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Análise filogenética entre Citrus spp. e Guignardia spp

Pereira, Fernanda Dias [UNESP] 27 February 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:09Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-27Bitstream added on 2014-06-13T20:33:54Z : No. of bitstreams: 1 pereira_fd_me_jabo.pdf: 415622 bytes, checksum: 3ed753ebff04eb379e6987cc2a0756c8 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A citricultura brasileira representa um importante segmento econômico na pauta de produtos agrícolas, não só por seu expressivo valor de produção, como por sua importância na geração de empregos diretos e indiretos. No mundo, o Brasil destaca-se como maior produtor de citros, e exportador de suco concentrado de laranja. Entretanto, a citricultura ressente-se de problemas complexos, de natureza diversa, com particular destaque para o de ordem fitossanitária. Dentre esses problemas destaca-se a Mancha Preta dos Citros (MPC), causada pelo fungo Guignardia citricarpa. A doença deprecia os frutos para o mercado in natura e restringe a possibilidade de exportação. Além disso, provoca a queda prematura dos frutos e eleva o custo de produção devido à necessidade de controle. O presente trabalho teve o objetivo de estabelecer relações filogenéticas entre Citrus spp. e Guignardia spp., entender a origem evolutiva do patossistema Citrus – G. citricarpa, bem como avaliar a ocorrência de G. citricarpa como patógeno em momentos distintos na história evolutiva de Citrus. Os dados filogenéticos foram gerados utilizando-se marcadores moleculares do tipo AFLP e sequenciamento da região ITS1-5.8S-ITS2, em ambos os gêneros. As análises filogenéticas foram realizadas no programa PAUP* v.4.0b10. Os resultados das análises filogenéticas utilizando AFLP foram mais informativos que aqueles gerados com base no sequenciamento da região ITS1-5.8S-ITS2, tanto para Citrus quanto para Guignardia. As análises de AFLP permitem concluir que G. citricarpa e G. mangiferae, isoladas de C. medica, apresentam maior distância filogenética em relação aos isolados das outras espécies cítricas. A evolução do patossistema Citrus/Guignardia não pôde ser estabelecida, de forma geral, por meio da associação das filogenias... / The Brazilian citriculture represents an important economic sector in the agenda of agricultural products, not only for its impressive production value, for its importance in generating direct and indirect jobs. In the world, Brazil stands out as the largest citrus producer and exporter of concentrated orange juice. However, the citriculture suffers from complex problems of diverse nature, with particular emphasis on plant health. Among these problems highlight the Black Spot of Citrus (BSC), caused by the fungus Guignardia citricarpa. The disease depreciates the fruit for the fresh market and restricts the ability to export. Furthermore, causes the fall premature fruit and raises the cost of production due to need for control. This study aimed to establish phylogenetic relationships between Citrus and Guignardia, understanding the evolutionary origin of pathosystem Citrus - G. citricarpa, and to evaluate the occurrence of G. citricarpa pathogen at different period in evolutionary history of Citrus. The phylogenetic data were generate for both genera using AFLP molecular markers and ITS1-5.8S-ITS2 sequencing . Phylogenetic analysis were performed in the PAUP * v.4.0b10 program. The phylogenetic analysis using AFLP were more informative than ITS1-5.8S-ITS2 sequencing in both genera Citrus and Guignardia. The AFLP analysis conclude that G. citricarpa and G. mangiferae isolated from C. medica presents a larger phylogenetic distance if compared to the other citrus spp. strains. The evolution of the pathosystem Citrus/Guignardia could not be established, in general, through the association of phylogenies generated for Citrus spp. and Guignardia spp. except in the particular case of bo isolated from C. medica, which follow a pattern of associations in pathogen/endophyte
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Análise filogenética entre Citrus spp. e Guignardia spp. /

Pereira, Fernanda Dias. January 2012 (has links)
Orientador: Silvana Giuliatti / Banca: Ana Lilia Alzate Marin / Banca: Gabriella Souza Cintra / Resumo: A citricultura brasileira representa um importante segmento econômico na pauta de produtos agrícolas, não só por seu expressivo valor de produção, como por sua importância na geração de empregos diretos e indiretos. No mundo, o Brasil destaca-se como maior produtor de citros, e exportador de suco concentrado de laranja. Entretanto, a citricultura ressente-se de problemas complexos, de natureza diversa, com particular destaque para o de ordem fitossanitária. Dentre esses problemas destaca-se a Mancha Preta dos Citros (MPC), causada pelo fungo Guignardia citricarpa. A doença deprecia os frutos para o mercado in natura e restringe a possibilidade de exportação. Além disso, provoca a queda prematura dos frutos e eleva o custo de produção devido à necessidade de controle. O presente trabalho teve o objetivo de estabelecer relações filogenéticas entre Citrus spp. e Guignardia spp., entender a origem evolutiva do patossistema Citrus - G. citricarpa, bem como avaliar a ocorrência de G. citricarpa como patógeno em momentos distintos na história evolutiva de Citrus. Os dados filogenéticos foram gerados utilizando-se marcadores moleculares do tipo AFLP e sequenciamento da região ITS1-5.8S-ITS2, em ambos os gêneros. As análises filogenéticas foram realizadas no programa PAUP* v.4.0b10. Os resultados das análises filogenéticas utilizando AFLP foram mais informativos que aqueles gerados com base no sequenciamento da região ITS1-5.8S-ITS2, tanto para Citrus quanto para Guignardia. As análises de AFLP permitem concluir que G. citricarpa e G. mangiferae, isoladas de C. medica, apresentam maior distância filogenética em relação aos isolados das outras espécies cítricas. A evolução do patossistema Citrus/Guignardia não pôde ser estabelecida, de forma geral, por meio da associação das filogenias... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Brazilian citriculture represents an important economic sector in the agenda of agricultural products, not only for its impressive production value, for its importance in generating direct and indirect jobs. In the world, Brazil stands out as the largest citrus producer and exporter of concentrated orange juice. However, the citriculture suffers from complex problems of diverse nature, with particular emphasis on plant health. Among these problems highlight the Black Spot of Citrus (BSC), caused by the fungus Guignardia citricarpa. The disease depreciates the fruit for the fresh market and restricts the ability to export. Furthermore, causes the fall premature fruit and raises the cost of production due to need for control. This study aimed to establish phylogenetic relationships between Citrus and Guignardia, understanding the evolutionary origin of pathosystem Citrus - G. citricarpa, and to evaluate the occurrence of G. citricarpa pathogen at different period in evolutionary history of Citrus. The phylogenetic data were generate for both genera using AFLP molecular markers and ITS1-5.8S-ITS2 sequencing . Phylogenetic analysis were performed in the PAUP * v.4.0b10 program. The phylogenetic analysis using AFLP were more informative than ITS1-5.8S-ITS2 sequencing in both genera Citrus and Guignardia. The AFLP analysis conclude that G. citricarpa and G. mangiferae isolated from C. medica presents a larger phylogenetic distance if compared to the other citrus spp. strains. The evolution of the pathosystem Citrus/Guignardia could not be established, in general, through the association of phylogenies generated for Citrus spp. and Guignardia spp. except in the particular case of bo isolated from C. medica, which follow a pattern of associations in pathogen/endophyte / Mestre
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Influência de fontes e doses de fungicidas cúpricos e estrobilurinas aplicadas em consonância com eventos chuvosos no controle da mancha preta dos citros /

Franco, Danilo January 2017 (has links)
Orientador: Antonio de Goes / Banca: Tais Ferreira de Almeida / Banca: Rita de Cássia Panizzi / Banca: Gabriella Souza Cintra / Banca: Walter Maldonado Júnior / Resumo: Neste estudo, foram realizados três experimentos (E1, E2 e E3). Os dois primeiros experimentos (E1 e E2) referem-se a avaliações da eficiência dose-resposta dos fungicidas hidróxido de cobre (HC), oxicloreto de cobre (OC) e óxido cuproso (OCp), aplicados nos estádios F1 e F2, no controle de Phyllosticta citricarpa, agente causal da mancha preta dos citros (MPC). E, no terceiro experimento (E3), foi avaliada a influência da aplicação de piraclostrobina em consonância com eventos chuvosos, no controle da MPC. Em E1 e E2 os fungicidas e dosagens avaliadas foram (g de cobre metálico 100 L-1 de calda): HC (43,7; 35,0; e 26,2; OC (100,8; 90,7; e 68,0) e; OCp (90,0; 56,3; e 42,2). No experimento E1 foram utilizadas plantas de laranjeira 'Pera', sob condições naturais de infecção, em Olímpia/SP. Foi adotado o delineamento experimental de blocos ao acaso, com quatro repetições. Cada parcela foi constituída de 33 plantas. Os fungicidas foram aplicados mediante turbopulverizador e vazão de 135 mL de calda m-3 de copa. Posteriormente, em todos os tratamentos, a partir do estádio F4 foram realizadas quatro aplicações de azoxistrobina a 75 g de i.a. 2.000 L-1, em intervalo de 42 dias. Foram realizadas quatro avaliações mensais, de agosto a novembro, amostrando-se casualmente 100 frutos nas seis plantas centrais da parcela, determinando-se a incidência (I) e severidade dos sintomas mediante escala de notas. A partir dos dados de severidade dos sintomas foi determinado o índice de doença (ID... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In this study, three experiments were performed (E1, E2 and E3). The first two experiments refer to the rate-response efficiency of the fungicides copper hydroxide (HC), copper oxychloride (OC) and cuprous oxide (OCp) in the control of Phyllosticta citricarpa, causal agent of citrus black spot (CBS). And the third (E3) the influence of pyraclostrobin application was evaluated in consonance with rainy events. In E1 and E2 the evaluated rates were: HC (43.7; 35.0; and 26.2 g of metallic copper 100L-1); OC (100.8, 90.7, and 68.0 g of metallic copper 100L-1); OCp (90.0, 56.3, and 42.2 g of metallic copper 100L-1). The experiment (E1) was conducted under natural infection by P. citricarpa in 'Pera' sweet orange planted in Olímpia/SP. A randomized blocks design was used, with four replications. Each plot was represented by 33 plants. The fungicides were applied in stages F1 and F2 by turbosprayer and 135 ml m-3 of the tree canopy. Subsequently, in F4 stage, all treatments were treated with azoxystrobin at 75 g 2000 L-1, four times in a 42-day interval. Four monthly evaluations were performed, from August to November, evaluating 100 fruits to determining the incidence and symptoms severity. Data were used to determined area under disease progress curve (AUDPC). In E2, a 'Pera' sweet orange plants were used, also located in Olímpia/SP. The treatments evaluated were similar those previously in E1, but were applied by a manual "De Vilbs" sprayer, with sufficient volum for uniform fruit... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Controle da mancha preta dos citros via fungicida cúprico e validação da produção de frutos cítricos em área não livre da doença : estudo de caso /

Fonseca, Antonio Eduardo January 2017 (has links)
Orientador: Antonio de Goes / Banca: Gabriella Souza Cintra / Banca: Walter Maldonado Júnior / Banca: Fernando Alvez de Azevedo / Banca: Fernanda Dias Pereira / Resumo: A mancha preta dos citros (MPC) é uma doença que causa lesões em frutos e queda prematura, levando a prejuízos de produção e rejeição no mercado consumidor. O uso de fungicidas sistêmicos ainda é a principal alternativa de controle, no entanto, se depara com os principais problemas do seu uso excessivo como acúmulo de resíduos nos frutos, seleção de estirpes resistentes e toxicidade ambiental. A busca por um controle alternativo pode envolver a aplicação de fungicidas cúpricos isoladamente, em intervalos reduzidos, no período de suscetibilidade do patógeno. Sendo assim, o trabalho teve como objetivos verificar o controle de MPC mediante a aplicação de fungicida cúprico em intervalo de 15 dias em diferentes dosagens e a validação da produção de frutos em padrão de exportação tomando como referência estudo de caso em propriedade localizada no município de Estiva Gerbi/SP. O experimento foi instalado no município de Bebedouro/SP durante a safra 2014/15, em pomar comercial de variedade 'Valência'. O delineamento experimental utilizado foi em blocos casualizados, com sete tratamentos. Foi adotado como referência o fungicida oxicloreto de cobre. Os tratamentos (em doses do produto comercial) avaliados foram: zero (testemunha), 37,5; 50; 75; 100 e 125 mL 100 L-1. Com vistas a análises comparativas adotou-se um tratamento adicional, constituído pelo convencionalmente empregado pela respectiva propriedade. Este tratamento foi composto pela aplicação do fungicida cúprico óxido cuproso ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The citrus black spot (MPC) is a disease that causes lesions in fruits and premature fall, leading to losses of production and rejection in the consumer market. The use of systemic fungicides is the main control alternative, however, it faces the main problems of its excessive use as accumulation of residues in the fruits, and environmental toxicity. The search for an alternative control can involve the application of copper fungicides isolated, at reduced intervals, during the period of susceptibility of the pathogen. Therefore, the objective of this study was to verify MPC control by means the application of copper fungicide in interval of 14 days in different dosages and the validation of fruit production in export pattern taking as reference a case study in property located in the municipality of Estiva Gerbi/SP. The experiment was installed in the Bebedouro/SP city during the 2014/15 harvest, in a commercial orchard of 'Valencia' variety. The experimental was a randomized block design with seven treatments. The fungicide copper oxychloride was used as reference. The treatments (in doses of commercial product) evaluated were: zero (control), 37.5; 50; 75; 100 and 125 mL 100 L-1. With a view to comparative analysis, an additional treatment was adopted, constituted by the conventionally employed by the respective property. This treatment was composed by the application of the fungicide cuprous oxide and fungicide of the strobilurin group. The applications were performed at ... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Intensidade da mancha preta dos citros em função de variáveis meteorológicas

Ninin, Mariana Viléla Lopes [UNESP] 06 January 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-01-06Bitstream added on 2014-06-13T19:44:37Z : No. of bitstreams: 1 ninin_mvl_dr_jabo.pdf: 504046 bytes, checksum: c4d5fb01770f50731225baa2e8790ca0 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundecitrus / O objetivo do presente trabalho foi construir modelos de favorabilidade para a expressão dos sintomas da mancha preta dos citros no estado de São Paulo e elaborar mapas de zonas de risco da expressão dos sintomas. Desenvolveu-se um sistema empírico com base em um banco de dados da ocorrência da doença e das condições climáticas, em campo, nos municípios de Barretos, Pedranópolis e Taquarituba, durante as Safras 2007/2008 e 2008/2009. A variedade de laranjeira doce utilizada nos experimentos foi a ‘Valência’ enxertada sobre limoeiro ‘Cravo’, com 10 anos de idade. Para a incidência da mancha preta foi avaliada a porcentagem de frutos com sintomas na planta e para a severidade, a porcentagem de casca lesionada por fruto. Na análise de regressão as variáveis climáticas e os dados de intensidade de doença foram selecionados no procedimento stepwise no programa SAS. Para a elaboração dos mapas de zonas de risco foram utilizados dados meteorológicos referentes as safras 2003/2004 e 2004/2005. Os modelos utilizados foram os construídos para o município de Pedranópolis que estava localizado na região 1 (Auriflama, Jales e Votuporanga), para o município de Barretos (região 2) e para o município de Taquarituba na região 3 (Tatuí e Campinas). A frequência dos dados foi horária e após a contabilização dos índices, foram calculadas as porcentagens de dias favoráveis à ocorrência das doenças durante o ano e em períodos pré-definidos. A partir destas informações, foram gerados os mapas temáticos do Estado de São Paulo, com a distribuição espacial da porcentagem de dias favoráveis à ocorrência das doenças. Os mapas de favorabilidade da mancha preta dos citros gerados com dados de campo apresentam a região Norte, central e Sudeste do estado de São Paulo com a maior porcentagem de dias favoráveis à expressão dos sintomas da doença... / The objective this study was to build forecasting models for the expression of citrus black spot in the state of Sao Paulo and produce maps of areas at risk of symptom expression. Developed an empirical system based on a database of disease occurrence and climatic conditions the city of Barretos, Pedranópolis and Taquarituba during the 2008/2009 and 2007/2008. The sweet orange variety was the 'Valencia', with 10 years. For the incidence of citrus black spot was evaluated the percentage of fruits with symptoms in the plant and the severity, the percentage of skin lesions fruit. In regression analysis climatic variables and data intensity of the disease were selected in stepwise in SAS. For maps of risk areas were used meteorological data regarding the 2004/2005 and 2003/2004. The models used were constructed for the city of Pedranópolis which was located in region 1 (Auriflama, Jales and Votuporanga), for the city of Barretos (region 2) and the region 3 Taquarituba (Tatuí and Campinas). The frequency of hourly and after accounting for the indices, we calculated the percentage of days favorable to the occurrence of disease. From this information, thematic maps were generated in the state of São Paulo, with the spatial distribution of the percentage of days favorable to the occurrence of diseases. Favorability maps of citrus black spot generated with field data show the north, central and southeastern state of Sao Paulo with the largest percentage of days favorable to the expression of disease symptoms. All citrus region of São Paulo is in favorable climatic conditions the expression of the symptoms of citrus black spot
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Intensidade da mancha preta dos citros em função de variáveis meteorológicas /

Ninin, Mariana Viléla Lopes. January 2011 (has links)
Resumo: O objetivo do presente trabalho foi construir modelos de favorabilidade para a expressão dos sintomas da mancha preta dos citros no estado de São Paulo e elaborar mapas de zonas de risco da expressão dos sintomas. Desenvolveu-se um sistema empírico com base em um banco de dados da ocorrência da doença e das condições climáticas, em campo, nos municípios de Barretos, Pedranópolis e Taquarituba, durante as Safras 2007/2008 e 2008/2009. A variedade de laranjeira doce utilizada nos experimentos foi a 'Valência' enxertada sobre limoeiro 'Cravo', com 10 anos de idade. Para a incidência da mancha preta foi avaliada a porcentagem de frutos com sintomas na planta e para a severidade, a porcentagem de casca lesionada por fruto. Na análise de regressão as variáveis climáticas e os dados de intensidade de doença foram selecionados no procedimento stepwise no programa SAS. Para a elaboração dos mapas de zonas de risco foram utilizados dados meteorológicos referentes as safras 2003/2004 e 2004/2005. Os modelos utilizados foram os construídos para o município de Pedranópolis que estava localizado na região 1 (Auriflama, Jales e Votuporanga), para o município de Barretos (região 2) e para o município de Taquarituba na região 3 (Tatuí e Campinas). A frequência dos dados foi horária e após a contabilização dos índices, foram calculadas as porcentagens de dias favoráveis à ocorrência das doenças durante o ano e em períodos pré-definidos. A partir destas informações, foram gerados os mapas temáticos do Estado de São Paulo, com a distribuição espacial da porcentagem de dias favoráveis à ocorrência das doenças. Os mapas de favorabilidade da mancha preta dos citros gerados com dados de campo apresentam a região Norte, central e Sudeste do estado de São Paulo com a maior porcentagem de dias favoráveis à expressão dos sintomas da doença... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective this study was to build forecasting models for the expression of citrus black spot in the state of Sao Paulo and produce maps of areas at risk of symptom expression. Developed an empirical system based on a database of disease occurrence and climatic conditions the city of Barretos, Pedranópolis and Taquarituba during the 2008/2009 and 2007/2008. The sweet orange variety was the 'Valencia', with 10 years. For the incidence of citrus black spot was evaluated the percentage of fruits with symptoms in the plant and the severity, the percentage of skin lesions fruit. In regression analysis climatic variables and data intensity of the disease were selected in stepwise in SAS. For maps of risk areas were used meteorological data regarding the 2004/2005 and 2003/2004. The models used were constructed for the city of Pedranópolis which was located in region 1 (Auriflama, Jales and Votuporanga), for the city of Barretos (region 2) and the region 3 Taquarituba (Tatuí and Campinas). The frequency of hourly and after accounting for the indices, we calculated the percentage of days favorable to the occurrence of disease. From this information, thematic maps were generated in the state of São Paulo, with the spatial distribution of the percentage of days favorable to the occurrence of diseases. Favorability maps of citrus black spot generated with field data show the north, central and southeastern state of Sao Paulo with the largest percentage of days favorable to the expression of disease symptoms. All citrus region of São Paulo is in favorable climatic conditions the expression of the symptoms of citrus black spot / Orientador: Modesto Barreto / Coorientador: Marcel Bellato Spósito / Banca: Érika Auxiliadora Giacheto Scaloppi / Banca: Fernando Alves Azevedo / Banca: José Carlos Barbosa / Banca: Rita de Cássia Panizzi / Doutor
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Período de incubação de Guignardia citricarpa em frutos de laranja 'Valência' e importância das pulverizações de cobre no controle da mancha preta /

Aguiar, Ronilda Lana. January 2011 (has links)
Resumo: A mancha preta dos citros (MPC), causada pelo fungo Guignardia citricarpa, produz lesões nos frutos que os depreciam para o mercado interno e os restringem para a exportação. O grande período de suscetibilidade dos frutos, em adição ao fato do patógeno causar infecções latentes, dificulta o entendimento do período de incubação da doença. O objetivo do trabalho foi determinar se o período de incubação da mancha preta do citros. Inoculou-se frutos de laranjeira 'Valência' em diferentes estádios fenológicos e também foi determinado a importância das pulverizações de fungicida cúprico, da fase de queda das pétalas e, até sete meses após, no controle da mancha preta dos citros. Os resultados obtidos indicaram uma relação linear negativa entre o período de incubação da MPC e o diâmetro dos frutos inoculados. O período de incubação em frutos inoculados, ainda imaturos (2,0, 2,5 e 3,0 cm de diâmetro), foi longo, sendo de 266 dias nos de menor diâmetro menor, enquanto que em frutos já desenvolvidos (5,0 e 7,0 cm de diâmetro) o período para expressão de sintomas foi mais curto, sendo de cerca de 30 dias. A mancha preta em frutos cítricos apresenta período de incubação variável, dependente do estádio fenológico em que os frutos tornaram-se infectados. A concentração do inóculo de Guignardia citricarpa não interfere no período de incubação da doença. Em relação à incidência da MPC, mesmo com seis pulverizações de cobre a cada 28 dias, 53,3% dos frutos expressaram sintomas da doença. Quanto à severidade, não há diferença de resposta entre os tratamentos. Portanto, os dados mostraram que as infecções precoces interferem na qualidade visual do fruto, porém não na produção. Com o crescimento dos frutos, as infecções interferem negativamente na produção, levando a um aumento na queda de frutos / Abstract: The citrus (Citrus spp.) black spot, caused by Guignardia citricarpa produces lesions on the fruit that depreciate the domestic market and to restrain them for export. The great period of susceptibility of the fruits in addition to the fact that the pathogen causing latent infection of complicates the understanding of the incubation period of the disease. The aim of this study was to determine the incubation period of the citrus black spot is constant or variable, inoculating fruits of 'Valência' orange at the different phenological stages and was also given the importance of copper fungicide sprays, stage of petal drop and up to seven months in the control of citrus black spot The results indicate a negative linear relationship between the incubation period of the CBS and the diameter of the fruits inoculated. The incubation period observed in fruits inoculated still immature (2,0, 2,5 and 3,0 cm diameter) was long, smaller in diameter occurred around 266 days, and fruits already developed (5,0 and 7,0 cm diameter) for the disease expression was shorter in diameter occurred in approximately 30 days. The citrus black spot has a variable incubation period depends on the phenological stages in which fruit is inoculated. The concentration of inoculum of Guignardia citricarpa not interfere with the incubation period of the disease. Regarding the incidence of CBS, even with six copper sprays every 28 days, 53.3% of the fruit expressed disease symptoms. For severity, there is no difference in response between treatments. Therefore, the data showed that early infections influence the visual quality of the fruit, but not in production. With the growth of the fruit, infections can affect negatively the production, leading to an increase in fruit drop / Doutor
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Estudo fitoquímico e quimiossitemático de Galipea, Swinglea (Rutaceae) e avaliação do potencial biológico dos compostos isolados / Phytochemistry and chemosystematic study of Galipea, Swinglea (ruataceae) and evaluated of potencial biological of isolated compounds

Cerqueira, Cristovam do Nascimento 07 June 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T20:36:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5773.pdf: 28798119 bytes, checksum: 8969d15b0ac7fba98e30be9b2199c2e7 (MD5) Previous issue date: 2011-06-07 / Financiadora de Estudos e Projetos / The Galipea genus species classifications has been confuse since genus classification. Showing no agreement among taxonomists in several classification systems since 1823. However, Kallunki & Pirani corrected errors exist in the ancient botanical classification reclassify several species of Galipeas like Conchocarpus or Angostura. Thus, it was chosen a specie of Galipea (G. carinata) and one Angostura (A.bracteata) which previously belonged to Galipea in order to evaluate a possible parallelism between the classification proposed by Kallunki & Pirani with the chemical profile of the species studied. The phytochemical studies of the A. bracteata and G. carinata no led to the isolation of the secondary metabolites, though the research literature shows a relation of parallelism between the botanical classification based on morphology of species of the genus with the same chemical this one, but this relationship was only apparent when you compare the already isolated Conchocarpus s alkaloids with those of Angostura, where it was discovered that the alkyl and alquilarilquinolinicos alkaloids present in Angostura, are absent in Conchocarpus. In turn, the acridones and indolquinazolínicos alkaloids found in Conchocarpus were not observed in Angostura. The comparison of the aforementioned genres with Galipea was not discussed due to the few reported alkaloid (2-quinolone) for the species of this genus can not be classified as this specific. The Swinglea glutinosa, a species native to Asia, possesses many reports acridones alkaloids and coumarins isolated from its fruit, stem and roots, but these metabolites are reported from polar extracts, thus having no knowledge whatsoever of metabolites of low polarity. This work is also aimed at expanding the knowledge of the chemical profile of this species. The phytochemical study of S. glutinosa led to the isolation of two triterpenes: 3α-Hidroxiglutin-5-ene (08) and friedelin (09), a diterpene (2Z)-2-methyl-[2,5,5,8 a-tetrametildecaidronaftalen-1-yl] but-2-en-1-ol (07), two steroids, sitosterol (10) and stigmasterol (11), a flavanone: pinostrobine (07) and three amides: N-benzoiltiramida (01), N-{2 - [4 - (3-oxobutoxyl) phenyl] ethyl} benzamide (02), 2 (E) N-methyl-fenilacrilamide (05), the latter being new in the literature. The amide N-{2 - [4 - (2,3-dihydroxy-3-methyl-4-oxobutoxyl) phenyl] ethyl} benzamide (03) and carboxylic acid (04) acid 4 - {4 - [2 - (benzoilamino ) ethyl] phenoxyl} -2.3-dihydroxy-2-methylbutanoic was identified by GC-MS, where these two metabolites enhance the biogenesis of novel amide via O-prenylation then the loss due to carbon dioxide in several oxidations methyl terminal. Some of the compounds have their biological activity by testing tested against the Guignardia citricarpa of growth either in vitro mycelial where only the substance (08) showed an inhibition of about 50% and substance (07) stimulated the growth of the fungus. In the inhibition test of germination and appressorium formation, which evaluates the inhibition of fungal reproductive structure that is the main way of infection, the substance (08) showed an inhibition of 93.5% and 96.5% germination and training appressoria, respectively. The substance (02) inhibited 90.5% and 94.5% germination in appressorium formation. Thus, this work took place some fungicidal compounds with potential to control the fungus G. citricarpa. / A classificação das espécies do gênero Galipea tem sido confuso desde a descrição do gênero, não mostrando concordância entre os taxonomistas em vários sistemas de classificação desde 1823. Contudo Kallunki & Pirani retificaram os erros existentes nas antigas classificações botânicas reclassificando varias espécies de Galipea como Conchocarpus ou Angostura. Desta forma, foi escolhida uma espécie de Galipea (G. carinata) e uma de Angostura (A.bracteata) que antes pertencia à Galipea no intuito de avaliar um possível paralelismo entre a classificação proposta por Kallunki & Pirani com o perfil químico das espécies estudadas. Os estudos fitoquimicos de A. bracteata e G. carinata não levaram o isolamento de metabólitos sencudários, entretanto o levantamento bibliográfico mostrou uma relação de paralelismo entre a classificação botânica baseada na morfologia das espécies do gênero com o perfil quimico das mesmas. Contudo, essa relação só foi evidenciada ao se fazer a comparação dos alcaloides já isolados da Conchocarpus com aqueles de Angostura, em que se averiguou que os alcaloides alquil- e alquilarilquinolinicos presentes na Angostura, encontravam-se ausêntes em Conchocarpus. Por sua vez, os alcaloides acridônicos e indolquinazolínicos encontrados em Conchocarpus não eram observados em Angostura. A comparação dos gêneros supracitados com Galipea não foi discutido devido aos poucos alcaloides relatados (2-quinolona) para as espécies desse gênero não podendo ser classificado como específico desta. A Swinglea glutinosa, espécie nativa da Ásia, possue muitos relatos na literatura de alcaloides acridônicos e cumarinas isoladas de seus frutos, tronco, e raízes, entretanto esses metabólitos relatados são provenientes de extratos polares, não possuindo assim conhecimento algum de metabólitos de baixa polaridade. Assim, neste trabalho também se objetivou ampliar o conhecimento do perfil químico dessa espécie. O estudo fitoquímico da S. glutinosa levou ao isolamento de dois triterpenos: 3α-Hidroxiglutin-5-eno (08) e friedelina (09); um diterpeno: (2Z)-2-metil-[2,5,5,8a-tetrametildecaidronaftalen-1- il]but-2-en-1-ol (07); dois esteroides: sitosterol (10) e estigmasterol (11); uma flavanona: pinostrobina (07); e três amidas: N-benzoiltiramida (01); N-{2-[4-(3- oxobutoxil)fenil]etil}benzamida (02); 2(E)N-metil-fenilacrilamida (05), sendo a última inédita na literatura. A amida N-{2-[4-(2,3-diidróxi-3-metil-4- oxobutoxil)fenil]etil}benzamida (03) e o ácido carboxílico (04) ácido 4-{4-[2- (benzoilamino)etil]fenoxil}-2,3-diidróxi-2-metilbutanóico foram identificados via CGEM, onde estes dois metabolitos reforçam a biogênese da amida inédita via Oprenilação seguida a perda de dióxido de carbono devido às varias oxidadações na metila terminal. Alguns dos compostos isolados tiveram sua atividade biológica avaliada frente à Guignardia citricarpa pelo ensaio de crecimento micelial in vitro onde apenas a substância (08) apresentou uma inibição de cerca de 50% e a substância (07) estimulou o crescimento do fungo. No ensaio de inibição da germinação e formação de apressórios, que avalia a inibição da estrutura reprodutiva do fungo que é a principal forma de infeção, a substância (08) apresentou uma inibição de 93,5% na germinação e 96,5% na formação de apressórios, respectivamente. A substância (02) inibiu 90,5 % na germinação e 94,5% na formação de apressórios. Sendo assim, neste trabalho verificou-se alguns compostos com potencial fungistático no controle do fungo G. citricarpa.
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Produção de estruturas reprodutivas e efeito do ambiente nos tipos de sintomas produzidos por Guignardia citricarpa em Citrus spp

Nozaki, Márcia de Holanda [UNESP] 29 March 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-03-29Bitstream added on 2014-06-13T19:04:54Z : No. of bitstreams: 1 nozaki_mh_dr_jabo.pdf: 745023 bytes, checksum: 9d7c07f38a8943e8fa117a5e301b9c6f (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A mancha preta dos citros (MPC) doença causada pelo fungo Guignardia citricarpa Kiely [anamorfo: Phyllosticta citricarpa (McAlp.)Van der Aa], deprecia comercialmente os frutos, causando sua queda prematura e elevando o custo de produção. Até o presente momento, informações acerca da etiologia da doença são escassas. Portanto, o presente trabalho teve como objetivos: (i) criar metodologias alternativas de obtenção da estrutura reprodutiva do fungo em laboratório; (ii) observar a taxa de germinação in vitro de conídios do fungo; (iii) estudar a influência da poda de plantas cítricas no campo sobre a expressão de sintomas de falsa melanose; (iv) e, a relação entre a presença de sintomas de ácaro da falsa ferrugem e sintomas do tipo mancha trincada em frutos cítricos. De maneira geral, tanto pseudotécios quanto ascósporos foram obtidos em maior número quando da utilização da metodologia de discos foliares autoclavados, bem como a maior expressão dos sintomas mediante inoculações através desta metodologia. Com os resultados obtidos, pode-se afirmar que através da realização de práticas culturais como a poda dos ramos secos, bem como o controle do ácaro da falsa ferrugem, o progresso da MPC no campo é reduzido. / Citrus black spot (CBS) disease caused by the fungus Guignardia citricarpa Kiely [anamorph: Phyllosticta citricarpa (McAlp.)Van der Aa], depreciates the fruit comercially, causing its premature fall and elevating production cost. Until the present moment, there is a lack of informations about the etiology of the disease. Therefore, the aim of the present work was: (i) create alternative methodologies to obtain reproductive structures on laboratory; (ii) observe the in vitro conidia germination rate; (iii) study the influence of the harvest of citric plants on the expression of false melanose symptoms; (iv) and the relation between the expression of symptoms of citrus rust mite on the presence of cracked spot symptoms. Both pseudothecia and ascospores were obtained in larger rate when using autoclavated leave discs, and also the larger expression of symptoms on inoculations made by this method. By the results obtained, it can be afirmed that the harvest of dead twigs, and the control of the citrus rust mite, the progress of CBS on field is reduced.
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Estudo comparativo do genoma e do transcriptoma de Phyllosticta citricarpa (fase sexual Guignardia citricarpa) agente da Mancha Preta dos Citros e Phyllosticta capitalensis

Pacheco, Inaiara de Souza [UNESP] 16 May 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-01-26T13:21:24Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-05-16Bitstream added on 2015-01-26T13:30:32Z : No. of bitstreams: 1 000795987.pdf: 998188 bytes, checksum: e6159c6f35ebfadfb6dd641749093a52 (MD5) / A Mancha Preta dos Citros (MPC), causada pelo fungo Phyllosticta citricarpa, é uma das mais importantes doenças da citricultura brasileira. No entanto, muito pouco se sabe sobre os mecanismos de patogenicidade deste patógeno na interação com seus hospedeiros. Além disso, P. citricarpa é morfologicamente muito semelhante a P. capitalensis, espécie endofítica também em citros, o que dificulta a diferenciação entre elas, gerando evidentes barreiras fitossanitárias à exportação de frutos in natura. Do mesmo modo, pouco ainda é conhecido sobre seus genomas, ainda não completamente sequenciados, assim como seus transcriptomas em diferentes condições. Assim, o objetivo geral desse trabalho foi avaliar e comparar os genomas e transcriptomas de P. citricarpa e P. capitalensis. O sequenciamento genômico com tecnologia Illumina gerou 179.880.616 reads para P. citricarpa que foram montados em 19.143 contigs, e 148.831.020 reads de P. capitalensis contidos em 11.080 contigs. Foram preditas 16.267 ORFs para a espécie patogênica e 14.813 para a espécie endofítica. Ambos os genomas são similares, com quantidades semelhantes de genes na maioria das categorias analisadas. Os transcriptomas por sua vez geraram em média 74 bilhões de reads por repetição biológica para ambas as espécies, com 3.074 transcritos diferencialmente expressos, sendo 2.637 mais expressos em P. citricarpa e 1.097 em P. capitalensis, com expressiva diferença qualitativa em ambas. P. citricarpa apresentou maior quantidade de genes expressos que P. capitalensis em quase todas as vias analisadas. A espécie endofítica apresentou maior número de genes expressos nas vias de sinalização e adesão. Além disso, os genes envolvidos na interação planta-patógeno foram também mais expressos na espécie endofítica. Os resultados obtidos dos genomas e transcriptomas de P. citricarpa e de P. capitalensis contribuem para maior compreensão da biologia dessas espécies / Citrus black spot (CBP), caused by Phyllosticta citricarpa, is one of the most important citrus disease in the Brazilian citrus industry. However, the mechanisms of pathogenicity of this pathogen during the interactions with their hosts are poorly understood. P. citricarpa is frequently associated with P. capitalensis, which is morphologically similar to the endophytic specie. This feature difficults the differentiation of both species resulting in phytossanitary barriers for in natura fruit exportation. Moreover, their genomes were not fully sequenced yet and there is a lack of knowledge of their transcriptomes in different conditions. Thus, the overall objectives of this work were to evaluate and compare the genome and transcriptome of both species. The total genome sequence was 179,880,616 reads for P. citricarpa and 148,831,020 reads for P. capitalensis assembled in 19,143 and 11,080 contigs, respectively. There were predicted 16,267 ORFs for the pathogenic specie and 14,813 for the endophytic specie. P. citricarpa and P. capitalensis presented very similar amounts of genes. The transcriptomic sequence generated on average 74 billion of reads per biological repeat for each species. There were obtained 3,074 differential expressed transcripts, 2,637 were more expressed in P. citricarpa and 1,097 in P. capitalensis. Transcriptional differences between these species were observed. P. citricarpa showed more expressed genes than P. capitalensis in most analyzed categories. The endophytic specie presented more expressed genes on signaling pathway and adhesion than the pathogenic specie. Additionally, plant-pathogen interaction genes were expressed on P. capitalensis. Thus, the results of genomic and transcriptomic analyses of the P. citricarpa and P. capitalensis contribute to the biology comprehension of these species

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