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Efeito do estresse térmico calórico na expressão de alguns genes relacionados à implantação e desenvolvimento inicial de embriões Nelore (Bos indicus) e Jersey (Bos taurus) produzidos in vitro

Silva, Cíntia Fernandes da [UNESP] 28 July 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-07-28Bitstream added on 2014-06-13T20:13:51Z : No. of bitstreams: 1 silva_cf_me_botib.pdf: 208564 bytes, checksum: 9902237dc3cc6c5d01fc8b9f746d5c3e (MD5) / Os efeitos deletérios do estresse térmico calórico (ETC) sobre a fertilidade são menos pronunciados em raças tolerantes ao calor, devido às diferenças na capacidade de termorregulação. Para melhor compreender as diferenças entre zebuínos e taurinos em relação ao ETC, objetivou-se com o presente trabalho comparar a expressão dos genes COX2, CDX-2, IFN-τ, HSF1, HSP70 PLAC8, relacionados com o desenvolvimento embrionário inicial, em embriões bovinos produzidos in vitro (zebuínos vs. taurinos), submetidos ou não ao ETC. Oócitos de vacas Nelore (Bos indicus) e Jersey (Bos taurus) foram obtidos por aspiração folicular guiada por ultrasson (OPU) e maturados in vitro por 24 horas. Em seguida, foram fertilizados in vitro (D=0) com sêmen Nelore e Jersey, respectivamente. Doze horas após a fertilização, os prováveis zigotos (zebuínos e taurinos) foram cultivados in vitro em temperatura de 38,5oC. Noventa e seis horas após a fertilização, os embriões ≥ 16 células, de ambas as raças, foram divididos aleatoriamente em dois grupos experimentais: controle, cultivado continuamente a 38,5 oC, e ETC, exposto a 41 oC por 6 horas, retornando a seguir para 38,5 oC. No D7, “pools” contento 5 blastocistos para cada grupo experimental foram submetidos à extração de RNA total (RNAesay-Qiagen). A expressão gênica dos genes-alvo foi analisada por RT-PCR em tempo real com oligo-dT na transcrição reserva (RT) e primers bovinos específicos na PCR. A expressão de ciclofilina A (CYC-A) foi utilizada como controle interno. As taxas de produçaão de embriões foram analisadas por ANOVA, utilizando o Proc GLM do SAS. As médias dos níveis de mRNA dos genes alvo entre os grupos foram comparadas por ANOVA paramétrica, seguido de contraste ortogonal. O ETC reduziu significativamente... / Not available
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Estimativas de parâmetros genéticos para características de crescimento e de carcaça em ovinos de corte

Ono, Rafael Keith [UNESP] 29 July 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-07-29Bitstream added on 2014-06-13T20:14:36Z : No. of bitstreams: 1 ono_rk_me_jabo.pdf: 515778 bytes, checksum: 1290bcd92cebca595d379194178c40d4 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Objetivo do presente estudo foi estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos para as características de crescimento: Peso ao nascer (PN), Peso ao desmame (PD), Ganho de peso pré-desmama (GDPRÉ) e Ganho de peso pós-desmama (GDPÓS) e de carcaça: Área de olho de lombo (AOL) e Espessura de gordura subcutânea (EGS) para uma raça materna composta. Os dados utilizados foram oriundos de uma fazenda pertencente ao programa de melhoramento genético de ovino (OviGol®), coletados entre os anos de 2008 e 2011. Os efeitos ambientais considerados nos modelos foram determinados a partir de análise de variância, pela metodologia dos quadrados mínimos, considerando apenas efeitos significativos (p<0,01). Os componentes de (co)variâncias e os parâmetros genéticos para as características foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML), sob modelo animal, utilizando o programa REMLF90. Avaliaram-se dois modelos em análises unicaracterísticas pelo teste da razão de verossimilhança (LRT), sendo escolhido o modelo mais completo, o qual incluía como efeitos aleatórios o ambiente permanente materno e o genético aditivo. As herdabilidades diretas estimadas em análise multi-característica, sob modelo animal, foram: 0,26; 0,20; 0,23; 0,15; 0,18 e 0,10, para PN, GDPRÉ, PD, GDPÓS, AOL e EGS respectivamente. As correlações genéticas variaram de baixa a alta magnitude, sendo a mais alta entre GDPRÉ e PD (0,99) e a mais baixa entre PN e GDPÓS (0,02). Os resultados indicam que há variação genética para PN, PD e GDPRÉ, com possibilidade de seleção dentro da população / The aim of this study was to estimate the (co)variance components and genetic parameters for growth: Birth Weight (BW), Weaning Weight (WW), average daily gain pre-weaning (ADGpre) and average daily gain post-weaning (ADGpos) and carcass: Eye Muscle Area (EMA) and Fat Depth (FD) for a composite maternal breed. The data used were from a farm belonging to the breeding program for sheep (OviGol®), collected between 2008 and 2011. The environmental effects considered in models were determined from analysis of variance by least squares method, considering only significant effects (p<0.01). The components of (co)variance and genetic parameters were estimated by restricted maximum likelihood (REML), under the animal model, obtained by the REMLF90 program. Two models were tested, differentiated only by random effects in single-trait analysis of the likelihood ratio test (LRT), whichever is the more complete model, which included as random maternal permanent environmental and additive genetic. The direct heritability, analysis in multi-trait and in an animal model, was 0.26, 0.20, 0.23, 0.15, 0.18 and 0.10, for BW, ADGpre, WW, ADGpos, EMA and FT respectively. Genetic correlations ranged from low to high values, being the highest among ADGpre and WW (0.99) and lowest between BW and ADGpos (0.02). The study indicates that there is genetic variation for PN, GDPRÉ and PD, with scope for selection within population
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Análise de polimorfismo de marcadores microssatélites do cromossomo 6 em raças bubalinas comerciais do Brasil

Meirelles, Jacqueline de Andréa Dernowsek [UNESP] 05 August 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-08-05Bitstream added on 2014-06-13T19:33:18Z : No. of bitstreams: 1 meirelles_jad_me_jabo.pdf: 1044355 bytes, checksum: 0bc33764beb92268741c437b1c688dd8 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os búfalos possuem importância econômica como animais de produção no cenário agropecuário brasileiro e mundial. O conhecimento de polimorfismos em marcadores microssatélites mapeados em búfalos é imprescindível para auxiliar em questões evolutivas da espécie, variabilidade genética intra e inter-populacional, além de serem potencialmente úteis para os programas de melhoramento animal. Foram utilizadas três raças comerciais bubalinas, Mediterrâneo, Jafarabadi e Murrah de rebanhos brasileiros para análise de polimorfismos visando avaliar a diversidade genética existente dentro e entre as raças. Foram analisados 30 animais de cada raça pela amplificação do DNA genômico extraído do bulbo de pelos utilizando quatro locos microssatélites localizados em um cromossomo de interesse econômico. Os produtos de PCR foram separados por eletroforese vertical em gel de poliacrilamida desnaturante. O loco IDVGA-53 não obteve sucesso na amplificação e foi descartado das análises de polimorfismo. Os locos MB099 e BL41 foram monomórficos. Os parâmetros de diversidade foram gerados para o loco CSSM054, o único polimórfico, com média de 3,33 alelos por loco. A heterozigosidade observada com média de 0,503 foi maior que a esperada, indicando excesso de heterozigotos. As raças Mediterrâneo e Jafarabadi apresentaram desvio de equilíbrio de Hardy-Weinberg. O parâmetro Theta indicou evidências de que as três raças diferem entre si, e quando analisadas duas a duas foi possível verificar alta estruturação populacional entre elas. A maior distância genética foi verificada entre as raças Mediterrâneo e Murrah. O conteúdo de informação polimórfica revelou que o loco CSSM054 foi altamente informativo para a raça Mediterrâneo, portanto, considerando todos os resultados, essa raça apresentou maior variabilidade genética / The buffalo water are economically important livestock in Brazilian global and agricultural scenario. The knowledge of polymorphisms in microsatellites markers mapped in buffaloes is essential to assist in evolutionary studies of species, genetic variability within and between populations, as well as being potentially useful for animal breeding programs. Three commercial breeds of buffalos (Mediterranean, Jaffarabadi and Murrah) of Brazilian herds were used for polymorphisms analysis to evaluate the genetic diversity within and among them. In each breed 30 animals were analysed by amplification of genomic DND extracted from the hair bulbs using four microsatellite loci located on a chromosome of economic interest. PCR products were separated by vertical electrophoresis in denaturing polyacrylamide gel. The IDVGA-53 locus was not successful in amplifying and was discarded from the analysis of polymorphism. The loci MB099 and CSSM054 were monomorphic. The parameters of diversity were generated for the locus CSSM054, the only polymorphic, with an average of 3.33 alleles per locus. With a mean value of 0.503, the observed heterozygosity was higher than the expected, indicating excess of heterozygotes. Mediterranean and Jaffarabadi breeds had deviation of Hardy-Weinberg equilibrium. The parameter Theta indicated evidence that the three breeds differ and when they were analyzed in pairs, it was observed high population differentiation among them. The largest genetic distance was found between the Mediterranean and Murrah breeds. The polymorphic information content revealed that the locus CSSM054 was highly informative to the Mediterranean breed, therefore considering all the results that race had a high genetic variability
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Parâmetros genéticos para a mortalidade pré e pós-natal em bovinos da raça Nelore

Magalhães Silva, Lívia Carolina [UNESP] 30 August 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-08-30Bitstream added on 2014-06-13T20:33:49Z : No. of bitstreams: 1 magalhaessilva_lc_me_jabo.pdf: 1240622 bytes, checksum: 43e0525da56c6c05bc0304559d7a5c2f (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Esta pesquisa teve como objetivo geral ampliar os estudos sobre a variabilidade genética para mortalidade pré (Mpre) e pós-natal (Mpos) em bovinos da raça Nelore, estimando parâmetros genéticos dessas características. Os dados analisados foram provenientes de fêmeas nascidas entre 1984 e 1995, pertencentes à Agropecuária Jacarezinho Ltda, localizada no município de Valparaíso. As variáveis Mpre e Mpos se caracterizam por expressão binária, considerando-se duas condições, para Mpre: 1= sucesso, para os bezerros que conseguiram nascer e 0= falha, para bezerros que não conseguiram chegar ao final da gestação; e para Mpos: 1= sucesso, para bezerros que estavam presentes na desmama e 0= falha, para os que apresentaram peso ao nascer (PN), mas não conseguiram sobreviver até a desmama. O grupo contemporâneo (GC) foi considerado como efeito aleatório no modelo. Para Mpre o GC foi definido como: ano e fazenda no inicio da estação de monta, ano e fazenda de nascimento da vaca e estação de monta. Como efeito fixo foi considerado a idade da fêmea ao inicio da estação de monta em classes (variando de 1 a 13 anos). Para Mpos o GC foi definido como: bezerros do mesmo sexo, fêmeas nascidas e paridas na mesma fazenda e ano e grupo de manejo ao nascimento das fêmeas, foram considerados como efeitos fixos a idade da vaca ao parto em classes (variando de 2 a 9 anos), e como covariável o PN do bezerro (efeito linear e quadrático). Os componentes de variância foram estimados em análise unicaracterística utilizando-se a inferência Bayesiana pelo programa THRGIBBS1F90. Os intervalos de amostragem foram pelo pacote estatístico “BOA” (“Bayesian Output Analysis”), do programa R (R DEVELOPMENT CORE TEAM). A taxa de Mpre, encontrada no conjunto de dados foi de 2,0% e a estimativa de herdabilidade direta para Mpre, com base na característica da fêmea foi de magnitude moderada... / The aims of this research were to increase the knowledge about genetic variability of stillbirth (Mpre) and postnatal mortality (Mpos) in Nellore cattle through estimates of the genetic parameters for these traits. Mpre and Mpos were assessed as a cow and calf traits, and sire and animal model were compared. Datasets were obtained from females born between 1984 and 1995 on the Agropecuaria Jacarezinho Ltda. Mpre and Mpos are characteristics of binary expression, considering, for Mpre: 1= success, for calves that could be born, and failure (0), for those failed to reach in the end of pregnancy. For Mpos: success (1) for calves those were present at weaning, and failure (0): for those who had birth weight (PN), but did not survive weaning. The contemporary group (CG) was considered as the random effect in the model. For Mpre the GC was defined by year and farm at start of the breeding season of the cow, year and farm of birth of the cow and breeding season; the fixed effect was the age of the cow at beginning of breeding season (in classes, ranging from 1-13 years). For Mpos the GC was defined by calves of the same sex, cows that were born and calved on the same farm, year and handling group at calving; the fixed effects was age of calving (in classes, ranging 2-9 years) and, as covariable, the PN of calf (linear and quadratic). Variance components were estimated in univariate analysis using the Bayesian inference by the program THRGIBBS1F90. The sampling intervals were defined by statistical package “BOA” (Bayesian Output Analysis) included in program R (R Development Core Team, 2008). The rate of Mpre found in the dataset was 2.0%. The estimate of direct heritability for Mpre, based on the female´s traits was moderate (0.22), indicating moderate genetic gain in the population and good prospects for selection response. Estimates of direct heritability (0.01) and maternal total... (Complete abstract click electronic access below)
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Estimação de parâmetros genéticos para produção de leite e seus constituintes em búfalas

Aspilcueta Borquis, Rusbel Raúl [UNESP] 26 February 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-02-26Bitstream added on 2014-06-13T20:14:41Z : No. of bitstreams: 1 aspilcuetaborquis_rr_me_jabo.pdf: 274348 bytes, checksum: 31ca6918ca8e55efea6a5e7c06c39b93 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Conhecer a variabilidade genética aditiva de características com importância econômica é fundamental para a elaboração de programas de melhoramento genético nas espécies domésticas. Assim sendo, utilizou-se 4.757 lactações completas de búfalas da raça Murrah, obtidas no período de 1985 a 2005 para estimação de parâmetros genéticos das produções acumuladas até os 305 dias de leite (PL305), gordura (PG305), proteína (PP305) e sólidos totais (PST305), e das produções no dia do controle PLDC, PGDC, PPDC e PSTDC, respectivamente, além das porcentagens de gordura (%G) e proteína (%P). Utilizando-se o método de máxima verossimilhança restrita foram realizadas análises tricaracterísticas envolvendo PL305, %G e %P. Considerando as informações no dia do controle, analisaram-se as produções mensais de leite, gordura, proteína e sólidos totais. Os modelos matemáticos incluíram como aleatórios os efeitos genético aditivo, de ambiente permanente e o residual e, como efeitos fixos, o grupo de contemporâneos (rebanho-ano-estação de parto), número de ordenhas e idade da búfala ao parto como covariável (linear e quadrático). Os mesmos efeitos foram incluídos no modelo para ajustes da produção no dia de controle de leite, gordura, proteína e sólidos totais, sendo o efeito de grupo de contemporâneos definido por rebanho-ano-mês de controle. Nas análises tricaracterísticas, observaram-se estimativas de herdabilidade moderadas e as correlações genéticas entre a produção de leite e as porcentagens de gordura e proteína foram baixas e negativas, indicando dificuldade de seleção simultânea para estas características. / Know the variability additive of characteristics with importance economic is fundamental for elaboration of programs of improvement genetic on the species domestic. Given this, uses 4.757 lactations completed of buffaloes from race Murrah, obtained into the period of 1985 and 2005, about to valuation of genetic parameters from the yield total the 305 days the milk (Y305), fat (YF305), protein (YP305) and solid totals (YST305), and the yield milk test day (YMTD), fat (YFTD), protein (YPTD) and solid total (YSTTD), there from the percentages of fat (%F) and (%P). Considering the information test day, analyzed productions month of milk, fat, protein and solid total. Variance components were estimated by restricted likelihood method, in analyzed three-trait for Y305, %F and %P. The model mathematicians included additive genetic, environmental permanent effects as random, the fixed effect of contemporary groups, number of to milk and age of the cow at calving as linear and quadratic covariável. Contemporary groups were defined by herd-year-month of test for test day month and by herd-year-season calving for yield total. For test day and yield total estimated by analyzed one and two-trait.
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Diversidade genética em maracujá amarelo utilizando marcadores moleculares fAFLP

Ganga, Rita Maria Devós [UNESP] 28 November 2003 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:09Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2003-11-28Bitstream added on 2014-06-13T18:29:33Z : No. of bitstreams: 1 ganga_rmd_me_jabo.pdf: 819507 bytes, checksum: 5ba45956cafb05a742d55332f642a8b2 (MD5) / Os maracujazeiros pertencem à família Passifloraceae e ao gênero Passiflora, reunindo mais de 500 espécies distribuídas pelos trópicos, principalmente no Brasil, centro de origem de pelo menos um terço das espécies, o que determina uma grande variabilidade genética. Como maior produtor mundial da fruta, o Brasil tem cerca de 35 mil hectares de área colhida e produção superior a 317 mil toneladas por ano, no qual Bahia, São Paulo e Sergipe respondem por mais de 50% da produção no País. A avaliação da variabilidade presente é indispensável aos trabalhos de melhoramento genético, cuja caracterização molecular pode fornecer a base para estudos de diversidade, pautando-se na composição genética sem influência do ambiente. Marcadores moleculares fAFLP foram utilizados para estimar a diversidade genética entre 36 acessos de maracujá amarelo (Passiflora edulis f. flavicarpa Deg.) coletados em 18 estados do Brasil. Os resultados obtidos permitiram concluir que os marcadores fAFLP se mostraram consistentes na verificação da variabilidade genética, detectando e quantificando a ampla divergência genética entre os 36 acessos de Passiflora edulis f. flavicarpa Deg. analisados, bem como a não formação de estruturação geográfica. Tais resultados podem auxiliar na definição de estratégias mais eficientes a serem utilizadas em programas de melhoramento genético de maracujazeiro amarelo. / Passion fruit trees belong to the Passionfloraceae family and to the Passiflora genus, gathering more than 500 species distributed over the tropics, mainly in Brazil, source of at least one third of the species, what determines a great genetic variability. As the world's biggest producing country, Brazil has around 35 thousand hectares of harvest area, and a production superior to 317 thousand tons per year from which Bahia, São Paulo and Sergipe are responsible for more than 50%. The assessment of the variability is essential to genetic breeding works, whose molecular characterization can provide us with the basis for studies on diversity, taking into account the genetic composition without environmental influence. fAFLP molecular markers were utilized to estimate genetic diversity among 36 yellow passion fruit accessions (Passiflora edulis f. flavicarpa Deg.) colleted in 18 Brazilian states. The obtained results led to the conclusion that the fAFLP markers were consistent regarding to the evaluation of genetic variability, detecting and quantifying the ample genetic divergence among the 36 analyzed accessions, as well as to the no geographic structural formation. Such results can be useful to the definition of more efficient strategies to be applied in genetic breeding programs of yellow passion fruit tree.
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Análise dialélica entre linhagens de pepino do tipo japonês

Lima, Ariane Teixeira da Silva [UNESP] 26 June 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:41Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-06-26Bitstream added on 2014-06-13T19:54:54Z : No. of bitstreams: 1 lima_ats_me_botfca.pdf: 547682 bytes, checksum: 52b4bf8172f6473b5078259de5aefb54 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial produtivo de 12 linhagens endogâmicas (S5) obtidas a partir de autofecundações sucessivas de duas populações de pepino japonês, população RY (Rensei x Yoshinari) e população TT (Tsuyataro x Taisho) e de 18 híbridos experimentais obtidos a partir do cruzamento entre linhagens no esquema de dialelo parcial circulante interpopulacional. O experimento foi realizado na Fazenda Experimental São Manuel da FCA/UNESP, Câmpus de Botucatu, no período de março de 2007 a julho de 2008. O delineamento foi em blocos ao acaso, com 33 tratamentos sendo 18 híbridos experimentais, 12 linhagens e três híbridos comerciais, com quatro repetições e cinco plantas por parcela. Foram avaliadas as características produção de frutos imaturos (número e massa) por planta, total e comercial, porcentagem de frutos comerciais, massa média de frutos comerciais, comprimento, diâmetro e relação comprimento/diâmetro dos frutos. As médias foram agrupadas pelo teste de Scott- Knott. Para todas as características de produção obtiveram-se uma linhagem (TT2) e seis híbridos experimentais (H16, H26, H11, H43, H54 e H15) tão ou mais produtivos que o melhor híbrido comercial, Tsuyataro. As heteroses dos híbridos para produção de frutos variaram de -20,90 a 45,33% com predomínio de valores positivos, o que mostrou a superioridade dos híbridos em relação à média dos genitores. / The objective of this work was to evaluate the yield potential of 12 inbred lines (S5 ) of two populations of Japanese cucumber: population RY (Rensei x Yoshinari) and population TT (Tsuyataro x Taisho) and 18 experimental hybrids obtained in a diallel partial circling inter population. The experiment was carried out in Experimental Farm São Manuel of FCA/UNESP, Campus Botucatu, in the period from March/2007 to July/2008. The design was randomized blocks, with 33 treatments, 18 experimental hybrids, 12 lines and three commercials hybrids, with four replicates and five plants per plot. The characteristics evaluated were immature fruits yield (number and weight) per plant, total and commercial; percentage of commercial fruits; average weight of commercial fruits; lenght, diameter and relation lenght/diameter of fruits. Treatment means were compared by Scott-Knott test. For all yield characteristics it was obtained a line (TT2) and six experimental hybrids (H16, H26, H11, H43, H54 e H15) as or more yielding than the best commercial hybrid, Tsuyataro. The heteroses of hybrids to yield fruit were from - 20,90 to 45,33%, most of them was positive, showing the superiority of hybrids in relation to parents average.
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Isolamento e caracterização de promotores órgão-específicos a partir de informações do Banco FORESTs (Eucalyptus Genome Sequencing Project Consortium)

Sassaki, Flávio Tetsuo [UNESP] 26 May 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:14Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-05-26Bitstream added on 2014-06-13T20:23:16Z : No. of bitstreams: 1 sassaki_ft_dr_botib.pdf: 639781 bytes, checksum: da9c5dfd420cacee439e439116e7d05b (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Os cassetes de expressão empregados atualmente para a produção de plantas geneticamente modificadas são baseados, na sua maioria, em promotores constitutivos que determinam a expressão generalizada do transgene na planta, o que muitas vezes não é necessário nem desejado. A alternativa mais viável para substituição de tais promotores é investir na identificação e caracterização de promotores órgão/tecidoespecíficos ou estímulo-dependentes nas espécies de interesse. O presente projeto teve como objetivos identificar e caracterizar genes com padrão de expressão órgãoespecífico em eucalipto e, a partir dessas informações, isolar e caracterizar as seqüências promotoras adjacentes. Predições in silico no banco de dados do projeto de seqüências expressas do eucalipto (FORESTs), e informações disponíveis na literatura a respeito de genes com padrão de expressão órgão-específico, foram utilizadas na seleção. Assim, 59 genes preditos como possuindo expressão exclusiva em dado órgão foram selecionados para a validação via RT-PCR. Dos candidatos validados, 2 eram de raiz, 1 de folha, 1 de botão floral e 1 de botão floral e fruto, concomitantemente. Três candidatos ubíquos também foram selecionados. Dois desses candidatos tiveram seus perfis de expressão em diferentes órgãos de eucalipto avaliados por PCR quantitativa, indicando que o primeiro é preferencialmente expresso em folhas, e o segundo expresso especificamente em raiz. A partir de estratégias de “genome walking” foram isolados diferentes promotores putativos, sendo que o promotor do candidato com expressão preferencial em folha (1.2 kb) foi selecionado para a caracterização funcional em plantas usando o gene uidA, que codifica a -glucuronidase (GUS), como repórter. Em plântulas transgênicas de tabaco da geração T1, a expressão de GUS foi detectada majoritariamente... / Many plant genetic engineering applications require spatial expression of transgenes, which in turn depends upon the availability of tissue- and organ-specific promoters. In the present work, the identification of genes with organ-specific expression in Eucalyptus grandis was performed aiming the subsequent isolation and characterization of contiguous promoter sequences. Candidates genes were selected by in silico predictions in the Eucalyptus EST project (FORESTs) database or by searching the available literature for genes with specific expression patterns. Fifty-nine genes with predicted organ-specific expression were selected for further RT-PCR validation. Among the validated candidate genes, 2 were root-specific, 1 was leaf-specific, 1 was flower-bud-specific and 1 was flower-bud and fruit specific. Three genes ubiquitously expressed were also selected. The relative expression levels of two of them (one leafspecific and one root-specific) over a broad range of eucalyptus organ/tissues were determined using real time PCR. The 5’ putative regulatory sequences of the validated genes were isolated using genome walking strategies, and the activity of the leafspecific promoter (1.2 kb) was further investigated in transgenic tobacco plants using a GUS reporter system. In transgenic seedlings from the T1 generation, GUS expression driven by this promoter was detected preferentially in cotyledons. In adult plants, however, GUS expression was detected in both stem and root, but in lower intensity if compared to the expression observed in leaves. This promoter was also able to modulate the transient expression of GUS in seedlings of Eucalyptus grandis.
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Aplicação de ferramentas moleculares e convencionais no melhoramento genético da soja

Espindola, Sybelli Magda Coelho Gonçalves [UNESP] 07 January 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-01-07Bitstream added on 2014-06-13T20:23:21Z : No. of bitstreams: 1 espindola_smcg_dr_jabo.pdf: 360908 bytes, checksum: 4d6651892be89ff6a6c3957a8387c0d9 (MD5) / Atualmente, a soja destaca-se como a mais importante oleaginosa cultivada no mundo. Os investimentos em pesquisa levaram à tropicalização da soja, permitindo, pela primeira vez na história, que o grão fosse plantado com sucesso, em regiões de baixas latitudes, entre o Trópico de Capricórnio e a linha do Equador. Em função disso tem-se buscado o desenvolvimento de genótipos com ampla adaptabilidade, o que implica em uma baixa interação genótipo x ambiente. O entendimento do tipo de interação permite um melhor posicionamento e indicação de regiões de plantio da cultivar em questão facilitando o trabalho do melhorista. A presença desse fenômeno pode acarretar uma redução da produtividade global de uma área para a qual se faça uma indicação geral de uma dada cultivar. Por outro lado, pode-se tirar proveito de sua existência usando-se procedimentos estatísticos que identifiquem o padrão dessa interação, e gerem informações que possibilitem o agrupamento de locais em zonas dentro das quais a magnitude da interação não seja significativa, permitindo indicações específicas de cultivares para tais zonas. O uso de ferramentas moleculares tem se apresentado como uma opção para seleção de características com base no genótipo e eliminando assim o efeito do ambiente na expressão da característica em questão. O melhoramento assistido por marcadores moleculares tem sido tema de inúmeros trabalhos de seleção assistida, cujos resultados variam de concretos e positivos a controversos e pouco significativos em termos de ganhos genéticos, econômicos e eficiência, quando comparados com a seleção fenotípica. Os capítulos seguintes permitem apresentar resultados de metodologias moleculares e convencionais aplicadas em um programa de melhoramento para seleção de genótipos superiores de soja. / Nowadays, soybean highlights as the most important oilseed cultivated in the world. The investments in research led to soybean “tropicalization”, allowing, for the first time in history, that the grain was seeded with success, in low latitudes, between the tropic of Capricorn and the Equator. Due to this, researchers have tried to develop wide adaptability genotypes, which implies in a low genotype x environment interaction. The comprehension of the type of interaction allows a better placement and indications of cultivar planting regions, facilitating the breeder’s work. The presence of this phenomenon may result in a global productivity decrease of an area that make up an overall indication of a given cultivar. On the other hand, it is possible to take advantage of their existence using statistical procedures to identify the pattern of this interaction, and generate information that allow the grouping of local areas within which the magnitude of the interaction is not significant. Specific cultivar indication for these zones. The use o molecular tools have shown as an option for characteristics selection base on genotype and then eliminating the environment effect in the expression of the characteristic in question. The molecular marker-assisted breeding has been the subject of numerous works assisted selection, whose results varies from concrete and positive to controversial and little significant in terms of genetic gains, and economic efficiency compared to phenotypic selection. The following chapters present results provide molecular and conventional methodologies applied in a breeding program for superior genotypes selection.
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Capacidade combinatória de linhagens de milho selecionadas para sistema radicular

Demétrio, Cláudia de Sousa [UNESP] 19 December 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-12-19Bitstream added on 2014-06-13T19:02:40Z : No. of bitstreams: 1 demetrio_cs_dr_jabo.pdf: 450658 bytes, checksum: 4414bc47de06a1e7edb568217892b6bc (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O continuo fenômeno de aquecimento global será certamente acompanhado de um aumento dos períodos de estiagem e instabilidade das condições climáticas. Informações prévias sobre o sistema radicular de genótipos de milho e sua possível relação com a parte aérea são de grande interesse num programa de melhoramento de milho. Assim, o presente trabalho teve como objetivos identificar a existência de possíveis efeitos da seleção prévia de linhagens endogâmicas de milho para comprimento, área e volume do sistema radicular e selecionar híbridos superiores para as regiões de São Paulo e Goiás, por meio da estimativa das capacidades geral e específica de combinação (CGC e CEC). Para avaliação das linhagens de milho como superiores e inferiores para comprimento, área e volume do sistema radicular, foi conduzido no ano de 2009, em Jaboticabal-SP, um experimento em solução nutritiva. No ano agrícola de 2009/2010, as linhagens selecionadas foram cruzadas em esquema de dialelos completos e parcial. Os híbridos dialélicos com sementes suficientes para avaliação das suas características agronômicas em três ambientes, Barretos-SP, Monte Azul Paulista-SP e Santa Helena de Goiás-GO e três testemunhas comerciais (2B707, AG7000 e DKB390) foram avaliados, no ano agrícola de 2010/2011, em delineamentos de blocos casualizados, com três repetições. As variáveis avaliadas foram: acamamento, quebramento, altura de plantas, altura de espiga e produtividade. Verificou-se que, em média para os três ambientes, o grupo de híbridos inferior para sistema radicular se destacou em produtividade em relação aos grupos de híbridos superior e superior x inferior. Porém, as combinações híbridas S10 x S13, S5 x I1 e S2 x S14 se destacaram pelos elevados valores CEC e CGC para seus genitores, apresentam, os três, pelo menos um genitor pertencente ao grupo de linhagens superiores / The continuous phenomenon of global warming will certainly be followed by an increase of droughts and unstable weather conditions. Prior information of genotype maize root systems and their possible relation with the shoot would be of great interest in a corn breeding program. Thus, this study aimed to identify the existence of possible effects of previous selection of maize inbred for length, area and volume of the root system and select superior hybrids for the regions of São Paulo and Goiás states, through the estimation of their general and specific combining abilities (CGC and CEC). To evaluate the maize inbreeds as superior and inferior for length, area and volume of the root system, an experiment in nutrient solution was carried out in 2009 in Jaboticabal-SP, Brazil. In the agricultural year 2009/2010, the selected lines were crossed in complete and partial diallel schemes. The diallel hybrids, with enough seeds for agronomic trait evaluations in three environments, Barretos-SP, Monte Azul Paulista-SP and Santa Helena de Goiás-GO, Brazil, and three commercial checks (2B707, DKB390 and AG7000) were evaluated during the crop year of 2010/2011, in a randomized block design, with three replications. The following variables were evaluated: percentage of lodged and broken plants, plant height, ear height and grain yield. On average for the three environments, the inferior group of hybrids for root system excelled in productivity in relation to the superior and superior x inferior groups. However, the hybrid combinations S10 x S13, S5 x I1 and S2 x S14 that best stood out, by high values of CEC and CGC for it´s genitors, have all three, at least one genitor belonging to the group of superior inbred lines

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