Since certain species are used in form of dietary supplements in developed world as antidiarrheal agents and because of presence of reports describing antidiarrheal properties of medicinal plants used in traditional African medicine, we can expect, that systematic microbiological and phytochemical research of plant derived products (extracts, essential oils and their constituents) can lead to the discovery of effective antidiarrheal low-cost agents applicable for elimination of diarrhea in certain African regains.

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Atualmente, a campilobacteriose representa uma importante zoonose tanto em países desenvolvidos quanto em países em desenvolvimento. No Brasil, vários estudos relatam a alta frequência de suínos eliminando o agente nas fezes, porém, a contaminação da carne suína comercializada tem sido pouco avaliada, principalmente no que diz respeito à presença de Campylobacter spp. A incidência deste agente em cortes de carne de aves é mais descrita, porém ainda faltam estudos que esclareçam a epidemiologia da doença. Os objetivos principais do presente estudo foram avaliar a presença de Campylobacter spp. em cortes de carne de frangos e suínos vendidos em mercados municipais, açougues e mercados de pequeno porte distribuídos nas cinco regiões do município de São Paulo. Das 115 amostras de origem suína avaliadas sete se mostraram positivas ao isolamento de Campylobacter coli e, das 105 amostras de carne de frango, 31 estavam contaminadas por Campylobacter jejuni ou Campylobacter coli. Dentre as 38 amostras de carne de frango e suíno positivas foram selecionadas 60 estirpes, as quais foram caracterizadas quanto à espécie, utilizando a reação em cadeia pela polimerase e a espectrometria de massa MALDI-TOF, foram ainda avaliadas quanto ao perfil de resistência a antimicrobianos e foram submetidas a genotipagem pelo polimorfismo de comprimento de fragmentos amplificados (AFLP). A partir dos resultados obtidos seis estirpes foram selecionadas para realização do sequenciamento do genoma completo e a partir da análise dos genomas foram identificados os STs, os genes de resistência e genes de virulência. / Currently, Campylobacteriosis represents an important zoonosis in both developed and developing countries. In Brazil, several studies report a high frequency of pigs excreting the agent in the feces, but the contamination of marketed pork has been insufficiently evaluated, especially with regard to the presence of Campylobacter spp. The incidence of this agent in cuts of poultry meat is more detailed; however, there are still studies lacking that clarify the epidemiology of the disease. The main aims of the present study were to evaluate the presence of Campylobacter spp. in chicken and pork cuts sold in municipal markets, butchers and small markets distributed in the five regions of the city of São Paulo. Of the 115 pork samples evaluated, seven were Campylobacter coli isolation positive and 31 of the 105 chicken samples were contaminated with Campylobacter jejuni or Campylobacter coli. Of the 38 chicken and pork positive samples, 60 strains were selected, which were characterized by species using polymerase chain reaction and MALDI-TOF mass spectrometry. They were also assessed for antimicrobial resistance profile and were genotyped by amplified fragment length polymorphism (AFLP). From the results obtained six strains were selected to carry out the complete genome sequencing and from the genome analysis the STs, the resistance genes and the virulence genes were identified.

Atualmente, a campilobacteriose representa uma importante zoonose tanto em países desenvolvidos quanto em países em desenvolvimento. No Brasil, vários estudos relatam a alta frequência de suínos eliminando o agente nas fezes, porém, a contaminação da carne suína comercializada tem sido pouco avaliada, principalmente no que diz respeito à presença de Campylobacter spp. A incidência deste agente em cortes de carne de aves é mais descrita, porém ainda faltam estudos que esclareçam a epidemiologia da doença. Os objetivos principais do presente estudo foram avaliar a presença de Campylobacter spp. em cortes de carne de frangos e suínos vendidos em mercados municipais, açougues e mercados de pequeno porte distribuídos nas cinco regiões do município de São Paulo. Das 115 amostras de origem suína avaliadas sete se mostraram positivas ao isolamento de Campylobacter coli e, das 105 amostras de carne de frango, 31 estavam contaminadas por Campylobacter jejuni ou Campylobacter coli. Dentre as 38 amostras de carne de frango e suíno positivas foram selecionadas 60 estirpes, as quais foram caracterizadas quanto à espécie, utilizando a reação em cadeia pela polimerase e a espectrometria de massa MALDI-TOF, foram ainda avaliadas quanto ao perfil de resistência a antimicrobianos e foram submetidas a genotipagem pelo polimorfismo de comprimento de fragmentos amplificados (AFLP). A partir dos resultados obtidos seis estirpes foram selecionadas para realização do sequenciamento do genoma completo e a partir da análise dos genomas foram identificados os STs, os genes de resistência e genes de virulência. / Currently, Campylobacteriosis represents an important zoonosis in both developed and developing countries. In Brazil, several studies report a high frequency of pigs excreting the agent in the feces, but the contamination of marketed pork has been insufficiently evaluated, especially with regard to the presence of Campylobacter spp. The incidence of this agent in cuts of poultry meat is more detailed; however, there are still studies lacking that clarify the epidemiology of the disease. The main aims of the present study were to evaluate the presence of Campylobacter spp. in chicken and pork cuts sold in municipal markets, butchers and small markets distributed in the five regions of the city of São Paulo. Of the 115 pork samples evaluated, seven were Campylobacter coli isolation positive and 31 of the 105 chicken samples were contaminated with Campylobacter jejuni or Campylobacter coli. Of the 38 chicken and pork positive samples, 60 strains were selected, which were characterized by species using polymerase chain reaction and MALDI-TOF mass spectrometry. They were also assessed for antimicrobial resistance profile and were genotyped by amplified fragment length polymorphism (AFLP). From the results obtained six strains were selected to carry out the complete genome sequencing and from the genome analysis the STs, the resistance genes and the virulence genes were identified.

Made available in DSpace on 2018-06-27T18:56:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Carmem Regina Cocco.pdf: 750542 bytes, checksum: 3dab59e0b66a9e48ba2ea358f2e7c77e (MD5) Carmem Regina Cocco.pdf.jpg: 3247 bytes, checksum: 4043838dc557b1573ae10b8d917643e1 (MD5) Previous issue date: 2008-11-11 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Carbon nanotubes have several technological applications, due to their electrical characteristics and high mechanical resistance. After the synthesis, in the stage of purification, impurities such as residues of metal catalysts can change the characteristics of the material. Carbon nanotubes (CNT) are materials of difficult decomposition, in which, even though using acids in systems in high temperature and pressure, we don t get good results in relation to the total destruction of the sample, creating a compromising in the next stage, the determination of the metals. In this work, we used the method of microwave induced combustion (MIC) for the decomposition of CNT and determination of metals (Fe, Ni, Co, Ca and La) by inductively coupled plasma optical emission spectrometry (ICP OES). The product of the combustion was absorbed in adequate solutions (water, HNO3 and HCl) and taken to the determination of the metals. Better results were gotten when the concentrated HCl was used as an absorbing solution. For the carbon nanotubes analyzed, even though purified, high concentrations of metal catalysts (from 0.01 to 2.7%) were found. / Nanotubos de Carbono (NTC) possuem diversas aplicações tecnológicas, devido as suas propriedades elétricas e elevada resistência mecânica. Após a síntese, na etapa de purificação, impurezas como resíduos de catalisadores remanescentes podem alterar as propriedades do material. Os NTC são materiais de difícil decomposição, onde, mesmo utilizando ácidos concentrados em sistemas a alta temperatura e pressão, não são obtidos resultados satisfatórios quanto a destruição total da amostra, proporcionando um comprometimento na etapa de determinação d metais. No presente trabalho, foi utilizado o procedimento de combustão iniciada por microondas (MIC) para a decomposição de NTC e posterior determinação de metais (Fe, Ni, Co, Ca e La) por espectrometria de emissão óptica com plasma indutivamente acoplado (ICP OES). O produto da combustão foi absorvido em soluções apropriadas (Água, HNO3 e HCl) e conduzido para a determinação dos metais. Melhores resultados foram obtidos quando HCl concentrado foi utilizado como solução absorvedora. Para os NTC estudados, mesmo sendo purificados, altas concentrações de catalisadores (0,01 a 2,7%) foram encontrados.

Agentes causadores de infecções urinárias, endocardites, meningites e septicemias os membros do gênero Enterococcus ganharam grande importância epidemiológica nos últimos anos, já que possuem resistência, tanto intrínseca quanto adquirida, a uma ampla gama de antibióticos. Entre as trinta e seis espécies descritas atualmente, duas recebem maior destaque,E. fecalis e E. faecium devido à alta frequência de multirresistência a antimicrobianos e a sua maior participação nos casos de infecções humanas. Vários estudos tem associado o uso de facilitadores de crescimento em animais de produção com o aumento da frequência de multirresistência em várias espécies de Enterococcus. Diante do exposto, no presente estudo foram avaliadas 245 cepas de Enterococcus faecalis isoladas de 171 suínos comercias quanto ao perfil de resistência a antimicrobianos através da determinação da concentração inibitória mínima e quanto ao perfil genotípico através da eletroforese em campo pulsado. As maiores taxas de resistência observadas foram contra a tilosina (98,7%) e lincomicina (98,7%), seguidas pela tetraciclina (97,1%), eritromicina (96,7%), estreptomicina (96,3%), combinação quinupristinadalfopristina (95,5%), kanamicina (93,8%), gentamicina (85,3%), ciprofloxacina (76,7%) e cloranfenicol (71,8%). Não foram identificadas cepas resistentes a vancomicina e a taxa de resistência a princípios como daptomicina (0,4,%), nitrofurantoína (1,2%) e tigeciclina (1,6%) foi baixa. Através da eletroforese em campo pulsado as cepas foram agrupadas em 109 pulsotipos, não havendo grupamentos diretamente relacionados ao perfil de resistência. As cepas foram agrupadas em maior frequência, de acordo com o animal e a granja de origem. No Brasil, o uso de avoparcina em suinocultura não foi muito intensivo, o que provavelmente não contribuiu para a seleção de cepas resistentes a vancomicina, no entanto, a resistência a altos níveis de gentamicina e estreptomicina é alarmante, e devido à importância destes antimicrobianos no tratamento das infecções humanas por Enterococcus, estes níveis de resistência deveriam ser monitorados em isolados de origem animal e ambiental. / Causative agents of urinary tract infections, endocarditis, meningitis and septicemia members of the genus Enterococcus gained great epidemiological importance in the last years, due to resistance, both intrinsic and acquired a wide range of antibiotics. Among the thirty-six species currently described two receive greater emphasis, E. faecalis and E. faecium due to the high frequency of multidrug resistance to antimicrobial agents and their greater involvement in cases of human infections. Several studies have associated the use of growth promoters in production animals to increase the frequency of multidrug resistance in various species of Enterococci. On the exposed, in the present study, 245 strains of E. faecalis isolated from 171 commercial pigs were evaluated for the antimicrobial resistance profile by determining the minimum inhibitory concentration and for the genotypic profile by pulsed field gel electrophoresis. The highest resistance rates were observed against tylosin (98.7 %) and lincomycin (98.7 %), followed by tetracycline (97.1 %), erythromycin (96.7%), streptomycin (96.3%), a combination quinupristin - dalfopristin (95.5 %), kanamycin (93.8 %), gentamicin (85.3 %), ciprofloxacin (76.7 %) and chloramphenicol (71.8%). Strains resistant to vancomycin were not found, and the rate of resistance to daptomycin (0.4 %), nitrofurantoin (1.2%) and tigecycline (1.6%) was low. By pulsed field gel electrophoresis the strains were grouped into 109 pulsotypes, with no groups directly related to the resistance profile. The strains were grouped into higher frequency, according to the animal and farm of origin. In Brazil, the use of avoparcin in swine production was not very intensive, which probably contribute to the low selection of vancomycin-resistant strains, however, resistance to high levels of gentamicin and streptomycin is alarming, and because of the importance of these antimicrobials in treatment of human infections caused by Enterococcus, these resistance levels should be monitored in isolates of animal and environmental origin.

O objetivo do presente estudo foi avaliar a capacidade de isolados de Listeria monocytogenes em formar biofilmes em superfícies inertes, bem como sua resistência a agentes sanitizantes. Foram utilizados 37 isolados provenientes de ambiente de laticínios, amostras de queijos e salmoura, pertencentes à coleção do Laboratório de Microbiologia e Micotoxicologia de Alimentos (LMMA) do Departamento de Engenharia de Alimentos da FZEA/USP. Dos 37 isolados avaliados, 67,6% eram pertencentes ao sorotipo 4b. Três isolados de L. monocytogenes foram obtidos de salmoura, 5 foram obtidos de caixas plásticas, 1 de queijo Prato, 1 da mão de manipulador de embalagens, e 27 foram isolados de superfícies sem contato com alimentos (piso da sala de pasteurização, piso da câmara fria, ralo da câmara fria ou estrado da câmara fria). Os isolados de L. monocytogenes apresentaram maior capacidade de produzir biofilme nos ensaios com cupons de aço inox (43,2% dos isolados), seguido dos ensaios em microplaca de poliestireno (16,2%), cupons de borracha (13,5%) e discos de silicone (2,7%). As células de L. monocytogenes aderidas nas superfícies do aço inox foram visualizadas sob microscopia eletrônica de varredura após 48 horas de incubação a 37ºC. Dezenove isolados de L.monocytogenes, os quais produziram biofilmes nos ensaios com aço inox, borracha ou silicone, foram testados para determinação da eficiência de sanitizantes pelo método de concentração inibitória mínima (CIM), utilizando-se ácido peracético (2%), cloreto de banzalcônio (1%), digluconato de clorexidina (2%), hipoclorito de sódio (2%) e tintura de iodo (2%). Os isolados de L. monocytogenes analisados apresentaram resistência a ácido peracético, hipoclorito de sódio e tintura de iodo, cujos valores de CIM foram 3,12%, 6,25% e 6,25%, respectivamente. Nenhum isolado apresentou resistência a cloreto de benzalcônio e digluconato de clorexidina, os quais foram eficientes para inibição de isolados de L. monocytogenes provenientes de amostras de queijos e ambientes de laticínios. A L. monocytogenes apresenta capacidade de persistir em ambiente de laticínios sob a forma de biofilme em várias superfícies inertes como aço inox, borracha e silicone, o que pode representar uma fonte permanente de contaminação para produtos e processos de obtenção de leite e derivados. / The objective of the present study was to evaluate the ability of isolates of Listeria monocytogenes to form biofilms and their resistance to sanitizers. Thirty seven strains belonging to the collection of the Laboratory of Microbiology and Food Mycotoxicology (LMMA), Department of Food Engineering of FZEA / USP, were used. Of the 37 isolates, 67.6% belonged to serotype 4b. Three isolates of L. monocytogenes were obtained from brine, 5 were obtained from plastic boxes, one of Prato cheese, one from the packaging handler\'s hand, and 27 were isolated from non-food contact surfaces (pasteurization room floor, the floor of the cold room, the drain cold or pallet from the cold chamber). The isolates of L. monocytogenes showed greater ability to produce biofilm in the assays with stainless steel coupons (43.2% of isolates), followed by polystyrene micro plate (16.2%), rubber coupons (13.5%) and silicone disks (2.7%) assays. Cells of L. monocytogenes attached to stainless steel surfaces were viewed under scanning electron microscopy after 48 hours incubation at 37°C. Nineteen strains of L. monocytogenes, which were considered biofilms producers in the assays with stainless steel, rubber or silicone, have been tested to evaluate the efficiency of the sanitizing method by means of the minimum inhibitory concentration (MIC), using peracetic acid (2%), sodium chloride benzalkonium (1%), chlorhexidine digluconate (2%), sodium hypochlorite (2%) and iodine solution (2%). The isolates of L. monocytogenes analyzed showed resistance to peracetic acid, sodium hypochlorite and iodine tincture, with MIC values of 3.12%, 6.25% and 6.25%, respectively. No isolate showed resistance to benzalkonium chloride and chlorhexidine digluconate, which were effective for inhibiting the isolates of L. monocytogenes from samples of cheeses and dairy environments. In conclusion, L. monocytogenes has the ability to persist in the environment of dairy products by forming biofilms in several inert surfaces such as stainless steel, rubber and silicone, which may represent a continuing source of contamination to manufacture processes of dairy products.

Agentes causadores de infecções urinárias, endocardites, meningites e septicemias os membros do gênero Enterococcus ganharam grande importância epidemiológica nos últimos anos, já que possuem resistência, tanto intrínseca quanto adquirida, a uma ampla gama de antibióticos. Entre as trinta e seis espécies descritas atualmente, duas recebem maior destaque,E. fecalis e E. faecium devido à alta frequência de multirresistência a antimicrobianos e a sua maior participação nos casos de infecções humanas. Vários estudos tem associado o uso de facilitadores de crescimento em animais de produção com o aumento da frequência de multirresistência em várias espécies de Enterococcus. Diante do exposto, no presente estudo foram avaliadas 245 cepas de Enterococcus faecalis isoladas de 171 suínos comercias quanto ao perfil de resistência a antimicrobianos através da determinação da concentração inibitória mínima e quanto ao perfil genotípico através da eletroforese em campo pulsado. As maiores taxas de resistência observadas foram contra a tilosina (98,7%) e lincomicina (98,7%), seguidas pela tetraciclina (97,1%), eritromicina (96,7%), estreptomicina (96,3%), combinação quinupristinadalfopristina (95,5%), kanamicina (93,8%), gentamicina (85,3%), ciprofloxacina (76,7%) e cloranfenicol (71,8%). Não foram identificadas cepas resistentes a vancomicina e a taxa de resistência a princípios como daptomicina (0,4,%), nitrofurantoína (1,2%) e tigeciclina (1,6%) foi baixa. Através da eletroforese em campo pulsado as cepas foram agrupadas em 109 pulsotipos, não havendo grupamentos diretamente relacionados ao perfil de resistência. As cepas foram agrupadas em maior frequência, de acordo com o animal e a granja de origem. No Brasil, o uso de avoparcina em suinocultura não foi muito intensivo, o que provavelmente não contribuiu para a seleção de cepas resistentes a vancomicina, no entanto, a resistência a altos níveis de gentamicina e estreptomicina é alarmante, e devido à importância destes antimicrobianos no tratamento das infecções humanas por Enterococcus, estes níveis de resistência deveriam ser monitorados em isolados de origem animal e ambiental. / Causative agents of urinary tract infections, endocarditis, meningitis and septicemia members of the genus Enterococcus gained great epidemiological importance in the last years, due to resistance, both intrinsic and acquired a wide range of antibiotics. Among the thirty-six species currently described two receive greater emphasis, E. faecalis and E. faecium due to the high frequency of multidrug resistance to antimicrobial agents and their greater involvement in cases of human infections. Several studies have associated the use of growth promoters in production animals to increase the frequency of multidrug resistance in various species of Enterococci. On the exposed, in the present study, 245 strains of E. faecalis isolated from 171 commercial pigs were evaluated for the antimicrobial resistance profile by determining the minimum inhibitory concentration and for the genotypic profile by pulsed field gel electrophoresis. The highest resistance rates were observed against tylosin (98.7 %) and lincomycin (98.7 %), followed by tetracycline (97.1 %), erythromycin (96.7%), streptomycin (96.3%), a combination quinupristin - dalfopristin (95.5 %), kanamycin (93.8 %), gentamicin (85.3 %), ciprofloxacin (76.7 %) and chloramphenicol (71.8%). Strains resistant to vancomycin were not found, and the rate of resistance to daptomycin (0.4 %), nitrofurantoin (1.2%) and tigecycline (1.6%) was low. By pulsed field gel electrophoresis the strains were grouped into 109 pulsotypes, with no groups directly related to the resistance profile. The strains were grouped into higher frequency, according to the animal and farm of origin. In Brazil, the use of avoparcin in swine production was not very intensive, which probably contribute to the low selection of vancomycin-resistant strains, however, resistance to high levels of gentamicin and streptomycin is alarming, and because of the importance of these antimicrobials in treatment of human infections caused by Enterococcus, these resistance levels should be monitored in isolates of animal and environmental origin.

Ertapenem is a carbapenem used to treat a wide range of bacterial infections. What sets ertapenem apart from other carbapenems is its longer half-life which implies it need only be administered once daily. We developed a physiologically-based pharmacokinetic model for the distribution of ertapenem within the body. In the model, parameters such as human body weight and height, age, organ volumes, blood flow rates, and partition coefficients of particular tissues are used to examine the absorption, distribution, metabolism, and excretion of ertapenem. The total and free blood concentrations found were then compared to experimental data. We then examined the sensitivity of the total concentration in the blood to body weight, body height, and age. This analysis allows the possibility of the model being used as a basis for understanding how differing health conditions might alter the concentration of ertapenem in the body and hence dosage may need to be adjusted.