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Caracterização genotípica microrganismos isolados de infecções da corrente sanguína relacionadas a cateteres em recém-nascidosPazzini, Letícia Teixeira [UNESP] 30 April 2010 (has links) (PDF)
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pazzini_lt_me_botib.pdf: 788936 bytes, checksum: f51793dd447f11779e6ccfab2171c59b (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / As infecções relacionadas a cateteres constituem uma das principais causas de bacteremias em UTIs neonatais. O objetivo do presente estudo foi analisar por meio de técnicas de tipagem molecular a similaridade dos microrganismos isolados de cateteres e hemoculturas para o diagnóstico de infecção da corrente sanguínea relacionada com cateteres em recém-nascidos. Foram avaliadas 124 pontas de cateteres e 155 hemoculturas concomitantes de 107 recém-nascidos da Unidade Neonatal. Foram utilizados para cultura de cateter o método semiquantitativo e qualitativo ou método semiquantitativo e quantitativo, e as hemoculturas cultivadas pelo sistema automatizado Bactec. Para a análise fenotípica da similaridade dos isolados de pontas de cateteres e hemoculturas foi utilizado o teste de sensibilidade às drogas antimicrobianas pela técnica da difusão da droga em ágar. Para análise genotípica do perfil de similaridade dos isolados de cateter e hemocultura concomitantes e para o delineamento do perfil clonal das amostras de S. epidermidis isoladas de hemoculturas foram utilizados as técnicas de RAPD-PCR (Random Amplified Polymorphic DNA based PCR) e REP-PCR (Repetitive Extragenic Palindromic Sequence based PCR). Dos 107 recém-nascidos estudados, 45 apresentaram o mesmo microrganismo na ponta de cateter e na hemocultura concomitantemente, desse total 86.7% apresentaram colonização por Staphylococcus coagulase-negativa, 4.4% por Staphylococcus aureus, 4.4% por Candida parapsilosis, 2.2% por Enterococcus faecalis e 2.2% por Pseudomonas aeruginosa. A determinação da similaridade dos isolados revelou que dos 45 recém-nascidos, 46.7% apresentaram infecções da corrente sanguínea relacionadas a cateter pelo método de disco difusão em ágar, 68.9% apresentavam infecções da corrente sanguínea relacionadas a cateter com a utilização da técnica de RAPD-PCR com os primers do grupo... / Catheter-related infections constitute one of the main causes of bacteremia in neonatal ICUs. The aim of the present study was to analyze, by means of molecular typing techniques, the similarity between microorganisms isolated from catheters and blood cultures for the diagnosis of catheter-related bloodstream infection in newborns. The evaluation included 124 catheter tips and 155 concomitant blood cultures from 107 newborns in a Neonatal Unit. For the catheter culture, the semiquantitative and qualitative method or the semiquantitative and quantitative method was used, as well as blood cultures kept by the automated system Bactec. For the phenotypic analysis of similarity between isolates from catheter tips and blood cultures, the test of sensitivity to antimicrobial drugs using the technique of drug diffusion in agar was adopted. For the genotypic analyses of similarity profiles between isolates from catheter and concomitant blood culture and for the clonal profile design of S. epidermidis samples isolated from blood cultures, the techniques RAPD-PCR (Random Amplified Polymorphic DNA-based PCR) and REP-PCR (Repetitive Extragenic Palindromic Sequence-based PCR) were employed. Of the 107 studied newborns, 45 had the same microorganism in the catheter tip and in the blood culture concomitantly; of this total, 86.7% were colonized with coagulase-negative Staphylococcus, 4.4% with Staphylococcus aureus, 4.4% with Candida parapsilosis, 2.2% with Enterococcus faecalis, and 2.2% with Pseudomonas aeruginosa. The assessment of similarity between isolates indicated that, of the 45 newborns, 46.7% had catheter-related bloodstream infections according to the agar disk diffusion method, and 68.9% had catheter-related bloodstream infections according to RAPD-PCR using group-1 primers (RAPD1 for Staphylococcus spp., RAPD 7 for Enterococcus faecalis, ERIC 1 for Pseudomonas aeruginosa, and OPR13... (Complete abstract click electronic acccess below)
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Caracterização genotípica microrganismos isolados de infecções da corrente sanguína relacionadas a cateteres em recém-nascidos /Pazzini, Letícia Teixeira. January 2010 (has links)
Orientador: Maria de Lourdes Ribeiro de Souza da Cunha / Banca: João César Lyra / Banca: Cilmery Suemi Kurokawa / Resumo: As infecções relacionadas a cateteres constituem uma das principais causas de bacteremias em UTIs neonatais. O objetivo do presente estudo foi analisar por meio de técnicas de tipagem molecular a similaridade dos microrganismos isolados de cateteres e hemoculturas para o diagnóstico de infecção da corrente sanguínea relacionada com cateteres em recém-nascidos. Foram avaliadas 124 pontas de cateteres e 155 hemoculturas concomitantes de 107 recém-nascidos da Unidade Neonatal. Foram utilizados para cultura de cateter o método semiquantitativo e qualitativo ou método semiquantitativo e quantitativo, e as hemoculturas cultivadas pelo sistema automatizado Bactec. Para a análise fenotípica da similaridade dos isolados de pontas de cateteres e hemoculturas foi utilizado o teste de sensibilidade às drogas antimicrobianas pela técnica da difusão da droga em ágar. Para análise genotípica do perfil de similaridade dos isolados de cateter e hemocultura concomitantes e para o delineamento do perfil clonal das amostras de S. epidermidis isoladas de hemoculturas foram utilizados as técnicas de RAPD-PCR (Random Amplified Polymorphic DNA based PCR) e REP-PCR (Repetitive Extragenic Palindromic Sequence based PCR). Dos 107 recém-nascidos estudados, 45 apresentaram o mesmo microrganismo na ponta de cateter e na hemocultura concomitantemente, desse total 86.7% apresentaram colonização por Staphylococcus coagulase-negativa, 4.4% por Staphylococcus aureus, 4.4% por Candida parapsilosis, 2.2% por Enterococcus faecalis e 2.2% por Pseudomonas aeruginosa. A determinação da similaridade dos isolados revelou que dos 45 recém-nascidos, 46.7% apresentaram infecções da corrente sanguínea relacionadas a cateter pelo método de disco difusão em ágar, 68.9% apresentavam infecções da corrente sanguínea relacionadas a cateter com a utilização da técnica de RAPD-PCR com os primers do grupo... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Catheter-related infections constitute one of the main causes of bacteremia in neonatal ICUs. The aim of the present study was to analyze, by means of molecular typing techniques, the similarity between microorganisms isolated from catheters and blood cultures for the diagnosis of catheter-related bloodstream infection in newborns. The evaluation included 124 catheter tips and 155 concomitant blood cultures from 107 newborns in a Neonatal Unit. For the catheter culture, the semiquantitative and qualitative method or the semiquantitative and quantitative method was used, as well as blood cultures kept by the automated system Bactec. For the phenotypic analysis of similarity between isolates from catheter tips and blood cultures, the test of sensitivity to antimicrobial drugs using the technique of drug diffusion in agar was adopted. For the genotypic analyses of similarity profiles between isolates from catheter and concomitant blood culture and for the clonal profile design of S. epidermidis samples isolated from blood cultures, the techniques RAPD-PCR (Random Amplified Polymorphic DNA-based PCR) and REP-PCR (Repetitive Extragenic Palindromic Sequence-based PCR) were employed. Of the 107 studied newborns, 45 had the same microorganism in the catheter tip and in the blood culture concomitantly; of this total, 86.7% were colonized with coagulase-negative Staphylococcus, 4.4% with Staphylococcus aureus, 4.4% with Candida parapsilosis, 2.2% with Enterococcus faecalis, and 2.2% with Pseudomonas aeruginosa. The assessment of similarity between isolates indicated that, of the 45 newborns, 46.7% had catheter-related bloodstream infections according to the agar disk diffusion method, and 68.9% had catheter-related bloodstream infections according to RAPD-PCR using group-1 primers (RAPD1 for Staphylococcus spp., RAPD 7 for Enterococcus faecalis, ERIC 1 for Pseudomonas aeruginosa, and OPR13... (Complete abstract click electronic acccess below) / Mestre
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Prevalencia e fatores associados a colonização retal e vaginal pelo Estreptococo do grupo B em parturientes e suas caracteristicas fenotipicasAlves, Valeria Moraes Neder 13 April 2005 (has links)
Orientador: Jose Antonio Simões / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-04T04:28:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Alves_ValeriaMoraesNeder_M.pdf: 694618 bytes, checksum: 74c214a9027dcefb819c6b963eba6be0 (MD5)
Previous issue date: 2005 / Resumo: Introdução - A colonização pelo estreptococo do Grupo B (EGB) é, em nível mundial, altamente prevalente entre as gestantes, variando de 4% a 30%. Estes microorganismos podem ser transmitidos verticalmente e causar sérias conseqüências neonatais. No Brasil ainda não foram adotadas estratégias de prevenção e tratamento para reduzir a incidência de infecção neonatal pelo EGB, as quais, para serem efetivas, devem ser elaboradas com base em conhecimentos sobre a prevalência, aos fatores associados ao maior risco de colonização e às características fenotípicas do estreptococo do Grupo B. Objetivo: estabelecer a prevalência da colonização pelo EGB no trato genital de parturientes, identificar os fatores associados à essa colonização e as características fenotípicas destes estreptococos. Método: foi realizado um estudo de corte transversal, no período de 11 de novembro de 2003 a 14 de maio de 2004. No momento da admissão para o parto, uma amostra de 316 parturientes do Hospital Universitário de Jundiaí foi submetida à coleta, com swab estéril, de material das regiões retal e vaginal, para detecção do EGB, por cultura seletiva no meio de Todd-Hewitt. Dados referentes aos fatores associados à colonização foram obtidos dos prontuários rotineiramente preenchidos, ou perguntados às parturientes e transcritos para a ficha de dados. A susceptibilidade a sete antimicrobianos (penicilina, ampicilina, eritromicina, nitrofurantoina, clindamicina, cefalotina e gentamicina) foi obtida através da técnica de disco difusão dos antibióticos. As amostras foram diferenciadas pela tipagem sorológica e anti-soros específicos para os tipos sorológicos Ia, Ib, II, III, IV, V). Resultados: A prevalência da colonização pelo EGB na amostra estudada foi de 14,6%. Trabalhar fora de casa foi um fator significativamente associado à colonização. Nenhuma cepa foi resistente à penicilina, ampicilina, eritromicina e nitrofurantoína. A maior resistência foi para a gentamicina (76,1%), seguida pela clindamicina (17,4%). O sorotipo mais freqüente foi o Ib (23,9%), seguido pelos sorotipos II e Ia (19,6% e 17,4%, respectivamente). Não houve correlação entre o sorotipo e a maior resistência antimicrobiana. CONCLUSÃO: a prevalência da colonização pelo EGB em parturientes do Hospital Universitário de Jundiaí foi alta. Não houve fatores associados à colonização, exceto ao que se refere ao fato de trabalhar fora de casa. A penicilina continua sendo a droga de escolha para a profilaxia intraparto, porém a clindamicina como alternativa em mulheres alérgicas à penicilina deverá ser melhor avaliada por antibiograma ou substituída pela cefalotina. O sorotipo mais freqüente (Ib) diferiu da maioria dos estudos em outros países, demonstrando a necessidade da identificação da sorotipagem em cada região, a fim de uma futura elaboração de vacinas específicas para as gestantes brasileiras / Abstract: Introduction - Genital colonization with Group B Streptococcus(GBS) occurs in 4% to 30% of pregnant women. GBS can be vertically transmitted and cause significant morbidity and mortality in newborns. Strategies for prevention and treatment to reduce the incidence of the newborn infection have not been established yet in Brazil. In order to be effective, these strategies must be made based on the knowledge on prevalence, risk factors for GBS colonization and on GBS phenotypic characteristics. Objectives: To establish the prevalence of GBS genital colonization, to identify the factors associated with this colonization and the GBS phenotypic characteristics (antibiotic susceptibility and serotypes). Methodology: The study was carried out from November 11, 2003 to May 14, 2004. A total of 316 pregnant women of the University Hospital of Jundiaí was sampled for GBS cultures at the admission for delivery. Samples were collected using sterile swab from the vagina and rectum, which were immediately inoculated onto Todd Hewitt¿s selective medium. Data regarding to the factors associated with the colonization were obtained from patient¿s clinical record files. GBS antibiotic susceptibilities were determined using disk diffusion to seven antibiotics (penicillin, ampicillin, erythromycin, clindamycin, cefalotin, gentamycin and nitrofurantoin) according to the guidelines of the National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCLS). Serotypes were determined using specific anti-serum Ia, Ib, II, III, IV and V. Results: GBS colonization rate was 14.6%. The only factor significantly associated with GBS colonization was to have a job out of home. None isolate was resistant to penicillin, ampicillin, erythromycin or nitrofurantoin. The highest resistance rate was to gentamycin (76.1%), followed by clindamycin (17.4%). The most frequent serotype was Ib (23.9%) followed by serotypes II and Ia (19.6% and 17.4%, respectively). No correlations were found between serotype and antibiotic resistance. Conclusion: GBS colonization rate was high in pregnant women attending the University Hospital of Jundiaí for delivery. No risk factors were associated with the colonization except to have a job out of home. Penicillin continues to be the drug of choice for intrapartum antibiotic prophylaxis. However, clindamycin as an alternative in women allergic to penicillin should be better evaluated using antibiotic sensitivity tests. The most frequent serotype found in this study (Ib) was not the same found in most of studies from another countries. This result highlights the importance of the knowledge of the most prevalent serotypes in each region to further development of an appropriate vaccine for GBS / Mestrado / Tocoginecologia / Mestre em Tocoginecologia
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Colonização endocervical em gestantes com trabalho de parto prematuro e/ou ruptura prematura de membranasPinto, Giuliane Jesus Lajos 22 July 2005 (has links)
Orientador: Renato Passini Junior / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-11-27T10:57:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Pinto_GiulianeJesusLajos_M.pdf: 245675 bytes, checksum: 71fd93a1854439989a54c4faa89da2dc (MD5)
Previous issue date: 2005 / Resumo: Objetivo: estudar a colonização bacteriana endocervical em gestantes com trabalho de parto prematuro e/ou ruptura prematura de membranas (termo e pré-termo). Método: 212 gestantes com trabalho de parto prematuro (TPP) e/ou ruptura prematura de membranas (RPM), internadas no Hospital Estadual Sumaré (Unicamp), foram avaliadas no período de julho de 2002 a janeiro de 2004. Na admissão hospitalar foram coletadas duas amostras do conteúdo endocervical, realizadas bacterioscopia e cultura em meios ágar-sangue ou ágar-chocolate. Foram analisadas associações da colonização endocervical com infecção de trato urinário materno, corioamnionite, uso de antibióticos, dados de parto, sofrimento fetal, prematuridade, infecção e óbito neonatais. Resultados: entre as mulheres estudadas, 74 (35%) tinham TPP e 138 (65%), RPM. A prevalência de colonização endocervical foi de 14,2% (IC=9,5%-18,9%), com resultados similares em TPP e RPM. Na população estudada, o microorganismo mais encontrado foi o estreptococo do grupo B (EGB) (9,4%), sendo também isolados Candida sp (5 casos), Streptococcus sp (2 casos), Streptococcus pneumoniae, Escherichia coli e Enterococcus sp (1 caso de cada). Das bacterioscopias analisadas, os achados mais freqüentes foram baixa prevalência de bacilos de Dodërlein e elevado número de leucócitos. Em mulheres colonizadas houve maior prevalência de infecção de trato urinário (23,8% versus 5,4%; p<0,01), infecção neonatal (25,0% versus 7,3%; p<0,01) e óbito neonatal (dois casos entre as colonizadas; p<0,02), quando comparadas às não-colonizadas. Conclusões: observou-se alta prevalência de colonização endocervical, sem a utilização de meios de cultura seletivos. O EGB foi o principal microorganismo isolado, reforçando a necessidade de triagem deste agente durante a gestação e nas situações de risco estudadas. Um terço das culturas positivas ocorreram por outros agentes. Estudos complementares são necessários para esclarecer a importância destes achados bacteriológicos no canal endocervical e sua associação com complicações gestacionais, sepse e mortalidade neonatais / Abstract: Objective: to study cervical colonization in women with preterm labor and/or premature rupture of membranes. Method: 212 pregnant women with preterm labor and/or premature rupture of membranes (PROM), admitted at Hospital Estadual Sumaré, during the period between July 2002 and January 2004, were studied. Two cervical samples from each woman were collected and bacterioscopy and culture in blood-agar or chocolate-agar plates were performed. Association of cervical microorganisms and urinary infection, chorioamnionitis, antibiotics use, prematurity, neonatal infection and neonatal death were evaluated. Results: the population evaluated consisted of 74 women with preterm labor (35%) and 138 women with PROM (preterm and term). The prevalence of cervical colonization was 14.2% (CI=9.5-18.9%), with similar results in preterm labor or PROM. Group B streptococcus was the most prevalent organism in this population (9.4%). Other organisms isolated were Candida sp, Streptococcus sp, Streptococcus pneumoniae, Escherichia coli and Enterococcus sp. The most common findings of bacterioscopy were a reduced number of lactobacilli and a great number of leukocytes. Endocervical colonization was associated with a higher occurrence of urinary tract infection (23.8% versus 5.4%; p<0.01), early-onset of neonatal infection (25.0% versus 7.3%; p<0.01) and neonatal mortality (2 cases in colonizated women; p<0.02) when compared with a negative culture of endocervical mucus. Conclusions: this study showed high prevalence of endocervical colonization despite of the use of a nonselective culture media. The main microorganism isolated was Group B streptococcus but other organisms were present in one third of studied population. More studies are needed to evaluate the influence of endocervical colonization in obstetrical outcome and in neonatal sepsis and mortality / Mestrado / Tocoginecologia / Mestre em Tocoginecologia
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