Dans une économie mondialisée sur un secteur très concurrentiel, ce travail de recherche articulé en cinq parties propose d’étudier de nouveaux schémas de concurrence entre médicaments princeps et génériques au sein de l’Union Européenne, en intégrant les articulations entre régulation publique et incitations à innover. Dans une première partie introductive, les spécificités réglementaires très évolutives des marchés pharmaceutiques sont présentées ainsi que leurs conséquences induites sur les systèmes de prix et l'innovation.La deuxième partie, vise à analyser dans un premier temps l'approche adoptée par la Commission Européenne et les autorités de concurrence des divers Etats membres quant à la définition du marché pertinent de produits sur ces marchés. Plus particulièrement, dans un second temps, une étude empirique des schémas de substitution existants est développée à partir des décisions prises par la Commission Européenne de 1989 à 2011 en matière de fusions dans le secteur concerné. Cet examen des différents critères retenus pour définir la taille du marché pertinent souligne la tendance lourde à définir des marchés pertinents de produits toujours plus étroits, atteignant même le niveau moléculaire.Dans la troisième partie, l’analyse du système de prix de référence mis en place dans de nombreux Etats membres sur ces marchés concurrentiels, montre,en prenant en compte les avantages informatifs des princeps, dans quelle mesure la mise en place d'un tel système, peut favoriser l’innovation.Sous la quatrième partie, la modélisation de l'impact des nouveaux modèles d'accords de partage de risques se propose d’étudier comment de tels accords peuvent résoudre les problématiques d'aléa moral et de sélection adverse sur ces marchés, en incitant les entreprises à investir dans leur produit et à renforcer la qualité des biens fournis.Enfin, la partie cinq conclut le travail en mettant en perspective les résultats obtenus et en analysant les conséquences sous-jacentes pour les politiques publiques. / The aim of this thesis is to examine the competition patterns that exist between originators and generics by focusing on the articulations between regulation and incentives to innovate. Once the characteristics of regulation in pharmaceutical markets is reviewed in the first chapter and an analysis of some current challenges related to cost-containment measures and innovation issues is performed, then in the second chapter, an empirical study is performed to investigate substitution patterns. Based on the EC´s merger decisions in the pharmaceutical sector from 1989 to 2011, this study stresses the key criteria to define the scope of the relevant product market based on substitution patterns and shows the trend towards a narrower market in time. Chapters three and four aim to analyse in depth two widespread measures, the internal reference pricing system in off-patent markets, and risk-sharing schemes in patent-protected markets. By taking into account informational advantages of originators over generics, the third chapter shows the extent to which the implementation of a reference price for off-patent markets can contribute in promoting innovation. Finally, in the fourth chapter, the modeling of risk-sharing schemes explains how such schemes can help in solving moral hazard and adverse selection issues by continuously giving pharmaceutical companies incentives to innovate and supplying medicinal products of a higher quality.

La thèse démontre que l'environnement protectionniste en Inde a contribué à bâtir une industrie pharmaceutique solide. L'arrivée simultanée de l'Accord ADPIC et de la libéralisation économique a créé des « push factors » à la fois compétitifs et favorables, obligeant les firmes pharmaceutiques indiennes (FPI) à chercher de nouvelles voies de croissance à l’étranger. Les politiques des pays africains en faveur des génériques, l’action des organisations internationales et la nouvelle gouvernance des marchés financés par les bailleurs de fonds ont aussi induits des « pull factors » permettant aux FPI de s'engager davantage sur ces marchés. Cette thèse montre à travers le cas du Mali que le marché en Afrique de l’Ouest francophone est divisé en quatre segments – le marché public financé par l'État et par des donateurs et le marché privé formel et informel – avec des réglementations différentes. Les FPI n'utilisent que l'exportation dans ces pays, mais leurs organisations varient selon le segment dans lequel elles souhaitent opérer. Enfin, ce travail utilise l’étude du Synriam, un nouvel antipaludéen pour montrer que Ranbaxy a utilisé le partenariat avec Medicines for Malaria Venture pour développer ses capacités, accéder à de nouveaux marchés et gagner en légitimité. Cette étude met en évidence que les organisations internationales peuvent créer des barrières institutionnelles et influencer les stratégies d'entrée des firmes. En conclusion, cette thèse illustre la richesse et la complexité du marché pharmaceutique africain et démontre également que les stratégies d'entrée sur le marché et d'exploitation des FPI sont influencées par l'environnement institutionnel sous-jacent. / This dissertation first shows that the early protectionist environment in India helped build a robust indigenous pharmaceutical industry. The simultaneous arrival of TRIPS and economic liberalization created both competitive and supportive push factors forcing Indian firms to look for new avenues of growth beyond national boundaries. Generic supporting policies of African countries, the action of international organizations and the new governance of donor-funded markets also acted as pull factors for Indian firms to engage in these markets.Next, taking the case of Mali, the thesis shows that the pharmaceutical market in Francophone West African countries is divided into four specific segments – government and donor-funded public and formal and informal private markets – with different regulatory characteristics. Indian firms are using only export to operate in these countries, but the organization of export varies according to the segment in which a firm intends to operate. Lastly, it takes the case of Synriam, a new antimalarial to show that Ranbaxy used the partnership with Medicines for Malaria Venture for developing capabilities, accessing new markets and gaining legitimacy. The case also reflects that international organizations may create institutional barriers and influence the market entry strategy of firms. To conclude, this thesis illustrates the richness and complexities of the African pharmaceutical market and shows that market entry and operation strategies of Indian firms are influenced by the underlying institutional environment.