Submitted by Marcos Anselmo (marcos.anselmo@unipampa.edu.br) on 2016-09-08T14:02:41Z No. of bitstreams: 2 LARISSA DA CUNHA.pdf: 1240653 bytes, checksum: 370a84da7c6dcb42867146f0c15487b1 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Approved for entry into archive by Marcos Anselmo (marcos.anselmo@unipampa.edu.br) on 2016-09-08T14:03:55Z (GMT) No. of bitstreams: 2 LARISSA DA CUNHA.pdf: 1240653 bytes, checksum: 370a84da7c6dcb42867146f0c15487b1 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-08T14:03:55Z (GMT). No. of bitstreams: 2 LARISSA DA CUNHA.pdf: 1240653 bytes, checksum: 370a84da7c6dcb42867146f0c15487b1 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2016-07-21 / Com o objetivo de avaliar a possibilidade da produção de guppy (Poecilia reticulata) em sistema com bioflocos, dois experimentos foram desenvolvidos no Laboratório de Aquariofilia da Universidade Federal do Pampa, Uruguaiana, RS. Os experimentos foram realizados em delineamento inteiramente casualizado e os resultados foram submetidos à análise de variância ANOVA e à comparação das médias pelo teste de Tukey (5%). O primeiro estudo objetivou avaliar o desempenho produtivo de juvenis de guppys (comprimento total inicial de 18,06 ± 0,30 mm e peso inicial de 0,056 ± 0,003 g), produzidos em sistema de bioflocos com diferentes taxas de alimentação, comparando-os com um sistema de produção em água clara. Foram avaliados quatro tratamentos, com quatro repetições: sistema de água clara (controle) com oferta de ração a 3% do peso vivo (SAC), sistema enriquecido com bioflocos sem a oferta de ração (BFT0), sistema enriquecido com bioflocos com oferta de ração a 1,5% do peso vivo (BFT1.5) e sistema enriquecido com bioflocos com oferta de ração a 3% do peso vivo (BFT3). Os parâmetros de qualidade da água foram monitorados semanalmente. Os resultados demonstraram que os tratamentos enriquecidos com bioflocos apresentaram melhor controle dos níveis de amônia da água. Ao final do período experimental os animais dos tratamentos SAC, BFT0 e BFT1.5 não apresentaram diferenças significativas entre si, para as variáveis CT, CP, peso e TCE. No entanto, todos os tratamentos foram inferiores ao tratamento BFT3 em todas as variáveis de desempenho analisadas. Em contrapartida, a CAA não apresentou diferença significativa entre os tratamentos BFT1.5 e BFT3, sendo o tratamento SAC mais elevado que os demais. A sobrevivência foi superior nos tratamentos com oferta de ração. O segundo estudo objetivou avaliar o desempenho produtivo de juvenis de guppys (comprimento total inicial 12,10 ± 0,13 mm e peso inicial 0,015 ± 0,000 g) submetidos à ciclos de restrição alimentar e realimentação em sistema de bioflocos. Foram avaliados três tratamentos, com seis repetições: sistema de água clara (controle) com alimentação diária (SAC), sistema enriquecido com bioflocos com alimentação durante cinco dias seguidos de dois dias de restrição de alimento (BFTR) e sistema enriquecido com bioflocos com alimentação diária (BFT). Os animais foram produzidos até entrarem no período reprodutivo e os parâmetros de qualidade da água foram mensurados semanalmente. Os resultados demonstram que os sistemas de cultivo BFT com e sem restrição alimentar apresentaram melhor controle dos níveis de nitrito em comparação ao sistema em água clara. Os animais produzidos nos sistemas BFT com e sem restrição alimentar atingiram o período reprodutivo na metade do tempo necessário para os animais produzidos em sistema de água clara, assim como apresentaram melhor desempenho produtivo (CT, CP, Peso, CAA e TCE). Os resultados sugerem que o sistema BFT pode ser empregado no cultivo de guppys, servindo como fonte alimentar aos organismos cultivados, melhorando o desempenho produtivo e os parâmetros de qualidade da água. / In order to assess the feasibility of guppy (Poecilia reticulata) production in system with bioflocs, two experiments were developed in Aquariofilia Laboratory of Federal University of Pampa, Uruguaiana, RS. The experiments were conducted in a completely randomized design and the results were submitted to analysis of variance ANOVA and the comparison of means by Tukey test (5%). The first study aimed to evaluate the performance of juvenile guppys (initial total length of 18.06 ± 0.30 mm and initial weight 0.056 ± 0.003 g), produced in biofloc system with different feed rates, comparing to a production system in clear water. Four treatments were evaluated with four replicates: clear water (control) system with feed supply 3% of body weight (CWS), biofloc technology system without the supply of feed (BFT0), biofloc technology system with feed supply 1.5% of body weight (BFT1.5) and biofloc technology system with feed supply 3% of body weight (BFT3). Water quality parameters were monitored weekly. The results showed that biofloc treatments showed better control of water ammonia levels. At the end of experiment the animals CWS, BFT and BFT1.5 showed no significant differences, for TL, SL, weight and SGR. However, all treatments were lower than BFT3 treatment in all three performance variables. In contrast, the FCR had no significant difference between the BFT1.5 and BFT3 treatments, being CWS the highest treatment. Survival was superior in the treatments with supply of feed. The second study aimed to evaluate the performance of juvenile guppys (initial total length 12.10 ± 0.13 mm and initial weight 0.015 ± 0.000 g) submitted to food restriction and refeeding cycles in biofloc system. Three treatments were evaluated, with six replications: clear water (control) system with daily food (CWS), biofloc technology system with food for five days followed by two days of food restriction (BFTR) and biofloc technology system with daily food (BFT). The animals were maintained until they enter the reproductive period and water quality parameters were measured weekly. The results demonstrate that the BFT cultivation systems with and without feed restriction showed better control of nitrite levels compared to the system in clear water. Animals produced in BFT systems with and without food restriction reached the reproductive period at half time required for animals produced in clear water system, and showed better growth performance (TL, SL, Weight, FCR and SGW). These results suggest that BFT system can be employed in guppys farming, serving as food source for organisms grown, improving growth performance and water quality parameters.

Submitted by Haroudo Xavier Filho (haroudo.xavierfo@ufpe.br) on 2016-03-04T16:25:51Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Roger Dissertação Mestrado 2014_ versão Final biblioteca_ Entregue_.pdf: 1359994 bytes, checksum: ce3bbcf3906e6cb72bdfea9a7b7e7d06 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-04T16:25:51Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Roger Dissertação Mestrado 2014_ versão Final biblioteca_ Entregue_.pdf: 1359994 bytes, checksum: ce3bbcf3906e6cb72bdfea9a7b7e7d06 (MD5) Previous issue date: 2014-02-20 / CAPES / CNPq / FINEP / O gênero Shewanella é um representante da classe das Gammaproteobactérias, família Shewanellaceae, compondo um grupo de bactérias gram-negativas, móveis, baciliforme, oxidase positiva, comumente encontrada em ambiente marinho e isolada do trato digestivo de animais aquáticos. Devido a suas características vem sendo amplamente testado como probiótico na carcinicultura. Estes têm sido utilizados na aquicultura para o controle biológico, aumento da taxa de conversão alimentar e sistema imune dos camarões. Este estudo teve por objetivo identificar potenciais bactérias probióticas retiradas do hepatopâncreas e estômago do camarão cultivado em sistema heterotrófico, avaliar as relações filogenéticas das cepas com o gênero Shewanella e caracteriza-las através de análisesmorfológicas, bioquímicas, produção de biofilme e antibiograma. A partir do cultivo heterotrófico de Litopenaeus vannamei, foram selecionadas as cepasIPA-S.51, IPA-S.111 e IPA-S.252para identificação através do sequenciamento parcial do gene 16S rRNA e comparados ao GenBank – NCBI e RDP - Seqmatch. As cepas foram alinhadas a 45 espécies do gênero Shewanella e avaliadas filogeneticamente utilizando os métodos Neighbor-Joining, Máxima Verossimilhança e Inferência Bayesiana. Quanto àsanálises morfológicas foram avaliadas parâmetros de acordo com a similaridade a padrões estabelecidos. Os testes bioquímicos foram realizados com o auxílio dos kits BACTRAY I, BACTRAY II e BACTRAY III (Labroclin®), totalizando 30 testes bioquímicos. A avaliação da capacidade de formação de biofilme foi realizada segundo Christensen e colaboradores. No antibiograma as cepas bacterianas foram submetidas a 13 antibióticos distintos segundo à técnica de Kirby e Bauer, com três repetições. O sequenciamento das cepas revelou alta similaridade a espécie Shewanella algae, utilizando o GenBank e o RDP-seqmath. A Inferência Bayesiana apresentou maior aporte estatístico e fidelidade dentre os métodos analisados. A Shewanella upenei apresentou alta similaridade as cepas estudadas, assim como a S. algae. As análises filogenéticas não descartam a hipótese de novas espécies para IPA-S.51, IPA-S.111 e IPAS. 252. As cepas estudadas foram sensíveis aos antibióticos Ampicilina/Subactan, Ofloxacina e Tetraciclina. A caracterização fenotípica fortalece a hipótese de especiação para as cepas testadas. Portanto, a capacidade de formação de biofilme, adicionada ao alto potencial enzimático e antagonismo a patógenos, característico do gênero Shewanella, tornam estas cepas potenciais probióticos para carcinicultura. / The genus Shewanella is one representant of Gammoproteobacteria class, family Shewanellaceae, being part of gram-negative bacteria group, mobile, bacilliform, oxidasepositive, commonly found on marine environments and isolated from the digestive tract of aquatic animals. Due to its characteristics, some tests as probiotics are being carried out in carciniculture. They are being used on aquaculture for biological control, augmentations on feed conversion rates and immune system of shrimps. This study has as objective identify potentials probiotics bacteria found in the hepatopancreas and stomach of shrimps cultivated on heterotrophic based system, evaluating the strain phylogenetic relationships with Shewanella genus and characterizing them through morphological and biochemical analysis, biofilm production and antibiogram. The strains IPA-S.51, IPA-S.111 e IPA-S.252 were selected from the heterotrophic cultivation of Litopenaeus vannamei, identified through partial 16S rRNA sequencing and compared to GenBank – NCBI and RDP - Seqmatch.The strains were aligned to 45 species of Shewanella genus and phylogenetically evaluated using Neighbor-Joining,Maximum-Likelihood estimation and Bayesian Inference.Regarding the morphological analysis parameters were evaluated according with established standard similarities. The biochemical tests were conducted with the assistance of BACTRAY I, BACTRAY II and BACTRAY III (Labroclin®) kits, totalizing 30 biochemical tests.The Biofilm capacity evaluation was made according Christensen et al. Regarding the antibiogram, the bacterial strains had undergone 13 distinct antibiotics according Kirby and Bauer, with three repetitions. The strains sequencing showed high similarity to Shewanella algae species, using GenBank and RDP-seqmath.The Bayesian inference displayed higher statistic contribution e fidelity among the other methods.The Shewanella upenei showed high similarity to the strains in study also as Shewanella algae.The phylogenetic analysis does not exclude the hypothesis of IPA-S.51, IPA-S.111 e IPA-S.252 being new species.The strains studied were sensitives to the antibiotics Ampicillin/Sulbactam, Ofloxacin, Tetracyclin. The phenotypic characterization of the strains supports the hypothesis of speciation. Thus, the capacity of biofilm formation plus the high enzymatic potential and antagonism interactions to pathogens, characteristics found in the Shewanella genus, make these strains potential probiotics to carciniculture.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-03-16T15:01:11Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) CAROLINA KROPNICZKI GOUVEIA - DISSERTAÇÃO.pdf: 1168935 bytes, checksum: ec9fc0cb4665cb4641bd7162f5449c56 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-16T15:01:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) CAROLINA KROPNICZKI GOUVEIA - DISSERTAÇÃO.pdf: 1168935 bytes, checksum: ec9fc0cb4665cb4641bd7162f5449c56 (MD5) Previous issue date: 2012 / A produção de camarões marinhos na região Nordeste do Brasil vem crescendo principalmente pela introdução da espécie Litopenaeus vannamei. Adicionadas à dieta ou diretamente na água, as bactérias probióticas têm sido utilizadas para controle biológico e aumento da digestibilidade alimentar e do sistema imune dos animais, elevando a lucratividade dos empreendimentos dedicados à carcinicultura. A influência de enzimas exógenas de bactérias na digestão dos camarões não está bem elucidada e ainda existe uma grande lacuna no que diz respeito a aspectos nutricionais tanto dos microrganismos, quanto dos animais cultivados. Dessa forma, objetivou-se avaliar as atividades proteolítica e amilolítica de cepas bacterianas isoladas do hepatopâncreas e estômago do L. vannamei e identificar as bactérias produtoras destas enzimas pelo sequenciamento do gene 16S rRNA. Para estudo do ambiente em tanques heterotróficos experimentais utilizando dois probióticos comerciais (HP1 e HP2) e em tanques controles heterotrófico (Het) e autotrófico (Aut), amostras de água foram tomadas ao final do experimento para contagem de bactérias heterotróficas, autotróficas e víbrios por plaqueamento em meios específicos. As médias de população bacteriana foram submetidas à análise de variância (ANOVA) complementada pelo teste de Tukey (p<0,05). Dos órgãos das amostras de camarão (n=3) foram retirados os materiais internos para isolamento das cepas bacterianas e seleção in vitro pela capacidade de produção de enzimas digestivas. Uma cepa de Bacillus subtilis (ATCC 6633) foi utilizada como testemunha na identificação utilizando os inicializadores universais para o domínio bactéria fD1 (Forward) e rD1 (Reverse). A população de bactérias heterotróficas foi mais representativa quando comparada às de autotróficas e víbrios, e o experimento Het atingiu a maior média (1,91x107 UFC/mL). As menores cargas de víbrios foram encontradas nos tanques experimentais HP1 e HP2 com médias de 2,46x104 e 2,00x104 UFC/mL, respectivamente. De 64 cepas isoladas, 11 possuíram índices enzimáticos satisfatórios (IE ≥ 2,0) para a produção de protease e amilase. Os amplicons após sequenciamento do DNA apresentaram tamanho maior que 1,4Kb e homologia com o GenBank e RDP, identificando bactérias como Bacillus subtilis e Shewanella algae. O incremento da população heterotrófica está relacionado à adição de melaço como fonte de carbono no sistema de cultivo e nos experimentos com os probióticos comerciais, a carga vibrionácea foi reduzida. A técnica de sequenciamento do gene 16S rRNA utilizando os primers fD1 e rD1 foi eficiente na caracterização bacteriana a nível de espécie e até subespécie, revelando a presença de bactérias com potencial para utilização como probiótico. / The marine shrimps cash crop in the Northeast region of Brazil is raising due to the introduction of Litopenaus vannamei. The probiotics bacteria added in the diet or directly in the water have been used for biological control and augmentations in the alimental digestibility and in the immune system, increasing the profits of enterprises related to carciniculture. The influence of bacterial exogenic enzymes on shrimp digestion is not clear and still has a gap concerning the nutrition aspects of shrimps and microorganisms. Therefore, this study had as objective the evaluations of proteolytic and amylolytic activities of bacterial strains isolated from hepatopancreas and stomach of L. vannamei and identify the bacteria responsible for enzymes production by sequencing the 16S rRNA gene. For environmental study in heterotrophic tanks using two commercial probiotics (HP1 e HP2) and in heterotrophic (Het) and autotrophic (Aut) control tanks, water samples were collected at the end of the experiment in order to count the autotrophic and heterotrophic bacteria and vibrio by plating in specific media. The means of bacterial population were submitted to variance analysis (ANOVA) and complemented by Tukey’s test (p<0.05). Internal materials were extracted from shrimp organs samples (n=3) in order to isolate the bacterial strains and “in vitro” selection due to its capacity to produce digestive enzymes. One strain of Bacillus subtilis (ATCC 6633) was used as witness on the identification using the universal primers fD1 (Forward) e rD1 (Reverse). The population of heterotrophic bacteria was more representative compared with autotrophic and vibrio population and the Het experiment presented the greatest mean (1,91x107 CFU.mL-1). The minor loads of vibrio were found in the experimental tanks HP1 and HP2 with means 2,46x104 e 2,00x104 CFU.mL-1 respectively. From sixty four strains, only eleven showed satisfactory enzymatic index (EI ≥ 2.0) to protease and amylase production. The amplicons after the DNA sequencing showed sizes bigger than 1,4Kb and homology with GenBank e RDP, identifying bacteria as Bacillus subtilis and Shewanella algae. The increment of heterotrophic population is related with the addition of molasses as carbon source in the crop system and the vibrio load were reduced in the experiments with commercial probiotics. The sequencing technique of 16S rRNA gene using fD1 and rD1 were efficient in the characterization of bacteria at the level of species and even at the level of subspecies, revealing the presence of bacteria with potential use as probiotic.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-13T14:16:14Z No. of bitstreams: 1 Freddy Vogeley de Carvalho.pdf: 463787 bytes, checksum: b80fbb83db5f99c4b734647939d38607 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-13T14:16:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Freddy Vogeley de Carvalho.pdf: 463787 bytes, checksum: b80fbb83db5f99c4b734647939d38607 (MD5) Previous issue date: 2010-02-12 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / In the present study compared the growth performance of Litopenaeus vannamei and Farfantepenaeus subtilis in nursery heterotrophic system. The experimental design consisted of two treatments (L. vannamei and F. subtilis) with four replications. The cultivation was carried out during 52 days in tanks like "raceway" (0.9m2 and 300L), with initial stocking density of 222 shrimp/m2 and initial weight of 0.024g and 0.034g for L. vannamei and F. subtilis. The animals were fed a commercial ration (35% crude protein). The formation of heterotrophic environment was induced by adding organic fertilizer (molasses) to adjust the relationship Carbon:Nitrogen (20:1). The physical and chemical parameters of water quality showed no significant differences between treatments. The assessment of growth performance showed significant differences between the species with the highest growth (0.31g/week), higher mean final weight (2.31g) and better-feed conversion factor (0.70) for L. vannamei, compared to F. subtilis with a growth of 0.12g/week, final average weight of 0.88g and feed conversion factor of 1.09. However, F. subtilis had a higher survival (83.50%) than the L. vannamei (63.25%). Despite the best performance obtained by L. vannamei, the results indicate the potential for nursery F. subtilis in heterotrophic systems. / No presente estudo foi comparado o desempenho zootécnico de Litopenaeus vannamei e Farfantepenaeus subtilis em berçário de sistema heterotrófico. O desenho experimental foi constituído por dois tratamentos (L. vannamei e F. subtilis), com quatro repetições. O cultivo foi realizado durante 52 dias em tanques tipo “raceway” (0,9m2 e 300L), com densidade inicial de estocagem de 222 camarões/m2 e peso inicial de 0,024g e 0,034g para L. vannamei e F. subtilis, respectivamente. Os animais foram alimentados com ração comercial (35% proteína bruta). A formação do ambiente heterotrófico foi induzida através da adição de fertilizante orgânico (melaço) para ajuste da relação Carbono:Nitrogênio (20:1). As variáveis físicas e químicas de qualidade da água não apresentaram diferenças significativas entre os tratamentos. A avaliação do desempenho zootécnico apresentou diferenças significativas entre as espécies, com maior crescimento (0,31g/semana), maior peso médio final (2,31g) e melhor fator de conversão alimentar (0,70) para o L. vannamei, quando comparado ao F. subtilis que apresentou crescimento de 0,12g/semana, peso médio final de 0,88g e fator de conversão alimentar de 1,09. Entretanto, o F. subtilis obteve maior sobrevivência (83,50%) que o L. vannamei (63,25%). Apesar do melhor desempenho zootécnico obtido pelo L. vannamei, os resultados indicam potencial para o berçário do F. subtilis em sistemas heterotróficos.