Resumo: A informatização de dados clínicos viabiliza o gerenciamento das informações e possibilita análises comparativas para a realização de trabalhos científicos. Atualmente, existem protocolos eletrônicos desenvolvidos e incorporados ao SINPE© (Sistema Integrado de Protocolos Eletrônicos) nas áreas de cirurgia do aparelho digestório, ortopedia, urologia, cirurgia plástica, cirurgia vascular, oftalmologia, enfermagem, fisioterapia, além de outros em desenvolvimento. Na área de cirurgia cardiovascular, ainda não havia sido criado nenhum protocolo eletrônico. Objetivos: a) criar uma base de dados clínicos referente às valvopatias cardíacas a partir da coleta padronizada de informações nas fontes bibliográficas de referência; b) informatizar esta base de dados clínicos sob a forma de um software, utilizando o programa: Sistema Integrado de Protocolos Eletrônicos - SINPE©; c) interpretar e comparar as informações obtidas entre coleta de dados prospectiva e retrospectiva no protocolo eletrônico de doenças valvares cardíacas; ) incorporar este protocolo eletrônico ao SINPE©. Material e Método: O “Protocolo Eletrônico Multiprofissional de Cirurgia Cardiovascular com Ênfase em Doenças Valvares” é um estudo descritivo, realizado no Serviço de Cirurgia Torácica e Cardiovascular, do Hospital de Clínicas da Universidade Federal do Paraná, sendo constituído pelas seguintes fases: criação da base teórica de dados clínicos de cirurgia ardiovascular com ênfase em doenças valvares; informatização dessa base teórica de dados, utilizando o SINPE©; interpretação dos dados da coleta prospectiva de pacientes; comparação dos resultados entre dois bancos de dados: um prospectivo e outro retrospectivo. A análise dos bancos de dados foi realizada com a aplicação da interface de visualização de informações denominada SINPE Analise©. Resultados: O protocolo eletrônico desenvolvido permitiu armazenar dados referentes à: anamnese, exame físico, exames complementares, diagnóstico, tratamento e evolução de pacientes portadores de doenças cardiovasculares, com ênfase nas doenças valvares cardíacas. Foram criados neste estudo um protocolo mestre composto por 18.448 itens e um protocolo específico de doenças valvares composto por 16.569 itens. As coletas de dados relativos à internação de pacientes submetidos à cirurgia cardíaca valvar formaram dois bancos de dados que puderam ser resgatados, comparados e analisados estatisticamente, comprovando a funcionalidade do método empregado. Conclusões: a) foi criada com sucesso uma base eletrônica de dados clínicos referente às valvopatias cardíacas a partir da coleta padronizada de nformações; b) esta base de dados clínicos foi informatizada sob a forma de um software, utilizando o programa SINPE©; c) foi possível interpretar e comparar as informações obtidas com as coletas de dados prospectiva e retrospectiva no protocolo eletrônico de doenças valvares cardíacas, utilizando os módulos do SINPE© e SINPE Analise©; d) o “Protocolo Eletrônico Multiprofissional de Cirurgia Cardiovascular com Ênfase em Doenças Valvares” foi incorporado ao SINPE©.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação, 2010. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2013-02-27T10:18:57Z No. of bitstreams: 1 2010_RodrigoCarneiroMunhozCoimbra.pdf: 6402497 bytes, checksum: d5a34dc54c861dc3ae5da8a9864343dd (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2013-02-27T10:20:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_RodrigoCarneiroMunhozCoimbra.pdf: 6402497 bytes, checksum: d5a34dc54c861dc3ae5da8a9864343dd (MD5) / Made available in DSpace on 2013-02-27T10:20:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_RodrigoCarneiroMunhozCoimbra.pdf: 6402497 bytes, checksum: d5a34dc54c861dc3ae5da8a9864343dd (MD5) / A genômica comparativa é uma área de pesquisa que tem como objetivo a busca de como dados genômicos podem estar relacionados entre diferentes espécies. Par¬ticularmente, o volume de dados disponibilizados em bancos de dados públicos permite a busca de sintenias entre múltiplos genomas. Um par de genes é dito sintênico quando estes se conservam dentro da mesma região do DNA. Os mé¬todos comparativos ainda usam abordagens tradicionais, tais como alinhamento textual e o uso de heurísticas para acelerar as comparações. Eles produzem como resultado arquivos textuais, o que dificulta análises mais específicas, tais como a identificação de sintenias. Nesse sentido, é essencial o desenvolvimento de ferra¬mentas de visualização de comparações entre múltiplos genomas que facilitem a identificação de sintenias. O objetivo deste trabalho é propor e implementar uma ferramenta computacional que implemente um novo método de visualização que permite identificar sintenias entre múltiplos genomas, a partir de um genoma não totalmente sequenciado. Essa ferramenta foi aplicada na identificação de sinte- nias no fungo P. brasiliensis. Essa nova ferramenta, denominada Syntainia, está sendo desenvolvida como um software livre e já está disponível para download em http://sourceforge.net/projects/syntainia. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Comparative genomics is a research field that aims to find how genomic data can be related among different species. Particularly, the volume of data available in public databases allows for searching of synteny among multiple genomes. A pair of genes is said to be syntenic when they keep within the same region of the DNA. The com¬parative methods still use traditional approaches, such as text alignment and the use of heuristics to speed up comparisons. They produce results as text files, which makes difficult more specific analyses, such as the identification of synteny. Thus, it is essential the development of visualization tools to compare multiple genomes that facilitate the identification of synteny. The objective of this work is to propose and implement a software tool that implements a new visualization method for identifying synteny among multiple genomes from a not fully sequenced genome. This tool was applied in the identification of syntenies in the fungus P. brasilien- sis. This new tool, called Syntainia, is being developed as free software and is now available for download at http://sourceforge.net/projects/syntainia.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, 2012. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-04-11T12:03:29Z No. of bitstreams: 1 2012_LaraBenignoPortoDantas.pdf: 4927075 bytes, checksum: cf1f7b839839d9119d4f195017e9132c (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-04-12T12:04:50Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_LaraBenignoPortoDantas.pdf: 4927075 bytes, checksum: cf1f7b839839d9119d4f195017e9132c (MD5) / Made available in DSpace on 2013-04-12T12:04:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_LaraBenignoPortoDantas.pdf: 4927075 bytes, checksum: cf1f7b839839d9119d4f195017e9132c (MD5) / Introdução: Os Sistemas de Informação Geográfica (SIGs) emergiram como ferramentas inovadoras que têm se mostrado bastante úteis para projetos em epidemiologia. Este é o primeiro estudo brasileiro que se propõe a descrever o padrão geográfico de distribuição espacial da acromegalia e a avaliar se o acesso ao Sistema de Saúde poderia influenciar a evolução da doença. Objetivos: Descrever a distribuição espacial, quanto ao local de residência, dos pacientes acromegálicos acompanhados no ambulatório de Neuroendocrinologia do Hospital Universitário de Brasília (HUB), visando identicar fatores externos que possam estar relacionados ao surgimento da doença. Validar um método capaz de vincular informações de um banco de dados eletrônico contendo o registro clínico de pacientes acromegálicos com programas de SIGs. Avaliar a dificuldade de acesso ao Sistema de Saúde e seu impacto no atraso para o diagnóstico e no tamanho tumoral na avaliação inicial. Métodos: A Unidade de Neuroendocrinologia do HUB dispõe de registro eletrônico próprio (Access, Microsoft, Bellevue, WA), em programa desenvolvido para armazenar dados relacionados ao acompanhamento de pacientes com doença hipofisária, sendo esse o centro de referência para acompanhamento dessas patologias no Distrito Federal (DF). Informações referentes a 112 pacientes portadores de acromegalia, diagnosticados 1995-2012, foram incorporadas a um formato de planilha (Excel 2003, Microsoft, Bellevue, WA) e os endereços residenciais foram plotados no software de SIG para análise espacial (ArcGIS 9.3 e Arcview 3.2, ESRI, Redlands, CA). Resultados: O diagnóstico da acromegalia tem aumentado na última década, superando o crescimento populacional. A idade ao diagnóstico também se elevou ao longo do tempo. A distribuição espacial mostrou que 38,1% dos pacientes residem entre 0,33 e 8,66 km; 17,7% entre 8,67 e 18,06km; 22,2% entre 18,07 e 25,67km e 22,0% entre 25,68 e 36,70km de distância do centro de referência para tratamento. Verificou-se que migração ocorreu em 26 casos, a partir de cidades localizadas em outros estados do Centro-Oeste e em diferentes regiões do país. Não houve correlação significativa entre o afastamento do domicílio e o atraso no diagnóstico (r = 0,43 p = 0,3), assim como também não houve correlação significativa entre distância da residência dos pacientes ao centro médico de referência e o volume tumoral (r = 0,57 p = 0,15). Conclusões: Este estudo validou a aplicação dos SIGs em dados clínicos de pacientes portadores acromegalia. Não foram encontradas diferenças espaciais relevantes na distribuição dos pacientes. Brasília é uma cidade urbana com baixa concentração de fatores ambientais nocivos e indústria, talvez por esse motivo não tenham sido identificadas diferenças significativas. Dados epidemiológicos de importância podem se tornar aparentes com a aplicação de técnicas de geoprocessamento em uma maior coorte de pacientes. Quanto ao acesso ao Sistema de Saúde, embora a distância entre o hospital e os domicílios dos pacientes não tenha repercutido no tempo para realização do diagnóstico e nem no volume tumoral, refletindo um acesso relativamente equânime ao centro de referência, a oferta de serviços precisa ser melhorada, pois pacientes oriundos de regiões distantes do DF necessitaram de atendimento no HUB. _______________________________________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Introduction: Geographic Information Systems (GIS) have emerged as innovative tools that have proven to be very useful for projects in epidemiology. This is the first Brazilian study that purports to describe the geographical pattern of spatial distribution of acromegaly and evaluate whether access to the Health System could influence disease progression. Objectives: To describe the spatial distribution of acromegalic patients treated in the Neuroendocrinology Unit of the University Hospital of Brasília, aiming to assess the presence of external factors that could be related to the emergence of the disease. To validate a method able to link information from an electronic database containing the clinical records of acromegalic patients with GIS programs. Appraise the difficulty of access to the Health System and its impact on delay to diagnosis and tumor size at baseline. Methods: The Neuroendocrinology Unit of the University Hospital of Brasília, which is the reference center for treatment of pituitary diseases in the Federal District, has its own electronic record (Access, Microsoft, Bellevue, WA), in a program designed to store data related to the attendance of patients with this kind of pathology. Information regarding 112 patients with acromegaly, diagnosed from 1995 to 2012, were incorporated into a spreadsheet format (Excel 2003, Microsoft, Bellevue, WA) and residential addresses were plotted in GIS software for spatial analysis (ArcGIS 9.3 and Arcview 3.2, ESRI, Redlands, CA). Results: The diagnosis of acromegaly has increased in the last decade, outpacing population growth. Age at diagnosis also increased over time. The spatial distribution showed that 38.1% of the patients resided between 0.33 and 8.66 km, 17.7% between 8.67 and 18.06 km, 22.2% between 18.07 and 25.67 km and 22.0% between 25.68 and 36.70 km away from the reference center for treatment. It was found that migration occurred in 26 cases, from cities located in other states in the Midwest and in different regions of the country. There was no significant correlation between the distance from patient´s home to the medical referral center and delayed diagnosis (r = 0.43 p = 0.3), as well as no significant correlation between distance of residence and tumor volume (r = 0.57 p = 0.15). Conclusions: This study validated the application of GIS in clinical data of patients with acromegaly. There were no relevant differences in the spatial distribution of patients. Brasília is an urban city with low concentration of harmful environmental factors and industry, perhaps for that reason there were no significant differences. Epidemiological data of relevance may become apparent with the application of GIS techniques in a larger cohort of patients. Regarding to the access to the Health System, although the distance between the hospital and patients' homes do not have resulted in a larger tumor volume or in a longer time for correct diagnosis, reflecting a relatively equitable access to the referral center, the provision of health services need to be improved because patients from distant regions of the Federal District required attendance at the University Hospital of Brasília.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Elétrica, 2013. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2013-04-25T15:41:42Z No. of bitstreams: 1 2013_PatrickLetouzeMoreira.pdf: 4516369 bytes, checksum: d4aeeef991be37a53ebc207587aa66dc (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-05-24T12:21:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_PatrickLetouzeMoreira.pdf: 4516369 bytes, checksum: d4aeeef991be37a53ebc207587aa66dc (MD5) / Made available in DSpace on 2013-05-24T12:21:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_PatrickLetouzeMoreira.pdf: 4516369 bytes, checksum: d4aeeef991be37a53ebc207587aa66dc (MD5) / No Brasil, através do SUS : Sistema Único de Saúde, o governo federal financia aproximadamente 94% dos transplantes de órgãos sólidos representando em 2010 6.053 cirurgias de um total de 6.442 que foram executadas por 241 equipes. Esse contexto representa uma oportunidade para a realização de pesquisas médicas. Para tanto, faz-se necessário um sistema de gerência da informação. Portanto, neste trabalho foi proposta uma metodologia para o desenvolvimento de sistemas de gerência da informação para o suporte a medicina baseada em evidência. Para testar essa metodologia, desenvolveu-se um sistema web para a gerência de pacientes de transplante de orgãos sólidos que seja centrado no paciente e que apoie a pesquisa médica na área favorecendo a qualidade da evidência e a força da recomendação no diagnóstico, no tratamento e na prevenção, de modo a permitir o uso de estimativas matemáticas de probabilidade e riscos. Além disso, foi desenvolvido um sistema para a evolução de diretrizes médicas e um sistema wiki para a elaboração colaborativa dessas diretrizes e de relatos de pesquisa médica. Por fim, para testar esses sistemas, escolheu-se o transplante de rins como estudo de caso devido a sua importância no contexto brasileiro. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / In Brazil the federal government nances approximately 94% of solid organs transplanta tions. In 2010 that represented 6,053 surgeries of 6,442 that were performed by 241 teams. This context represents an opportunity for medical research and a management information system would be an asset. Therefore, in this work a methodology for the development of management information systems to support evidence based medicine was proposed. In order to test this methodology, a web system for transplantation management was developed that is patient-centered to support medical research promoting quality of evidence and strength of recommendation in the diagnosis, treatment, and prevention, allowing the use of mathematical estimates of probability and risk. Besides, it was developed a system for the evolution of medical initiatives and guidelines, and a wiki system for the collaborative writing of guidelines and study reports. Finally, to test these systems, kidney transplantation was chosen as study case due to its importance in the Brazilian context.

Resumo: A densitometria radiográfica é técnica que permite avaliar a densidade óssea, utilizando referências confeccionadas em material inerte (ex. alumínio), principalmente para investigação de alterações ósseas e doenças como a osteoporose. Para aumentar a precisão de técnica, alguns autores propõe o uso de equações matemáticas, como métodos dos mínimos quadrados, teorema de LaPlace e regra de Sarrus o que permitirá obter melhor ajuste da curva característica de absorção aos raios-X pelo objeto de estudo. O uso de tecnologias como Java, gnuplot, broffice calc, todas elas de código aberto, possibilitou-nos o desenvolvimento do software "ODR-ATA", capaz de analisar e processar imagens radiográficas digitais ou digitalizadas e calcular valores de densidade próximos aos valores do objeto em estudo. Atualmente diversas soluções pagas possuem suporte para realizar a densitometria radiográfica. O objetivo deste estudo foi desenvolver uma solução computacional de código livre, para cálculo da densidade óssea a partir da densitometria radiográfica. Para testar o software, foi realizado um experimento a partir de uma tomada radiográfica de uma escada de alumínio de valores conhecidos. Foram feitas 10 repetições e avaliados os degraus 4, 5, 6, 7 e 8 da escada de alumínio. Os resultados obtidos pelo "ODR-ATA" para os degraus 5, 6, 7 e 8 demonstraram uma precisão e exatidão de ordem de 3,64% e 3,63% respectivamente, atestando a validade e confiabilidadena utilização do software na obtenção da densidade óssea obtida pela densidade radiográfica. / Abstract: The radiographic densitometry is the technic that allows the evaluation of bone density, which uses references created in inert material (e.g. aluminium) especially to the investigation of bone modifications and illnesses such as osteoporosis. To increase technical precision some authors suggest the use of mathematical equations, such as the least squares method, Laplace's theorem, and the Rule of Sarrus allowing better results when achieving the adjustment of the curve that is characteristic of X-ray absorption by what is being studied. The usage of technologies such as Java, gnuplot, broffice calc, all of open code, allowed us to develop the software "ODR-ATA", which is capable of analyzing and processing digital radiographic images and of calculating values of density close to the values of the object under study. Recently, various paid solutions have the support to perform radiographic densitometry. The purpose of this study is to develop a computational solution of free code to calculate bone density starting from the radiographic densitometry. In order to test the software I performed an experiment that started with the radiography of an aluminum ladder of unknown values. I performed 10 repetitions and evaluated steps 4,5,6,7, and 8 of the aluminum ladder. The results I achieved with "ODR-ATA" for steps of number 5,6,7, and 8 show a precision of 3,64%% and 3,63% respectively, which attest for the validity and reliability of the software in the discovery of the bone density obtained through the radiographic densitometry / Orientador: Mário Jefferson Quirino Louzada / Banca: Luciana Del Pinoti Ciarlini / Banca: Gilberto Aparecido Coclete / Mestre

Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2009 / Bibliografia: f. 73-79 / Aprendizagem de ontologias (ontology learning) é definida como um conjunto de métodos e técnicas para a construção semiautomática de uma nova ontologia ou para o enriquecimento de uma já existente. Para construir uma ontologia de maneira semiautomática é / Ontology Learning is defined as a set of methods and techniques for the semi-automatic construction of a new ontology or to enrich an existing one. To build an ontology in a semiautomatic way it is necessary to automate the process of acquiring knowledge.

Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2008 / Bibliografia: f. 133-139 / O aumento da morbimortalidade e a ausência de uma padronização para a coleta de dados assistênciais das vítimas de queimaduras requerem estudos mais aprimorados. O objetivo deste trabalho foi a proposição de atributos e a implementação de um banco de dado / Increased morbidity and mortality and the lack of standardized procedures for collecting data on healthcare provided to burns victims require more enhanced studies to be performed. The aim of this thesis was to propose attributes for and the implementatio

Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2005 / Inclui bibliografia / Este trabalho apresenta uma arquitetura multi-agente para o controle e monitoramento de infecções hospitalares em unidades de tratamento intensivo neonatal. O objetivo é fazer interagir, de forma dinâmica e inteligente, fontes de informações distribuídas

Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2005 / Inclui bibliografia / Este trabalho propõe o uso de técnicas clássicas da engenharia de software orientada a objetos para a modelagem de sistemas de agentes cognitivos independentes, bem como mostrar a relevância de uma arquitetura distribuída e aberta, baseada no modelo agent / This work considers the use of classic techniques of the guided engineering of software the objects for the modeling of systems of independent cognitivos agents, as well as showing the relevance of a distributed and opened architecture, based in the agen

Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2012 / Bibliografia: f.132-140 / Introdução: A educação Médica está passando por transformações significativas nos últimos anos, em especial desde a década de 2000, quando foram elaboradas as novas diretrizes para o curso de Medicina, pautadas em competências (28 competências em sua tota / Introduction: Medical education is undergoing significant transformation in recent years, particularly since the 2000s, when new guidelines were developed for th Medical school, grounded in competences (28 competences in total). This guideline aims at tra