Th.--Sci. nat.--Lille 1, 1979. N°: 458. / Contient des articles.

Th.--Sci. nat.--Nancy--I.N.P.L., 1977.

Thèse doctorat : Sciences : Strasbourg 1 : 2006. Thèse doctorat : Sciences : Tokyo - Japon : 2006. / Thèse soutenue en co-tutelle. Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. 13 p.. Index.

Les rétinol déshydrogénases ou RDHs sont des oxydoréductases inhérentes à l’accomplissement de la fonction visuelle de la rétine. Elles sont en effet impliquées dans le cycle visuel rétinien. Suite à l’absorption de la lumière par le pigment visuel des photorécepteurs, la rhodopsine, la RDH8 est la première enzyme qui va intervenir dans le cycle visuel après la libération du chromophore de la rhodopsine, le tout-trans rétinal. Ainsi, la RDH8 détoxifie les photorécepteurs car le tout-trans rétinal est une espèce très réactive qui peut induire des dommages à la rétine. La RDH11, quant à elle, agit de concert avec la RDH5 au niveau de la dernière étape du cycle visuel dans l’épithélium pigmentaire rétinien en transformant le 11-cis rétinol en 11-cis rétinal, qui sera réacheminé vers les photorécepteurs pour régénérer le pigment visuel. Toutefois, la structure tertiaire des RDHs n’a encore jamais été résolue. Ces enzymes sont néanmoins reconnues pour être associées aux membranes cellulaires par leur segment N- et/ou C-terminal. Nous avons alors entrepris ce travail afin de caractériser la structure de ces enzymes et mieux comprendre leur interaction avec les membranes. Nous avons étudié dans un premier temps différentes portions du segment N- et C-terminal de la RDH11 et la RDH8 respectivement, par différentes méthodes spectroscopiques. Nous avons alors observé que les segments de ces deux enzymes agissent par deux modes d’action totalement différents. La RDH11 ferait appel à un segment N-terminal transmembranaire qui adopte une conformation hélicale peu importe sa longueur, alors que la RDH8 utiliserait un segment C-terminal qui adopte une structure secondaire variable selon la longueur et dont la liaison est périphérique à la membrane. En plus, la liaison de la RDH8 par son segment C-terminal serait potentiellement facilitée par une ou plusieurs acylations situées au niveau de certaines cystéines. Les mesures de pression d’insertion maximale ont permis de comparer les interactions entre des segments de longueur variable en N-terminal de la RDH11 et en C-terminal de la RDH8 avec des monocouches de différents phospholipides. Ainsi, nous avons déterminé les interactions les plus favorables pour chacun de ces segments. Nous nous sommes focalisés par la suite sur l’étude de l’enzyme RDH8 et la comparaison de ses propriétés structurales, de stabilité et de liaison membranaire avec celles de sa forme tronquée RDH8t, dépourvue de son segment en C-terminal. Notons que nous avons mis au point un protocole adapté pour surexprimer et purifier la RDH8 et sa forme tronquée. À notre connaissance, il s’agit ici des premiers travaux de recherche rapportant la surexpression et la purification d’une RDH8 (bovine) complète dans un système procaryote (E. coli). Nous avons alors constaté que les deux formes de la RDH8, complète et tronquée, comprenaient majoritairement des hélices α en plus de la présence de feuillets β, en accord avec le motif de Rossmann fold suggéré dans la littérature pour cette famille d’enzymes. Il s’est avéré également que le segment C-terminal a un impact sur la stabilité de la RDH8 comme démontré par les mesures du contenu en structure secondaire de ces protéines en fonction des conditions de stockage et dans les expérimentations de dénaturation thermique. Enfin, les mesures de pression d’insertion maximale (PIM) et de synergie ont démontré que le segment C-terminal facilitait la liaison membranaire de la forme complète par rapport à la forme tronquée, notamment dans le contexte de phospholipides portant une tête polaire chargée négativement. L’interaction membranaire de la RDH8 pourrait donc impliquer des interactions électrostatiques. Des expériences de spectroscopie de fluorescence ont permis de confirmer l’implication du segment C-terminal dans la liaison de la RDH8 avec des bicouches lipidiques grâce à la présence de deux résidus tryptophanes uniquement dans son segment C-terminal. / In the retina, retinol dehydrogenases (RDHs) play a crucial role in the visual cycle allowing a good vision. The first step of the visual cycle is taking place in photoreceptors where RDH8 is located and then in the retinal pigmented epithelium (RPE) where RDH11 can be found. RDH11 is likely anchored to membranes by means of its N-terminal segment whereas RDH8 has been postulated to be membrane bound via its C-terminal segment. So, to better evaluate the role of the N-terminal segment of RDH11 and the C-terminal segment of RDH8 in the membrane binding of these proteins, different variants (Long and Short) of the aforementioned segments have been studied. In addition, mutations of the C-terminal segment of RDH8 have been introduced to monitor their interaction with lipid monolayers or bilayers. We have thus analyzed the secondary structure content of these segments by conventional spectroscopic methods such as circular dichroism (CD) and attenuated total reflectance (ATR) infrared spectroscopy whereas their interaction with phospholipids have been mainly monitored by surface pressure measurements when using monolayers and fluorescence spectroscopy for bilayers. Overall, we found that the N-terminal segment of RDH11 adopts an α-helix conformation acting as a transmembrane domain. Values of maximum insertion pressure (MIP) and synergy suggested a preferential binding of the RDH11 Long-peptide to phosphoethanolamine, which are abundant in the RPE. In the case of RDH8, our findings suggest an important role of the long C-terminal segment in membrane binding, which is supported by its helical content and the larger values of MIP and synergy. We also compared the behavior of RDH8 and its truncated form (RDH8t, without its C-terminal segment) to better understand the involvement of this segment in membrane binding. Thus, both enzymes have been expressed in E. coli, purified by affinity chromatography and studied by the spectroscopic methods mentioned above and by using MIP and synergy measurements. RDH8 and RDH8t display a secondary structure content in agreement with their predicted Rossmann fold. Interestingly, the removal of the C-terminal segment decreased the temporal and thermal stability of these enzymes. In addition, this segment contributes to protein-lipid interaction especially in presence of negatively charged phospholipids likely through electrostatic interactions. The involvement of the C-terminal segment of the RDH8 in its membrane anchoring has been further confirmed by fluorescence measurements of its two Trp residues located in this segment. The present characterization of RDH8 is a first step paving the way for the elucidation of its structural and functional features to gain a better understanding of its role within the visual cycle and investigating mechanisms of retinal pathogenesis.

Thesis (doctoral)--Karolinska Institutet, Stockholm, 1982. / Extra t.p. with thesis statement inserted. eContent provider-neutral record in process. Description based on print version record. Includes bibliographical references.

Thesis (doctoral)--Karolinska Institutet, Stockholm, 1982. / Extra t.p. with thesis statement inserted. Includes bibliographical references.

Les protéines appartenant à la famille S100 et les annexines interviennent lors de différents mécanismes membranaires vitaux. En effet, le complexe protéique S100A10-annexine A2 permettrait le recrutement d'une partie du C-terminal de la protéine AHNAK à la membrane en présence de calcium, avant de former une plateforme qui initierait la réparation membranaire. Cependant, aucune donnée moléculaire n'est à ce jour disponible sur la liaison membranaire de la S100A10 et du segment C-terminal d'AHNAK de ce complexe. Leur liaison membranaire doit donc être étudiée afin de mieux comprendre leurs rôles lors du processus de réparation membranaire. Afin de combler le manque de données sur le rendement et la quantité de S100A10 solubilisée et purifiée parmi la littérature existante, le protocole de surexpression et purification de la S100A10 a été optimisé dans un premier temps. La protéine a été identifiée par spectrométrie de masse et la stabilité de sa structure secondaire a été analysée par dichroïsme circulaire à différentes températures au cours du temps. La S100A10 obtenue est stable pendant au moins 60 jours à plusieurs températures, dont 20 °C, permettant d'effectuer des expériences biophysiques à température ambiante avec la protéine non-dénaturée. En parallèle, le segment peptidique C-terminal d'AHNAK (pAHNAK) a été synthétisé commercialement. L'étude par spectroscopie infrarouge de réflexion totale atténuée (ATR) montre que sa structure secondaire ne subit pas de changement majeur en présence et en absence de lipides. Deux modèles membranaires ont été choisis dans nos études. D'abord, celui des monocouches de Langmuir a été utilisé pour mimer les membranes cellulaires afin de caractériser l'interaction des protéines avec différents phospholipides composant les membranes. Les études de la liaison membranaire de ces protéines ont été effectuées avec ce modèle en le couplant avec la tensiométrie de surface. Ces travaux ont démontré que le pAHNAK interagissait plus fortement avec les lipides insaturés, en particulier les lipides monoinsaturés, qu'avec les lipides saturés. De plus, le pAHNAK interagit préférentiellement avec la tête polaire des phospholipides de type phosphatidylsérine (PS), qui sont chargées négativement, puis avec ceux de type phosphatidyléthanolamine (PE) et enfin avec ceux de type phosphatidylcholine (PC). Avec le même modèle, la profondeur d'insertion des protéines dans des monocouches lipidiques a été déterminée par ellipsométrie. Les expériences avec des phospholipides monoinsaturés démontrent que la profondeur d'insertion du pAHNAK suit la même tendance (PS˃PE˃PC). Le deuxième modèle employé est celui des bicouches lipidiques avec lequel l'affinité de ces protéines pour les têtes polaires des phospholipides a spécifiquement été évaluée par résonance magnétique nucléaire (RMN) du ³¹P à l'état solide. Ces études de RMN confirment la tendance de préférence du pAHNAK pour les différents types de phospholipide à 37 °C observée précédemment. La liaison membranaire de la S100A10 a ensuite été étudiée selon la même stratégie que pour le pAHNAK. Les résultats de la tensiométrie montrent que la S100A10 préfère interagir avec les phospholipides insaturés avec des têtes polaires PE ou PS, et surtout les phospholipides polyinsaturés contenant de longues chaînes acyles. Les expériences d'ellipsométrie suggèrent que la S100A10 suit l'ordre d'insertion PC > PE > PS, ce qui pourrait être expliqué par un changement d'orientation de la protéine. De plus, les résultats de RMN suggèrent qu'à 20 °C et à 37 °C, la S100A10 pourrait s'insérer partiellement dans la membrane près des têtes polaires PS. L'ensemble de nos travaux de recherche démontrent que, dans un environnement physiologique à 37 °C, le pAHNAK et la S100A10 peuvent probablement interagir avec des phospholipides monoinsaturés ayant une tête polaire chargée négativement. Cependant, le pAHNAK aura tendance à s'insérer dans les chaînes acyles alors que la S100A10 s'insérerait partiellement près des têtes polaires. Ce projet a ainsi permis de développer les connaissances sur la liaison membranaire de la protéine S100A10 et du pAHNAK et d'émettre de nouvelles hypothèses quant au rôle des PS dans la réparation membranaire. De plus, la poursuite de ces travaux mènera à l'identification potentielle des conditions conduisant à une modification de leur liaison membranaire, et éventuellement à une perte de fonction. Ainsi, les connaissances développées dans cette thèse permettent de mieux comprendre la liaison membranaire de la S100A10 et du C-terminal d'AHNAK afin de mieux déterminer leurs rôles dans la réparation membranaire, ainsi que dans les autres mécanismes physiologiques auxquels ces protéines participent. / Proteins belonging to S100 family proteins and annexins are involved in various vital membrane mechanisms. The S100A10-annexin A2 protein complex was postulated to recruit part of the C-terminal segment of the AHNAK protein to the membrane in the presence of calcium, before forming a platform which can initiate membrane repair. However, no molecular data is currently available on the membrane binding of S100A10 and of the C-terminal segment of AHNAK of this complex. Their membrane binding should therefore be studied in order to better understand their roles during the membrane repair process. In order to fill the lack of data on the yield and the quantity of purified and solubilized S100A10 in the existing literature, the protocol for the overexpression and purification of S100A10 was first optimized. The protein was identified by mass spectrometry and its secondary structure stability was analyzed by circular dichroism at different temperatures over time. The S100A10 obtained is stable for at least 60 days at several temperatures, including 20 °C, allowing to perform biophysical experiments at room temperature with a non-denatured protein. In parallel, the C-terminal peptide segment of AHNAK (pAHNAK) was commercially synthesized. Attenuated total reflection infrared spectroscopy (ATR) study shows that its secondary structure does not undergo major changes in the presence and absence of lipids. Two membrane models were chosen in our studies. First, the Langmuir monolayers model was used to mimic cell membranes in order to characterize the interaction of proteins with the different phospholipids found in membranes. Membrane binding studies of these proteins were carried out with this model by coupling it with surface tensiometry. This work demonstrated that pAHNAK interact more strongly with unsaturated lipids, in particular monounsaturated lipids, than with saturated lipids. In addition, pAHNAK preferentially interacts with the phosphatidylserine (PS) polar head group which is negatively charged, then with phosphatidylethanolamine (PE) and finally with phosphatidylcholine (PC). With the same model, the insertion depth of pAHNAK into lipid monolayers was determined by ellipsometry. Experiments with monounsaturated phospholipids demonstrate that the insertion depth of pAHNAK follows the same trend (PS˃PE˃PC). The second model membrane used is lipid bilayers with which the affinity of pAHNAK for phospholipid polar head groups has specifically been evaluated by solid state ³¹P nuclear magnetic resonance (NMR). These NMR studies confirm the previously observed preference trend of pAHNAK at 37 °C for the different polar head groups. The membrane binding of S100A10 was then studied according to the same strategy as pAHNAK. The results of the tensiometry show that S100A10 prefers to interact with unsaturated phospholipids bearing PE or PS polar head groups, and especially polyunsaturated ones containing long fatty acyl chains. Ellipsometric experiments suggest that S100A10 follows the order of insertion PC> PE> PS, which could be explained by a change in orientation of the protein. Moreover, NMR results suggest that, at 20 and 37 °C, S100A10 could partially insert into the membrane near the PS polar head group. All of our research demonstrates that, in a physiological environment of 37 °C, pAHNAK and S100A10 can probably interact with monounsaturated phospholipids containing a negatively charged polar head group. However, pAHNAK will tend to insert into the acyl chains while S100A10 would insert partially near the polar head group of phospholipids. This project has thus made it possible to develop knowledge on the membrane binding of the S100A10 protein and of pAHNAK as well as to provide new hypotheses regarding the role of PS in membrane repair. In addition, the continuation of this work will lead to potentially identify the conditions leading to a modification of the membrane binding of these proteins, and possibly to a loss of function. Thus, the knowledge developed in this thesis allows to improve our understanding of the membrane binding of S100A10 as well as of the C-terminal segment of AHNAK in order to better determine their roles in membrane repair, as well as in other physiological mechanisms in which these proteins are involved.

Cette thèse de doctorat a porté sur l'étude de deux protéines membranaires d'origine animale appelées CCC8 (ou SLC12A9) et CCC9 (ou SLC12A8) qui appartiennent à la superfamille des cotransporteurs cation-chlore, mais dont le rôle n'est pas de transporter les ions Na+ et/ou K+ avec le Cl" à travers les surfaces cellulaires à l'instar des autres membres de la famille. En cours de caractérisation, nous avons trouvé que CCC8 et 9 pouvaient se comporter comme des transporteurs de polyamines à la surface cellulaire, ce qui nous a permis d'être les premiers à identifier de tels systèmes de transport chez les animaux. On en connaissait l'existence depuis longtemps, mais pour une raison imprécise, leur identité moléculaire était demeurée elusive. Il faut mentionner à cet effet que tous les CCCs font partie d'un groupe plus large de protéines appelé « transporteurs d'acides aminés-polyamines-organocations » (ou APC pour l'acronyme anglais amino acid-polyamine-organocation carriers). L'importance de nos résultats réside dans le rôle que jouent les polyamines dans la prolifération et la differentiation cellulaires, et ce, dans des conditions normales autant que pathologiques. Entre autres, il semble exister un lien important entre le métabolisme intracellulaire des polyamines et la cancérogenèse de même qu'entre le gène CCC9 et une maladie appelée psoriasis vulgaris.

La recoverine est impliquée dans la cascade de la phototransduction. C’est une neuroprotéine sensible aux ions calcium. Cette famille de protéines comprend quatorze membres qui ont des caractéristiques structurales communes comme la présence de quatre motifs EF-hand, la liaison du calcium et la N-myristoylation. Le phénomène de calcium-myristoyl switch a été démontré sans ambiguïté uniquement pour la recoverine; il s’agit d’un changement de structure tertiaire qui est modulé par la concentration en calcium. Ainsi, en absence de calcium, la recoverine est dans une conformation cytosolique avec son groupement myristoyle enfoui dans une poche hydrophobe. À concentration élevée en calcium, la recoverine lie deux ions calcium, ce qui résulte en l’extrusion du groupement myristoyle de sa poche hydrophobe et lui permet d’être recrutée à l’interface membranaire. La recoverine est donc une protéine périphérique de la membrane des disques du segment externe des bâtonnets dont la composition lipidique est unique. En effet, cette membrane possède le plus haut contenu en chaînes acyle polyinsaturées parmi tous les lipides du corps humain. De plus, les lipides sont majoritairement zwitterioniques avec la phosphatidylcholine et la phosphatidyléthanolamine. Aussi, il existe un faible pourcentage de lipides chargés négativement, notamment la phosphatidylsérine, qui jouent un rôle dans l’interaction membranaire de la recoverine. L’utilisation de systèmes lipidiques modèles, tels que les vésicules multilamellaires et les bicouches lipidiques orientées mécaniquement, permet de cibler l’influence de chacune des composantes de la membrane. L’objectif général de ce projet de thèse, divisé en quatre objectifs spécifiques, était de déterminer l’influence de la présence du calcium, de la myristoylation de la recoverine et de la composition lipidique sur l’interaction membranaire de la recoverine. Le premier objectif spécifique consistait à déterminer la stabilité structurale de la recoverine myristoylée ou non myristoylée en absence et présence de calcium. La spectroscopie infrarouge a permis de constater que la recoverine est stable structuralement à la température ambiante et corporelle. La présence de calcium audessus d’un certain ratio avec la recoverine assure sa stabilité structurale jusqu’à une température de 65 °C; l’agrégation de la recoverine est observée au-dessus de cette température. La myristoylation de la recoverine augmente sa stabilité thermique. Le deuxième objectif spécifique était de comprendre le rôle des lipides chargés négativement sur l’interaction membranaire de la recoverine. Nous avons ainsi démontré que la recoverine nécessite un minimum de calcium pour conserver sa stabilité thermique en présence de phosphatidylglycérol qui lie aussi le calcium et réduit ainsi la quantité disponible pour la recoverine. La fonte des complexes entre le calcium et le phosphatidylglycérol favorise l’interaction membranaire avec la recoverine en augmentant davantage la température de transition de phase de ces lipides. Le troisième objectif spécifique consistait à caractériser l’effet de la fluidité membranaire sur l’immobilisation de la recoverine en utilisant différentes chaînes acyle de la phosphatidylcholine. La spectroscopie de résonance magnétique nucléaire à l’état solide du deutérium a été employée en utilisant un groupement myristoyle perdeutéré. Nous avons ainsi confirmé le phénomène de calcium-myristoyl switch de la recoverine selon la concentration en calcium. De plus, nous avons aussi montré qu’une fluidité membranaire optimale est nécessaire pour l’immobilisation membranaire du groupement myristoyle. Le quatrième objectif spécifique était d’analyser l’interaction membranaire de la recoverine avec la dioléoylphosphatidylcholine. La spectroscopie infrarouge a montré que la recoverine reste stable thermiquement en présence de ces lipides et ne perturbe pas leur organisation. La recoverine non myristoylée augmente légèrement l’hydratation des lipides qui est corrélée avec une hausse de la diffusion latérale des lipides tel que déterminée par la technique de centerband-only detection of exchange (CODEX) en spectroscopie de résonance magnétique à l’état solide du phosphore-31. La spectroscopie de résonance magnétique du fluor-19 a permis d’observer le calcium-myristoyl switch et l’immobilisation du groupement myristoyle de la recoverine dans la membrane en présence de calcium, ainsi que deux environnements différents pour le groupement myristoyle en absence de calcium. En conclusion, le calcium permet l’interaction membranaire et de conserver la recoverine stable thermiquement. La myristoylation de la recoverine permet son ancrage dans la membrane et augmente l’interaction avec les phosphatidylglycérols. Finalement, une fluidité membranaire optimale est nécessaire à l’ancrage de la recoverine dans la membrane et la charge négative des lipides augmente l’interaction membranaire de la recoverine. / Recoverin is evolved in the phototransduction cascade. It is a neuronal calcium sensor. This protein family of fourteen members shares common structural characteristics such as the presence of four EF-Hand motifs, the binding of calcium and the N-myristoylation. The phenomenon of calcium-myristoyl switch has been demonstrated without ambiguity only for recoverin; it is a change in tertiary structure which is triggered by calcium concentration. So, in the absence of calcium, recoverin is in a cytosolic form with its myristoyl moiety hidden in a hydrophobic pocket. At high calcium concentration, recoverin binds two calcium ions which in turn leads to the extrusion of its myristoyl moiety from the hydrophobic pocket and to its recruitment at the membrane. Recoverin is closely bound to rod outer segment disk membranes which present a unique lipid membrane composition. Indeed, this membrane displays the highest content of polyunsaturated lipid acyl chains in the human body. Moreover, the lipid polar headgroup is in majority zwitterionic with phosphatidylcholine and phosphatidylethanolamine. Also, a small amount of the negatively charged phosphatidylserine is present, which seems to play a role in the membrane interaction of recoverin. Using lipid model systems such as multilamellar vesicles and mechanically oriented lipid bilayers allows to more properly characterize the role of each membrane component. The aim of this thesis project, divided in four specific objectives, was to gain information on recoverin membrane interaction by studying the influence of the presence of calcium, of recoverin myristoylation and of membrane composition. The first specific objective was to determine the structural stability of myristoylated or non myristoylated recoverin in the absence and presence of calcium. Recoverin is structurally stable at ambient and body temperature as shown by infrared spectroscopy. The presence of calcium beyond a specific calcium:recoverin ratio allows protein structural stability up to 65 °C, recoverin aggregation is observed above this temperature. The second specific objective was to understand the role of negatively charged lipids on recoverin membrane interaction. We have demonstrated that recoverin needs a minimal amount of bound calcium to preserve its thermal stability since phosphatidylglycerol binds calcium, which reduces the concentration of calcium available for recoverin. The melting of complexes between calcium and phosphatidylglycerol favors membrane interaction of recoverin by further increasing the lipid phase transition temperature. The third specific objective was to investigate the effect of membrane fluidity on the recoverin immobilization using phosphatidylcholine bearing different lipid acyl chains. Deuterium solid-state nuclear magnetic resonance spectroscopy was used with a perdeuterated myristoyl moiety on recoverin. We have thus confirmed the dependence of the calcium-myristoyl switch phenomenon on calcium concentration. Moreover, we have shown that an optimal membrane fluidity is required for the membrane immobilization of the myristoyl moiety of recoverin. The fourth specific objective was to study the recoverin membrane interaction with dioleoylphosphatidylcholine. Infrared spectroscopy has shown that recoverin does not perturb lipid bilayer organization and remains thermally stable in the presence of these lipids. Non myristoylated recoverin increases slightly lipid hydration that is correlated to an increase in lipid lateral diffusion as seen with centerband-only detection of exchange (CODEX) pulse sequences by phosphorus-31 solid-state nuclear magnetic resonance spectroscopy. 19-Fluorine nuclear magnetic resonance spectroscopy allows the observation of the calcium-myristoyl switch and of recoverin myristoyl moiety membrane immobilization in the presence of calcium as well as two different environments for the recoverin myristoyl moiety in the absence of calcium. In conclusion, calcium allows recoverin membrane interaction and thermal stability of recoverin. Recoverin myristoylation allows its anchorage in the membrane and increases interaction with phosphatidylglycerol. Finally, an optimal membrane fluidity is required for recoverin membrane anchorage and negatively charged lipids increase recoverin membrane interaction.

Les protéines membranaires intégrales jouent un rôle indispensable dans la survie des cellules et 20 à 30% des cadres de lectures ouverts codent pour cette classe de protéines. La majorité des protéines membranaires se trouvant sur la Protein Data Bank n’ont pas une orientation et une insertion connue. L’orientation, l’insertion et la conformation que les protéines membranaires ont lorsqu’elles interagissent avec une bicouche lipidique sont importantes pour la compréhension de leur fonction, mais ce sont des caractéristiques difficiles à obtenir par des méthodes expérimentales. Des méthodes computationnelles peuvent réduire le temps et le coût de l'identification des caractéristiques des protéines membranaires. Dans le cadre de ce projet de maîtrise, nous proposons une nouvelle méthode computationnelle qui prédit l’orientation et l’insertion d’une protéine dans une membrane. La méthode est basée sur les potentiels de force moyenne de l’insertion membranaire des chaînes latérales des acides aminés dans une membrane modèle composèe de dioléoylphosphatidylcholine. / Integral membrane proteins play many important roles, and account for 20 to 30% of the open reading frames code for this class of proteins. Most of the membrane proteins found on the Protein Data Bank do not have a known membrane orientation and insertion, and such information is not available from the standard PDB format. The orientation, insertion and conformation that the membrane proteins have when interacting with a lipid bilayer are important for understanding their functions, but they are difficult characteristics to obtain experimentally. Computational methods can help reduce the cost and time allocated to determine the characteristics of a membrane protein. In this project, we propose a new computational method that predicts the orientation and the insertion of a protein in a lipid bilayer. The method is based on the potential mean force of the insertion of the amino acid side chain analogs in a dioleoylphosphatidylcholine lipid bilayer.