Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2015. / O Brasil possui ampla diversidade de pimentas e pimentões, destacando-se quatro espécies domesticadas: Capsicum annuum, C. baccatum, C. chinense e C. frutescens. Dentre as doenças que acometem esse grupo, a mancha-bacteriana está entre as mais importantes em cultivos a campo aberto. Inicialmente, apenas as espécies X. euvesicatoria e X. gardneri estariam associadas ao gênero Capsicum, porém, recentemente foi constatada a ocorrência de X. perforans na Flórida e X. vesicatoria na Macedônia e na Bulgária associada ao pimentão. Xanthomonas euvesicatoria apresenta especificidade em nível de raças fisiológicas, com 11 raças relatadas até o presente, o que contribui para a dificuldade no controle da doença. O controle químico da mancha-bacteriana tem sido realizado com produtos à base de cobre. Considerando a pouca informação sobre a presença dessas raças em lavouras de Capsicum no Brasil, no presente trabalho foram identificados 76 isolados de Xanthomonas obtidos de amostras de folhas sintomáticas de pimentas coletadas, entre os anos 1982 e 2014, nos estados de Goiás, Ceará, Bahia, Sergipe, Pernambuco, Roraima, Pará, Amazonas, Minas Gerais, Espírito Santo e São Paulo e do Distrito Federal. Para tanto, utilizou-se PCR com iniciadores específicos e a análise comparativa com isolados de referência dos perfis obtidos por BOXPCR. Setenta e um isolados foram identificados como X. euvesicatoria. Quatro isolados, coletados na região Sudeste, foram X. gardneri e um isolado do Ceará foi X. perforans, sendo este o primeiro relato da ocorrência natural dessas espécies em campos de produção de pimentão no país. Os isolados de X. euvesicatoria foram ainda caracterizados quanto à raça pela reação provocada nas linhagens diferenciais quase-isogênicas ECW, ECW-10R, ECW20R e ECW-30R, as três últimas contendo os genes de resistência Bs1, Bs2 e Bs3, respectivamente. A ocorrência da reação de hipersensibilidade (RH) foi observada com 12, 24 e 36 horas após a infiltração, respectivamente para os três genótipos resistentes. Os isolados foram das seguintes raças: 0, 2, 5, 1 ou 7, 3 ou 8, 4 ou 9, 6 ou 10. Isolados das raças 1 ou 7, 3 e 8, 4 e 9 ou 6 e 10 ainda não puderam ser definidos pela não utilização do PI-234047, um acesso de C. pubescens ainda não presente no banco de germoplasma de Capsicum da Embrapa Hortaliças. Avaliou-se também a sensibilidade in vitro de 73 isolados ao cobre. Utilizou-se sulfato de cobre em meio CYE, nas concentrações de 0, 50, 100 e 200 ppm (μg/mL), considerando resistentes os isolados que apresentaram crescimento confluente em três repetições. No controle (ausência de cobre) houve crescimento de 100% dos isolados. Nas concentrações de 50 e 100 μg/mL, 74% e 63% dos isolados foram insensíveis, respectivamente. Apenas sete isolados (10%) foram insensíveis a maior concentração do produto (200 μg/mL). O esclarecimento da frequência de ocorrência de espécies e raças associadas à mancha-bacteriana do pimentão; a elucidação dos níveis de sensibilidade que esses isolados apresentam ao cobre são informações de fundamental importância para a adoção de estratégias de manejo eficientes da mancha-bacteriana das culturas de pimentão e pimentas no país. / Great diversity of peppers and bell peppers is observed in Brazil. Four domesticated species of Capsicum can be highlighted: Capsicum annuum, C. baccatum, C. frutescens and C. chinense. Bacterial spot is one of the most relevant disease of the genera in open field cultivation systems. Up to recently, the only species associated with the genus Capsicum were X. euvesicatoria and X. gardneri. . However, the occurrence of X. perforans was reported in Florida, and of X. vesicatoria in Macedonia and Bulgaria. Xanthomonas euvesicatoria specialized as physiological races, and 11 races have been reported up to date, which contributes to the difficulty of disease control. Chemical control of the disease has been made with copper-based products. Considering the little information about the presence of these races in Capsicum crops in Brazil, in the present study seventy-six Xanthomonas isolates from symptomatic peppers leaf samples were collected between the years 1982 to 2014 in the states of Goiás, Ceará, Bahia, Sergipe, Pernambuco, Roraima, Pará, Amazonas, Minas Gerais, Espírito Santo and São Paulo, as well as in and the Federal District; had their species identified. These isolates were characterized using specific primers and PCR-BOX. Seventyone isolates were identified as X. euvesicatoria. Four isolates collected in the Southeast, were X. gardneri and one isolate of Ceará was X. perforans. In order to determine the races of X. euvesicatoria isolates, near isogenic lines ECW-10R, ECW-30R, ECW-20R and ECW, which contain the resistance genes Bs1, Bs2 and Bs3, respectively, were used. The presence or absence of a hypersensitive response (HR) was observed 12, 24 and 36 hours after inoculation, respectively for the three resistant genotypes. The isolates were of the following races: 0, 2, 5, 7 or 1, 3, 8, 9 or 4, 6 or 10. Isolates of races 1 or 7, 3 and 8, 4 and 9 or 6 and 10 were not yet possible to define not using the PI-234047, since Embrapa Hortaliças does not have C. pubescens in its Capsicum germplasm bank. Copper in vitro sensitivity of 71 isolates was also evaluated. Copper sulfate CYE medium at concentrations of 0, 50, 100 and 200 ppm (μg/mL) was used. Those isolates that showed confluent growth after three repetitions were considered insensitive. One hundred percent of the isolates growed on the check-control (no copper amended to the medium). With concentration of 50 and 100 μg/mL, 74% and 63% of the isolates were insensitive, respectively. Only seven isolates (10%) were insensitive to higher product concentration (200 μg/mL). Insights on the frequency of occurrence of species and races associated with pepper bacterial spot; elucidation of insensitivity levels to copper of the Brazilian isolates are information of fundamental importance for the adoption of efficient management strategies to bacterial spot on Capsicum crops in the country.

Dissertação (mestrado)-Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2010. / Submitted by Fernanda Weschenfelder (nandaweschenfelder@gmail.com) on 2010-11-08T18:47:38Z No. of bitstreams: 1 2010_EdivanioRodriguesdeAraujo.pdf: 980854 bytes, checksum: fe7d2ce245647e86d78739fbcf79b877 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-11-11T00:37:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_EdivanioRodriguesdeAraujo.pdf: 980854 bytes, checksum: fe7d2ce245647e86d78739fbcf79b877 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-11-11T00:37:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_EdivanioRodriguesdeAraujo.pdf: 980854 bytes, checksum: fe7d2ce245647e86d78739fbcf79b877 (MD5) / Dentre as doenças que acometem a tomaticultura nacional, a mancha bacteriana é uma das mais importantes, principalmente para o segmento de processamento industrial. A mancha bacteriana é causada por quatro diferentes espécies do gênero Xanthomonas, a saber, X. euvesicatoria, X. vesicatoria, X. perforans e X. gardneri. Os objetivos desta dissertação foram avaliar o efeito da temperatura sobre componentes da patogenicidade das espécies causadoras da mancha bacteriana; observar a competitividade entre as espécies X. perforans e X. gardneri in vitro e in planta e avaliar a competitividade entre isolados de X. perforans sensíveis e resistentes ao cobre. Para a primeira etapa, isolados representantes das quatro espécies foram inoculados em plantas de tomate de variedade suscetível Yuba (CNPH 851) e submetidos a diferentes temperaturas constantes para posterior quantificação de severidade e período de incubação. Realizaram-se testes para verificação de inibição de crescimento in vitro, o que pode estar relacionado à produção de bacteriocina. Inoculações em casa de vegetação de isolados de X. perforans e X. gardneri foram realizadas para quantificação da doença e observação de competitividade entre ambas. Da mesma maneira, isolados sensíveis e resistentes a cobre foram inoculados conjuntamente no intuito de verificar a ocorrência de competitividade entre estes. Pôde-se observar que tanto a severidade, como o período de incubação, foram influenciados diretamente pela temperatura. Xanthomonas perforans mostrou-se mais agressiva sob temperaturas mais elevadas, enquanto X. gardneri foi favorecida por temperaturas menores. Xanthomonas euvesicatoria foi menos agressiva para todas as temperaturas avaliadas, enquanto X. vesicatoria apresentou uma maior constância para estas temperaturas. As inoculações 2 individuais e conjuntas demonstraram vantagem competitiva de X. perforans para causar doença, bem como uma maior frequência de recuperação, em meio de cultura, de X. perforans em relação a X. gardneri, evidenciando essa vantagem competitiva da espécie. Foi verificada a inibição no crescimento de três isolados brasileiros de X. euvesicatoria por parte de um isolado nacional de X. perforans, provavelmente relacionado com a produção de bacteriocina. Já entre os isolados de X. perforans resistentes e sensíveis a cobre, pôde-se observar, de forma geral, uma maior severidade da doença para os isolados sensíveis, indicando que isolados resistentes podem ter redução de agressividade quando na ausência do seu produto de controle. Este é o primeiro relato de isolados brasileiros de Xanthomonas associados à mancha bacteriana do tomateiro com ação específica de inibição a outros isolados de espécies correlatas, bem como o primeiro estudo sobre o efeito da temperatura sobre este patossistema no Brasil, considerando as quatro diferentes espécies que causam a doença e também a primeira constatação de perda de competitividade de X. perforans associada à aquisição de resistência ao cobre. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Bacterial spot of tomato stands out as one of the main diseases of this crop, especially for the segment of industrial processing. The disease is caused by four different species of the genus Xanthomonas, namely, X. euvesicatoria, X. vesicatoria, X. perforans and X. gardneri. The objectives of this dissertation were to evaluate the effect of temperature on pathogenic components of bacterial spot caused by each species separately, to assess the competitiveness between X. perforans and X. gardneri in vitro and in planta and to compare the fitness of strains of X. perforans sensitive and resistant to copper. In the first assay, isolates representative of all four species were inoculated on tomato plants of susceptible variety Yuba (CNPH 851) and subjected to different constant temperatures for subsequent quantification of disease severity and period of incubation. In vitro competition tests were carried out in order to check for growth inhibition, which may be related to the production of bacteriocin. A greenhouse test, with isolates of X. perforans and X. gardneri was performed to quantify the disease caused by each species, and to compare the competitiveness of the two species, when inoculated simultaneously. Similarly, X. perforans isolates sensitive and resistant to copper were inoculated either isolated or in various combinations in order to verify possible loss of fitness associated with naturally-acquired copper resistance. Both disease severity, as well as the incubation period, were directly influenced by temperature: X. perforans was more aggressive under high temperatures, while X. gardneri showed preference for lower temperatures. X. euvesicatoria was the least aggressive in all temperatures tested, whereas X. vesicatoria aggressiveness was more stable at all temperature tested. The individual and combined 4 inoculations demonstrated fitness advantage of X. perforans over X. gardneri, and also higher frequency of recovery in culture medium of X. perforans, indicating a fitness edge for that species. One single Brazilian isolate of X. perforans was found to inhibit the growth of three Brazilian isolates of X. euvesicatoria, probably related to the production of bacteriocin. Among X. perforans isolates resistant and sensitive to copper, greater disease severity was associated with sensitivity to copper, indicating that resistant isolates may have reduced aggressiveness when in the absence of Cu. This is the first account of Brazilian strains of Xanthomonas associated with bacterial spot of tomato with the specific action of inhibiting other strains of related species, the first study on the effect of temperature on this disease in Brazil, considering that four different species cause disease. This was the first report that reduced fitness of X. perforans associated with the acquisition of copper resistance.

A mancha bacteriana, doença causada por Xanthomonas campestres pv. passiflorae, apresenta-se como uma das mais importantes doenças do maracujazeiro, podendo limitar a produção dessa frutífera em algumas regiões do País. O uso de resistência genética e controle químico, juntamente com o emprego de medidas de exclusão, são as práticas de controle da doença mais recomendadas. Cinqüenta isolados patogênicos de Xanthomonas campestres pv. passiflorae, coletados em áreas produtoras de maracujá, foram genotipados com marcadores do tipo RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) afim de se estabelecer o grau de similaridade genética entre eles. Os resultados indicaram que todos os isolados diferiram entre si. Não foi encontrado nenhum isolado idêntico. A análise de agrupamento separou os isolados em 11 diferentes grupos, considerando 90% como valor limite de similaridade genética. Houve um alto grau de variabilidade genética entre os isolados, com valores de 82 a 95%, não havendo contudo correlação aparente entre origens geográficas e similaridade genética. Isso pode ser uma indicativa de que populações de X. c. pv. passiflorae são compostas por um mosaico de genótipos. Em adição, isolados geneticamente distintos foram isolados de uma mesma planta, indicando a possibilidade de infecções múltiplas. Com base no dendrograma, os cinco isolados mais divergentes foram selecionados para ensaios de inoculação em plantas de maracujá. Os resultados indicaram a existência de variação em níveis de agressividade entre isolados, verificado pela variação significativa da porcentagem de área lesionada, que variou de 3,086 a 31,825 cm2. Este é o primeiro relato da variação de patogenicidade desta espécie de Xantomhonas e esses resultados mostraram a importância de se considerar o genótipo bacteriano na seleção de variedades resistentes. Doze isolados foram testados quanto a sua sensibilidade in vitro a cobre e aos antibióticos streptomicina e oxitetraciclina. Os isolados de X. c. pv. passiflorae apresentaram pouca variação em relação a sensibilidade a cobre quando cultivadas na presença de 100ppm deste elemento. Apesar disto, todos os isolados tiveram seu crescimento reduzido acima de 80% nesta concentração. Nenhuma correlação foi encontrada entre as diferenças na sensibilidade e a origem geográfica dos isolados. Em geral, os mesmos resultados foram encontrados no teste com antibióticos. Algumas diferenças foram encontradas a 1.200 ppm e 2.400 ppm do produto comercial Agrimicina, todos os isolados tiveram seu crescimento reduzido a níveis de 96% a 1.200 ppm e acima de 98% a 2.400. Estes resultados indicam níveis de sensibilidade normal dos isolados coletados e reforçam a importância desses produtos como agentes de controle de X. c. pv. passiflorae. / The disease bacterial spot, caused by Xanthomonas campestris pv. passiflorae, is one of the most important disease of passion-fruit, which can limit its production in some regions of Brazil. The use of genetic resistance and chemical control, as well as the adoption of exclusion measures are the more recommended practices for the control of this disease. Fifty pathogenic isolates of Xanthomonas campestris pv. passiflorae, collected from production areas, were genotyped with RAPD markers (Random Amplified Polymorphic DNA) in order to establish the degree of their genetic similarities. The results indicated that all the isolates differed from each other, i.e., no identical isolates were found. Clustering analysis grouped the isolates in 11 clusters considering 90% of similarity as the threshold value. There was a high degree of genetic variability among isolates, which varied from 82 to 95%, and no apparent correlation between their geographical origin and their clustering pattern, indicating that populations of Xanthomonas campestris pv passiflora are composed of a mosaic of genotypes. In addition, distinct isolates were found in the same plant, indicating the possibility of multiple infection. Based on the dendrogram, the five more divergent isolates were selected for inoculation trials in Passiflora edulis f. flavicarpa plants. The results showed a variation in the agressivness, as indicated by significant variation in the percentage of lesioned area, which ranged from 3,086 to 31,825 cm2. This is the first report of variation in pathogenicity in X. c. passiflora and the results highlights the importance of considering the genotype of the bacterium during the selection of resistant varieties. Five isolates were tested for their in vitro sensitivity to copper and the antibiotics streptomycin and oxytetracyclin. X. c. pv. passiflorae isolates varied slightly regarding their sensitivity to copper when grown in the presence of 100 ppm of this element. Notwithstanding, all isolates had their growth reduced to levels above 80% at this concentration. No correlation was found between the differences in sensitivity and the geographic origin of the isolates. In general, the same results were found in the screening with antibiotics. Albeit some differences were found at 1.200 and 2.400 ppm of the commercial product Agrimicin, all isolates had their growth reduced to levels above 96% at 1.200 ppm and above 98% at 2.400. These results indicate normal sensitivity levels of the bacterium collected from these areas and reinforce the importance of these chemicals as control agents of X. c. pv. passiflorae.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-04-26T17:14:04Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1563780 bytes, checksum: 6d7bfb0f3753694df6bc43773053fdf8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-26T17:14:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1563780 bytes, checksum: 6d7bfb0f3753694df6bc43773053fdf8 (MD5) Previous issue date: 2003-11-06 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Estudou-se a etiologia da mancha bacteriana do eucalipto a partir de amostras de folhas de plantas, coletadas em condições de viveiro e campo nos Estados do Rio Grande do Sul, São Paulo, Minas Gerais, Bahia, Mato Grosso do Sul, Amapá e Pará. Os sintomas da doença são caracterizados por anasarca, lesões internervurais no limbo, perfurações no centro das lesões, lesões no pecíolo e nos ramos, concentração de lesões ao longo da nervura principal e lesões lineares nas bordas e no ápice da folha. Identificaram-se vinte e cinco isolados incitadores de reação de hipersensibilidade (HR) em plantas não-hospedeiras e patogênicos a Eucalyptus spp., quando inoculados nas folhas por injeção. Baseado em testes bioquímicos, utilização de fontes de carbono (MicroLog BIOLOG), análise filogenética de rDNA16S e perfil de ácidos graxos, identificaram-se dez isolados de Xanthomonas axonopodis, quatro de X. campestris, quatro de Pseudomonas syringae, dois de Pseudomonas putida, dois de Pseudomonas cichorii, dois de Rhizobium sp. e um de Erwinia sp. Apenas os isolados de P. syringae e Erwinia sp. não foram patogênicos a Eucalyptus spp. quando inoculados, por atomização de suspensão de inóculo (10 8 ufc/mL), em mudas. Tendo em vista a maior freqüência de isolados de X. axonopodis, avaliou-se sua gama de hospedeiros por meio de inoculações por atomização de inóculo (10 8 ufc/mL) em mudas de espécies ou clones pertencentes às seguintes famílias botânicas: Myrtaceae (Corymbia maculata, Eugenia jambolana, E. camaldulensis, E. cloeziana, E. grandis, E. robusta, E. saligna, E. urophylla, E. urophylla x E. maidenii, E. globulus, Myrciaria jaboticaba e Psidium guajava), Caricaceae (Carica papaya), Fabaceae (Phaseolus vulgaris e Pisum sativum), Rosaceae (Prunus persicae), Rutaceae (Citrus limon) e Solanaceae (Lycopersicon esculentum). Apenas as plantas da família Myrtaceae foram suscetíveis, e dentre essas, apenas espécies de Corymbia e Eucalyptus apresentaram sintomas. A freqüência de plantas com sintomas variou com a espécie, sendo que E. cloeziana e o clone de E. urophylla x E. maidenii foram os materiais mais suscetíveis. Para embasar a quantificação da doença em eucalipto, desenvolveu-se uma escala diagramática contendo oito níveis de severidade. Na validação da escala por três grupos de avaliadores inexperientes, concluiu-se que não houve acurácia nas estimativas com ou sem a escala, mas houve tendência de maior precisão para avaliadores com a escala sem treinamento prévio. / The etiology of Eucalyptus bacterial leaf blight was studied on plants in nurseries and plantations in the states of Rio Grande do Sul, São Paulo, Minas Gerais, Bahia, Mato Grosso do Sul, Amapá and Pará. The disease is characterized by water soaked, angular and interveinal spots on the leaf limb followed by shot holes and lesions in petioles and branches. The lesions can be found along the main vein, at the leave edge and at the upper portion of the limb. Of the several isolates obtained during isolations, 25 induced hypersensitive reaction in non-host plants, and were pathogenic to Eucalyptus spp.. Identification of these isolates by biochemical tests using carbon sources (MicroLog BIOLOG), filogenetic analysis of rDNA16S and FAME profile, revealed that 10 isolates belonged to Xanthomonas axonopodis, four each to X. campestris and Pseudomonas syringae, two each to P. putida, P. cichorii, and Rhizobium sp., and one to Erwinia sp.. When the Eucalyptus seedlings were inoculated by spraying the bacterial suspension (10 8 ufc/ml) of any isolate, only P. syringae e Erwinia sp. did not produce typical disease symptoms. Because of the higher frequency of X. axonopodis isolates, it was evaluated for its host range. Plants from the botanical families Myrtaceae (Corymbia maculata, Eugenia jambolana, E. camaldulensis, E. cloeziana, E. grandis, E. robusta, E. saligna, E. urophylla, E. urophylla x E. maidenii, E. globulus, Myrciaria jaboticaba and Psidium guajava), Caricaceae (Carica papaya), Fabaceae (Phaseolus vulgaris and Pisum sativum), Rosaceae (Prunus persicae), Rutaceae (Citrus limon) and Solanaceae (Lycopersicon esculentum) were spray inoculated with the bacterial suspension (10 8 ufc/ml). Only plants of Myrtaceae family showed susceptibility, but the symptoms developed only seedlings of Eucalyptus and Corymbia. The frequency of symptomatic plants varied among the species with E. urophylla x E. maidenii clones and E. cloeziana being the more susceptible hosts. A diagrammatic scale of eight disease severity levels was developed for disease quantification on eucalyptus leaves. The validation of the scale by three groups of inexperienced evaluators showed that although there was no accuracy in disease estimation with or without the scale, the group of untrained evaluators using the scale had higher precision. / Tese importada do Alexandria

Com o objetivo de verificar a ocorrência de bactérias fitopatogênicas em plantas de arroz, bactérias fluorescentes (Bf1, Bf2, Bf3) foram isoladas de sementes em meio B de King semi-seletivo. Os isolados que induziram reação de hipersensibilidade em fume foram inoculados em arroz. Nas folhas e colmos de arroz, os isolados induziram lesões necróticas, de coloraçao cinza, alongadas, com bordas de cor castanha-escura. O efeito destes isolados bacterianos em plantas de sete cultivares de arroz foi testado através da inoculação de colmos e folhas, 21 dias apos a emergência, em casa-de-vegetação. Independente da cultivar ou do ponto da inoculação, todos os isolados induziram a formação de lesões. Baseado no comprimento de lesão e percentagem de plantas com sintomas, o isolado Bf1 foi considerado o mais virulento. Não houve diferença nas reações entre as cultivares. A campo, oito cultivares de arroz foram semeadas em outubro e dezembro de 1992. A inoculação do colma com suspensão bacteriana (isolado Bf1) aumentou espiguetas estéreis e manchas nas glumas, reduziu poder germinativo, peso de mil sementes e numero de grãos inteiros. Plantas das cultivares BR-IRGA 414 e El Paso 144 apresentaram maior grau de manchamento das glumas do que as plantas das cultivares El Paso 48 e Bluebelle, quando colhidas das parcelas semeadas em outubro. / In order to verify the occurrence of phytopathogenic bacteria in rice plants, fluorescent bacteria (Bf1, Bf2, Bf3) were isolated from seeds in semiselective King'B medium. Isolates that induced tobacco hypersensitivity reaction were inoculated in rice. In rice leaves and stems, the isolates caused elongated gray blotches and necrosis lesions sourrounded by an brownish-black border. The effect of this bacterial isolates in plants of seven rice cultivars was tested through the stems and leaves inoculation, 21 days after the emergence, in greenhouse. Regardless of cultivar or inoculation site, all isolates induced lesions formation. Based on lesion lenght and percentage of plants with symptoms, the isolate Bfl was considered the most virulent. No differences of reaction were found among cultivars. In the field, eight rice cuI ti vars were sowed in October and December, 1992. Stem inoculation with bacterial suspension (isolate Bf1) increased sterile spike lets and blotch on the glumes, decreased seed viability, lOOO-seed weight and number of whole grains. Plants of the cultivars BR-IRGA 414 and El Paso 144 showed higher blotching grade of glumes than plants of the cultivars El Paso 48 and Bluebelle, when harvested from plots sowed in October.

Com o objetivo de verificar a ocorrência de bactérias fitopatogênicas em plantas de arroz, bactérias fluorescentes (Bf1, Bf2, Bf3) foram isoladas de sementes em meio B de King semi-seletivo. Os isolados que induziram reação de hipersensibilidade em fume foram inoculados em arroz. Nas folhas e colmos de arroz, os isolados induziram lesões necróticas, de coloraçao cinza, alongadas, com bordas de cor castanha-escura. O efeito destes isolados bacterianos em plantas de sete cultivares de arroz foi testado através da inoculação de colmos e folhas, 21 dias apos a emergência, em casa-de-vegetação. Independente da cultivar ou do ponto da inoculação, todos os isolados induziram a formação de lesões. Baseado no comprimento de lesão e percentagem de plantas com sintomas, o isolado Bf1 foi considerado o mais virulento. Não houve diferença nas reações entre as cultivares. A campo, oito cultivares de arroz foram semeadas em outubro e dezembro de 1992. A inoculação do colma com suspensão bacteriana (isolado Bf1) aumentou espiguetas estéreis e manchas nas glumas, reduziu poder germinativo, peso de mil sementes e numero de grãos inteiros. Plantas das cultivares BR-IRGA 414 e El Paso 144 apresentaram maior grau de manchamento das glumas do que as plantas das cultivares El Paso 48 e Bluebelle, quando colhidas das parcelas semeadas em outubro. / In order to verify the occurrence of phytopathogenic bacteria in rice plants, fluorescent bacteria (Bf1, Bf2, Bf3) were isolated from seeds in semiselective King'B medium. Isolates that induced tobacco hypersensitivity reaction were inoculated in rice. In rice leaves and stems, the isolates caused elongated gray blotches and necrosis lesions sourrounded by an brownish-black border. The effect of this bacterial isolates in plants of seven rice cultivars was tested through the stems and leaves inoculation, 21 days after the emergence, in greenhouse. Regardless of cultivar or inoculation site, all isolates induced lesions formation. Based on lesion lenght and percentage of plants with symptoms, the isolate Bfl was considered the most virulent. No differences of reaction were found among cultivars. In the field, eight rice cuI ti vars were sowed in October and December, 1992. Stem inoculation with bacterial suspension (isolate Bf1) increased sterile spike lets and blotch on the glumes, decreased seed viability, lOOO-seed weight and number of whole grains. Plants of the cultivars BR-IRGA 414 and El Paso 144 showed higher blotching grade of glumes than plants of the cultivars El Paso 48 and Bluebelle, when harvested from plots sowed in October.

Com o objetivo de verificar a ocorrência de bactérias fitopatogênicas em plantas de arroz, bactérias fluorescentes (Bf1, Bf2, Bf3) foram isoladas de sementes em meio B de King semi-seletivo. Os isolados que induziram reação de hipersensibilidade em fume foram inoculados em arroz. Nas folhas e colmos de arroz, os isolados induziram lesões necróticas, de coloraçao cinza, alongadas, com bordas de cor castanha-escura. O efeito destes isolados bacterianos em plantas de sete cultivares de arroz foi testado através da inoculação de colmos e folhas, 21 dias apos a emergência, em casa-de-vegetação. Independente da cultivar ou do ponto da inoculação, todos os isolados induziram a formação de lesões. Baseado no comprimento de lesão e percentagem de plantas com sintomas, o isolado Bf1 foi considerado o mais virulento. Não houve diferença nas reações entre as cultivares. A campo, oito cultivares de arroz foram semeadas em outubro e dezembro de 1992. A inoculação do colma com suspensão bacteriana (isolado Bf1) aumentou espiguetas estéreis e manchas nas glumas, reduziu poder germinativo, peso de mil sementes e numero de grãos inteiros. Plantas das cultivares BR-IRGA 414 e El Paso 144 apresentaram maior grau de manchamento das glumas do que as plantas das cultivares El Paso 48 e Bluebelle, quando colhidas das parcelas semeadas em outubro. / In order to verify the occurrence of phytopathogenic bacteria in rice plants, fluorescent bacteria (Bf1, Bf2, Bf3) were isolated from seeds in semiselective King'B medium. Isolates that induced tobacco hypersensitivity reaction were inoculated in rice. In rice leaves and stems, the isolates caused elongated gray blotches and necrosis lesions sourrounded by an brownish-black border. The effect of this bacterial isolates in plants of seven rice cultivars was tested through the stems and leaves inoculation, 21 days after the emergence, in greenhouse. Regardless of cultivar or inoculation site, all isolates induced lesions formation. Based on lesion lenght and percentage of plants with symptoms, the isolate Bfl was considered the most virulent. No differences of reaction were found among cultivars. In the field, eight rice cuI ti vars were sowed in October and December, 1992. Stem inoculation with bacterial suspension (isolate Bf1) increased sterile spike lets and blotch on the glumes, decreased seed viability, lOOO-seed weight and number of whole grains. Plants of the cultivars BR-IRGA 414 and El Paso 144 showed higher blotching grade of glumes than plants of the cultivars El Paso 48 and Bluebelle, when harvested from plots sowed in October.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:53Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-01-13Bitstream added on 2014-06-13T20:04:34Z : No. of bitstreams: 1 jaciani_fj_dr_jabo.pdf: 1617312 bytes, checksum: 98bec775500aab00ebca7cf99caade23 (MD5) / Um dos objetivos do presente estudo foi avaliar a diversidade genética de isolados brasileiros de X. citri subsp. citri (Xcc) com base em genes efetores do Sistema de Secreção Tipo III (avrXacE1, avrXacE2, avrXacE3, avrBs2, hpaF, XAC3090 e pthA4). Um total de 49 haplótipos foi identificado entre os 157 isolados analisados por “Southern blot”, e o maior polimorfismo genético observado nas análises com a sonda PthA4. Esses efetores estão amplamente distribuídos na população do patógeno e podem ser úteis para uma melhor compreensão da interação patógeno-hospedeiro. Outro objetivo desse trabalho foi a caracterização patogênica e genética de isolados de X. fuscans subsp. aurantifolii tipos B e C (Xfa-B e Xfa-C). Observou-se pequena agressividade dos isolados de Xfa-B e grande variação na patogenicidade de Xfa-C. Os isolados de Xfa-C produtores de pigmento escuro em meio de cultura foram menos agressivos que os isolados não produtores. Alguns isolados de Xfa-C foram patogênicos também a limões, limas ácidas, citrumelo ‘Swingle’ e tangerinas. Os isolados de Xfa-B e Xfa-C foram diferenciados pelas técnicas de AFLP, BOX e ERIC-PCR, com relativa diversidade entre isolados do mesmo patótipo, e análises da sequência do gene gyrB revelaram alta similaridade desses isolados com espécies de Xanthomonas patogênicas a outros hospedeiros (X. fuscans subsp. fuscans e X. axonopodis pvs. anacardii, dieffenbachiae, rhynchosiae, sesbaniae e vignicola). No presente estudo também foi descrito o primeiro relato de X. alfalfae (Xa) no Brasil. Os isolados investigados demonstraram limitada patogenicidade e agruparam-se geneticamente com X. alfalfae subsps. alfalfae e citrumelonis e X. axonopodis pvs. allii, cassiae, desmodii, patelii e ricini / In the present study, as one of the objectives, is showed the genetic diversity of Brazilian strains of X. citri subsp. citri (Xcc) based on effector genes of the Type III Secretion System (avrXacE1, avrXacE2, avrXacE3, avrBs2, hpaF, XAC3090 e pthA4). A total of 49 haplotypes were identified from 157 Xcc strains by Southern blot analysis using the cited genes as DNA probes. The highest polymorphism was observed with the PthA4. Those bacterium genes are extensively present in the Xcc population and can be used to a better comprehension of the Xcc-plant interaction. As a second objective, we present the genetic and pathogenic characterization of X. fuscans subsp. aurantifolii types B and C strains (Xfa-B e Xfa-C). In the pathogenic testes carried out Xfa-B presented a very limited pathogenicity, weaker than Xfa-C. Strains of this last pathotype presented a relatively high degree of pathogenicity variation, and those Xfa-C strains producers of dark pigment on culture medium were less pathogen than those not producers. Also some Xfa-C strains are pathogens to limes, lemons, Swingle citrumelo, and mandarins. Strains of Xfa-B and C were clearly differentiated by the molecular techniques AFLP, BOX and ERIC-PCR. Sequences of the gyrB gene revealed a high similarity of Xfa strains and other pathovars of Xanthomonas not pathogens of citrus. Finally, we presented the first detection of X. alfalfa (Xa) in Brazil, detected on a single Swingle citrumelo tree in São Paulo state. The Brazilian Xa strains showed a very limited pathogenicty, similar of a X. alfalfa subsp. citrumelonis

Orientador: Jesus Aparecido Ferro / Coorientador: José Belasque Júnior / Banca: Rui Pereira Leite / Banca: Nelson Arno Wulff / Banca: Manoel Victor Franco Lemos / Banca: Jackson Antônio Marcondes de Souza / Resumo: Um dos objetivos do presente estudo foi avaliar a diversidade genética de isolados brasileiros de X. citri subsp. citri (Xcc) com base em genes efetores do Sistema de Secreção Tipo III (avrXacE1, avrXacE2, avrXacE3, avrBs2, hpaF, XAC3090 e pthA4). Um total de 49 haplótipos foi identificado entre os 157 isolados analisados por "Southern blot", e o maior polimorfismo genético observado nas análises com a sonda PthA4. Esses efetores estão amplamente distribuídos na população do patógeno e podem ser úteis para uma melhor compreensão da interação patógeno-hospedeiro. Outro objetivo desse trabalho foi a caracterização patogênica e genética de isolados de X. fuscans subsp. aurantifolii tipos B e C (Xfa-B e Xfa-C). Observou-se pequena agressividade dos isolados de Xfa-B e grande variação na patogenicidade de Xfa-C. Os isolados de Xfa-C produtores de pigmento escuro em meio de cultura foram menos agressivos que os isolados não produtores. Alguns isolados de Xfa-C foram patogênicos também a limões, limas ácidas, citrumelo 'Swingle' e tangerinas. Os isolados de Xfa-B e Xfa-C foram diferenciados pelas técnicas de AFLP, BOX e ERIC-PCR, com relativa diversidade entre isolados do mesmo patótipo, e análises da sequência do gene gyrB revelaram alta similaridade desses isolados com espécies de Xanthomonas patogênicas a outros hospedeiros (X. fuscans subsp. fuscans e X. axonopodis pvs. anacardii, dieffenbachiae, rhynchosiae, sesbaniae e vignicola). No presente estudo também foi descrito o primeiro relato de X. alfalfae (Xa) no Brasil. Os isolados investigados demonstraram limitada patogenicidade e agruparam-se geneticamente com X. alfalfae subsps. alfalfae e citrumelonis e X. axonopodis pvs. allii, cassiae, desmodii, patelii e ricini / Abstract: In the present study, as one of the objectives, is showed the genetic diversity of Brazilian strains of X. citri subsp. citri (Xcc) based on effector genes of the Type III Secretion System (avrXacE1, avrXacE2, avrXacE3, avrBs2, hpaF, XAC3090 e pthA4). A total of 49 haplotypes were identified from 157 Xcc strains by Southern blot analysis using the cited genes as DNA probes. The highest polymorphism was observed with the PthA4. Those bacterium genes are extensively present in the Xcc population and can be used to a better comprehension of the Xcc-plant interaction. As a second objective, we present the genetic and pathogenic characterization of X. fuscans subsp. aurantifolii types B and C strains (Xfa-B e Xfa-C). In the pathogenic testes carried out Xfa-B presented a very limited pathogenicity, weaker than Xfa-C. Strains of this last pathotype presented a relatively high degree of pathogenicity variation, and those Xfa-C strains producers of dark pigment on culture medium were less pathogen than those not producers. Also some Xfa-C strains are pathogens to limes, lemons, Swingle citrumelo, and mandarins. Strains of Xfa-B and C were clearly differentiated by the molecular techniques AFLP, BOX and ERIC-PCR. Sequences of the gyrB gene revealed a high similarity of Xfa strains and other pathovars of Xanthomonas not pathogens of citrus. Finally, we presented the first detection of X. alfalfa (Xa) in Brazil, detected on a single Swingle citrumelo tree in São Paulo state. The Brazilian Xa strains showed a very limited pathogenicty, similar of a X. alfalfa subsp. citrumelonis / Doutor

Made available in DSpace on 2014-07-29T14:52:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 abadia tese.pdf: 6055071 bytes, checksum: 41810223bb4492258f77c027a3385652 (MD5) Previous issue date: 2009-02-17 / The search of alternative products for tomato bacterial spot has been promoting by the lack of effectiveness registered by the traditional products available. The objective of this work was to evaluate a range of chemical products by in vitro tests, in experiments seedlings and field experiments. The products studied were: acibenzolar-S-methyl; benzalkonium chloride; phosphite; copper hydroxide, copper oxicloreto; metiram + pyraclostrobin and famoxadone + mancozebe. The in vitro tests were carried out at Embrapa Hortaliça, Brasília-DF, in July of 2007. The bactericide action was evaluated on Xanthomonas perforans and X. gardneri. The trial was in a complete randomized block design with four replications and plot was constituted by a Petri plate impregnated with solidified bacterial suspension. The halo of inhibition formed was evaluated. The experiments with seedlings were carried out with the hybrid Heinz 9553 at the commercial nursery VIVATI in Rio Verde, Goiás, in August to September and November to December of 2008. There were three trials in a complete randomized block design with three replications. The products were sprayed by using CO2 portable sprayer. The inoculation occurred 29 days after sowing, with an isolated of X. gardneri. Disease severity was evaluated on 15 leaflets per plot at 14 and 16 days after inoculation of the first and second experiment, respectively. Data was expressed as percentage of leaf affected by program Quant. It was also suggested a possible interaction between the regulator of growth paclobutrazol and the behavior of certain products in the reduction of the severity of the disease. Two field trials were carried out at the experimental farm of Unilever Bestfoods, in Goiânia-GO, from February to June of 2007 and April to August of 2008. The first was with the hybrid Heinz 9992 in a complete randomized block design, with 15 treatments and three replications, and inoculated with X. perforans. The second was in a split plot completely randobized block design with three replications. Variety (Hypeel 108 and U2006) was ascertained for factor A and the 10 treatments for factor B. Xanthomonas perforans and X. gardneri were inoculated in different moments. In both trials foliage severity, number of fruits with symptoms and yield were evaluated. In the second trial fruits with sun scald was also taken. In the in vitro test, the products to which X. perforans and X. gardneri were sensitive in the recommended dose were the benzalkonium chloride and famoxadone + mancozeb. Methiram + pyraclostrobin had action in the dosage recommended only for X. gardneri. Xanthomonas perforans was sensitive to this product only starting from ten times more. The products of copper base did not have action in the bacteria at the recommended dose, being sensitive only at a hundred time more. For the trials of seedlings it was noticed that metiram + pyraclostrobin, copper oxicloreto, famoxadone + mancozebe, phosphite and copper hydroxide reduced the severity under certain conditions. In the field trials, in generally, acibenzolar-S-methyl and famoxadone + mancozeb lead to the better results. / A pouca disponibilidade de produtos eficazes tem propiciado a busca por alternativas de controle da mancha bacteriana do tomateiro. Sendo assim, este trabalho teve como objetivo avaliar uma gama de produtos químicos em testes in vitro, experimentos com mudas e em experimentos de campo. Foram estudados: acibenzolar-S-metil; cloretos de benzalcônio; fosfitos; hidróxido de cobre, oxicloreto de cobre; metiram + piraclostrobina e famoxadona + mancozebe. Os testes in vitro foram conduzidos na Embrapa Hortaliças, Brasília-DF, em julho de 2007. A ação bactericida dos produtos foi avaliada sobre Xanthomonas perforans e X. gardneri. O ensaio foi em blocos casualizados com quatro repetições e a parcela foi constituída por uma placa de Petri impregnada com suspensão bacteriana solidificada. Avaliou-se o halo de inibição formado. Os experimentos de mudas foram conduzidos com o híbrido Heinz 9553 no viveiro comercial VIVATI em Rio Verde GO, de agosto a setembro e de novembro a dezembro de 2008. Foram três ensaios inteiramente casualizados com três repetições. Os tratamentos (produtos) foram pulverizados na parte aérea utilizando pulverizador costal de barra. A inoculação foi aos 29 dias após a semeadura, com um isolado de X. gardneri. Avaliou-se a severidade da doença em 15 folíolos por parcela aos 14 e 16 dias após a inoculação do primeiro e segundo experimento, respectivamente. Esta foi expressa em porcentagem de área foliar atacada processada pelo programa Quant. É sugerido uma possível interação entre o regulador de crescimento paclobutrazol e o comportamento de certos produtos na redução da severidade da doença. Dois ensaios de campo foram conduzidos na área experimental da Unilever Bestfoods, em Goiânia-GO, de fevereiro a junho de 2007 e de abril a agosto de 2008. O primeiro foi com o híbrido Heinz 9992 em delineamento experimental blocos casualizados, com 15 tratamentos e três repetições. Inoculou-se X. perforans. Já o segundo ensaio foi fatorial em parcelas subdivididas em blocos ao acaso e três repetições. O fator A foi hídrido (Hypeel 108 e U2006) e o fator B (tratamentos). Inoculou-se X. perforans e X. gardneri em momentos distintos. Em ambos ensaios foram avaliados severidade foliar, número de frutos com sintomas e produtividade. No segundo ensaio tomou-se também número de frutos com escaldadura. No teste in vitro os produtos aos quais X. perforans e X. gardneri foram sensíveis na dose recomendada foram os cloretos de benzalcônio e a famoxadona + mancozebe. Metiram + piraclostrobina tiveram ação na dosagem recomendada somente para X. gardneri. Xanthomonas perforans foi sensível ao produto somente a partir de dez vezes maior a dosagem recomendada. Os produtos à base de cobre não tiveram ação nas bactérias na dosagem recomendada, sendo sensíveis apenas na dose cem vezes maior a dosagem recomendada. Em mudas metiram + piraclostrobina, oxicloreto de cobre, famoxadona + mancozebe, fosfito e hidróxido de cobre reduziram a severidade em mudas no ensaio realizado em agosto. Em campo, notou-se que, de maneira geral acibenzolar-S-metil e famozadona + mancozebe estão entre os melhores resultados.