Rodovias podem fragmentar populações por dois mecanismos, mortalidade e evitamento. Como espécies que evitam rodovias são raramente atropeladas por veículos e, então, não são detectadas em monitoramentos de fauna atropelada, outras abordagens são necessárias para identificar se eles estão sendo afetados. Ctenomys minutus (tuco-tuco) é um roedor subterrâneo que habita campos arenosos nas margens de rodovias e são raramente registrados em monitoramentos de fauna atropelada. Buscamos identificar se as rodovias são uma barreira para o fluxo gênico de tuco-tuco baseado em nove loci de microssatélite. Coletamos amostras de tecido epitelial de indivíduos de quatro populações: duas com a presença (Weber e Amaral) e, como controle, duas com a ausência de rodovia (Maribo I e Maribo II). Mensuramos diversidade genética, diferenciação genética (estatística F) e acessamos estrutura genética (agrupamento bayesiano). Não observamos redução na variabilidade genética e encontramos um baixo nível de isolamento entre Weber e Amaral e um isolamento ainda menor entre Maribo I e Maribo II. O método bayesiano separou os indivíduos em dois grupos, onde Maribo I e Maribo II são um grupo consistente e Weber e Amaral possuem fracas diferenciações. Os resultados nos indicam que um efeito de barreira entre as populações separadas pela rodovia está em processo e que é necessário mais tempo para observarmos de forma mais clara o isolamento. São necessários mais estudos genéticos e comportamentais para certificar este padrão. Sob aspectos práticos, seria adequado monitorar as populações afetadas e, eventualmente, aplicar alguma medida de mitigação na estrada pra proporcionar conectividade. Por fim, a abordagem genética se mostrou muito interessante para avaliar este impacto. / Roads can fragment populations by two mechanisms, mortality and avoidance behavior. Since species that avoid roads are rarely killed by vehicles and thus cannot be detected in roadkill surveys, other approaches are necessary to identify whether they are affected. Ctenomys minutus (tuco-tuco) is a subterranean rodent who inhabits sand fields including at the margins of roads, however is rarely recorded on roadkill surveys. We aimed to identify if roads are a barrier to the gene flow of tuco-tuco based on nine microsatellite loci. We collected tissue samples from individuals of four populations: a pair with the presence (Weber and Amaral) and, as control, a pair with absence of a road (Maribo I and Maribo II). We measured the genetic diversity, the genetic differentiation (F-statistics), and assessed the genetic structure (Bayesian clustering). We observed no reduction in genetic variability and a low isolation level in pairwise comparison of Weber and Amaral, which was even lower between Maribo I and Maribo II. The Bayesian method separated individuals into 2 clusters, where Maribo I and Maribo II are one consistent cluster and Weber and Amaral present weak differentiations. The results indicate that a barrier effect between populations separated by roads is in process. More genetic and behavioral studies are needed to confirm this pattern. Under practical aspects, it would be appropriate to monitor the affected populations and possibly apply some mitigation measure on the road to provide connectivity. Finally, genetic approach proved very interesting to evaluate this impact.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2016-08-24T10:39:04Z No. of bitstreams: 1 Cybelle Lais Souto Maior Sales de Melo.pdf: 1716582 bytes, checksum: 7ff4305eec4c0fb70e4fce74a1633981 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-24T10:39:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cybelle Lais Souto Maior Sales de Melo.pdf: 1716582 bytes, checksum: 7ff4305eec4c0fb70e4fce74a1633981 (MD5) Previous issue date: 2012-08-30 / Many studies show that the edges of the forests typically present different species compositions and community structure when compared to the interior of the forests. However, only a few compare the different edge environment of an even forest fragment. Therefore, understanding how the established populations are affected at these locations is crucial for the conservation and recovery of many fragmented landscapes. Thus, the objective was to analyze the edge effect upon the arboreal structure of the urban forest of Jaguarana, Paulista–PE. The methodology used was in the transect form, at a 10x100 m dimension, subdivided into 10 contiguous parcels of 10x10m. Transects were launched into different edge environments: Environment 1 (A1) –environment at a low level of anthropization, located at a place where there is neither neighborship with communities, nor with roads, when compared to other edge areas, being, in a certain way, more isolated; Environment 2 (A2) –environment at a high level of anthropization, adjacent to Jaguarana Community, suffering greater pressure resulting from the action of humans. Environment 3 (A3) –environment at an average level of anthropization, being located farther from the near forest areas, however, adjacent to the highway BR-101, suffering greater effects related to the abiotic factors. For the analysis, all arboreal individuals with circumference at breast height (CBH) > 15cm, to 1,30m from the ground were collected, totalizing 311 individuals: 129 from A1, 62 from A2 and 120 from A3. Fifty-one taxons were identified: 2 at family-level, 4 at gender-level, 50 at specie-level, and 5 undetermined. The edge environment adjacent to the community differed statistically from the others, according to the T-Test, at 5% of probability, due to its inferiority regarding the number of individuals, although there were no significant differences on the base area among the environments, according to the T-Test, at 5% of probability. The majority of the individuals flocked in the first classes of diameter, tending to the inverted-J, typical uneven-aged forests. The result of the diversity index of Shannon (H’) ranged from 3,16 nats/ind., considered below average of the index found in the fragments of dense rain forests of Low Lands in the state of Pernambuco. The majority of the species presented uniform special distribution and, concerning the ecological groups, the majority were classified at the initial succession stage, at all edge environments. / Muitos estudos mostram que as bordas das florestas possuem tipicamente diferentes composições de espécies e estrutura de comunidade, quando comparadas com seu interior, entretanto são poucos os que comparam os diferentes ambientes de borda de um mesmo fragmento florestal. Portanto, compreender como as populações estabelecidas são afetadas nestes locais é crucial para a conservação e recuperação de muitas paisagens fragmentadas. Desta forma, objetivou-se analisar a estrutura arbórea de três ambientes de borda da Floresta Urbana da Jaguarana, Paulista-PE. Foram lançados transectos, de dimensão 10x100 m, subdividido em 10 parcelas contíguas de 10 x 10 m. em diferentes ambientes de borda: Ambiente 1 (A1) - ambiente com baixo grau de antropização, situado em local onde não há proximidade com comunidades, nem com estradas, quando comparado com outras áreas de borda, estando, de certa forma, mais isolado; Ambiente 2 (A2) - ambiente com alto grau de antropização, adjacente a comunidade da Jaguarana, sofrendo maior pressão dos efeitos das ações humanas; Ambiente 3 (A3) - ambiente com grau de antropização mediana, estando situado mais distante das comunidades próximas à mata, porém, ao lado da rodovia PE-15, com maiores efeitos ligados aos fatores abióticos. Para o levantamento, todos os indivíduos arbóreos com circunferência à altura do peito (CAP) ≥ 15 cm, a 1,30 m do solo foram amostrados, totalizando 311 indivíduos: 129 do A1, 62 do A2 e 120 do A3. Foram identificados 51 táxons: 2 em nível de família, 4 em nível de gênero, 50 em nível de espécie, e 5 indeterminados. O ambiente de borda adjacente à comunidade diferiu estatisticamente dos demais, pelo Teste-t, a 5% de probabilidade, devido à sua inferioridade no número de indivíduos, porém não houve diferenças significativas na área basal entre os ambientes, pelo Teste-t, a 5% de probabilidade. A maioria dos indivíduos se concentrou nas primeiras classes de diâmetro, tendendo ao J-invertido, comum em florestas inequiâneas. O resultado do índice de diversidade de Shannon (H’) para os três ambientes foi considerado abaixo da média dos índices encontrados em fragmentos de Floresta Ombrófila Densa de Terras Baixas no estado de Pernambuco. A maioria das espécies apresentou distribuição espacial uniforme, e, em relação aos grupos ecológicos, a maioria foi classificada em estágio de sucessão inicial, em todos os ambientes de borda.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-12-02T11:27:57Z No. of bitstreams: 1 Marcos Aurelio Paes de Oliveira.pdf: 851630 bytes, checksum: 2143362518b27ef1e6da1fcf00bdbee8 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-02T11:27:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcos Aurelio Paes de Oliveira.pdf: 851630 bytes, checksum: 2143362518b27ef1e6da1fcf00bdbee8 (MD5) Previous issue date: 2011-02-07 / Atlantic forest fragments, surrounded by crops such as sugarcane, may undergo changes in terms of termite community richness and composition. This study aimed to analyze termite richness in Pernambuco's sugarcane region and to compare the communities found in sugarcane plantations and in Atlantic forest fragments near such plantations. For the richness study, four 1 ha areas were delimited within the plantations in each sugarcane processing plant selected – Trapiche, União & Indústria, São José, and Central Olho D'Água. A comparative analysis between the termites that occur in forest fragments and in sugarcane plantations was carried out at the São José processing plant, where three transects were placed 10, 50, and 300 m parallel to each environment's border, respectively. The insects were collected from all of the micro-habitats in ten intercalated sectors of 10 m2 for each transect. The richness study in the sugarcane plantations recorded 13 species of eight genera and two families (Rhinotermitidae and Termitidae). The number of species varied from six to nine per processing plant. Twelve Termitidae species occurred, of which Subfamily Nasutitermitinae was the richest (S=6). Rhinotermitidae included only one species, which belonged to Subfamily Heterotermitinae. The comparative analysis between the two environments studied revealed 27 termite species in the Atlantic forest fragments, from 17 genera and three families. Termitidae had the greatest number of species (24), Subfamily Nasutitermitinae was the richest. Ten species occurred in sugarcane, including six genera and one family; Subfamily Syntermitinae stood out in terms of species number (S=4). The results showed a higher termite richness than what had been previously recorded for Pernambuco's sugarcane plantations. Additionally, termite associations to forest fragments and sugarcane plantations were distinct – for the latter, species richness decreased the further away the transects were from the forest's edge. / Fragmentos florestais de Mata Atlântica, circundados por culturas como a cana-de-açúcar, podem sofrer alterações na riqueza e na composição de comunidades termíticas. O objetivo deste trabalho foi analisar a riqueza de cupins nas regiões canavieiras de Pernambuco e comparar as comunidades termíticas existentes em cana-de-açúcar e remanescentes de Mata Atlântica, próximas a canaviais. No estudo da riqueza delimitaram-se quatro áreas de um hectare para cada Usina – Trapiche, União & Indústria, São José e Central Olho D`água. A análise comparativa entre os cupins que ocorrem em fragmentos de mata e em canavial foi realizada na Usina São José, onde foram traçados três transectos a 10, 50 e 300 metros, respectivamente, paralelos à borda de cada ambiente. Em 10 setores intercalados, de 10m2, de cada transecto, os insetos foram coletados em todos os micro-habitats. O estudo de riqueza nos canaviais registrou 13 espécies pertencentes a oito gêneros e a duas famílias (Rhinotermitidae e Termitidae). O número de espécies variou de seis a nove por Usina. Em Termitidae ocorreram 12 espécies, com a subfamília Nasutitermitinae apresentando maior riqueza (S=6). Rhinotermitidae contou com apenas uma espécie da subfamília Heterotermitinae. A análise comparativa entre os dois ambientes estudados registrou 27 espécies de cupins nos fragmentos de Mata Atlântica, sendo 17 gêneros e três famílias. Termitidae apresentou maior número de espécies (24) e a maior riqueza (S=12) foi observada na subfamília Nasutitermitinae. Em cana-de-açúcar ocorreram 10 espécies incluídas em seis gêneros e em uma família, tendo a subfamília Syntermitinae se destacado em número de espécie (S=4). Os resultados apresentaram uma riqueza de térmitas mais elevada que aquela previamente registrada para os canaviais pernambucanos e a associação termítica entre os fragmentos de mata e cana apresentaram-se distintas, havendo diminuição na riqueza de espécies, nessa última, à medida que os transectos se afastavam da borda da mata.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The main aim of the present study was to advance our knowledge of the biodiversity of the Caatinga biome, the only exclusively Brazilian ecoregion, which suffers constant degradation. The study area, in the municipality of Porto da Folha, Sergipe, appears to be typical of the region, with evidence of habitat degradation and hunting pressure, factors which affect local populations of fauna and flora directly. Line transect population surveys were conducted in July, August, and December, 2009, with a total of 132.9 km walked on four trails representing the main area of the fragment. The results of these surveys provided reliable density estimates for only two species Callithrix jacchus (168.7 individuals per km²) and Kerodon rupestris (116.7 inds./km²) whereas only two sightings of the target species (Callicebus barbarabrownae) were collected. The presence of other mammals, such as the Virginia opossum (Didelphis albiventris) and the raccoon (Procyon cancrivorous) was recorded from tracks and other indirect evidence. Given the paucity of records for the target species, population parameters were estimated using playback survey methods, based on the broadcasting of the species vocalizations through a megaphone, in order to provoke a response from the animals, which reveals their position in the forest and permits the mapping of group locations through triangulation. Playback surveys were conducted between September and November, 2009. The mapped locations were analyzed in order to define the portion of the fragment occupied by the titi monkeys, and identify habitat preferences. Two resident groups were identified, in addition to the presence of at least one solitary animal. With a total of 57 records, the playback method proved far more efficient than the traditional line transect procedure for the surveying of the Callicebus population, and should be the method of choice for surveys, especially in small fragments. During complementary observations, a total of 66 bird species were recorded at the site in July, August and November, 2009. Most of the species were either insectivores (36.6%), omnivores (22.7%) or granivores (16.7%), and the largest number of species was recorded in anthropogenic habitats. In addition to providing the first detailed data on population parameters and habitat preferences in Callicebus barbarabrownae, the study emphasizes the value of playback procedures for the surveying of titi populations. / O principal objetivo deste estudo foi aumentar o conhecimento da biodiversidade do bioma caatinga, a ecoregião exclusivamente brasileira e que sofre constante degradação. A área de estudo, no município de Porto da Folha, Sergipe, apresenta evidências de degradação de habitat e pressão de caça, fatores que afetam diretamente as populações locais de fauna e flora. Durante o censo populacional, realizado nos meses de julho, agosto e dezembro de 2009, um total de 132,9 km foram percorridos em quatro trilhas que representam as principais áreas do fragmento. A aplicação deste método permitiu estimar a densidade de duas espécies Callithrix jacchus (169,7 indivíduos/km2) e Kerodon rupestris (116,7 indivíduos/km2) considerando que apenas dois avistamentos da espécie-alvo (Callicebus barbarabrownae) foram coletados. A presença de outros mamíferos, como o gambá-davirgínia (Didelphis albiventris) e o guaxinim (Procyon cancrivorous) foi registrada por visualização e outras evidências indiretas. Devido à escassez de registros para a espéciealvo, parâmetros populacionais foram estimados usando o método de playback onde as vocalizações dos animais são reproduzidas com o auxílio de um megafone, a fim de provocar uma resposta dos mesmos. Ao responder ao playback eles revelam a sua posição na floresta e permitem o mapeamento dos locais dos grupos através da triangulação. Este método foi aplicado entre setembro e novembro de 2009. O mapeamento das localizações foi analisado a fim de definir a área de ocupação dos guigós no fragmento e identificar as preferências de habitat. Dois grupos residentes foram identificados, além da presença de pelo menos um animal solitário. Com um total de 57 registros, o método de reprodução de playback se mostrou mais eficiente do que o procedimento de transecção linear, para o levantamento da população de Callicebus sugerindo que este deve ser o método escolhido para levantamentos, especialmente em pequenos fragmentos. Durante observações complementares, um total de 66 espécies de aves foi registrado no local em julho, agosto e novembro de 2009. As espécies numericamente dominantes na área de estudo foram os insetívoros (36,6%), seguidos dos onívoros (22,7%) e granívoros (16,7%) e o maior número de espécies foram registra das em habitats antrópicos. Além de fornecer os primeiros dados detalhados sobre os parâmetros populacionais e de preferências de habitat para Callicebus barbarabrownae, o presente estudo ressalva a importância dos procedimentos de reprodução de playback para o levantamento das populações de guigós.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2016-07-20T13:16:55Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) dissertação final - andrevhity - cd - bdtd.pdf: 7048267 bytes, checksum: 0a2bd5941283791f51f6e1671f68b201 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-20T13:16:55Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) dissertação final - andrevhity - cd - bdtd.pdf: 7048267 bytes, checksum: 0a2bd5941283791f51f6e1671f68b201 (MD5) Previous issue date: 2015-12-09 / CAPEs / As operações unitárias em pedreiras tais como: desmonte, perfuração e britagem são imprescindíveis, e são etapas que exige controle na produção e que demandam quantidade razoável de elementos essenciais para a produção e que desgastam rapidamente, por essa razão estes procedimentos necessitam de análise e acompanhamento contínuo. Uma maneira de otimizar a produção em pedreiras e garantir com isso melhor controle na produção é realizando uma análise estrutural mais detalhada do maciço rochoso e determinando previamente as suas descontinuidades, seu estágio de deformação e o seu comportamento mediante a aplicação de explosivos. Um modelo matemático pode ser aplicado para simular a fragmentação do desmonte de rochas e posteriormente adequar a granulometria proveniente da mina (ROM – Run of Mine) obtendo uma melhoria no desempenho do desmonte e otimizando a britagem com o aumento da eficiência/produtividade. O modelo consiste nas equações propostas de Kuznetsov (1973), Cunningham (1983), Lilly (1986) e Tidman e Rosin-Rammler (1933), e são utilizadas para maior interação entre explosivo e rocha. / The unit operations in quarries such as blasting, drilling and crushing are essential, and are steps that require control in production and demand reasonable amount of essential elements for the production and wear out quickly, therefore these procedures require analysis and monitoring continuous. One way to optimize the production in quarries and thereby ensure better control of production, making it a more detailed structural analysis of the rock mass and previously determining the discontinuities, its deformation stage and its behavior upon the application of explosives. A mathematical model can be applied to simulate the rock blasting fragmentation and then tailor the grain size from the mine (ROM - Run of Mine) obtaining an improvement in the performance of dismantling and optimizing crushing with increasing efficiency and productivity. The model consists of the equations proposed Kuznetsov (1973), Cunningham (1983), Lilly (1986) and Rosin - Rammler and Tidman (1933), and are used for higher interaction between explosive and rock.

Made available in DSpace on 2014-10-09T12:33:19Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T14:06:27Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Neste trabalho apresentamos um estudo das reações nucleares de alta energia que são fundamentais na definição do termo fonte dos reatores nucleares subcríticos acionados por fonte externa. Estas reações nucleares, também conhecidas como \"spallation\", consistem na interação de hádrons de alta energia com os núcleons do núcleo atômico. A fenomenologia destas reações consiste em duas etapas, sendo que à primeira, o próton interage através de espalhamentos múltiplos, em um processo denominado cascata intra-nuclear seguido da etapa na qual o núcleo excitado oriundo da cascata intranuclear ou evapora partículas de forma a atingir estados energéticos moderados ou fissiona, em um processo conhecido como competição entre evaporação e fissão. Neste trabalho os principais modelos nucleares, os modelos de Bertini e Cugnon, são revistos, pois estes modelos são fundamentais para propósito de projeto devido à falta de dados nucleares avaliados para estas reações. A implementação e validação dos métodos de cálculo para o projeto destas fontes são realizadas. A implementação da metodologia é realizada utilizando o programa MCNPX ( \"Monte Carlo N-Particle eXtended\"), dedicado para cálculos de transporte destas partículas e a validação é realizada mediante uma cooperação internacional junto a um projeto coordenado de pesquisa da Agencia Internacional de Energia Atômica e trabalhos disponíveis. O objetivo é qualificar os cálculos relacionados às reações nucleares e os canais de desexcitação envolvidos. O CRISP, um código nacional para a descrição da fenomenologia das reações envolvidas, também foi estudado e os modelos implementados no código foram revistos e melhorados de forma a dar continuidade ao seu processo de qualificação. Devido às limitações dos principais modelos na descrição de produção de nuclídeos leves, a reação de multi-fragmentação foi estudada. As discrepâncias nos cálculos de produção destes nuclídeos são atribuídas à falta do canal de multi-fragmentação estatística do núcleo. A implementação deste canal foi realizada para a aplicação em reações de altas energias junto ao código CRISP de forma a reproduzir a produção de nuclídeos leves, bem como sua validação mediante a comparação com dados experimentais disponíveis para este fenômeno, obtendo com isso uma melhor reprodução de todo o espectro de produção de nuclídeos do processo. / Tese (Doutoramento) / IPEN/T / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP

Orientador: Vera Nisaka Solferini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-12T18:32:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Schwarcz_KaiserDias_M.pdf: 1400141 bytes, checksum: dd7ec0c32ab504bed6d9f8912fc65118 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: A floresta atlântica semidecídua, um dos principais tipos de formações vegetais constituintes da Mata Atlântica Brasileira, estende-se ao longo das regiões central e sudeste do interior do país. A sua destruição tem resultado na eliminação de muitas populações e, potencialmente, na erosão da diversidade genética de diversas espécies. A área originalmente coberta pela Mata Atlântica era de cerca de 15% do território nacional, indo do atual Estado do Rio Grande do Norte até o Rio Grande do Sul, estendendo-se, nas regiões sul e sudeste, do litoral brasileiro até a Argentina e o Paraguai. Desde então, a Mata Atlântica tem sido devastada principalmente devido à exploração predatória dos recursos florestais, causando sua redução a 7,3% de sua área original, distribuídos de forma fragmentada pelo território brasileiro. No estado de São Paulo a Mata Atlântica está reduzida a menos de 5% de sua área original e em Campinas, ocupa apenas 2,42% da área municipal. O agravamento da fragmentação florestal causado pela ação humana podem alterar os fluxos de vento, radiação e água ao longo da paisagem, bem como os padrões de migração e dispersão de animais, pólen e sementes. Uma vez que a maior parte da Mata Atlântica se apresenta hoje distribuída em fragmentos descontínuos, é fundamental estudar os efeitos desta nova situação ecológica sobre os atributos genéticos das populações vegetais. Neste trabalho, foi estudada a variabilidade e estruturação genéticas de Metrodorea nigra e Astronium graveolens com síndrome de dispersão autocórica e anemocárica, respectivamente. Foram coletados 47 indivíduos adultos e 113 jovens de M. Nigra e 28 adultos e 84 jovens de A. graveolens em dois fragmentos de mata atlântica localizados na Área de Proteção Ambiental de Souzas e Joaquim Egídeo no município de Campinas, São Paulo. Os indivíduos adultos, devido ao seu longo tempo de vida, refletem um evento reprodutivo menos influenciados pelos processos de fragmentação, quando em comparação com os indivíduos jovens. Através da comparação entre jovens e adultos, esperava-se verificar o efeito da fragmentação sobre a variabilidade de espécies com síndromes de dispersão distintas. Ambas as espécies apresentaram deficiência de heterozigottos. M. nigra apresentou coeficiente de endogamia (f) médio de 0,64 ; enquanto A. graveolens apresentou f de 0,21. O alto valor de f para M. nigra é uma conseqüência da síndrome de dispersão autocórica e do comportamento de forrageio dos polinizadores preferenciais desta espécie. O grupo de indivíduos jovens de A. graveolens apresentaram heterozigozidade (HO) maior que os adultos, indicando uma redução na incidência de acasalamentos entre indivíduos aparentados. Esta redução provavelmente está relacionada à maior eficiência da dispersão anemocórica desta espécie após a degradação ambiental dos fragmentos. Em A. graveolens a estruturação genética entre os grupos de jovens foi maior que entre os grupos de adultos; indicando uma menor eficiência na dispersão de pólen após a fragmentação. Os resultados indicam que a fragmentação, acompanhada da degradação ambiental dentro dos fragmentos, pode reduzir o número de cruzamentos endogâmicos em espécies com sementes dispersas pelo vento. Já em espécies com dispersão autocórica de sementes, a fragmentação tem efeitos menos evidentes sobre os atributos genéticos. Entretanto, o fluxo de pólen pode ser reduzido pelo dificultamento do vôo de insetos entre os fragmentos. Para uma maior compreensão do atual estado genético das populações arbóreas da Mata Atlântica, são necessários novos estudos envolvendo maior número de fragmentos florestais, espécies arbóreas com diferentes características biológicas; assim como o estudo dos efeitos da fragmentação sobre as espécies polinizadoras. / Abstract: The Semideciduous Forest is one of the major formations of the Brazilian Atlantic Forest. It extends along the central and southeast regions of the country's interior. Its destruction has resulted in the elimination of many populations and the erosion of genetic diversity in different species. The Atlantic Forest originally covered about 15% of the national territory, ranging from the current state of Rio Grande do Norte to Rio Grande do Sul, and from the brazilian coast to Argentina and Paraguay. Since then, the Atlantic Forest has been devastated mainly due to the predatory exploitation of forest resources, causing a reduction to 7.3% of its original area, distributed in fragmented remnants through brazilian territory. In the state of São Paulo, the Atlantic Forest is reduced to less than 5% of its original area. In Campinas, occupies only 2.42% of the municipal area. The forest fragmentation increase caused by human action can change the flow of the wind, the solar irradiation and the water along the landscape, as well as patterns of migration and dispersal of animals, pollen and seeds. As most of the Atlantic Forest is today distributed in discontinued fragments, it is essential to study the effects of this new ecological situation on the genetic attributes of plant populations. In this work, we studied the genetic structure and variability of Metrodorea nigra and Astronium graveolens wich have explosive dehiscence and wind-mediated seed dispersion mechanisms, respectively. Forty seven adults and 113 young individuals of M. nigra were collected; while for A. graveolens this number were of 28 adults and 84 young. The field studies were conducted in two diferent remnants of Atlantic Forest in the reserve of Souzas and Joaquim Egídeo (Área de Proteção Ambiental de Souzas e Joaquim Egídeo) in Campinas, São Paulo. We also made a comparison between young and adult specimens of each species. The adults, due to their long lifetime, preserves information of a reproductive event less influenced by fragmentation processes compared to young individuals. Trougth this comparison, it was expected to detect differential fragmentation influences on the diversity of species with distinct seeds dispersion mechanisms. The two species showed heterozigosity deficience in both populations. M. nigra had a mean endogamy coefficiente (f) of 0,64; while A. graveolens had 0,21. The high value of f in M. nigra is an consequence of its autocoric seed dispersion machanism and also of its polinators behavior. The group of young individuals of A. graveolens showed heterozigosity (HO) higher than the adults; suggesting a lower incidence of endogamy after the fragmentation. This could be probabily ralated to the better eficience os wind-mediated seed dispersion of this species after the enviromental degradation in those remnants. Also in A. graveolens the genetic structure between the two young groups was higher than between the adults, suggesting a lower eficience in the pollen dispersion after fragmentation. The results sugests that the fragmentation, accompanied by environmental degradation in the fragments, may reduce inbreding in wind dispersed species. In autochoric dispersed species, fragmentation has a lighter effect on the genetic attributes. However, the flow of pollen can be reduced by hindering the flight of insects between the fragments. To better understand the current genetic status of tropical tree populations, new studies involving more forest fragments are required, as well as tree species with different biological characteristics and the study of the effects of fragmentation on the pollinating species. / Mestrado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Mestre em Genética e Biologia Molecular

Orientador: Vera Nisaka Solferini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-08T11:25:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bertagna_Maina_M.pdf: 3610709 bytes, checksum: 15a2936742bc15364c08a56eed4dbbeb (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: A fragmentação do habitat é o processo pelo qual uma área contínua pode ser tanto reduzida quanto dividida em áreas menores, chamadas de fragmentos. Conforme as paisagens florestais tornam-se fragmentadas, as populações são reduzidas, diminuindo a diversidade de espécies. A perda de espécies pode ser devido à redução da área, à perda de heterogeneidade ambiental e à perda de variabilidade genética. Em plantas, as conseqüências genéticas da fragmentação do habitat são mais complexas devido a características da história de vida de cada espécie. Em espécies arbóreas pioneiras, a extinção e a recolonização podem aumentar o fluxo gênico e reduzir a diferenciação entre as populações. Assim, estudos de genética de populações de ambientes fragmentados permitiriam entender quais são os mecanismos que envolvem desde a dinâmica destas populações nestes ambientes e o fluxo gênico entre elas. Através da eletroforese de isozimas, Croton floribundus (Euphorbiaceae) foi estudada em seis remanescentes de Mata Atlântica, pertencentes à Área de Proteção Ambiental de Souzas e Joaquim Egídio, Campinas, SP. Os objetivos deste trabalho foram investigar e comparar a variabilidade genética entre e dentro de fragmentos, de adultos e jovens de C. floribundus, fazendo inferências sobre o fluxo gênico e sua importância em uma paisagem fragmentada. Amostras de adultos e jovens foram coletadas e analisadas através das estimativas de variabilidade genética intrapopulacional e dos níveis de estruturação populacional a partir das estatísticas-F de Wright (parâmetro q). Os altos índices de diversidade genética e pouca diferenciação genética entre as amostras estudadas indicam que C. floribundus consiguiu manter a variabilidade genética de suas populações em curto prazo, sob condições de paisagem antropizada. Foi observada uma alta variabilidade genética e um alto índice de endocruzamento que podem ser explicados pelas características da história de vida de C. floribundus. A fragmentação recente, o número limitado de gerações transcorridas após a fragmentação, a dominância na paisagem, a alta densidade de indivíduos e à ocorrência de fluxo gênico entre fragmentos mais próximos podem ter facilitado a manutenção da variabilidade genética e a baixa diferenciação entre as amostras de adultos e jovens de C. floribundus estudadas / Abstract: Habitat fragmentation is the process during which a large and continuous area is reduced or divided in small patches, called remnants. As forest landscapes are fragmented, their populations are reduced, so the species diversity. The loss of species may be due to the reduction of the area, of the environmental heterogeneity and of the genetic variability. In plants, the genetic consequences of habitat fragmentation are complex due to the particularities of the of each species¿ life history. In pioneer species, recurrent events of extinction and recolonization can promote gene flow and reduce the differentiation between populations. Thus, genetic studies of fragmented populations may help to understand the mechanisms involved in the dynamics of these populations as well as the levels of gene flow among them. Through electrophoretic procedures, Croton floribundus (Euphorbiaceae) was studied in six remnants of Atlantic Forest, belonging to the Área de Proteção Ambiental de Souzas e Joaquim Egídio, Campinas, SP. The objectives of this study were to investigate and compare the genetic variability within and among samples of adults and juveniles of C. floribundus, making inferences about the levels of gene flow and its importance in a fragmented landscape. Samples were collected and analyzed through estimates of intrapopulacional genetic variability and levels of population estrutucture. The high populational genetic diversity and the low genetic differentiation between the studied samples indicate that populations of C. floribundus keep their genetic variability in a short term, under the conditions of a disturbed landscape. The high genetic variability and the high levels of inbreeding can be explained by the life history characteristics of C. floribundus. The recent fragmentation, with a limited number of generations, the abundance of this species in the landscape, the high density of individuals and the occurrence of gene flow between close remnants may mantain of the high genetic variability and the low differentiation among the studied samples of adults and juveniles of C. floribundus / Mestrado / Genetica Animal e Evolução / Mestre em Genética e Biologia Molecular

Orientador: Eleonore Zulnara Freire Setz / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-15T17:03:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Castilho_CamilaPaulade_M.pdf: 1116230 bytes, checksum: e9733bf18b309857ead4034f314a0bca (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: No presente estudo avaliei a comunidade de mamíferos de médio e grande porte em 13 fragmentos pequenos (1 a 12 ha) e um fragmento controle (220 ha) da Área de Proteção Ambiental de Campinas, estado de São Paulo. A comunidade foi estudada através de parcelas de areia iscadas com dois tipos de iscas odoríferas (Pro's Choice e Canine Call) ao longo das quatro estações do ano, durante o período de julho de 2007 a junho de 2009. O esforço variou de 15 a 170 parcelas-noite entre os fragmentos, com um esforço total de 665 parcelas-noite para o conjunto de fragmentos. A comunidade foi composta por 20 espécies, variando de uma a sete espécies por fragmento e 11 no controle, sendo a maioria espécies generalistas e oportunistas, incluindo três espécies exóticas: o cachorro-doméstico (Canis lupus familiaris), a lebre européia (Lepus europaeus) e o ratão-do-banhado (Myocastor coypus). A riqueza da comunidade não esteve relacionada com a área dos fragmentos (rs = 0,083; p>0,05). A análise de similaridade também não evidenciou nenhum padrão na composição entre os fragmentos. Grandes carnívoros predadores de topo não foram verificados no interior dos fragmentos através das parcelas de areia, sendo a jaguatirica (Leopardus pardalis) o maior carnívoro registrado. No entanto, a riqueza registrada para o conjunto dos fragmentos foi superior em relação a outros fragmentos florestais maiores em tamanho e número em outras regiões do estado de São Paulo. A análise de abundância e de freqüência de ocorrência revelou o domínio da comunidade por três espécies mesopredadoras, o gambá (Didelphis sp), o cachorrodoméstico e o cachorro-do-mato (Cerdocyon thous) e uma presa, o tatu-galinha (Dasypus novemcinctus). Esse predomínio aparentemente parece estar relacionado à ausência de grandes predadores de topo, devido à liberação dessas espécies do controle demográfico imposto por esses últimos, bem como à plasticidade comportamental dessas espécies. Na ausência de predadores, essas espécies estiveram negativamente correlacionadas às áreas dos fragmentos, exceto o gambá. Em conclusão, a comunidade da APA de Campinas demonstrou-se simplificada e dominada por espécies generalistas. Os últimos remanescentes da região representam os últimos refúgios para a comunidade de médios e grandes mamíferos / Abstract: I evaluated the medium and large mammal community in 13 small fragments (1 to 12ha) and a control (220ha) in the Environmental Protected Area of Campinas, São Paulo state. The community was sampled using baited track stations (Pro's Choice and Canine Call bait) over a year (once each quarter) from July 2007 to June 2009, giving 15 to 170 track-station nights among the fragments and 665 track-station nights for all the remnants. Twenty species were recorded, varying from one to ten species per fragment, and eleven in the control. Most species was generalist and opportunist. Three exotic species (domestic dog, Canis lupus familiaris; European hare, Lepus europaeus; and nutria, Myocastor coypus) were among those recorded. No correlation between richness and fragment size was found (rs = 0,083; p> 0,05). No pattern in similarity was found among them. Although the smaller fragments had fewer species than the control, the species were often distinct. Large carnivores, top predators, were not sampled in the fragments interior by the track-stations and ocelot was the biggest carnivore registered. Opossums, domestic dog, nine-banded armadillo and crab-eating fox were the most abundant and frequent species in the community. As expected, the generalist species (except opossums) were negatively correlated with fragment area. Interactions between predator-prey and competitor abundances among those species were not detected. In conclusion, the mammal community was simplified and dominated by a few generalist species. The fragments seem representative of the last refuges to the community of the medium and large mammals / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

Orientador: Vera Nisaka Solferini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-15T21:43:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Peres_ElenArroyo_M.pdf: 3413124 bytes, checksum: 396b939134071fb3306c13d15c7080d9 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: A Mata Atlântica e uma das mais importantes florestas tropicais do mundo e, devido a sua grande riqueza de espécies e altas taxas de endemismo, e considerada um hotspot mundial para conservação. Entretanto, o bioma tem sido intensamente devastado nos últimos 500 anos, ficando restrito a pequenos fragmentos isolados. A fragmentação do habitat pode afetar diretamente a biodiversidade, já que o tamanho dos fragmentos e a conectividade entre eles exercem grande influencia sobre a estrutura das populações. Embora não tenha efeitos previsíveis sobre a variabilidade genética das espécies, a subdivisão do habitat favorece a ação da deriva genética e, conseqüentemente, o acumulo de divergências entre as populações locais, caso o fluxo gênico entre elas seja diminuído. Assim, as conseqüências da fragmentação dependem da habilidade de migração dos indivíduos entre fragmentos, o que e influenciado pelas propriedades especificas da matriz, pela distancia entre os fragmentos e pela capacidade de dispersão de cada espécie. Sendo um grupo bastante variável quanto aos meios de dispersão, as aranhas constituem um bom modelo para o estudo da fragmentação. O objetivo deste trabalho foi investigar, por meio de PCR-RFLP do mtDNA, a variabilidade genética e estrutura populacional da aranha Araneus venatrix dentro e entre cinco fragmentos de Mata Atlântica do Estado de São Paulo, alem de inferir os prováveis processos evolutivos responsáveis pela distribuição dos haplóipos na região estudada. Foram observados altos índices de variabilidade, o que pode estar relacionado ao habito de forrageamento e comportamento social da espécie. A fragmentação do habitat parece afetar a diversidade genética, apesar de não haver correlação significativa entre tamanho do fragmento e variabilidade, sugerindo que fatores como grau de conservação dos fragmentos e conectividade entre eles também são importantes para a variabilidade genética na espécie. A forte estruturação populacional encontrada sugere que a capacidade de dispersão de A. venatrix e relativamente limitada a longas distancias, ao menos entre as fêmeas. A migração dos indivíduos também pode ter sido prejudicada pela fragmentação do habitat, já que a matriz urbano-industrial e agrícola entre os fragmentos pode ter aumentado o isolamento de algumas populações. As analises fitogeográficas não apontaram para eventos históricos de fragmentação ou expansão demográfica recente entre as populações de A. venatrix, sugerindo que a distribuição dos alótipos provavelmente se deve a restrições ao fluxo gênico entre as populações, sendo influenciada posteriormente pelos efeitos da fragmentação antropica do habitat. / Abstract: Brazilian Atlantic Forest is considered a biodiversity hotspot due to its high pecies richness and endemism. However, this biome has been intensively depleted in the last 500 years, and now the remains are found in more or less isolated patches of different sizes. Habitat fragmentation may directly affect biodiversity once patch size and connectivity play important roles in the structure of communities. Though the genetic effects of habitat subdivision cannot be predicted, it may promote random genetic drift and interpopulational divergence when gene flow is reduced or absent. Therefore, the consequences of habitat fragmentation depend on the dispersal ability of each species, which may be influenced by the properties of the surrounding matrix and the distance between fragments. Spiders are a very diverse group regarding dispersal behavior and, hence, represent a suitable model for fragmentation studies. The aim of this work was to investigate, with analysis of mtDNA PCR-RFLP, intra and interpopulational genetic variability and structure of the spider Araneus venatrix in five patches of Brazilian Atlantic Forest. We discuss the likely evolutionary processes responsible for haplotypes distribution in this region. High levels of genetic diversity were observed, which may be related to species' foraging and social behavior. Habitat fragmentation also seems to affect genetic variance, although no significant correlation between variability and patch size was found, suggesting that levels of disturbance and patch connectivity may also be important for the species genetic diversity. High levels of populational structure reveal limited dispersal ability in A. venatrix, at least among females. Migration may also be affected by fragmentation, since the urban and agroecossystem matrix could isolate some of the patches. Phylogeographic analysis did not indicate fragmentation historic events or demographic expansion in A. venatrix populations, suggesting that the distribution of haplotypes is probably due to restricted gene flow and isolation by distance, influenced by antropogenic habitat fragmentation. / Mestrado / Genetica Animal e Evolução / Mestre em Genética e Biologia Molecular