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Biologia termal e seleção de microhabitats de Amphisbaena munoai em campos rochosos do bioma pampa

Matias, Nathalia Rocha January 2013 (has links)
A ecologia termal de répteis fossoriais é pouco conhecida porque as observações em condições naturais são difíceis. Para saber se répteis fossoriais têm a capacidade de termorregulação ou se são conformistas, é necessário estudar a biologia térmica em relação à temperatura do corpo e ao ambiente térmico das espécies. Todos os organismos utilizam estratégias para lidar com a heterogeneidade térmica: animais endotérmicos reagem fisiologicamente e animais ectotérmicos têm resposta comportamental. A área de estudo localiza-se no município de São Jerônimo, no Rio Grande do Sul. O estudo de campo ocorreu de março de 2011 a outubro de 2012. totalizando 1.104 horas/coletor de esforço de captura. De hora em hora foram medidas as temperaturas ambientais, e no encontro de um espécime foram medidos o comprimento rostro-cloacal, a temperatura cloacal e as temperaturas ambientais do microhabitat. Foram encontradas 192 Amphisbaena munoai. Para o experimento de seleção de microhabitats termais em laboratório foram capturados 14 espécimes, no local do estudo de campo e levados para o Laboratório de Herpetologia da Universidade Federal do Rio Grande do Sul, onde os espécimes foram acondicionados em aquário com luz artificial e pedras de tamanhos diferentes. A maioria dos indivíduos apresentou temperatura corporal entre 24ºC e 30ºC, tanto no estudo de campo como o de laboratório. No inverno e na primavera foram encontrados mais espécimes que no verão e no outono. Na primavera a A. munoai demonstrou atividade noturna similar a diurna. Em laboratório encontramos anfisbenas com temperatura corporal até 5ºC mais alta que qualquer temperatura ambiental, o que indica a interferência de mecanismo fisiológico na termorregulação destes animais. Análises de variância (ANOVA) foram utilizadas para comparar temperaturas sazonalmente e Análises de regressão múltipla para determinar a importância relativa da fonte de calor. A seleção de microhabitats foi constatada através da Análise de Correlação Canônica (Rc=0.2, X2=13.4, gl=6, p<0.04). Amphisbaena munoai é uma espécie tigmotérmica termoconformista diária e sazonal, porém esta espécie é capaz de termorregular ativamente, selecionando microhabitats para desenvolver suas diferentes atividades dentro de um intervalo de temperatura ideal.
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Biologia termal e seleção de microhabitats de Amphisbaena munoai em campos rochosos do bioma pampa

Matias, Nathalia Rocha January 2013 (has links)
A ecologia termal de répteis fossoriais é pouco conhecida porque as observações em condições naturais são difíceis. Para saber se répteis fossoriais têm a capacidade de termorregulação ou se são conformistas, é necessário estudar a biologia térmica em relação à temperatura do corpo e ao ambiente térmico das espécies. Todos os organismos utilizam estratégias para lidar com a heterogeneidade térmica: animais endotérmicos reagem fisiologicamente e animais ectotérmicos têm resposta comportamental. A área de estudo localiza-se no município de São Jerônimo, no Rio Grande do Sul. O estudo de campo ocorreu de março de 2011 a outubro de 2012. totalizando 1.104 horas/coletor de esforço de captura. De hora em hora foram medidas as temperaturas ambientais, e no encontro de um espécime foram medidos o comprimento rostro-cloacal, a temperatura cloacal e as temperaturas ambientais do microhabitat. Foram encontradas 192 Amphisbaena munoai. Para o experimento de seleção de microhabitats termais em laboratório foram capturados 14 espécimes, no local do estudo de campo e levados para o Laboratório de Herpetologia da Universidade Federal do Rio Grande do Sul, onde os espécimes foram acondicionados em aquário com luz artificial e pedras de tamanhos diferentes. A maioria dos indivíduos apresentou temperatura corporal entre 24ºC e 30ºC, tanto no estudo de campo como o de laboratório. No inverno e na primavera foram encontrados mais espécimes que no verão e no outono. Na primavera a A. munoai demonstrou atividade noturna similar a diurna. Em laboratório encontramos anfisbenas com temperatura corporal até 5ºC mais alta que qualquer temperatura ambiental, o que indica a interferência de mecanismo fisiológico na termorregulação destes animais. Análises de variância (ANOVA) foram utilizadas para comparar temperaturas sazonalmente e Análises de regressão múltipla para determinar a importância relativa da fonte de calor. A seleção de microhabitats foi constatada através da Análise de Correlação Canônica (Rc=0.2, X2=13.4, gl=6, p<0.04). Amphisbaena munoai é uma espécie tigmotérmica termoconformista diária e sazonal, porém esta espécie é capaz de termorregular ativamente, selecionando microhabitats para desenvolver suas diferentes atividades dentro de um intervalo de temperatura ideal.
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Efeito do pastejo sobre as assembleias de formigas nos campos sulinos

Dröse, William January 2015 (has links)
A conservação da biodiversidade aliada ao uso sustentável dos ecossistemas é considerada um grande desafio. A atividade pastoril é um dos principais tipos de uso da terra e cobre cerca de 25% da superfície terrestre. No entanto, apenas recentemente é que a manutenção da biodiversidade dos ecossistemas surgiu como preocupação em função desta prática. Os Campos Sulinos são ambientes do sul do Brasil que abrigam uma ampla riqueza de espécies. As formigas desempenham papéis essenciais nestes ecossistemas campestres e são fortemente recomendadas para avaliar efeitos do manejo da terra. Desta forma, foi avaliado experimentalmente o efeito de diferentes tipos de manejo pastoril sobre as assembleias de formigas nos Campos Sulinos. As coletas foram realizadas em seis localidades do Rio Grande do Sul (RS), nos anos de 2011, 2012 e 2013. Foram utilizados dois métodos amostrais: armadilhas de solo (pitfall trap) e rede de varredura (sweep net). Em cada localidade, três tipos de tratamentos foram avaliados: (i) manejo pastoril convencional, (ii) manejo pastoril sustentável e (iii) exclusão de pastejo. Foram coletadas 96 espécies de formigas, pertencentes a 28 gêneros. Houve redução significativa na abundância, riqueza e diversidade de espécies de formigas com três anos de abandono de manejo. A composição de espécies não foi afetada pelos tratamentos, apenas pelas diferentes regiões. A estrutura da vegetação e variáveis do habitat foram modificados ao longo do tempo, respondendo aos diferentes tipos de manejo pastoril. Espécies vegetais classificadas como touceiras apresentaram correlações negativas com as formigas, enquanto espécies lenhosas e forbs foram positivamente correlacionadas com estes organismos. Estes resultados demonstram que a ausência de manejo pastoril em campos nativos do RS afeta negativamente as assembleias de formigas, e poderão auxiliar na elaboração de futuros planos de conservação dos Campos Sulinos.
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Tuco-tucos do pampa rio-grandense : a filogeografia de Ctenomys torquatus (rodentia-ctenomyidae) e a descrição de uma nova espécie

Roratto, Paula Angélica January 2012 (has links)
O tuco-tuco de colar, Ctenomys torquatus, possui uma das maiores distribuições geográficas entre estes roedores, habitando os campos de baixa altitude em toda metade norte do Uruguai e na porção sul do estado do Rio Grande do Sul, Brasil. A variabilidade cromossômica, comum em espécies deste roedor subterrâneo, ocorre em apenas algumas populações periféricas de C. torquatus, particularmente em regiões na quais grandes cursos d’água separam formas cromossômicas distintas. Com os objetivos de descrever os padrões filogeográficos de C. torquatus, bem como o efeito de grandes rios na estruturação de populações e diferentes cariótipos, o presente estudo fez uso de três marcadores mitocondriais (sequência hiper variável 1 da região controle e os genes citocromo-c oxidase I e citocromo-b), além do desenvolvimento e aplicação de locos de microssatélites. A filogenia obtida com o gene citocromo-b, juntamente com evidências morfológicas e cariotípicas, claramente demonstraram a singularidade de uma nova espécie, denominada Ctenomys ibicuiensis. Esta espécie possui apenas um cariótipo (2n = 50) e não compartilha um ancestral comum direto recente com o tuco-tuco de colar, apesar da proximidade geográfica. Este trabalho apresenta a posição filogenética da nova espécie e sua relação filogeográfica com o tuco-tuco de colar. Análises filogenéticas também foram empregadas com o objetivo de estimar uma taxa de evolução molecular para o DNA mitocondrial dos ctenomídeos, a qual foi posteriormente aplicada em inferências demográficas considerando uma escala de tempo. Associada a estreita área de ocorrência e pequena amostragem, as populações de C. ibicuiensis apresentaram baixa variabilidade genética em comparação com as demais espécies do gênero Ctenomys, embora não tenha havido evidências da ocorrência de processos de redução populacional (bottleneck) nem índices de endogamia singificativos. Análises de estruturação genética para dados de microssatélite e DNA mitocondrial revelaram diferenciação significativa entre as populações, não havendo situações de clados ou grupos de haplótipos altamente divergentes, relacionados a linhagens regionais, para nenhuma das espécies. Testes de neutralidade, mismatch distribution e duas análises demográficas baseadas em coalescência sinalizaram a ocorrência de expansão populacional recente para C. torquatus, 9 amplamente distribuída; ao passo que um padrão de estabilidade populacional foi observado para a espécie C. ibicuiensis, geograficamente restrita. A região central do Rio Grande do Sul é a provável origem da expansão populacional recente descrita para C. torquatus. O cariótipo mais comum e amplamente distribuído 2n = 44, considerado plesiomórfico, e os registros pontuais e periféricos de variações cariotípicas, corroboram este cenário de expansão. AMOVA e outras análises de estruturação não demonstraram substancial partição da variação genética associada à presença dos rios. O efeito do rio atuando como barreira ao fluxo gênico foi verificado apenas pela comparação da baixa estruturação genética entre as localidades da nascente em relação aos demais pontos do rio onde a largura e a vazão são maiores. A expansão demográfica do tuco-tuco de colar e diversos eventos de dispersão cruzando o rio, evidenciados pelo compartilhamento de haplótipos em localidades de ambas as margens, podem estar vinculados as condições de clima seco e frio durante o período glacial pleistocênico, caracterizado pelo domínio dos campos, ausência de mata ciliar e rios com cursos d’água bastante reduzidos. Considerando as condições de baixa vagilidade, territorialidade e organização em pequenos demes, os efeitos de isolamento pela distância e deriva genética parecem prevalecer sobre as descontinuidades do habitat, a exemplo da alta diferenciação populacional encontrada. / The collared tuco-tuco, Ctenomys torquatus, has one of the widest ranges among tuco-tucos, inhabiting the grassed lowlands from the half north of Uruguay to the southern part of the Rio Grande do Sul State, Brazil. Chromosomic variability, common for these subterranean rodents, is showed in punctual and peripherical populations of C. torquatus, with particular reference for two situations were a great river separating distinct cariotípica forms. With the aims of describing the phylogeographic patterns of C. torquatus, as well as the effects of major rivers on structuration of its populations and karyomorphs, the present study made use of three mitochondrial markers (the hyper variable sequence 1 of the control region, the cytochrome c oxidase I and the cytochrome b genes), besides the development and application of microsatellite loci. Phylogeny of the cytochrome b gene, associated with morphological and karyotypic evidences, unambiguously demonstrated the uniqueness of a new species, denominated Ctenomys ibicuiensis. This species is karyotypicaly monomorphic (2n = 50) and do not share a direct and recent common ancestor with the collared tuco-tuco, despite ranges neighborhood. The present work shows the phylogenetic position of the new species and its phylogeographic relationships with the collared tucotuco. Phylogenetic analysis was also approached in order to estimate molecular rates for the mitochondrial DNA of tuco-tucos, which subsequently were applied for demographic inferences in a timescale framework. Associated with its small geographic range and sampling, C. ibicuiensis populations showed low genetic variability in comparison with other tuco-tucos, but no evidences of bottlenecks or endogamy were reported. Analysis of genetic structure for microsatellite loci and mitochondrial DNA revealed strong differentiation among populations, anyone deeply divergent clade associated with regional lineages was found for both species. Neutrality tests, mismatch distributions and two demographic analyses based in coalescence showed a pattern of recent population expansion for the widespread C. torquatus, whereas a long time population stability was recovered for the highly restrict C. ibicuiensis. The recently expanded populations of C. torquatus probably originated from the central region of the Rio Grande do Sul State. The widespread karyotype 2n = 44, previously cited as plesiomorphic, 11 and the few chromosomic variations reported on the periphery of this species, are in agreement with such scenery of expansion. The AMOVA analyses, and other structuration assays, did not show a substantial relationship between the genetic variation partitioning and the presence of great rivers. The effect of river as a barrier to gene flow was reported only comparing the low genetic structuration between headwater sites in comparison with all the other wider sites along the river. Expansion of the collared tuco-tuco and several events of crossing the river, as indicated by haplotype sharing, can be related with dry and cold climatic conditions during the glaciations of the Pleistocene, when grasslands dominated, gallery forest did not occur and water courses probably were reduced. As a low vagile and territorial subterranean rodent, living in small demes, geographic distances and genetic drift seem let a stronger signature of population differentiation for tuco-tucos, rather than habitat discontinuities.
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Mecanismo de indução e quebra de diapausa em Euryades corethrus (LEPDOPTERA: PAPILIONIDAE: TROIDINI)

Castro, Andressa Caporale de January 2016 (has links)
A diapausa é um tipo de dormência encontrada em insetos, que é causada por uma alteração na programação genética, em resposta a estímulos ambientais, que pausa ou retarda o desenvolvimento. Os mecanismos ambientais que podem estimular esse processo são o fotoperíodo, a temperatura e a umidade, sendo o primeiro mais comum. Ainda existem dois tipos de básicos de diapausa: a obrigatória e a facultativa. Espécies de insetos que habitam zonas de campo são particularmente expostas a condições extremas de sazonalidade, e para superar essas condições a maioria das borboletas entra em dipausa pupal. Euryades corethrus é uma das espécies que se utiliza desse processo para evitar condições climáticas adversas. O presente estudo se propõe a avaliar os efeitos de variáveis abióticas na indução e na quebra da diapausa pupal em E. corethrus. Para isso, imaturos dessa espécie foram submetidos a três diferentes experimentos, cada qual controlando uma das possíveis variáveis envolvidas na ativação da diapausa. No experimento de fotoperíodo, os indivíduos foram expostos a quarto tratamentos com diferentes durações de luz e escuro (LD): 10:14, 12:12, 14:10 e 16:08. No experimento de temperatura, foram desenhados cinco tratamentos com médias de temperaturas distintas: 15ºC, 20°C, 25°C, 30°C e 35ºC., No experimento de umidade, foram estabelecidos três tratamentos com diferentes umidades relativas (RH): <20%, 40-80% e >90%. Para avaliar se a supressão de algum fator abiótico particular poderia desencadear o término da diapausa, metade das pupas em diapausa oriundas de cada um dos três experimentos foi submetida a condições que removessem o fator que desencadeou o processo, expondo as pupas dormentes a condições mais amenas. Os resultados sugerem que a diapausa é principamente induzida por fotoperíodo, mais precisamente por fotofases curtas. Em relação aos experimentos de temperatura, os tratamentos de 15°C e 35°C causaram 100% de mortalidade, isso provavelmente porque eles utrapassam o limiar fisiológico da espécie, enquanto 30% dos indivíduos expostos a 30°C entraram em dipausa. Todos os outros tratamentos, dos três fatores, mostraram baixas taxas de indução ((LD): 12:12, 14:10, 16:8; (RH): <20%, 40-80% , >90%; 20°C, 25°C). Considerando o término da diapausa, os resultados demonstram que o fotoperíodo não foi suficiente para acelerar esse proceso. O fotoperíodo teve o efeito mais significativo na indução da diapausa, com fotofases curtas ditando a expressão da diapausa. Esse resultado corrobora o comportamento de muitos insetos de regiões temperadas, que entram em diapausa obrigatória em função das fotofases curtas do outono. Cerca de 30% dos imaturos criados em 30°C entraram em diapausa, sugerindo que as temperaturas de verão podem estimular dormência, esta sendo, provavelmente, uma diapausa facultativa. Em relação à quebra de diapausa, os resultados sugerem que este processo é bastante complexo, provavelmente envolvendo outros processsos que não só a supressão da condição que induziu a diapausa.
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Detecção da expansão da soja no bioma Pampa a partir de atributo espectro-temporal e classificação orientada a objeto

Nóbrega, Mauro Ricardo Roxo January 2016 (has links)
O bioma Pampa ocorre na Argentina, Brasil, Uruguai e Paraguai. Suas paisagens compõem um rico patrimônio cultural relativo à biodiversidade, com flora e fauna singulares. Nos últimos anos, a área cultivada com soja teve um crescimento significativo nos municípios situados no sul do estado do Rio Grande do Sul, especialmente sobre o bioma Pampa. Este avanço tem causado preocupação, tanto por parte de ambientalistas, apreensivos em relação à preservação deste bioma, como pelos órgãos de planejamento agrícola, visto que esta região é considerada de risco elevado para o cultivo da soja em função de restrições hídricas. Neste sentido, este estudo objetivou identificar transformações ocorridas, entre os anos 2000 e 2015, em uma área de abrangência do bioma Pampa em virtude da inserção e expansão da cultura da soja. O estudo monitorou a expansão das lavouras de soja no sul do Brasil sobre áreas pertencentes ao bioma Pampa através dos índices de vegetação (EVI e NDVI) de imagens MODIS. Foram realizados dois trabalhos de campo, um em 2014 e o outro em 2015, nos quais foram coletados diferentes usos e coberturas da terra na área de estudo. Uma parte desses dados serviu de base para a realização de testes metodológicos, e a outra para verificação de acurácia. Inicialmente, o padrão de evolução dos índices ao longo do tempo foi caracterizado para as culturas da soja e do arroz irrigado no bioma como um todo, e após foram analisadas as diferenças entre regiões ecoclimáticas. Foram realizadas duas modalidades de classificação, pixel a pixel e orientada a objeto. A classificação pixel a pixel foi a estratégia usada na confecção das máscaras de área plantada com culturas de primavera/verão nas safras 2000/2001, 2002/2003, 2005/2006, 2008/2009, 2012/2013, 2013/2014 e 2014/2015. Como as culturas da soja e do arroz apresentam ciclos fenológicos similares, conferindo baixa separabilidade entre as classes, foi calculada a distância de Bhattacharyya, feição por feição disponível, de áreas conhecidas com soja e com arroz (trabalho de campo) para cada região ecoclimática, de forma a definir as feições e períodos de maior separabilidade entre as culturas. Em seguida foi realizada uma classificação orientada a objeto para a safra 2014/2015 através de árvore de decisão e, com base nesta árvore, o processo foi generalizado para as demais safras avaliadas. Visando caracterizar se as áreas de expansão da soja estão ocorrendo sobre áreas de campos ou áreas de arroz, as áreas classificadas foram cruzadas com o Modelo HAND. Os resultados mostraram que as culturas de primavera-verão tiveram um incremento de 1.760.225 ha em área plantada, o que equivale a 92% em relação a 2000. Existem diferenças no padrão de variação dos indicadores espectrais ao longo da safra (bandas e índices de vegetação) apresentados pelas lavouras de soja e arroz no bioma Pampa. O melhor momento verificado para a distinção das culturas de soja e arroz ocorre no período que antecede o ciclo destas culturas. Em termos de indicador espectral as imagens de índices de vegetação são as que melhor diferenciam as culturas da soja e do arroz. Na metade sul do estado, a soja vem sendo cultivada preponderantemente nas áreas mais úmidas. / The Pampa biome occurs in Argentina, Brazil, Uruguay and Paraguay. Its landscapes make up a rich cultural heritage relating to biodiversity with singular flora and fauna. In recent years the soybean had significant increase in municipalities in the south of the Rio Grande do Sul state, especially on the Pampa biome. This development had caused many issues in these environmentalists, as by the organisms of agricultural planning or by its consideration of high risk for soy cultivation due to water restrictions. Thus, this study aims to identify changes that occurred between 2000 and 2015 in Pampa biome coverage area due to the insertion and expansion of soybean cultivation. The study monitored the expansion of soybean crops in southern Brazil on areas belonging to the Pampa biome through the vegetation index (EVI and NDVI) on MODIS images. There were two on field activities, one in 2014 and another in 2015, in which different usages and land cover were sampled in the study area. A portion of this data was used in methodological tests and the other for assessing. Initially, the pattern of evolution of the indices over time was characterized for both soybean and rice crops, and later on the differences between ecoclimatic regions. Two methods of classification were considered: pixel by pixel and object-based. The pixel by pixel classification was the strategy used in the making of masks for area planted with spring-summer crops in the 2000/2001, 2002/2003, 2005/2006, 2008/2009, 2012/2013, 2013/2014 and 2014 / 2015 years. Since soybean and rice crops have similar phenological cycle, the Bhattacharyya distance was computed for each considered feature on known areas with soy and rice (field work) for each ecoclimatic region, in order to define the indices and periods of high separability between cultures. Later on an object-based classification for the 2014/2015 harvest was done using a decision tree, and based on this tree the process was generalized to the other crops evaluated. In order to characterize whether the soybean expansion is occurring on non-cultivated fields or rice areas, the classified areas were crossed-checked with a HAND model. The results showed that the spring-summer crops had an increase of 1,760,225 ha in acreage, which is equivalent to 92% compared to the year of 2000. There are differences of spectral indices in the pattern of variation along the crop (bands and vegetation indices) shown by soybean and rice in the Pampa biome. The best time for the distinction of soybean and rice cultures occurs in the period before the cycle of these crops. In terms of spectral index the vegetation indices (NDVI and EVI) images are those that best differentiate the soybean and rice. In the southern part of the state, the soybean has been cultivated mainly in wet areas, although.
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Estudo da produção agronômica e utilização da análise de adaptabilidade e estabilidade como critério de seleção de uma coleção de acessos de Paspalum nicorae Parodi / Study of agronomic production and utilization of adaptability and stability analysis as a criterion for selection of a collection of Paspalum nicorae Parodi accessions

Pereira, Emerson André January 2009 (has links)
O bioma pampa apresenta uma grande variabilidade de forrageiras nativas com bom valor nutritivo, indicando o potencial do desenvolvimento de pesquisas com o intuito de preservar este meio e apresentar alternativas de pastagens para os produtores rurais. Entretanto, esta imensa diversidade vem sendo substituída por espécies exóticas, provocando uma diminuição da comunidade campestre natural. Uma das espécies nativas que merece mais estudos é o Paspalum nicorae Parodi, espécie perene, apomítica, que apresenta uma ampla adaptação a diferentes tipos de solos, especialmente a solos arenosos, sendo tolerante a geadas e a secas moderadas, com alta tolerância ao pastejo. O presente estudo teve como objetivos avaliar uma coleção de 53 genótipos de P. nicorae, conduzidos em duas regiões fisiograficamente distintas durante dois anos, buscando caracterizar o comportamento produtivo da espécie e selecionar genótipos superiores através da analise de estabilidade e adaptabilidade, para etapas subseqüentes do Programa de Caracterização de Germoplasma e Melhoramento de Plantas Forrageiras. Um dos experimentos foi implantado na Área Experimental da Embrapa Pecuária Sul em Bagé e o outro na Estação Experimental Agronômica da Universidade Federal do Rio Grande do Sul, em Eldorado do Sul. As avaliações ocorreram de outubro de 2007 a fevereiro de 2009 através de linhas e de parcelas, adotando o delineamento de blocos causalizados com três repetições. Houve variação das produções forrageiras entre os tratamentos ao longo do tempo e entre diferentes locais. A maioria dos acessos de P. nicorae apresentaram elevados rendimentos ao serem comparados com os da testemunha (cv. Pensacola) tanto na avaliação em linhas, como na avaliação por hectare. Os acessos 28 B e 26 A de P. nicorae apresentando elevada produção, respectivamente para MST e MSF em g.linha-1 e previsibilidade, demonstrando serem estáveis e adaptados nas regiões estudas. Em relação à qualidade nutricional, os percentuais de PB e FDN obtidos pela coleção em estudo, apresentaram semelhanças aos encontrados na testemunha. Os resultados apontam perspectivas de trabalhos futuros visando explorar a variabilidade encontrada entre os acessos da coleção. A coleção de P. nicorae apresentou produção de forragem superior a cv. Pensacola, e alguns acessos apresentaram desempenhos bem expressivos. Para o rendimento de MST e MSF, destacaram-se, respectivamente, os acessos 28 B e 26 A de P. nicorae, demonstrando previsibilidade nos comportamentos. Sugere-se estes dois acessos para etapas subseqüentes em um programa de melhoramento de plantas forrageiras. / The Pampas Bioma presents a wide variability of native forages with good nutrition value, indicating a potential development of researches aiming at preserving this environment and presenting alternative forages to farmers. However, this large diversity has been replaced by exotic species, leading to a decreased natural field community. One of the native species requiring more studies is Paspalum nicorae Parodi, a perennial, apomitic species showing high adaptation to different kinds of soil, especially to sandy soils; it also tolerates hoarfrortr and mild drought, with high tolerance to grazing. This study aimed at assessing a collection of 53 genotypes of P. nicorae, introduced in two physiographically distinct regions along two years, in an attempt to both characterize the productive behavior of this species and select superior genotypes for subsequent phases of a program for forage improvement. This research is part of a more comprehensive project of characterization of a collection of P. nicorae belonging to the Department of Forages and Agrometeorology of UFRGS. One of the experiments was carried out in Bagé, at the Experimental área of Embrapa Pecuária Sul, and the other at the Experimental Agronomic Station of Universidade Federal do Rio Grande do Sul, in Eldorado do Sul. The assessments were performed from October 2007 to February 2008 through lines and plants, using the delineation of causal blocks with three repetitions. There was variation of forage production among treatments over time and in both sites. Most genotypes of P. nicorae presented high yields when compared to the clock (cv. Pensacola) both in the line and hectare assessments. Genotypes 28 B and 26 A of P. nicorae showed high yield to MST and MSF in g.line-1, respectively, as well as predictability, showing stability and adaptation in the regions studied. Regarding the bromatological quality, percentages of PB and FDN in the collection studied were similar to those found in the witness. Results have pointed out perspectives of future studies aiming at exploring the variability found among genotypes of the collection of P. nicorae. The performance of the collection of P. nicorae was higher than that of cv. Pensacola, and some genotypes presented quite significant yields. For the yield of MST and MSF, genotypes 28 B and 26 A of P. nicorae, respectively, were outstanding, showing predictability in behavior. These two genotypes have been suggested for subsequent phases of a program of forage improvement.
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Estrutura populacional, diversidade genética, área de distribuição e conservação do Cardeal-Amarelo - Gubernatrix Cristata (Vieillot, 1817) (Aves, Passeriformes, Emberizidae) / Population Structure, genetic diversity, distribution range and conservation of yellow cardinal En – Gubernatrix cristata (Vieillot, 1817) (Aves, Passeriformes)(Emberizidae)

Ferreira, Claiton Martins January 2010 (has links)
Gubernatrix cristata, o cardeal-amarelo, é uma espécie de ave rara do Pampa. Ele tem uma distribuição geográfica restrita ao sul da América do Sul (Uruguai, Argentina e sul do Brasil) e é exclusivo deste bioma. Quatorze viagens de campo foram feitas de Abril de 2006 a março de 2009, em uma tentativa de encontrar indivíduos e coletar amostras para análise genética. Desenvolvemos dez marcadores microssatélites isolados a partir desta espécie e caracterizamos a sua variabilidade alélica. O número de alelos observados em cada locus variou de 4 a 14, com uma média de 7,5 alelos por locus. Os microssatélites mostraram-se úteis em revelar os níveis de diversidade de G. cristata e, portanto, podem ser usados para explorar a estrutura genética das populações dispersas ao longo de sua distribuição geográfica atual. Um total de 72 amostras de cardeal-amarelo foi usado neste estudo, 59 foram de amostras contemporâneas e 13 amostras de espécimes de museu. Nós acessamos a diversidade genética da espécie através dos dez loci polimórficos de microssatélites nucleares do G. cristata desenvolvidos nesse estudo e através de um fragmento do gene ND2 do DNA mitocondrial. Encontramos apenas três haplótipos com diversidade nucleotídica e haplotípica respectivamente igual a π = 0,00277 e Hd = 0,6219. O Fst (0,00340) e Nm (73,18) mostraram uma fraca estruturação com pouca diferenciação genética. A estatística Fs de Fu foi significativamente diferente de zero (2,248) e D de Tajima foi positivo (2,17506). Ambos os testes mostraram um indicativo de evidência provável de uma diminuição no tamanho da população e/ou seleção equilibradora. As análises usando o "no admixture model" e um grande burnin (500000) não resultaram em clustering dos indivíduos. Devido a esse resultado nenhuma atribuição individual a uma área geográfica foi possível. O presente estudo auxilia na compreensão das necessidades de conservação do cardeal-amarelo, fornecendo informações sobre a diversidade genética e estruturação populacional ao longo de sua área de distribuição. Embora não tenhamos encontrado estruturação dentro da nossa área de estudo, é preciso mais estudos, analisando a diversidade genética e estruturação populacional em toda a área de distribuição da espécie, e adicionando mais amostras de animais silvestres da população de La Pampa e de Corrientes. O mapa da área de distribuição do cardeal-amarela parece estar ultrapassado devido à situação cada vez mais crítica que a espécie está enfrentando na natureza. Dada a recente falta de conhecimento sobre sua distribuição e seu estado de conservação em seu habitat natural, decidimos modelar a distribuição potencial da espécie. A principal idéia por trás dessa informação era propor estratégias para sua conservação. Para melhor alcançar esse objetivo, focamos nossa pesquisa especificamente em a) localizar as populações silvestres desta espécie no Rio Grande do Sul, Uruguai e Argentina, e b) identificar as áreas de ocorrência do cardeal-amarelo que poderiam ser transformadas em áreas protegidas. Todos os registros georeferenciados de G. cristata foram extraídos de diferentes fontes: através de trabalho de campo, peles de museu, literatura e bases de dados da Internet. Para modelar a distribuição da espécie, foram selecionadas 20 variáveis ambientais e o aplicativo de modelagem Maxent v. 3.3.2. Mapas de distribuição histórica e atual de G. cristata foram criados usando DIVA GIS. O modelo que melhor prediz o índice relativo de adequação ambiental para a espécie é o modelo onde a AUC resultante sobre dados de testes foi 0,868. O resultado do teste de jackknife acerca da importância das variáveis mostrou que a variável ambiental com maior ganho quando usada isoladamente é bio1_sa_30s_cut (temperatura média anual) que, portanto, parece ter as informações mais úteis por si só. A variável ambiental que mais diminui o ganho quando é omitida é alt_sa_30s_cut (altitude) que, portanto, parece ter o máximo de informação que não está presente nas outras variáveis. Se o objetivo de pesquisas futuras do cardeal-amarelo em sua área de distribuição for detectar outras populações, então as áreas preditas em ter elevada adequabilidade relativa no modelo espacial são um bom ponto de partida para a pesquisa mais direcionada. A pressão da caça sobre a espécie é tão grande que o cardeal-amarelo hoje em dia parece ser encontrado apenas em áreas de difícil acesso. Muitas das áreas adequadas para a espécie mostrada pelo modelo podem ainda conter populações e também podem ser usadas como áreas-chave para futuras reintroduções dentro do programa de conservação do cardeal-amarelo. / Gubernatrix cristata, the yellow cardinal, is a rare bird species from the Pampas grassland. It has a restricted geographical distribution in southern South America and is unique to this Biome (Uruguay, Argentina, and Southern Brazil). Fourteen field trips were made from April 2006 to March 2009 in an attempt to find individuals and collect samples for genetic analysis. We developed ten microsatellite markers isolated from this species and the characterization of their allele variability. The number of alleles observed for each locus ranged from 4 to 14, with an average of 7.5 alleles per locus. The microsatellites proved to be useful in revealing levels of diversity in G. cristata, and thus can be used to explore the genetic structure of scattered populations across its present geographic range. A total of 72 yellow cardinal samples was taken in this study, 59 were from contemporary specimens and 13 samples were from museum specimens. We accessed the species genetic diversity through ten polymorphic nuclear microsatellite loci of G. cristata and a ND2 mtDNA fragment. We found only three haplotypes with nucleotide and haplotype diversity equals to π = 0.00277 and Hd = 0.6219. The Fst (0,00340) and Nm (73,18) shown a weak structuring with little genetic differentiation. Fu's Fs statistic was significantly different from zero (2,248) and Tajima's D was positive (2,17506). Both tests showed likely evidence indicating a decrease in population size and/or balancing selection. Analyses using the “no admixture model” and a larger burn-in (500000) yielded no clustering of individuals. Due to this result no individual assignment to any geographical area was possible. The present study assists in understanding the conservation needs for yellow cardinal by providing information on the genetic diversity and population structuring along its distribution range. Although we found no structuring within our study area, further study is needed, examining the genetic diversity and population structuring throughout the species’ range, adding more samples from wild animals from La Pampa population and Corrientes. The yellow cardinal distribution range map seems to be outdated because of the increasingly critical situation the species is facing in nature. Given the recent lack of knowledge regarding its distribution and its state of preservation in its natural habitat we decided to model the species potential distribution. The main idea behind this information was to propose strategies for their conservation. To better achieve that target we specifically focused our research on a) locating wild populations of this species in Rio Grande do Sul, Uruguay and Argentina, and b) identifying areas of occurrence of yellow cardinal that could be turned into protected areas. We extracted all georeferenced G. cristata records from different sources: field working, museum skins, literature, and internet datasets. To model the species distributions, 20 environmental predictors were selected. To model the species distributions we selected the modeling application Maxent v. 3.3.2. Historical and current distribution maps of G. cristata were created using DIVA GIS. The model that best predicts the relative index of environmental suitability for the species is the model where resulting AUC on test data was 0.868. The results of the jackknife test of variable importance showed that the environmental variable with highest gain when used in isolation is bio1_sa_30s_cut (Annual Mean Temperature), which therefore appears to have the most useful information by itself. The environmental variable that decreases the gain the most when it is omitted is alt_sa_30s_cut (Altitude), which therefore appears to have the most information that isn't present in the other variables. If the objective of future surveys of the yellow cardinal in its distribution range is to detect other populations, then areas predicted to have high relative suitability in the spatial model is a good starting point for further targeted survey. The hunting pressure on the species is so great that the yellow cardinal nowadays seems to be only found in areas of difficult access. Many of the areas suitable for the species shown by the model may still contain populations and can also be used as key areas for future reintroductions into the yellow cardinal conservation program.
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Estudo da produção agronômica e utilização da análise de adaptabilidade e estabilidade como critério de seleção de uma coleção de acessos de Paspalum nicorae Parodi / Study of agronomic production and utilization of adaptability and stability analysis as a criterion for selection of a collection of Paspalum nicorae Parodi accessions

Pereira, Emerson André January 2009 (has links)
O bioma pampa apresenta uma grande variabilidade de forrageiras nativas com bom valor nutritivo, indicando o potencial do desenvolvimento de pesquisas com o intuito de preservar este meio e apresentar alternativas de pastagens para os produtores rurais. Entretanto, esta imensa diversidade vem sendo substituída por espécies exóticas, provocando uma diminuição da comunidade campestre natural. Uma das espécies nativas que merece mais estudos é o Paspalum nicorae Parodi, espécie perene, apomítica, que apresenta uma ampla adaptação a diferentes tipos de solos, especialmente a solos arenosos, sendo tolerante a geadas e a secas moderadas, com alta tolerância ao pastejo. O presente estudo teve como objetivos avaliar uma coleção de 53 genótipos de P. nicorae, conduzidos em duas regiões fisiograficamente distintas durante dois anos, buscando caracterizar o comportamento produtivo da espécie e selecionar genótipos superiores através da analise de estabilidade e adaptabilidade, para etapas subseqüentes do Programa de Caracterização de Germoplasma e Melhoramento de Plantas Forrageiras. Um dos experimentos foi implantado na Área Experimental da Embrapa Pecuária Sul em Bagé e o outro na Estação Experimental Agronômica da Universidade Federal do Rio Grande do Sul, em Eldorado do Sul. As avaliações ocorreram de outubro de 2007 a fevereiro de 2009 através de linhas e de parcelas, adotando o delineamento de blocos causalizados com três repetições. Houve variação das produções forrageiras entre os tratamentos ao longo do tempo e entre diferentes locais. A maioria dos acessos de P. nicorae apresentaram elevados rendimentos ao serem comparados com os da testemunha (cv. Pensacola) tanto na avaliação em linhas, como na avaliação por hectare. Os acessos 28 B e 26 A de P. nicorae apresentando elevada produção, respectivamente para MST e MSF em g.linha-1 e previsibilidade, demonstrando serem estáveis e adaptados nas regiões estudas. Em relação à qualidade nutricional, os percentuais de PB e FDN obtidos pela coleção em estudo, apresentaram semelhanças aos encontrados na testemunha. Os resultados apontam perspectivas de trabalhos futuros visando explorar a variabilidade encontrada entre os acessos da coleção. A coleção de P. nicorae apresentou produção de forragem superior a cv. Pensacola, e alguns acessos apresentaram desempenhos bem expressivos. Para o rendimento de MST e MSF, destacaram-se, respectivamente, os acessos 28 B e 26 A de P. nicorae, demonstrando previsibilidade nos comportamentos. Sugere-se estes dois acessos para etapas subseqüentes em um programa de melhoramento de plantas forrageiras. / The Pampas Bioma presents a wide variability of native forages with good nutrition value, indicating a potential development of researches aiming at preserving this environment and presenting alternative forages to farmers. However, this large diversity has been replaced by exotic species, leading to a decreased natural field community. One of the native species requiring more studies is Paspalum nicorae Parodi, a perennial, apomitic species showing high adaptation to different kinds of soil, especially to sandy soils; it also tolerates hoarfrortr and mild drought, with high tolerance to grazing. This study aimed at assessing a collection of 53 genotypes of P. nicorae, introduced in two physiographically distinct regions along two years, in an attempt to both characterize the productive behavior of this species and select superior genotypes for subsequent phases of a program for forage improvement. This research is part of a more comprehensive project of characterization of a collection of P. nicorae belonging to the Department of Forages and Agrometeorology of UFRGS. One of the experiments was carried out in Bagé, at the Experimental área of Embrapa Pecuária Sul, and the other at the Experimental Agronomic Station of Universidade Federal do Rio Grande do Sul, in Eldorado do Sul. The assessments were performed from October 2007 to February 2008 through lines and plants, using the delineation of causal blocks with three repetitions. There was variation of forage production among treatments over time and in both sites. Most genotypes of P. nicorae presented high yields when compared to the clock (cv. Pensacola) both in the line and hectare assessments. Genotypes 28 B and 26 A of P. nicorae showed high yield to MST and MSF in g.line-1, respectively, as well as predictability, showing stability and adaptation in the regions studied. Regarding the bromatological quality, percentages of PB and FDN in the collection studied were similar to those found in the witness. Results have pointed out perspectives of future studies aiming at exploring the variability found among genotypes of the collection of P. nicorae. The performance of the collection of P. nicorae was higher than that of cv. Pensacola, and some genotypes presented quite significant yields. For the yield of MST and MSF, genotypes 28 B and 26 A of P. nicorae, respectively, were outstanding, showing predictability in behavior. These two genotypes have been suggested for subsequent phases of a program of forage improvement.
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Tuco-tucos do pampa rio-grandense : a filogeografia de Ctenomys torquatus (rodentia-ctenomyidae) e a descrição de uma nova espécie

Roratto, Paula Angélica January 2012 (has links)
O tuco-tuco de colar, Ctenomys torquatus, possui uma das maiores distribuições geográficas entre estes roedores, habitando os campos de baixa altitude em toda metade norte do Uruguai e na porção sul do estado do Rio Grande do Sul, Brasil. A variabilidade cromossômica, comum em espécies deste roedor subterrâneo, ocorre em apenas algumas populações periféricas de C. torquatus, particularmente em regiões na quais grandes cursos d’água separam formas cromossômicas distintas. Com os objetivos de descrever os padrões filogeográficos de C. torquatus, bem como o efeito de grandes rios na estruturação de populações e diferentes cariótipos, o presente estudo fez uso de três marcadores mitocondriais (sequência hiper variável 1 da região controle e os genes citocromo-c oxidase I e citocromo-b), além do desenvolvimento e aplicação de locos de microssatélites. A filogenia obtida com o gene citocromo-b, juntamente com evidências morfológicas e cariotípicas, claramente demonstraram a singularidade de uma nova espécie, denominada Ctenomys ibicuiensis. Esta espécie possui apenas um cariótipo (2n = 50) e não compartilha um ancestral comum direto recente com o tuco-tuco de colar, apesar da proximidade geográfica. Este trabalho apresenta a posição filogenética da nova espécie e sua relação filogeográfica com o tuco-tuco de colar. Análises filogenéticas também foram empregadas com o objetivo de estimar uma taxa de evolução molecular para o DNA mitocondrial dos ctenomídeos, a qual foi posteriormente aplicada em inferências demográficas considerando uma escala de tempo. Associada a estreita área de ocorrência e pequena amostragem, as populações de C. ibicuiensis apresentaram baixa variabilidade genética em comparação com as demais espécies do gênero Ctenomys, embora não tenha havido evidências da ocorrência de processos de redução populacional (bottleneck) nem índices de endogamia singificativos. Análises de estruturação genética para dados de microssatélite e DNA mitocondrial revelaram diferenciação significativa entre as populações, não havendo situações de clados ou grupos de haplótipos altamente divergentes, relacionados a linhagens regionais, para nenhuma das espécies. Testes de neutralidade, mismatch distribution e duas análises demográficas baseadas em coalescência sinalizaram a ocorrência de expansão populacional recente para C. torquatus, 9 amplamente distribuída; ao passo que um padrão de estabilidade populacional foi observado para a espécie C. ibicuiensis, geograficamente restrita. A região central do Rio Grande do Sul é a provável origem da expansão populacional recente descrita para C. torquatus. O cariótipo mais comum e amplamente distribuído 2n = 44, considerado plesiomórfico, e os registros pontuais e periféricos de variações cariotípicas, corroboram este cenário de expansão. AMOVA e outras análises de estruturação não demonstraram substancial partição da variação genética associada à presença dos rios. O efeito do rio atuando como barreira ao fluxo gênico foi verificado apenas pela comparação da baixa estruturação genética entre as localidades da nascente em relação aos demais pontos do rio onde a largura e a vazão são maiores. A expansão demográfica do tuco-tuco de colar e diversos eventos de dispersão cruzando o rio, evidenciados pelo compartilhamento de haplótipos em localidades de ambas as margens, podem estar vinculados as condições de clima seco e frio durante o período glacial pleistocênico, caracterizado pelo domínio dos campos, ausência de mata ciliar e rios com cursos d’água bastante reduzidos. Considerando as condições de baixa vagilidade, territorialidade e organização em pequenos demes, os efeitos de isolamento pela distância e deriva genética parecem prevalecer sobre as descontinuidades do habitat, a exemplo da alta diferenciação populacional encontrada. / The collared tuco-tuco, Ctenomys torquatus, has one of the widest ranges among tuco-tucos, inhabiting the grassed lowlands from the half north of Uruguay to the southern part of the Rio Grande do Sul State, Brazil. Chromosomic variability, common for these subterranean rodents, is showed in punctual and peripherical populations of C. torquatus, with particular reference for two situations were a great river separating distinct cariotípica forms. With the aims of describing the phylogeographic patterns of C. torquatus, as well as the effects of major rivers on structuration of its populations and karyomorphs, the present study made use of three mitochondrial markers (the hyper variable sequence 1 of the control region, the cytochrome c oxidase I and the cytochrome b genes), besides the development and application of microsatellite loci. Phylogeny of the cytochrome b gene, associated with morphological and karyotypic evidences, unambiguously demonstrated the uniqueness of a new species, denominated Ctenomys ibicuiensis. This species is karyotypicaly monomorphic (2n = 50) and do not share a direct and recent common ancestor with the collared tuco-tuco, despite ranges neighborhood. The present work shows the phylogenetic position of the new species and its phylogeographic relationships with the collared tucotuco. Phylogenetic analysis was also approached in order to estimate molecular rates for the mitochondrial DNA of tuco-tucos, which subsequently were applied for demographic inferences in a timescale framework. Associated with its small geographic range and sampling, C. ibicuiensis populations showed low genetic variability in comparison with other tuco-tucos, but no evidences of bottlenecks or endogamy were reported. Analysis of genetic structure for microsatellite loci and mitochondrial DNA revealed strong differentiation among populations, anyone deeply divergent clade associated with regional lineages was found for both species. Neutrality tests, mismatch distributions and two demographic analyses based in coalescence showed a pattern of recent population expansion for the widespread C. torquatus, whereas a long time population stability was recovered for the highly restrict C. ibicuiensis. The recently expanded populations of C. torquatus probably originated from the central region of the Rio Grande do Sul State. The widespread karyotype 2n = 44, previously cited as plesiomorphic, 11 and the few chromosomic variations reported on the periphery of this species, are in agreement with such scenery of expansion. The AMOVA analyses, and other structuration assays, did not show a substantial relationship between the genetic variation partitioning and the presence of great rivers. The effect of river as a barrier to gene flow was reported only comparing the low genetic structuration between headwater sites in comparison with all the other wider sites along the river. Expansion of the collared tuco-tuco and several events of crossing the river, as indicated by haplotype sharing, can be related with dry and cold climatic conditions during the glaciations of the Pleistocene, when grasslands dominated, gallery forest did not occur and water courses probably were reduced. As a low vagile and territorial subterranean rodent, living in small demes, geographic distances and genetic drift seem let a stronger signature of population differentiation for tuco-tucos, rather than habitat discontinuities.

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