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Détection automatique de déviations chirurgicales et identification de comportements chirurgicaux par modélisation et analyse des processus chirurgicaux / Automatic detection of sugical deviations and identification of surgical behavior thanks to modelisation and analysis of surgical process

Huaulme, Arnaud 25 January 2017 (has links)
Les événements indésirables (EIs) sont devenus une vraie préoccupation du monde médical, leur réduction étant recherchée pour assurer la meilleure sécurité possible pour les patients. Les EIs sont, selon la HAS, ‘‘ des situations qui s'écartent de procédures ou de résultats escomptés dans une situation habituelle et qui sont ou qui seraient potentiellement sources de dommages’’. Alors que les EIs postopératoires sont étudiés depuis de nombreuses années, ceux ayant lieu au cours des opérations ne le sont que depuis récemment, comme le montre la récente classification des EIs intraopératoires par Kaafarani et al. publié en 2014. Cependant, la classification d'EIs intraopératoires n'est que la première étape pour comprendre les comportements chirurgicaux qui les entraînent.Dans cette thèse, nous présenterons des méthodes pour détecter l'apparition de déviations dues à l'apparition d'EIs intraopératoires et pour identifier des comportements chirurgicaux à partir de modèle de processus chirurgicaux.Ce travail a nécessité de concevoir et développer une modélisation formelle de la rectopexie et des événements indésirables qui sont associés à cette procédure chirurgicale grâceà la mise en place d'ontologies. Cette modélisation formelle nous a permis de bien appréhender le principe de cette opération et de fournir un vocabulaire permettant une annotation détaillé de vidéos endoscopiques de rectopexies, afin de créer des modèles de processus chirurgicaux en jeu.Grâce à l'annotation des vidéos chirurgicales basée sur cette modélisation, nous avons développé une une méthode de détection automatique des déviations dues à l'apparition d'événements indésirables Cette méthode est basée sur un alignement temporel non-linéaire multi-dimensionnel, que nous avons développé, suivi d'un modèle semi-Markovien caché que nous avons entraîné pour déterminer s'il existe des déviations par rapport à une chirurgie de référence et si celles-ci sont dues à des événements indésirables.Cette détection de déviations dues aux événements indésirables est la première étape afin de comprendre les raisons de leurs apparitions. Nous émettons l'hypothèse que leurs apparitions peuvent être expliquées par une succession d’activités, c'est-à-dire un pattern. Pour répondre à cette hypothèse, nous avons mis en place une méthode de découverte de patterns permettant d'identifier les comportements chirurgicaux spécifiques à différents critères. Cette identification de comportements chirurgicaux est réalisée par une classification ascendante hiérarchique avec la mise en place d'une nouvelle métrique basée sur les patterns partagés entre les chirurgies. Afin de valider notre méthode, nous l'avons comparé à deux études mettant en évidence des différences de comportements chirurgicaux, comme par exemple entre différents sites chirurgicaux ou entre deux types de procédure de la même opération. Une fois la méthode validée, nous avons utilisé notre méthode afin de montrer s'il existait des comportements chirurgicaux spécifiques à des données préopératoires et à l'apparition d'événements indésirables.Pour finir, nous revenons sur les contributions les plus importantes de ces travaux à travers une discussion générale et nous proposons différentes pistes pour améliorer nos résultats / L'auteur n'a pas fourni de résumé en anglais
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Hybrid Model Approach to Appliance Load Disaggregation : Expressive appliance modelling by combining convolutional neural networks and hidden semi Markov models. / Hybridmodell för disaggregering av hemelektronik : Detaljerad modellering av elapparater genom att kombinera neurala nätverk och Markovmodeller.

Huss, Anders January 2015 (has links)
The increasing energy consumption is one of the greatest environmental challenges of our time. Residential buildings account for a considerable part of the total electricity consumption and is further a sector that is shown to have large savings potential. Non Intrusive Load Monitoring (NILM), i.e. the deduction of the electricity consumption of individual home appliances from the total electricity consumption of a household, is a compelling approach to deliver appliance specific consumption feedback to consumers. This enables informed choices and can promote sustainable and cost saving actions. To achieve this, accurate and reliable appliance load disaggregation algorithms must be developed. This Master's thesis proposes a novel approach to tackle the disaggregation problem inspired by state of the art algorithms in the field of speech recognition. Previous approaches, for sampling frequencies <img src="http://www.diva-portal.org/cgi-bin/mimetex.cgi?%5Cleq" />1 Hz, have primarily focused on different types of hidden Markov models (HMMs) and occasionally the use of artificial neural networks (ANNs). HMMs are a natural representation of electric appliances, however with a purely generative approach to disaggregation, basically all appliances have to be modelled simultaneously. Due to the large number of possible appliances and variations between households, this is a major challenge. It imposes strong restrictions on the complexity, and thus the expressiveness, of the respective appliance model to make inference algorithms feasible. In this thesis, disaggregation is treated as a factorisation problem where the respective appliance signal has to be extracted from its background. A hybrid model is proposed, where a convolutional neural network (CNN) extracts features that correlate with the state of a single appliance and the features are used as observations for a hidden semi Markov model (HSMM) of the appliance. Since this allows for modelling of a single appliance, it becomes computationally feasible to use a more expressive Markov model. As proof of concept, the hybrid model is evaluated on 238 days of 1 Hz power data, collected from six households, to predict the power usage of the households' washing machine. The hybrid model is shown to perform considerably better than a CNN alone and it is further demonstrated how a significant increase in performance is achieved by including transitional features in the HSMM. / Den ökande energikonsumtionen är en stor utmaning för en hållbar utveckling. Bostäder står för en stor del av vår totala elförbrukning och är en sektor där det påvisats stor potential för besparingar. Non Intrusive Load Monitoring (NILM), dvs. härledning av hushållsapparaters individuella elförbrukning utifrån ett hushålls totala elförbrukning, är en tilltalande metod för att fortlöpande ge detaljerad information om elförbrukningen till hushåll. Detta utgör ett underlag för medvetna beslut och kan bidraga med incitament för hushåll att minska sin miljöpåverakan och sina elkostnader. För att åstadkomma detta måste precisa och tillförlitliga algoritmer för el-disaggregering utvecklas. Denna masteruppsats föreslår ett nytt angreppssätt till el-disaggregeringsproblemet, inspirerat av ledande metoder inom taligenkänning. Tidigare angreppsätt inom NILM (i frekvensområdet <img src="http://www.diva-portal.org/cgi-bin/mimetex.cgi?%5Cleq" />1 Hz) har huvudsakligen fokuserat på olika typer av Markovmodeller (HMM) och enstaka förekomster av artificiella neurala nätverk. En HMM är en naturlig representation av en elapparat, men med uteslutande generativ modellering måste alla apparater modelleras samtidigt. Det stora antalet möjliga apparater och den stora variationen i sammansättningen av dessa mellan olika hushåll utgör en stor utmaning för sådana metoder. Det medför en stark begränsning av komplexiteten och detaljnivån i modellen av respektive apparat, för att de algoritmer som används vid prediktion ska vara beräkningsmässigt möjliga. I denna uppsats behandlas el-disaggregering som ett faktoriseringsproblem, där respektive apparat ska separeras från bakgrunden av andra apparater. För att göra detta föreslås en hybridmodell där ett neuralt nätverk extraherar information som korrelerar med sannolikheten för att den avsedda apparaten är i olika tillstånd. Denna information används som obervationssekvens för en semi-Markovmodell (HSMM). Då detta utförs för en enskild apparat blir det beräkningsmässigt möjligt att använda en mer detaljerad modell av apparaten. Den föreslagna Hybridmodellen utvärderas för uppgiften att avgöra när tvättmaskinen används för totalt 238 dagar av elförbrukningsmätningar från sex olika hushåll. Hybridmodellen presterar betydligt bättre än enbart ett neuralt nätverk, vidare påvisas att prestandan förbättras ytterligare genom att introducera tillstånds-övergång-observationer i HSMM:en.
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Contribution to deterioration modeling and residual life estimation based on condition monitoring data / Contribution à la modélisation de la détérioration et à l'estimation de durée de vie résiduelle basées sur les données de surveillance conditionnelle

Le, Thanh Trung 08 December 2015 (has links)
La maintenance prédictive joue un rôle important dans le maintien des systèmes de production continue car elle peut aider à réduire les interventions inutiles ainsi qu'à éviter des pannes imprévues. En effet, par rapport à la maintenance conditionnelle, la maintenance prédictive met en œuvre une étape supplémentaire, appelée le pronostic. Les opérations de maintenance sont planifiées sur la base de la prédiction des états de détérioration futurs et sur l'estimation de la vie résiduelle du système. Dans le cadre du projet européen FP7 SUPREME (Sustainable PREdictive Maintenance for manufacturing Equipment en Anglais), cette thèse se concentre sur le développement des modèles de détérioration stochastiques et sur des méthodes d'estimation de la vie résiduelle (Remaining Useful Life – RUL en anglais) associées pour les adapter aux cas d'application du projet. Plus précisément, les travaux présentés dans ce manuscrit sont divisés en deux parties principales. La première donne une étude détaillée des modèles de détérioration et des méthodes d'estimation de la RUL existant dans la littérature. En analysant leurs avantages et leurs inconvénients, une adaptation d’une approche de l'état de l'art est mise en œuvre sur des cas d'études issus du projet SUPREME et avec les données acquises à partir d’un banc d'essai développé pour le projet. Certains aspects pratiques de l’implémentation, à savoir la question de l'échange d'informations entre les partenaires du projet, sont également détaillées dans cette première partie. La deuxième partie est consacrée au développement de nouveaux modèles de détérioration et les méthodes d'estimation de la RUL qui permettent d'apporter des éléments de solutions aux problèmes de modélisation de détérioration et de prédiction de RUL soulevés dans le projet SUPREME. Plus précisément, pour surmonter le problème de la coexistence de plusieurs modes de détérioration, le concept des modèles « multi-branche » est proposé. Dans le cadre de cette thèse, deux catégories des modèles de type multi-branche sont présentées correspondant aux deux grands types de modélisation de l'état de santé des système, discret ou continu. Dans le cas discret, en se basant sur des modèles markoviens, deux modèles nommés Mb-HMM and Mb-HsMM (Multi-branch Hidden (semi-)Markov Model en anglais) sont présentés. Alors que dans le cas des états continus, les systèmes linéaires à sauts markoviens (JMLS) sont mis en œuvre. Pour chaque modèle, un cadre à deux phases est implémenté pour accomplir à la fois les tâches de diagnostic et de pronostic. A travers des simulations numériques, nous montrons que les modèles de type multi-branche peuvent donner des meilleures performances pour l'estimation de la RUL par rapport à celles obtenues par des modèles standards mais « mono-branche ». / Predictive maintenance plays a crucial role in maintaining continuous production systems since it can help to reduce unnecessary intervention actions and avoid unplanned breakdowns. Indeed, compared to the widely used condition-based maintenance (CBM), the predictive maintenance implements an additional prognostics stage. The maintenance actions are then planned based on the prediction of future deterioration states and residual life of the system. In the framework of the European FP7 project SUPREME (Sustainable PREdictive Maintenance for manufacturing Equipment), this thesis concentrates on the development of stochastic deterioration models and the associated remaining useful life (RUL) estimation methods in order to be adapted in the project application cases. Specifically, the thesis research work is divided in two main parts. The first one gives a comprehensive review of the deterioration models and RUL estimation methods existing in the literature. By analyzing their advantages and disadvantages, an adaption of the state of the art approaches is then implemented for the problem considered in the SUPREME project and for the data acquired from a project's test bench. Some practical implementation aspects, such as the issue of delivering the proper RUL information to the maintenance decision module are also detailed in this part. The second part is dedicated to the development of innovative contributions beyond the state-of-the-are in order to develop enhanced deterioration models and RUL estimation methods to solve original prognostics issues raised in the SUPREME project. Specifically, to overcome the co-existence problem of several deterioration modes, the concept of the "multi-branch" models is introduced. It refers to the deterioration models consisting of different branches in which each one represent a deterioration mode. In the framework of this thesis, two multi-branch model types are presented corresponding to the discrete and continuous cases of the systems' health state. In the discrete case, the so-called Multi-branch Hidden Markov Model (Mb-HMM) and the Multi-branch Hidden semi-Markov model (Mb-HsMM) are constructed based on the Markov and semi-Markov models. Concerning the continuous health state case, the Jump Markov Linear System (JMLS) is implemented. For each model, a two-phase framework is carried out for both the diagnostics and prognostics purposes. Through numerical simulations and a case study, we show that the multi-branch models can help to take into account the co-existence problem of multiple deterioration modes, and hence give better performances in RUL estimation compared to the ones obtained by standard "single branch" models.
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Apprentissage statistique de modèles de comportement multimodal pour les agents conversationnels interactifs / Learning multimodal behavioral models for interactive conversational agents

Mihoub, Alaeddine 08 October 2015 (has links)
L'interaction face-à-face représente une des formes les plus fondamentales de la communication humaine. C'est un système dynamique multimodal et couplé – impliquant non seulement la parole mais de nombreux segments du corps dont le regard, l'orientation de la tête, du buste et du corps, les gestes faciaux et brachio-manuels, etc – d'une grande complexité. La compréhension et la modélisation de ce type de communication est une étape cruciale dans le processus de la conception des agents interactifs capables d'engager des conversations crédibles avec des partenaires humains. Concrètement, un modèle de comportement multimodal destiné aux agents sociaux interactifs fait face à la tâche complexe de générer un comportement multimodal étant donné une analyse de la scène et une estimation incrémentale des objectifs conjoints visés au cours de la conversation. L'objectif de cette thèse est de développer des modèles de comportement multimodal pour permettre aux agents artificiels de mener une communication co-verbale pertinente avec un partenaire humain. Alors que l'immense majorité des travaux dans le domaine de l'interaction humain-agent repose essentiellement sur des modèles à base de règles, notre approche se base sur la modélisation statistique des interactions sociales à partir de traces collectées lors d'interactions exemplaires, démontrées par des tuteurs humains. Dans ce cadre, nous introduisons des modèles de comportement dits "sensori-moteurs", qui permettent à la fois la reconnaissance des états cognitifs conjoints et la génération des signaux sociaux d'une manière incrémentale. En particulier, les modèles de comportement proposés ont pour objectif d'estimer l'unité d'interaction (IU) dans laquelle sont engagés de manière conjointe les interlocuteurs et de générer le comportement co-verbal du tuteur humain étant donné le comportement observé de son/ses interlocuteur(s). Les modèles proposés sont principalement des modèles probabilistes graphiques qui se basent sur les chaînes de markov cachés (HMM) et les réseaux bayésiens dynamiques (DBN). Les modèles ont été appris et évalués – notamment comparés à des classifieurs classiques – sur des jeux de données collectés lors de deux différentes interactions face-à-face. Les deux interactions ont été soigneusement conçues de manière à collecter, en un minimum de temps, un nombre suffisant d'exemplaires de gestion de l'attention mutuelle et de deixis multimodale d'objets et de lieux. Nos contributions sont complétées par des méthodes originales d'interprétation et d'évaluation des propriétés des modèles proposés. En comparant tous les modèles avec les vraies traces d'interactions, les résultats montrent que le modèle HMM, grâce à ses propriétés de modélisation séquentielle, dépasse les simples classifieurs en terme de performances. Les modèles semi-markoviens (HSMM) ont été également testé et ont abouti à un meilleur bouclage sensori-moteur grâce à leurs propriétés de modélisation des durées des états. Enfin, grâce à une structure de dépendances riche apprise à partir des données, le modèle DBN a les performances les plus probantes et démontre en outre la coordination multimodale la plus fidèle aux évènements multimodaux originaux. / Face to face interaction is one of the most fundamental forms of human communication. It is a complex multimodal and coupled dynamic system involving not only speech but of numerous segments of the body among which gaze, the orientation of the head, the chest and the body, the facial and brachiomanual movements, etc. The understanding and the modeling of this type of communication is a crucial stage for designing interactive agents capable of committing (hiring) credible conversations with human partners. Concretely, a model of multimodal behavior for interactive social agents faces with the complex task of generating gestural scores given an analysis of the scene and an incremental estimation of the joint objectives aimed during the conversation. The objective of this thesis is to develop models of multimodal behavior that allow artificial agents to engage into a relevant co-verbal communication with a human partner. While the immense majority of the works in the field of human-agent interaction (HAI) is scripted using ruled-based models, our approach relies on the training of statistical models from tracks collected during exemplary interactions, demonstrated by human trainers. In this context, we introduce "sensorimotor" models of behavior, which perform at the same time the recognition of joint cognitive states and the generation of the social signals in an incremental way. In particular, the proposed models of behavior have to estimate the current unit of interaction ( IU) in which the interlocutors are jointly committed and to predict the co-verbal behavior of its human trainer given the behavior of the interlocutor(s). The proposed models are all graphical models, i.e. Hidden Markov Models (HMM) and Dynamic Bayesian Networks (DBN). The models were trained and evaluated - in particular compared with classic classifiers - using datasets collected during two different interactions. Both interactions were carefully designed so as to collect, in a minimum amount of time, a sufficient number of exemplars of mutual attention and multimodal deixis of objects and places. Our contributions are completed by original methods for the interpretation and comparative evaluation of the properties of the proposed models. By comparing the output of the models with the original scores, we show that the HMM, thanks to its properties of sequential modeling, outperforms the simple classifiers in term of performances. The semi-Markovian models (HSMM) further improves the estimation of sensorimotor states thanks to duration modeling. Finally, thanks to a rich structure of dependency between variables learnt from the data, the DBN has the most convincing performances and demonstrates both the best performance and the most faithful multimodal coordination to the original multimodal events.

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