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Cyathus (Basidiomycota): relações filogenéticas de espécies do Nordeste brasileiroSILVA, Maria Aparecida 15 March 2012 (has links)
Submitted by Haroudo Xavier Filho (haroudo.xavierfo@ufpe.br) on 2016-02-26T16:26:29Z
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Previous issue date: 2012-03-15 / CAPES / O gênero Cyathus Haller: Pers., junto com mais quatro gêneros, formou, por muito tempo, um
grupo conhecido como “Bird’s nest fungi” devido a morfologia cônica com estrutura lenticulares
em seu interior, lembrando ovos em seus ninhos. Os estudos morfológicos, durante muito tempo,
forneceram a base para as diferentes construções de classificação infragenérica e, como muitas
espécies se diferenciavam de forma tênue, isso gerava muita polêmica. Sequências de DNA vêm
sendo usadas para esclarecer melhor a história evolutiva do grupo. No Brasil, o grupo é
pouquíssimo estudado, de forma que mais trabalhos envolvendo a união da taxonomia molecular
com a tradicional são necessários para uma melhor compreensão do gênero. Assim, o presente
trabalho teve como objetivos inferir a filogenia de espécimes de Cyathus oriundas do nordeste
brasileiro e, com a associação dos caracteres morfológicos, propor uma classificação melhor para o
táxon. Para isso, foram examinadas 46 exsicatas, das quais seis eram do herbário JPB, cinco do
Herbário HUEFS e 37 do herbário de Fungos UFRN, sendo que este último apresenta o maior
número de exsicatas de Cyathus no Nordeste, somando um total de 19 espécies. Dos 46 espécimes,
33 foram utilizados para extração de DNA, resultando no sequenciamento da região ITS de seis
espécies e da região LSU de oito espécies. As árvores filogenéticas mostram que essas espécies se
encontram em clados separados das demais espécies oriundas de regiões não tropicais, no entanto,
não altera a topologia geral dos principais clados sugeridos em trabalhos anteriores. De acordo com
os estudos taxonômicos tradicionais, temos duas espécies que constituem segundo registro para o
mundo: C. pedicelatus e C. setosus; uma primeira referencia para o Brasil de C. olivaceobrunneus,
e a primeira referência para o Nordeste de C. bekerleyanus. A análise dos dados moleculares aponta
para a delimitação de cinco novas espécies para a ciência. Todas as sequências de DNA geradas
foram depositadas no GenBank e são novas para o banco de dados. / The genus Cyathus Haller: Pers., together with other four genera, formed a group known as bird's
nest fungi due to their conic morphology with lenticular structures inside resembling bird’s eggs in
their nests. Morphological studies, for a long time, provided the basis to the different constructions
of infrageneric classification and, as many species differed weakly from one another, that generated
much controversy. DNA sequences have been used to better clarify the evolutionary history of the
group. In Brazil, the group is as yet poorly studied, hence, more work involving the union of the
traditional and molecular taxonomy is needed for better understanding of the genus. Therefore, this
work had the objectives of inferring the phylogeny of specimens of Cyathus from the Brazilian
Northeast and, in association with morphological characters, to propose a better classification for
the taxon. Forty six exsiccates were examined, being six from JPB herbarium, five from HUEFS
herbarium and 37 of UFRN-Fungos herbarium. The latter has the largest number of exsiccates of
this genus in the Northeast, totaling 19 species. Thirty-three specimens were chosen for DNA
extraction, resulting in the sequencing of the ITS region of six species and the LSU region of eight
species. The phylogenetic trees show that these species sampled in this work are positioned in
clades separated from those reported from non-tropical regions, however, this does not change the
general topology of the main clades suggested in the works published previously. According to the
traditional taxonomy studies we have two species that constitute the second record to the world, C.
pedicelatus and C. setosus; one first record to Brazil, C. olivaceobrunneus; and one first record to
the Northeast region of C. bekerleyanus. Analysis of the molecular data suggests five new species
to Science. All DNA sequences of the tropical species sampled were deposited in the GenBank and
are new records for the database.
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Relação filogenética, por ITS-rDNA, de Colletotrichum spp., agente causal da mancha foliar da gala em macieira / Phylogenetic relationship by ITS-rDNA of Colletotrichum spp. causal agent of apple glomerella leaf spotRibeiro, Diorvania Cardoso 26 February 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007-02-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The apple is a temperate clime fruit with larger dispersion, consumption and the more
marketed all over the world as fresh fruit. The apple production has been committed by the
incidence of diseases, in which Apple Leaf Spot (ALS), whose causal agent is the
Colletotrichum spp. Nowadays this disease is one of the largest concerns of the producers and
researchers. The origin of this disease in apple tree plants is not still well known. Studies
based on the phylogeny allow to relate evolutionarily the organisms and characterize possible
divergence mechanisms origin. This will contribute in disease control and prevention of new
races sprout. The objective of this work was to study the variation of the ITSs rDNA among
apple tree pathogenic isolates of Colletotrichum spp. from apple, citrus and feijoa. All isolates
were first cultivated on PDA, for one week at 24oC. In the PCR amplification of the rDNA
was used initiators ITS1 and ITS4. The amplified fragment was digested with restriction
enzymes (Rsa I, Alu I, Hinf I, Hpa II, Hha I, Xho I, Acc I, Eco RI and Taq I). The revelation
was in 2% agarose gel. It was obtained a great variation with products of the cleaved PCR
products, from 90 to 500 pb. The amplified fragment was purified (QIAquick Gel Extraction
Kit 250 - Unisciense of Brazil) and the fragment (ITS of the rDNA) was sequenced for all
isolates. The sequences were aligned with the ClustalW software and the phylogenetic tree
was constructed in the Mega 3.1 software. The products obtained in the PCR amplification of
the rDNA region (ITS1-5,8S-ITS2), with the initiators pair ITS1 and ITS4 revealed a
fragment with approximately 600 pb, for all the isolated analyzed. Through the analysis for
the ARDRA was possible to separate isolates groups in haplotypes, which was efficient for
the correlation between haplotypes and hosts, containing in a same haplotypes of the same
host. It was possible to group the isolates of Colletotrichum in species, using the phylogenetic
tree, independent of his host. All of the obtained sequences presented more than 93% of
similarity, fact that reinforces the hypothesis that the Colletotrichum spp., causal agent of
ALS, is nearly related with citrus and feijoa Colletotrichum / A maçã é a fruta de clima temperado de maior dispersão, consumo e a mais
comercializada como fruta fresca em todo o mundo. A produção de maçã no Brasil tem sido
comprometida pela incidência de várias doenças, das quais a Mancha Foliar da Gala (MFG),
cujo agente causal são espécies de Colletotrichum spp., tem sido, atualmente, uma das
maiores preocupações dos produtores e pesquisadores. A origem desta doença em macieira
ainda não está bem esclarecida e a utilização de estudos baseados na filogenia permitem
relacionar os organismos evolutivamente, caracterizando possíveis mecanismos de
divergência evolutiva e a origem do patógeno, contribuindo na adoção de medidas de controle
e prevenção quanto ao surgimento de novas raças. O presente trabalho objetivou estudar a
variação do DNA ribossomal, (rDNA) entre isolados de Colletotrichum spp. patogênicos em
macieira, em citros e goiaba serrana. Todos os isolados foram cultivados em meio BDA, por
uma semana a 24oC. A amplificação do rDNA foi realizada utilizando-se iniciadores ITS1 e
ITS4, seguida pela digestão da região ITS (espaçador interno transcrito) com enzimas de
restrição (Rsa I, Alu I, Hinf I, Hpa II, Hha I, Xho I, Acc I, Eco RI e Taq I). Os produtos
obtidos na amplificação da região ITS1-5,8S-ITS2 do rDNA revelaram um fragmento de
aproximadamente 600 pares de bases (pb), para todos os isolados analisados. Todos os
fragmentos amplificados foram clivados, obtendo uma grande variação, a qual foi de 90 a 500
pb. Utilizando a técnica de ARDRA (Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis) foi
possível separar e agrupar os isolados em haplótipos, a qual foi eficiente para a correlação
entre haplótipo e hospedeiros, agrupando em um mesmo haplótipo isolados do mesmo
hospedeiro. O fragmento amplificado foi purificado com kit QIAquick Gel Extraction Kit 250
(Qiagen, Hilden, Germany) e as amostras foram seqüenciadas na região ITS do rDNA de todos
os isolados. As seqüências foram alinhadas no software ClustalW e a árvore filogenética foi
construída no software Mega 3.1. Com o seqüenciamento de DNA foi possível inferir sobre a
possível espécie de fungo que pertence o segmento de DNA analisado. A região ITS do rDNA
mostrou-se muito eficaz para estudos de filogenia. A partir da árvore filogenética foi possível
agrupar os isolados de Colletotrichum por espécies, independente do seu hospedeiro. Todas as
seqüências obtidas apresentaram valores superiores a 93% de similaridade, fato esse, que
reforça que o Colletotrichum spp., causador da MFG, possui relações de parentesco com o
isolados de Colletotrichum spp. isolados de citros e de goiaba serrana
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Fungos ectomicorrízicos do sul do Brasil, com ênfase no hábito hipógeo / Ectomycorrhizal fungi from southern Brazil, with emphasis on the hypogeous habitSulzbacher, Marcelo Aloisio 29 October 2010 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Fungi represent an extremely important group of organisms in terrestrial ecosystems. Among their several important ecological roles, is the mutualistic association with
plant roots, forming different types of mycorrhiza. Most studies carried out so far focused on epigeous ectomycorrhizal fungi, which occur above ground. On the other hand, below ground, hypogeous ectomycorrhizal fungi, are still poorly studied. This research aimed to study the diversity of hypogeous ectomycorrhizal fungi (Basidiomycetes) collected in Eucalyptus spp. plantations in the Central Region of Rio Grande do Sul, Brazil, based on morphological and molecular characters. Samples were taken between May 2009 and July 2010. A total of five species belonging to three families were identified. The material was analyzed to determine the morphological and molecular characters. Among the species identified are:
Chondrogaster pachysporus Maire, Descomyces albus (Berk.) Bougher & Castellano, Hysterangium affine Massee & Rodway in Massee, Hysterangium inflatum Rodway and Setchelliogaster tenuipes (Setch.) Pouzar. Additionally a
second species of Chondrogaster sp. was collected. However, no identity was determined for this species. Furthermore, it is believed it represents a new
undescribed species to science. Among the species studied, Descomyces albus is reported for the first time in the State of Rio Grande do Sul. Hysterangium affine and
H. inflatum are newly recorded species from Brazil while Chondrogaster pachysporus is recorded for the first in South America. / Os fungos representam um grupo de organismos extremamente importante nos ecossistemas terrestres. Entre as muitas funções por eles desempenhadas está a associação mutualística com as raízes dos vegetais, formando diferentes tipos de micorrizas. A maioria dos estudos realizados até o momento está principalmente focada nos fungos ectomicorrízicos epígeos, os quais ocorrem acima do solo. Por
outro lado, os fungos ectomicorrízicos hipógeos, que vivem abaixo da superfície do solo, são ainda pouco estudados. A presente pesquisa tem como objetivo estudar a
diversidade de fungos ectomicorrízicos hipógeos (Basidiomycetes) coletados em plantações de Eucalyptus spp. na Região Central do Rio Grande do Sul, Brasil, com
base em características morfológicas e moleculares. O período de coleta dos fungos foi de maio de 2009 a julho de 2010. Um total de cinco espécies pertencentes a três famílias foram identificadas. Este material foi analisado para verificar suas
características morfológicas e moleculares. Dentre as espécies identificadas estão: Chondrogaster pachysporus Maire, Descomyces albus (Berk.) Bougher & Castellano, Hysterangium affine Massee & Rodway in Massee, Hysterangium inflatum Rodway e Setchelliogaster tenuipes (Setch.) Pouzar. Adicionalmente identificou-se uma segunda espécie de Chondrogaster sp. porém não se chegou a
uma espécie conhecida, acreditando tratar-se de uma espécie ainda desconhecida para a ciência. Dentre as espécies estudadas, destacam-se a Descomyces albus que é citada pela primeira vez para o Estado do Rio Grande do Sul, Hysterangium affine e H. inflatum que têm sua ocorrência registrada pela primeira vez no Brasil, além de Chondrogaster packysporus citado pela primeira vez para a América do Sul.
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Pour une meilleure caractérisation du registre fossile pélagique : diversité morphologique, biogéographie et écologie des espèces cryptiques de foraminifères planctoniques / For a better characterization of the fossil pelagic record : molecular, biogeographical and ecological diversity of planctonic foraminifers cryptic speciesMorard, Raphaël 09 November 2010 (has links)
L’utilisation des coquilles carbonatées de foraminifères planctoniques comme marqueurs paléocéanographiques repose sur l’hypothèse fondamentale que chaque espèce morphologique correspond à une espèce biologique caractéristique d’un habitat spécifique. Cette relation empirique a été récemment remise en cause par des analyses moléculaires qui ont révélé la présence systématique de plusieurs espèces génétiques (espèces cryptiques) au sein des morpho-espèces actuelles. Il a été suggéré que ces espèces cryptiques ou génotypes, présentaient (1) des préférences biogéographiques et écologiques restreintes par rapport à leur morpho-espèce respective et (2) des différences morphologiques. Dans ce travail, nous avons caractérisé la diversité génétique, morphologique et écologique de 4 morpho-espèces clefs de la paléocéanographie, i.e. Orbulina universa, Truncorotalia truncatulinoides, Globoconella inflata et Globigerina bulloides. Cette étude repose sur le développement d’un protocole d’extraction ADN non destructif pour la coquille calcaire, permettant l’analyse conjointe de la variabilité génétique et morphologique d’un même individu. Les variations de forme ou de porosité de chacun des génotypes des morphoespèces ont été quantifiées. Il apparaît que le fort degré de plasticité morphologique largement documenté chez les foraminifères planctonique et jusqu’alors interprété comme écophénotypique, est au moins en partie la conséquence du regroupement de plusieurs génotypes présentant des morphologies et préférences écologique particulières. Sur la base de ces observations, des modèles de reconnaissance morphologique permettant d’identifier les génotypes à partir de la morphologie de la coquille, utilisables à l’échelle populationnelle, ont été développés. Afin de quantifier l’impact de l’intégration de la diversité cryptique dans les reconstitutions paléocéanographiques basées sur les assemblages de foraminifères planctoniques, les fonctions de transfert couramment utilisées ont été re-calibrées en intégrant les distributions restreintes des génotypes d’O. universa, T. truncatulinoides, G. inflata et G. bulloides. Ces re-calibrations conduisent à un degré de précision jusqu’alors jamais atteint dans les reconstructions paléocéanographiques basées sur les assemblages de foraminifères planctoniques. / The usefulness of calcareous shells of planktonic foraminifera as a paleoceanographic proxy relies on the key hypothesis that each morphospecies corresponds to a biological species with a specific habitat. This empirical relationship has been challenged since molecular analyses have revealed a significant level of cryptic genetic diversity among modern morphospecies of planktonic foraminifera. Previous workers have suggested that the cryptic species or genotypes (1) display narrower biogeographic and ecological ranges than their related morphospecies, and (2) exhibit shell morphological differences. In this work, we have characterized the genetic, morphological and ecological diversity among four planktonic foraminiferal morphospecies of significance in paleoceanography, i.e. Orbulina universa, Truncorotalia truncatulinoides, Globoconella inflata and Globigerina bulloides. Our study relies on the development of a new single-cell DNA extraction protocol that retains the shell, allowing direct morpho-genetic comparisons. Shape or porosity variations within each genotype have been quantified. It appears that the high degree of morphological plasticity widely documented in planktonic foraminifera and classically seen as ecophenotypy, is at least partly the spurious consequence of lumping several genotypes that display morphological and environmental preferences. Based on these observations, we developed several population-scale models, which allow recognition of the cryptic species based on their shell morphology. Finally, in order to quantify the impact of integrating cryptic diversity in assemblage-based aleoceanographic reconstructions, we have re-calibrated transfer functions based on the ecological ranges of the genotypes of O. universa, T. truncatulinoides, G. inflata and G. bulloides in the southern oceans. Such recalibrations led to a great, previously never reached improvement in the accuracy of the assemblage-based paleoceanographic reconstructions.
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Caracterização molecular (PCR) e infecção de Metarhizium anisopliae var. acridum e Metarhizium anisopliae em Zaprionus indianusLEÃO, Mariele Porto Carneiro January 2006 (has links)
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Previous issue date: 2006 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Foram analisadas as linhagens Metahizium anisopliae var. acridum e Metarhizium
anisopliae var. anisopliae quanto à patogênicidade sobre Zaprinus indianus, utilizando as
concentrações 104, 105, 106, 107, 108 conídios/mL considerando o percentual de emergência
de adultos. De acordo com a metodologia empregada verificou-se que as duas linhagens
apresentaram ação contra Z. indianus. Os marcadores moleculares ITS (Internal Trancride
Spacer) do rDNA, Intron Splice Site Primer e Microssatélite (SSR- Simple Sequence
Repeats), foram utilizados para avaliar a diversidade genética entre as linhagens antes e após
a passagem pela mosca. A análise de agrupamento usando o método de UPGMA baseada nas
distâncias genéticas dos marcadores moleculares confirmou a diversidade genética
reconhecida no gênero Metarhizium. O microssatélite (GTG)5 e o intron do grupo mRNA
nuclear tiveram a mesma sensibilidade em detectar a variabilidade genética entre as linhagens
de Metarhizium . Os produtos de amplificação dos loci ITS1-5.8-ITS2 do rDNA com os
iniciadores ITS4 e ITS5 foram eficientes em demonstrar que as linhagens estudadas pertence
à espécie Metarhizium anisopliae, apesar da diversidade genética demonstrada pelos
marcadores (GTG)5 e EI1. Os perfis de amplificações da região microssatélite, intron e ITS
após a passagem por Z. indianus comprovaram que as linhagens reisoladas foram às mesmas
que foram utilizadas para infectar
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Caracterização molecular de espécies deMetarhizium e patogenicidade sobre DiatraeasaccharalisLIMA, Maria do Livramento Ferreira January 2005 (has links)
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Previous issue date: 2005 / Foram analisadas 15 linhagens de Metarhizium isoladas de diferentes regiões e hospedeiros quanto às características genéticas e 7 linhagens quanto a patogenicidade sobre Diatraea saccharalis. Os marcadores moleculares ITS (Internal Transcrided Spacer) do rDNA, Intron splice site primer, RAPD e Microssatélites (SSR-Simple Sequence Repeats) foram utilizados para avaliar a diversidade genética entre as linhagens. A análise de agrupamento usando o método UPGMA baseada nas distâncias genéticas dos quatro marcadores moleculares confirmou a diversidade genética reconhecida no gênero Metarhizium. As enzimas de restrição, HaeIII e MspI, evidenciaram a diversidade genética entre as linhagens ao digerirem os produtos de amplificação do locus ITS1-5.8S-ITS2 do rDNA com os iniciadores ITS4 e ITS5, a enzima DraI não apresentou sítios de restrição. Os introns do grupo mRNA nuclear discriminaram as linhagens de Metarhizium apenas com a utilização do iniciador EI1. As técnicas de RAPD e regiões de Microssatélite foram eficientes em demonstrar a diversidade entre as linhagens. Porém o microssatélite (GACA)4 foi mais sensível em detectar a variabilidade intra e interespecífica entre as diferentes linhagens de Metarhizium. Não houve correlação entre grupos e regiões geográficas. As linhagens 4415, 4400 e 4897 causaram maior percentual de mortalidade das larvas de Diatraea saccharalis. Também não houve correlação entre os agrupamentos gerados pelas técnicas moleculares e percentual de mortalidade de larvas de D. saccharalis
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Análise da diversidade genética através de marcadores moleculares e características citomorfológicas de Colletotrichum gloeosporioidesSOUSA, Adna Cristina Barbosa de January 2004 (has links)
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Previous issue date: 2004 / Foram analisadas 20 linhagens de C. gloeosporioides quanto às características
genéticas e citomorfológicas. Os marcadores moleculares, RAPD, microssatélites, Intron
Spice Site Primer e região ITS do DNA ribossomal, foram utilizados para avaliar a
diversidade genética entre as linhagens. A análise de agrupamento através do método
UPGMA confirmou a diversidade genética intraespecífica reconhecida em C.
gloeosporioides. Com a técnica de RAPD foi detectada uma maior similaridade genética
entre as linhagens. As regiões de microssatélites investigadas, demonstraram alto
polimorfismo genético e os introns discriminaram todos as linhagens apenas com o primer
(EI-1), e revelaram maior diversidade genética em relação aos outros marcadores
moleculares utilizados. As três enzimas de restrição testadas, HaeIII, DraI e MspI
evidenciaram a diversidade genética entre as linhagens nos produtos de amplificação dos
loci ITS1-5.8S-ITS2 do rDNA com os primers ITS1 e ITS4. Todos os marcadores
empregados, foram eficientes em demonstrar o alto grau de polimorfismo genético,
constatado pela formação de grupos altamente diversificados, sem apresentar correlação
entre os hospedeiros. Os aspectos macroscópicos exibiram uma variação na coloração,
textura e segregação de setores nas colônias, e as observações microscópicas demonstraram
a formação de estruturas vegetativas e reprodutivas peculiares da espécie. A condição
nuclear investigada através da técnica de HCl-Giemsa, evidenciou conídios 100%
uninucleados
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Taxonomická studie okruhu terčovníku Physconia muscigena / A taxonomic study of Physconia muscigena groupStarosta, Jakub January 2016 (has links)
The principal goal of my study was to find if ecologically and chemically different populations of lichens in the Physconia muscigena (Ach.) Poelt group belong to several species or a single one. This study focused on the molecular and chemical investigations of mostly European and Canadian populations. I use sequence data from three genes (ITS rDNA, mtSSU rDNA and TEF1) for the reconstruction of phylogenetic trees. I investigate phylogenetic relationships among the closely related species P. muscigena, P. bayeri, P. rossica, and P. isidiomuscigena. Also, I wanted to detect any possible geographical or ecological trends among chemotypes and haplotypes. As an additional goal I checked the recent localities of P. muscigena in the Czech Republic for valorising its conservation status. Results show that: (1) sequenced data of ITS rDNA and TEF1 show high intraspecific variability in P. muscigena samples. This genetic variability does not correlate neither with geographical distribution nor thallus chemistry; (2) P. bayeri is synonymous with P. muscigena; (3) some samples P. muscigena contain new undetermined secondary metabolite, (4) Physconia muscigena has only three recent localities in Czech Republic. Key words: Physconia muscigena, Physconia bayeri, infraspecific variability, taxonomy, TEF1, ITS...
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Diverzita fotobiontů ve stélkách lišejníku Psora decipiens / Photobiont diversity in lichen thallus Psora decipiensJadrná, Iva January 2017 (has links)
Psora decipiens is a characteristic species of the terricolous lichen community Toninio-Psoretum decipientis distributed mostly on calcareous or basic substrates. The community consists in various modifications of lichens Placidium squamulosum, Toninia sedifolia, T. opuntioides, Fulgensia fulgens, F. bracteata and others. Photobionts of the lichen Psora decipiens were determined. Psora decipiens shared with Placidium sp. the single photobiont species, a common terrestrial alga Myrmecia israeliensis. Cloning of ITS rDNA revealed high intrathalline variability in M. israeliensis within a single lichen thallus. Several genotypes were often found in a thallus, uncovering either a high mutation rate of the algae or constant relichenization processes. Saxicolous Psora species (P. testacea, P. himalayana, P. valesiaca and P. rubiformis) had M. biatorellae as a photobiont, indicating a possible photobiont influence on substrate specifity of Psora lichens. Finally, the proper methodology used for identification of lichen photobionts is discussed. For a correct photobiont identification, morphological investigations of intrathaline diversity combined with coherent molecular techniques are needed. Such procedure was not applied in the former studies of Psora decipiens, resulting in a poor characterization of...
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Pour une meilleure caractérisation du registre fossile pélagique : diversité morphologique, biogéographie et écologie des espèces cryptiques de foraminifères planctoniquesMorard, Raphaël 09 November 2010 (has links) (PDF)
L'utilisation des coquilles carbonatées de foraminifères planctoniques comme marqueurs paléocéanographiques repose sur l'hypothèse fondamentale que chaque espèce morphologique correspond à une espèce biologique caractéristique d'un habitat spécifique. Cette relation empirique a été récemment remise en cause par des analyses moléculaires qui ont révélé la présence systématique de plusieurs espèces génétiques (espèces cryptiques) au sein des morpho-espèces actuelles. Il a été suggéré que ces espèces cryptiques ou génotypes, présentaient (1) des préférences biogéographiques et écologiques restreintes par rapport à leur morpho-espèce respective et (2) des différences morphologiques. Dans ce travail, nous avons caractérisé la diversité génétique, morphologique et écologique de 4 morpho-espèces clefs de la paléocéanographie, i.e. Orbulina universa, Truncorotalia truncatulinoides, Globoconella inflata et Globigerina bulloides. Cette étude repose sur le développement d'un protocole d'extraction ADN non destructif pour la coquille calcaire, permettant l'analyse conjointe de la variabilité génétique et morphologique d'un même individu. Les variations de forme ou de porosité de chacun des génotypes des morphoespèces ont été quantifiées. Il apparaît que le fort degré de plasticité morphologique largement documenté chez les foraminifères planctonique et jusqu'alors interprété comme écophénotypique, est au moins en partie la conséquence du regroupement de plusieurs génotypes présentant des morphologies et préférences écologique particulières. Sur la base de ces observations, des modèles de reconnaissance morphologique permettant d'identifier les génotypes à partir de la morphologie de la coquille, utilisables à l'échelle populationnelle, ont été développés. Afin de quantifier l'impact de l'intégration de la diversité cryptique dans les reconstitutions paléocéanographiques basées sur les assemblages de foraminifères planctoniques, les fonctions de transfert couramment utilisées ont été re-calibrées en intégrant les distributions restreintes des génotypes d'O. universa, T. truncatulinoides, G. inflata et G. bulloides. Ces re-calibrations conduisent à un degré de précision jusqu'alors jamais atteint dans les reconstructions paléocéanographiques basées sur les assemblages de foraminifères planctoniques.
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