta de subpopulações inclusive entre amostras de lugares distantes. Sugere-se que se existir estruturação populacional esta deve ser do tipo isolamento por distância, para poder comprovar esta hipótese se propõe estender a pesquisa no futuro incluindo amostragem de locais muito distantes através da América Andina e diferentes marcadores. O grupo de marcadores foi também altamente útil para identificação genética de indivíduos através das penas anônimas coletadas no habitat, porém não resulta muito forte como prova de paternidade, precisando de marcadores mais polimórficos e melhor distribuídos pelo genoma. / The Andean Condor (Vultur gryphus) is a scavenger bird of the New World vultures (Cathartidae) that lives along the Andes Mountains. Its population has declined in the last century until being considered an endangered species. In Ecuador, approximately 100 birds have been registered in freedom. To avoid extinction in this country has been initiated a conservation program involving several areas of biological sciences, one of these, population genetics. In order to describe the genetic situation of the condor in Ecuador, blood and feather samples from captive and wild condors, plus several samples of molted feathers from different locations were collected and analyzed through seven heteroespecific microsatellite amplified in the condor genome by PCR. The results show that the group of 72 samples had a moderate to low genetic diversity in the amplified loci, despite the large areas where it is distributed. The analysis of molecular variance (AMOVA) and Hardy-Weinberg with heterozygote deficiency as alternative hypothesis denotes that sampled condors do not constitute an inbred population. Structuring analyzes suggest there is not subpopulations even among samples from distant places. If exist some kind of pop0ulation structure in the species, it could be like isolation by distance structured, but in order to prove this hypothesis, it is recommended to extend the research including samples from distant locations through Andean America and more powerful genetic markers. Those markers was also highly useful for the genetic identification of not assigned feathers collected in the habitat, but as paternity test require more polymorphic markers and better distributed throughout the genome.

A andiroba (Carapa guianensis) é uma espécie arbórea de importância econômica na região Amazônica pelo grande interesse que vem despertando nas indústrias madeireira e cosmética. É uma planta monóica, com floração assincrônica e auto-incompatível. Ela é bastante plástica e se adapta para ocupar diferentes ambientes, sendo encontrada tanto no baixio como na terra firme. Os objetivos do presente estudo foram avaliar a estrutura genética de duas populações naturais de andiroba e quantificar a diversidade genética intrapopulacional, a autocorrelação espacial e o fluxo gênico analisando uma única população em dois ambientes distintos (terra firme e baixio) e em três classes de tamanho (plântulas, jovens e adultos). Para o estudo interpopulacional, foram avaliados 39 indivíduos adultos no município de Porto Acre e 38 em Rio Branco. Já para o intrapopulacional analisaram-se 957 indivíduos do município de Rio Branco. Foram utilizados sete locos polimórficos de microssatélites que permitiram observar 42 alelos em ambas as populações, sendo que as estimativas dos parâmetros genéticos foram muito próximas entre elas. Não foi observada endogamia e a taxa de cruzamento aparente foi alta indicando reprodução por alogamia. A maior parte da variabilidade genética (90,5%) foi encontrada dentro das populações. No entanto, a divergência genética entre as populações (9,5%) foi estatisticamente significativa e pode ser considerada intermediária. Com relação à variabilidade intrapopulacional, observou-se 85 alelos na população Rio Branco, com 67 alelos ocorrendo no ambiente de terra firme e 70 no baixio. A diversidade gênica foi semelhante nas três classes de tamanho na população total e nos dois ambientes, não tendo sido observada endogamia em nenhuma das classes de tamanho dos ambientes. Também não foi observada divergência genética entre as classes de tamanho. Já entre os indivíduos do ambiente de terra firme e os do baixio esta divergência foi baixa (1,63%), mas significativa. A taxa de cruzamento aparente foi alta tanto para os ambientes como para a população total. As analises de autocorrelação espacial dos genótipos revelaram que a população Rio Branco apresentou baixa estruturação espacial, sendo que as árvores localizadas a uma distância de até aproximadamente 370 metros tenderam a ser geneticamente similares. No ambiente de baixio encontrouse este mesmo padrão, com árvores localizadas a uma distância de até 160 metros mostrando-se mais aparentadas entre si. Quando se observou separadamente cada classe de tamanho neste ambiente, verificou-se baixa estruturação na classe dos jovens, e uma disposição quase que aleatória dos genótipos na classe dos adultos. Na terra firme não se observou estruturação espacial dos genótipos em nenhuma das classes. As analises de parentesco das plântulas indicaram que 7,3% dos parentais paternos foram encontrados no ambiente de terra firme e 9,4% no baixio. Este baixo índice encontrado mostra que é grande a quantidade de fluxo gênico vindo de fora da área amostrada. Verificou-se fluxo gênico de longo alcance dentro da população, observando-se uma distância média de até 888,8 metros entre os ambientes. Com base nos conhecimentos gerados sobre a estrutura genética, podem-se estabelecer estratégias de manejo e conservação dessas populações naturais de andiroba. / Crabwood (Carapa guianensis) is a tree of economic importance in the Amazon region, due to the great interest it has been attracting in the wood and cosmetics industries. It is a monoecious species, with asynchronic flowering and self-incompatible. This species is very plastic and adapts to occupy different habitats, and it is found in the lowland and upland habitats. The objectives of this study were to evaluate the genetic structure between two natural populations of crabwood, and to quantify the intrapopulational genetic diversity, the spatial autocorrelation and gene flow of one population, considering two habitats (upland and lowland) and three size classes (seedlings, young plants and adults). For the interpopulational study, 39 adult individuals were evaluated in the municipal district of Porto Acre and 38 in Rio Branco. For the intrapopulational studies, 957 individuals were analyzed in the municipal district of Rio Branco. Seven polymorphic microssatellite loci were used to detect 42 alleles in both populations, were the genetic parameter estimates were very similar to each other. Inbreeding was not observed and the apparent outcrossing rate was high, indicating an outcrossing breeding system for this species. Most of the genetic variability (90.5%) was found to be within populations. However, the genetic divergence between them (9.5%) was statistically significant and can be considered as intermediate. Regarding the intrapopulacional variability, 85 alleles were observed in the Rio Branco population, with 67 alleles occurring in the upland habitat and 70 in the lowland. The genetic diversity was similar in the three size classes in the total population, and in the two habitats. No inbreeding was observed in any of the size classes of either habitat. No genetic divergence was observed between size classes as well. Between individuals of the upland habitat and those of the lowland habitat, this divergence was low (1.63%), but significant. The autocorrelation spatial analysis of the genotypes showed that the Rio Branco population presented low spatial genetic structuring, with the trees located at a distance of approximately 370 meters tending to be genetically similar. In the lowland habitat the same pattern was found, with trees located at a distance of 160 meters tending to be more related between themselves. When each size class of this habitat was observed separately, a low spatial genetic structuring was found in the young classes and an almost random disposal of the genotypes was observed in the adult classes. In the upland habitat, a spatial genetic structure of the genotypes was not observed in any of the size classes. The paternity analysis of the seedlings indicated that 7.3% of the male parents were found in the upland habitat and 9.4% in the lowland. This low index shows that the amount of gene flow coming from outside the sampling area is high. Long-distance gene flow within the population studied was observed, with an average distance of 888.8 m found between habitats. Based in the acquired knowledge on the genetic structure, management and conservation strategies can be established for these natural crabwood populations.