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Evolução temporal de uma superfície de pilha de rejeito em pasta : influência da rugosidade e do diâmetro dos sedimentos no processo Eros.

Branches, André Miranda Brito January 2015 (has links)
Programa de Pós-Graduação em Engenharia Mineral. Departamento de Engenharia de Minas, Escola de Minas, Universidade Federal de Ouro Preto. / Submitted by Oliveira Flávia (flavia@sisbin.ufop.br) on 2015-05-27T19:33:18Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22190 bytes, checksum: 19e8a2b57ef43c09f4d7071d2153c97d (MD5) DISSERTAÇÃO_EvoluçãoTemporalSuperfície.pdf: 3536366 bytes, checksum: c9d63be0fcebc3a0f48cf8616a23d4cf (MD5) / Approved for entry into archive by Gracilene Carvalho (gracilene@sisbin.ufop.br) on 2015-05-28T16:57:06Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22190 bytes, checksum: 19e8a2b57ef43c09f4d7071d2153c97d (MD5) DISSERTAÇÃO_EvoluçãoTemporalSuperfície.pdf: 3536366 bytes, checksum: c9d63be0fcebc3a0f48cf8616a23d4cf (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-28T16:57:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22190 bytes, checksum: 19e8a2b57ef43c09f4d7071d2153c97d (MD5) DISSERTAÇÃO_EvoluçãoTemporalSuperfície.pdf: 3536366 bytes, checksum: c9d63be0fcebc3a0f48cf8616a23d4cf (MD5) Previous issue date: 2015 / A técnica de disposição de rejeitos espessados apareceu recentemente como uma alternativa viável para disposição dos rejeitos gerados nas minerações, frente aos potenciais riscos inerentes a disposição de rejeitos em formas de polpa em barragens convencionais e/ou frente a falta de controle durante o processo construtivo de aterros hidráulicos. Entretanto, pouco se sabe a evolução, em longo prazo, da superfície das pilhas formadas pela disposição de rejeito em pasta. Para entender esse comportamento usou-se como ferramenta de simulação o software SIBERIA. Buscou-se determinar o surgimento e o efeito dos processos erosivos em uma pilha de rejeito em pasta com aproximadamente vinte e um por cento de inclinação após longos períodos de disposição (100 e 250 anos). Os dados para modelagem via SIBERIA consideraram três valores distintos para a rugosidade superficial e para o diâmetro médio das partículas de sedimento, bem como as propriedades características da pasta mineral produzida à partir de rejeito de minério de ferro. A melhor configuração final da pilha foi encontrada para o diâmetro de sedimento de sedimento de 2 centímetros e coeficiente de Manning de 0,02 os quais resultaram em uma perda total de altura da pilha de 93 centímetros após 250 anos. Os resultados indicam que para o menor valor do coeficiente de rugosidade de Manning e o maior diâmetro médio representativo das partículas de sedimento, menor será a intensidade do transporte de sedimentos e, portanto, em um longo prazo, maior será a integridade da pilha de rejeito em pasta. ________________________________________________________________________________________ / ABSTRACT: The disposal of thickened tailings technique recently appeared as a viable alternative for disposal of waste generated in mining activities, compared to the potential risks associated with waste disposal in conventional dams and / or forward the lack of control during the construction process hydraulic landfills. However, little information is known about the developments, in the long-term run, the surface of heaps formed by the disposal of waste paste. To understand this behavior was used as simulation tool the SIBERIA software. We sought to determine the rise and the effect of erosion on a pile of tailings paste with about twenty-one percent slope after long periods of deposition (100 and 250 years). The data used for modeling by SIBERIA considered three different values for the surface roughness and the average diameter of the particles sediment and the characteristic properties of the mineral paste produced from iron ore tailings. The results indicate that for the lowest value of the Manning roughness coefficient and the largest representative average particle diameter of the sediment, there was the lower the intensity of sediment transport and therefore, in a long term, the greater the integrity of the tailings pile.
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Porosidade de sistemas polidispersos.

Prado, Diogo Rodrigues January 2015 (has links)
Programa de Pós-Graduação em Engenharia Mineral. Departamento de Engenharia de Minas, Escola de Minas, Universidade Federal de Ouro Preto. Dissertação (Mestrado em Engenharia Mineral) – Escola de Minas, Universidade Federal de Ouro Preto, Ouro Preto, 2015. / Submitted by giuliana silveira (giulianagphoto@gmail.com) on 2015-12-03T17:08:42Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO_PorosidadeSistemasPolidispersos.pdf: 1484683 bytes, checksum: 480dc4b4cf51ce14dc8071f60eb4b377 (MD5) / Rejected by Oliveira Flávia (flavia@sisbin.ufop.br), reason: Falta a referência. on 2015-12-09T17:10:12Z (GMT) / Submitted by giuliana silveira (giulianagphoto@gmail.com) on 2015-12-09T17:14:56Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO_PorosidadeSistemasPolidispersos.pdf: 1484683 bytes, checksum: 480dc4b4cf51ce14dc8071f60eb4b377 (MD5) / Approved for entry into archive by Oliveira Flávia (flavia@sisbin.ufop.br) on 2015-12-09T17:26:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO_PorosidadeSistemasPolidispersos.pdf: 1484683 bytes, checksum: 480dc4b4cf51ce14dc8071f60eb4b377 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-09T17:26:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO_PorosidadeSistemasPolidispersos.pdf: 1484683 bytes, checksum: 480dc4b4cf51ce14dc8071f60eb4b377 (MD5) Previous issue date: 2015 / A porosidade pode ser um parâmetro muito importante quando se trabalha com materiais granulares. Na filtragem o valor de porosidade é um dos parâmetros que vai determinar a taxa de filtragem, no estudo de rochas reservatórios é um dos parâmetros para determinação da quantidade estocada. Mas apesar de ser um parâmetro de grande utilidade em diversas áreas a determinação de seu valor na maioria das aplicações é cara, difícil ou até mesmo impossível. A proposta do trabalho é desenvolver relações entre a distribuição granulométrica e o valor de porosidade resultante para esse material. Para o desenvolvimento de modelos foram geradas distribuições granulométricas de esferas de vidro que poderiam ser adequadamente descritas pela equação de Weibull-Rosin-Rammler, então obteve-se vários valores de porosidade variando o valor do parâmetro de agudez da equação de Weibull-Rosin-Rammler. Com os resultados foi gerado um modelo utilizando regressão para equação que se julgava adequada e outros dois utilizando as técnicas de aprendizado de máquina (Bagging e Boosting), sendo que um dos modelos obteve aderência de 91,54 % aos dados experimentais. Com isso obteve- se um modelo que pode ser usado para descrever empacotamentos aleatórios com distribuição granulométrica próxima a equação de Weibull-Rosin-Rammler. ________________________________________________________ / ABSTRACT The porosity can be a very important parameter when working with granular materials. In filtration, the porosity value is one of important parameters that will determine the rate of filtration, the study of reservoir rocks is one of parameters to determine the quantity stored. In despite of being a useful parameter in several areas, the determination of its value in the most of applications is expensive, hard or even impossible. The purpose of this study is to develop relations between the particle size distribution and the porosity value for this material. To develop models were generated size distribution of glass spheres, could be adequately described by the Weibull-Rosin-Rammler equation, then many porosity values was obtained varying the value of the sharpness parameter of Weibull-Rosin-Rammler equation. With the results, a model using regression with the equation was thought appropriate was generated and other two models using machine-learning techniques (Bagging and Boosting), one of the models obtained 91.54% of adherence to the experimental data.Thus was obtained a model that can be used to describe random packing with sharp size distribution described by the Weibull-Rosin-Rammler equation.
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ImagEM : Programa de Modelagem 2D para dados TDEM

Travaglia Filho, Umberto José 20 December 2016 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Geociências, Pós-Graduação em Geociências Aplicadas, 2016. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2017-05-02T17:14:17Z No. of bitstreams: 1 2016_UmbertoJoséTravagliaFilho.pdf: 4405139 bytes, checksum: e286c5da82e172b958605cb778ceff3c (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-05-08T21:15:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_UmbertoJoséTravagliaFilho.pdf: 4405139 bytes, checksum: e286c5da82e172b958605cb778ceff3c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-08T21:15:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_UmbertoJoséTravagliaFilho.pdf: 4405139 bytes, checksum: e286c5da82e172b958605cb778ceff3c (MD5) Previous issue date: 2017-05-08 / Devido ao aumento no número de levantamentos de campo utilizando o Método Eletromagnético no Domínio do Tempo (TDEM), novos programas para processamento deste método foram desenvolvidos. Com o objetivo de contribuir com a aplicação do método, foi desenvolvido o programa ImagEM – programa de modelagem 2D para dados TDEM. O ImagEM possui sub-rotinas para realizar o pré-processamento, processamento (inversão simplificada por meio do método da secante) e imageamento dos perfis do campo secundário, das linhas de contorno da resistividade e da seção da resistividade pela profundidade para dados terrestres e aéreos, além da modelagem do alvo (mergulho, direção e profundidade). Os mapas podem ser obtidos pelo método de Krigagem, ou do Inverso da Distância Ponderada. Nesta tese são apresentados três artigos. No primeiro artigo, foram aplicados dados sintéticos para modelos de duas e três camadas, com a resistividade variando entre 10 e 100 Ω•m e profundidade variando entre 100 e 400m. No segundo artigo, os dados coletados com o equipamento PROTEM (Geonics) foram submetidos ao programa. A área desta coleta foi o complexo Cristalino em Carajás - PA, a inversão recuperou os valores de resistividade que variam entre 1.104 e 2.104 Ω•m e profundidade entre 50 e 400m. Também foi possível descrever as feições das regiões condutivas e a mudança em sua direção. No último artigo, foram utilizados os dados Aeroeletromagnéticos (AEM), sobre a Bacia de San Pedro (EUA), obtidos pelo GEOTEM nas três componentes (x, y e z). Aplicando a transformada de Hilbert sobre as três componentes foi possível calcular o Envelope de Energia. Por meio da razão entre a componente Bz e o Envelope de Energia foi possível avaliar os picos de energia e estimar o mergulho, a profundidade e a direção (strike) do alvo. Estes resultados foram modelados utilizando a função RDI (Resistivity Depth Image) que apresenta uma imagem da resistividade pela profundidade descrita também pelo programa. Estas informações trouxeram mais detalhes para se realizar a modelagem da subsuperfície condutiva. / Due to the increase of field surveys using Time Domain Electromagnetic Methods (TDEM), new algorithms for data processing have been developed. In order to contribute to the use of TDEM, the program ImagEM - 2D modeling program for TDEM data was developed. The ImagEM has subroutines to execute pre-processing, processing (simplified inversion through the secant method) and imaging of secondary field profiles of resistivity contour lines and depth section resistivity for ground and air data, beyond the target modeling (dip, direction and depth). Maps can be obtained through the methods of Kriging, or Inverse Distance Square. This thesis presents three articles. The first article was applied to synthetic data models with two and three layers, with resistivity ranging from 10 to 100 Ω.m and depth ranging between 100 and 400m. In the second article the program was submitted to data collected in Carajás using the PROTEM equipment (Geonics), the inversion routine recovered the resistivity values ranging from 1.104 and 2.104 Ω.m and depth values from 50 to 400m. Also, it was possible to describe the features of conductive regions and the change in its direction. In the last article we use airborne electromagnetic data (AEM) from the Basin of San Pedro (USA), obtained by GEOTEM with three components (x, y and z). Applying a Hilbert transform on the three component data, it was possible to calculate the energy envelope. Through the ratio of Bz and the Energy Envelope component it was possible to evaluate the energy peaks and estimate the dip, depth and direction (strike) of the target, these results were confronted with section of RDI also described by the program. These data brought more information to carry out the modeling of the conductive subsurface.
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Solução de um problema não linear do tipo reação-difusão na modelagem dispersão de insetos

Soares, Maria Elaine dos Santos January 2002 (has links)
Neste trabalho tratamos da solução de um problema não linear do tipo tração-difusão, na modelagem de dispersão de insetos. Começamos estabelecendo uma lei de conservação e a partir desta, deduzimos algumas equações importantes para o desenvolvimento do nosso estudo, tais como a equação de convecção, de difusão e simultaneamente convecção e difusão. Se considerarmos uma escala de tempo que possibilite a adição ou retirada de indivíduos no meio, conforme seja considerada reprodução, migração ou morte, podemos acrescentar ao processo difusivo um termo de reação, obtendo então, a equação do tipo reação-difusão. Se o temp de reação for deendendee da densidade populacional e do tipo logístico, obtém-se a equação de Fischer. Dessa equação abordamos alguns aspectos, tais como, determinação dos estados estacionários, análise da estabillidade dos mesmos, representação gráfica no plano de fase e por último investigamos a existência de solução do tipo onda viajante. Abordamos, também, alguns exemplos apresentados na literatura, envolvendo equação da difusão com coeficiente constante e com coeficiente dependente da densidade populacional. Além disso, apresentamos o resultados obtidos com a modelagem em tempo discreto, a partir de um trabalho experimental com besouros marcados para o experimento e depois liberados Banks et al (1985) , em que os autores admitiram uma variação temporal e a partir dos dados obtidos fizeram uma estimativa para o coeficiente de difusão D (t), bem como para o coeficiente de decaimento α(t) do termo de reação linear em u. Construimos curvas que se ajustam a essas alternativas e apresentamos esses coeficientes em versão continua D (t) e α(t), dependentes da variável tempo t. Através de uma abordagem numérica, os modelos foram comparadas da variável tempo t. Através de uma abordagem numérica, os modelos foram comparados para diversos casos, usando diferentes combinação de D constante e D variando no tempo, a constante e a variando no tempo. Além disso, analisamos tambén, o efeito da substituição do coeficiente de difusão D constante por D(t) na equação de Fisher.
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Utilização de métodos de modelagem molecular para caracterização do sistema (nBuCp)2Zr(CH3)2 imobilizado em sílica e ativado com MAO

Rossetti, Heitor Luiz January 2006 (has links)
Neste trabalho é apresentada uma seleção métodos e softwares de modelagem molecular na escala da mecânica quântica. O método da DFT implementado no software ADF, versão 2004.01, foi escolhido para modelagem rigorosa e o método da solução analítica da equação de Schrödinger dependente do tempo, implementado no software em desenvolvimento SIMULMOLEC5, para modelagem aproximada. Ambos foram aplicados na modelagem de espécies químicas presentes no sistema catalítico heterogêneo bis-(n-butil ciclopentadienil) dimetil zircônio, (nBuCp)2Zr(CH3)2, ativado com metilaluminoxano (MAO) in situ e suportado em sílica. O software ADF, foi validado e, após, utilizado nas modelagens de trimetilalumínio, MAO, oligômeros do ácido silícico, do precursor catalítico (nBuCp)2Zr(CH3)2 e o mesmo enxertado em sílica e ativado com MAO. Todas essas espécies apresentaram características coerentes com os dados experimentais. O software SIMULMOLEC5 foi avaliado inicialmente quanto à aplicabilidade a espécies químicas com zircônio e alumínio. Foi modificado para gerar superfícies de isopotencial tridimensionais e re-parametrizado para utilizar somente dados físicos como raios covalentes, primeiros potenciais de ionização, números atômicos e posições dos elementos químicos nas moléculas modeladas. O trimetilalumínio e dímeros e dois complexos de Cp2Zr(CH3)2 ativados com MAO foram modeladas com sucesso. / In this work it is presented a selection of quantum mechanics scale molecular modelling methods and software. The method of DFT implemented in the software ADF, version 2004.01, was chosen for rigorous modelling and the method of the analytical solution of time dependent Schrödinger equation, implemented in the SIMULMOLEC5 software, was selected for approximated modelling. Both were applied in the modelling of chemical species present in the heterogeneous catalytic system bis-(n-butyl cyclopentadienil) dimethyl zirconium, (nBuCp)2Zr(CH3)2, activated in situ with methylaluminoxane (MAO) and grafted on silica. The ADF software was validated and used for modelling trimethylaluminium (TMA) , MAO, silicic acid oligomers as simplified models of silica, the catalytic precursor (nBuCp)2Zr(CH3)2 and the same grafted on silica and activated with MAO. All those species showed predicted characteristics coherent with the experimental data. The SIMULMOLEC5 software was initially evaluated for the applicability to chemical species with zirconium and aluminum. It was modified to generate threedimensional isopotencial surfaces and was reparametrized to use only physical data like covalent radii, first ionization potentials, atomic numbers and positions of the chemical elements in the modeled molecules. TMA dimers and two complexes of Cp2Zr(CH3)2 activated MAO were successfully modeled.
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Editor distribuído de manipulação colaborativa de documentos diagramáticos

Cayres, Paulo Henrique January 2001 (has links)
Este trabalho apresenta um framework para editores distribuídos de manipulação colaborativa de documentos diagramáticos (FreDoc). FreDoc fornece um conjunto de classes que propicia um ambiente distribuído para edição colaborativa de diagramas de duas dimensões. Ele é constituído de 4 pacotes de classes: 1) de controle de acesso; 2) de controle de edição; 3) formas geométricas básicas; e 4) editor distribuído. Além disso, é apresentado um estudo sobre mecanismos para construção de editores distribuídos. Editores distribuídos são ferramentas úteis no processo de criação de documentos em um ambiente colaborativo tal como a World Wide Web. O uso de editores distribuídos torna o processo de colaboração mais rápido, pois o colaborador participa ativamente do processo de construção através da inserção de anotações que. Estas anotações podem ser aceitas ou rejeitadas total ou parcialmente pelo ou coordenador. Por fim, é descrito um protótipo, o FreDocUML, desenvolvido para testar a aplicação do framewrok FreDoc, mostrando um processo colaborativo de edição de diagrama de classes na notação UML é descrito.
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Modelagem estratigráfica de clinoformas deposicionais : construção e aplicação de um modelo computacional baseado em mecânica estatística

Menezes, Jorge Rui Corrêa de January 2004 (has links)
Sob a premissa de que a geometria do perfil deposicional das clinoformas pode conter informações sobre a composição textural dos sedimentos que as compõem, bem como sobre a energia da coluna d’água, foi desenvolvido um modelo computacional para a análise teórica dos fatores controladores do tipo de curvatura dos foresets das clinoformas, e, por extensão dos taludes submarinos. Um modelo análogo de suspensão dinâmica foi implementado experimentalmente com um programa em código Matlab, denominado MAXWELL, e é classificado como um modelo estratigráfico, bidimensional, analítico, determinístico, dinâmico, parcialmente dedutivo e parcialmente baseado em regras. Contém um modelo de escoamento de fluido em linhas de corrente, e trata indiretamente a tensão de cisalhamento no domínio de um sistema fechado bifásico líquido-vapor análogo, a partir a proposta de analogias entre os processos de evaporação e de suspensão de sedimentos. É uma abordagem baseada na competência de transporte do fluxo d’água, pois considera temperatura e velocidade de fluxo combinado onda-corrente como variáveis controladoras análogas da intensidade de transferência de energia. Os processos deposicionais marinhos são reduzidos a um fenômeno da superfície deposicional, que é considerada análoga a uma interface líquidovapor dentro de um sistema fechado. A equação de distribuição estatística de velocidades moleculares de Maxwell é usada para calcular a proporção de moléculas na fase líquida, considerada análoga à proporção de sedimentos depositados, bem como a proporção na fase vapor, tomada como análoga à proporção de sedimentos em suspensão. O estado energético do sistema é parametrizado por três potenciais: energia interna, como função do tamanho de grão (areia, silte ou argila); energia térmica do meio, como função da energia hidrodinâmica, e energia gravitacional, como função do declive topográfico As simulações indicam que os principais fatores controladores do perfil deposicional das clinoformas, e por extensão, dos taludes submarinos em geral, são a energia hidrodinâmica da coluna d’água e a granulometria (ou coesão) do sedimento, que podem ser consideradas dois parâmetros comutáveis, isto é, grãos grossos ou coesos podem produzir sobre a geometria das clinoformas o mesmo efeito da baixa energia hidrodinâmica, e vice-versa. Com base no fator de decaimento da energia hidrodinâmica com o aumento da batimetria, foram definidas três ordens de grandeza da intensidade da energia da coluna d’água: baixa energia (10–1), alta x energia (10-2) e muito alta energia (10-3). Com base nesse critério, foram caracterizados quatro tipos de perfis deposicionais de clinoformas: dois tipos sigmoidais e dois tipos exponenciais. Os tipos sigmoidais podem ser de alta energia ou de muito alta energia, e distinguem-se pela granulometria do sedimento e pela distribuição de declividades em relação à dimensão na direção horizontal. Os perfis de tipo exponencial podem ser tanto de baixa energia, quanto de alta energia. A subida relativa do nível do mar afeta o tipo geométrico do perfil deposicional apenas de forma indireta, a partir da retenção da fração grossa do influxo sedimentar na plataforma ou topset. Os principais fatores controladores do ângulo de declividade do perfil das clinoformas são a granulometria do sedimento, a energia hidrodinâmica, a profundidade d’água da bacia e o desvio lateral da corrente de fundo. A dedução da litofácies a partir da geometria das clinoformas parece promissora apenas para os tipos teóricos sigmoidais, que são distintos na forma e no conteúdo sedimentar.
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Um Estudo sobre modelos conceituais para ferramentas de definição de processos de workflow

Telecken, Tiago Lopes January 2004 (has links)
A crescente necessidade de padronização, eficácia e gerenciamento de processos têm aumentado o interesse das mais diferentes organizações pela tecnologia de workflow. Entretanto, a rápida propagação da tecnologia de workflow, ocorrida na última década, fez com que muitos sistemas desenvolvidos nesta área fossem disponibilizados e difundidos sem uma padronização clara. Analisando-se especificamente a fase de construção do workflow, nota-se que há muitas divergências. Conceitualmente, ainda não há modelos nem metodologias de modelagem amplamente aceitos e consolidados. Quanto às implementações, ainda não existe uma especificação clara e detalhada das ferramentas de definição. A conseqüência deste panorama é a baixa interoperabilidade e a baixa padronização dos conceitos, funcionalidades e interações das ferramentas de definição. Contudo, muitos esforços estão sendo feitos para solucionar o problema da interoperabilidade e padronização. A área de workflow como um todo já começa a apontar fortes tendências de padronização dos conceitos, funcionalidades e interações de seus sistemas. Detectar e avaliar tais tendências são os focos de estudos desta dissertação. Mais precisamente, o objetivo desta dissertação é fornecer informações e métodos que possam ajudar desenvolvedores e usuários de ferramentas de definição a: compreender, descrever e avaliar os conceitos, funcionalidades e interações deste tipo de ferramenta. Para tanto, é mostrado um método de descrição de modelos conceituais de ferramentas de definição. O referido método é resultado de uma pesquisa sobre o modelo conceitual deste tipo de ferramenta. Com base nas informações pesquisadas, foi desenvolvido o modelo conceitual de uma ferramenta de definição chamada de Amaya Workflow (AW). Para mostrar a viabilidade de implementação do modelo conceitual AW e concretizar em um software os estudos desenvolvidos durante esta dissertação, foi implementado o protótipo Amaya Workflow. Por fim, é mostrado um panorama geral das funcionalidades, conceitos e interações das principais ferramentas de definição existentes. Com base neste panorama e nos estudos anteriores, é descrito um método de avaliação de modelos conceituais de ferramentas de definição.
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Proposta e implementação de uma máquina de workflow para o Projeto CEMT

França, Montgomery Barroso January 2004 (has links)
Este trabalho apresenta um protótipo de uma máquina de workflow, de uso geral, implementado em plataforma de software livre. O protótipo utiliza um servidor web com PHP, em sistema operacional Linux, alguns programas desenvolvidos em C e o banco de dados MySql. O projeto CEMT demanda o uso da tecnologia de workflow, com o objetivo de controlar a execução de cursos a distância. Antes de ser iniciado o desenvolvimento do protótipo, foi feito um estudo sobre algumas máquinas de workflow existentes, com o objetivo de encontrar alguma que tivesse licença livre e pudesse ser utilizada no projeto CEMT, ou colher subsídios para o desenvolvimento de uma máquina de workflow própria. Foram testadas duas máquinas de workflow de licença livre (Openflow e OFBIZ), uma máquina com cópia de demonstração (Reactor) e foram consultadas as documentações fornecidas pelos fabricantes. Além disso foi consultada também a documentação do Domino Workflow, que não disponibilizou cópia de avaliação e cuja licença não é livre. Um dos requisitos do protótipo é a compatibilidade com os padrões de interface recomendados pela WfMC. Esses padrões permitem a interoperabilidade entre softwares de workflow. O primeiro benefício da adoção desses padrões é a interação com o editor gráfico de workflow AW (Amaya Workflow), desenvolvido no Instituto de Informática da UFRGS. Este editor gera definições de processos de workflow no formato da linguagem XPDL (XML Process Definition Language), que alimentam a máquina de workflow. O esquema XPDL foi traduzido para um esquema de banco de dados relacional e foi desenvolvido um compilador que lê um arquivo no formato XPDL e gera comandos SQL de inserção das informações desse arquivo no banco de dados. Foi desenvolvida uma interface web para demonstrar o funcionamento do protótipo. A API definida na Interface 2 da WfMC foi implementada parcialmente. Essa API permite o desenvolvimento independente de outras interfaces de usuário. Foram propostas algumas extensões à Interface 1 e modificações na definição de estados recomendada pela Interface 2 da WfMC. Com isso foi possível aumentar o controle sobre a execução das instâncias de workflow. Foram incluídas as restrições de data e possibilidade de bloqueio na execução de instâncias de atividades. Outras extensões possibilitam um serviço de notificações e atividades em grupo e oferecem novas possibilidades de alocação de atividades. O funcionamento básico do protótipo é descrito e inclui as funcionalidades de carga da definição de processo, instanciação de processo, visualização da lista de trabalho e execução das atividades, entre outras.
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Divergência funcional da família gênica da álcool desidrogenase em plantas

Thompson, Claudia Elizabeth January 2006 (has links)
As proteínas glicolíticas em plantas são codificadas por pequenas famílias multigênicas, que fornecem um interessante contraste às famílias multigênicas com um grande número de cópias estudadas até o momento. Os genes Adh codificam enzimas glicolíticas, conhecidas como álcool desidrogenase, as quais têm sido caracterizadas em várias famílias de plantas. Embora as seqüências de aminoácios das cadeias longas de ADH, que contêm zinco como cofator, sejam altamente conservadas, a função metabólica dessa enzima é variável. Além disso, elas têm diferentes padrões de expressão e estão submetidas a diferentes taxas não-sinônimas entre as diferentes cópias gênicas. É possível que as cópias de Adh tenham sido mantidas como conseqüência da substituição adaptativa de aminoácidos que conferiu uma mudança em sua função. Neste estudo, estendemos análises prévias dessa família gênica, utilizando técnicas de filogenia e modelagem molecular, com o objetivo de entender o processo de diversificação envolvido na evolução dessa família multigênica. As análises filogenéticas indicaram que têm havido eventos separados de duplicação dentro de angiospermas, ou seja, genes identificados como Adh1, Adh2 e Adh3 em diferentes grupos podem não ser homólogos. Nenhuma indicação de seleção positiva foi encontrada para a família gênica Adh em plantas. Entretanto, os coeficientes de divergência funcional ( ) estimados entre os grupos de genes Adh1 e Adh2 indicaram mudanças sítio-específicas, estatisticamente significativas, na taxa evolutiva entre os mesmos, bem como entre aqueles genes Adh de diferentes famílias botânicas, sugerindo que alterações nas restrições funcionais podem ter ocorrido em alguns resíduos de aminoácidos depois da especiação. Modelos teóricos da estrutura tridimensional da enzima álcool desidrogenase de 17 espécies de plantas foram construídos e validados estereoquimicamente. Os resíduos de aminoácidos importantes para a divergência funcional dessa enzima foram identificados na estrutura tridimensional da mesma. / The glycolytic proteins in plants are coded by small multigene families, which provide an interesting contrast to the high copy number gene families studied to date. The alcohol dehydrogenase (Adh) genes encode glycolytic enzymes that have been characterized in some plant families. Although the amino acid sequences of zinccontaining long-chain (LC) ADHs are highly conserved, the metabolic function of this enzyme is variable. Besides this, they have different patterns of expression and are submitted to differences in nonsynonymous substitution rates between gene copies. It is possible that the Adh copies have been retained as a consequence of adaptative amino acid replacement which has conferred a subtle change in function. We extend previous studies of this gene family, with the goal of using phylogenetic approach and molecular modeling tools to understand the process of diversification involved in the evolutionary process of this multigene family. The phylogenetic analysis indicate that there have been a number of separate duplication events within angiosperms, that is to say genes labeled Adh1, Adh2 and Adh3 in different groups may not be homologous. No indication of positive selection was encountered for the plant Adh gene family. However, the coefficients of functional divergence ( ) estimated between the Adh1 and Adh2 gene groups indicate statistically significant site-specific shift of evolutionary rate between them, as well as between those of different botanical families, suggesting that altered functional constraints may take place at some amino acid residues after speciation. Theoretical tridimensional models of seventeen plant alcohol dehydrogenase were constructed and verified to be stereochemically valid. The amino acids residues important for the functional divergence of this enzyme were identified in the ADH tridimensional structure.

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