Made available in DSpace on 2014-08-20T13:44:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_carolina_terra_borges.pdf: 918571 bytes, checksum: 18eeef3adf6b7f2c33e02b67f0bfa596 (MD5) Previous issue date: 2013-07-31 / Soybean seed quality is high related with crop production. Seed coat has the function of maintaining this quality, since acts as a modulator of the interactions between the internal and external environment of the seed, controls gas exchange and water to the environment and regulates germination by interfering with the mechanisms dormancy. In soybean seed husk is present lipoxygenase VLXC, which is involved in the temporary storage of nitrogen. Given the above, the objective of this study was to evaluate the expression of the gene coding for the protein VLXC on the tegument of four soybean genotypes at different times of collection after anthesis. The experiment was conducted in greenhouse Station Lowlands of Embrapa Clima Temperado and Laboratório de biotecnologia de sementes (UFPel / FAEM) in the city of Capão do Leão - RS, in a completely randomized design with three replications, and treatments arranged in a factorial model. We used four contrasting genotypes, two cultivars of yellow coat (COODETEC 202 and BMX Potência RR) and two genotypes of black coat (Tegumento Preto and IAC). Samples were collected along the integuments of developing soybean seed corresponding to periods of 25, 30, 35, 40, 45, 50 and 55 days after anthesis. Proceeded to RNA extraction of tegument, followed by obtaining the cDNA for further analysis of qRT-PCR (polymerase chain reaction of reverse transcription real-time), to quantify the relative accumulation of gene transcripts VLX-C. The level accumulation of gene transcripts VLXC cultivar CD 202 has been raised most of the times, followed by a low expression evaluated last time that corresponds with the time it was made harvesting soybeans. The strain TP and the IAC and BMX Potência RR did not show the same behavior of the cultivar CD 202, due to low accumulation of gene transcripts VLXC in all periods. The results indicate that the relative accumulation of gene transcripts VLXC in the seed coat of soybeans differs between both periods evaluated, as well as between genotypes. / A qualidade de sementes de soja é um dos fatores responsáveis para a obtenção de altas produtividades nas lavouras. Para isso, o tegumento da semente tem como função a manutenção dessa qualidade, visto que atua como modulador das interações entre a parte interna e o meio externo da semente, controla trocas gasosas e de água com o ambiente e regula a germinação, interferindo nos mecanismos de dormência. No tegumento de sementes de soja encontra-se presente a lipoxigenase VLXC, a qual está envolvida no armazenamento temporário de nitrogênio. Diante do exposto, o objetivo deste trabalho foi avaliar a expressão do gene que codifica para a proteína VLXC no tegumento de quatro genótipos de soja, em épocas distintas de coleta após a antese. O experimento foi conduzido em casa de vegetação da Estação Terras Baixas da Embrapa Clima Temperado e no Laboratório de Biotecnologia de Sementes (UFPel/FAEM), no município de Capão do Leão - RS, em delineamento completamente casualizado, com três repetições, sendo os tratamentos arranjados em esquema bifatorial. Foram utilizados quatro genótipos de soja contrastantes quanto à coloração, duas cultivares de tegumento amarelo (COODETEC 202 e BMX Potência RR) e duas cultivares de tegumento preto (Tegumento Preto e IAC). Foram efetuadas coletas dos tegumentos ao longo do desenvolvimento da semente de soja correspondendo aos períodos de 25, 30, 35, 40, 45, 50 e 55 dias após a antese. Procedeu-se a extração de RNA dos tegumentos, seguido da obtenção do cDNA para posterior análise de qRT-PCR (Reverse transcription polymerase chain reaction in real-time) visando quantificar o acúmulo relativo de transcritos do gene VLXC. O nível de acúmulo de transcritos para o gene VLXC na cultivar CD 202 foi elevado na maioria das amostragens, seguido de baixa expressão na última época avaliada, que corresponde ao momento em que foi efetuada a colheita da soja. A linhagem TP e as cultivares IAC e BMX Potência RR não apresentaram o mesmo comportamento da cultivar CD 202, devido ao baixo acúmulo de transcritos do gene VLXC, em todas as épocas avaliadas. Os resultados obtidos indicam que o acúmulo relativo de transcritos do gene VLXC no tegumento de sementes de soja difere tanto entre as épocas avaliadas, bem como entre os genótipos estudados.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:44:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_alexandra_alves_cantos.pdf: 312424 bytes, checksum: 0f9b4b907d36772b9ac4fe5b1cbcf414 (MD5) Previous issue date: 2009-05-07 / The aeration of soybean seeds with cold air has been used in several decades, and its benefits in maintaining quality are well known. Recently, the aeration with cold air produced by cooling units is gaining acceptance, particularly in regions where the aeration with cold ambient air is not possible. The chill of soybean seeds with naturally or artificially produced cold air is a very important step for maintaining the physiological quality of seeds. Despite its benefits within the process of seed production, the potential and flexibility of the cold treatment of seed has not been fully exploited by seed makers. The objective of this work is evaluate the effects of aeration with air conditioning on physiological quality of soybean seeds after a period of conventional storage. The study was conducted at COODETEC in Cascavel - Paraná, with the cultivar CD 212RR. In this work, a portion of 73 bags was cooled for 53 minutes with cold air inflation to reach 15 ° C using a cooling unit. Another portion of 67 bags were stored without the cooling process. Both portions were stored for eight months in two separate blocks, but under the same environmental conditions. Seed samples of the two portions were taken every two months and sent to the COODETEC Laboratory of Seed Analysis for germination tests using the following methods: paper test, sand germination, accelerated aging germination and the first count germination. The analysis of variance showed significant differences between the treatments. In the standard germination test applied after eight months of storage, the cold-treated seeds showed only three percentage points reduction in germination, down from 88% to 85%. In the samples without cold treatment, the germination dropped 28 points before bagging , down from 88% to 60%. It demonstrates the benefits of cold treatment of soybean seeds, in order to maintaining the physiological quality of seeds. / A aeração de sementes de soja, com ar ambiente frio, tem sido usada a varias décadas, e seus benefícios na manutenção da qualidade são bem conhecidos. Mais, recentemente a aeração com ar frio produzido por resfriadores vem ganhando aceitação principalmente em regiões em que a areação com ar ambiente frio não é possível. O resfriamento de sementes de soja com ar frio natural ou produzido artificialmente é uma etapa muito importante para a manutenção da qualidade fisiológica das sementes. Apesar dos seus benefícios dentro do processo de produção de sementes, o potencial e a flexibilidade da tecnologia de refrigeração de sementes não tem sido totalmente explorada pelos sementeiros. Diante disso, o objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos da aeração com ar resfriado na qualidade fisiológica de sementes de soja após um período de armazenamento a temperatura ambiente. O trabalho foi desenvolvido na COODETEC em Cascavel no Paraná, com a cultivar CD 212RR. Após a colheita e beneficiamento das sementes, uma porção de 73 sacas foi resfriada por 53 minutos com a insuflação de ar frio, até atingir 15ºC, usando um resfriador. Outra porção de 67 sacos foi ensacada sem ser resfriada. Ambas as porções foram armazenadas em dois blocos separados, mas sob as mesmas condições de ambiente, por oito meses. Amostras de sementes dos dois tratamentos foram retiradas a cada dois meses e encaminhadas ao Laboratório de Analise de Sementes da Coodetec para testes de germinação em rolo de papel, germinação em areia, envelhecimento acelerado e teste de primeira contagem. A análise de variância mostrou significância entre os tratamentos avaliados. No teste padrão de germinação, para o tratamento com resfriamento de sementes, após oito meses de armazenamento apresentou apenas três pontos percentuais de redução na germinação, baixando de 88% para 85%. Enquanto que tratamento sem o resfriamento antes do ensaque a germinação caiu 28 pontos percentuais, baixando de 88% para 60%.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:44:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_antenor_reinaldo_canton.pdf: 770686 bytes, checksum: c4da43fc7ad42829566e026966a0d20e (MD5) Previous issue date: 2010-12-22 / The aeration of soybean seeds with cold air has been used in several decades, and its benefits in maintaining quality are well known. Recently, the aeration with cold air produced by cooling units is gaining acceptance, particularly in regions where the aeration with cold ambient air is not possible. The chill of soybean seeds with naturally or artificially produced cold air is a very important step for maintaining the physiological quality of seeds. Despite its benefits within the process of seed production, the potential and flexibility of the cold treatment of seed has not been fully exploited by seed makers. The objective of this work is evaluate the effects of aeration with air conditioning on physiological quality of soybean seeds after a period of conventional storage. The study was conducted at COODETEC in Cascavel - Paraná, with the cultivar CD 212RR. In this work, a portion of 73 bags was cooled for 53 minutes with cold air inflation to reach 15 ° C using a cooling unit. Another portion of 67 bags were stored without the cooling process. Both portions were stored for eight months in two separate blocks, but under the same environmental conditions. Seed samples of the two portions were taken every two months and sent to the COODETEC Laboratory of Seed Analysis for germination tests using the following methods: paper test, sand germination, accelerated aging germination and the first count germination. The analysis of variance showed significant differences between the treatments. In the standard germination test applied after eight months of storage, the cold-treated seeds showed only three percentage points reduction in germination, down from 88% to 85%. In the samples without cold treatment, the germination dropped 28 points before bagging , down from 88% to 60%. It demonstrates the benefits of cold treatment of soybean seeds, in order to maintaining the physiological quality of seeds. / A aeração de sementes de soja, com ar ambiente frio, tem sido usada a varias décadas, e seus benefícios na manutenção da qualidade são bem conhecidos. Mais, recentemente a aeração com ar frio produzido por resfriadores vem ganhando aceitação principalmente em regiões em que a areação com ar ambiente frio não é possível. O resfriamento de sementes de soja com ar frio natural ou produzido artificialmente é uma etapa muito importante para a manutenção da qualidade fisiológica das sementes. Apesar dos seus benefícios dentro do processo de produção de sementes, o potencial e a flexibilidade da tecnologia de refrigeração de sementes não tem sido totalmente explorada pelos sementeiros. Diante disso, o objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos da aeração com ar resfriado na qualidade fisiológica de sementes de soja após um período de armazenamento a temperatura ambiente. O trabalho foi desenvolvido na COODETEC em Cascavel no Paraná, com a cultivar CD 212RR. Após a colheita e beneficiamento das sementes, uma porção de 73 sacas foi resfriada por 53 minutos com a insuflação de ar frio, até atingir 15ºC, usando um resfriador. Outra porção de 67 sacos foi ensacada sem ser resfriada. Ambas as porções foram armazenadas em dois blocos separados, mas sob as mesmas condições de ambiente, por oito meses. Amostras de sementes dos dois tratamentos foram retiradas a cada dois meses e encaminhadas ao Laboratório de Analise de Sementes da Coodetec para testes de germinação em rolo de papel, germinação em areia, envelhecimento acelerado e teste de primeira contagem. A análise de variância mostrou significância entre os tratamentos avaliados. No teste padrão de germinação, para o tratamento com resfriamento de sementes, após oito meses de armazenamento apresentou apenas três pontos percentuais de redução na germinação, baixando de 88% para 85%. Enquanto que tratamento sem o resfriamento antes do ensaque a germinação caiu 28 pontos percentuais, baixando de 88% para 60%.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Morningglory is an annual plant reproduced by seeds. Seed germination occurs in streams during spring and summer making it difficult to control. Its occurrence has increased in soybean crops in southern states by the exclusive use of the herbicide glyphosate in weed control. This species has seed dormancy caused by impermeable to water, whose absorption is prevented by the seminal tegument. The possibility of using effective methods to overcome dormancy of seeds of bindweed would be ideal for studies of management of these species in agroecosystems as this would result in more uniform plant stands. This study aimed to: evaluate methods aimed at breaking dormancy of seeds of three species of morningglory, and investigate whether there are differences in dormancy between species of this weed (Chapter I); select alternative techniques in weed management prior to sowing of soybean by desiccation with glyphosate, alone and in combination with residual herbicides and selective culture, and also in post -emergency soybeans, with or without the application of glyphosate (Chapter II). In the experiment of scarification, sulfuric acid treatment (98%) resulted in increases in germination varies according to the species examined. Ipomoea undivided was less sensitive to treatment, for Ipomoea triloba, soaking the seeds for 10min in H2SO4 showed better germination. Already in Ipomoea purpurea, the response was linear and the best germination of this species occurred in time of 20min. Mechanical scarification enhanced germination of three species, because it promotes a break in the integument allowing more water uptake by seed. Soaking in KNO3 (0.2% v/v) promoted germination below 40% for the three species to morningglory. Seed exposure to radiation Ipomoea triloba ultrasound for 45 and 60 min resulted in germination percentage above 70%, but for Ipomoea purpurea and Ipomoea indivisa germination was below 50%. The results of experiment management of morningglory showed that the treatments applied in the pre-drying in soybean planting this species is not adequately controlled, controlling less than 80%. But the assessment at 14 DAT, treatments T3 (glyphosate + diclosulam) and T2 (glyphosate + clorimuron) controlled respectively 88 and 86%. In general, the highest grain yields were obtained when combining the treatments of drying with application of glyphosate V2 and V5 stages of soybeans, or just in V5, except for T1 (glyphosate - 720) and T4 (glyphosate + imazethapyr - 720 + 90). T3 (glyphosate + diclosulam - 720 + 25.2) stood out positively desiccation on pre-seeding, controlling the flow of seedling emergence in morningglory (81% at 28 DAT) and also in productivity grains (3.116 kg ha-1) when it was applied post-emergence glyphosate in soybeans. The application of the herbicide glyphosate has shown effective results in the management of morningglory. Therefore, it is necessary the use of combined applications of herbicides. The integrated management of weeds must not dismiss the use of herbicides, but control of the morningglory in soybean requires a management that includes addition of chemical control, several cultural practices, and therefore will require more investment by the producer but to have a greater return due to increased profitability. / A germinação das sementes de cordas-de-viola ocorre em fluxos durante a primavera e verão dificultando seu controle. As sementes apresentam dormência causada principalmente pela impermeabilidade do tegumento seminal à água. A possibilidade de se utilizar métodos eficazes na superação da dormência de sementes de cordas-de-viola é importante em estudos de manejo de Ipomoea spp. em agroecossistemas, pois resultaria em populações mais uniformes. Este trabalho teve por objetivos: (i) avaliar métodos capazes de superar a dormência de sementes de três espécies de cordas-de-viola e investigar se há diferenças na dormência entre as espécies desta planta daninha (Capítulo I) e (ii) selecionar alternativas de controle de cordas-de-viola antecedendo a semeadura da soja RR® através da dessecação com o herbicida glifosato, aplicado isolado e em associação com herbicidas residuais seletivos à cultura; e também em pós-emergência da soja RR®, com ou sem a aplicação do glifosato (Capítulo II). No experimento I (superação de dormência de sementes de cordas-de-viola), o tratamento com ácido sulfúrico (H2SO4) à 98 % resultou em incrementos na germinação das sementes variando de acordo com a espécie analisada. Ipomoea indivisa foi a espécie menos sensível ao tratamento; enquanto que em Ipomoea triloba , a imersão das sementes por 10min em H2SO4 apresentou melhor germinação. Já, em Ipomoea purpurea, a resposta foi linear e a maior percentagem de germinação ocorreu no tempo de 20min. A escarificação mecânica do tegumento seminal favoreceu a germinação das três espécies, pois promoveu uma ruptura no tegumento permitindo melhor embebição de água pela semente; enquanto que a imersão das sementes das três espécies de corda-de-viola em nitrato de potássio (KNO3) a 0,2% v/v, proporcionou germinações inferiores a 40 %. A exposição das sementes de Ipomoea triloba à radiação de ultrasom por 45 e 60min resultou em germinações das sementes maiores que 70%; porém para Ipomoea indivisa e Ipomoea purpúrea, a germinação foi inferior a 50%. Os resultados do experimento de manejo de cordas-de-viola em soja RR® (Capítulo II) mostraram que os tratamentos aplicados na dessecação em pré-semeadura da soja RR não controlaram satisfatoriamente esta planta daninha, com controles em geral inferiores 80 %; exceto nos tratamentos com as combinações de glifosato (720 g e.a. ha-1) com diclosulam (25,2 g i.a. ha-1) e glifosato (720 g e.a. ha-1) com clorimuron (20 g i.a. ha-1), onde os controles foram acima de 85%. Em geral, as maiores produtividades de grãos foram obtidas quando se associou os tratamentos de dessecação com a aplicação de glifosato em pós-emergência da soja RR nos estádios V2 e V5 ou apenas em V5; exceto para os tratamentos glifosato (720 g e.a. ha-1) e a combinação de glifosato (720 g e.a. ha-1) com imazetapir (90 g i.a. ha-1). O manejo de plantas daninhas em soja RR® não deve descartar o uso de herbicidas, porém o controle de cordas-de-viola necessita que se integre além do controle químico, outras práticas culturais, e consequentemente serão necessários mais investimentos pelo produtor, mas que terá retorno em função do aumento da rentabilidade por área.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The objective of this study was to evaluate the genetic resistance of cultivars for the possible damage caused by Rhizoctonia solani in controlled humidity conditions. For this, the work was divided into parts, which began from the get the pathogen identified in the AG-4 anastomosis group, mainly responsible for causing rot the root system and soybean seedling damping-off. Then the spread was performed in laboratory, cultured in petri dishes, and after standing in a culture medium using corn flour, sand and distilled water, which was evaluated inoculum different doses (0, 5, 15, 25, 40g) in order to adjust the conditions for the damage. For the tests in the greenhouse, all experimental units were formed by a polyethylene tray with a capacity of 2.5 L, containing sterile sand 5.5Kg, with additional fertilizers and 80% of field capacity. For the evaluation of inoculum doses opening was arranged in 5 rows in each tray and the treatments applied to the quantities evaluated with 4 repeated, with a repetition of each tray. Two days after inoculation, 50 seeds were sown in each tray. This procedure was performed twice, each time with a different cultivar. We evaluated the germination and the damage to the root system, considered the end that 25g enough to cause damage. Evaluations were carried germination and sanity 40 cultivars which 10 were selected to be used in the final assay. Finally, selected cultivars were evaluated in a greenhouse in two exposure to the pathogen, with and without R. solani, forming a bi factorial (10x2) with 20 treatments. Emergence were evaluated, and tipping in pre emergency, and morphological analyzes, at 28 DAS, plant height was evaluated, fresh and shoot dry, fresh and dry weight of root and root length and volume. For emergencies, there was no significant difference between cultivars without inoculation, however, in inoculum exposure conditions NS 5959 cultivars, TEC 6070 IRGA and ZIP 64 proved superior. To rot in pre-emergency assessments to grow with higher rates was the BMX NIB, with 53.86% of the seeds. For seedling height, the earliest cultivars showed the highest values, with the NS 5959 and V-TOP with the best rates. Both fresh weight as the shoot dry mass did not differ among cultivars and treatments. The analysis of the root system showed better results for cultivars IRGA TEC 6070, NS 5959, CEP 64 and V-TOP to root length, V-TOP and TEC IRGA 6070 for fresh and dry weight of root and root volume. Pathogen confirmation evaluation, the result was positive for all analyzes. In conclusion, you can see very vulnerable cultivars to R. solani, which is an important pathogen found in lowland conditions and can cause major yield losses. / O objetivo deste trabalho foi avaliar a resistência genética de cultivares comerciais quanto aos possíveis danos causados por Rhizoctonia solani em condições de umidade controlada. Para isso o trabalho foi dividido em partes, onde teve início a partir da obtenção do patógeno identificado no grupo de anastomose AG-4, responsável principalmente por causar podridões ao sistema radicular e tombamento de plântulas de soja. Em seguida foi realizada a sua propagação em laboratório, cultivado em placas de petri, e após em um meio de cultura utilizando farinha de milho, areia e água destilada, onde avaliou-se doses de inóculo distintas (0, 5, 15, 25 e 40 g) visando adequar as condições necessárias para obter os danos. Para os ensaios em casa de vegetação, todas as unidades experimentais foram formadas por uma bandeja de polietileno com capacidade para 2,5 L, contendo 5,5Kg de areia estéril, com adubação complementar e com 80% da capacidade de campo. Para a avaliação das doses de inóculo, procedeu-se a abertura de 5 linhas em cada bandeja e aplicou-se os tratamentos com as quantidades avaliadas, com 4 repetição, sendo cada bandeja uma repetição. Dois dias após a inoculação, foram semeadas 50 sementes em cada bandeja. Esse procedimento foi realizado duas vezes, sendo cada vez, com uma cultivar distinta. Avaliou-se a germinação e os danos causados ao sistema radicular, considerado ao final que 25g suficiente para causar danos. Procedeu-se avaliações de germinação e sanidade de 40 cultivares, onde 10 foram selecionadas para serem utilizadas no ensaio final. Por fim, as cultivares selecionadas foram avaliadas em casa de vegetação em duas condições de exposição ao patógeno, com e sem R. solani, formando um esquema bi fatorial (10x2) com 20 tratamentos. Foram avaliadas emergência de plântulas, e tombamento em pré emergência, e para análises morfológicas, aos 28 DAS, avaliou-se altura de plantas, massa fresca e seca da parte aérea, massa fresca e seca de raiz e comprimento e volume radicular. Para a emergência, não houve diferença significativa entre cultivares sem inoculação, porém, em condições de exposição ao inóculo as cultivares NS 5959, TEC IRGA 6070 e CEP 64 mostraram-se superiores. Para avaliações de podridão em pré-emergência, a cultivar com maiores índices foi a BMX PONTA, com 53,86% das sementes. Para altura de plântulas, as cultivares mais precoces apresentaram os maiores valores, sendo a NS 5959 e V-TOP com os melhores índices. Tanto a massa fresca quanto a massa seca da parte aérea não apresentaram diferenças estatísticas entre cultivares e entre tratamentos. Já a análise do sistema radicular mostrou melhores resultados para as cultivares TEC IRGA 6070, NS 5959, CEP 64 e V-TOP para comprimento radicular, V-TOP e TEC IRGA 6070 para massa fresca e seca de raiz e volume de raiz. Em avaliação de confirmação de patógeno, o resultado foi positivo para todas as análises realizadas. Em conclusão, é possível verificar grande vulnerabilidade de cultivares a R. solani, que é um importante patógeno encontrado em condições de várzea e que pode causar grande perdas de produtividade.

L'étude de la photochimie dans le système solaire est de toute première importance pour appréhender la chimie organique complexe au sein d'un environnement extraterrestre. Parmi ces environnements, les comètes revêtent un intérêt particulier en exobiologie puisqu'elles ont pu, ainsi que leurs grains, être des vecteurs de matière organique sur la Terre primitive et ainsi contribuer à l'émergence de la vie. Mais dans quelle mesure, la matière organique potentiellement présente au sein des grains survit-elle face aux rayonnements solaires? Ma thèse porte sur l'étude de la dégradation photochimique de trois bases azotées (adénine, guanine et uracile) et d'un acide aminé (glycine) dans les conditions du système solaire, c'est à dire soumis à des rayonnements énergétiques VUV/UV ( <300 nm). Les études conduites lors de ce travail peuvent aussi être appliquées à l'interprétation des mesures du le spectromètre de masse COSIMA présent sur l'orbiteur de la mission cométaire ROSETTA et dont l'objectif est l'analyse de la surface de grains cométaires capturés dans l'environnement de la comète 67P/Churyomov-Gerasimenko. Ce travail présente les spectres de sections efficaces d'absorption mesurés dans les domaines VUV/UV pour des films organiques purs. Ces spectres ont mené à la déduction de constantes de photolyse, ainsi qu'à l'élaboration d'un modèle simulant la cinétique de destruction globale d'un film organique optiquement épais. La confrontation entre ce modèle et les données expérimentales d'irradiation en orbite basse terrestre ainsi qu'en laboratoire a permis d'estimer les temps de vie des molécules considérées à 1 ua puis extrapolés à différentes distances héliocentriques. Les résultats obtenus ont montré que la glycine, l'adénine et la guanine, potentiellement présentes au sein des grains cométaires, seraient totalement détruites entre le moment de l'éjection des grains du noyau cométaire et l'arrivée sur Terre si elles sont en surface. En sous-surface, elles sont au contraire très stables, de part la protection efficace que leur confèrent les minéraux constitutifs du grain contre les rayonnements solaires. Dans le cadre de la mission ROSETTA, les résultats diffèrent. Au plus loin du soleil, à 3,5 ua, l'abondance des molécules ne diminuerait pas de façon significative pendant le temps de parcours des grains entre le noyau et l'orbiteur. Au périhélie, la "survie" des molécules dépendra fortement de la distance noyau-orbiteur. Les pertes significatives des 3 molécules par photochimie n'auraient lieu que si l'orbiteur se situe au moins à quelques centaines de kilomètres du noyau / The study of photochemistry in the solar system is of prime importance to assess complex organic chemistry in an extraterrestrial environment. Among those environments, comets are subject to a particular interest in the context of exobiology, along with their grains, as they could have bring organic matter on the primitive earth, and hence contribute to the emergence of life. But to what extent does the organic matter potentially with in grains survive face to solar radiation? My thesis deals with the study of photochemical degradation of three nitrogenous bases (adenine, guanine and uracil) and one amino acid ( glycine) in the conditions of the solar system, which means subject to VUV/UV energetically radiations ( <300 nm). Studies performed during this work can also be applied to the interpretation of COSIMA mass spectrometer, present on the cometary mission ROSETTA, which aims to analyze the surface of cometary grains captured in the environment of the 67P/Churyomov-Gerasimenko comet. This work present absorption cross section spectrum measured in the VUV/UV range, for pure organic films. These spectrum led to the deduction of photolysis rate constants, and to the elaboration of a model simulating the global kinetic of destruction of a optically thick organic film. The comparison between this model and experimental data of low earth orbit irradiation as well as laboratory data allowed to estimates lifetimes for the considered molecules at 1 AU, and then extrapolated at different heliocentrically distances. Results show that glycine, adenine and guanine, potentially existing inside the cometary grains, would be entirely destroyed between the ejection of the grains and the arrival on earth if they exist at the surface. Below the surface, they are at the contrary very stable, thanks the effective protection of the mineral constitutive of the grain against solar radiations. In the frame of ROSETTA mission, results differ. At the farther of the sun, at 3.5 AU, the abundance of the molecule would not significantly decrease during the time of travel of grains between the core and the orbiter. At the perihelia, the survival of molecule strongly depends of the core-orbiter distance. Significant loss of the 3 molecules by photochemistry would only occurred if the orbiter is at more than hundred of kilometers from the core

Afin de s'adapter à son environnement chimique, l'organisme a développé au cours de l'évolution des systèmes enzymatiques capables de transformer de nombreuses molécules étrangères ou xénobiotiques (médicaments, composés toxiques, carcinogènes...), le plus souvent de nature hydrophobe, en métabolites suffisamment hydrophiles pour être plus facilement excrétés par voie urinaire et/ou biliaire. Certaines de ces enzymes sont également impliquées dans des processus cataboliques ou de biosynthèses de composés endogènes (acides gras, rétinoïdes, stéroïdes, prostaglandines…). Ces enzymes jouent ainsi un rôle fondamental à la fois dans la défense de l'organisme face à son environnement chimique et dans des processus physiologiques essentiels. On comprend dès lors que s'il existe, chez certains individus, des anomalies de séquence ou de structure des gènes codant pour ces enzymes, une partie de la population présentera une susceptibilité particulière à certaines molécules de l'environnement, voire des dysfonctionnements de certaines réactions biologiques indispensables. Les travaux de cette thèse s'inscrivent dans cette démarche. Dans un premier temps, ils ont consisté à évaluer la nature et l'étendue de la variabilité de la séquence nucléotidique de trois gènes codants pour les enzymes CYP4A11, CYP4A22 et la Glycine N-acyltransférase (GLYAT). Dans un deuxième temps, les analyses fonctionnelles des variations de séquence identifiées ont été abordées par des approches in silico et in vitro. Les cytochromes P450 CYP4A11 et CYP4A22, participent à la biotransformation de composés endogènes et sont impliqués plus particulièrement dans la voie d’activation de l’acide arachidonique. Des travaux récents suggèrent que des anomalies génétiques de ces enzymes constituent des facteurs de susceptibilité à l’hypertension artérielle chez l’homme. Nous avons ainsi analysé les variations de séquence du gène CYP4A11 et CYP4A22 dans des échantillons d'ADN provenant de volontaires sains. Au total, 26 polymorphismes ont été identifiés et 5 nouveaux CYP4A* allèles ont été caractérisés pour chaque isoforme CYP4A. Les structures 3D des protéines CYP4A ont été construites et validées pour l’analyse de l’impact des mutations identifiées. Bien que des travaux supplémentaires soient nécessaires pour confirmer le lien entre le polymorphisme génétique du CYP4A11 et du CYP4A22 et l’hypertension artérielle, ce travail représente la première description et caractérisation du polymorphisme génétique des isoformes CYP4A dans une population Française. De plus, nous avons mise en évidence une variabilité interethnique de ce polymorphisme génétique dans différentes populations testées. La glycine N-acyltransférase ou GLYAT est une enzyme impliquée dans la détoxication de xénobiotiques contenant un groupement carboxylique par conjugaison d’un résidu de glycine. Sept variations de séquence de la GLYAT ont été identifiées et quatre nouveaux GLYAT* allèles ont été caractérisés. La localisation des certaines mutations dans des structures secondaires très conservées de la protéine suggère un impact sur l’activité catalytique de cette enzyme. Bien que les conséquences cliniques potentielles de ces variations restent encore à étudier, ces résultats seront utiles pour de futures études d’association de ce polymorphisme génétique de la GLYAT avec les altérations de détoxications de xénobiotiques contenant un groupement carboxylique comme l’aspirine, certains pesticides ou le toluène. / Through evolution, in order to adapt to its chemical environment, the human organism has developed enzymatic systems that can transform exogenous molecules or xenobiotic (drugs, toxins, carcinogens…), generally of hydrophobic nature, in metabolites more easily excretable via urinary or biliary tract. Some of these enzymes are also involved in catabolic processes or in the biosynthesis of endogenous compounds (fatty acids, retinoids, steroids, prostaglandins…). These enzymes thus play a major role in the protective response of the body toward chemicals and in essential physiological processes. The existence of anomalies in the sequence or structure of the genes encoding these enzymes can expose carriers of these anomalies to particular susceptibility toward xenobiotics or to impairment of essential biological reactions. In a first step, we investigated the nature and extent of the sequence variability of three genes coding for the enzymes CYP4A11, CYP4A22 and Glycine N-acyltransferase (GLYAT). In a second step, functional analyses of sequence variations were carried out, by in silico and in vitro experiments. The CYP4A11 and CYP4A22 genes are the only members of the human CYP4A subfamily. The activity of the recently identified CYP4A22 isoform is still unknown, but the CYP4A11 isoform is know as a &#969;-hydroxylase of the arachidonic acid, which converted into 20-hydroxyeicosatetraenoic acid (20-HETE). Several studies have shown that genetic anomalies of CYP4A are likely to contribute for susceptibility to hypertension in humans. We analyzed the sequence variations of the CYP4A11 and CYP4A22 genes in genomic DNA samples of healthy volunteers. A total of 26 polymorphisms were identified and 5 novel CYP4A* alleles were characterized for each CYP4A gene. The CYP4A 3D models were built and validated to analyse the potential impact of sequence variations identified. This work represents the first description and characterisation of genetic polymorphism of the human CYP4A genes in a French population. The glycine N-acyltranferase or GLYAT plays an important role in the detoxification of xenobiotics containing a carboxylic group via conjugation with a glycine residue. Seven sequence variations of the GLYAT gene were identified and four novel GLYAT* alleles were characterized. Localisation of missense mutations in predicted secondary structures suggest that these variants might have a potential role on the GLYAT protein activity. These results could be helpful in investigating the potential association of GLYAT variants with an incidence of reduced efficiency in xenobiotic carboxylic acids detoxification in humans, such as acetylsalicylic acid, pesticides, and solvents (Toluene).

Made available in DSpace on 2016-01-26T18:56:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Leila.pdf: 151367 bytes, checksum: 8d608bf8fde1f905b52307aca18e1344 (MD5) Previous issue date: 2007-05-07 / An experiment with soybean (cv. Conquista) was conduced in greenhouse, using samples of soil in areas under culture of pastures and annual cultures, obtained from seven cities of the region west of São Paulo. It was evaluated component of the nitrogen fixation and competitiveness of the strains of Bradyrhizobium recommended in reply the inoculation in soybean. The inoculation in the majority of the treatments had effect which is reflected in the increment of nodulation and accumulation of total N yield. The parameter numbers and dry mass of nodules in the soybean root showed significant interaction with local variables and evaluated inoculation. The increase of the nodulation in soybean inoculated in acid soil shows good adaptation of the recommended strains. The strain SEMIA 5080 was found in the majority of the nodules evaluated in the sorological typification. / Foi realizado um experimento com soja (cv. conquista), em casa de vegetação, utilizando-se amostras de solo de áreas sob cultivo de pastagens e culturas anuais, oriundas de sete municípios da região oeste paulista. Foram avaliados componentes da fixação biológica de nitrogênio e competitividade das estirpes de Bradyrhizobium em resposta à inoculação comercial em soja. Houve resposta à inoculação na maioria dos locais avaliados, o que refletiu na maior nodulação e acúmulo de N total na parte aérea. Os parâmetros número e massa seca de nódulos na raiz de soja apresentaram interação significativa com as variáveis, local e inoculação avaliadas. O aumento da nodulação da soja inoculada em solos ácidos mostra boa adaptação das estirpes recomendadas para o uso em inoculantes comerciais para os locais avaliados. A estirpe SEMIA 5080 foi encontrada na maioria dos nódulos avaliados na tipificação sorológica.

Made available in DSpace on 2016-07-18T17:51:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Leila.pdf: 151367 bytes, checksum: 8d608bf8fde1f905b52307aca18e1344 (MD5) Previous issue date: 2007-05-07 / An experiment with soybean (cv. Conquista) was conduced in greenhouse, using samples of soil in areas under culture of pastures and annual cultures, obtained from seven cities of the region west of São Paulo. It was evaluated component of the nitrogen fixation and competitiveness of the strains of Bradyrhizobium recommended in reply the inoculation in soybean. The inoculation in the majority of the treatments had effect which is reflected in the increment of nodulation and accumulation of total N yield. The parameter numbers and dry mass of nodules in the soybean root showed significant interaction with local variables and evaluated inoculation. The increase of the nodulation in soybean inoculated in acid soil shows good adaptation of the recommended strains. The strain SEMIA 5080 was found in the majority of the nodules evaluated in the sorological typification. / Foi realizado um experimento com soja (cv. conquista), em casa de vegetação, utilizando-se amostras de solo de áreas sob cultivo de pastagens e culturas anuais, oriundas de sete municípios da região oeste paulista. Foram avaliados componentes da fixação biológica de nitrogênio e competitividade das estirpes de Bradyrhizobium em resposta à inoculação comercial em soja. Houve resposta à inoculação na maioria dos locais avaliados, o que refletiu na maior nodulação e acúmulo de N total na parte aérea. Os parâmetros número e massa seca de nódulos na raiz de soja apresentaram interação significativa com as variáveis, local e inoculação avaliadas. O aumento da nodulação da soja inoculada em solos ácidos mostra boa adaptação das estirpes recomendadas para o uso em inoculantes comerciais para os locais avaliados. A estirpe SEMIA 5080 foi encontrada na maioria dos nódulos avaliados na tipificação sorológica.

Submitted by Michele Mologni (mologni@unoeste.br) on 2017-08-29T18:09:13Z No. of bitstreams: 1 Daniele Perreti Bettio.pdf: 593796 bytes, checksum: 557767ed1535a67decf261ceeb060bca (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-29T18:09:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Daniele Perreti Bettio.pdf: 593796 bytes, checksum: 557767ed1535a67decf261ceeb060bca (MD5) Previous issue date: 2017-03-30 / In the western region of São Paulo, the great problem with degraded pastures and sandy soils has been minimized with the implantation of systems that integrate crops and livestock. The objective of the present work was to evaluate biometric and biochemical changes in soybean crop and the impacts caused by soil microbiology in response to different management practices in a crop - livestock integration system in its third year of implementation. For this, soil samples were collected from an area under an integration system and different soil management, in its third experimental year, which is located at the Experimental Farm of UNOESTE, in the municipality of Presidente Bernardes - SP. Vessels with a capacity of 5 kg were filled with soil and afterwards the sowing of soybean cultivar RIBER 6813 RR was carried out. The pots with the plants were arranged in the vegetation of the University of the West - UNOESTE, in Presidente Prudente - SP, under periodic irrigation and controlled conditions of temperature and humidity for 60 days.The experimental design was completely randomized in a double factorial system (2x5) with six replications. The treatments consisted of scarification of the soil and different fertilizations: T0 = Control (fertilization only of soybean planting); T1 = Liming; T2 = Liming + Gypsum; T3 = Liming + Gypsum + NPK; and T4 = Liming + Gypsum + NPK + Micronutrients. Microbiological analyzes of the soil (carbon and microbial nitrogen, basal respiration and enzymatic activity (dehydrogenase)) were also carried out. Biochemical analyzes of the plants (MDA, total phenols and peroxidase), soya growth and nodulation were also performed. The results were submitted to the Tukey test at the 5% probability level. Soil scarification and fertilization with micronutrients provided, in the third experimental year, a reduction in microbiological indicators in the soil, after its effectiveness in the production system. The system of production without scarification with liming only, at the beginning of the implantation, increased the microbial biomass and maintained the microbial quotient in values suitable for sustainable agricultural systems. The secondary metabolism in soybean indicated that, in the third experimental year, there was an increase in the compounds related to the defense of the plants in the management with less chemical and physical interventions of the soil. / Na região do Oeste Paulista o grande problema com pastagens degradadas e solos arenosos vem sendo minimizado com implantações de sistemas que integram lavoura e pecuária. O objetivo do presente trabalho foi avaliar alterações biométricas e bioquímicas na cultura da soja e os impactos ocasionados na microbiologia do solo em resposta a diferentes manejos impostos em um sistema de Integração Lavoura – Pecuária, em seu terceiro ano de implantação. Para tanto, foram coletadas amostras de solo de uma área conduzida sob sistema de integração e diferentes manejos do solo, em seu terceiro ano experimental, a qual está localizada na Fazenda Experimental da UNOESTE, no município de Presidente Bernardes – SP. Vasos com capacidade de 5 Kg foram preenchidos com o solo e posteriormente foi realizada a semeadura da cultivar de soja RIBER 6813 RR. Os vasos com as plantas ficaram dispostos na casa de vegetação da Universidade do Oeste Paulista – UNOESTE, em Presidente Prudente – SP, sob irrigação periódica e condições controladas de temperatura e umidade, durante 60 dias. O delineamento experimental empregado foi inteiramente ao acaso em sistema fatorial duplo, (2x5) com seis repetições. Os tratamentos na área experimental consistiam em escarificação do solo e diferentes adubações: T0 = Controle (apenas adubação de plantio da soja); T1 = Calagem; T2 = Calagem + Gesso agrícola; T3 = Calagem + Gesso agrícola + NPK; e T4 = Calagem + Gesso agrícola + NPK + Micronutrientes. Foram realizadas análises microbiológicas do solo (carbono e nitrogênio microbiano, respiração basal e atividade enzimática (desidrogenase)), também foram realizadas análises bioquímicas das plantas (MDA, fenóis totais e peroxidase), avaliação de crescimento e nodulação da soja. Os resultados foram submetidos ao Teste de Tukey ao nível de 5% de probabilidade. A escarificação do solo e as adubações com micronutrientes proporcionaram, no terceiro ano experimental, após sua efetivação no sistema de produção, redução nos indicadores microbiológicos no solo. O sistema de produção sem escarificação com intervenção apenas da calagem, no início da implantação, elevou a biomassa microbiana e manteve o quociente microbiano em valores adequados para sistemas agrícolas sustentáveis. O metabolismo secundário na soja indicou que, ainda no terceiro ano experimental, houve aumento nos compostos relacionados com a defesa das plantas nos manejos com menos intervenções químicas e físicas do solo.