Thèse de doctorat : ingéniérie scientifique et visualisation : Ecole centrale de Paris : 2009. / Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. 79 réf.

Thèse de doctorat : Images et systèmes : Villeurbanne, INSA : 2002. / Thèse : 2002ISAL0039. Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. p.243-255.

Thèse de doctorat : Images et Systèmes : Villeurbanne, INSA : 2002. / Le chap.7 est rédigé en anglais. Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. p.145-150.

Habilitation à diriger des recherches : Informatique : Rennes 1 : 1999. / Bibliogr. p.109-136.

Thèse de doctorat : Génie biologique et médical : Paris 12 : 2005. / Version électronique uniquement consultable au sein de l'Université Paris 12 (Intranet). Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. : 194 réf.

Texte remanié de: Doctoral diss.--Austin--University of Texas, 1992. Titre de soutenance : Privatizing space-derived data : a case study of the effects of the Land remote-sensing commercialization act of 1984 on the academic geography community. / Notes bibliogr. Bibliogr. p.287-314. Index.

L’imagerie fantôme (IF) qui a été développée dans des années 1980, est une nouvelle et prometteuse technique d’imagerie utilisant des fluctuations classiques ou quantiques de lumière. Cette technique a certains avantages par rapport à des méthodes d’imagerie traditionnelle et elle trouve aujourd’hui de nombreuses applications dans l’imagerie diffractive par des rayons X, la télédétection, ou l’imagerie biomédicale. L’inconvénient de l’IF est qu’elle demande un assez grand nombre de mesures et un traitement des données très extensif pour arriver à une bonne qualité des images. Pour augmenter l’efficacité de cette technique on a besoin de l’information a priori sur l’objet ou le dispositif optique. La parcimonie d’objets comme l’information a priori a été déjà utilisée dans le traitement d’images. Dans cette thèse nous allons introduire la notion de la parcimonie comme l’information a priori dans l’imagerie fantôme et étudier l’amélioration des performances de l’IF grâce à cette information. Nous allons aussi faire les premiers pas dans l’étude des limites quantiques de la super-résolution des objets parcimonieux. / Ghost Imaging (GI), which was developed from 1980s, is a novel and promising imaging technique based on classical or quantum correlation of the light. It has several advantages over the conventional imaging techniques and nowadays finds many practical applications in X-ray diffraction imaging, remote sensing, or biomedical imaging. The drawback of traditional GI is a large number of measurements and extensive information processing needed for a good quality of images. To improve the imaging efficiency and the image quality GI requires a priori information about the object or the imaging scheme. Sparsity of the objects has been used for a while as a priori information in signal processing. In this thesis we will introduce the sparsity a priori information of the object into the GI and study the improvement of its performance. We will also make first steps towards the quantum limits of super-resolution of sparse optical objects.

La connectomique est un des plus grands défis dans la compréhension et le diagnostic des maladies du cerveau. En effet, les mauvaises connexions et le mauvais fonctionnement des circuits du cerveau sont à l'origine de nombreuses maladies neurologiques. Ceci peut être causé par des défauts génétiques, un dérèglement en cours de développement ou à une dégénérescence à un stade ultérieur de la vie. Pour étudier les changements morphologiques à la base des maladies mentales et neurologiques, les technologies d'imagerie actuelles sont limitées. Du fait de la difficulté à acheminer la lumière à l'intérieur de grands volumes de tissus, les études se font bien souvent à partir d'images bidimensionnelles de coupes histologiques et résultent, dans de nombreux cas, à des informations spatiales incomplètes. Dans ce projet, nous avons adopté une stratégie qui permet d'obtenir des images 3D de grands volumes à haute résolution, et ce, sans coupe histologique. D'une part, des techniques de transparisation ont été utilisées afin de minimiser la diffusion de la lumière dans les échantillons de tissus. D'autre part, pour une imagerie plus rapide, nous avons conçu un microscope de fluorescence à feuillet lumineux, à large champ de vue et à haute résolution. Les rayons d'un faisceau laser afocal sont déviés par un axicon pour interagir entre eux et former, dans l'échantillon, une fine aiguille lumineuse qui forme un feuillet lumineux une fois balayée à très grande vitesse dans un plan. Le signal de fluorescence émanant de la section illuminée par le feuillet est collecté selon un axe perpendiculaire par une caméra scientifique CMOS. Cette stratégie a permis de surpasser les systèmes déjà existants en fournissant des images grand volume avec une résolution isotrope de l'ordre du micron. Enfin, ce nouvel outil nous a permis de faire des études précédemment impossibles et aura certainement un impact direct sur l'évaluation post-mortem et l'optimisation de traitements, la découverte de médicaments et l'identification des régions cibles pour les maladies neurodégénératives. / Connectomics is one of the biggest challenges in understanding and diagnosing brain diseases. Indeed, many neurological diseases have their origins in a bad connection or a malfunction of brain circuits. This can be caused by genetic defects, developmental dysfunction or degeneration at a later stage of life. To study the morphological changes underlying mental and neurological diseases, current imaging technologies are limited. In fact, studies are often based on two-dimensional images of histological sections and result, in many cases, in incomplete spatial information. In this project, we adopted a strategy that allows us to obtain 3D images of large volumes at high resolution, without any histological section. On the one hand, optical clearing techniques were used to minimize light scattering in tissue samples. On the other hand, for faster imaging, we have designed a fluorescence light sheet microscope with a large field of view and high resolution. The rays of an afocal laser beam are deflected by an axicon (conical prism) to interact with each other and form, in the sample, a thin needle-shaped beam which, when swept at a very high speed along an axis, forms a light sheet. The fluorescence signal from the section illuminated by the light sheet is collected along a perpendicular axis by a scientific CMOS camera. This strategy has surpassed existing systems by providing large volume images with an isotropic micronic resolution. Finally, this new tool has allowed us to make previously impossible studies and will certainly have a direct impact on postmortem evaluation and treatment optimization, drug discovery and identification of target areas for neurodegenerative diseases.

Le domaine de l'aviation est en constante évolution. Les nouveaux avions sont de plus en plus performants, mais de plus en plus bruyants. Plusieurs pays imposent une taxe sur le niveau du bruit d'un avion au décollage. Pour cette raison, un travail continuel est fait afin de réduire l'émission du bruit provenant des moteurs d'avions. Toutefois, cela n'est pas encore suffisant et il y a de la place pour l'amélioration des techniques de réduction du bruit. Ce projet de maîtrise s'inscrit dans le cadre du projet ACOU 1 en collaboration avec le Consortium de recherche et d'innovation en aérospatiale au Québec (CRIAQ) et Pratt&Whitney Canada. L'objectif principal est de développer différentes méthodes de mesure pour déterminer les propriétés des matériaux acoustiques qui se trouvent dans les nacelles pour moteur d'avions. Ces matériaux sont utilisés pour réduire le bruit généré par le moteur d'avion. Un résistivimètre à haut débit a été fabriqué et validé. La validation a été effectuée avec des échantillons de mousses de mélamine et de plaques perforées. Ce résistivimètre permet de mesurer la résistance à l'écoulement des matériaux acoustiques. Une méthode optique a été élaborée pour mesurer le taux de perforation et le diamètre de perforations de plaques perforées ou de "liners" (traitements acoustiques). Les résultats de validation ont été concluants. Une méthode acoustique a été développée pour déterminer le taux de perforation et le nombre de perforations ouvertes. Les mesures ont été faites dans le domaine linéaire et avec des échantillons de plaques perforées. Les valeurs expérimentales sont proches des valeurs théoriques.

Le statut ganglionnaire a la valeur pronostique la plus importante chez les patientes atteintes d’un cancer du sein, le taux de survie étant corrélé au nombre de ganglions envahis. Dans le traitement des cancers du sein opérables d'une taille inférieure à 3 cm, la technique du ganglion sentinelle (GS) remplace le curage ganglionnaire de stadification. Toutefois, cette technique nécessite l’emploi simultané de radioisotopes et de colorants physiologiques présentant divers effets secondaires. Ainsi, notre stratégie a été de tester, sur modèle pré-clinique de nouveaux traceurs fluorescents, les Quantum Dots (QDs), pour la technique du GS. Une étude sur la détection in vivo du ganglion axillaire (GA) par spectrofluorimétrie fibrée après injection sous-cutanée (s.c.) de QDs émettant dans le rouge a été réalisée et leur quantification ex vivo a été effectuée par spectrofluorimétrie jusqu’à 24 h. Ce travail a montré l’accumulation rapide et sélective des QDs dans le GA chez la souris. Une étude sur la localisation in vivo de 2 ganglions régionaux par imagerie de fluorescence a été réalisée suite à l’administration s.c. de QDs émettant dans le proche infrarouge (PIR) ainsi qu’une étude de biodistribution ex vivo par spectrométrie de masse (ICP-MS). Les résultats obtenus ont montré que l’imagerie de fluorescence pouvait être utilisée après injection de QDs pour localiser et suivre leur accumulation dans les ganglions superficiels chez la souris saine. Pour se rapprocher de la clinique, le repérage in vivo du GS axillaire a été investi sur modèle tumoral murin de cancer du sein par imagerie de fluorescence après administration s.c. de QDs émettant dans le PIR. Deux techniques de détection des métastases ganglionnaires ont été utilisées puis comparées : l’histologie conventionnelle et la RT-PCR. Tous les GS axillaires ont été détectés in vivo par imagerie, sauf un GS qui était complètement envahi par les cellules tumorales et la meilleure incidence de métastases ganglionnaire a été observée avec la RT-PCR. Ainsi, les QDs pourraient être utilisés comme substitut des marqueurs actuellement employés dans la technique du GS pour les cancers du sein. / Lymph node (LN) status is the most important prognostic factor in breast cancer patients and a determinant predictor of recurrence and survival. In the treatment of operable breast cancers with a size inferior of 3 cm, the sentinel lymph node biopsy (SLNB) substitutes the axillary LN dissection. However, this technique requires the simultaneous use of a radiocolloid and a physiologic dye, which present several secondary effects. Thus, our strategy was to test in preclinical model the new fluorescent markers, Quantum Dots (QDs) for SLNB. A study on in vivo axillary LN (ALN) mapping by light induced fluorescence was performed after subcutaneous (s.c.) injection of red-emitting QDs and their ex vivo quantification was realized by spectrofluorimetry for up to 24 h. We showed a fast and selective accumulation of QDs in ALN in healthy mice. An in vivo study on localization of 2 regional LNs by fluorescence imaging was carried out after the s.c. administration of near-infrared (NIR) emitting QDs along with ex vivo biodistribution study by mass spectroscopy (ICP-MS). Obtained results shown that fluorescence imaging can be used after QDs injection to map and follow their accumulation in superficial LNs in healthy mice. To approach the human clinic in a best possible way, sentinel ALN mapping was investigated after s.c. delivery of NIR emitting QDs in murine breast cancer model by fluorescence imaging. Two techniques for LN metastasis detection were used and compared: conventional histology and RT-PCR. All sentinel ALNs were located in vivo by imaging except one ALNs which was completely invaded by cancer cells and best incidence of LN metastasis was registered by RT-PCR (60 %). Thus, QDs could be used as a substitute for the markers currently employed in SLNB in breast cancers.