• Refine Query
  • Source
  • Publication year
  • to
  • Language
  • 196
  • 129
  • 94
  • 48
  • 20
  • 18
  • 13
  • 11
  • 8
  • 7
  • 6
  • 6
  • 4
  • 4
  • 3
  • Tagged with
  • 651
  • 78
  • 77
  • 60
  • 55
  • 52
  • 46
  • 45
  • 43
  • 41
  • 38
  • 36
  • 35
  • 34
  • 32
  • About
  • The Global ETD Search service is a free service for researchers to find electronic theses and dissertations. This service is provided by the Networked Digital Library of Theses and Dissertations.
    Our metadata is collected from universities around the world. If you manage a university/consortium/country archive and want to be added, details can be found on the NDLTD website.
11

Využití molekulárních markerů pro studium genetické variability u hybridních rostlin

Řezníčková, Eva January 2012 (has links)
No description available.
12

Diversidade e identificação de fungos endofíticos em folhas de Cocos nuciferaL., em Goiana Pernambuco, com base em morfologia e sequências de rDNA

Oliveira, Rafael José Vilela de 26 February 2014 (has links)
Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-11T13:58:56Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertacao Rafael José Vilela de Oliveira.pdf: 3058227 bytes, checksum: 2c27a6fc4b5e7d2a25ff68f39e05a22d (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-11T13:58:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertacao Rafael José Vilela de Oliveira.pdf: 3058227 bytes, checksum: 2c27a6fc4b5e7d2a25ff68f39e05a22d (MD5) Previous issue date: 2014-02-26 / Fungos endofíticos são micro-organismos que habitam o interior da planta hospedeira, sem causar danos aparentes ou estruturas externas visíveis. O coqueiro (Cocos nucifera L.) é uma espécie tropical, largamente distribuída na Ásia, África, América Latina e regiões do Pacífico, sendo o Brasil o quarto maior produtor mundial. Devido à importância agroeconômica do coco, este trabalho teve por objetivo determinar a micobiota endofítica de folhas sadias de C. nucifera em duas cultivares (Anão-amarelo e Anão-verde) e um híbrido (PB 121) em Goiana, Pernambuco. No laboratório, fragmentos de raque e folíolo foram lavados com água corrente e sabão neutro, e com auxílio de um furador esterilizado foram feitos discos foliares (6 mm), posteriormente desinfestados em álcool 70% por 1 minuto, em hipoclorito de sódio (NaOCl) a 2% por 2 minutos e 30 segundos, em álcool 70% por 30 segundos e finalmente duas lavagens com água destilada esterilizada. Os fragmentos foram tranferidos para placa de Petri, em triplicata, contendo Batata-Dextrose-Ágar (BDA) acrescido de cloranfenicol (50 mg.L-1). Foram sequenciados a região ITS do rDNA dos isolados e em seguida verificada a similaridade Blastn e realizada análises filogenéticas. Índices de diversidade, curva de acumulação de espécies, similaridade e frequência de ocorrência foram calculados. O total de 1296 fragmentos de folhas/raques foram analizados e 474 espécimes de fungos endofíticos foram isolados e distribuídos em 31 gêneros e 37 espécies. A espécies identificadas são representantes do filo Ascomycota, pertencentes às classes Sordariomycetes, Dothideomycetes e Eurotiomycetes, além de Occultifur externus, Rhodotorula marina e Pseudozyma hubeiensis anamorfos do filo Basidiomycota e Syncephalastrum racemosum do filo Zygomycota. Arthrinium xenocordella, Ascotricha guamenses, Phlyctaeniella sp., Pyrenochaetopsis decipiens, P. leptospora e Stenella musae são citadas pela primeira vez como endofíticos. Fusarium proliferatum, F. solani e Paecilomyces lilacinus são reportadas pela primeira vez como endofíticos em Cocos nucifera.
13

Análise estrutural, aplicação filogenética e barcode do ITS 2 na broca pequena da cana-de-açúcar Diatraea spp (Lepidoptera)

REGUEIRA NETO, Marcos da Silveira 31 January 2014 (has links)
Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-13T15:04:42Z No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Marcos da Silveira Neto.pdf: 2631812 bytes, checksum: b75b5dd740260c8e5df8486b6a787c94 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-13T15:04:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Marcos da Silveira Neto.pdf: 2631812 bytes, checksum: b75b5dd740260c8e5df8486b6a787c94 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2014 / FACEPE / No Brasil as espécies D. flavipennella e D. saccharalis tem uma grande importância para o setor sucroalcooleiro por causar danos em cana-de-açúcar. Os estágios de ovo, larva, pupa e adulto são muito parecidos entre essas espécies e a identificação pode ser confusa. O Espaçador Interno Transcrito 2 (ITS2) do locus DNA ribossomal, que tem um papel importante no processamento do DNAr, vem sendo aplicado em estudos filogenéticos e populacionais por ter como característica divergência evolutiva. Este trabalho tem como objetivo compreender o grau de divergência evolutiva entre as espécies D. flavipennella e D. saccharalis com base no marcador ITS 2, analisar sua estrutura e características funcionais. O DNA foi extraído de amostras de ovo, lagarta e adulto. Foi realizada PCR e os amplicons foram purificados e sequenciados. As sequências foram analisadas com o programa MEGA 5.01. O tamanho do ITS 2 foi de 410 pb em D. flavipennella e 448 pb em D. saccharalis. O conteúdo de GC foi similar entre as duas espécies. As sequências apresentaram regiões conservadas intercaladas por regiões variáveis. Algumas regiões conservadas apresentavam motivos presentes também em espécies de diferentes grupos, provavelmente associados às estruturas participantes no processamento do RNA pós-transcricional. Três repetições microssatélites estavam presentes em D. saccharalis e ausentes em D. flavipennella, contribuindo para a diferença de tamanho entre as duas espécies. Apesar da divergência existente entre as sequências das espécies, existem regiões que são conservadas em níveis taxonômicos mais altos.
14

Taxonomy and phylogeny of the genus Mycosphaerella and its anamorphs

Crous, Pieter Willem 28 August 2010 (has links)
Thesis (DSc)--University of Pretoria, 2010. / Microbiology and Plant Pathology / Unrestricted
15

Vehicular Traffic Flow Prediction Model Using Machine Learning-Based Model

Wang, Jiahao 14 June 2021 (has links)
Intelligent Transportation Systems (ITS) have attracted an increasing amount of attention in recent years. Thanks to the fast development of vehicular computing hardware, vehicular sensors and citywide infrastructures, many impressive applications have been proposed under the topic of ITS, such as Vehicular Cloud (VC), intelligent traffic controls, etc. These applications can bring us a safer, more efficient, and also more enjoyable transportation environment. However, an accurate and efficient traffic flow prediction system is needed to achieve these applications, which creates an opportunity for applications under ITS to deal with the possible road situation in advance. To achieve better traffic flow prediction performance, many prediction methods have been proposed, such as mathematical modeling methods, parametric methods, and non-parametric methods. It is always one of the hot topics about how to implement an efficient, robust and accurate vehicular traffic prediction system. With the help of Machine Learning-based (ML) methods, especially Deep Learning-based (DL) methods, the accuracy of the prediction model is increased. However, we also noticed that there are still many open challenges under ML-based vehicular traffic prediction model real-world implementation. Firstly, the time consumption for DL model training is relatively huge compared to parametric models, such as ARIMA, SARIMA, etc. Second, it is still a hot topic for the road traffic prediction that how to capture the special relationship between road detectors, which is affected by the geographic correlation, as well as the time change. The last but not the least, it is important for us to implement the prediction system in the real world; meanwhile, we should find a way to make use of the advanced technology applied in ITS to improve the prediction system itself. In our work, we focus on improving the features of the prediction model, which can be helpful for implementing the model in the real word. Firstly, we introduced an optimization strategy for ML-based models' training process, in order to reduce the time cost in this process. Secondly, We provide a new hybrid deep learning model by using GCN and the deep aggregation structure (i.e., the sequence to sequence structure) of the GRU. Meanwhile, in order to solve the real-world prediction problem, i.e., the online prediction task, we provide a new online prediction strategy by using refinement learning. In order to further improve the model's accuracy and efficiency when applied to ITS, we provide a parallel training strategy by using the benefits of the vehicular cloud structure.
16

VNetIntSim: An Integrated Simulation Platform to Model Transportation and Communication Networks

Elbery, Ahmed, Rakha, Hesham, Elnainay, Mustafa Y., Hoque, Mohammad A. 01 January 2015 (has links)
The paper introduces a Vehicular Network Integrated Simulator (VNetIntSim) that integrates transportation modelling with Vehicular Ad Hoc Network (VANET) modelling. Specifically, VNetIntSim integrates the OPNET software, a communication network simulator, and the INTEGRATION software, a microscopic traffic simulation software. The INTEGRATION software simulates the movement of travellers and vehicles, while the OPNET software models the data exchange through the communication system. Information is exchanged between the two simulators as needed. As a proof of concept, the VNetIntSim is used to quantify the impact of mobility parameters (traffic stream speed and density) on the communication system performance, and more specifically on the data routing (packet drops and route discovery time).
17

Phylogenetic Analysis of Iliamna (Malvaceae) Using the Internal Transcribed Spacer Region

Bodo Slotta, Tracey A. 26 May 2000 (has links)
The genus Iliamna Greene has a taxonomically complex history. Since its desciption in 1906, the genus was not recognized for some time, several species were initially placed into other genera, and the species status of a few was questioned. Today, eight species of Iliamna are recognized. Six species are located in western North America and two are found isolated to the east. Species in Iliamna are very similar morphologically with only a few characters distinguishing several as separate entities. The need for systematic study became apparent since all but one species are considered rare or endangered. Also, the differentiation between two endangered species, I. corei and I. remota, was unclear in a previous study using random amplified polymorphic DNA fragments. Of the western species, four overlap in distribution (I. crandallii, I grandi ora, I. longisepala, and I. rivularis) and their recognition as separate species has been questioned. The focus of this study was to develop a phylogeny for Iliamna using sequences from the internal transcribed spacer region (ITS) of the nuclear ribosomal RNA genes in order to determine its biogeographical and evolutionary history. Cladistic analysis was performed and the resulting phylogeny is presented. The ITS data provide new insights in the origination of the genus and its distribution. In Iliamna, the ITS region is 677 base pairs long with 120 sites providing information in the formation of phylogenetic trees. Iliamna forms a well-supported clade distinct from related genera and is monophyletic. Three well-supported groups are formed. One contains representatives from the Pacific Northwest. Another contains all of the remaining species with the third clade nested therein. This last clade contains the two eastern species, I. corei and I. remota, but there is not enough variability to support the divergence of these taxa as distinct species. There is also not sufficient variability in the ITS region to identify the western species I. crandallii, I. grandi ora, I. longisepala and I. rivularis as distinct entities. / Master of Science
18

Identificação molecular e produção de enzimas celulolíticas por Trichoderma spp

Melo, Laryssa da Silva 14 October 2009 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-11T13:38:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Laryssa da Silva Melo.pdf: 834446 bytes, checksum: 1dbffe1130e351818bfc66f05b6077ae (MD5) Previous issue date: 2009-10-14 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Trichoderma are anamorphic fungi belonging to the class of Hifomicetos, also called imperfect fungi, or asexual conidial and whose gender Hypocrea teleomorph. They are free-living fungi, distributed throughout the world and found in different soil temperatures, especially those containing organic matter. Usually are not considered important human pathogens, but there are some reports indicating occasional pathogenicity of some species. Its easy handling and in vitro, stability and viability of colonies preserved this kind are a big target for biotechnology research. Because of these characteristics were isolated Trichoderma from plant Victoria amazonica, Rollinia sp. Murraya paniculata and Strychnos cogens; wood Scleronema micranthum, known as cardeiro; jatoba (Hymenaea courbaril), land of cubiu culture (Solanum sessiliflorum) and Indian black earth, in order to identify the molecular biology, the species level, such isolates and to assess their ability to produce cellulolytic enzymes. Of the 30 lines obtained were cultured spore, which were preserved in mineral oil, Castellani and method in 10% glycerol. From the suspension in glycerol, each sample was inoculated in 20ml of 10μL BD and cultivated 26oC, 100 rpm for 40:00 h. Next was extracted genomic DNA, performed PCR of specific regions of the ITS-1 and ITS-2 ribosomal DNA sequencing and subsequently. For the production of enzymes, the isolates were first grown in induction medium. Were inoculated 10μL of spore solution (glycerol 10%) in 50 mL of solution Manachini where the substratum was used to carboxymethylcellulose. The fungi were incubated at 27 ° C, 120 rpm for 120 hours. The dosage of CMCase was performed using the method of acid Dinitrosalicílico. For the determination of β-glucosidase was used p-nitrophenyl-β-D-glucopyranoside (PNPG) as substrate for the enzyme. The total protein concentration was determined by the Bradford method, using the reagent concentrate commercial Bio-RadTM and bovine serum albumin (ASB) as standard. The result of molecular identification of the first 13 samples revealed the species: T. harzianum, T. koningii, T. asperellum, T. viride, T. ovaslisporum, T. hamatum, T. piluliferum and T. koningiopsis, with a percentage between 96 and 99% identity and 100% reliability. The results indicated CMCase enzyme to low values, less than 0.100 U / mL with the exception of T. koningii (MPCE 10 3.2), T. harzianum (MPCE 2 2.2a), both isolates of M. paniculata, and isolate 1437 identified as Trichoderma sp., from Indian black earth, which showed slightly higher levels of 0.112 and 0.103 and 0.105 U / mL, respectively. For β-glucosidase, the results showed high activity in the vast majority of isolates with emphasis on T. harzianum MPCE 3 3.1 (10.45 U / mL) and T. piluliferum Vrc 2 3.2 (9.71 U / mL). All isolates produced protein in culture medium containing carboxymethylcellulose as substrate inducer / Trichoderma são fungos anamórficos pertencentes à classe dos hifomicetos, também chamados fungos imperfeitos, assexuais ou conidiais e que têm como teleomorfo o gênero Hypocrea. São fungos de vida livre, distribuídos em todo o mundo e encontrados em solos de diversas temperaturas, especialmente naqueles que contém matéria orgânica. Geralmente não são considerados importantes patógenos humanos, mas existem alguns relatos indicando patogenicidade ocasional em algumas espécies. Sua fácil manipulação e cultivo in vitro, estabilidade e viabilidade das colônias preservadas, fazem desse gênero um grande alvo para as pesquisas biotecnológicas. Por tais características, foram isolados Trichoderma das plantas Victoria amazonica, Rollinia sp., Murraya paniculata e Strychnos cogens; da madeira Scleronema micranthum, conhecida como cardeiro; de jatobá (Hymenaea courbaril), do solo de cultura de cubiu (Solanum sessiliflorum) e de terra preta de índio, com o objetivo de identificar, pela biologia molecular, em nível de espécie, tais isolados, bem como avaliar sua capacidade de produção de enzimas celulolíticas. Das 30 linhagens obtidas foram realizadas culturas monospóricas, as quais foram preservadas em óleo mineral, método Castellani e em glicerol 10%. A partir da suspensão em glicerol, de cada amostra foi inoculado 10μL em 20mL de BD e cultivado a 26oC, a 100 rpm por 40:00h. Em seguida foi extraído o DNA genômico, deste realizada a PCR específica para as regiões ITS-1 e ITS-2 do DNA ribossômico e posteriormente o sequenciamento. Para a produção de enzimas, os isolados foram previamente cultivados em meio indutor. Foram inoculados 10μL da solução de esporos (Glicerol 10%) em 50mL de solução de Manachini onde o substrato indutor utilizado foi a carboximetilcelulose. Os fungos foram incubados a 27°C, 120 rpm durante 120 horas. A dosagem de CMCase foi efetuada com base no método do Ácido Dinitrosalicílico. Para a dosagem de β-glucosidase foi utilizado o pnitrofenil- β-D-Glucopiranosídeo (pNPG) como substrato para a enzima. A concentração de proteínas totais foi determinada pelo método de Bradford, utilizando-se o reagente concentrado comercial da Bio-RadTM e albumina de soro bovino (ASB), como padrão. O resultado da identificação molecular das primeiras 13 amostras nos revelaram as espécies: T. harzianum, T. koningii, T. asperellum, T. viride, T. ovaslisporum, T. hamatum, T. piluliferum e T. koningiopsis, com um percentual entre 96 e 99% de identidade e 100% de confiabilidade. Os resultados enzimáticos para CMCase indicaram valores baixos, inferiores a 0,100 U/mL com exceção de T. koningii (MPCe 10 3.2), T. harzianum (MPCe 2 2.2a), ambos isolados de M. paniculata, e o isolado 1437 identificado como Trichoderma sp., proveniente de terra preta de índio, que apresentaram valores um pouco mais altos de 0,112 e 0,103 e 0,105 U/mL, respectivamente. Para β-glucosidase, os resultados apresentados mostraram alta atividade na grande maioria dos isolados com destaque para T. harzianum MPCe 3 3.1(10,45U/mL) e T. piluliferum Vrc 2 3.2 (9,71 U/mL). Todos os isolados produziram proteínas em meio de cultura contendo carboximetilcelulose como substrato indutor
19

Filogenia molecular e delimitação de espécies no gênero Brasiliorchis (MAXILLARIINAE, ORCHIDACEAE) / Molecular phylogeny and species delimitation in the genus Brasiliorchis (MAXILLARIINAE, ORCHIDACEAE)

Novello, Mariana 21 June 2013 (has links)
O gênero Brasiliorchis inclui atualmente 14 espécies de orquídeas restritas ao bioma Mata Atlântica, ocorrendo desde Misiones, Argentina, até o Estado da Bahia, na região nordeste do Brasil.Embora estas espécies tenham sido tradicionalmente reconhecidas pelos seus caracteres vegetativos e principalmente florais, elas são morfologicamente muito similares e apresentam caracteres diagnósticos contínuos,assim, ousoexclusivo da morfologiapode não ser útil para identificação das espéciesneste grupo de orquídeas. Um estudo morfométrico anteriormente realizado com seis espécies deste gênero não conseguiu identificar agrupamentos claros. Amaioria dos caracteres analisados apresentou sobreposição entre diferentes espécies, sendo que apenas a espécie B. gracilisse mostrou distinta das demais. O objetivo desse estudo foi contribuir para aidentificação de linhagens evolutivamente distintas dentro do gênero e avaliar se os padrões filogenéticos de diversificação corroboram com o estudo morfométrico anteriormente realizado.Foram utilizados dados de sequências de plastídios (psbj-petA, atpl-atpH)e nucleares (ITS1-2) considerandoampla variação geográfica e morfológica observada no grupo. Foram amostrados 96 indivíduos,originados de 37 localidades de ocorrência no Brasil, incluindo 11 espéciesdo gênero. Análises de máxima parcimônia e bayesiana foram realizadas considerando os dados separadamente e concatenados.Os resultados suportam B. schunkeana como irmã de todas as outras espécies do gênero. B. barbozaefoi reconhecida como um grupo monofilético distinto, corroborando com os caracteres morfológicos diagnósticos desta espécie, e possivelmente irmão das espécies do complexo B. picta.A espécie B. gracilis não foi reconhecida como um grupo monofilético, não corroborando com o estudo de morfometria, na qual essa espécie se apresentou distinta das outras do complexo. Contudo, nas análises concatenadas alguns indivíduos apresentaram-se como irmãos das espécies do complexo B. picta. As espécies morfologicamente homogêneas pertencentes ao complexo B. picta (B. chrysantha, B. marginata, B. porphyrostele, B. ubatubana, B. phoenicanthera e B. picta) não formaram clados monofiléticos distintos. B. kautskyi e B. consanguinea, as quais são morfologicamente distintas, foram incluídas nos clados constituídos pelas espécies do complexo B. picta.Eventos de introgressão e hibridação podem ser potenciais causas da insuficiente resolução das árvores filogenéticas obtidas nesse estudo. Os padrões observados também sugerem que a separação das linhagens pode ter ocorrido recentemente e/ou rapidamente. Marcadores adicionais e análises de árvores de espécies podem ajudar a esclarecer os padrões de diversificação neste grupo. / The genus Brasiliorchis currently includes 14 species of orchids occurring mainly in the Atlantic Forest Biome, from Misiones, Argentina, to the stateof Bahia, in northeastern Brazil. Although these species have been traditionally recognized by vegetative andmainly floral traits, they are morphologically very similar and display continuouscharacters, thus the exclusive use of the morphologycannot be useful for species identificationin this group of orchids. A morphometric study previously conducted with six species of this genus could not identify clear groupings. The majority of analyzed characters showed overlap between different species, with only the species B. gracilisbeing distinct from the others. The goals of this study were to contribute to the identification of evolutionary distinct lineages within the genus and assess if the phylogenetic patterns of diversification agree with a previous morphometric study available. Sequence data from plastid (psbj-petA, atpl-atpH) and nuclear (ITS1-2)regions were used considering wide morphological and geographical sampling variation. We sampled 96 individuals, originated from 37 sites of occurrence in Brazil, including 11 species of the genus. Bayesian and parsimony analyses were performed considering data separately and concatenated. The results support B. schunkeana as sister to all other species of the genus. B. barbozaewasrecognized as a monophyletic group,corroborating with morphological diagnostic characters of this species,and possibly sisters of the complex species B. picta.The species B. gracilis was not recognized as a monophyletic group, not agreeing with the morphometry study, which showed this species as being distinct from the other species in the complex. However, in the concatenated analysis, some individuals presented themselves as sisters of the species complex B. picta. The morphologically homogeneous species belonging to the B. picta complex (B. chrysantha, B. marginata, B. porphyrostele, B. ubatubana, B. phoenicanthera e B. picta) did not form distinct monophyletic clades. B. kautskyi and B. consanguinea, which are morphologically clearly distinct, are embedded in clades consisting of the B. pictaspecies complex.Hybridization and introgression events may be potential causes of insufficient resolution of phylogenetic trees obtained in this study. The observed patterns also suggest that the separation of the lineage may have occurred recently and/or quickly.Additional markers and species tree analyses may help clarify diversification patterns in this group.
20

Filogenia molecular e delimitação de espécies no gênero Brasiliorchis (MAXILLARIINAE, ORCHIDACEAE) / Molecular phylogeny and species delimitation in the genus Brasiliorchis (MAXILLARIINAE, ORCHIDACEAE)

Mariana Novello 21 June 2013 (has links)
O gênero Brasiliorchis inclui atualmente 14 espécies de orquídeas restritas ao bioma Mata Atlântica, ocorrendo desde Misiones, Argentina, até o Estado da Bahia, na região nordeste do Brasil.Embora estas espécies tenham sido tradicionalmente reconhecidas pelos seus caracteres vegetativos e principalmente florais, elas são morfologicamente muito similares e apresentam caracteres diagnósticos contínuos,assim, ousoexclusivo da morfologiapode não ser útil para identificação das espéciesneste grupo de orquídeas. Um estudo morfométrico anteriormente realizado com seis espécies deste gênero não conseguiu identificar agrupamentos claros. Amaioria dos caracteres analisados apresentou sobreposição entre diferentes espécies, sendo que apenas a espécie B. gracilisse mostrou distinta das demais. O objetivo desse estudo foi contribuir para aidentificação de linhagens evolutivamente distintas dentro do gênero e avaliar se os padrões filogenéticos de diversificação corroboram com o estudo morfométrico anteriormente realizado.Foram utilizados dados de sequências de plastídios (psbj-petA, atpl-atpH)e nucleares (ITS1-2) considerandoampla variação geográfica e morfológica observada no grupo. Foram amostrados 96 indivíduos,originados de 37 localidades de ocorrência no Brasil, incluindo 11 espéciesdo gênero. Análises de máxima parcimônia e bayesiana foram realizadas considerando os dados separadamente e concatenados.Os resultados suportam B. schunkeana como irmã de todas as outras espécies do gênero. B. barbozaefoi reconhecida como um grupo monofilético distinto, corroborando com os caracteres morfológicos diagnósticos desta espécie, e possivelmente irmão das espécies do complexo B. picta.A espécie B. gracilis não foi reconhecida como um grupo monofilético, não corroborando com o estudo de morfometria, na qual essa espécie se apresentou distinta das outras do complexo. Contudo, nas análises concatenadas alguns indivíduos apresentaram-se como irmãos das espécies do complexo B. picta. As espécies morfologicamente homogêneas pertencentes ao complexo B. picta (B. chrysantha, B. marginata, B. porphyrostele, B. ubatubana, B. phoenicanthera e B. picta) não formaram clados monofiléticos distintos. B. kautskyi e B. consanguinea, as quais são morfologicamente distintas, foram incluídas nos clados constituídos pelas espécies do complexo B. picta.Eventos de introgressão e hibridação podem ser potenciais causas da insuficiente resolução das árvores filogenéticas obtidas nesse estudo. Os padrões observados também sugerem que a separação das linhagens pode ter ocorrido recentemente e/ou rapidamente. Marcadores adicionais e análises de árvores de espécies podem ajudar a esclarecer os padrões de diversificação neste grupo. / The genus Brasiliorchis currently includes 14 species of orchids occurring mainly in the Atlantic Forest Biome, from Misiones, Argentina, to the stateof Bahia, in northeastern Brazil. Although these species have been traditionally recognized by vegetative andmainly floral traits, they are morphologically very similar and display continuouscharacters, thus the exclusive use of the morphologycannot be useful for species identificationin this group of orchids. A morphometric study previously conducted with six species of this genus could not identify clear groupings. The majority of analyzed characters showed overlap between different species, with only the species B. gracilisbeing distinct from the others. The goals of this study were to contribute to the identification of evolutionary distinct lineages within the genus and assess if the phylogenetic patterns of diversification agree with a previous morphometric study available. Sequence data from plastid (psbj-petA, atpl-atpH) and nuclear (ITS1-2)regions were used considering wide morphological and geographical sampling variation. We sampled 96 individuals, originated from 37 sites of occurrence in Brazil, including 11 species of the genus. Bayesian and parsimony analyses were performed considering data separately and concatenated. The results support B. schunkeana as sister to all other species of the genus. B. barbozaewasrecognized as a monophyletic group,corroborating with morphological diagnostic characters of this species,and possibly sisters of the complex species B. picta.The species B. gracilis was not recognized as a monophyletic group, not agreeing with the morphometry study, which showed this species as being distinct from the other species in the complex. However, in the concatenated analysis, some individuals presented themselves as sisters of the species complex B. picta. The morphologically homogeneous species belonging to the B. picta complex (B. chrysantha, B. marginata, B. porphyrostele, B. ubatubana, B. phoenicanthera e B. picta) did not form distinct monophyletic clades. B. kautskyi and B. consanguinea, which are morphologically clearly distinct, are embedded in clades consisting of the B. pictaspecies complex.Hybridization and introgression events may be potential causes of insufficient resolution of phylogenetic trees obtained in this study. The observed patterns also suggest that the separation of the lineage may have occurred recently and/or quickly.Additional markers and species tree analyses may help clarify diversification patterns in this group.

Page generated in 0.0231 seconds