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Semi-parametric bayesian model, applications in dose finding studies / Modèle bayésien semi-paramétrique, applications en positionnement de dose

Clertant, Matthieu 22 June 2016 (has links)
Les Phases I sont un domaine des essais cliniques dans lequel les statisticiens ont encore beaucoup à apporter. Depuis trente ans, ce secteur bénéficie d'un intérêt croissant et de nombreuses méthodes ont été proposées pour gérer l'allocation séquentielle des doses aux patients intégrés à l'étude. Durant cette Phase, il s'agit d'évaluer la toxicité, et s'adressant à des patients gravement atteints, il s'agit de maximiser les effets curatifs du traitement dont les retours toxiques sont une conséquence. Parmi une gamme de doses, on cherche à déterminer celle dont la probabilité de toxicité est la plus proche d'un seuil souhaité et fixé par les praticiens cliniques. Cette dose est appelée la MTD (maximum tolerated dose). La situation canonique dans laquelle sont introduites la plupart des méthodes consiste en une gamme de doses finie et ordonnée par probabilité de toxicité croissante. Dans cette thèse, on introduit une modélisation très générale du problème, la SPM (semi-parametric methods), qui recouvre une large classe de méthodes. Cela permet d'aborder des questions transversales aux Phases I. Quels sont les différents comportements asymptotiques souhaitables? La MTD peut-elle être localisée? Comment et dans quelles circonstances? Différentes paramétrisations de la SPM sont proposées et testées par simulations. Les performances obtenues sont comparables, voir supérieures à celles des méthodes les plus éprouvées. Les résultats théoriques sont étendus au cas spécifique de l'ordre partiel. La modélisation de la SPM repose sur un traitement hiérarchique inférentiel de modèles satisfaisant des contraintes linéaires de paramètres inconnus. Les aspects théoriques de cette structure sont décrits dans le cas de lois à supports discrets. Dans cette circonstance, de vastes ensembles de lois peuvent aisément être considérés, cela permettant d'éviter les cas de mauvaises spécifications. / Phase I clinical trials is an area in which statisticians have much to contribute. For over 30 years, this field has benefited from increasing interest on the part of statisticians and clinicians alike and several methods have been proposed to manage the sequential inclusion of patients to a study. The main purpose is to evaluate the occurrence of dose limiting toxicities for a selected group of patients with, typically, life threatening disease. The goal is to maximize the potential for therapeutic success in a situation where toxic side effects are inevitable and increase with increasing dose. From a range of given doses, we aim to determine the dose with a rate of toxicity as close as possible to some threshold chosen by the investigators. This dose is called the MTD (maximum tolerated dose). The standard situation is where we have a finite range of doses ordered with respect to the probability of toxicity at each dose. In this thesis we introduce a very general approach to modeling the problem - SPM (semi-parametric methods) - and these include a large class of methods. The viewpoint of SPM allows us to see things in, arguably, more relevant terms and to provide answers to questions such as asymptotic behavior. What kind of behavior should we be aiming for? For instance, can we consistently estimate the MTD? How, and under which conditions? Different parametrizations of SPM are considered and studied theoretically and via simulations. The obtained performances are comparable, and often better, to those of currently established methods. We extend the findings to the case of partial ordering in which more than one drug is under study and we do not necessarily know how all drug pairs are ordered. The SPM model structure leans on a hierarchical set-up whereby certain parameters are linearly constrained. The theoretical aspects of this structure are outlined for the case of distributions with discrete support. In this setting the great majority of laws can be easily considered and this enables us to avoid over restrictive specifications than can results in poor behavior.
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Institutions, inégalités et croissance économique : quelles interactions dans les pays d'Afrique Sub-Saharienne? / Institutions, Disparities and Economic growth : What interactions in the countries of Sub-Saharan Africa?

Djékondé, Naïmbayel 22 April 2016 (has links)
Le concept de gouvernance appréhendée par la Banque mondiale au milieu des années 1980, apparaît comme une préoccupation majeure au niveau de l’analyse du développement économique. Il est de plus en plus présent dans les débats sur la recherche de solides fondements de la croissance économique, notamment la croissance économique de long terme dans les pays en voie de développement. La résurgence de la pauvreté après la mise en œuvre des programmes d’ajustement structurel, la persistance des inégalités en Afrique subsaharienne, l’importance des ressources naturelles dont dispose ces pays, et la volonté manifestée récemment par les Chefs d’Etat de ces pays, d’engager leurs pays respectifs à l’initiative de transparence dans les industries extractives (ITIE), suscitent de nombreux enjeux, auxquels seule leur capacité à conduire la bonne gouvernance leur mettra en position de réaliser une croissance économique capable de réduire les inégalités. L’objectif principal de cette thèse est d’analyser le rôle des institutions dans la détermination de la croissance économique en Afrique au Sud Sahara et en diagnostiquant l’influence d’autres variables anthropo-sociologiques telle que la fragmentation ethnique sur la trajectoire de la croissance économique. En utilisant des techniques économétriques et statistiques adéquates et pertinentes, nous arrivons dans un premier temps à montrer qu’il existe une relation positive et très significative entre l’ensemble des variables de gouvernance (Ecoute des citoyens et reddition des comptes ; Stabilité politique et absence de violence ; Efficacité des pouvoirs publics ; Qualité de la réglementation ; Règle de Loi ou Etat de droit ; Maitrise de la corruption) et le taux de croissance du PIB par tête des pays en Afrique au Sud du Sahara. De plus, Cette croissance du PIB par tête est beaucoup plus importante pour les pays colonisés par l’Angleterre et moins favorable pour ceux colonisés par la France. On est tenté à ce stade de l'analyse de lier la qualité des institutions des pays africains à celle des pays colonisateurs. Dans un second temps, l’étude a révélé qu’il n’y a pas de relation linéaire entre le taux de croissance du PIB par tête et les variables mises en évidence. De plus, en présence de la variable« Ethnie », les variables de gouvernance n’ont pas d’influence fondamentale sur la croissance économiquedes pays en Afrique au Subsaharienne. Néanmoins, une relation positive et très significative entre la variable « Ethnie » et le taux de croissance du PIB par tête a été mise en évidence. Enfin, ce travail nous a permis d’apprécier la qualité des institutions et des systèmes de contre-pouvoir notamment l’implication des Organisations de la Société Civile dans la définition et la mise en œuvre des politiques et programmes de développement au Tchad à partir de l’analyse de l’état de la gouvernance économique et financière. / The concept of governance initiated by the World Bank in the mid-1980s appears to be a major concern in the analysis of economic development. It is increasingly present in the debate on finding a solid foundation for economic growth, particularly long-term economic growth in developing countries. The resurgence of poverty following the implementation of structural adjustment programs, the persistence of inequality in sub-Saharan Africa, the abundance of natural resources available to these countries and the clear willingness lately shown by the Heads of State of these countries, to commit their respective countries to the Extractive Industries Transparency Initiative (EITI), raise many issues, to which only their capacity to upload good governance will enable them to attain an economic growth that can reduce levels of inequality. The main objective of this thesis is to analyze the role of institutions in determining economic growth in Africa South Sahara and diagnosing the influence of other anthropological - sociological variables such as ethnic fractionalization in the path of the economic growth. Using appropriate econometric techniques and relevant statistics, we reach first to show that there is a positive and highly significant relationship between all governance variables (Citizen Voices and Accountability, Political Stability and Absence of Violence, Government Effectiveness, Regulatory Quality, Rule of Law or State of Law, Control Corruption) and the GDP growth rate per capita of the countries in Africa south of the Sahara. In addition, the growth of GDP per capita is much more important for countries colonized by England and less favorable to those colonized by France. One is tempted at this stage of the analysis to link the quality of the institutions of the African countries to that of the colonizing countries. Secondly, the study found that there is no linear relationship between the growth rate of GDP per capita and variables highlighted. Moreover, in the presence of the variable " Ethnic ", the governance variables do not have a fundamental influence on economic growth of the countries in Sub-Saharan Africa. Nevertheless, a positive and highly significant relationship between the variable " Ethnic " and the GDP growth rate per capita was highlighted. Finally, this work has allowed us to appreciate the quality of institutions and systems against power including the involvement of civil society organizations in the definition and implementation of the development of policies and programs in Chad from the analysis of the state of the economic and financial governance.
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Estimation récursive pour les modèles semi-paramétriques

Nguyen, Thi Mong Ngoc 26 November 2010 (has links) (PDF)
Dans cette th ese, nous nous int eressons au mod ele semi-param etrique de r egression de la forme y = f( \theta'x; \epsilon), lorsque x \in R^p et y\in R. Notre objectif est d' etudier des probl emes d'estimation des param etres \theta et f de ce mod ele avec des m ethodes r ecursives. Dans la premi ere partie, l'approche que nous d eveloppons est fond ee sur une m ethode introduite par Li (1991), appel ee Sliced Inverse Regression (SIR). Nous proposons des m ethodes SIR r ecursives pour estimer le param etre . Dans le cas particulier o u l'on consid ere le nombre de tranches egal a 2, il est possible d'obtenir une expression analytique de l'estimateur de la direction de . Nous proposons une forme r ecursive pour cet estimateur, ainsi qu'une forme r ecursive de l'estimateur de la matrice d'int er^et. Ensuite, nous proposons une nouvelle approche appell ee \SIRoneslice" (r ecursive ou non r ecursive) de la m ethode SIR bas ee sur l'utilisation de l'information contenue dans une seule tranche optimale (qu'il faudra choisir parmi un nombre quelconque de tranches). Nous proposons egalement un crit ere \bootstrap na f" pour le choix du nombre de tranches. Des r esultats asymptotiques sont donn es et une etude sur des simulations d emontre le bon comportement num erique des approches r ecursives propos ees et l'avantage principal de l'utilisation la version r ecursive de SIR et de SIRoneslice du point de vue des temps de calcul. Dans la second partie, nous travaillons sur des donn ees de valvom etrie mesur ees sur des bivalves. Sur ces donn ees, nous comparons le comportement num erique de trois estimateurs non param etrique de la fonction de r egression : celui de Nadaraya-Watson, celui de Nadaraya-Watson r ecursif et celui de R ev esz qui est lui aussi r ecursif. Dans la derni ere partie de cette th ese, nous proposons une m ethode permettant de combiner l'estimation r ecursive de la fonction de lien f par l'estimateur de Nadaraya- Watson r ecursif et l'estimation du param etre via l'estimateur SIR r ecursif. Nous etablissons une loi des grands nombres ainsi qu'un th eor eme de limite centrale. Nous illustrons ces r esultats th eoriques par des simulations montrant le bon comportement num erique de la m ethode d'estimation propos ee.
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Détection des ruptures dans les processus causaux: Application aux débits du bassin versant de la Sanaga au Cameroun

Kengne, William Charky 03 May 2012 (has links) (PDF)
Cette thèse porte sur la détection de rupture dans les processus causaux avec application aux débits du bassin versant de la Sanaga. Nous considérons une classe semi-paramétrique de modèles causaux contenant des processus classique tel que l'AR, ARCH, TARCH. Le chapitre 1 est une synthèse des travaux. Il présente le modèle avec des exemples et donne les principaux résultats obtenus aux chapitres 2, 3,4. Le chapitre 2 porte sur la détection off-line de ruptures multiples en utilisant un critère de vraisemblance pénalisée. Le nombre de rupture, les instants de rupture et les paramètres du modèle sur chaque segment sont inconnus. Ils sont estimés par maximisation d'un contraste construit à partir des quasi-vraisemblances et pénalisées par le nombre de ruptures. Nous donnons les choix possibles du paramètre de pénalité et montrons que les estimateurs des paramètres du modèle sont consistants avec des vitesses optimales. Pour des applications pratiques, un estimateur adaptatif du paramètre de pénalité basé sur l'heuristique de la pente est proposé. La programmation dynamique est utilisée pour réduire le coût numérique des opérations, celui-ci est désormais de l'ordre de $\mathcal{O}(n^2)$. Des comparaisons faites avec des résultats existants montrent que notre procédure est plus stable et plus robuste. Le chapitre 3 porte toujours sur la détection off-line de ruptures multiples, mais cette fois en utilisant une procédure de test. Nous avons construit une nouvelle procédure qui, combinée avec un algorithme de type ICSS (Itereted Cumulative Sums of Squares) permet de détecter des ruptures multiples dans des processus causaux. Le test est consistant en puissance et la comparaison avec des procédures existantes montre qu'il est plus puissant. Le chapitre 4 étudie la détection des ruptures on-line dans la classe de modèle considéré aux chapitres 2 et 3. Une procédure basée sur la quasi-vraisemblance des observations a été développée. La procédure est consistante en puissance et le délai de détection est meilleur que celui des procédures existantes. Le chapitre 5 est consacré aux applications aux débits du bassin versant de la Sanaga, les procédures décrites aux chapitres 2 et 3 ont été utilisées en appliquant un modèle ARMA sur les données désaisonnalisées et standardisées. Ces deux procédures ont détecté des ruptures qui sont "proches".

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